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##GATKCommandLine.HaplotypeCaller=<ID=HaplotypeCaller,Version=3.5-0-g36282e4,Date="Sat Oct 01 22:08:15 CEST 2016",Epoch=1475352495904,CommandLineOptions="analysis_type=HaplotypeCaller input_file=[/home/itiukova/private/again/bwa_dekkera_REF_sorted.bam] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/home/itiukova/private/again/new_ass_m.fasta nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=500 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false out=/home/itiukova/private/again/raw_variants_contigs.vcf likelihoodCalculationEngine=PairHMM heterogeneousKmerSizeResolution=COMBO_MIN dbsnp=(RodBinding name= source=UNBOUND) dontTrimActiveRegions=false maxDiscARExtension=25 maxGGAARExtension=300 paddingAroundIndels=150 paddingAroundSNPs=20 comp=[] annotation=[] excludeAnnotation=[] group=[Standard, StandardHCAnnotation] debug=false useFilteredReadsForAnnotations=false emitRefConfidence=NONE bamOutput=null bamWriterType=CALLED_HAPLOTYPES disableOptimizations=false annotateNDA=false heterozygosity=0.001 indel_heterozygosity=1.25E-4 standard_min_confidence_threshold_for_calling=30.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=10.0 max_alternate_alleles=6 input_prior=[] sample_ploidy=2 genotyping_mode=DISCOVERY alleles=(RodBinding name= source=UNBOUND) contamination_fraction_to_filter=0.0 contamination_fraction_per_sample_file=null p_nonref_model=null exactcallslog=null output_mode=EMIT_VARIANTS_ONLY allSitePLs=false gcpHMM=10 pair_hmm_implementation=VECTOR_LOGLESS_CACHING pair_hmm_sub_implementation=ENABLE_ALL always_load_vector_logless_PairHMM_lib=false phredScaledGlobalReadMismappingRate=45 noFpga=false sample_name=null kmerSize=[10, 25] dontIncreaseKmerSizesForCycles=false allowNonUniqueKmersInRef=false numPruningSamples=1 recoverDanglingHeads=false doNotRecoverDanglingBranches=false minDanglingBranchLength=4 consensus=false maxNumHaplotypesInPopulation=128 errorCorrectKmers=false minPruning=2 debugGraphTransformations=false allowCyclesInKmerGraphToGeneratePaths=false graphOutput=null kmerLengthForReadErrorCorrection=25 minObservationsForKmerToBeSolid=20 GVCFGQBands=[1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 70, 80, 90, 99] indelSizeToEliminateInRefModel=10 min_base_quality_score=10 includeUmappedReads=false useAllelesTrigger=false doNotRunPhysicalPhasing=true keepRG=null justDetermineActiveRegions=false dontGenotype=false dontUseSoftClippedBases=false captureAssemblyFailureBAM=false errorCorrectReads=false pcr_indel_model=CONSERVATIVE maxReadsInRegionPerSample=10000 minReadsPerAlignmentStart=10 mergeVariantsViaLD=false activityProfileOut=null activeRegionOut=null activeRegionIn=null activeRegionExtension=null forceActive=false activeRegionMaxSize=null bandPassSigma=null maxProbPropagationDistance=50 activeProbabilityThreshold=0.002 min_mapping_quality_score=20 filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
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##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
##INFO=<ID=ClippingRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref number of hard clipped bases">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
##INFO=<ID=ExcessHet,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value for exact test of excess heterozygosity">
##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts (not necessarily the same as the AC), for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
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chr1	299879	.	T	G	7170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.015;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.019;QD=16.30;ReadPosRankSum=-1.558;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,220:440:99:7199,0,6842
chr1	299916	.	C	T	7845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.784;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.178;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,201:391:99:7874,0,7376
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chr1	313081	.	T	C	6353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.301;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.498;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,168:356:99:6382,0,7212
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chr1	313522	.	A	G	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.938;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=1.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.036;QD=14.70;ReadPosRankSum=2.442;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,94:190:99:2822,0,2842
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chr1	315604	.	A	ATTAC	10477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.179;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-3.870;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.936;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,254:517:99:10515,0,10650
chr1	315614	.	C	A	9926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.426;ClippingRankSum=0.022;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-1.183;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,242:507:99:9955,0,10900
chr1	315624	.	TTACACCCTATTCTC	T	10114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.161;ClippingRankSum=0.390;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-1.848;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.129;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,252:552:99:10152,0,12222
chr1	315643	.	ATCT	A	10678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.879;ClippingRankSum=-1.349;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=2.316;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.702;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,252:520:99:10716,0,10761
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chr1	316148	.	TACTTCTCCCC	T	7183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-0.385;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=0.728;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,230:495:99:7221,0,10143
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chr1	317768	.	A	G	7693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-0.731;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.333;QD=18.58;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,194:414:99:7722,0,13858
chr1	317774	.	A	G	8224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-1.815;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.202;QD=19.54;ReadPosRankSum=2.067;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,201:421:99:8253,0,13434
chr1	317786	.	A	G	8211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=-0.406;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.365;QD=19.93;ReadPosRankSum=1.757;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,200:412:99:8240,0,11916
chr1	317792	.	A	G	7889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-0.668;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=6.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.628;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.324;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,205:410:99:7918,0,10802
chr1	318077	.	T	C	7773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.560;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.506;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,260:538:99:7802,0,8344
chr1	318204	.	A	G	6709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.007;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.087;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,212:449:99:6738,0,7481
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chr1	325540	.	A	G	7369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.088;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=7.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.596;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=1.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,194:406:99:7398,0,9185
chr1	325549	.	C	G	7395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.770;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.105;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,198:409:99:7424,0,9100
chr1	325657	.	T	C	8709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.911;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.039;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,225:410:99:8738,0,6900
chr1	325674	.	C	T	9332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=2.078;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=4.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.761;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,227:421:99:9361,0,7674
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chr1	329578	.	TA	T	1397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=1.155;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.152;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,111:353:99:1435,0,7086
chr1	329620	.	ATT	A	4788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=-1.339;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=9.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.152;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,147:343:99:4826,0,6426
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chr1	334908	.	G	A	5736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-1.182;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.344;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,149:308:99:5765,0,6286
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chr1	337584	.	G	T	12742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.174;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=1.576;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.774;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,313:608:99:12771,0,11826
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chr1	337600	.	C	A	12427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.820;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=1.668;QD=20.64;ReadPosRankSum=-1.398;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,310:602:99:12456,0,11556
chr1	337610	.	C	T	12243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.448;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.635;QD=21.41;ReadPosRankSum=-1.217;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,300:572:99:12272,0,10898
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chr1	338981	.	T	A	10365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.255;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.130;QD=20.81;ReadPosRankSum=-1.720;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,257:498:99:10394,0,9461
chr1	339094	.	C	T	7944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-2.627;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.650;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,247:494:99:7973,0,9938
chr1	339096	.	C	T	7935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.981;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.331;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,240:491:99:7964,0,10071
chr1	339097	.	A	G	7789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.466;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.022;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.610;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,237:488:99:7818,0,10231
chr1	339115	.	T	C	10466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.820;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.234;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,257:493:99:10495,0,9775
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chr1	342820	.	GA	G	4139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.821;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.852;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,177:294:99:4177,0,2434
chr1	342849	.	T	C	7042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=-0.870;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.302;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,230:403:99:7071,0,6377
chr1	342990	.	TA	T	5996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=1.020;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.456;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.974	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,219:495:99:6034,0,7773
chr1	343056	.	AATC	A	7909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.028;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.260;QD=16.62;ReadPosRankSum=-1.890;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,214:476:99:7947,0,10192
chr1	343529	.	A	G	6272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.492;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=0.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.508;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,173:370:99:6301,0,7340
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chr1	347623	.	T	C	7958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=1.896;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.621;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,207:435:99:7987,0,8857
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chr1	355735	.	C	T	9824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.377;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.571;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,258:510:99:9853,0,9770
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chr1	357038	.	CAT	C	11272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=-0.580;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.250;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.425;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,275:550:99:11310,0,11220
chr1	357041	.	A	C	10672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.994;ClippingRankSum=0.157;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.708;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,271:543:99:10701,0,10971
chr1	357047	.	T	C	10691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=-0.245;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.681;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,266:532:99:10720,0,10654
chr1	357049	.	C	T	10580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.832;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.602;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.822;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,269:533:99:10609,0,10453
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chr1	357209	.	CT	C	7618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.107;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=7.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.998;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.323;SOR=1.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,291:607:99:7656,0,8473
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chr1	360379	.	T	C	7050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=1.975;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.480;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,187:420:99:7079,0,12309
chr1	360562	.	A	G	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=-0.085;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=77.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-0.643;QD=10.84;ReadPosRankSum=-5.795;SOR=5.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,93:246:99:2695,0,16907
chr1	360565	.	G	GAATTGAGGAGCAGGAAGAAATGAAGAGATGAAAAATGAAGAGAGATAAAATGAAGAGAGATAAAATGAAGAGGGATA	2718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=-0.184;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=83.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.825;QD=11.67;ReadPosRankSum=-7.267;SOR=5.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,93:233:99:2756,0,16830
chr1	364504	.	T	C	7059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=1.188;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=10.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.783;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.298;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,223:428:99:7088,0,6568
chr1	365213	.	G	A	8339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.614;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.797;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.276;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,267:574:99:8368,0,11642
chr1	365321	.	A	AT	9307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.292;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.136;QD=18.96;ReadPosRankSum=-2.805;SOR=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,244:491:99:9345,0,9704
chr1	365327	.	AC	A	9353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.739;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.188;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,234:493:99:9391,0,10594
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chr1	382013	.	A	C	7543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.247;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.869;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,200:386:99:7572,0,7114
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chr1	390109	.	G	A	7978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=-0.160;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.629;QD=17.50;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,228:456:99:8007,0,8256
chr1	390143	.	AT	A	5116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-0.314;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=8.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.816;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,176:359:99:5154,0,6700
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chr1	395596	.	T	G	7261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-1.817;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.178;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,189:425:99:7290,0,9846
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chr1	395631	.	C	T	7484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.089;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.726;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,190:435:99:7513,0,10119
chr1	395654	.	T	A	7084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.437;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.702;QD=16.29;ReadPosRankSum=-2.168;SOR=0.980	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,199:435:99:7113,0,8888
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chr1	411332	.	T	C	8254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=-0.950;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.518;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,219:461:99:8283,0,9070
chr1	411342	.	T	G	8803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.492;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.900;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.896;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,225:458:99:8832,0,9240
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chr1	421719	.	T	C	10069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.923;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,256:496:99:10098,0,9652
chr1	423326	.	T	G	8323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.975;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.688;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,212:428:99:8352,0,8520
chr1	423329	.	A	G	8310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.549;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.560;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,213:431:99:8339,0,8522
chr1	424374	.	T	C	7069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.266;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.280;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.284;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,228:467:99:7098,0,7704
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chr1	438827	.	T	C	8060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=1.213;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.449;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.748;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,207:447:99:8089,0,13760
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chr1	446157	.	A	T	6957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=2.721;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.478;QD=15.92;ReadPosRankSum=3.233;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,230:437:99:6986,0,6043
chr1	446274	.	C	CAA,CAAA	7292.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-0.769;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=9.045;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.724;QD=31.99;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=1.360	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:7,107,114:228:99:7330,2399,1976,2539,0,2246
chr1	446573	.	C	CAAAA,CAAAAAAAA	9261.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.030;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.94;MQRankSum=1.003;QD=31.19;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=0.252	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:2,27,47:76:99:9299,3744,3137,1168,0,580
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chr1	483012	.	G	A	10109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.705;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.151;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,323:604:99:10138,0,8359
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chr1	485940	.	TA	T	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.475;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-0.758;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,24:96:99:139,0,982
chr1	498276	.	G	GAAA	3788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;QD=32.66;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,49:52:99:3826,426,0
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chr1	543207	.	G	GA	5926.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.042;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.215;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.417;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,258:511:99:5964,0,6135
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chr1	543687	.	A	G	10019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.646;ClippingRankSum=-0.356;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.014;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,246:483:99:10048,0,9597
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chr1	632238	.	C	T	8386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.276;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.142;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,217:441:99:8415,0,8575
chr1	633612	.	T	C	6805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.445;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.342;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,219:440:99:6834,0,8372
chr1	633944	.	C	T	7450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.119;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.522;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.963;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,195:413:99:7479,0,8497
chr1	633945	.	T	C	7447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.005;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.761;QD=17.95;ReadPosRankSum=3.057;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,195:415:99:7476,0,8518
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chr1	649973	.	C	G	5494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.445;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=3.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.072;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,176:308:99:5523,0,3947
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chr1	654169	.	A	G	11997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=-0.420;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.558;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,322:632:99:12026,0,11734
chr1	654187	.	T	C	11995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-2.513;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.145;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.330;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,298:604:99:12024,0,12078
chr1	654206	.	A	G	11362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-1.719;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.337;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.635;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,308:615:99:11391,0,11776
chr1	659815	.	C	T	7053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.695;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=0.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.438;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,186:394:99:7082,0,8246
chr1	659817	.	A	G	7209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=0.010;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=0.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.058;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.620;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,181:387:99:7238,0,8402
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chr1	671484	.	T	TC	6293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=1.147;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.827;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,231:420:99:6331,0,4868
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chr1	785961	.	T	C	7666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.983;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.217;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,200:462:99:7695,0,10498
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chr1	802866	.	A	G	8664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.348;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.481;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.121;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,223:470:99:8693,0,10034
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chr1	826021	.	AT	A	2952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-1.488;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.988;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,139:303:99:2990,0,3735
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chr1	826922	.	A	T	13046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.428;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.845;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,334:647:99:13075,0,14478
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chr1	839303	.	C	T	6270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.028;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=0.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.850;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,168:306:99:6299,0,5022
chr1	844230	.	A	G	13889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.501;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.181;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,351:671:99:13918,0,12361
chr1	844235	.	G	A	14274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.623;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.645;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,355:676:99:14303,0,12991
chr1	844238	.	G	A	14648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.621;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.095;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,360:683:99:14677,0,12867
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chr1	853367	.	T	C	7963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.705;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.950;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,253:514:99:7992,0,8236
chr1	853641	.	GA	G	5059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.385;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.256;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,230:459:99:5097,0,5117
chr1	853703	.	A	G	10865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.093;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.089;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,345:663:99:10894,0,11960
chr1	853726	.	T	C	12452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=-0.056;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.273;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.630;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,327:692:99:12481,0,14606
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chr1	863058	.	TAACTTTAAATTTTCACCCCGCCC	T	4007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.361;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-0.978;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,136:294:99:4045,0,5731
chr1	863075	.	CCCGCCCAACTTTAAATTTTCACCCCGCCCAACTTTAAATTTTCACT	C	4299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=1.348;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-0.613;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,125:330:99:4337,0,7562
chr1	863176	.	CTTCAAATTTTCACCCCCAACTT	C	7051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.317;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=0.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=2.485;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,179:387:99:7089,0,8106
chr1	863198	.	T	TGG	7158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.040;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.962;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,179:349:99:7196,0,6590
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chr1	864122	.	A	G	8896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.770;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.733;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,301:617:99:8925,0,9502
chr1	864164	.	G	A	11515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-1.011;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.329;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.266;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,299:616:99:11544,0,12412
chr1	864167	.	G	A	11575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.879;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.367;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,299:616:99:11604,0,12339
chr1	864578	.	G	A	6075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=1.975;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.085;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.777;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,213:426:99:6104,0,7674
chr1	866417	.	C	T	6938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.142;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.257;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.970;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,185:375:99:6967,0,7252
chr1	866436	.	C	T	6629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.480;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=3.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.619;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,176:373:99:6658,0,7391
chr1	866463	.	C	T	6434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.770;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.223;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,177:396:99:6463,0,8272
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chr1	871511	.	C	T	8063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.801;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.273;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,209:432:99:8092,0,8697
chr1	871687	.	CT	C	3797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.519;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.307;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,172:357:99:3835,0,4204
chr1	871770	.	C	CA	7483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.035;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.910;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,194:385:99:7521,0,7395
chr1	871773	.	C	T	7735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.378;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.093;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,192:382:99:7764,0,7503
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chr1	874618	.	T	C	7093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-0.376;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.380;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,193:424:99:7122,0,9069
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chr1	882501	.	T	G	12263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.219;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.958;QD=19.75;ReadPosRankSum=2.678;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,315:621:99:12292,0,14593
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chr1	896908	.	G	T	14202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.272;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.451;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.910;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,354:666:99:14231,0,9319
chr1	896923	.	A	C	12737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.390;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.427;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,337:629:99:12766,0,11044
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chr1	912613	.	T	C	10876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.603;DP=766;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.006;QD=14.80;ReadPosRankSum=4.494;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,366:735:99:10905,0,11708
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chr1	915733	.	T	C	8587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.472;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.613;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.666;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,267:511:99:8616,0,7625
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chr1	925742	.	A	G	9699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=1.041;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.676;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,258:537:99:9728,0,10731
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chr1	930453	.	G	T	6383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.207;ClippingRankSum=0.345;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.592;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,169:446:99:6412,0,11362
chr1	930461	.	C	T	6159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.319;ClippingRankSum=0.279;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.242;QD=14.10;ReadPosRankSum=-3.013;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,165:437:99:6188,0,11291
chr1	930463	.	GCGGAACCTGCCGATCTTAAAC	G	5989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.051;ClippingRankSum=0.480;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=5.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.921;QD=11.98;ReadPosRankSum=-3.009;SOR=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,166:500:99:6027,0,13631
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chr1	931111	.	T	G	11959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.012;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.308;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,305:672:99:11988,0,14911
chr1	931129	.	G	T	12198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=-0.628;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.322;QD=17.53;ReadPosRankSum=-2.163;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:389,307:696:99:12227,0,15729
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chr1	936568	.	CT	C	9150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=1.878;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=5.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.262;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,240:418:99:9188,0,3664
chr1	936583	.	C	T	7699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.351;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.977;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.981;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,253:462:99:7728,0,8208
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chr1	941890	.	G	A	9317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.816;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=5.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.007;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,245:484:99:9346,0,9657
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chr1	943343	.	C	A	9129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.769;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.004;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,237:528:99:9158,0,11952
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chr1	952221	.	CGGT	C	7867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=1.264;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.886;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,206:454:99:7905,0,9995
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chr1	1019053	.	A	G	59508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=2.153;DP=1884;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.266;QD=32.63;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:440,1384:1824:99:59537,0,15076
chr1	1019064	.	A	T	60273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.292;DP=1927;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.578;QD=32.23;ReadPosRankSum=-2.114;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:437,1433:1870:99:60302,0,14311
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chr1	1028001	.	GA	G	5407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.933;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.239;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,223:406:99:5445,0,4279
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chr1	1041343	.	C	T,CT	2858.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.405;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=1.236;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.466;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:11,85,93:189:99:2896,1468,4229,1376,0,4078
chr1	1042161	.	T	C	12603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.614;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.284;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,326:643:99:12632,0,12432
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chr1	1042377	.	G	A	8761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.042;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.206;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,282:539:99:8790,0,8011
chr1	1042566	.	C	T	9794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.714;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.245;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.813;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,311:602:99:9823,0,8860
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chr1	1055837	.	G	A	8217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.333;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.816;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,268:532:99:8246,0,7915
chr1	1056167	.	C	T	8873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=-0.593;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.553;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,276:548:99:8902,0,8453
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chr1	1063662	.	GA	G	4072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.418;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.295;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,215:449:99:4110,0,4743
chr1	1066000	.	A	G	8796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.129;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=5.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.171;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,277:563:99:8825,0,8966
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chr1	1088098	.	T	C	9889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.618;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.632;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,262:539:99:9918,0,10485
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chr1	1098902	.	G	A	7491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-1.502;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.215;QD=14.98;ReadPosRankSum=-2.027;SOR=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,239:500:99:7520,0,8143
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chr1	1109687	.	A	G	10189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.860;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.725;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,258:501:99:10218,0,9387
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chr1	1117183	.	C	T	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=1.832;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.855;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.190;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,242:520:99:9397,0,10725
chr1	1117186	.	T	C	9361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.833;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.724;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,242:508:99:9390,0,10672
chr1	1117222	.	G	A	10111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.040;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.328;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,266:528:99:10140,0,10056
chr1	1117234	.	ATGAT	A	10639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.594;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.402;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,274:548:99:10677,0,10623
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chr1	1128955	.	G	A	10292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-0.322;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.256;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.607;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,282:534:99:10321,0,9280
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chr1	1133809	.	G	GC	9209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.534;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.579;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,276:528:99:9247,0,8195
chr1	1133861	.	C	T	7018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.855;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.580;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,230:489:99:7047,0,8273
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chr1	1139203	.	G	A	11251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=1.263;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.621;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,289:599:99:11280,0,12424
chr1	1139218	.	C	T	10776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.445;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.384;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,293:613:99:10805,0,13194
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chr1	1145771	.	GGA	G	4044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=1.234;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.351;QD=9.13;ReadPosRankSum=2.442;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,195:443:99:4082,0,10112
chr1	1145786	.	C	T	8338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.158;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.551;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,222:449:99:8367,0,8607
chr1	1145904	.	G	A	7207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.783;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.918;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:7236,0,7534
chr1	1146855	.	TCCATTAC	T	8205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.256;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=5.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.047;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,221:510:99:8243,0,11720
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chr1	1165672	.	A	T	11197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-1.232;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.297;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.752;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,289:579:99:11226,0,11465
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chr1	1176557	.	A	G	8261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.620;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.250;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,217:479:99:8290,0,10338
chr1	1176727	.	G	T	6799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=1.774;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.308;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,227:486:99:6828,0,8162
chr1	1176796	.	TATTTATTTACATACTAGATTTATTTACATACTGTATTTATTTACATACTAGATTTATTTACATACTGTATTTATTTACATACTAG	T	5816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.535;ClippingRankSum=0.417;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-1.056;QD=11.36;ReadPosRankSum=-4.795;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,189:512:99:5854,0,13044
chr1	1176962	.	CT	C	10113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=1.333;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQRankSum=-8.672;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.654;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,259:561:99:10151,0,12263
chr1	1176967	.	T	TCG	10355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.358;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQRankSum=-8.465;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,253:547:99:10393,0,11787
chr1	1176973	.	CTGATTGATTTA	C	9678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.536;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-7.684;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,247:558:99:9716,0,12669
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chr1	1185228	.	G	A	12351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.536;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.207;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,312:637:99:12380,0,13190
chr1	1185249	.	A	C	12882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=-0.019;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.460;QD=20.16;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,319:639:99:12911,0,13361
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chr1	1185673	.	TA	T	9218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=-0.884;DP=816;ExcessHet=3.0103;FS=19.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=0.597;QD=12.03;ReadPosRankSum=-5.502;SOR=1.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:509,257:766:99:9256,0,21226
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chr1	1185678	.	G	A	11321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=-0.077;DP=818;ExcessHet=3.0103;FS=20.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-3.535;QD=14.80;ReadPosRankSum=-5.281;SOR=1.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:492,273:765:99:11350,0,20575
chr1	1185702	.	A	G	12562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;ClippingRankSum=0.854;DP=891;ExcessHet=3.0103;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=0.463;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.557;SOR=0.989	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:501,327:828:99:12591,0,20736
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chr1	1189886	.	C	A	11230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.017;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.010;QD=20.09;ReadPosRankSum=-2.859;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,290:559:99:11259,0,10472
chr1	1189889	.	C	T	11152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.708;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.293;QD=19.99;ReadPosRankSum=-2.077;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,283:558:99:11181,0,10536
chr1	1190378	.	C	T	10084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.693;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.911;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,258:520:99:10113,0,14322
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chr1	1204807	.	G	A	6556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.083;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=5.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.595;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,167:379:99:6585,0,8582
chr1	1204823	.	G	C	6243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.049;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.685;QD=16.65;ReadPosRankSum=-2.041;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,175:375:99:6272,0,7673
chr1	1204900	.	A	G	6793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=-0.544;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.159;QD=16.18;ReadPosRankSum=2.905;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,217:420:99:6822,0,6021
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chr1	1212545	.	A	G	8769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.062;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.521;QD=15.97;ReadPosRankSum=-2.032;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,287:549:99:8798,0,8010
chr1	1212868	.	C	CTTT,CTTTT	5846.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.696;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.18;MQRankSum=0.807;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:11,36,32:79:99:5884,828,406,751,0,456
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chr1	1218387	.	CTGTATAACAACACTGTATAACGACATTGTATAACAACAT	C	14678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-0.012;DP=856;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=3.880;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.591;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:437,388:825:99:14716,0,17298
chr1	1218468	.	C	T	9436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.819;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.926;QD=15.50;ReadPosRankSum=-6.395;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,309:609:99:9465,0,9230
chr1	1218598	.	G	A	8084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=-0.290;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.974;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,257:500:99:8113,0,7326
chr1	1219843	.	GCAATCAACC	G	6563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=1.596;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.680;QD=14.21;ReadPosRankSum=-2.141;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,225:462:99:6601,0,9123
chr1	1219858	.	A	G	6832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.088;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.915;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,236:458:99:6861,0,8759
chr1	1219875	.	C	G	8406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.352;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.071;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,213:430:99:8435,0,8795
chr1	1219881	.	G	C	8212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=1.296;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.145;QD=19.14;ReadPosRankSum=2.584;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,206:429:99:8241,0,8989
chr1	1219901	.	T	C	7594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=-0.874;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.442;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,199:407:99:7623,0,8041
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chr1	1224433	.	T	C	8904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.367;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.745;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,236:499:99:8933,0,9698
chr1	1224589	.	T	G	6160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.759;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.782;QD=12.89;ReadPosRankSum=-8.552;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,208:478:99:6189,0,8790
chr1	1224846	.	G	A	6658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=1.340;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.390;QD=14.51;ReadPosRankSum=-2.404;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,214:459:99:6687,0,9480
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chr1	1243058	.	A	G	9919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.372;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.008;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,256:494:99:9948,0,8914
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chr1	1258235	.	A	T	10273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.303;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.867;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.293;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,275:532:99:10302,0,8948
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chr1	1261829	.	T	C	8604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.067;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.343;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,223:448:99:8633,0,8742
chr1	1262110	.	T	TA	7102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-1.232;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.513;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,182:387:99:7140,0,8001
chr1	1262111	.	GATTC	G	7090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.176;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=2.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.117;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,186:395:99:7128,0,8151
chr1	1262220	.	T	TGG	4498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=1.797;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.505;QD=15.84;ReadPosRankSum=-2.711;SOR=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,136:284:99:4536,0,5114
chr1	1262255	.	GA	G	5133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.675;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=1.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.288;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,128:251:99:5171,0,4770
chr1	1262274	.	ATTAT	A	7434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.699;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.279;QD=20.43;ReadPosRankSum=-1.743;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,188:364:99:7472,0,6867
chr1	1262282	.	A	T	7188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.381;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.666;QD=20.66;ReadPosRankSum=-2.063;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,182:348:99:7217,0,6651
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chr1	1262361	.	T	C	8413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=-0.165;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.448;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.033;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,219:478:99:8442,0,10101
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chr1	1272202	.	A	C	10199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.490;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.534;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,263:514:99:10228,0,9465
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chr1	1272218	.	A	G	10313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.219;ClippingRankSum=-0.568;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.044;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,250:483:99:10342,0,9432
chr1	1272219	.	C	T	10407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-0.289;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.013;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,252:488:99:10436,0,9551
chr1	1272222	.	A	G	9785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.740;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.795;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,251:486:99:9814,0,9331
chr1	1272278	.	T	C	7909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=1.733;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.463;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,206:432:99:7938,0,8673
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chr1	1286793	.	A	C	10074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.035;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.458;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,261:562:99:10103,0,11797
chr1	1286795	.	G	A	10074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-2.894;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.535;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,261:561:99:10103,0,11797
chr1	1287010	.	TA	T	8571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=1.979;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.922;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,226:483:99:8609,0,9876
chr1	1287021	.	CT	C	3120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.482;ClippingRankSum=-0.019;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.821;QD=6.45;ReadPosRankSum=4.893;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,189:484:99:3158,0,11453
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chr1	1294125	.	A	G	11601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.883;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.891;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,308:588:99:11630,0,14162
chr1	1294145	.	T	C	11796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.774;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.257;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,309:574:99:11825,0,13596
chr1	1295681	.	C	T	8434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.037;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.077;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,232:478:99:8463,0,16180
chr1	1295704	.	T	C	9233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-1.838;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.532;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,231:468:99:9262,0,17644
chr1	1295713	.	T	C	8737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.137;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.573;QD=19.20;ReadPosRankSum=3.167;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,225:455:99:8766,0,16687
chr1	1296013	.	T	TC	10139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=-0.252;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.627;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,273:589:99:10177,0,12195
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chr1	1303906	.	G	T	8335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=1.758;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.056;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,264:571:99:8364,0,9717
chr1	1303938	.	C	A	8432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.371;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.125;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,262:569:99:8461,0,9788
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chr1	1318331	.	C	T	11375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=1.467;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.798;QD=20.72;ReadPosRankSum=-2.233;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,292:549:99:11404,0,9945
chr1	1318919	.	A	G	10811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.571;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.575;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,281:583:99:10840,0,14096
chr1	1318928	.	G	A	10717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.379;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.082;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,294:603:99:10746,0,14747
chr1	1320051	.	T	C	13144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=-0.169;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.737;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,346:674:99:13173,0,12377
chr1	1320071	.	C	T	14796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=1.221;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.161;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,367:692:99:14825,0,12677
chr1	1320073	.	T	C	14714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-0.291;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.691;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,368:692:99:14743,0,12644
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chr1	1329261	.	G	A	12606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.446;DP=790;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.819;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.997;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,406:769:99:12635,0,11154
chr1	1329783	.	A	G	10006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.494;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.758;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,322:675:99:10035,0,11372
chr1	1329872	.	A	T	12081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=-0.052;DP=915;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=1.474;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:460,420:880:99:12110,0,13861
chr1	1329891	.	ACAACAG	A	12549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=1.465;DP=939;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-0.771;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.686;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,330:716:99:12587,0,14862
chr1	1330288	.	A	G	8991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.115;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.640;QD=16.93;ReadPosRankSum=3.532;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,269:531:99:9020,0,8825
chr1	1330356	.	T	C	10078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=-0.052;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.871;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,257:518:99:10107,0,10289
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chr1	1338779	.	T	C	9287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;ClippingRankSum=-1.070;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.680;QD=17.83;ReadPosRankSum=3.433;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,241:521:99:9316,0,17853
chr1	1338782	.	C	A	9350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=-0.020;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.530;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.790;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,245:524:99:9379,0,17952
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chr1	1347928	.	T	C	9461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=3.431;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.027;QD=15.31;ReadPosRankSum=-1.706;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,311:618:99:9490,0,9706
chr1	1349142	.	T	G	12754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=1.672;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.082;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,332:629:99:12783,0,11279
chr1	1349156	.	C	T	13304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=1.521;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.139;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,335:638:99:13333,0,11845
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chr1	1365285	.	G	C	10708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.352;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.200;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,279:553:99:10737,0,11181
chr1	1365386	.	A	ATT	6043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=1.291;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.070;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,198:421:99:6081,0,8690
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chr1	1377263	.	G	A	9405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.614;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.987;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,248:527:99:9434,0,10474
chr1	1377281	.	G	A	9819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.212;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.673;QD=18.53;ReadPosRankSum=-2.048;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,265:530:99:9848,0,10087
chr1	1377354	.	C	CT	3602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.088;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.063;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.348;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,198:423:99:3640,0,4690
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chr1	1384543	.	C	A	9644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=-0.003;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.108;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,329:685:99:9673,0,11143
chr1	1385087	.	T	C	10638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.847;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.362;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,276:550:99:10667,0,10647
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chr1	1391124	.	C	T	6169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.401;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.828;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,203:389:99:6198,0,5459
chr1	1391145	.	C	G	5579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.293;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=7.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.448;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,184:354:99:5608,0,5058
chr1	1392947	.	GGGAACAGGGGGTGGAATTGGTGCTGAAGTTTGA	G	6560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.582;ClippingRankSum=-0.320;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.207;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,190:471:99:6598,0,11355
chr1	1393499	.	G	A	14460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-1.372;DP=774;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.975;QD=19.57;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,384:739:99:14489,0,14144
chr1	1393510	.	G	T	14387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.381;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.586;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,374:727:99:14416,0,13453
chr1	1393659	.	G	A	10503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=-1.187;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-1.126;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,268:507:99:10532,0,9327
chr1	1393662	.	A	G	10769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.307;ClippingRankSum=-0.368;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-3.534;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,259:496:99:10798,0,9503
chr1	1393667	.	T	G	10637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;ClippingRankSum=0.927;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-0.574;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,255:484:99:10666,0,9721
chr1	1393670	.	ACCTGCCGCTTTTTCCGCATTT	A	10628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;ClippingRankSum=-0.439;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-1.031;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,260:554:99:10666,0,11720
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chr1	1398445	.	T	G	11809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-1.065;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.609;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,298:559:99:11838,0,10325
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chr1	1416283	.	A	C	9000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=-0.421;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.815;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,271:574:99:9029,0,11594
chr1	1416290	.	C	T	10336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.258;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.507;QD=18.46;ReadPosRankSum=-2.653;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,269:560:99:10365,0,9331
chr1	1416671	.	T	C	9514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.115;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.191;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,304:559:99:9543,0,7767
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chr1	1419766	.	T	C	10798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.990;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.325;QD=21.13;ReadPosRankSum=2.599;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,278:511:99:10827,0,8864
chr1	1419797	.	GA	G	9833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=-0.296;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.058;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.611;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,254:560:99:9871,0,12122
chr1	1419799	.	A	G	9930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=1.171;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.392;QD=17.51;ReadPosRankSum=2.166;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,260:567:99:9959,0,12281
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chr1	1424112	.	A	G	9660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.360;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.211;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,247:522:99:9689,0,10969
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chr1	1424126	.	G	T	10393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-0.792;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=1.509;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,265:554:99:10422,0,11952
chr1	1424128	.	C	A	10354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=1.241;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.138;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,259:546:99:10383,0,11913
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chr1	1430066	.	A	G	8064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.033;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.302;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,268:586:99:8093,0,10118
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chr1	1436108	.	G	A	9681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.242;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.968;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,237:455:99:9710,0,8701
chr1	1436118	.	A	T	10076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.202;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.447;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,248:477:99:10105,0,9385
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chr1	1446066	.	TA	T	4346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.066;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=4.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.678;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,205:431:99:4384,0,4584
chr1	1446198	.	G	A	9429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.850;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.437;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,251:514:99:9458,0,10027
chr1	1446211	.	G	A	9551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.793;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.103;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,254:514:99:9580,0,9974
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chr1	1448761	.	C	T	11145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.504;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.849;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,288:574:99:11174,0,11183
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chr1	1448808	.	A	G	10844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.248;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.029;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,274:540:99:10873,0,10341
chr1	1449174	.	A	G	8761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-1.149;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.060;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,235:470:99:8790,0,8989
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chr1	1451521	.	TTAAGGCATGTGCCTAATTCA	T	9732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=0.033;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=0.501;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.965;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,253:620:99:9770,0,14710
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chr1	1451667	.	CTTTGTTGTTA	C	10670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=-0.855;DP=817;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.904;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,283:643:99:10708,0,14086
chr1	1458483	.	A	T	10605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.357;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.293;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,279:594:99:10634,0,12113
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chr1	1458694	.	A	G	7736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;ClippingRankSum=2.552;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.156;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,249:533:99:7765,0,8213
chr1	1458947	.	TA	T	9420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.348;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.525;QD=19.27;ReadPosRankSum=-2.493;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,246:489:99:9458,0,10340
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chr1	1482835	.	C	G	10934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=1.252;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.744;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,282:571:99:10963,0,11311
chr1	1482978	.	A	T	10380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.601;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.922;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,264:577:99:10409,0,12508
chr1	1482979	.	T	C	10410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=-0.566;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.323;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,261:573:99:10439,0,12673
chr1	1482985	.	C	A	10483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.890;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.448;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.673;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,261:575:99:10512,0,12820
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chr1	1506320	.	A	AGG	7361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=-1.828;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.547;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,181:393:99:7399,0,8700
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chr1	1512182	.	C	T	10854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=1.345;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.329;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,281:568:99:10883,0,13891
chr1	1513358	.	A	AAT	12277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-1.310;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQRankSum=-0.192;QD=30.63;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,323:325:99:12315,914,0
chr1	1513970	.	GCTCGCTTACA	G	5892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=1.490;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-0.598;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.102;SOR=1.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,200:476:99:5930,0,10857
chr1	1514039	.	T	C	7513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.382;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.108;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.807;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,254:550:99:7542,0,8874
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chr1	1521633	.	C	G	9555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.077;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.114;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,252:542:99:9584,0,11358
chr1	1521640	.	T	C	9718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.414;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.113;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,249:541:99:9747,0,11752
chr1	1521645	.	C	G	9549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.728;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.667;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,246:534:99:9578,0,11482
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chr1	1524296	.	T	C	12419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.525;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.209;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,306:604:99:12448,0,12094
chr1	1524311	.	G	A	11622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.174;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.222;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,306:608:99:11651,0,11571
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chr1	1528497	.	G	A	8969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=-0.393;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.561;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,228:482:99:8998,0,10203
chr1	1528505	.	A	G	8708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=1.753;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.811;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,222:471:99:8737,0,9769
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chr1	1585425	.	A	G	12412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.299;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.203;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,305:586:99:12441,0,11261
chr1	1585428	.	T	G	12215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.654;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.800;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.541;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,312:604:99:12244,0,11183
chr1	1585467	.	A	G	8680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.707;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.014;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,297:612:99:8709,0,9359
chr1	1589582	.	T	C	7666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.222;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.812;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,247:520:99:7695,0,10234
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chr1	1597414	.	G	A	9507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.206;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.309;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,291:563:99:9536,0,8602
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chr1	1604473	.	C	T	10667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.190;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.100;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,269:574:99:10696,0,12280
chr1	1604478	.	A	G	10436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.674;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.004;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,265:568:99:10465,0,12526
chr1	1604521	.	C	A	9717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=1.579;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.031;QD=16.36;ReadPosRankSum=2.301;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,273:594:99:9746,0,12298
chr1	1604985	.	A	G	11540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-1.405;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.621;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,296:603:99:11569,0,16052
chr1	1604988	.	A	G	11661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-1.559;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.007;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,301:613:99:11690,0,16097
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chr1	1619125	.	T	C	8246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-0.236;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.075;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,264:537:99:8275,0,8441
chr1	1619150	.	TGATA	T	9197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.667;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.145;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,238:513:99:9235,0,11046
chr1	1619168	.	T	C	9400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.584;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.777;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,248:537:99:9429,0,11028
chr1	1620298	.	G	A	7590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.561;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.417;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,257:572:99:7619,0,10051
chr1	1620316	.	A	G	8234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.385;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.024;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,272:574:99:8263,0,9489
chr1	1620674	.	T	C	10077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=-0.707;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.197;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,262:576:99:10106,0,12268
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chr1	1625419	.	G	A	11002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.480;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.614;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,268:560:99:11031,0,11616
chr1	1625431	.	G	A	11326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.193;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.442;QD=19.56;ReadPosRankSum=2.288;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,285:579:99:11355,0,11760
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chr1	1629860	.	TA	T	5143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=1.979;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.821;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,232:497:99:5181,0,6007
chr1	1629894	.	T	TA	21430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.696;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQRankSum=-0.158;QD=33.48;ReadPosRankSum=-1.847;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,539:543:99:21468,1482,0
chr1	1630123	.	A	T	9829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.587;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.737;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.706;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,308:598:99:9858,0,10987
chr1	1631803	.	A	C	9893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=1.483;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.530;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.794;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,261:549:99:9922,0,10883
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chr1	1634811	.	GAAAGAAATAGA	G	9360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=-1.321;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-3.377;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,249:534:99:9398,0,10968
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chr1	1635268	.	G	A	8177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.426;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=4.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.216;QD=16.72;ReadPosRankSum=2.895;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,265:489:99:8206,0,6831
chr1	1635488	.	C	T	6923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=-1.396;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.235;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,230:510:99:6952,0,8413
chr1	1636812	.	T	C	12771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=1.229;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.142;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,337:648:99:12800,0,20459
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chr1	1637487	.	T	G	11176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.245;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.422;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,282:565:99:11205,0,11540
chr1	1637491	.	G	A	11558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.836;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=5.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.118;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,288:572:99:11587,0,11406
chr1	1637495	.	T	C	11399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.500;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.524;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,296:588:99:11428,0,11274
chr1	1637772	.	C	T	5986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-0.183;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.178;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,217:443:99:6015,0,6563
chr1	1638951	.	G	A	6805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=1.223;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=11.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.443;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,181:344:99:6834,0,9552
chr1	1638962	.	A	G	6802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=-0.576;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=8.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.078;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.236;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,178:362:99:6831,0,10098
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chr1	1641859	.	T	C	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.454;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=10.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.261;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.635;SOR=1.375	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,71:191:99:2631,0,6269
chr1	1641871	.	C	G	3011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.666;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=13.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.118;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,78:198:99:3040,0,6283
chr1	1641873	.	G	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-0.772;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=11.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.534;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.516;SOR=1.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,79:195:99:3018,0,6286
chr1	1642490	.	GATGATGATATTATGA	G	5047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=-0.570;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-2.579;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,141:429:99:5085,0,11799
chr1	1642513	.	GATGGAAAATAGTATGGAAAATAGT	G	5094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.906;ClippingRankSum=2.049;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=7.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-2.407;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,141:450:99:5132,0,12824
chr1	1642548	.	A	T	5052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.043;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=13.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-1.467;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,138:387:99:5081,0,10001
chr1	1643315	.	A	G	3508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-0.756;DP=757;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=0.528;QD=5.18;ReadPosRankSum=2.530;SOR=0.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:511,167:678:99:3537,0,18702
chr1	1643521	.	G	A	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=1.167;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.249;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:468,105:573:99:1728,0,18528
chr1	1643605	.	T	TA	10227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.850;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.780;QD=17.82;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,258:574:99:10265,0,12385
chr1	1643616	.	C	G	10938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.555;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.469;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,271:579:99:10967,0,12837
chr1	1643633	.	C	T	10506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=-0.628;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.199;QD=17.87;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,278:588:99:10535,0,11967
chr1	1644125	.	C	G	9881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.236;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.291;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,258:522:99:9910,0,15071
chr1	1644129	.	C	T	9823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.175;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.257;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,255:516:99:9852,0,14916
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chr1	1654885	.	G	A	8790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.016;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.177;QD=18.13;ReadPosRankSum=-2.711;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,227:485:99:8819,0,10374
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chr1	1654927	.	G	C	8897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.829;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.395;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,229:467:99:8926,0,9106
chr1	1654960	.	A	G	8962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=-0.560;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.171;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,230:469:99:8991,0,9329
chr1	1654966	.	GTATTTA	G	9235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=1.475;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.033;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.089;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,233:491:99:9273,0,10302
chr1	1654993	.	T	C	10274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-1.609;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.050;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,253:491:99:10303,0,9538
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chr1	1659533	.	G	A	10225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=-0.892;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=6.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.207;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.023;SOR=1.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,273:592:99:10254,0,19237
chr1	1659867	.	A	T	8042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.659;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.213;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,210:451:99:8071,0,9409
chr1	1659880	.	CA	C	7859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-1.783;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.335;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.433;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,210:464:99:7897,0,9757
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chr1	1666972	.	A	G	5846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.348;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.696;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,161:345:99:5875,0,7054
chr1	1667005	.	G	C	4466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.063;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.816;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,146:281:99:4495,0,3823
chr1	1667038	.	G	A	6007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.438;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.584;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,161:334:99:6036,0,6643
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chr1	1675043	.	T	C	10789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.041;ClippingRankSum=-2.189;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.687;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.811;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,270:543:99:10818,0,11088
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chr1	1675057	.	A	C	11395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.523;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.121;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,279:546:99:11424,0,10794
chr1	1675075	.	A	G	11637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.094;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.349;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,287:557:99:11666,0,10764
chr1	1675082	.	T	C	11234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.845;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=4.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.620;QD=20.39;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,284:551:99:11263,0,10392
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chr1	1681025	.	A	G	9158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.042;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.288;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.685;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,231:453:99:9187,0,10710
chr1	1681026	.	A	C	9214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.283;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.306;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.558;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,232:456:99:9243,0,10815
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chr1	1688254	.	T	C	10208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=1.656;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.089;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.782;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,337:641:99:10237,0,9095
chr1	1688795	.	CA	C	7057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.197;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.421;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,251:499:99:7095,0,6797
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chr1	1694243	.	T	C	11097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-1.598;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.391;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,279:576:99:11126,0,12063
chr1	1694247	.	A	T	11156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-1.530;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.445;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,288:588:99:11185,0,11782
chr1	1694415	.	T	C	12033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.502;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.607;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,313:557:99:12062,0,9510
chr1	1694435	.	T	C	12770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=-0.024;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.105;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.264;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,311:564:99:12799,0,9897
chr1	1694453	.	C	A	12031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.525;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.067;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,287:552:99:12060,0,10661
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chr1	1705940	.	C	T	7602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.794;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.180;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,205:423:99:7631,0,8118
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chr1	1713279	.	T	C	8794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.346;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=9.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.285;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,224:416:99:8823,0,7463
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chr1	1715077	.	T	C	5948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=-0.057;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.012;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,202:422:99:5977,0,8337
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chr1	1718200	.	C	T	9420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.278;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.492;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,256:589:99:9449,0,12968
chr1	1718710	.	C	CTTTT,CTTTTTTTT	5064.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.489;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-1.466;QD=32.49;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,34,48:83:99:5102,1722,1382,1200,0,1040
chr1	1718751	.	A	G	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.991;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.864;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,95:200:99:2681,0,3276
chr1	1718830	.	GA	G	3685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.101;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.542;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.477;SOR=1.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,152:306:99:3723,0,3725
chr1	1719658	.	A	G	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.041;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.095;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,270:545:99:8559,0,8455
chr1	1719694	.	C	T	9687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.189;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.369;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,324:615:99:9716,0,8646
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chr1	1726326	.	C	T	10045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.469;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.332;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,270:555:99:10074,0,11509
chr1	1726343	.	T	C	9505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.931;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.083;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,252:510:99:9534,0,10802
chr1	1726461	.	T	G	7856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.386;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.079;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,203:454:99:7885,0,14605
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chr1	1730690	.	T	C	4170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=1.304;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.039;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,130:253:99:4199,0,3905
chr1	1733999	.	C	T	7900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=1.671;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.184;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,207:419:99:7929,0,8272
chr1	1734002	.	C	T	7882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.059;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.395;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,201:415:99:7911,0,8366
chr1	1734386	.	C	T	8654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.291;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.485;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,221:436:99:8683,0,8375
chr1	1734398	.	C	T	8626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-0.877;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.390;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,221:434:99:8655,0,8196
chr1	1734624	.	ACTTTATGCTTATGCTCTC	A	8481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=-0.164;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.499;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,230:588:99:8519,0,14213
chr1	1734675	.	C	T	8307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.178;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.097;QD=13.96;ReadPosRankSum=-3.241;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,269:595:99:8336,0,10611
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chr1	1739595	.	GA	G	8343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.569;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.108;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,223:467:99:8381,0,9204
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chr1	1743012	.	TA	T	11452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.622;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.364;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,290:555:99:11490,0,10655
chr1	1743016	.	A	G	11226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=1.471;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.310;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,285:548:99:11255,0,10189
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chr1	1747171	.	A	G	9824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=-0.532;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.277;QD=19.26;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,251:510:99:9853,0,10324
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chr1	1747189	.	A	G	10105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.098;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.118;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.107;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,241:508:99:10134,0,11052
chr1	1747190	.	T	C	9928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.334;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.273;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,241:512:99:9957,0,11190
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chr1	1765952	.	T	C	8612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.413;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=3.746;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,217:476:99:8641,0,10576
chr1	1765983	.	A	G	9138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=-1.711;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-1.587;QD=18.35;ReadPosRankSum=-5.106;SOR=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,227:498:99:9167,0,11290
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chr1	1767094	.	T	A	10491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-1.142;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.686;QD=20.37;ReadPosRankSum=2.991;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,269:515:99:10520,0,9567
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chr1	1768147	.	G	C	8212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.827;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.627;QD=18.37;ReadPosRankSum=2.482;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,211:447:99:8241,0,9003
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chr1	1770915	.	C	T	8633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.205;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.683;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,231:505:99:8662,0,10869
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chr1	1775912	.	G	A	5831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=1.475;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=17.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-1.415;QD=21.36;ReadPosRankSum=1.225;SOR=1.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,147:273:99:5860,0,4856
chr1	1776225	.	TTTTTCCTCGTTC	T	2879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.164;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=8.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-6.329;QD=7.68;ReadPosRankSum=-8.592;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,104:375:99:2917,0,10756
chr1	1776233	.	CGTT	C	9983.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.948;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=6.462;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,271:607:99:10021,0,12812
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chr1	1780358	.	TTC	T	7384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.269;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.049;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,198:420:99:7422,0,8420
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chr1	1786248	.	C	T	10563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=-1.688;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=2.801;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,275:542:99:10592,0,10557
chr1	1786251	.	T	C	10641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.924;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=2.988;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,280:556:99:10670,0,10620
chr1	1786289	.	CCTGCATTTGCTGCTG	C	7380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=1.096;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-4.462;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,199:450:99:7418,0,9738
chr1	1786332	.	G	A	7764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-2.070;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-1.255;QD=15.28;ReadPosRankSum=-2.543;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,249:508:99:7793,0,7983
chr1	1786368	.	CTGT	C	9225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-2.176;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-2.285;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,228:463:99:9263,0,9229
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chr1	1791449	.	G	A	7811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.174;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.409;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,250:490:99:7840,0,7195
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chr1	1793335	.	AATGAAGAATCGTTGAAGAATTCAG	A	9722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-1.384;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-2.791;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,255:620:99:9760,0,20975
chr1	1793373	.	GATCAATTCAAGATCAATTCA	G	7273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;ClippingRankSum=-0.248;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=0.337;QD=12.72;ReadPosRankSum=-2.813;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,193:572:99:7311,0,18685
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chr1	1793402	.	AAGATCAATTCAG	A	5923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;ClippingRankSum=-0.512;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=0.177;QD=11.30;ReadPosRankSum=-7.990;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,164:524:99:5961,0,15405
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chr1	1793685	.	A	G	8498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=1.153;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.510;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,223:471:99:8527,0,9662
chr1	1793688	.	G	A	8422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.453;ClippingRankSum=2.171;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.761;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,222:460:99:8451,0,9561
chr1	1794045	.	G	T	6720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-2.137;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=6.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.331;QD=17.69;ReadPosRankSum=2.720;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,209:380:99:6749,0,5108
chr1	1794525	.	G	T	5428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=1.378;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.095;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,142:286:99:5457,0,5571
chr1	1794528	.	C	A	5480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.196;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.062;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,143:287:99:5509,0,5600
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chr1	1796914	.	T	C	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.062;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.246;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,237:440:99:9408,0,8257
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chr1	1798715	.	TATTAGCATGGGTATTCATGGAAAGAGCGCACAGTGATGCAAAGGTGCATTCATGGAGATAAGATG	T	15695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.326;ClippingRankSum=0.685;DP=962;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-6.990;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.889;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:526,410:936:99:15733,0,20942
chr1	1798812	.	G	GA	12734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=-0.990;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-6.810;QD=18.92;ReadPosRankSum=-6.345;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,396:673:99:12772,0,8280
chr1	1798884	.	T	A	8465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.923;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.974;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,231:497:99:8494,0,9990
chr1	1798904	.	A	G	7521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.108;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=4.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.775;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.805;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,210:481:99:7550,0,10489
chr1	1799038	.	A	ACC	7149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.704;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.976;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,210:460:99:7187,0,8626
chr1	1799982	.	G	A	8920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.057;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.545;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,236:466:99:8949,0,8774
chr1	1799997	.	C	T	9382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.350;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.779;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,232:449:99:9411,0,8623
chr1	1800003	.	A	C	9023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.397;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.230;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,228:436:99:9052,0,8250
chr1	1800015	.	T	G	8511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-0.700;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.087;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,211:420:99:8540,0,8022
chr1	1800051	.	C	T	7652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=1.312;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.268;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,194:410:99:7681,0,8452
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chr1	1806429	.	C	G	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.304;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.060;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.725;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,144:306:99:4704,0,5258
chr1	1806571	.	T	C	5807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=-0.585;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.544;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,188:425:99:5836,0,7310
chr1	1806646	.	T	G	7159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.067;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.488;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,251:548:99:7188,0,8779
chr1	1806671	.	CTG	C	8096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.561;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=5.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.040;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,243:550:99:8134,0,10624
chr1	1806720	.	ATT	A,AT	15877.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.308;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.271;QD=30.19;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:11,269,246:526:99:15915,5421,5278,10187,0,9649
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chr1	1810604	.	G	C	6114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=-1.783;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.924;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,156:319:99:6143,0,6438
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chr1	1817607	.	C	T	9616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;ClippingRankSum=-0.430;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-3.005;QD=17.39;ReadPosRankSum=2.334;SOR=1.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,246:553:99:9645,0,12567
chr1	1817614	.	GTGTAATGAATAATGAATCTAATGAGTGAGCCTAATAAA	G	9231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;ClippingRankSum=-0.603;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=7.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-0.314;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.369;SOR=1.165	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:394,249:643:99:9269,0,16021
chr1	1817685	.	C	T	8508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.724;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=18.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-1.687;QD=16.05;ReadPosRankSum=-3.953;SOR=1.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,251:530:99:8537,0,9382
chr1	1817706	.	AAATTTAATGAACATAGTAAATCTAATGAATAATAAGTCTGATG	A	8173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.208;ClippingRankSum=1.512;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=0.087;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,221:552:99:8211,0,12975
chr1	1817927	.	GAATAATGAATCTAATGTGTCTTATA	G	7934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.218;ClippingRankSum=-0.940;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-1.174;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,213:512:99:7972,0,11770
chr1	1818038	.	G	GTCAA	11331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.227;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.330;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.888;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,292:605:99:11369,0,12128
chr1	1818770	.	G	A	7136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=1.059;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.688;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,227:432:99:7165,0,6134
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chr1	1826813	.	T	C	11136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.709;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.315;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,294:628:99:11165,0,12893
chr1	1826828	.	G	A	11688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=1.589;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.247;QD=18.21;ReadPosRankSum=-2.251;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,311:642:99:11717,0,12764
chr1	1826867	.	A	G	13130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.097;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.017;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.627;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,339:638:99:13159,0,11323
chr1	1826876	.	C	T	12821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.043;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.408;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,329:626:99:12850,0,11445
chr1	1826965	.	T	G	11930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.385;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.574;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,315:624:99:11959,0,11633
chr1	1826983	.	G	A	11149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.354;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.132;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,300:605:99:11178,0,11776
chr1	1827103	.	A	G	11363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.246;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=4.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.032;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.662;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,293:621:99:11392,0,16998
chr1	1827107	.	T	C	11323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-1.307;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.133;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.916;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,289:611:99:11352,0,17077
chr1	1827108	.	T	G	11241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=1.401;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=18.55;ReadPosRankSum=2.003;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,286:606:99:11270,0,16995
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chr1	1835248	.	G	A	10868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=-0.360;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.656;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,279:555:99:10897,0,10574
chr1	1835265	.	A	C	11799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.891;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.391;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,285:557:99:11828,0,10296
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chr1	1849726	.	T	C	8428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=1.262;DP=987;ExcessHet=3.0103;FS=10.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.438;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.316	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:403,326:729:99:8457,0,19376
chr1	1849794	.	T	TTTTCTTTTTCTCTTTTTCTCTTTTTCTCCTTTTTTTTTCCTTTCCCTTTTCTCTTTCTCTCCTTTTTTTCTCCCGTTTCC	3192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.626;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=37.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=0.255;QD=9.53;ReadPosRankSum=-14.050;SOR=0.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,124:335:99:3230,0,13278
chr1	1850556	.	C	T	9719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=1.824;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.369;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,257:604:99:9748,0,16267
chr1	1850559	.	C	G	9813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.176;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.065;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,262:601:99:9842,0,16203
chr1	1851305	.	T	C	7897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.247;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.143;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,278:558:99:7926,0,8666
chr1	1851448	.	G	GT	7957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.515;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.063;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,266:581:99:7995,0,9996
chr1	1851504	.	GCAC	G	9688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.370;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.387;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,257:525:99:9726,0,10213
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chr1	1852160	.	G	A	10012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.448;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.456;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,310:571:99:10041,0,7760
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chr1	1856544	.	A	T	9623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.473;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.470;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.353;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,248:486:99:9652,0,13093
chr1	1856551	.	G	A	9748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.503;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.769;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,254:496:99:9777,0,13188
chr1	1856655	.	T	G	10256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.093;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.190;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,275:565:99:10285,0,10879
chr1	1856669	.	AT	A	5233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.362;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.428;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,249:547:99:5271,0,11491
chr1	1856712	.	C	T	8499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.057;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.117;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,279:560:99:8528,0,8831
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chr1	1868381	.	G	A	12778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.436;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.484;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,320:637:99:12807,0,12549
chr1	1868404	.	C	T	11915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=1.410;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.217;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.856;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,314:625:99:11944,0,11851
chr1	1913986	.	A	ATT	1261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=2.012;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=1.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.147;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,68:149:99:1299,0,1962
chr1	1918833	.	C	A	8929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.775;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,287:581:99:8958,0,8980
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chr1	1929933	.	TATA	T	11770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.211;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.238;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,307:653:99:11808,0,13330
chr1	1931148	.	A	G	9154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=-1.138;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.417;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,304:580:99:9183,0,7606
chr1	1931554	.	GCCAAGAAAGGTCGCACCCCCTAATTTAGTTTAGTCAATATA	G	20003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-0.945;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQRankSum=2.406;QD=33.05;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,451:453:99:20041,1367,0
chr1	1933840	.	C	T	7968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.696;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.795;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,282:614:99:7997,0,10073
chr1	1934206	.	A	G	10547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.653;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.028;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.665;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,336:647:99:10576,0,9770
chr1	1934528	.	T	G	29688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=1.104;DP=844;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.787;QD=29.75;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,794:796:99:29717,2342,0
chr1	1936341	.	TA	T	5798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.378;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.560;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,248:545:99:5836,0,7772
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chr1	1945690	.	TTGTC	T	9952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=2.429;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.580;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,282:565:99:9990,0,10766
chr1	1945910	.	T	C	10768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-0.054;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.740;QD=18.13;ReadPosRankSum=5.225;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,281:594:99:10797,0,12204
chr1	1945926	.	T	C	11494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=0.112;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.696;QD=18.05;ReadPosRankSum=2.603;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,311:637:99:11523,0,12359
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chr1	1945971	.	G	A	12888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=1.416;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.901;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,316:635:99:12917,0,12847
chr1	1945979	.	T	C	12688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-0.063;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.012;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,331:646:99:12717,0,12273
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chr1	1957697	.	T	G	7652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-1.215;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.625;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,191:358:99:7681,0,6619
chr1	1957704	.	C	T	8139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.564;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.931;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,203:382:99:8168,0,7223
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chr1	1962673	.	G	T	10131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-0.221;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.945;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,260:494:99:10160,0,8941
chr1	1962822	.	A	G	12561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=1.055;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.922;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.545;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,326:675:99:12590,0,17372
chr1	1962832	.	T	C	12597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.812;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.065;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,333:673:99:12626,0,17203
chr1	1962867	.	G	C	10318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.178;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.900;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,336:691:99:10347,0,11209
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chr1	1973471	.	T	C	9688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.935;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.356;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,256:551:99:9717,0,11543
chr1	1973482	.	G	T	10452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.913;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.370;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.398;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,278:578:99:10481,0,11512
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chr1	1973588	.	GATTAAAGGATAA	G	9004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.207;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=9.029;QD=15.39;ReadPosRankSum=4.004;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,277:585:99:9042,0,12021
chr1	1973621	.	A	C	11942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.438;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=1.853;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,317:610:99:11971,0,10931
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chr1	1988489	.	T	C	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-1.223;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=4.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.663;QD=17.08;ReadPosRankSum=-1.638;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,277:614:99:10516,0,12914
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chr1	1995982	.	T	TACGATAAAATTCAATTATTCAATATTGTGAAAGCAGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	4230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.701;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.123;QD=18.39;ReadPosRankSum=-12.442;SOR=0.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,116:230:99:4268,0,4662
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chr1	1996711	.	G	A	13250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.710;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.183;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.632;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,361:735:99:13279,0,14179
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chr1	1997091	.	C	G	9873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.772;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.757;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,249:490:99:9902,0,9493
chr1	1997096	.	A	G	9773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.923;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.229;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,245:482:99:9802,0,9442
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chr1	2009721	.	C	T	15140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.053;DP=762;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-2.282;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,381:737:99:15169,0,14410
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chr1	2011052	.	C	A	8850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.175;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.015;QD=16.27;ReadPosRankSum=3.080;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,279:544:99:8879,0,8355
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chr1	2021227	.	A	ATTT,ATTTT	8552.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.047;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=2.545;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-0.330;QD=36.40;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:18,65,49:132:99:8590,1455,776,1308,0,811
chr1	2021670	.	C	T	10560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.856;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.082;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.838;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,277:546:99:10589,0,10394
chr1	2021679	.	A	G	11009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-1.942;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.295;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.737;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,277:538:99:11038,0,8066
chr1	2021680	.	C	T	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=1.174;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.064;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,274:540:99:10550,0,10361
chr1	2021713	.	C	G	8559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.424;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.073;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,281:549:99:8588,0,8203
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chr1	2026618	.	GATTCAGTACTCACCTCTAGTACGTTTA	G	7611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=-0.271;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=3.622;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,248:547:99:7649,0,11477
chr1	2026682	.	ACTCCTCTCAGC	A	10743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.736;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-0.110;QD=17.76;ReadPosRankSum=-3.874;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,284:605:99:10781,0,12419
chr1	2027625	.	G	T	6837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=-1.548;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.485;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,180:373:99:6866,0,7485
chr1	2027631	.	T	C	6962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=2.521;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.980;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,172:359:99:6991,0,7810
chr1	2027632	.	A	G	6910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=1.531;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=1.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.879;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,173:365:99:6939,0,8049
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chr1	2033921	.	A	G	9020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.318;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.255;QD=18.26;ReadPosRankSum=-2.002;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,235:494:99:9049,0,10210
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chr1	2037542	.	G	A	13830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.310;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.468;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,336:674:99:13859,0,13544
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chr1	2044933	.	T	C	12009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=-0.187;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.364;QD=19.88;ReadPosRankSum=3.286;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,305:604:99:12038,0,11687
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chr1	2049427	.	G	A	12153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=1.694;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.086;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,303:643:99:12182,0,13690
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chr1	2054324	.	C	T	11193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.809;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.923;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,286:540:99:11222,0,9758
chr1	2054329	.	C	A	11037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.107;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.783;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,286:545:99:11066,0,9966
chr1	2054408	.	C	CG	9922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.118;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.280;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,283:561:99:9960,0,9430
chr1	2054534	.	C	T	10776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.225;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.596;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,302:626:99:10805,0,12898
chr1	2054541	.	T	G	12213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.899;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.072;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,295:633:99:12242,0,13665
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chr1	2061260	.	C	T	5342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.038;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.306;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.004;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,182:392:99:5371,0,6547
chr1	2061282	.	G	A	8254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.577;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.362;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,210:403:99:8283,0,7350
chr1	2061286	.	G	A	8228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.596;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.577;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,214:402:99:8257,0,7321
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chr1	2064757	.	A	C	5610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=-1.641;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=16.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.167;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,145:277:99:5639,0,5012
chr1	2064791	.	A	G	4652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.409;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.222;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,124:265:99:4681,0,5435
chr1	2064798	.	G	A	4428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=-0.484;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.710;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,117:251:99:4457,0,5199
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chr1	2074382	.	T	C	10553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.838;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-2.137;QD=20.82;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,265:507:99:10582,0,9727
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chr1	2078709	.	C	G	13228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=-0.431;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.369;QD=21.23;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,341:623:99:13257,0,10955
chr1	2078715	.	C	T	13321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.717;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.394;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,336:622:99:13350,0,10926
chr1	2078739	.	T	A	12629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.328;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.891;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,312:599:99:12658,0,11082
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chr1	2084680	.	G	A	14126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.346;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.047;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.780;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,365:669:99:14155,0,11436
chr1	2084695	.	T	C	13509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.697;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.886;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,353:663:99:13538,0,11579
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chr1	2085609	.	G	A	10971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.698;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.651;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,285:618:99:11000,0,13820
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chr1	2087766	.	CT	C	11769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.244;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.154;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,308:597:99:11807,0,11060
chr1	2087773	.	T	C	12052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.418;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.203;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,328:626:99:12081,0,11149
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chr1	2088947	.	A	G	8616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=-0.340;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=5.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.600;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.678;SOR=0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,277:570:99:8645,0,9697
chr1	2089013	.	GA	G	6051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.646;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.612;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,252:498:99:6089,0,5940
chr1	2089120	.	C	T	8282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.456;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.241;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.720;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,279:538:99:8311,0,7829
chr1	2089387	.	CATCAT	C	11235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.117;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.832;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.041;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,297:623:99:11273,0,12652
chr1	2089511	.	C	T	9421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.088;ClippingRankSum=0.617;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.070;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,332:673:99:9450,0,10698
chr1	2090663	.	C	T	7502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=1.115;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.260;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,262:540:99:7531,0,8256
chr1	2090723	.	T	C	9230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.057;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.899;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,241:517:99:9259,0,10588
chr1	2090738	.	C	G	9027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.030;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.444;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,243:522:99:9056,0,10477
chr1	2090807	.	G	T	10058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.722;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.613;QD=19.53;ReadPosRankSum=-2.167;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,263:515:99:10087,0,9745
chr1	2090821	.	A	G	10256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=1.116;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.914;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,254:522:99:10285,0,10755
chr1	2090835	.	A	G	10118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.242;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.631;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:10147,0,10304
chr1	2091574	.	TAGGAAGTGAGGAGGTAATAAGATAGGGAGTAAAAGATAAATA	T	5621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.248;ClippingRankSum=-1.331;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.964;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.264;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:407,175:582:99:5659,0,15704
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chr1	2093141	.	T	C	6126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=1.588;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.339;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,159:313:99:6155,0,5796
chr1	2093336	.	A	G	4507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.582;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.384;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,127:304:99:4536,0,6672
chr1	2093355	.	A	G	4751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.077;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.332;QD=15.58;ReadPosRankSum=2.050;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,132:305:99:4780,0,6522
chr1	2093599	.	GAAGGGATATTTGAAGGGATTATTTGAAGGGGAATTGATGAATTATTTA	G	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.58;QD=30.11;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:99:494,153,0
chr1	2093836	.	T	G	12102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.610;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=1.371;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,312:612:99:12131,0,11662
chr1	2093847	.	T	C	11895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.646;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=3.450;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,305:617:99:11924,0,11951
chr1	2093890	.	CATTTACTTCATAATGAGGAATG	C	8605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.157;DP=749;ExcessHet=3.0103;FS=5.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-1.898;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,252:620:99:8643,0,13862
chr1	2093947	.	A	G	12021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.331;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=6.947;QD=19.94;ReadPosRankSum=4.631;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,315:603:99:12050,0,10765
chr1	2093960	.	A	G	11939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.646;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=4.077;QD=19.93;ReadPosRankSum=4.446;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,298:599:99:11968,0,11770
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chr1	2101104	.	C	T	12305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-1.570;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.077;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,321:605:99:12334,0,14992
chr1	2101664	.	C	T	6136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.867;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.183;QD=15.15;ReadPosRankSum=2.109;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,198:405:99:6165,0,6458
chr1	2101733	.	G	A	7372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-0.413;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.841;QD=18.34;ReadPosRankSum=2.375;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,197:402:99:7401,0,8266
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chr1	2136050	.	C	T	10185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.139;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.171;QD=19.70;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,260:517:99:10214,0,10021
chr1	2136070	.	A	G	8076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.387;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.235;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,262:516:99:8105,0,7881
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chr1	2136391	.	T	C	9661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.854;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.154;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,250:485:99:9690,0,8782
chr1	2136404	.	C	T	10901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.154;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.466;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,266:499:99:10930,0,9246
chr1	2136420	.	T	C	10300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.288;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.923;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,275:523:99:10329,0,9430
chr1	2136623	.	C	T	11105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.590;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.265;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,280:578:99:11134,0,11776
chr1	2136624	.	C	T	11262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.788;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.398;QD=19.52;ReadPosRankSum=-1.745;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,281:577:99:11291,0,11764
chr1	2136641	.	C	G	11527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.786;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.659;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,287:579:99:11556,0,11937
chr1	2136660	.	T	C	11430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=2.636;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.484;QD=19.24;ReadPosRankSum=2.206;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,300:594:99:11459,0,10940
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chr1	2144189	.	TCTATTTTCTCG	T	7048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.516;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=4.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-2.858;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,240:488:99:7086,0,9505
chr1	2145168	.	C	G	9303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=1.541;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.032;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,246:511:99:9332,0,10318
chr1	2145179	.	G	A	9264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.460;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.908;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,230:501:99:9293,0,11009
chr1	2145191	.	T	C	9359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=-0.023;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.477;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,232:511:99:9388,0,11350
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chr1	2153876	.	A	ATTT,ATT	7079.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.953;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=4.332;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.157;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.255	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:13,132,43:188:99:7117,560,490,4881,0,4933
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chr1	2156592	.	G	T	6379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-1.412;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.195;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,214:442:99:6408,0,6681
chr1	2156607	.	GAA	G	6435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=-1.259;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.197;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,207:420:99:6473,0,8015
chr1	2156622	.	T	TA	9442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.478;ClippingRankSum=-1.426;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.858;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,235:464:99:9480,0,9085
chr1	2156639	.	A	G	9559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.461;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=4.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.855;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.472;SOR=1.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,243:489:99:9588,0,9937
chr1	2156645	.	AT	A	9582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=1.151;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=2.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.757;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,252:503:99:9620,0,9781
chr1	2156688	.	G	A	7587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.687;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.154;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.720;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,253:527:99:7616,0,8176
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chr1	2165717	.	T	C	8805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.200;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.780;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,284:508:99:8834,0,8336
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chr1	2178604	.	C	CT,CTTT	2340.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.028;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=10.878;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.52;MQRankSum=1.163;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.429;SOR=1.938	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:27,54,49:130:99:2378,780,934,655,0,1700
chr1	2179744	.	T	C	7340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=-1.866;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.078;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,259:545:99:7369,0,8803
chr1	2179920	.	TC	T	8772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.137;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.358;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,267:533:99:8810,0,8803
chr1	2180368	.	A	C	8328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=-0.410;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.126;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,219:483:99:8357,0,10597
chr1	2180374	.	T	A	8444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=1.066;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.218;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,212:478:99:8473,0,10818
chr1	2180386	.	G	T	7947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.837;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.612;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,209:470:99:7976,0,10330
chr1	2181179	.	A	ATT	6946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=1.029;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.676;QD=18.62;ReadPosRankSum=-3.362;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,178:373:99:6984,0,7561
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chr1	2184405	.	C	T	10174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.798;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.432;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,255:527:99:10203,0,10920
chr1	2184408	.	G	A	10303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=2.196;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.196;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,254:520:99:10332,0,10621
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chr1	2191642	.	G	A	11033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=-0.473;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.505;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,287:589:99:11062,0,11842
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chr1	2196523	.	C	T	7257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.248;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.438;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,191:384:99:7286,0,7713
chr1	2196559	.	A	C	7946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-0.444;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.171;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,205:414:99:7975,0,8031
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chr1	2201912	.	C	T	5790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.458;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.165;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,190:381:99:5819,0,6126
chr1	2201930	.	T	C	5730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=-1.625;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.391;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,192:377:99:5759,0,5343
chr1	2211929	.	GCACAATTTCAAATCTATCTCT	G	7035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-1.035;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQRankSum=-1.093;QD=30.09;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.356	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,178:179:99:7073,592,0
chr1	2220396	.	GA	G	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.191;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.103;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.015;SOR=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,44:200:99:330,0,3061
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chr1	2228797	.	A	G	7948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.359;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.084;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,200:393:99:7977,0,7773
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chr1	2231322	.	C	A	3883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.461;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.264;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,135:301:99:3912,0,5083
chr1	2231675	.	CT	C	3907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.596;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.247;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,172:381:99:3945,0,4903
chr1	2232618	.	C	T	6502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.269;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.644;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,209:413:99:6531,0,6456
chr1	2232687	.	A	G	6012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.892;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=7.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.658;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,196:395:99:6041,0,7343
chr1	2232756	.	ACAACAACAGCAG	A	5290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=1.060;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=0.421;QD=12.78;ReadPosRankSum=2.184;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,170:414:99:5328,0,9783
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chr1	2233049	.	A	G	10828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-2.120;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.556;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,280:540:99:10857,0,9876
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chr1	2236920	.	T	TA	4879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.387;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.096;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.747;SOR=1.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,195:424:99:4917,0,6007
chr1	2237050	.	T	TTATATATATATATA	1460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=-0.322;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=8.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-1.154;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,47:115:99:1498,0,2994
chr1	2238412	.	AC	A	13355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.146;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.121;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,337:623:99:13393,0,11328
chr1	2238419	.	G	A	11471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-1.484;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.691;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.550;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,338:634:99:11500,0,11464
chr1	2238479	.	C	T	11546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.540;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.761;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,295:619:99:11575,0,12761
chr1	2238481	.	A	T	11546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=1.211;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.324;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,297:624:99:11575,0,12760
chr1	2238696	.	T	C	6466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=-1.230;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.391;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,222:409:99:6495,0,5627
chr1	2240056	.	A	T	8692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.770;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.178;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.395;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,233:457:99:8721,0,8398
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chr1	2245804	.	G	A	7799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.498;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.589;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,207:438:99:7828,0,8795
chr1	2245816	.	C	A	7750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=1.506;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.961;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,198:419:99:7779,0,8828
chr1	2245826	.	G	T	7927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-2.199;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.071;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.594;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,210:437:99:7956,0,9033
chr1	2246032	.	T	C	6759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.790;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.066;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,212:447:99:6788,0,7633
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chr1	2248196	.	AT	A	9950.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.513;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.747;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,267:571:99:9988,0,11883
chr1	2248496	.	A	G	6640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=-0.134;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.782;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,172:356:99:6669,0,7184
chr1	2248501	.	T	G	6883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=1.427;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.883;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,178:362:99:6912,0,7243
chr1	2249698	.	C	T	7858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=1.060;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=7.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.007;QD=19.90;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,203:395:99:7887,0,7235
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chr1	2259636	.	G	C	9656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=1.514;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.093;QD=18.39;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,246:525:99:9685,0,11269
chr1	2259651	.	A	G	9353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.608;ClippingRankSum=-1.009;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.154;QD=18.38;ReadPosRankSum=-2.440;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,246:509:99:9382,0,10190
chr1	2260178	.	G	A	7549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.744;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.163;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,239:460:99:7578,0,6680
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chr1	2268009	.	T	TG	9218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=1.475;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.256;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,236:462:99:9256,0,8805
chr1	2268011	.	GA	G	9248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.006;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.701;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,233:459:99:9286,0,8921
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chr1	2271919	.	C	G	5156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.933;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.081;QD=15.72;ReadPosRankSum=-7.505;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,166:328:99:5185,0,4939
chr1	2272258	.	T	C	9018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.604;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.986;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,228:486:99:9047,0,10144
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chr1	2279305	.	G	C	5158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.839;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.625;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.491;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,132:289:99:5187,0,6274
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chr1	2281523	.	C	CT	8289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-0.262;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.336;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,212:428:99:8327,0,8552
chr1	2281539	.	G	A	8417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.309;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.429;QD=19.62;ReadPosRankSum=-2.395;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,209:429:99:8446,0,9211
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chr1	2284470	.	C	T	6255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.894;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.192;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,177:383:99:6284,0,7996
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chr1	2288048	.	GTATGGGTGTTCCGCCGGCGGGAAA	G	5544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.415;ClippingRankSum=-0.407;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=5.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-0.826;QD=15.98;ReadPosRankSum=2.738;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,152:347:99:5582,0,7406
chr1	2288727	.	T	C	8584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.142;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.568;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,272:544:99:8613,0,8746
chr1	2288852	.	A	G	8992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.608;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.639;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,263:490:99:9021,0,8451
chr1	2288864	.	C	A	9167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.280;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.892;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,228:445:99:9196,0,8598
chr1	2288876	.	T	C	8498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.581;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.079;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,226:448:99:8527,0,8448
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chr1	2296596	.	G	A	3702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.991;ClippingRankSum=-0.076;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.140;QD=9.19;ReadPosRankSum=3.893;SOR=1.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,181:403:99:3731,0,6010
chr1	2296598	.	A	G	3702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.897;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=5.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.699;QD=9.17;ReadPosRankSum=3.435;SOR=1.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,181:404:99:3731,0,6010
chr1	2296676	.	G	T	10723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.472;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.069;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.599;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,279:498:99:10752,0,8024
chr1	2296684	.	T	A	10649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.672;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.817;QD=22.00;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,272:484:99:10678,0,7876
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chr1	2307017	.	G	GA	1203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.961;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.827;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.505;SOR=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,95:216:99:1241,0,5711
chr1	2307034	.	TTTGA	T	6613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=-0.893;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.413;QD=17.36;ReadPosRankSum=3.728;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,176:381:99:6651,0,7841
chr1	2307068	.	ACT	A	6590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.013;ClippingRankSum=0.744;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.088;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,170:344:99:6628,0,6877
chr1	2307085	.	C	T	6598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.905;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.755;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,175:365:99:6627,0,7049
chr1	2307361	.	T	C	6630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.884;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=8.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.235;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,173:351:99:6659,0,7034
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chr1	2314298	.	T	A	6316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.578;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.548;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,162:345:99:6345,0,7764
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chr1	2314716	.	G	A	9392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.307;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.018;QD=21.15;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,239:444:99:9421,0,8158
chr1	2314717	.	TA	T	9310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.653;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.233;QD=20.88;ReadPosRankSum=-2.946;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,237:446:99:9348,0,8090
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chr1	2318680	.	C	T	9218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.603;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.558;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,240:486:99:9247,0,9727
chr1	2319860	.	A	G	6623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.260;DP=372;ExcessHet=3.0103;FS=10.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.493;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,169:351:99:6652,0,7279
chr1	2319862	.	A	G	6737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.045;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.234;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,168:353:99:6766,0,7438
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chr1	2328864	.	G	A	7569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.214;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.685;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,248:471:99:7598,0,6934
chr1	2328901	.	A	T	9647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.523;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.590;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,253:495:99:9676,0,9254
chr1	2328912	.	C	T	9525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-2.238;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.034;QD=19.64;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,250:485:99:9554,0,9048
chr1	2329206	.	A	C	7224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=1.346;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.198;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,227:461:99:7253,0,7398
chr1	2331517	.	G	C	6104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.178;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.925;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.209;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,192:390:99:6133,0,5982
chr1	2332056	.	G	GAAA	8326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.215;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.739;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,207:410:99:8364,0,7850
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chr1	2336674	.	C	T	9156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.841;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.643;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,240:479:99:9185,0,13178
chr1	2336685	.	T	C	9278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.255;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.628;QD=18.90;ReadPosRankSum=3.829;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,245:491:99:9307,0,13328
chr1	2336778	.	G	T	10105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.288;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.176;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.822;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,264:497:99:10134,0,8896
chr1	2336798	.	C	T	9774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-0.098;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.997;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.454;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,243:484:99:9803,0,9588
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chr1	2343809	.	G	A	10497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-1.252;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.117;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,277:551:99:10526,0,10293
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chr1	2344931	.	A	G	8090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-2.194;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.701;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,200:455:99:8119,0,10279
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chr1	2346840	.	TTATTTGTTTC	T	7844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;ClippingRankSum=-0.375;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=24.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.159;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,200:377:99:7882,0,6818
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chr1	2346916	.	C	A	5563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=-1.036;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.371;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,151:310:99:5592,0,5250
chr1	2346933	.	A	G	5909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=-0.944;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=4.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.270;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,161:325:99:5938,0,5738
chr1	2347200	.	A	C	6735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.647;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.998;QD=15.48;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,182:435:99:6764,0,10023
chr1	2347208	.	T	G	6938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.116;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.226;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,179:437:99:6967,0,10506
chr1	2347209	.	G	A	7013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.728;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.486;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,181:435:99:7042,0,10650
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chr1	2356553	.	G	A	9078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=1.375;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.770;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,236:465:99:9107,0,8884
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chr1	2376273	.	G	C	6694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.841;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.591;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,204:382:99:6723,0,5488
chr1	2376311	.	A	AT	1458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.713;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.693;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.503;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,99:218:99:1496,0,1904
chr1	2378803	.	A	G	10665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.339;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.104;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,282:521:99:10694,0,14347
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chr1	2387071	.	T	C	10825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-1.343;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.246;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,265:570:99:10854,0,12339
chr1	2387091	.	C	T	9644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.204;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.968;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,242:528:99:9673,0,11643
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chr1	2389416	.	A	T	9465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.171;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.779;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,244:497:99:9494,0,14307
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chr1	2412441	.	T	C	10662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=-1.102;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.790;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,265:521:99:10691,0,9879
chr1	2412446	.	G	T	10902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.078;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.255;QD=21.21;ReadPosRankSum=-1.431;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,270:514:99:10931,0,9708
chr1	2412448	.	C	T	10752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.763;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.311;QD=20.80;ReadPosRankSum=-1.467;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,273:517:99:10781,0,9506
chr1	2412498	.	AGTTG	A	8883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=1.078;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.444;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,237:508:99:8921,0,10502
chr1	2412553	.	TTATATAGTTCAGTAAACACAAAAGAGAG	T	8633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.888;ClippingRankSum=1.538;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.199;QD=15.73;ReadPosRankSum=-3.327;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,227:549:99:8671,0,13067
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chr1	2426595	.	A	G	12320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=-0.372;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.182;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,309:614:99:12349,0,11767
chr1	2426832	.	C	T	8155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.216;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.454;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,276:567:99:8184,0,10789
chr1	2429281	.	C	A	9132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.704;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.738;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,246:479:99:9161,0,8250
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chr1	2437513	.	A	G	8864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.005;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.680;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,232:466:99:8893,0,8819
chr1	2437529	.	A	G	8937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=2.278;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.678;QD=19.14;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,240:467:99:8966,0,8603
chr1	2438241	.	A	G	10000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=1.796;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.413;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,329:612:99:10029,0,8301
chr1	2438268	.	C	T	12447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-0.089;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.544;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,318:604:99:12476,0,10863
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chr1	2449092	.	G	T	9280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.325;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.823;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,249:535:99:9309,0,11045
chr1	2449415	.	G	C	9758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=1.180;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.195;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,242:519:99:9787,0,11053
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chr1	2454624	.	ATGATG	A	8389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.699;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.585;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,278:589:99:8427,0,12171
chr1	2454630	.	A	C	8434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.198;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.851;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,281:576:99:8463,0,11667
chr1	2454792	.	ACAG	A	9275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=1.749;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.089;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,237:497:99:9313,0,10276
chr1	2454797	.	A	T	9704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.638;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.846;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,242:497:99:9733,0,10285
chr1	2454803	.	C	T	9874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-1.272;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.594;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,243:483:99:9903,0,9859
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chr1	2454820	.	G	C	9606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.971;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.805;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,239:496:99:9635,0,10301
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chr1	2459783	.	G	A	9650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-1.021;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.370;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,252:521:99:9679,0,10398
chr1	2459786	.	C	T	9832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.856;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=5.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.791;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,245:505:99:9861,0,10527
chr1	2459789	.	T	A	9614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.463;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.013;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=1.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,243:506:99:9643,0,10237
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chr1	2466009	.	C	T	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.302;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.782;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,241:501:99:9397,0,10137
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chr1	2475341	.	A	G	10977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.548;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.911;QD=19.09;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,286:575:99:11006,0,11064
chr1	2476522	.	C	G	11383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.047;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.412;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,296:615:99:11412,0,12379
chr1	2476528	.	A	G	11673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.334;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.015;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,306:617:99:11702,0,12638
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chr1	2483668	.	A	C	10018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.734;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.744;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,245:497:99:10047,0,10123
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chr1	2483686	.	C	T	10296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.184;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.918;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,268:537:99:10325,0,10096
chr1	2483920	.	A	T	11491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.392;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.461;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,303:597:99:11520,0,14570
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chr1	2489746	.	G	GAA	8486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.176;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.929;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,210:453:99:8524,0,9374
chr1	2489749	.	G	GAC	8627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=-0.078;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.100;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.663;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,223:473:99:8665,0,9464
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chr1	2492857	.	T	C	8700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=-0.435;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.701;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,228:498:99:8729,0,10536
chr1	2492865	.	C	T	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=1.195;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.717;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,221:487:99:8884,0,11025
chr1	2492881	.	C	T	9098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-1.458;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.377;QD=18.65;ReadPosRankSum=-3.439;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,230:488:99:9127,0,10792
chr1	2492896	.	GGCATGCACATTCTT	G	9133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.543;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.739;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,225:557:99:9171,0,13671
chr1	2492923	.	A	T	9832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.886;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.410;QD=17.91;ReadPosRankSum=2.428;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,243:549:99:9861,0,12436
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chr1	2494883	.	A	G	11390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.428;ClippingRankSum=0.468;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.327;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,295:570:99:11419,0,10536
chr1	2494926	.	A	G	8452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-2.373;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.600;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,279:551:99:8481,0,8177
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chr1	2502726	.	T	C	8030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.528;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.207;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,262:589:99:8059,0,10120
chr1	2502765	.	C	T	9205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.535;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.746;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,294:568:99:9234,0,9788
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chr1	2511281	.	T	C	9267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.925;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.047;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,305:575:99:9296,0,8546
chr1	2511476	.	A	G	9097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.010;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.123;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.980;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,295:559:99:9126,0,8118
chr1	2511507	.	A	T	11320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.178;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.385;QD=21.00;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,288:539:99:11349,0,9711
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chr1	2523162	.	T	C	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=-2.343;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.046;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,208:418:99:8304,0,8261
chr1	2523171	.	G	A	8243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=1.157;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.475;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,206:403:99:8272,0,7823
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chr1	2529675	.	T	A	7531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=-0.015;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=10.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.531;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.144;SOR=1.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,193:376:99:7560,0,7603
chr1	2529676	.	G	C	7495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.572;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=25.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.421;QD=19.07;ReadPosRankSum=2.360;SOR=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,193:393:99:7524,0,7523
chr1	2530705	.	T	C	10465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.004;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.537;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,269:546:99:10494,0,14102
chr1	2530710	.	A	G	10807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-1.610;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.289;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,281:561:99:10836,0,14202
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chr1	2537039	.	T	C	10952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=-0.766;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.377;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,282:588:99:10981,0,14576
chr1	2537386	.	T	C	8259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.550;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.151;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,235:511:99:8288,0,10167
chr1	2537406	.	C	T	7820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.459;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.799;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,208:488:99:7849,0,10662
chr1	2537473	.	T	TTAC	7833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=1.869;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.024;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,199:445:99:7871,0,9534
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chr1	2541561	.	A	G	12793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.787;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.665;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,332:675:99:12822,0,18049
chr1	2541907	.	T	A	10867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.238;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.828;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.980	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,282:610:99:10896,0,16924
chr1	2541908	.	T	G	10867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.156;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.493;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,283:611:99:10896,0,16924
chr1	2543150	.	G	A	8287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=1.652;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.503;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,211:423:99:8316,0,8342
chr1	2543152	.	G	A	8287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.730;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.073;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.424;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,212:424:99:8316,0,8342
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chr1	2544632	.	T	C	10238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=0.042;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.087;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,269:549:99:10267,0,10004
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chr1	2551664	.	A	T	9437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.113;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.181;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,249:450:99:9466,0,9497
chr1	2551678	.	T	A	9239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.675;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.003;QD=20.86;ReadPosRankSum=1.220;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,234:443:99:9268,0,9654
chr1	2551708	.	CA	C	4846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-1.559;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.083;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,204:430:99:4884,0,5598
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chr1	2561450	.	T	G	9040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-1.432;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.116;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,235:472:99:9069,0,9101
chr1	2561468	.	C	T	9220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.566;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.538;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,251:501:99:9249,0,9272
chr1	2561673	.	T	C	8328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.465;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.444;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,212:459:99:8357,0,9785
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chr1	2577630	.	C	CT	2991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-1.339;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.086;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,161:330:99:3029,0,3755
chr1	2578546	.	G	A	8241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.803;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.667;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,260:520:99:8270,0,8477
chr1	2578558	.	T	C	8093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=1.743;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.923;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,264:534:99:8122,0,8424
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chr1	2587237	.	GATC	G	4798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.050;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.953;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,128:304:99:4836,0,6944
chr1	2587301	.	C	CATT	5768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.724;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=3.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.512;QD=17.22;ReadPosRankSum=-2.374;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,138:335:99:5806,0,7862
chr1	2587314	.	A	G	5229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.212;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=8.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.569;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=1.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,137:339:99:5258,0,8228
chr1	2587315	.	T	C	5400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=1.653;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=8.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.182;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,136:337:99:5429,0,8174
chr1	2587333	.	T	C	6051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-2.294;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=13.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.447;QD=16.53;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=0.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,153:366:99:6080,0,9005
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chr1	2590843	.	C	T	8292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.616;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.341;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,215:473:99:8321,0,10198
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chr1	2593854	.	G	A	9209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.783;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.216;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,239:483:99:9238,0,9292
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chr1	2605378	.	A	G	7991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.296;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.217;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,205:414:99:8020,0,8666
chr1	2605384	.	G	A	8221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-0.836;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.253;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,210:422:99:8250,0,8467
chr1	2605402	.	T	A	8017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.546;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.451;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,213:427:99:8046,0,8275
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chr1	2617100	.	T	C	7911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=1.084;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.618;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,209:431:99:7940,0,9040
chr1	2617110	.	G	A	8278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-1.983;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.236;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,212:445:99:8307,0,9175
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chr1	2622281	.	C	G	10760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=2.131;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.945;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,278:557:99:10789,0,14185
chr1	2622288	.	G	C	10979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-1.001;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.929;QD=19.40;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,284:566:99:11008,0,14151
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chr1	2634453	.	A	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.935;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=18.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.15;MQRankSum=-0.431;QD=23.15;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=0.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,52:99:99:2320,0,1816
chr1	2634454	.	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=-0.082;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=15.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.15;MQRankSum=1.078;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.833;SOR=0.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,52:98:99:2291,0,1819
chr1	2634470	.	A	G	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.270;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.74;MQRankSum=0.564;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,44:81:99:1564,0,1479
chr1	2634497	.	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.592;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.66;MQRankSum=-1.238;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,39:64:99:1027,0,596
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chr1	2636701	.	G	A	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=1.717;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=26.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.95;MQRankSum=0.813;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,115:153:99:3062,0,742
chr1	2636716	.	G	A	4119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.901;ClippingRankSum=0.706;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=61.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.22;MQRankSum=3.438;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,159:204:99:4148,0,805
chr1	2636800	.	A	G	2934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.161;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=41.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.44;MQRankSum=-2.937;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.489;SOR=1.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,129:356:99:2963,0,5669
chr1	2637269	.	G	T	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;QD=29.81;SOR=5.376	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:3982,277,0
chr1	2637274	.	T	A	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;QD=24.16;SOR=8.838	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:3750,253,0
chr1	2638981	.	T	C	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.931;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=29.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=0.896;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,92:148:99:3775,0,3157
chr1	2638982	.	A	G	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=1.551;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=29.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=0.762;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,95:153:99:3775,0,3157
chr1	2644904	.	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;QD=25.93;SOR=7.614	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1980,132,0
chr1	2644906	.	C	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;QD=33.94;SOR=7.614	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1980,132,0
chr1	2648022	.	C	T	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.57;QD=31.54;SOR=1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:596,54,0
chr1	2648036	.	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.12;QD=31.93;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:571,51,0
chr1	2648053	.	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.30;QD=30.94;SOR=3.716	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:647,60,0
chr1	2648815	.	T	A	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.98;SOR=4.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:318,30,0
chr1	2648826	.	A	G	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.92;SOR=5.670	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:507,48,0
chr1	2648846	.	C	T	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.06;SOR=6.869	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:930,90,0
chr1	2648861	.	T	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.11;SOR=7.614	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1397,132,0
chr1	2649564	.	C	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=24.54;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:200,21,0
chr1	2649590	.	G	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=33.44;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
chr1	2649593	.	T	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=25.65;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
chr1	2649611	.	G	A	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=24.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
chr1	2650021	.	A	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=27.69;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:222,21,0
chr1	2650040	.	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.85;SOR=5.549	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:476,45,0
chr1	2650064	.	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;QD=28.88;SOR=7.168	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1581,108,0
chr1	2650067	.	C	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;QD=22.59;SOR=7.223	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1581,108,0
chr1	2652278	.	T	C	5935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;QD=29.30;SOR=1.964	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:5964,412,0
chr1	2652280	.	G	A	5935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.45;QD=33.43;SOR=2.176	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:5964,412,0
chr1	2652307	.	A	G	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.03;QD=35.60;SOR=4.735	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:3707,276,0
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chr1	2664057	.	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.98;SOR=4.977	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:347,33,0
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chr1	2664980	.	GCAACTTGAACAACTTGAA	G	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=32.75;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
chr1	2668176	.	G	T	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.21;QD=30.65;SOR=1.362	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3326,229,0
chr1	2668179	.	T	C	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;QD=36.64;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3457,244,0
chr1	2668551	.	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.85;SOR=5.549	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:476,45,0
chr1	2668566	.	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.47;SOR=6.358	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:729,69,0
chr1	2668600	.	A	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.11;SOR=7.658	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1428,135,0
chr1	2668612	.	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.200;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=0.133;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.933;SOR=6.518	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,51:52:99:1588,146,0
chr1	2668640	.	C	T	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.353;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=-0.593;QD=28.91;ReadPosRankSum=1.637;SOR=7.195	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,72:73:99:2139,207,0
chr1	2668665	.	T	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=1.109;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.08;MQRankSum=0.693;QD=29.75;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=1.629	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,99:100:99:3003,290,0
chr1	2668695	.	G	A	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.78;QD=29.16;SOR=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:3761,384,0
chr1	2671147	.	T	C	8935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.52;QD=31.68;SOR=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,200:200:99:8964,611,0
chr1	2671151	.	G	A	9061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.31;QD=34.64;SOR=1.226	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:9090,617,0
chr1	2671154	.	A	T	8805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;QD=29.93;SOR=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,193:193:99:8834,596,0
chr1	2674302	.	T	C	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-2.508;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=1.929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.91;MQRankSum=0.169;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.929;SOR=1.261	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,156:160:99:4381,379,0
chr1	2677977	.	G	C	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;QD=27.95;SOR=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:783,81,0
chr1	2678698	.	CA	C	894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.53;QD=28.10;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:63:932,63,0
chr1	2678712	.	A	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.41;QD=33.64;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1091,78,0
chr1	2678740	.	CTT	C	2707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.59;QD=35.27;SOR=8.086	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2745,184,0
chr1	2678743	.	C	CCT	2797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.53;QD=31.37;SOR=8.155	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2835,190,0
chr1	2678762	.	GGACT	G	4050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.78;QD=30.94;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:4088,274,0
chr1	2678777	.	A	G	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;QD=32.01;SOR=3.507	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:4841,328,0
chr1	2678785	.	T	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;QD=26.92;SOR=2.792	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:4957,343,0
chr1	2680253	.	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;QD=29.90;SOR=6.932	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:955,93,0
chr1	2680289	.	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;QD=29.45;SOR=5.549	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:470,45,0
chr1	2684182	.	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=26.52;SOR=7.523	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1922,129,0
chr1	2684184	.	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.71;SOR=7.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1922,129,0
chr1	2688828	.	A	G	45.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=15.09;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:73,9,0
chr1	2688848	.	A	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=18.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
chr1	2692134	.	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;QD=31.89;SOR=6.869	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:985,90,0
chr1	2692231	.	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.96;QD=33.27;SOR=2.615	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:3755,336,0
chr1	2692441	.	C	A	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.45;QD=36.13;SOR=2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:4446,307,0
chr1	2692447	.	G	T	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.07;QD=33.59;SOR=2.511	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:4275,292,0
chr1	2692531	.	G	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.90;QD=30.07;SOR=7.476	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1261,122,0
chr1	2692543	.	C	T	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;QD=28.08;SOR=7.328	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1653,114,0
chr1	2692546	.	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.63;QD=34.46;SOR=7.112	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1585,108,0
chr1	2694215	.	GATGAGAATGAGGGTGAGGATGAGAATGAGGGTGGAA	G	1346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.87;QD=27.75;SOR=6.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:99:1384,104,0
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chr1	2695494	.	T	C	8072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.34;QD=32.46;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,187:187:99:8101,566,0
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chr1	2849274	.	G	A	6486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=2.045;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.427;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.781;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,208:445:99:6515,0,7448
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chr1	2861818	.	C	T	8598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.583;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.203;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,232:485:99:8627,0,9402
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chr1	2874866	.	A	T	12734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;ClippingRankSum=0.680;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-2.068;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,315:564:99:12763,0,9599
chr1	2874877	.	G	A	12424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.129;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-3.207;QD=22.92;ReadPosRankSum=1.664;SOR=1.028	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,309:542:99:12453,0,9258
chr1	2874892	.	AATTGAAAATTCATCATTAAAGGATACTGCATTGACTCCTTCCTACCTCAAG	A	10277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.880;ClippingRankSum=-0.393;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=2.692;QD=15.32;ReadPosRankSum=-13.668;SOR=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,297:671:99:10315,0,14853
chr1	2874991	.	A	G	9948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.133;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=7.737;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.688;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,262:566:99:9977,0,11496
chr1	2875006	.	A	T	10105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=2.365;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.197;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.669;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,270:566:99:10134,0,14799
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chr1	2890218	.	T	G	8112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=1.482;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.465;QD=19.32;ReadPosRankSum=-1.417;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,209:420:99:8141,0,8237
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chr1	2890233	.	C	T	8362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=2.058;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.077;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,218:449:99:8391,0,8884
chr1	2890291	.	T	C	9789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.936;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.385;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,245:485:99:9818,0,9373
chr1	2890297	.	G	A	10398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.498;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.935;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,260:498:99:10427,0,9485
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chr1	2897635	.	C	T	5806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=1.070;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=8.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.218;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.014;SOR=1.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,188:393:99:5835,0,6289
chr1	2897672	.	A	G	5987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.010;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=10.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-1.223;QD=18.83;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,181:318:99:6016,0,4367
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chr1	2905388	.	C	T	9719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.892;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.983;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,254:535:99:9748,0,14155
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chr1	2919328	.	AT	A	4633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.634;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.348;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,200:432:99:4671,0,5346
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chr1	2930218	.	T	C	9440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=1.888;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.789;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,247:532:99:9469,0,11215
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chr1	2939349	.	C	G	7498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=-1.143;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.265;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,236:466:99:7527,0,7022
chr1	2939475	.	A	G	8611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=-0.561;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.189;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:8640,0,9114
chr1	2939498	.	ATCCATG	A	8589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.298;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.130;QD=17.01;ReadPosRankSum=3.093;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,227:505:99:8627,0,10918
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chr1	2956333	.	A	G	9302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.188;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.530;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,250:527:99:9331,0,10534
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chr1	2966305	.	C	T	8943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.094;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.207;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,235:513:99:8972,0,11054
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chr1	2976364	.	G	A	10630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.018;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.993;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,280:544:99:10659,0,9925
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chr1	2982535	.	AG	A	4204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-2.336;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=5.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.156;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.407	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,191:406:99:4242,0,7184
chr1	2982617	.	G	C	6685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-1.371;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=2.522;QD=14.50;ReadPosRankSum=-3.580;SOR=0.413	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,225:461:99:6714,0,7341
chr1	2982647	.	G	T	7114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.036;ClippingRankSum=-0.013;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.709;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,187:427:99:7143,0,9777
chr1	2982648	.	T	C	7527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.429;ClippingRankSum=0.198;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.983;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,191:430:99:7556,0,6896
chr1	2982655	.	T	G	7402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.437;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.082;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,188:423:99:7431,0,9827
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chr1	3006165	.	T	C	10945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=-0.608;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.722;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,285:591:99:10974,0,12015
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chr1	3017079	.	C	T	10265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=1.399;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.789;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,266:535:99:10294,0,10352
chr1	3017083	.	T	C	10033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.128;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.288;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,260:526:99:10062,0,10387
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chr1	3036920	.	TCGGCTGAGCATTAAATG	T	8515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=-0.485;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.732;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.152;SOR=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,223:486:99:8553,0,10315
chr1	3036993	.	A	T	7520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.451;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.460;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,197:428:99:7549,0,8647
chr1	3037010	.	T	TC	8484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=2.450;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.481;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,206:415:99:8522,0,8447
chr1	3037014	.	C	T	8297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.349;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.735;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,207:413:99:8326,0,8156
chr1	3037015	.	T	TC	8168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=-0.418;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.333;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,207:412:99:8206,0,8081
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chr1	3047070	.	C	T	10325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=-0.202;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.673;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,268:526:99:10354,0,10186
chr1	3047077	.	T	A	10408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;ClippingRankSum=-1.865;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.176;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.199;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,270:540:99:10437,0,10391
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chr1	3056786	.	T	C	10160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=-0.453;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.123;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,265:553:99:10189,0,11178
chr1	3056920	.	A	G	8160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-0.174;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.951;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,262:554:99:8189,0,8776
chr1	3056949	.	A	G	7596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.647;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.870;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,248:512:99:7625,0,10062
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chr1	3060769	.	A	G	10695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.046;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,290:599:99:10724,0,9110
chr1	3060790	.	C	T	9750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.077;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.823;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,281:575:99:9779,0,11969
chr1	3060799	.	C	T	10132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.266;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.509;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,265:546:99:10161,0,10531
chr1	3061123	.	C	T	9138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=-0.617;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.105;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,241:547:99:9167,0,12067
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chr1	3064960	.	A	G	9610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-0.155;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.923;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.612;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,248:530:99:9639,0,11013
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chr1	3065374	.	A	G	8498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.980;ClippingRankSum=0.306;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.637;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,273:554:99:8527,0,7947
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chr1	3068440	.	T	G	13564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=-1.791;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.252;QD=23.19;ReadPosRankSum=2.253;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,324:585:99:13593,0,10402
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chr1	3076823	.	T	G	9905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.466;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.820;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,239:517:99:9934,0,11259
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chr1	3080675	.	C	T	10239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.797;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.841;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.082;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,266:559:99:10268,0,11508
chr1	3080815	.	A	G	8548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=-0.077;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.586;QD=15.10;ReadPosRankSum=2.090;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,294:566:99:8577,0,8064
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chr1	3097654	.	T	C	9726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.259;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.281;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.901;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,259:559:99:9755,0,11854
chr1	3097666	.	T	C	9472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.685;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.956;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,252:558:99:9501,0,11882
chr1	3098494	.	A	G	7166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=-0.635;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.279;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,188:409:99:7195,0,14183
chr1	3098495	.	C	G	7166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=-0.335;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.773;QD=17.57;ReadPosRankSum=3.949;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,187:408:99:7195,0,14183
chr1	3101025	.	G	T	9134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-1.295;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.250;QD=18.99;ReadPosRankSum=4.093;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,237:481:99:9163,0,7995
chr1	3101026	.	G	T	7413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=1.528;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.013;QD=15.41;ReadPosRankSum=3.185;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,234:481:99:7442,0,17097
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chr1	3114041	.	A	G	6724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=1.512;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.074;QD=12.50;ReadPosRankSum=2.173;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,225:538:99:6753,0,9657
chr1	3114429	.	C	CTA	6913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.311;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.196;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,204:451:99:6951,0,8618
chr1	3114774	.	C	T	7568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.028;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.409;QD=14.28;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,258:530:99:7597,0,8001
chr1	3114800	.	A	G	7915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=1.301;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.360;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,257:533:99:7944,0,8001
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chr1	3122832	.	C	G	9102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.194;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=6.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.580;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.307;SOR=1.125	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,239:460:99:9131,0,8310
chr1	3122929	.	T	C	8901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.535;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.307;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,230:463:99:8930,0,9206
chr1	3122933	.	T	A	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.210;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.837;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,228:463:99:8818,0,9187
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chr1	3125133	.	A	G	8818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.176;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.326;QD=19.47;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,238:453:99:8847,0,7959
chr1	3125517	.	C	T	11269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.660;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.824;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,297:573:99:11298,0,10380
chr1	3125529	.	C	T	11539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=2.080;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.519;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,301:586:99:11568,0,10910
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chr1	3134045	.	A	T	23604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.484;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.249;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.277	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,641:645:99:23633,1839,0
chr1	3135286	.	CT	C	6662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.008;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.558;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,193:372:99:6700,0,6273
chr1	3135311	.	A	G	6971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.300;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.885;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,181:360:99:7000,0,6743
chr1	3135439	.	T	G	9659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=-1.119;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.172;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,250:494:99:9688,0,9193
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chr1	3144617	.	TTTTA	T	3094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.598;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.243;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,171:399:99:3132,0,8920
chr1	3144812	.	G	A	7487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.180;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.679;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,248:496:99:7516,0,7790
chr1	3145435	.	T	TC	10485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=1.161;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=5.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.402;QD=21.23;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=1.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,268:494:99:10523,0,8426
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chr1	3147507	.	T	C	9458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.830;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.035;QD=22.36;ReadPosRankSum=-2.068;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,224:423:99:9487,0,8092
chr1	3147524	.	G	C	8714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-0.748;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.041;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,209:406:99:8743,0,7895
chr1	3147526	.	AT	A	8594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.066;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.657;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,210:387:99:8632,0,3837
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chr1	3151452	.	A	G	8105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.607;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.499;QD=17.81;ReadPosRankSum=-2.010;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,211:455:99:8134,0,9347
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chr1	3158196	.	C	T	8247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=1.179;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.171;QD=21.09;ReadPosRankSum=-2.261;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,194:391:99:8276,0,8096
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chr1	3164345	.	C	A	8379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.204;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.647;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,269:563:99:8408,0,9337
chr1	3165395	.	T	G	7450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.708;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=7.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.224;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.599;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,227:431:99:7479,0,6624
chr1	3165416	.	A	G	7883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.015;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,247:457:99:7912,0,6383
chr1	3167565	.	G	C	5775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-1.251;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.594;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,190:391:99:5813,0,6014
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chr1	3186117	.	G	A	9772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.336;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.034;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,255:537:99:9801,0,11141
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chr1	3195026	.	TA	T	9243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.722;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.550;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,232:434:99:9281,0,8000
chr1	3195029	.	A	T	9281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=1.152;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.715;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,234:441:99:9310,0,8163
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chr1	3201892	.	A	T	8927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.018;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.273;QD=16.72;ReadPosRankSum=3.469;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,274:534:99:8956,0,8042
chr1	3202055	.	GGTATT	G	7269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=1.247;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.225;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,236:529:99:7307,0,11360
chr1	3202109	.	T	TA	8199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.172;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.219;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,251:518:99:8237,0,8819
chr1	3202161	.	C	T	9013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.598;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.375;QD=19.30;ReadPosRankSum=-2.206;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,241:467:99:9042,0,8548
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chr1	3213692	.	GTGA	G	7252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.594;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=0.297;QD=13.31;ReadPosRankSum=2.419;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,255:545:99:7290,0,10779
chr1	3213764	.	T	C	8804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.156;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=1.328;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,296:627:99:8833,0,10304
chr1	3214063	.	C	T	12900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.627;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.696;QD=19.06;ReadPosRankSum=5.157;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,339:677:99:12929,0,12993
chr1	3214080	.	G	A	13643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.330;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.345;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,343:696:99:13672,0,14007
chr1	3214090	.	G	A	13232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=0.877;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.209;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,331:685:99:13261,0,14223
chr1	3214106	.	G	T	12330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.169;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.362;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,321:675:99:12359,0,13568
chr1	3214170	.	T	G	9727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.493;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.181;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,315:664:99:9756,0,10635
chr1	3214361	.	A	G	4260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-0.372;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=14.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=0.550;QD=16.45;ReadPosRankSum=-7.731;SOR=1.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,149:259:99:4289,0,16929
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chr1	3215728	.	C	A	9749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-0.132;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.468;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,299:584:99:9778,0,8962
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chr1	3223608	.	C	T	9785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.605;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.267;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,258:517:99:9814,0,9872
chr1	3223765	.	A	G	8845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.740;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.878;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,229:454:99:8874,0,9576
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chr1	3230167	.	A	C	11164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.030;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.072;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,299:596:99:11193,0,11162
chr1	3230178	.	T	G	10698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.482;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.378;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,280:566:99:10727,0,11176
chr1	3230230	.	C	T	9528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.515;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.391;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,255:490:99:9557,0,8804
chr1	3230232	.	CA	C	9507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.300;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.191;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.070;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,253:488:99:9545,0,8904
chr1	3230963	.	T	C	8078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.352;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.877;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,264:564:99:8107,0,9222
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chr1	3237982	.	G	A	9773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.512;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=5.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.369;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,258:550:99:9802,0,13213
chr1	3238001	.	C	T	9343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.469;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.065;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,247:534:99:9372,0,13059
chr1	3238058	.	T	C	9950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-1.080;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.501;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.848;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,260:531:99:9979,0,12853
chr1	3238064	.	A	G	9966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.167;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.671;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,259:538:99:9995,0,12892
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chr1	3244457	.	A	G	10507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.191;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.022;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,270:530:99:10536,0,10304
chr1	3244460	.	A	G	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=1.340;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.085;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,269:528:99:10550,0,10306
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chr1	3246878	.	C	T	11481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-3.256;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.517;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,289:556:99:11510,0,15281
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chr1	3249954	.	T	G	10011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.166;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.599;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.951;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,251:535:99:10040,0,11492
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chr1	3250008	.	C	T	10503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.963;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.241;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,263:567:99:10532,0,12179
chr1	3250009	.	T	C	10590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.218;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.231;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,266:571:99:10619,0,12308
chr1	3250033	.	G	A	10816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.011;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.060;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.714;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,300:612:99:10845,0,11505
chr1	3250061	.	G	A	12022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.032;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=6.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.436;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=1.138	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,310:606:99:12051,0,11531
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chr1	3251725	.	C	G	10795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.802;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.173;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,278:564:99:10824,0,11229
chr1	3251754	.	A	G	10736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.806;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.343;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,279:567:99:10765,0,11327
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chr1	3253457	.	C	A	9013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=1.066;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.222;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,236:520:99:9042,0,11312
chr1	3253730	.	C	T	8436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.554;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.712;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,228:488:99:8465,0,9903
chr1	3253748	.	T	C	8501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.495;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.445;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,225:484:99:8530,0,9907
chr1	3253788	.	GAAAT	G	10693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.499;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.213;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,280:543:99:10731,0,10094
chr1	3253827	.	T	C	11350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.494;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.703;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,287:551:99:11379,0,10237
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chr1	3258276	.	G	A	9023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.806;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.223;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,229:474:99:9052,0,10034
chr1	3258289	.	G	C	9344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.985;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.853;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,242:498:99:9373,0,9768
chr1	3258531	.	C	CT	6662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.188;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.407;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,258:550:99:6700,0,7854
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chr1	3261610	.	A	G	9056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.927;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.927;QD=18.30;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,242:495:99:9085,0,9784
chr1	3261634	.	G	A	9678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.711;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.817;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,245:515:99:9707,0,10723
chr1	3261636	.	T	C	9725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-1.564;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.254;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,241:507:99:9754,0,10957
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chr1	3265232	.	CA	C	8343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-1.062;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.131;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,225:449:99:8381,0,8277
chr1	3265256	.	T	C	9370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.190;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.826;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,252:497:99:9399,0,9154
chr1	3265318	.	C	T	9325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.855;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.530;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,248:539:99:9354,0,11350
chr1	3265332	.	A	G	9402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.703;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.243;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,239:527:99:9431,0,11766
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chr1	3270707	.	A	G	9137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.755;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.501;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.781;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,245:526:99:9166,0,10728
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chr1	3277630	.	TGGTCCCCTGGGCCACCTGGTCCTCCTGGACCGCCTGGACCGCTATCATACTGCCAGTCTGCTTCTCGGCAGTCATTCCCA	T	8486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.223;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=1.774;QD=17.04;ReadPosRankSum=14.196;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,260:498:99:8524,0,9028
chr1	3278028	.	C	T	8657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.217;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.156;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=1.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,286:597:99:8686,0,9436
chr1	3278041	.	TC	T	10076.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=-1.240;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.123;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,260:572:99:10114,0,12435
chr1	3278045	.	C	G	10419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.213;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.126;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,271:584:99:10448,0,12472
chr1	3278046	.	T	TA	10421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.122;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.427;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,267:575:99:10459,0,12354
chr1	3278701	.	C	T	8617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=1.738;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.219;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,229:447:99:8646,0,8791
chr1	3278717	.	GT	G	8671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=-1.066;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.329;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,238:471:99:8709,0,9127
chr1	3278963	.	ACGAACCAAAAAAC	A	10075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=0.318;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.944;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,261:596:99:10113,0,13272
chr1	3278982	.	A	T	10390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=1.500;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.136;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,273:575:99:10419,0,12197
chr1	3279261	.	G	T	8659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.580;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.960;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,286:573:99:8688,0,8794
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chr1	3281989	.	G	A	9659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=-0.735;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.156;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,242:486:99:9688,0,9708
chr1	3281995	.	A	G	9155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=1.490;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.323;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,235:468:99:9184,0,9061
chr1	3282169	.	A	G	7327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.772;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.316;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,231:492:99:7356,0,8371
chr1	3282197	.	T	G	8664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.096;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-1.944;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,225:469:99:8693,0,9509
chr1	3282200	.	T	C	8865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=1.610;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-1.205;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,221:459:99:8894,0,9998
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chr1	3283270	.	T	C	9461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.182;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.112;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,247:521:99:9490,0,10847
chr1	3283369	.	T	TA	8785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.034;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=5.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.088;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,220:457:99:8823,0,9330
chr1	3283381	.	A	G	9301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.393;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.123;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,248:508:99:9330,0,9953
chr1	3283425	.	A	T	8067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.758;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.977;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,265:561:99:8096,0,9192
chr1	3283502	.	AAAGTTAAAGCTG	A	7060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-1.418;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=2.450;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.617;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,200:509:99:7098,0,12007
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chr1	3290019	.	T	C	10510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=-0.388;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.710;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,260:527:99:10539,0,10899
chr1	3290028	.	T	A	11203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-0.821;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.961;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,273:539:99:11232,0,11142
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chr1	3298271	.	G	GA	12770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.061;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.752;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.510;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,317:652:99:12808,0,13285
chr1	3298280	.	T	C	13459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.646;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.218;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,346:713:99:13488,0,14571
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chr1	3304121	.	C	T	12130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.113;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.350;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.892;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,305:610:99:12159,0,12062
chr1	3304122	.	C	T	12055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.672;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.463;QD=19.93;ReadPosRankSum=2.072;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,303:605:99:12084,0,11942
chr1	3304419	.	GGAGT	G	8273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=-0.232;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=11.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.373;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.314;SOR=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,218:492:99:8311,0,10929
chr1	3304443	.	A	G	7496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=-1.158;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=7.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.866;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,186:450:99:7525,0,10990
chr1	3304460	.	T	C	6031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.673;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=5.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.561;QD=15.12;ReadPosRankSum=-2.401;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,157:399:99:6060,0,9814
chr1	3304477	.	C	T	4531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.197;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-2.364;QD=13.21;ReadPosRankSum=-4.114;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,124:343:99:4560,0,8720
chr1	3304502	.	TATTTTTC	T	1406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.215;ClippingRankSum=0.698;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=8.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-5.508;QD=4.52;ReadPosRankSum=-7.802;SOR=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,75:311:99:1444,0,9516
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chr1	3304525	.	T	C	3820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.688;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=0.030;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,91:256:99:3849,0,7494
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chr1	3322557	.	T	A	9559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-2.015;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.800;QD=17.84;ReadPosRankSum=-2.230;SOR=0.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,245:536:99:9588,0,11928
chr1	3322570	.	A	G	10026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.287;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.042;QD=18.10;ReadPosRankSum=-2.269;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,251:554:99:10055,0,12471
chr1	3322588	.	C	T	9345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.277;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.869;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,252:565:99:9374,0,12113
chr1	3322655	.	G	A	8134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.103;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=9.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.177;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.885;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,267:536:99:8163,0,8255
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chr1	3327099	.	G	GTT	7385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.303;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.961;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,236:464:99:7423,0,7245
chr1	3327139	.	T	A	8797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.901;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.653;QD=16.14;ReadPosRankSum=-2.508;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,286:545:99:8826,0,7642
chr1	3328295	.	A	T	8685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.115;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.474;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,285:556:99:8714,0,8435
chr1	3328471	.	T	A	9835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.339;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.290;QD=18.35;ReadPosRankSum=2.052;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,255:536:99:9864,0,11598
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chr1	3335680	.	A	G	9506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.143;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.063;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.240;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,305:588:99:9535,0,8441
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chr1	3341021	.	C	CATTTTT	10777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=1.504;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.017;QD=23.08;ReadPosRankSum=-5.421;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,244:467:99:10815,0,8814
chr1	3341022	.	G	GCCGTCTCGT	10891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.246;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.050;QD=24.37;ReadPosRankSum=-4.550;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,226:447:99:10929,0,8812
chr1	3341024	.	G	T	10004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=-1.160;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.604;QD=22.13;ReadPosRankSum=-4.850;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,231:452:99:10033,0,8689
chr1	3341030	.	G	A	8925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=-0.418;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.141;QD=19.57;ReadPosRankSum=-3.519;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,229:456:99:8954,0,8837
chr1	3341083	.	CT	C	4834.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.766;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.099;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,214:397:99:4872,0,3981
chr1	3342005	.	C	T	8630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.747;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.299;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,289:614:99:8659,0,9857
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chr1	3345115	.	C	T	9004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.812;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.874;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,230:479:99:9033,0,10161
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chr1	3350303	.	T	C	9850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.599;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.074;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,267:539:99:9879,0,10128
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chr1	3351290	.	G	A	10744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.092;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.390;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,281:508:99:10773,0,8547
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chr1	3353669	.	G	A	8286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.794;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=0.096;QD=19.32;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,213:429:99:8315,0,8467
chr1	3353671	.	G	GTA	8871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=1.297;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-0.388;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.849;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,217:432:99:8909,0,8758
chr1	3353682	.	A	G	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.107;ClippingRankSum=0.197;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-0.862;QD=20.30;ReadPosRankSum=-2.242;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,220:433:99:8818,0,8806
chr1	3353685	.	T	C	8663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.017;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-1.924;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.034;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,224:450:99:8692,0,8712
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chr1	3358344	.	A	G	10174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=1.245;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.017;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,282:621:99:10203,0,14137
chr1	3358365	.	G	A	10634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.089;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.441;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,270:590:99:10663,0,14091
chr1	3358381	.	A	G	10732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=-0.002;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.409;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,266:567:99:10761,0,13711
chr1	3358386	.	C	T	10635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.294;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.247;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.684;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,279:578:99:10664,0,13265
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chr1	3360899	.	T	G	10237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=0.228;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.109;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,271:542:99:10266,0,10026
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chr1	3362148	.	G	A	9485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.753;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.230;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,237:492:99:9514,0,10639
chr1	3362149	.	G	A	9278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.692;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.269;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,237:492:99:9307,0,10612
chr1	3362153	.	T	C	9527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-2.031;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.322;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,240:500:99:9556,0,10636
chr1	3362164	.	C	T	9836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.183;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.161;QD=19.83;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,245:496:99:9865,0,10405
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chr1	3364749	.	G	C	10246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=2.228;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.422;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,277:571:99:10275,0,11044
chr1	3364769	.	G	A	10000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=-1.494;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.139;QD=18.08;ReadPosRankSum=2.122;SOR=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,265:553:99:10029,0,11017
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chr1	3364898	.	CATGTG	C	8870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.101;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.586;QD=17.88;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,225:496:99:8908,0,14122
chr1	3364922	.	G	A	7675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=-0.825;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.417;QD=17.81;ReadPosRankSum=-3.822;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,197:431:99:7704,0,10511
chr1	3364929	.	T	A	7026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-0.010;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.060;QD=17.14;ReadPosRankSum=-5.166;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,182:410:99:7055,0,9772
chr1	3364957	.	T	A	8195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-1.325;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.640;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,215:422:99:8224,0,7969
chr1	3364969	.	A	G	8726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.300;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.328;QD=19.39;ReadPosRankSum=2.631;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,215:450:99:8755,0,9394
chr1	3364973	.	C	T	8558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.914;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=1.294;QD=19.23;ReadPosRankSum=2.473;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,214:445:99:8587,0,9577
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chr1	3364979	.	T	G	8519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.659;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.407;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.922;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,215:444:99:8548,0,9538
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chr1	3366045	.	A	T	10262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.037;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.755;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,280:590:99:10291,0,11752
chr1	3366199	.	G	C	11200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.394;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.714;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,291:584:99:11229,0,11536
chr1	3366206	.	A	C	11549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-1.788;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.218;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.430;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,301:603:99:11578,0,11669
chr1	3366229	.	T	C	11250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.020;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.287;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,292:599:99:11279,0,12022
chr1	3366230	.	T	C	11250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=-1.945;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.708;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,292:600:99:11279,0,12022
chr1	3366243	.	T	C	11681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=1.994;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,298:620:99:11710,0,12444
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chr1	3368725	.	C	T	10590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.891;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.868;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,283:596:99:10619,0,12139
chr1	3368739	.	T	C	11178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-2.133;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.596;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,282:595:99:11207,0,12527
chr1	3368758	.	T	C	10574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.557;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.160;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,286:610:99:10603,0,12307
chr1	3369150	.	A	T	9555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.303;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.437;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,254:541:99:9584,0,11220
chr1	3369158	.	GCATTTGAGAGGA	G	7598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.464;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.491;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,237:553:99:7636,0,12579
chr1	3369201	.	A	AT	7735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=-0.064;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.740;QD=14.73;ReadPosRankSum=-2.995;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,236:525:99:7773,0,9573
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chr1	3375985	.	T	C	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-0.589;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.946;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,295:589:99:9164,0,8749
chr1	3376584	.	G	A	9921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.692;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.275;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.018;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,256:513:99:9950,0,10178
chr1	3376587	.	C	T	9816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.028;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.058;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,253:514:99:9845,0,10164
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chr1	3376652	.	G	A	8386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.115;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.370;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,261:501:99:8415,0,7368
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chr1	3381069	.	G	A	12545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.807;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.649;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,339:651:99:12574,0,11769
chr1	3381089	.	G	C	12250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.317;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.471;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,323:639:99:12279,0,11952
chr1	3381511	.	T	A	9634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=2.529;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.879;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,306:559:99:9663,0,9247
chr1	3381604	.	C	T	10337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.152;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.348;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,272:561:99:10366,0,10768
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chr1	3386606	.	G	A	10021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=-0.203;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.305;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,271:519:99:10050,0,9449
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chr1	3396282	.	C	A	8782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.249;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.101;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,230:479:99:8811,0,9864
chr1	3396666	.	A	G	8740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.854;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.088;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,277:534:99:8769,0,8282
chr1	3396697	.	G	T	9014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=1.090;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.281;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,242:523:99:9043,0,10650
chr1	3396716	.	C	T	9123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-1.409;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.734;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,248:525:99:9152,0,10446
chr1	3396904	.	GAA	G	8157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-1.266;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.137;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,214:441:99:8195,0,8648
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chr1	3408580	.	A	G	9744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.711;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.698;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,317:610:99:9773,0,9065
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chr1	3412000	.	A	G	10411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-2.075;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=8.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.114;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.112;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,270:558:99:10440,0,11317
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chr1	3414826	.	T	C	9223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.320;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.411;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,243:509:99:9252,0,10353
chr1	3414840	.	C	T	9565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.569;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.142;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,257:528:99:9594,0,10286
chr1	3415000	.	T	C	12752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.138;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.615;QD=20.11;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,333:634:99:12781,0,11426
chr1	3415009	.	C	T	12481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-0.700;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.167;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,319:625:99:12510,0,11724
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chr1	3417559	.	T	A	11914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=-0.205;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.592;QD=19.47;ReadPosRankSum=2.095;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,302:612:99:11943,0,12438
chr1	3417573	.	T	A	11957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.612;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.051;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,315:612:99:11986,0,11373
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chr1	3422027	.	T	G	9475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=1.047;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.712;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,243:499:99:9504,0,10131
chr1	3422030	.	T	C	9432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.226;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.828;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,245:506:99:9461,0,10236
chr1	3422205	.	GA	G	5800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.509;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.552;QD=10.72;ReadPosRankSum=4.541;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,236:541:99:5838,0,7658
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chr1	3429121	.	G	A	11242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.343;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.721;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.651;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,299:571:99:11271,0,9544
chr1	3429139	.	A	G	10814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=-0.541;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.970;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,295:576:99:10843,0,11316
chr1	3429247	.	T	C	10025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=2.042;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.857;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,309:595:99:10054,0,9271
chr1	3429697	.	G	A	12113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=-0.158;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.830;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,322:655:99:12142,0,12465
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chr1	3446381	.	T	C	8701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.590;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.227;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,281:602:99:8730,0,9791
chr1	3447145	.	C	G	12092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.585;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.374;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,313:602:99:12121,0,11268
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chr1	3451670	.	C	CAT	10510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=1.197;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.815;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.946;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,268:483:99:10548,0,8013
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chr1	3452277	.	G	C	11344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-1.504;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.018;QD=18.33;ReadPosRankSum=-2.453;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,301:619:99:11373,0,12381
chr1	3452295	.	C	T	10864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.816;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.001;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.508;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,288:617:99:10893,0,12388
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chr1	3454959	.	A	G	8815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-1.565;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.496;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.512;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,278:533:99:8844,0,9397
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chr1	3463409	.	A	G	8451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-1.092;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.016;QD=19.56;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,219:432:99:8480,0,8090
chr1	3463425	.	A	G	9089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.197;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.083;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,221:440:99:9118,0,8818
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chr1	3468565	.	T	C	8910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.547;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.510;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,237:485:99:8939,0,13297
chr1	3468572	.	C	T	8958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.424;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.143;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,233:473:99:8987,0,13350
chr1	3468740	.	CATTTATTATCAAAA	C	10034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=1.065;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.574;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,263:560:99:10072,0,11567
chr1	3468899	.	A	G	13200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.231;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.661;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,341:667:99:13229,0,12523
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chr1	3472340	.	A	G	8603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=1.602;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.274;QD=15.04;ReadPosRankSum=-1.772;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,272:572:99:8632,0,9366
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chr1	3474982	.	G	A	9891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=0.380;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.434;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,262:600:99:9920,0,13082
chr1	3475013	.	T	C	10297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.585;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=2.009;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,271:571:99:10326,0,11605
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chr1	3478814	.	C	T	9669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.298;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.213;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,247:469:99:9698,0,8819
chr1	3478819	.	T	C	9546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.199;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.272;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,247:481:99:9575,0,9031
chr1	3478971	.	AT	A	6691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.195;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,184:413:99:6729,0,5169
chr1	3478984	.	T	G	5105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=0.491;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.181;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,190:451:99:5134,0,9904
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chr1	3484951	.	G	A	10541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.608;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.461;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,285:572:99:10570,0,13938
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chr1	3486476	.	G	A	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.252;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.292;QD=18.41;ReadPosRankSum=-1.967;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,249:509:99:9397,0,9907
chr1	3486488	.	C	T	9583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=1.376;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.942;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.700;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,255:514:99:9612,0,9976
chr1	3486776	.	A	G	8455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=1.213;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.169;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,277:562:99:8484,0,8840
chr1	3486788	.	C	T	8648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.500;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.744;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,275:557:99:8677,0,8835
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chr1	3490318	.	G	C	13372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.225;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.902;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,345:700:99:13401,0,13647
chr1	3490366	.	C	T	9984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=-0.501;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.520;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,326:669:99:10013,0,10947
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chr1	3498672	.	T	A	10682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.391;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.593;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,282:609:99:10711,0,12818
chr1	3498679	.	G	A	10712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.245;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.508;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,279:605:99:10741,0,12678
chr1	3498914	.	GC	G	9901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.931;ClippingRankSum=-0.095;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.933;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,261:565:99:9939,0,11837
chr1	3498924	.	T	TAACA	11026.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.636;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.706;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,279:592:99:11064,0,12250
chr1	3499289	.	A	T	11463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.019;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.481;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,297:591:99:11492,0,11201
chr1	3499304	.	TCTC	T	11496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.670;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.201;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,294:582:99:11534,0,11324
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chr1	3509462	.	G	T	9668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.511;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.190;QD=15.77;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,311:613:99:9697,0,9340
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chr1	3518426	.	T	A	10563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.484;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.891;QD=20.55;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,277:514:99:10592,0,8990
chr1	3518676	.	T	G	19848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-2.107;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=-1.774;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,538:542:99:19877,1492,0
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chr1	3524821	.	T	C	10506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.406;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.804;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,264:555:99:10535,0,11970
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chr1	3533298	.	T	A	11283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.601;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.320;QD=18.47;ReadPosRankSum=2.331;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,295:611:99:11312,0,12273
chr1	3533307	.	A	G	11878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=1.432;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.928;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,310:618:99:11907,0,11916
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chr1	3554761	.	C	T	11959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;ClippingRankSum=0.680;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.458;QD=19.61;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,302:610:99:11988,0,12190
chr1	3555034	.	C	T	8345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.755;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.681;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,266:562:99:8374,0,9015
chr1	3556839	.	G	A	8158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.589;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.680;QD=14.29;ReadPosRankSum=2.088;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,267:571:99:8187,0,9826
chr1	3557227	.	G	GC	9275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.804;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.442;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,288:625:99:9313,0,11172
chr1	3557451	.	AGTTGACGTTAGTGGACGACTCTGGGCTACTTCAAGTGTTTCGGCCACTAACGTCAAGAGGAAGGTGTCG	A	10686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.674;ClippingRankSum=-0.741;DP=865;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.628;QD=14.36;ReadPosRankSum=2.299;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:404,340:744:99:10724,0,15674
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chr1	3561778	.	T	C	11801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.014;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.743;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,303:629:99:11830,0,12746
chr1	3561779	.	G	A	11823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.007;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.214;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,307:632:99:11852,0,12743
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chr1	3562342	.	T	C	12908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.322;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.113;QD=18.82;ReadPosRankSum=2.057;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,331:686:99:12937,0,20548
chr1	3562344	.	T	C	12908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.429;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.963;QD=18.96;ReadPosRankSum=2.319;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,336:681:99:12937,0,20548
chr1	3563480	.	G	A	8352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.482;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.463;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,269:556:99:8381,0,9220
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chr1	3566886	.	T	A	11920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=1.331;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.488;QD=20.95;ReadPosRankSum=-1.786;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,301:569:99:11949,0,10130
chr1	3567369	.	C	A	8424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.193;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.121;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,270:543:99:8453,0,8711
chr1	3567679	.	ACTTT	A	8136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=-0.159;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.247;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,211:409:99:8174,0,7559
chr1	3567791	.	TAAATAA	T	9841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-1.186;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.853;QD=19.57;ReadPosRankSum=2.063;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,253:503:99:9879,0,9679
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chr1	3570979	.	T	C	10688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.264;ClippingRankSum=-1.705;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.322;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,276:537:99:10717,0,10245
chr1	3571303	.	A	AG	8268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-0.854;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.695;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,264:538:99:8306,0,8586
chr1	3571345	.	A	G	7245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.290;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-3.743;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,244:513:99:7274,0,8764
chr1	3571376	.	TA	T	975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.427;ClippingRankSum=0.921;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=12.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-3.007;QD=2.73;ReadPosRankSum=2.740;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,91:357:99:1013,0,10294
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chr1	3575827	.	T	C	8888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.163;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.220;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.677;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,229:437:99:8917,0,8028
chr1	3575928	.	T	C	8034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.028;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.940;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,214:474:99:8063,0,9909
chr1	3575949	.	T	A	8921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-0.785;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.195;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,223:478:99:8950,0,10305
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chr1	3582667	.	G	A	8412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.813;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.408;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,266:547:99:8441,0,8788
chr1	3582694	.	AT	A	8395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=-0.653;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.601;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,223:470:99:8433,0,9755
chr1	3582709	.	A	G	9111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=-1.414;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.218;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,231:490:99:9140,0,10558
chr1	3582721	.	C	A	9104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.223;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.310;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,232:480:99:9133,0,10120
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chr1	3588023	.	A	G	8726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-2.163;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.875;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,225:493:99:8755,0,10750
chr1	3588111	.	TA	T	3894.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=1.130;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.227;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.810;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,186:390:99:3932,0,4252
chr1	3588154	.	C	T	7708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-1.787;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.803;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,208:439:99:7737,0,8626
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chr1	3590144	.	T	A	6657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.132;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.350;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,220:444:99:6686,0,6882
chr1	3590237	.	CAA	C	6234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=1.432;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.270;QD=15.36;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,174:406:99:6272,0,8971
chr1	3590242	.	A	G	6293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=-1.291;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.018;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,178:424:99:6322,0,9135
chr1	3590264	.	G	GAAA	6829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=1.850;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.229;QD=17.03;ReadPosRankSum=-4.508;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,190:401:99:6867,0,8010
chr1	3590399	.	A	C	8999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.065;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.208;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,230:437:99:9028,0,7991
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chr1	3592596	.	C	T	8682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=1.406;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.084;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.092;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,234:479:99:8711,0,9298
chr1	3592746	.	A	G	7941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.430;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=5.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.261;QD=16.14;ReadPosRankSum=-1.967;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,263:492:99:7970,0,7180
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chr1	3604551	.	T	G	9868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.881;ClippingRankSum=-1.170;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.336;QD=19.24;ReadPosRankSum=-2.012;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,245:513:99:9897,0,10750
chr1	3604554	.	AC	A	10044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.847;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.390;QD=19.43;ReadPosRankSum=-2.894;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,256:517:99:10082,0,10760
chr1	3604559	.	GA	G	9821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=-0.775;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.958;QD=18.92;ReadPosRankSum=-2.216;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,254:519:99:9859,0,10291
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chr1	3614110	.	G	A	9289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.630;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.617;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,240:498:99:9318,0,9811
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chr1	3614226	.	A	G	8622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.660;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.151;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,225:479:99:8651,0,11414
chr1	3614244	.	C	A	8959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.422;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.838;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,233:487:99:8988,0,12620
chr1	3614248	.	C	G	9151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-1.131;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.650;QD=18.83;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,232:486:99:9180,0,12719
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chr1	3777950	.	A	G	10211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.718;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.319;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.713;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,263:560:99:10240,0,11617
chr1	3777953	.	T	C	10483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.637;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.262;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.712;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,261:556:99:10512,0,11613
chr1	3777974	.	G	A	10462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-1.293;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.969;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,261:555:99:10491,0,11940
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chr1	3779242	.	TAC	T	6678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.558;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.899;QD=14.55;ReadPosRankSum=-3.617;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,213:459:99:6716,0,9729
chr1	3779245	.	T	TCCC	6454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.270;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.252;QD=14.51;ReadPosRankSum=-2.912;SOR=1.013	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,203:445:99:6492,0,9596
chr1	3779668	.	GA	G	6157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.013;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.853;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,280:530:99:6195,0,5375
chr1	3780067	.	A	G	11196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.815;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.362;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,283:593:99:11225,0,12201
chr1	3780072	.	C	T	11754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.313;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.856;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,298:612:99:11783,0,12892
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chr1	3782394	.	T	C	7636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.231;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.357;QD=18.27;ReadPosRankSum=-2.217;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,198:418:99:7665,0,8792
chr1	3782401	.	G	A	7085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;ClippingRankSum=-0.520;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.386;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.917;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,190:409:99:7114,0,8687
chr1	3782433	.	C	T	7221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.540;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.636;QD=16.56;ReadPosRankSum=2.406;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,238:436:99:7250,0,6129
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chr1	3785500	.	T	C	8459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.972;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.516;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,227:456:99:8488,0,9076
chr1	3785513	.	A	G	8667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.305;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.869;QD=19.57;ReadPosRankSum=-2.744;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,215:443:99:8696,0,10719
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chr1	3787378	.	T	A	9070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=-0.236;DP=826;ExcessHet=3.0103;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-3.253;QD=13.44;ReadPosRankSum=6.197;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:423,252:675:99:9099,0,17291
chr1	3787381	.	T	G	9010.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=-0.902;DP=826;ExcessHet=3.0103;FS=2.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-2.352;QD=13.04;ReadPosRankSum=6.139;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:439,252:691:99:9048,0,17882
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chr1	3787492	.	T	A	9781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.012;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.181;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,325:666:99:9810,0,10730
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chr1	3791724	.	T	A	9643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.986;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.534;QD=19.02;ReadPosRankSum=-2.501;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,251:507:99:9672,0,9782
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chr1	3794722	.	G	A	7636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=2.021;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.207;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,263:561:99:7665,0,8998
chr1	3794748	.	T	A	9999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-0.125;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.206;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,251:546:99:10028,0,11121
chr1	3794762	.	C	T	9998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=-1.350;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.244;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,249:520:99:10027,0,10884
chr1	3794778	.	TTTTATTTCA	T	9042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.019;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.574;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.791;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,234:505:99:9080,0,10989
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chr1	3798715	.	T	C	12698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.962;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.131;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,318:603:99:12727,0,11417
chr1	3798732	.	A	G	12511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=-0.698;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.886;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,303:589:99:12540,0,11561
chr1	3798733	.	A	G	12430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-0.321;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.176;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,303:588:99:12459,0,11525
chr1	3798739	.	T	C	12100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=-0.570;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.416;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,301:584:99:12129,0,11464
chr1	3798748	.	C	G	12744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.237;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.449;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,306:589:99:12773,0,11369
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chr1	3801433	.	G	A	9633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.380;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.232;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.483;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,313:658:99:9662,0,10668
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chr1	3804650	.	A	AT	4246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.038;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,185:391:99:4284,0,4972
chr1	3804731	.	C	T	7669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.415;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.174;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,198:422:99:7698,0,8806
chr1	3804740	.	A	G	7880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.779;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.550;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,210:442:99:7909,0,9536
chr1	3804763	.	A	G	6810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.663;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.582;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,231:441:99:6839,0,7877
chr1	3805238	.	G	C	6681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-0.413;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.152;QD=15.12;ReadPosRankSum=2.815;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,217:442:99:6710,0,7239
chr1	3805281	.	G	T	9201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=-0.740;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.211;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.741;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,239:490:99:9230,0,9894
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chr1	3810665	.	T	C	11548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.332;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.629;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,308:624:99:11577,0,12342
chr1	3810679	.	C	G	12129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.190;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.328;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,301:636:99:12158,0,13658
chr1	3810694	.	A	G	12615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-1.610;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.760;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,311:628:99:12644,0,13026
chr1	3810708	.	G	A	12176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.721;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.999;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,307:628:99:12205,0,13065
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chr1	3813205	.	A	G	9457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-1.888;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.468;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.463;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,249:544:99:9486,0,17266
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chr1	3815590	.	G	T	10505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.858;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.777;QD=17.05;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,285:616:99:10534,0,12645
chr1	3815617	.	A	G	9037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.182;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.207;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,295:613:99:9066,0,9981
chr1	3815674	.	A	G	10424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.881;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.564;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,265:567:99:10453,0,11903
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chr1	3820439	.	A	G	7681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.566;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.278;QD=17.30;ReadPosRankSum=1.467;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,213:444:99:7710,0,10141
chr1	3820737	.	G	A	9549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-1.128;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.893;QD=15.94;ReadPosRankSum=3.166;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,309:599:99:9578,0,8856
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chr1	3825978	.	C	T	10698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=-0.018;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.759;QD=18.51;ReadPosRankSum=3.409;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,278:578:99:10727,0,11634
chr1	3825984	.	A	T	10796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=-1.947;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.330;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,278:576:99:10825,0,12217
chr1	3826002	.	C	A	10645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.003;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.913;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,286:586:99:10674,0,11422
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chr1	3827935	.	AT	A	3111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.555;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=8.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.468;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,213:374:99:3149,0,2250
chr1	3828093	.	A	C	10336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=1.517;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.030;QD=19.14;ReadPosRankSum=4.765;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,264:540:99:10365,0,10465
chr1	3828105	.	G	A	10630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.743;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.146;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,281:554:99:10659,0,10473
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chr1	3884619	.	G	A	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;ClippingRankSum=1.138;DP=1008;ExcessHet=3.0103;FS=69.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=0.255;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=6.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:845,134:979:99:3186,0,36720
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chr1	3884625	.	T	C	3365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.721;ClippingRankSum=-0.200;DP=1050;ExcessHet=3.0103;FS=76.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=1.681;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.761;SOR=6.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:875,147:1022:99:3394,0,36205
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chr2	317929	.	T	G	19324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.141;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-1.839;QD=30.67;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=1.051	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,544:546:99:19353,1593,0
chr2	328101	.	A	AT	4500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.038;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.994;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,263:348:99:4538,0,746
chr2	331526	.	A	ATTT,ATTTT	10235.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.808;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.11;MQRankSum=1.501;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:9,82,63:154:99:10273,1946,1045,1706,0,953
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chr2	615621	.	C	CA	4667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.160;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=5.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.349;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,185:384:99:4705,0,5020
chr2	626314	.	A	ATT,ATTT	6849.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=1.718;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=1.559;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-0.144;QD=27.11;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:8,32,107:147:99:6887,2046,1550,673,0,419
chr2	641276	.	G	GA	10685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;QD=30.36;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,352:352:99:10723,1054,0
chr2	646793	.	AAGC	A	3917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.879;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-0.852;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,141:316:99:3955,0,6599
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chr2	713647	.	G	A	11259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.166;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=0.047;QD=21.95;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,275:513:99:11288,0,9557
chr2	713651	.	ATTTAAT	A	11268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.571;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=2.041;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,274:530:99:11306,0,10092
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chr2	735463	.	GAAGAGACTCAGA	G	6585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.756;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.966;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,181:394:99:6623,0,8157
chr2	735503	.	G	C	6334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.493;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.150;QD=16.08;ReadPosRankSum=3.029;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,200:394:99:6363,0,6043
chr2	735537	.	AGT	A	8088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.832;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.983;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,213:450:99:8126,0,9459
chr2	735540	.	ATCTCTAACAGAAG	A	8156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-1.522;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.047;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,213:470:99:8194,0,10249
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chr2	742754	.	G	A	8085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=2.532;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=8.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.872;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.496;SOR=1.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,247:489:99:8114,0,7703
chr2	743227	.	C	T	8120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.609;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.905;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,262:509:99:8149,0,9283
chr2	744655	.	T	G	7292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=8.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-1.470;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.361;SOR=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,190:390:99:7321,0,7565
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chr2	748725	.	T	C	8366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=-0.015;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.421;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,287:610:99:8395,0,10350
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chr2	749217	.	T	A	10792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=-0.712;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.306;QD=19.66;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,279:549:99:10821,0,10563
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chr2	754328	.	G	A	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.802;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.147;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,103:221:99:3847,0,4669
chr2	754350	.	C	CGAA	5412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.038;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.373;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,134:285:99:5450,0,5937
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chr2	783413	.	A	G	7513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.532;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.818;QD=14.48;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,257:519:99:7542,0,7732
chr2	783432	.	G	A	7318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=1.222;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.199;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,237:468:99:7347,0,7176
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chr2	802553	.	CCG	C	8130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=0.986;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.283;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,202:420:99:8168,0,9023
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chr2	817607	.	G	A	8764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.781;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.713;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,232:488:99:8793,0,10332
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chr2	817673	.	G	T	7042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.029;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.656;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,246:519:99:7071,0,8260
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chr2	829593	.	C	T	7569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=-0.254;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.115;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,245:507:99:7598,0,8013
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chr2	837225	.	C	T	9048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.865;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.641;QD=20.24;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,232:447:99:9077,0,8324
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chr2	844337	.	T	C	8094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.090;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.151;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.647;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,211:454:99:8123,0,9667
chr2	845268	.	ACTGAATGAGT	A	11427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=1.346;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.570;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.538;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,300:637:99:11465,0,13201
chr2	845281	.	GCTGATTA	G	11722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=-0.108;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.210;QD=18.46;ReadPosRankSum=2.695;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,296:635:99:11760,0,13967
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chr2	848771	.	CAT	C	10316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-1.205;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.088;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.574;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,263:533:99:10354,0,10767
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chr2	859465	.	A	C	21787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.776;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-1.135;QD=28.31;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,601:605:99:21816,1716,0
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chr2	884313	.	A	AT	4037.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.735;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.294;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,178:381:99:4075,0,4928
chr2	884505	.	GA	G	17541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=1.014;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQRankSum=-0.846;QD=33.11;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,390:391:99:17579,1182,0
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chr2	916874	.	TTTTC	T	7831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.080;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.013;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,210:447:99:7869,0,9176
chr2	916960	.	A	G	8098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.230;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.823;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,272:536:99:8127,0,7996
chr2	917026	.	AT	A	5035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=2.204;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=8.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=2.158;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.852;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,227:450:99:5073,0,4924
chr2	917112	.	GTT	G	4300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.111;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=4.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-7.247;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,118:328:99:4338,0,8310
chr2	917122	.	TAATTCTGATTTC	T	4535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.495;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=5.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-7.545;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.872;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,133:374:99:4573,0,9396
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chr2	967891	.	G	A	9298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.489;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.379;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,246:508:99:9327,0,10181
chr2	968037	.	C	G	7675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-1.119;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.219;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,242:465:99:7704,0,7001
chr2	970009	.	A	T	16670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.645;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=2.000;QD=32.36;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.374	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,451:454:99:16699,1268,0
chr2	971747	.	CTGGCGATTTT	C	3500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.494;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=7.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-7.381;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.742;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,115:342:99:3538,0,8823
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chr2	989733	.	G	A	7994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=2.180;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.447;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.310;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,260:519:99:8023,0,8349
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chr2	996105	.	T	C	9631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=1.236;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.183;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,242:495:99:9660,0,10255
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chr2	1028161	.	A	G	8600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.787;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-3.079;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,205:422:99:8629,0,8989
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chr2	1028491	.	A	G	9209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.863;ClippingRankSum=1.692;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-5.290;QD=20.38;ReadPosRankSum=-3.563;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,222:452:99:9238,0,9238
chr2	1028498	.	G	A	8966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.600;ClippingRankSum=-1.280;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-5.885;QD=19.88;ReadPosRankSum=-4.846;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,225:451:99:8995,0,9130
chr2	1028499	.	C	T	9053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=-0.402;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-4.922;QD=20.12;ReadPosRankSum=-4.642;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,223:450:99:9082,0,9082
chr2	1028503	.	T	TCAAGC	9203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.740;ClippingRankSum=0.411;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-3.224;QD=20.45;ReadPosRankSum=-4.580;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,219:450:99:9241,0,9196
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chr2	1043924	.	AT	A	4652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-0.737;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.165;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.226;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,206:399:99:4690,0,4365
chr2	1044028	.	A	G	9760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=-0.219;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=5.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-0.942;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=1.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,245:439:99:9789,0,7835
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chr2	1078961	.	C	T	12701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.407;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.380;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.415;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,332:646:99:12730,0,12100
chr2	1078974	.	A	T	13330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.222;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.559;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,332:652:99:13359,0,12722
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chr2	1085935	.	A	G	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=1.316;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=11.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.232;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.046;SOR=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,94:319:99:3441,0,9201
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chr2	1105320	.	G	A	7298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=-1.105;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.208;QD=16.97;ReadPosRankSum=-4.503;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,195:430:99:7327,0,9235
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chr2	1115070	.	T	C	8890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=1.313;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,283:604:99:8919,0,9829
chr2	1116524	.	C	T	12291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-0.055;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.830;QD=18.65;ReadPosRankSum=1.954;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,317:659:99:12320,0,12646
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chr2	1124960	.	C	T	9938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-1.233;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.592;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,305:613:99:9967,0,9626
chr2	1125676	.	T	C	9350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.799;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.246;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,303:576:99:9379,0,8082
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chr2	1138552	.	A	G	7901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.752;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.346;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,262:586:99:7930,0,9844
chr2	1139481	.	T	G	23581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.656;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.305;QD=31.74;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,641:644:99:23610,1852,0
chr2	1140274	.	C	CA	4835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=1.295;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=8.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.317;QD=10.22;ReadPosRankSum=-2.310;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,238:473:99:4873,0,5001
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chr2	1156559	.	A	G	9085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.165;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.541;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,297:580:99:9114,0,9055
chr2	1156611	.	A	G	10122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-0.640;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.637;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,318:629:99:10151,0,9774
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chr2	1163692	.	A	T	11603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-1.259;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=1.197;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,289:544:99:11632,0,10302
chr2	1163705	.	C	G	10953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=2.830;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=1.144;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,280:549:99:10982,0,10116
chr2	1163730	.	TTAGATGAAA	T	7981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.632;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-1.980;QD=17.66;ReadPosRankSum=3.329;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,212:452:99:8019,0,9323
chr2	1163817	.	T	C	7334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.313;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=2.376;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,205:453:99:7363,0,9163
chr2	1163842	.	C	G	6474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.141;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=0.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=1.975;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,172:394:99:6503,0,8791
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chr2	1172714	.	G	A	10768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.369;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.822;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,294:610:99:10797,0,11833
chr2	1174246	.	A	AAT	1395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.832;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=0.013;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,58:129:99:1433,0,1849
chr2	1174744	.	CA	C	5911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.564;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.695;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,239:495:99:5949,0,6424
chr2	1176087	.	T	G	10120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-2.352;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.792;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.235;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,262:537:99:10149,0,10805
chr2	1176088	.	T	G	10120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.635;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.076;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,260:530:99:10149,0,10805
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chr2	1187721	.	T	C	10763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=1.901;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.757;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,274:577:99:10792,0,12467
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chr2	1191689	.	A	G	11332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-1.263;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.132;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,295:579:99:11361,0,13008
chr2	1191692	.	C	T	11354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=-0.344;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.375;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.526;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,292:577:99:11383,0,12964
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chr2	1204149	.	G	A	11817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.919;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.831;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,316:626:99:11846,0,11438
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chr2	1207179	.	C	A	6694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.666;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.442;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,218:444:99:6723,0,6787
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chr2	1219012	.	G	A	10686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-0.563;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.774;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,276:570:99:10715,0,13959
chr2	1219016	.	A	C	10832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=1.149;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.259;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,282:590:99:10861,0,14203
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chr2	1224133	.	A	C	8371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-0.675;DP=777;ExcessHet=3.0103;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-4.423;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,242:619:99:8400,0,15286
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chr2	1224137	.	GGATGATGATGATGATGATGAT	G,TGATGATGATGATGATGATGAT	22190.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=1.053;DP=861;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-2.278;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:8,323,256:587:99:22228,9643,19188,12634,0,14496
chr2	1224188	.	A	T	12952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=-1.064;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=5.826;QD=18.53;ReadPosRankSum=-2.374;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,341:699:99:12981,0,13602
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chr2	1229911	.	A	G	6917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.981;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.545;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.908;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,234:492:99:6946,0,10040
chr2	1229916	.	T	C	9018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.174;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.100;QD=18.48;ReadPosRankSum=-2.142;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,236:488:99:9047,0,7973
chr2	1229973	.	T	G	7518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.266;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.629;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.704;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,195:399:99:7547,0,7949
chr2	1229979	.	G	T	7894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=1.412;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.632;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,201:410:99:7923,0,8360
chr2	1229980	.	A	G	7872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.179;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.541;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,202:409:99:7901,0,8363
chr2	1230141	.	C	CTA	5595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.196;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.141;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,167:361:99:5633,0,6660
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chr2	1245102	.	T	C	9572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.252;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.168;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,236:486:99:9601,0,9964
chr2	1245112	.	A	AGC	9516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.456;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.877;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.911;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,236:486:99:9554,0,10216
chr2	1245114	.	GTA	G	9474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.082;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.395;QD=19.30;ReadPosRankSum=-2.612;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,235:491:99:9512,0,10386
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chr2	1293388	.	A	G	11724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.577;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.496;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,304:605:99:11753,0,11564
chr2	1293403	.	T	C	12223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=1.055;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.630;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,306:607:99:12252,0,11795
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chr2	1304291	.	A	AT	5682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.513;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.102;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,195:415:99:5720,0,6554
chr2	1304328	.	CT	C	4852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.432;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.328;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,205:408:99:4890,0,4649
chr2	1308917	.	T	C	10228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.337;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.592;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,274:580:99:10257,0,11679
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chr2	1308935	.	T	G	10830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.614;ClippingRankSum=0.385;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.260;QD=18.97;ReadPosRankSum=2.142;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,275:571:99:10859,0,11727
chr2	1309077	.	A	AT	4715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.095;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.749;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,208:421:99:4753,0,5121
chr2	1311356	.	C	A	9902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=1.196;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.369;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,331:627:99:9931,0,8890
chr2	1311417	.	T	A	8054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.851;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.502;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,261:561:99:8083,0,9730
chr2	1311541	.	T	C	9500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.618;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.494;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,246:538:99:9529,0,11482
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chr2	1311737	.	CCAATCTGGTAACACTAACTTTAATAAAGTA	C	8600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.531;ClippingRankSum=0.765;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.088;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,233:580:99:8638,0,13749
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chr2	1368839	.	TGTAC	T	8625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.665;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.923;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,220:462:99:8663,0,9629
chr2	1368849	.	G	GA	4746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.320;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.368;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,211:457:99:4784,0,9544
chr2	1368935	.	T	C	7469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.359;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.367;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,250:515:99:7498,0,8092
chr2	1368993	.	T	C	9690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.379;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.352;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,256:531:99:9719,0,10358
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chr2	1383714	.	A	C	8115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=-1.428;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.307;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,265:539:99:8144,0,8968
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chr2	1402943	.	T	C	8509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.179;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.894;QD=17.05;ReadPosRankSum=2.296;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,223:499:99:8538,0,10528
chr2	1402949	.	TGTCTGA	T	8579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-1.293;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.265;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,227:510:99:8617,0,11254
chr2	1409732	.	A	G	7726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-1.556;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.362;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,254:468:99:7755,0,6573
chr2	1415549	.	TTCTTACA	T	6440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.002;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.813;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,209:447:99:6478,0,9273
chr2	1416400	.	T	C	8735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.132;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.469;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,283:552:99:8764,0,7987
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chr2	1416672	.	A	T	8120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.232;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=-5.117;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,203:472:99:8149,0,11029
chr2	1416674	.	A	AG	8285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=1.736;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-2.349;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,206:470:99:8323,0,10933
chr2	1416675	.	T	G	8255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=-1.509;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=-4.474;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.233;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,210:475:99:8284,0,10894
chr2	1416679	.	T	G	8147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=0.310;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=-0.834;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.570;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,210:473:99:8176,0,10651
chr2	1416685	.	T	G	8711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.806;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.255;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.918;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,218:487:99:8740,0,10945
chr2	1416692	.	T	C	8786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.532;ClippingRankSum=0.980;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=3.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-1.805;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.971;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,224:499:99:8815,0,11065
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chr2	1425791	.	A	G	7841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=-0.961;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.968;QD=17.66;ReadPosRankSum=-4.672;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,218:444:99:7870,0,8198
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chr2	1425893	.	T	C	5245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.316;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.666;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,186:446:99:5274,0,9719
chr2	1426108	.	G	A	7959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.742;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.486;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,210:445:99:7988,0,12308
chr2	1426114	.	A	G	7653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.072;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.608;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,199:435:99:7682,0,12332
chr2	1426304	.	G	A	8507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=1.900;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.597;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,218:444:99:8536,0,8882
chr2	1426310	.	A	G	8483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.056;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.117;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,223:453:99:8512,0,9043
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chr2	1439701	.	G	A	8825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.713;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.955;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.394;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,215:429:99:8854,0,10774
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chr2	1459536	.	G	T	7189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.072;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.731;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,233:494:99:7218,0,8188
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chr2	1461631	.	C	T	9334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-0.489;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.072;QD=17.81;ReadPosRankSum=3.506;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,295:524:99:9363,0,7087
chr2	1461649	.	C	T	9096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.165;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.194;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,310:557:99:9125,0,7221
chr2	1461668	.	T	C	11394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.101;QD=22.00;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,291:518:99:11423,0,8645
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chr2	1468198	.	A	G	9401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=1.732;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.881;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,246:482:99:9430,0,9032
chr2	1468469	.	G	A	11059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.680;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.052;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,284:528:99:11088,0,10791
chr2	1468478	.	G	T	11052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-1.438;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.396;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,287:537:99:11081,0,10741
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chr2	1473081	.	A	T	9562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-0.269;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.229;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,243:496:99:9591,0,10204
chr2	1473088	.	T	C	9334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.227;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.610;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,242:481:99:9363,0,9308
chr2	1473157	.	G	A	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.162;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.411;QD=21.39;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,250:476:99:10209,0,8950
chr2	1473159	.	T	G	10169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.055;ClippingRankSum=0.831;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.016;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,249:477:99:10198,0,9211
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chr2	1484958	.	A	C	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.340;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=5.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.355;QD=17.25;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,182:411:99:7117,0,8988
chr2	1484988	.	C	T	7027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.431;ClippingRankSum=2.300;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.582;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,233:408:99:7056,0,5356
chr2	1485550	.	T	C	7668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;ClippingRankSum=0.956;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.171;QD=14.66;ReadPosRankSum=2.114;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,248:523:99:7697,0,7899
chr2	1487104	.	C	CAAAA	6862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.405;ClippingRankSum=0.093;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.781;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,172:388:99:6900,0,8434
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chr2	1495045	.	G	A	7804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.246;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.850;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,249:514:99:7833,0,8110
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chr2	1501773	.	C	T	6419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=1.045;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.993;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,206:464:99:6448,0,10158
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chr2	1507340	.	T	C	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-0.550;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.462;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.005;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,96:228:99:3543,0,6535
chr2	1507533	.	A	T	5489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-0.367;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-3.940;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,177:386:99:5518,0,6424
chr2	1507557	.	GATGAGATGAATCATGATGAAAGTA	G	4296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.889;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-4.533;QD=11.61;ReadPosRankSum=5.775;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,151:370:99:4334,0,8138
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chr2	1513463	.	T	G	9680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.564;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.349;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,252:523:99:9709,0,10614
chr2	1513539	.	G	A	7685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-2.212;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.698;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,259:517:99:7714,0,7895
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chr2	1523315	.	C	G	7892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=1.640;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.994;QD=17.23;ReadPosRankSum=2.837;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,208:458:99:7921,0,11221
chr2	1523354	.	G	T	9101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.785;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.032;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,236:471:99:9130,0,9138
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chr2	1529160	.	A	G	10136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=1.321;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.012;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,269:560:99:10165,0,11192
chr2	1529281	.	C	T	9308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.792;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.694;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,280:535:99:9337,0,7982
chr2	1529486	.	G	A	12537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.183;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=5.113;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,322:622:99:12566,0,12118
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chr2	1537531	.	A	G	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.295;ClippingRankSum=1.149;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=10.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.407;QD=9.46;ReadPosRankSum=-3.456;SOR=1.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,78:286:99:2733,0,8231
chr2	1537712	.	A	T	6700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=-0.558;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=9.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-2.422;QD=16.50;ReadPosRankSum=-3.888;SOR=1.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,175:406:99:6729,0,9048
chr2	1537717	.	GTTTTT	G	6642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.252;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=11.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-2.003;QD=16.61;ReadPosRankSum=-3.183;SOR=1.145	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,168:400:99:6680,0,9280
chr2	1537726	.	GTTTT	G	6582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=-0.705;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=12.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-2.436;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=1.084	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,168:393:99:6620,0,9336
chr2	1537732	.	T	G	6504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=-0.576;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=10.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-3.527;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.999;SOR=1.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,169:383:99:6533,0,9081
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chr2	1542980	.	CTT	C	6011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;ClippingRankSum=-0.538;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=0.013;QD=13.63;ReadPosRankSum=-2.318;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,160:441:99:6049,0,11526
chr2	1542995	.	C	A	6294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.265;ClippingRankSum=-0.503;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-0.107;QD=14.74;ReadPosRankSum=-4.359;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,167:427:99:6323,0,10454
chr2	1543000	.	C	A	6581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.374;ClippingRankSum=-0.861;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-0.153;QD=15.71;ReadPosRankSum=-4.103;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,165:419:99:6610,0,10983
chr2	1543005	.	A	G	6362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.272;ClippingRankSum=0.415;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-0.437;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.361;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,166:426:99:6391,0,11071
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chr2	1544523	.	C	A	7629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.332;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.679;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,242:408:99:7658,0,4952
chr2	1544736	.	CAAAAG	C	7770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.300;DP=715;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-3.104;QD=14.36;ReadPosRankSum=4.814;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,218:541:99:7808,0,13554
chr2	1544747	.	AAAGC	A	7670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.818;ClippingRankSum=0.167;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-4.162;QD=13.25;ReadPosRankSum=4.914;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,218:579:99:7708,0,14939
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chr2	1554052	.	T	C	7604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.814;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.348;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.700;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,236:483:99:7633,0,8085
chr2	1554257	.	T	TG	7736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.417;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.546;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,225:446:99:7774,0,7384
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chr2	1558380	.	C	T	6210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.571;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=3.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.484;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,167:379:99:6239,0,8284
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chr2	1571413	.	A	G	9284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=3.051;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.908;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,241:502:99:9313,0,10324
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chr2	1582274	.	T	TAC	8823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-0.401;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.230;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,226:443:99:8861,0,8404
chr2	1582321	.	C	G	8188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.110;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.155;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.990;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,218:467:99:8217,0,9413
chr2	1582340	.	A	T	8448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-1.332;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.006;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,227:488:99:8477,0,9910
chr2	1582374	.	G	T	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-1.005;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.098;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,242:463:99:9408,0,8601
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chr2	1587505	.	C	T	6541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.353;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.504;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,209:397:99:6570,0,5877
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chr2	1598156	.	C	T	8139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.942;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.044;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,265:485:99:8168,0,6863
chr2	1598267	.	T	C	8320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=-0.650;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.390;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,222:513:99:8349,0,11947
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chr2	1604168	.	T	C	8222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.358;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.445;QD=17.88;ReadPosRankSum=1.073;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,217:460:99:8251,0,9256
chr2	1604183	.	G	A	8757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.691;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.071;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,232:473:99:8786,0,9336
chr2	1605854	.	C	T	8119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.026;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.151;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,215:422:99:8148,0,13421
chr2	1605870	.	A	G	7679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.079;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.082;QD=18.78;ReadPosRankSum=4.579;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,198:409:99:7708,0,13765
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chr2	1611462	.	T	C	5952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.551;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=6.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=1.352;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.415;SOR=1.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,207:491:99:5981,0,10843
chr2	1611502	.	CA	C	9965.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=-0.905;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=4.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-2.747;QD=22.15;ReadPosRankSum=2.323;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,258:450:99:10003,0,7295
chr2	1611505	.	TCCTTGTCCAGGTCCCAAACCTTGTCCAGGTCCCAAACCTTGTCCAGGTCCCAAACCTTGTCCAGGTCCCAA	T	9633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.411;ClippingRankSum=-1.069;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-2.839;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.893;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,262:564:99:9671,0,11519
chr2	1611973	.	T	C	7019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=1.044;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.605;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,183:380:99:7048,0,7634
chr2	1611977	.	G	A	6895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.139;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.355;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,180:373:99:6924,0,7528
chr2	1611997	.	G	C	5250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-1.699;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.122;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,172:356:99:5279,0,5718
chr2	1612153	.	A	G	4860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-0.844;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.007;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,134:312:99:4889,0,6860
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chr2	1617790	.	C	T	9750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.064;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.438;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,259:475:99:9779,0,8099
chr2	1617799	.	T	C	9318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.038;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.206;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,231:441:99:9347,0,8041
chr2	1617976	.	T	C	7042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.814;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.083;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,184:416:99:7071,0,9186
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chr2	1620730	.	T	TA	7396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-3.182;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.129;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,215:401:99:7434,0,6296
chr2	1620810	.	CTTT	C	5612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.353;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=7.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.674;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,148:365:99:5650,0,8809
chr2	1620822	.	C	T	5613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.818;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=9.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.441;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,150:368:99:5642,0,8717
chr2	1620903	.	A	T	4750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=1.462;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=4.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.031;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,154:344:99:4779,0,5822
chr2	1620993	.	G	A	7349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.669;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.610;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,190:405:99:7378,0,8536
chr2	1620999	.	C	A	7539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.131;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.130;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.806;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,190:409:99:7568,0,8883
chr2	1621008	.	C	A	7384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-0.288;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.116;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,194:414:99:7413,0,8625
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chr2	1627221	.	T	A	10089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.771;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.202;QD=21.70;ReadPosRankSum=-2.128;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,251:465:99:10118,0,8521
chr2	1627226	.	C	T	9896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.734;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.298;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,252:464:99:9925,0,8251
chr2	1627262	.	A	T	5207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.543;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=5.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.581;QD=14.63;ReadPosRankSum=-2.556;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,171:356:99:5236,0,5805
chr2	1627321	.	C	CTTTTT	1986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;QD=29.07;SOR=7.276	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:2024,175,0
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chr2	1632587	.	T	C	8730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.165;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.319;QD=20.74;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,216:421:99:8759,0,8354
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chr2	1632606	.	C	CT	7972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.589;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.948;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,211:426:99:8010,0,8230
chr2	1633873	.	T	C	7996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.027;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=5.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.086;QD=18.47;ReadPosRankSum=2.082;SOR=1.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,207:433:99:8025,0,8867
chr2	1633876	.	A	G	7916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.121;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=5.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.333;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.353;SOR=1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,199:422:99:7945,0,9119
chr2	1633891	.	T	C	8387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=1.001;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.384;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,204:442:99:8416,0,9631
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chr2	1636037	.	A	T	10453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=1.126;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=4.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.775;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.446;SOR=1.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,256:530:99:10482,0,11112
chr2	1636042	.	CA	C	9910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.496;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.654;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.214;SOR=1.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,251:523:99:9948,0,11158
chr2	1636067	.	C	G	9635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.164;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.165;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,259:511:99:9664,0,9353
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chr2	1641763	.	C	T	7203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.555;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.258;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,182:368:99:7232,0,7453
chr2	1641768	.	T	C	6981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=1.163;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.985;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,178:360:99:7010,0,7640
chr2	1641783	.	T	A	6437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=2.426;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.835;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.720;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,168:352:99:6466,0,7029
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chr2	1646532	.	T	G	7921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=-1.589;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.494;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.392;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,208:440:99:7950,0,8779
chr2	1646550	.	A	G	8024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-1.299;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.785;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,218:460:99:8053,0,9052
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chr2	1647996	.	C	T	8633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.687;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.223;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,233:470:99:8662,0,9017
chr2	1648019	.	C	G	9048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.987;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.746;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.948;SOR=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,224:469:99:9077,0,9951
chr2	1648036	.	G	C	9846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=-0.630;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-2.486;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.616;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,248:493:99:9875,0,10111
chr2	1648048	.	GCAGATAAGATACCAGATAGGATACCAGATAAGATACCAGATAGGATATCAGATAAGATACCAGATAGGATAC	G	9414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.428;ClippingRankSum=-0.020;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=6.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-0.440;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:385,249:634:99:9452,0,15371
chr2	1648096	.	TCAGATAAGATACCAGATAGGATAC	T	4939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=-0.724;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=2.182;QD=12.20;ReadPosRankSum=12.915;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,158:405:99:4977,0,9871
chr2	1648479	.	T	C	9561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.524;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.478;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,249:494:99:9590,0,9405
chr2	1648491	.	A	G	9786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.561;ClippingRankSum=-1.292;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.277;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,246:477:99:9815,0,9113
chr2	1648506	.	T	C	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.791;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.124;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,246:484:99:9930,0,9530
chr2	1648524	.	C	A	8840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.336;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.386;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,231:459:99:8869,0,8759
chr2	1648696	.	C	T	7026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.443;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.016;QD=18.84;ReadPosRankSum=2.581;SOR=0.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,183:373:99:7055,0,7248
chr2	1648704	.	C	T	6504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.177;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=9.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.108;QD=18.80;ReadPosRankSum=3.112;SOR=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,167:346:99:6533,0,7020
chr2	1648740	.	T	C	4512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=-0.632;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=21.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.407;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.021;SOR=1.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,143:292:99:4541,0,4430
chr2	1648767	.	A	G	4430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.750;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=36.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.533;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,146:276:99:4459,0,4197
chr2	1648812	.	C	G	6042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.976;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=7.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.535;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,156:322:99:6071,0,6445
chr2	1648829	.	T	C	6786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.344;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.684;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,165:336:99:6815,0,6821
chr2	1648848	.	A	G	6292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=-1.182;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,161:330:99:6321,0,6925
chr2	1648851	.	A	G	6235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.155;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=0.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.876;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,161:335:99:6264,0,6809
chr2	1648892	.	T	C	4988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-0.033;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=4.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.718;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,163:337:99:5017,0,5304
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chr2	1652184	.	A	C	8578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.564;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.109;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,224:466:99:8607,0,9549
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chr2	1652216	.	T	C	7515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.299;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.023;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,203:428:99:7544,0,8755
chr2	1652320	.	A	G	9717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-2.025;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.199;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.441;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,249:513:99:9746,0,10336
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chr2	1652915	.	T	G	7772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=-0.698;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=7.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.018;QD=16.30;ReadPosRankSum=-1.686;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,198:477:99:7801,0,11221
chr2	1652921	.	G	A	7883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.090;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=7.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.504;QD=16.77;ReadPosRankSum=-1.770;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,198:470:99:7912,0,11422
chr2	1652924	.	A	G	8216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=1.391;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=9.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.409;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,196:469:99:8245,0,11449
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chr2	1657020	.	CAG	C	7065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.050;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.430;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,183:404:99:7103,0,8601
chr2	1657103	.	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.024;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.677;QD=5.92;ReadPosRankSum=4.365;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,104:269:99:1621,0,7181
chr2	1657104	.	A	ATT	1210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-0.884;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=2.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-1.042;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,90:289:99:1248,0,7396
chr2	1657106	.	T	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.236;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=13.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.775;QD=4.18;ReadPosRankSum=7.443;SOR=1.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,95:306:99:1307,0,7702
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chr2	1665731	.	G	A	9554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=1.349;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.048;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,245:493:99:9583,0,9599
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chr2	1671041	.	G	A	7410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.045;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.082;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,194:410:99:7439,0,8388
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chr2	1675221	.	G	A	10876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.200;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.016;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,283:567:99:10905,0,11186
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chr2	1682361	.	T	C	6798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=2.153;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.088;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.966;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,177:414:99:6827,0,16555
chr2	1682362	.	T	C	6873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.213;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.663;QD=16.68;ReadPosRankSum=2.737;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,176:412:99:6902,0,16759
chr2	1682364	.	A	G	7078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=-0.592;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.731;QD=17.22;ReadPosRankSum=2.899;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,174:411:99:7107,0,17112
chr2	1682367	.	A	T	7148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=-1.270;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.906;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.180;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,181:412:99:7177,0,16756
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chr2	1687045	.	G	C	11910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.274;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=3.556;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,298:563:99:11939,0,10399
chr2	1687066	.	GAAAATCAACTAAAATCAACTAAAATCAACC	G	7731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.285;ClippingRankSum=0.574;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=0.018;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,218:553:99:7769,0,12971
chr2	1687135	.	A	G	8593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.483;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=10.349;QD=14.54;ReadPosRankSum=4.185;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,287:591:99:8622,0,9376
chr2	1687167	.	A	C	8905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.237;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.542;QD=14.92;ReadPosRankSum=-4.343;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,286:597:99:8934,0,9573
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chr2	1690436	.	C	T	12278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.101;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=0.442;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,306:596:99:12307,0,11806
chr2	1690459	.	G	A	13039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.422;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-2.151;QD=21.10;ReadPosRankSum=-2.514;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,327:618:99:13068,0,11763
chr2	1690478	.	C	T	12494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.348;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-1.312;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.220;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,307:603:99:12523,0,11838
chr2	1690482	.	ATTTGATTTCTCCATTTTGATTTCTCCATTCTGATTTCTCCAT	A	11753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;ClippingRankSum=0.777;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=0.273;QD=16.99;ReadPosRankSum=-8.350;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:387,305:692:99:11791,0,15427
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chr2	1695251	.	G	A	10411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.643;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.687;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,273:516:99:10440,0,9968
chr2	1695265	.	T	C	11089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=1.288;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.318;QD=22.27;ReadPosRankSum=2.297;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,270:498:99:11118,0,9184
chr2	1695270	.	T	G	10942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.291;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.246;QD=21.71;ReadPosRankSum=2.341;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,275:504:99:10971,0,9238
chr2	1695299	.	A	G	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-1.961;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.786;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.432	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,271:504:99:10066,0,9421
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chr2	1699930	.	T	C	7081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.509;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.096;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,168:310:99:7110,0,5835
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chr2	1703095	.	G	A	14805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.215;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-3.881;QD=23.10;ReadPosRankSum=-8.247;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,364:641:99:14834,0,11009
chr2	1703110	.	C	T	13756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.507;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-5.514;QD=22.30;ReadPosRankSum=-7.470;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,339:617:99:13785,0,11085
chr2	1703134	.	G	C	14073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.734;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-5.596;QD=22.70;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,331:620:99:14102,0,11312
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chr2	1708203	.	T	A	8907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.434;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.422;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,222:447:99:8936,0,9138
chr2	1708208	.	A	ATGG	9344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=2.160;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.555;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,223:458:99:9382,0,9562
chr2	1708224	.	T	A	8979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.814;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.380;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,222:452:99:9008,0,9330
chr2	1708225	.	C	A	8856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.206;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.501;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,223:453:99:8885,0,9297
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chr2	1711317	.	A	G	9428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.097;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.339;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,236:518:99:9457,0,11437
chr2	1711321	.	A	T	9362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;ClippingRankSum=-1.171;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.964;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,228:505:99:9391,0,11191
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chr2	1714074	.	C	T	8775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=2.595;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.570;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,222:479:99:8804,0,10421
chr2	1714080	.	T	C	8494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.090;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.712;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,223:481:99:8523,0,10136
chr2	1714426	.	C	G	12330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-0.570;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.081;QD=18.19;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,322:678:99:12359,0,13934
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chr2	1718153	.	T	C	9481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.494;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.407;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.781;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,247:558:99:9510,0,12299
chr2	1718231	.	G	T	5975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-1.201;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-1.439;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.630;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,193:408:99:6004,0,6677
chr2	1719926	.	TAAAGAGGAAGTCTGCAAA	T	9803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.200;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.317;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,258:545:99:9841,0,12374
chr2	1720265	.	GATATTGCACCTACTAATCTTACAATATTGTACTTATCATCTTAATA	G	6592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.619;ClippingRankSum=-0.574;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-4.391;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,220:583:99:6630,0,13839
chr2	1720307	.	TAATAATATTGCACCTACCAATCTTACAATATTGCACTTATCATCTC	T	5312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.119;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=1.195;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.604;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,155:394:99:5350,0,9290
chr2	1720512	.	T	C	10833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=-1.404;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.030;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.698;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,290:645:99:10862,0,13416
chr2	1720526	.	A	C	11789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.261;ClippingRankSum=1.282;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.274;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,293:613:99:11818,0,13144
chr2	1720528	.	A	C	11389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=1.370;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.491;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,295:629:99:11418,0,12998
chr2	1720909	.	A	G	9922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.919;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.975;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,254:484:99:9951,0,9132
chr2	1720911	.	A	G	10026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=2.110;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.395;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,249:484:99:10055,0,9185
chr2	1720914	.	C	T	9809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.198;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.737;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.317;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,249:482:99:9838,0,9193
chr2	1720941	.	T	C	7465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.720;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.665;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,240:455:99:7494,0,6566
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chr2	1723360	.	A	G	12927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=-1.004;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.583;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,313:629:99:12956,0,12713
chr2	1723376	.	CTTAT	C	12320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-0.080;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=1.104;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,303:647:99:12358,0,14069
chr2	1723381	.	CACT	C	11790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.080;ClippingRankSum=-1.385;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.133;QD=18.31;ReadPosRankSum=2.052;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,304:644:99:11828,0,13751
chr2	1723387	.	G	A	11785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.552;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.607;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.910;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,302:629:99:11814,0,12997
chr2	1731666	.	A	G	12377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.856;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.470;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,321:610:99:12406,0,11533
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chr2	1738240	.	C	T	9326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-1.238;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.047;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,290:572:99:9355,0,10613
chr2	1738500	.	ATT	A	6181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.463;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.740;QD=16.48;ReadPosRankSum=2.021;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,160:375:99:6219,0,8208
chr2	1738513	.	GGTTCGCACTATTT	G	6657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=-0.489;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.055;QD=14.96;ReadPosRankSum=4.991;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,184:445:99:6695,0,10362
chr2	1738628	.	T	A	8344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=2.410;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.848;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,218:457:99:8373,0,10634
chr2	1738633	.	G	A	8347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.826;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.029;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,213:448:99:8376,0,11043
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chr2	1745729	.	T	G	8202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-1.011;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.106;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,261:525:99:8231,0,8270
chr2	1745769	.	A	G	7757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-0.164;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,245:485:99:7786,0,7228
chr2	1745924	.	A	G	8710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.002;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.077;QD=19.75;ReadPosRankSum=2.635;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,226:441:99:8739,0,11044
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chr2	1749073	.	G	A	9665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=2.045;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.793;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,256:523:99:9694,0,10225
chr2	1749110	.	A	G	8965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.480;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.516;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,294:584:99:8994,0,9027
chr2	1755044	.	G	GGAAGAA	12287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=-0.832;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.526;QD=22.55;ReadPosRankSum=-2.267;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,284:545:99:12325,0,10293
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chr2	1760669	.	A	G	7288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.727;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.793;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,235:465:99:7317,0,7120
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chr2	1761361	.	G	A	9249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.403;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.495;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,298:562:99:9278,0,7897
chr2	1761379	.	G	A	8982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.677;ClippingRankSum=0.342;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.851;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.996;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,296:573:99:9011,0,7400
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chr2	1767085	.	G	A	9733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.582;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.185;QD=20.15;ReadPosRankSum=2.570;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,250:483:99:9762,0,8970
chr2	1767264	.	A	T	8357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.786;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.401;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.729;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,270:542:99:8386,0,8344
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chr2	1775835	.	G	A	9440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.203;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.636;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,238:467:99:9469,0,9502
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chr2	1780958	.	GTTTTTGCAAACTCAGGTGAACC	G	7239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.241;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=0.603;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,197:452:99:7277,0,9888
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chr2	1782294	.	C	T	8829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=1.237;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.269;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,230:466:99:8858,0,9267
chr2	1782300	.	T	G	8710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.150;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.256;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,219:454:99:8739,0,9229
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chr2	1796260	.	C	T	11825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.803;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.079;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,297:611:99:11854,0,12559
chr2	1796263	.	C	T	11624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=1.372;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.879;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,299:616:99:11653,0,12469
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chr2	1819258	.	A	G	8169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.814;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.343;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,219:485:99:8198,0,10469
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chr2	1822541	.	G	C	9030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;ClippingRankSum=-1.248;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.626;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,230:475:99:9059,0,9778
chr2	1822544	.	G	T	8933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=-1.009;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.081;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,232:473:99:8962,0,9482
chr2	1822727	.	AAAAC	A	8911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.672;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.273;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.048;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,223:431:99:8949,0,8339
chr2	1822733	.	GACTGGACGAA	G	8994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=0.844;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.139;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,230:468:99:9032,0,9541
chr2	1822748	.	A	T	9312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-1.627;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.501;QD=20.74;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,229:449:99:9341,0,8736
chr2	1822758	.	T	A	8603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.732;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.088;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,222:451:99:8632,0,8753
chr2	1822787	.	TCTCATAATTTTCCC	T	7329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.405;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.523;QD=16.85;ReadPosRankSum=-5.562;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,195:435:99:7367,0,9346
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chr2	1841397	.	A	T	9111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.443;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.261;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,297:596:99:9140,0,11365
chr2	1841562	.	T	C	7746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.918;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=15.49;ReadPosRankSum=2.168;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,243:500:99:7775,0,9809
chr2	1841612	.	A	ATT	9959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-1.833;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.855;QD=18.65;ReadPosRankSum=-2.702;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,250:534:99:9997,0,11409
chr2	1841614	.	A	ATTGCGG	11140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.157;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.729;QD=20.48;ReadPosRankSum=-2.675;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,252:544:99:11178,0,11629
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chr2	1846615	.	A	G	12936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.575;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.240;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,323:662:99:12965,0,13763
chr2	1846619	.	G	A	12621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-1.340;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.738;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,320:665:99:12650,0,14090
chr2	1846620	.	T	C	12714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.097;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.187;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,313:658:99:12743,0,13958
chr2	1846625	.	T	C	12207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.188;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.845;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,306:651:99:12236,0,13799
chr2	1846626	.	G	A	12051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=1.942;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.101;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,305:647:99:12080,0,13643
chr2	1849961	.	A	G	9557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.081;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.412;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.139;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,310:615:99:9586,0,9503
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chr2	1863325	.	T	G	10094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.406;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.307;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,250:529:99:10123,0,15223
chr2	1863329	.	G	T	9984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=1.394;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.115;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,259:539:99:10013,0,15050
chr2	1863670	.	TA	T	9139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.768;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.839;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,234:488:99:9177,0,10106
chr2	1863674	.	G	GT	9336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.114;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.442;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,237:495:99:9374,0,10181
chr2	1863689	.	C	T	9174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.036;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.783;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,238:506:99:9203,0,10338
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chr2	1873622	.	G	T	8470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;ClippingRankSum=0.493;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=6.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.125;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.662;SOR=1.108	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,221:448:99:8499,0,9379
chr2	1873897	.	A	ATTT	5178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.696;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.132;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,188:357:99:5216,0,5870
chr2	1875663	.	C	CT	6230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=1.689;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.314;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,243:546:99:6268,0,8219
chr2	1876136	.	G	A	9347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.913;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.602;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,247:504:99:9376,0,9684
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chr2	1890053	.	G	A	8151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.452;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.384;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.833;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,214:403:99:8180,0,7194
chr2	1890303	.	G	A	8177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=-0.620;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.242;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,220:520:99:8206,0,16415
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chr2	1902651	.	G	A	11698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.905;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.242;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,290:595:99:11727,0,12365
chr2	1902664	.	C	T	11700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.217;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.496;QD=18.57;ReadPosRankSum=3.214;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,298:630:99:11729,0,13098
chr2	1902665	.	G	A	11703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-0.710;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.895;QD=18.97;ReadPosRankSum=2.272;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,300:617:99:11732,0,13056
chr2	1903119	.	GACTCGAGCTTCTCAC	G	8517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=-1.799;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=1.116;QD=17.00;ReadPosRankSum=2.824;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,227:501:99:8555,0,10662
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chr2	2038697	.	G	A	19719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.653;DP=1027;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.520;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:468,504:972:99:19748,0,18210
chr2	2038729	.	T	C	14311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.761;ClippingRankSum=0.505;DP=949;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.671;QD=16.28;ReadPosRankSum=5.791;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:499,380:879:99:14340,0,19708
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chr2	2040414	.	AAT	A	23710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.492;DP=1214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQRankSum=5.302;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:592,585:1177:99:23748,0,23774
chr2	2040418	.	GCTGT	G	23126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.781;DP=1269;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQRankSum=1.288;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:648,583:1231:99:23164,0,26240
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chr2	2042048	.	C	G	8148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.799;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.319;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,268:528:99:8177,0,7974
chr2	2042121	.	T	C	7276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.364;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.944;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,236:486:99:7305,0,7726
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chr2	2045435	.	A	T	11098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-0.887;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.473;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,290:601:99:11127,0,12799
chr2	2045454	.	G	A	9175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.545;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=3.868;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,299:611:99:9204,0,9508
chr2	2045600	.	C	T	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.910;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.618;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.911;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,303:559:99:9397,0,7998
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chr2	2047395	.	A	G	5932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-1.095;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.058;QD=15.53;ReadPosRankSum=3.882;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,188:382:99:5961,0,6144
chr2	2047758	.	T	C	7364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=-0.564;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.381;QD=15.94;ReadPosRankSum=3.407;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,237:462:99:7393,0,6646
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chr2	2053257	.	C	G	10424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.488;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.477;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,276:618:99:10453,0,13544
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chr2	2054309	.	T	A	8052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.005;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQRankSum=-11.023;QD=17.54;ReadPosRankSum=-5.360;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,196:459:99:8081,0,10484
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chr2	2054531	.	A	G	7583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.540;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.475;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,209:405:99:7612,0,8309
chr2	2054679	.	G	A	6490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.627;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.412;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,220:443:99:6519,0,6706
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chr2	2058007	.	A	G	11097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=2.376;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQRankSum=-0.330;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,355:689:99:11126,0,10414
chr2	2058224	.	G	A	7440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=-0.349;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=5.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.009;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,255:533:99:7469,0,8485
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chr2	2060236	.	G	A	12474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=1.887;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQRankSum=-6.531;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,309:647:99:12503,0,13282
chr2	2060251	.	A	G	12173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.456;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQRankSum=-3.657;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,319:663:99:12202,0,13802
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chr2	2062891	.	G	A	10572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.348;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.634;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,332:621:99:10601,0,11032
chr2	2062903	.	C	T	9087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=-1.808;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.743;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,290:635:99:9116,0,13187
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chr2	2064442	.	T	A	11225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.749;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.377;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,272:544:99:11254,0,10729
chr2	2064443	.	A	G	11162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.263;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.246;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,275:543:99:11191,0,10986
chr2	2064460	.	C	T	10532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.351;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.195;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,280:562:99:10561,0,10551
chr2	2064484	.	A	AC	7080.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.279;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.471;QD=13.14;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,262:539:99:7118,0,8651
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chr2	2067699	.	C	T	8541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.347;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.868;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=1.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,276:591:99:8570,0,9009
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chr2	2072343	.	G	A	9485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=-0.635;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.158;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,331:656:99:9514,0,9603
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chr2	2094401	.	TAA	T	11974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=-1.423;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-8.732;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.154;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:410,308:718:99:12012,0,16847
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chr2	2094408	.	GAA	G	12155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=1.230;DP=759;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-10.142;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:410,325:735:99:12193,0,16435
chr2	2094512	.	T	C	11032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-0.778;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.378;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,345:673:99:11061,0,9961
chr2	2094880	.	G	A	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.813;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.931;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,326:602:99:10209,0,8844
chr2	2094969	.	A	G	9242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-0.568;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.913;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,307:640:99:9271,0,9637
chr2	2095094	.	A	AAAAGAAAAAGGGAAGGAGGAAGAGAAAGAAAAAATGAAGGATGAAGAG	16270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.165;ClippingRankSum=1.473;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.533;QD=30.47;ReadPosRankSum=-14.967;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,266:534:99:16308,0,10129
chr2	2095111	.	C	T	12369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.816;ClippingRankSum=0.148;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=0.883;QD=19.86;ReadPosRankSum=-8.754;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,310:623:99:12398,0,12640
chr2	2095134	.	G	A	13164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.720;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.488;QD=20.35;ReadPosRankSum=-3.777;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,329:647:99:13193,0,12682
chr2	2095147	.	A	G	11742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=1.432;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-1.696;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,316:651:99:11771,0,12688
chr2	2095157	.	GAATGAAGAA	G	9203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=1.121;DP=733;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-3.860;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,252:572:99:9241,0,12338
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chr2	2101204	.	A	T	4690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.123;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.280;QD=18.04;ReadPosRankSum=-1.196;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,124:260:99:4719,0,5262
chr2	2101207	.	T	C	4577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=-0.879;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.758;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.612;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,119:248:99:4606,0,5136
chr2	2101218	.	C	T	3904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=-0.509;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.972;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,115:210:99:3933,0,2928
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chr2	2105030	.	T	A	11014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.602;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.424;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,279:571:99:11043,0,11855
chr2	2105034	.	A	C	11291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.022;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.968;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,276:560:99:11320,0,11511
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chr2	2107113	.	TA	T	9045.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.759;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.473;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,279:515:99:9083,0,7664
chr2	2107152	.	G	C	9366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.997;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=4.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.664;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,301:576:99:9395,0,8856
chr2	2107181	.	A	T	9852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.375;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.239;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,316:633:99:9881,0,10037
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chr2	2109711	.	C	T	10801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.739;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.207;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,335:672:99:10830,0,10689
chr2	2110616	.	C	T	12434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.138;DP=746;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.709;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.599;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,393:718:99:12463,0,10061
chr2	2110721	.	AC	A	8272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.139;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.236;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,292:550:99:8310,0,6965
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chr2	2122938	.	T	C	12029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.124;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.738;QD=18.54;ReadPosRankSum=-4.284;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,314:649:99:12058,0,12832
chr2	2122957	.	GAGT	G	10243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-1.926;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=6.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=5.187;QD=19.11;ReadPosRankSum=19.585;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,271:536:99:10281,0,11477
chr2	2122960	.	T	TAGAATGAAGAGAGTG	10996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.707;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=17.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-3.834;QD=19.46;ReadPosRankSum=-3.834;SOR=3.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,264:565:99:11034,0,12270
chr2	2122964	.	A	AGAATGAAGAATGAAGAGAGCGAGTG	2229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.221;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=19.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-7.506;QD=6.54;ReadPosRankSum=-6.713;SOR=2.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,20:341:99:2267,0,13602
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chr2	2142083	.	A	C	10682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.202;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.991;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.695;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,277:588:99:10711,0,12285
chr2	2142090	.	G	T	10764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.718;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.158;QD=18.56;ReadPosRankSum=2.157;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,274:580:99:10793,0,12358
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chr2	2144955	.	T	TC	7753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.266;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.779;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,253:530:99:7791,0,11048
chr2	2144966	.	T	C	10512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.315;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.921;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,273:526:99:10541,0,9845
chr2	2145067	.	G	A	7500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.378;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.246;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,247:528:99:7529,0,8933
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chr2	2149031	.	A	G	8953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.850;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.179;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,270:550:99:8982,0,8980
chr2	2149849	.	C	T	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.739;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.275;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,280:582:99:8973,0,9771
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chr2	2268132	.	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;ClippingRankSum=-0.331;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-14.536;QD=0.80;ReadPosRankSum=-13.932;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:554,82:636:99:535,0,23245
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chr2	2271018	.	G	GA	13178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.874;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=3.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=-0.661;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.102	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,457:460:99:13216,1315,0
chr2	2271036	.	G	GA	12827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.843;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=3.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=-1.627;QD=27.89;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,454:460:99:12865,1230,0
chr2	2290378	.	AT	A	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.364;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.857;QD=0.30;ReadPosRankSum=1.826;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,62:406:99:158,0,6492
chr2	2294400	.	A	AT	11490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.341;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=4.154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQRankSum=-0.571;QD=24.66;ReadPosRankSum=-2.528;SOR=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:17,449:466:99:11528,996,0
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chr2	2655147	.	G	GTTATT	2914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;ClippingRankSum=-0.195;DP=976;ExcessHet=3.0103;FS=4.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-5.223;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:615,118:733:99:2952,0,29245
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chr2	2691304	.	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.491;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQRankSum=-7.041;QD=1.12;ReadPosRankSum=2.977;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:674,69:743:99:860,0,28451
chr2	2691305	.	A	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.202;DP=771;ExcessHet=3.0103;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQRankSum=-7.040;QD=1.09;ReadPosRankSum=3.245;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:686,68:754:99:853,0,28536
chr2	2691308	.	A	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-0.041;DP=781;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQRankSum=-6.760;QD=0.95;ReadPosRankSum=1.937;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:692,72:764:99:755,0,28982
chr2	2691388	.	G	A	10165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=-0.111;DP=3642;ExcessHet=3.0103;FS=19.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.71;MQRankSum=1.398;QD=2.82;ReadPosRankSum=3.002;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3084,516:3600:99:10194,0,114950
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chr2	2732257	.	G	GA	13628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=31.19;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,437:437:99:13666,1360,0
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chr2	2936413	.	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;ClippingRankSum=-0.863;DP=1692;ExcessHet=3.0103;FS=13.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.17;MQRankSum=4.732;QD=0.05;ReadPosRankSum=2.800;SOR=1.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1511,163:1674:99:116,0,53833
chr2	2936434	.	A	G	17934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.950;ClippingRankSum=0.074;DP=1622;ExcessHet=3.0103;FS=107.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.70;MQRankSum=-23.611;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=4.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:927,687:1614:99:17963,0,28763
chr2	2936583	.	G	GGCATGAATTC	1098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.495;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQRankSum=0.573;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=1.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,6:253:99:1136,0,9612
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chr2	2987496	.	C	CA	5443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.023;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.336;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,299:359:99:5481,0,270
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chr2	3038441	.	A	C	9627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.297;DP=1516;ExcessHet=3.0103;FS=5.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.79;MQRankSum=-6.326;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1080,304:1384:99:9665,0,45387
chr2	3038442	.	G	T	9748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.311;DP=1494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQRankSum=-2.981;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:881,294:1175:99:9786,0,36579
chr2	3038443	.	T	TTTC	2517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=1.933;DP=1491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQRankSum=-7.273;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.280;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1135,145:1280:99:2555,0,48639
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chr2	3038702	.	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.080;ClippingRankSum=-0.568;DP=827;ExcessHet=3.0103;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQRankSum=-12.053;QD=1.41;ReadPosRankSum=3.096;SOR=1.243	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:724,81:805:99:1167,0,30832
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chr2	3038776	.	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=1.413;DP=797;ExcessHet=3.0103;FS=11.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQRankSum=-9.787;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=2.218	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:643,60:703:99:444,0,26354
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chr2	3230801	.	G	A	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.495;ClippingRankSum=0.888;DP=961;ExcessHet=3.0103;FS=8.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.09;MQRankSum=-5.986;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:838,99:937:99:1598,0,37723
chr2	3230811	.	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.446;ClippingRankSum=-3.485;DP=846;ExcessHet=3.0103;FS=1.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQRankSum=-8.049;QD=2.50;ReadPosRankSum=2.649;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:721,105:826:99:2091,0,31401
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chr3	603050	.	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=-0.697;DP=1976;ExcessHet=3.0103;FS=7.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.58;MQRankSum=4.733;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=1.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1610,217:1827:99:1563,0,60279
chr3	603054	.	A	G	13609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.848;ClippingRankSum=1.223;DP=2126;ExcessHet=3.0103;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQRankSum=1.795;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1538,446:1984:99:13638,0,64523
chr3	603063	.	G	A	13651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.183;ClippingRankSum=-0.075;DP=2320;ExcessHet=3.0103;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.24;MQRankSum=1.183;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1699,434:2133:99:13680,0,72447
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chr3	643454	.	CAT	C	3969.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.099;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.580;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.945;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,126:244:99:4007,0,3609
chr3	643532	.	T	C	6035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=-0.602;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.424;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,197:412:99:6064,0,6387
chr3	644882	.	A	G	8575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-1.527;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.500;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.270;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,274:573:99:8604,0,9310
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chr3	656689	.	T	C	9268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-1.572;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.551;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,236:499:99:9297,0,10938
chr3	656701	.	A	G	8702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.523;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=7.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.616;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,213:483:99:8731,0,11071
chr3	656710	.	TA	T	8450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-2.165;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.264;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,213:491:99:8488,0,11540
chr3	656734	.	TAGCG	T	7973.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=1.533;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=6.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.186;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.193;SOR=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,206:480:99:8011,0,11206
chr3	656742	.	A	G	7772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.038;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.090;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.454;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,202:476:99:7801,0,11210
chr3	656752	.	T	A	7721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.698;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=4.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.056;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,202:464:99:7750,0,10815
chr3	656753	.	A	G	7718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.929;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.418;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.100;SOR=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,201:465:99:7747,0,10853
chr3	657648	.	T	G	24173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.161;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQRankSum=-0.711;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.086	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,652:655:99:24202,1839,0
chr3	657690	.	AATGAGAGAG	A	11153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.989;DP=762;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.487;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,307:676:99:11191,0,14322
chr3	658382	.	AT	A	4835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.812;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.119;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,206:430:99:4873,0,5177
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chr3	667158	.	T	C	9609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.060;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.223;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,254:542:99:9638,0,11133
chr3	667172	.	T	C	9540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-1.750;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.119;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,256:528:99:9569,0,10634
chr3	667926	.	A	G	8332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.103;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.506;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,217:446:99:8361,0,8902
chr3	667935	.	A	T	8657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.016;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.123;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,223:449:99:8686,0,8797
chr3	669748	.	T	C	8866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.001;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.914;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.560;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,233:474:99:8895,0,7706
chr3	669759	.	G	A	7534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.850;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.990;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,244:505:99:7563,0,11630
chr3	669912	.	G	A	8791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.569;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.061;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,268:529:99:8820,0,9299
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chr3	675335	.	G	A	7101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.516;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.246;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,194:421:99:7130,0,8767
chr3	675843	.	G	GTA	4962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=1.454;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=2.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.183;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,131:291:99:5000,0,6475
chr3	675859	.	T	C	5451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=-0.583;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=7.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.654;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,150:348:99:5480,0,7589
chr3	677802	.	A	G	9259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.996;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.290;QD=16.71;ReadPosRankSum=4.201;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,289:554:99:9288,0,8429
chr3	677987	.	G	GAA	6270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=1.483;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.035;QD=15.84;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,192:396:99:6308,0,6844
chr3	678011	.	TGGA	T	8552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.815;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.010;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,224:466:99:8590,0,9594
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chr3	693984	.	G	A	8192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.938;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.119;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,206:435:99:8221,0,9076
chr3	693987	.	A	G	8183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;ClippingRankSum=-1.618;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.576;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,209:438:99:8212,0,9109
chr3	693999	.	G	T	8169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.926;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.413;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,203:437:99:8198,0,9636
chr3	694000	.	T	C	8161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.983;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.081;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,203:435:99:8190,0,9493
chr3	694006	.	T	C	8109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.704;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.825;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,215:455:99:8138,0,9404
chr3	694082	.	T	C	8896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.886;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.973;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.242;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,229:461:99:8925,0,9040
chr3	694086	.	T	C	8818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.809;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.172;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,227:458:99:8847,0,9038
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chr3	700925	.	CCTT	C	5949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.018;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.876;QD=17.05;ReadPosRankSum=3.231;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,149:349:99:5987,0,8106
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chr3	706883	.	C	T	7698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.768;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.728;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,199:427:99:7727,0,9217
chr3	706906	.	A	C	7311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=-0.533;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.349;QD=17.29;ReadPosRankSum=2.185;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,232:423:99:7340,0,7131
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chr3	708113	.	TA	T	5904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-1.125;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.364;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,262:501:99:5942,0,5269
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chr3	712661	.	G	GA	6176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=-0.638;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.635;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,197:416:99:6214,0,8707
chr3	712673	.	A	G	8610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=1.942;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.023;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,235:493:99:8639,0,9655
chr3	712775	.	C	G	7645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=0.667;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.324;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,266:548:99:7674,0,10324
chr3	713099	.	A	C	7966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.688;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.668;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,264:548:99:7995,0,8855
chr3	713127	.	A	G	8469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.188;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.290;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.730;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,280:582:99:8498,0,9442
chr3	713206	.	C	T	11401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.987;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.372;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,296:614:99:11430,0,12630
chr3	713210	.	G	A	11344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-1.166;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.039;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,292:611:99:11373,0,12500
chr3	713283	.	A	G	8863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.332;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.845;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,285:556:99:8892,0,8337
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chr3	723048	.	C	T	10319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.585;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.576;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,271:545:99:10348,0,10496
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chr3	723123	.	TGA	T	8880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-0.986;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.037;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,228:489:99:8918,0,10447
chr3	723381	.	C	CTT	6042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.655;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.036;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,192:418:99:6080,0,7677
chr3	724641	.	GT	G	9140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.547;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.097;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,232:492:99:9178,0,10465
chr3	724647	.	T	C	9697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=-0.519;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.220;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,248:523:99:9726,0,11036
chr3	724649	.	C	T	9622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=-1.173;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.364;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,247:523:99:9651,0,10948
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chr3	727923	.	G	A	6679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.086;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=3.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.776;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.983;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,180:378:99:6708,0,7012
chr3	730289	.	A	AACAGGTAAT	10785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.789;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.668;QD=21.32;ReadPosRankSum=-2.634;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,253:506:99:10823,0,9726
chr3	730311	.	A	G	10764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-1.091;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.570;QD=19.57;ReadPosRankSum=-3.331;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,290:550:99:10793,0,10001
chr3	730612	.	C	CT	3665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-2.003;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=5.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.679;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,170:379:99:3703,0,4666
chr3	731236	.	T	TG	8759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.207;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.563;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,226:451:99:8797,0,8765
chr3	731237	.	A	C	8768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.063;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.383;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,226:453:99:8797,0,8765
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chr3	740655	.	A	G	9934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.268;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.858;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.638;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,256:503:99:9963,0,9604
chr3	740657	.	G	A	9934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-1.273;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.116;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,256:501:99:9963,0,9604
chr3	740694	.	TG	T	7149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.833;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.915;QD=14.27;ReadPosRankSum=2.390;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,226:501:99:7187,0,10789
chr3	740697	.	A	T	7310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.891;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.196;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.670;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,234:511:99:7339,0,11149
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chr3	749308	.	TA	T	3305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.226;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.209;QD=9.42;ReadPosRankSum=2.624;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,169:351:99:3343,0,3591
chr3	749842	.	T	A	6698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-0.564;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.169;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,209:402:99:6727,0,5734
chr3	751476	.	C	G	6468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.950;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.505;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,207:417:99:6497,0,7914
chr3	753131	.	ACAG	A	9515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.437;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.684;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,249:491:99:9553,0,9279
chr3	754504	.	C	G	8293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.111;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=13.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.642;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.793;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,217:471:99:8322,0,10117
chr3	754515	.	A	C	8749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.317;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=14.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.306;QD=18.54;ReadPosRankSum=-2.177;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,227:472:99:8778,0,9573
chr3	754609	.	C	T	10020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.530;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.917;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,256:506:99:10049,0,9906
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chr3	759497	.	C	T	10693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=1.024;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.399;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,272:552:99:10722,0,11392
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chr3	759817	.	G	A	9509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.458;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.033;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.525;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,291:557:99:9538,0,8197
chr3	762449	.	G	GACA	8083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=1.728;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.038;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.576;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,204:437:99:8121,0,13906
chr3	762451	.	G	T	8070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.713;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.322;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,208:443:99:8099,0,13909
chr3	764844	.	T	C	7988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.551;ClippingRankSum=0.317;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.398;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,263:552:99:8017,0,8155
chr3	765635	.	T	C	5812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.941;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=6.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.148;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,179:331:99:5841,0,4945
chr3	765822	.	TGCGTTGCTGGGAATAGGAGGA	T	3890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=-1.254;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=0.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-0.591;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,110:284:99:3928,0,6895
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chr3	765934	.	TTTGAATTTCTGAATCTGGGCTCGC	T	6785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.427;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=4.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-0.581;QD=17.35;ReadPosRankSum=4.895;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,179:391:99:6823,0,8319
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chr3	771879	.	T	C	7960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.108;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=4.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.163;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.296;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,200:447:99:7989,0,10164
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chr3	777249	.	G	A	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.883;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.193;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,65:144:99:2428,0,4815
chr3	777535	.	C	T	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.519;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.986;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,37:56:99:1135,0,487
chr3	777588	.	T	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.164;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.997;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,30:95:99:1069,0,2565
chr3	777599	.	A	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.729;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.722;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,35:104:99:1180,0,2699
chr3	777987	.	A	T	5213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=1.027;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.499;QD=18.75;ReadPosRankSum=2.478;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,135:278:99:5242,0,8287
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chr3	780933	.	C	T	5241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=-0.990;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.404;QD=15.19;ReadPosRankSum=2.462;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,177:345:99:5270,0,5285
chr3	782103	.	T	A	9996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.617;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.489;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,258:518:99:10025,0,10135
chr3	782105	.	T	G	9996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=-0.097;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.070;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,253:513:99:10025,0,10135
chr3	782288	.	C	T	9279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;ClippingRankSum=-1.212;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.270;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,247:553:99:9308,0,11617
chr3	782293	.	GATTTTCATTTCCTTCATTTCCTTTCCCTTC	G	9436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.994;ClippingRankSum=1.248;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-1.886;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:399,249:648:99:9474,0,15745
chr3	782343	.	TCATTTCCTTCATTTC	T	8786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;ClippingRankSum=-1.365;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.687;QD=15.86;ReadPosRankSum=-4.439;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,231:554:99:8824,0,13016
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chr3	783648	.	C	T	7438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=1.307;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.380;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,184:367:99:7467,0,7212
chr3	783684	.	T	C	7308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.175;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=0.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.315;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,188:399:99:7337,0,8260
chr3	783688	.	C	A	7364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.245;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.587;QD=18.37;ReadPosRankSum=-1.523;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,190:401:99:7393,0,8231
chr3	783728	.	G	A	9603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.874;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.169;QD=21.58;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,246:445:99:9632,0,7583
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chr3	797537	.	C	CTAA	6492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=1.234;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.197;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,166:376:99:6530,0,8159
chr3	797560	.	A	G	5775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.530;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.860;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,193:414:99:5804,0,6894
chr3	797574	.	T	C	6144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=-0.709;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.045;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,197:412:99:6173,0,6321
chr3	797613	.	G	T	8140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.562;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.435;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,213:453:99:8169,0,9387
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chr3	800639	.	G	T	7624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.639;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=5.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.747;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,201:393:99:7653,0,7181
chr3	800668	.	T	G	6648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.918;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.372;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,204:408:99:6677,0,6672
chr3	801112	.	CT	C	3505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.151;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=7.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.996;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.773;SOR=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,164:322:99:3543,0,3422
chr3	801202	.	G	GAAA,GAAAA	6737.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.790;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.21;MQRankSum=1.733;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:10,63,15:88:99:6775,637,152,1277,0,923
chr3	801248	.	CATACA	C	6326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.898;ClippingRankSum=0.251;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.218;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,165:342:99:6364,0,6821
chr3	801295	.	G	A	8130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.986;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.055;QD=15.00;ReadPosRankSum=1.113;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,286:542:99:8159,0,7540
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chr3	803200	.	G	T	9220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.500;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.815;QD=16.86;ReadPosRankSum=2.331;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,291:547:99:9249,0,7747
chr3	803256	.	G	A	12540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.404;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=1.541;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,326:585:99:12569,0,9586
chr3	803278	.	ATAATGAACTGTCCCTTGTTTACACATGTCCGTTTTATCATACAATTTCTACTT	A	12106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.549;ClippingRankSum=-1.280;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=5.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=3.265;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,313:697:99:12144,0,15402
chr3	803640	.	T	C	6607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.153;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.186;QD=13.30;ReadPosRankSum=3.818;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,250:497:99:6636,0,7183
chr3	806247	.	C	T	8254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=-1.574;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.475;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,213:442:99:8283,0,9123
chr3	806249	.	C	A	8369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.739;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.626;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,209:436:99:8398,0,9322
chr3	806250	.	C	G	8311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.133;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.180;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,207:437:99:8340,0,9192
chr3	806253	.	G	A	8059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.976;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.537;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,207:442:99:8088,0,9284
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chr3	820028	.	T	C	7763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.116;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.444;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.747;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,207:432:99:7792,0,8749
chr3	820044	.	C	G	7929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.334;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.005;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,214:451:99:7958,0,8836
chr3	820432	.	T	C	6809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-1.063;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.045;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,231:481:99:6838,0,7745
chr3	820451	.	C	T	6534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=2.614;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.561;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,219:471:99:6563,0,7729
chr3	820645	.	C	T	6656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.014;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.611;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.622;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,217:447:99:6685,0,6770
chr3	821483	.	G	A	9993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.258;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.553;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,255:498:99:10022,0,9359
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chr3	825107	.	G	T	7994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.760;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,208:410:99:8023,0,7692
chr3	825110	.	G	GA	4063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=1.027;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.272;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,181:390:99:4101,0,8576
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chr3	825639	.	G	A	6118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.065;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.436;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,198:407:99:6147,0,6768
chr3	826473	.	A	AT	3409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=1.078;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=2.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.420;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,173:371:99:3447,0,4274
chr3	826610	.	A	G	7565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.296;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.177;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.721;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,234:425:99:7594,0,6211
chr3	826978	.	C	G	9019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=-0.388;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.519;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.048;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,234:481:99:9048,0,9576
chr3	826985	.	G	A	8999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=-1.569;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.213;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,237:481:99:9028,0,9628
chr3	827002	.	A	T	6858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;ClippingRankSum=-1.121;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.008;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,237:491:99:6887,0,8051
chr3	827016	.	G	A	7197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.994;ClippingRankSum=-0.284;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.648;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.374;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,247:501:99:7226,0,8194
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chr3	832786	.	TAAAATGAAATAAATATGGGTCGCGATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATG	T	8566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=1.042;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=1.514;QD=23.28;ReadPosRankSum=2.259;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,222:368:99:8604,0,5669
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chr3	832908	.	GA	G	8146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.908;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.604;QD=17.19;ReadPosRankSum=-2.052;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,233:474:99:8184,0,8783
chr3	833172	.	C	T	9925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.585;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.867;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,255:532:99:9954,0,10985
chr3	833174	.	C	T	9925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=1.202;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.175;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,258:536:99:9954,0,10985
chr3	833262	.	T	C	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.440;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.441;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,237:484:99:9168,0,9611
chr3	833264	.	G	A	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.560;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.064;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,229:473:99:9168,0,9611
chr3	833292	.	G	A	9582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.225;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.526;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,247:493:99:9611,0,9377
chr3	833303	.	G	C	10548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.607;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.707;QD=21.40;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,262:493:99:10577,0,9198
chr3	833315	.	A	T	10490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-1.283;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.288;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,257:487:99:10519,0,8994
chr3	833316	.	T	C	10373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-1.776;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.079;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,262:490:99:10402,0,8877
chr3	833375	.	G	T	10282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-1.236;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.517;QD=21.16;ReadPosRankSum=2.617;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,264:486:99:10311,0,8535
chr3	833377	.	C	T	10282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=1.617;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.343;QD=21.42;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,259:480:99:10311,0,8535
chr3	833633	.	C	T	6562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.395;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.469;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,181:352:99:6591,0,6935
chr3	833653	.	T	G	6901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.185;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.471;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,184:365:99:6930,0,7060
chr3	834266	.	T	C	9658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.238;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.047;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,251:509:99:9687,0,9981
chr3	834273	.	A	C	9900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.486;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.166;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,246:494:99:9929,0,10209
chr3	834285	.	A	G	9813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-1.174;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.176;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,247:478:99:9842,0,9330
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chr3	836766	.	A	G	8997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.558;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.611;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,230:480:99:9026,0,11613
chr3	836768	.	A	G	8985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-1.191;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-3.122;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,230:482:99:9014,0,11781
chr3	836770	.	T	C	9082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=1.645;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.540;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.711;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,229:477:99:9111,0,12078
chr3	836782	.	T	C	8930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=-0.388;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.153;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.237;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,226:477:99:8959,0,11910
chr3	836786	.	A	C	8813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=1.511;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.334;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,220:468:99:8842,0,11897
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chr3	838609	.	C	T	6020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.639;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.977;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,197:421:99:6049,0,6792
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chr3	839174	.	T	C	10394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=2.244;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.064;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,260:496:99:10423,0,9493
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chr3	841378	.	A	G	9164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.998;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.530;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,240:500:99:9193,0,9767
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chr3	842487	.	T	G	7269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=-0.665;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.391;QD=14.81;ReadPosRankSum=-2.302;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,235:491:99:7298,0,8464
chr3	843267	.	T	C	10047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-1.390;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.554;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,263:552:99:10076,0,11288
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chr3	843642	.	G	A	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.392;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.263;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,284:545:99:8921,0,7978
chr3	845436	.	A	G	7788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.933;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.248;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,204:459:99:7817,0,10242
chr3	845439	.	A	G	8051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.245;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.742;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,204:461:99:8080,0,10445
chr3	845442	.	A	G	8181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.319;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.641;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,212:472:99:8210,0,10353
chr3	845544	.	T	G	9487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.185;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,241:488:99:9516,0,10335
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chr3	861769	.	T	C	8902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=-1.317;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.340;QD=18.36;ReadPosRankSum=2.250;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,228:485:99:8931,0,9942
chr3	861799	.	T	C	7850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.763;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.339;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,243:485:99:7879,0,7634
chr3	861814	.	C	T	7569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=1.838;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.926;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,242:496:99:7598,0,7823
chr3	864859	.	A	G	8835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=1.773;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.229;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,275:481:99:8864,0,6199
chr3	866547	.	C	T	8451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.713;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.591;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,217:455:99:8480,0,9141
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chr3	873616	.	T	C	9971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.510;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.550;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,240:480:99:10000,0,9685
chr3	873632	.	T	C	9545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=2.055;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.533;QD=20.57;ReadPosRankSum=-1.220;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,232:464:99:9574,0,9345
chr3	873644	.	A	G	8880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.204;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.270;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,229:462:99:8909,0,9089
chr3	873937	.	AT	A	5642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.664;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.057;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.725;SOR=1.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,231:463:99:5680,0,5655
chr3	874086	.	T	G	8347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.704;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.574;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.730;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,218:470:99:8376,0,15681
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chr3	882497	.	T	A	6893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-1.301;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.298;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,246:544:99:6922,0,8834
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chr3	885493	.	C	T	8840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-1.236;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.342;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,238:495:99:8869,0,9909
chr3	885510	.	C	T	9174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-0.629;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.048;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,231:484:99:9203,0,10127
chr3	885519	.	T	C	8796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=-0.380;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.265;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.559;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,223:467:99:8825,0,9493
chr3	885558	.	G	A	8133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.141;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.653;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.342;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,256:466:99:8162,0,6434
chr3	886501	.	C	T	7515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.885;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.103;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,236:477:99:7544,0,7866
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chr3	899705	.	T	C	7547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-1.151;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.848;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,249:533:99:7576,0,8834
chr3	902214	.	C	T	6250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=-0.047;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.686;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,228:431:99:6279,0,6188
chr3	903114	.	C	T	8278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.342;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.396;QD=16.56;ReadPosRankSum=-1.796;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,263:500:99:8307,0,7230
chr3	903129	.	T	A	7297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.077;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.763;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,228:451:99:7326,0,6984
chr3	904242	.	A	G	7370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.716;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.513;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,195:378:99:7399,0,7011
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chr3	905787	.	T	A	6442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.506;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.284;QD=16.56;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,223:389:99:6471,0,4900
chr3	905841	.	T	C	5052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.484;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-0.757;QD=19.36;ReadPosRankSum=2.305;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,139:261:99:5081,0,4346
chr3	905864	.	A	C	4390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=1.083;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=0.371;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.725;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,107:198:99:4419,0,3648
chr3	905869	.	G	A	4463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.740;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-1.332;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,108:204:99:4492,0,3772
chr3	905871	.	G	A	4418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.409;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-0.295;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,106:201:99:4447,0,3817
chr3	905886	.	TATATATATATATATGTAG	T	3502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.672;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.645;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.775;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,89:199:99:3540,0,4362
chr3	905942	.	T	C	3968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.053;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-1.883;QD=16.54;ReadPosRankSum=-2.316;SOR=0.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,104:240:99:3997,0,5566
chr3	905950	.	C	T	4327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.136;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=2.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.677;QD=16.58;ReadPosRankSum=-2.857;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,109:261:99:4356,0,6213
chr3	905972	.	A	G	4775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-0.032;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.008;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,123:310:99:4804,0,7671
chr3	905975	.	TCAAAAAGAGAGAAGGAA	T	4598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=-0.382;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.218;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,126:356:99:4636,0,9287
chr3	906023	.	T	G	5584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=-0.195;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.631;QD=13.86;ReadPosRankSum=-2.608;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,155:403:99:5613,0,9626
chr3	906039	.	A	G	5945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=-1.917;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.365;QD=13.86;ReadPosRankSum=-2.644;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,165:429:99:5974,0,10182
chr3	906078	.	ATTT	A	7204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.182;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.884;QD=15.07;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,189:478:99:7242,0,11635
chr3	906085	.	C	A	7308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.662;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.066;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,195:480:99:7337,0,11830
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chr3	907175	.	C	T	8911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-1.841;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=5.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.651;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.989	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,221:412:99:8940,0,7453
chr3	908298	.	A	G	6967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-0.229;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.665;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,225:464:99:6996,0,7327
chr3	908327	.	T	G	6677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-0.453;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.505;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,215:437:99:6706,0,7039
chr3	908384	.	C	T	8844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.582;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.306;QD=20.91;ReadPosRankSum=-1.457;SOR=0.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,225:423:99:8873,0,7393
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chr3	919824	.	G	A	7713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.343;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.064;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,206:446:99:7742,0,9131
chr3	920461	.	A	G	7508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=-0.323;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.281;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,260:528:99:7537,0,8025
chr3	920903	.	C	G	6779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=3.060;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.626;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.536;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,214:443:99:6808,0,7054
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chr3	927247	.	T	A	7389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.185;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.075;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,233:407:99:7418,0,5174
chr3	928090	.	G	A	7243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.530;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.267;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,234:470:99:7272,0,7529
chr3	928317	.	C	A	11851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.030;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.665;QD=19.24;ReadPosRankSum=2.759;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,307:616:99:11880,0,12149
chr3	928318	.	T	G	11851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.258;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.889;QD=19.02;ReadPosRankSum=3.245;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,306:623:99:11880,0,12149
chr3	928462	.	C	CT	5855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.368;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=5.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.749;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.383;SOR=1.089	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,241:490:99:5893,0,6158
chr3	928571	.	C	T	7795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.150;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.252;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,204:420:99:7824,0,8315
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chr3	932816	.	A	G	8905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.667;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.502;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.115;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,237:522:99:8934,0,11022
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chr3	932951	.	C	T	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.175;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.611;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,295:555:99:9092,0,7817
chr3	933581	.	A	G	7667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.512;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.542;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.993;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,240:437:99:7696,0,6190
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chr3	937742	.	A	G	10361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.890;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.064;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,256:486:99:10390,0,9943
chr3	937749	.	G	A	10229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.754;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.804;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,261:491:99:10258,0,9307
chr3	938289	.	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.527;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.460;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.013;SOR=1.321	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,28:90:99:893,0,2068
chr3	938942	.	C	T	8571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.982;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.995;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,225:463:99:8600,0,11491
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chr3	941867	.	A	C	9435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-0.881;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.328;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,242:465:99:9464,0,8330
chr3	941882	.	A	G	10224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.883;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.235;QD=22.23;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,251:460:99:10253,0,8407
chr3	941885	.	G	A	10085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=-0.865;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.129;QD=21.23;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,256:475:99:10114,0,8397
chr3	941943	.	A	G	7741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.462;ClippingRankSum=0.447;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.810;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,207:493:99:7770,0,11342
chr3	941954	.	A	G	8322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=1.976;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.817;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,217:512:99:8351,0,11977
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chr3	941992	.	A	G	10346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-2.961;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.283;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,267:481:99:10375,0,8146
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chr3	943207	.	C	T	10436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.338;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.667;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.950;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,266:550:99:10465,0,11194
chr3	943233	.	C	T	9942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-0.603;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.528;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,259:542:99:9971,0,11053
chr3	943247	.	G	A	10010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=1.843;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.800;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.385;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,252:555:99:10039,0,12258
chr3	943250	.	G	A	10246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.805;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.018;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.900;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,255:556:99:10275,0,12255
chr3	943262	.	G	A	10357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=-1.834;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.021;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,256:551:99:10386,0,11871
chr3	943284	.	C	A	9314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.344;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.344;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,229:488:99:9343,0,10693
chr3	943287	.	ACC	A	9074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.037;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.969;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,225:493:99:9112,0,11002
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chr3	949436	.	TGCTGC	T	5150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.250;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=0.180;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.110;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,144:361:99:5188,0,8926
chr3	949447	.	CTGT	C	7724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-1.384;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.915;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,196:402:99:7762,0,8372
chr3	949461	.	GTGT	G	4330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.061;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.379;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.533;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,114:301:99:4368,0,7705
chr3	949468	.	CTGCTGCTGCTGTTGT	C	3865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.248;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-2.069;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,101:305:99:3903,0,8394
chr3	949513	.	T	C	6535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.895;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=4.046;QD=19.93;ReadPosRankSum=4.262;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,167:328:99:6564,0,6249
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chr3	951368	.	A	T	7610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=2.218;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.594;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,194:383:99:7639,0,7487
chr3	951373	.	G	GC	7681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.939;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.613;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.558;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,197:394:99:7719,0,7623
chr3	951456	.	T	C	7514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.887;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.773;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.196;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,199:414:99:7543,0,8362
chr3	951462	.	G	A	7677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=-0.752;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.004;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,201:415:99:7706,0,8293
chr3	951626	.	A	G	7661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.069;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.245;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,196:396:99:7690,0,7784
chr3	951634	.	C	T	8484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.075;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.812;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,214:417:99:8513,0,7986
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chr3	954036	.	A	T	9377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.355;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.396;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:9406,0,9811
chr3	954050	.	C	T	9380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.404;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.737;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,227:462:99:9409,0,9769
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chr3	957432	.	C	T	5455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=1.016;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.435;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.651;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,180:364:99:5484,0,6657
chr3	957457	.	T	C	5189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-1.536;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.655;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,180:380:99:5218,0,6679
chr3	957732	.	T	TG	9353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=2.110;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.667;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,232:499:99:9391,0,10607
chr3	957735	.	A	G	9719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=1.052;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.808;QD=18.76;ReadPosRankSum=-2.094;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,244:518:99:9748,0,10873
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chr3	959325	.	T	C	9424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-1.041;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=2.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.869;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,221:345:99:9453,0,10010
chr3	959329	.	T	C	9261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=1.591;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.967;QD=26.54;ReadPosRankSum=-2.112;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,224:349:99:9290,0,10016
chr3	959362	.	G	A	6461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=1.262;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.094;QD=16.15;ReadPosRankSum=-2.813;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,202:400:99:6490,0,17346
chr3	959390	.	T	C	3505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=-0.377;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=4.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.063;QD=7.52;ReadPosRankSum=6.012;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,136:466:99:3534,0,14832
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chr3	960991	.	T	C	6256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=1.793;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.325;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.665;SOR=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,208:461:99:6285,0,7751
chr3	961171	.	C	T	11763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.487;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.709;QD=20.82;ReadPosRankSum=3.198;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,301:565:99:11792,0,10090
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chr3	961207	.	G	A	12085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=-1.176;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.580;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,300:545:99:12114,0,9782
chr3	961209	.	A	G	11942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.720;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.652;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,294:544:99:11971,0,9715
chr3	961210	.	G	A	11906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=-0.780;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.344;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,293:546:99:11935,0,9634
chr3	961492	.	TAATACCAATAGTACTTCCCAGAAAAGTAACACTTTCCAGCAAAGC	T	3112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;QD=26.85;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3150,274,0
chr3	961741	.	C	G	6314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-1.553;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=0.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.429;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,161:324:99:6343,0,6319
chr3	961747	.	A	G	6377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=2.106;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.309;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,162:331:99:6406,0,6455
chr3	962239	.	C	T	5514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.242;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.825;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,144:273:99:5543,0,4989
chr3	962245	.	C	T	5346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-1.004;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=3.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.113;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,136:262:99:5375,0,4884
chr3	962261	.	T	G	4608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.715;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.085;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.490;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,120:240:99:4637,0,4615
chr3	962263	.	A	G	4608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.551;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.108;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,116:233:99:4637,0,4615
chr3	962299	.	G	C	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.249;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=5.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.877;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.579;SOR=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,102:211:99:3116,0,3231
chr3	962482	.	A	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=1.079;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.743;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:678,0,395
chr3	962495	.	G	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.638;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.305;QD=22.27;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:585,0,399
chr3	962532	.	A	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=-0.632;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.497;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,34:68:99:1330,0,1360
chr3	962536	.	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.745;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.646;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,35:73:99:1315,0,1533
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chr3	964951	.	T	C	8138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=-0.572;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.683;QD=19.02;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,215:428:99:8167,0,12166
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chr3	965335	.	T	C	8822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.890;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.066;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,231:464:99:8851,0,9134
chr3	965350	.	T	C	8842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.866;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.298;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.665;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,222:464:99:8871,0,10022
chr3	965356	.	T	C	8701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.582;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.489;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,229:485:99:8730,0,9925
chr3	965449	.	T	G	15675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.026;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQRankSum=0.547;QD=34.13;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,430:434:99:15704,1202,0
chr3	965575	.	G	A	8190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.419;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.826;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,211:407:99:8219,0,7282
chr3	965587	.	G	T	7895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=-0.640;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.561;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,206:403:99:7924,0,7452
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chr3	966090	.	T	G	7446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.260;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-3.216;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.993;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,193:457:99:7475,0,10867
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chr3	966311	.	C	T	10047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.568;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=1.228;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,249:446:99:10076,0,7842
chr3	966318	.	T	C	9547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-0.145;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.996;QD=21.26;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,242:449:99:9576,0,7852
chr3	966332	.	A	G	8050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=-0.329;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.112;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.671;SOR=1.013	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,241:462:99:8079,0,6373
chr3	966354	.	A	T	8278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.985;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.014;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,240:469:99:8307,0,6421
chr3	966375	.	G	A	7986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.904;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.482;QD=17.91;ReadPosRankSum=-2.016;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,210:446:99:8015,0,9756
chr3	966383	.	A	AT	7990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-1.657;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.255;QD=18.45;ReadPosRankSum=-3.096;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,196:433:99:8028,0,9683
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chr3	966388	.	TATGG	T	6812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.721;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=7.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-2.303;QD=15.81;ReadPosRankSum=-2.216;SOR=1.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,176:431:99:6850,0,10484
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chr3	967141	.	A	G	9671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.600;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.848;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,255:517:99:9700,0,11351
chr3	967154	.	T	C	9695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.708;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.195;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,259:540:99:9724,0,10842
chr3	967213	.	G	C	9865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=-0.635;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.198;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,259:571:99:9894,0,12164
chr3	967219	.	C	G	10074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.853;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.069;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,265:575:99:10103,0,12275
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chr3	969009	.	A	T	7010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.840;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.101;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,200:424:99:7039,0,7234
chr3	969030	.	T	C	6347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=1.052;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.234;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,187:396:99:6376,0,6463
chr3	969127	.	C	T	7124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.810;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.550;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,184:348:99:7153,0,6383
chr3	969132	.	G	A	7174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.435;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.398;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,183:354:99:7203,0,6536
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chr3	971612	.	T	C	9338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.595;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.502;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,245:460:99:9367,0,8164
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chr3	972718	.	A	G	9527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-0.546;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.820;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,246:520:99:9556,0,10764
chr3	972723	.	A	G	9456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-0.002;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.724;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,247:522:99:9485,0,10727
chr3	972787	.	G	A	7212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.224;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.001;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:7241,0,7628
chr3	972805	.	C	A	6878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-1.917;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.380;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,213:452:99:6907,0,7567
chr3	972817	.	T	C	7490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.037;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.011;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,220:444:99:7519,0,7146
chr3	972924	.	T	C	8936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.680;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.705;QD=20.45;ReadPosRankSum=1.757;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,224:437:99:8965,0,8254
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chr3	976983	.	A	G	5881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.250;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.006;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,157:311:99:5910,0,5795
chr3	977003	.	T	A	6842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.955;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=4.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.420;QD=20.80;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,167:329:99:6871,0,6601
chr3	977011	.	G	A	7101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.550;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=6.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.536;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=1.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,168:332:99:7130,0,6590
chr3	977030	.	G	A	7836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=-1.150;DP=372;ExcessHet=3.0103;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.205;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,200:369:99:7865,0,7419
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chr3	982014	.	T	C	7341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.155;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.973;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.638;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,198:445:99:7370,0,9428
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chr3	982077	.	C	T	8221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.219;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.272;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,206:425:99:8250,0,9006
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chr3	984055	.	T	C	10004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=-1.942;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.016;QD=21.24;ReadPosRankSum=-2.165;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,243:471:99:10033,0,9033
chr3	984065	.	T	TTCCCC	9962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.734;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.174;QD=21.11;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,242:472:99:10000,0,9382
chr3	984067	.	T	C	10031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.570;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.144;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,221:450:99:10060,0,9430
chr3	984073	.	T	TGG	9183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.793;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.488;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,221:456:99:9221,0,9823
chr3	984075	.	T	A	9286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.388;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=7.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.930;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,217:449:99:9315,0,9691
chr3	984085	.	A	G	9006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.930;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=8.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.951;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,230:454:99:9035,0,9250
chr3	984086	.	G	A	9009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.643;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=8.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.416;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,228:448:99:9038,0,9208
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chr3	985936	.	T	C	7571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.186;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.431;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,249:500:99:7600,0,7824
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chr3	988160	.	C	T	9083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=1.005;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.899;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,245:543:99:9112,0,11472
chr3	988561	.	T	A	7383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-0.044;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.628;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,233:484:99:7412,0,7763
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chr3	990545	.	A	G	6455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.379;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=4.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.605;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,171:351:99:6484,0,7661
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chr3	990702	.	A	G	7131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.058;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.446;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,187:417:99:7160,0,9047
chr3	990711	.	A	T	7289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.710;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.584;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,189:424:99:7318,0,9496
chr3	990726	.	C	T	7061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=1.196;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.578;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,189:432:99:7090,0,9453
chr3	990836	.	C	T	8075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=2.028;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.014;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,205:428:99:8104,0,8416
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chr3	992183	.	G	A	9086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=2.087;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.530;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,234:502:99:9115,0,10295
chr3	992198	.	G	A	9765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-0.596;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.471;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,244:510:99:9794,0,10614
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chr3	993057	.	A	G	7152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=-0.957;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.510;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,182:392:99:7181,0,8246
chr3	993247	.	G	A	11703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.077;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.343;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,288:566:99:11732,0,10875
chr3	993254	.	T	A	12768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.099;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.596;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,315:601:99:12797,0,11391
chr3	993268	.	A	G	12356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.013;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.028;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,330:652:99:12385,0,12020
chr3	993303	.	T	G	22993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=1.751;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQRankSum=-0.263;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.893	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,634:640:99:23022,1803,0
chr3	993504	.	G	T	7980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.165;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.063;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,237:450:99:8009,0,6362
chr3	993543	.	T	C	8864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.062;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.346;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,232:449:99:8893,0,8291
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chr3	995313	.	T	G	6739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-1.326;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.880;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,194:392:99:6768,0,6250
chr3	995402	.	A	G	8388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.502;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.136;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,212:431:99:8417,0,8728
chr3	995403	.	C	T	8550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=-0.293;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.258;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,215:434:99:8579,0,8800
chr3	995408	.	T	C	8774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.986;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.002;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,213:434:99:8803,0,8893
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chr3	1000439	.	G	T	9652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.104;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.207;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.567;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,256:534:99:9681,0,18156
chr3	1000572	.	A	T	9037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=1.454;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.337;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,306:611:99:9066,0,9456
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chr3	1005963	.	C	T	7351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.545;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=0.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-0.629;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.647;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,187:353:99:7380,0,6539
chr3	1005969	.	C	T	6914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=1.935;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.163;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,173:320:99:6943,0,5985
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chr3	1009409	.	GGTGGTGGGGGAGCTGCTGGAGGCACTGGAGACTTCGATTTCGCAGCAAATGCAGGTGGAA	G	494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.500;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.501;QD=1.43;ReadPosRankSum=-4.150;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,35:345:99:532,0,12647
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chr3	1010274	.	T	A	21658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.987;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQRankSum=-0.056;QD=34.00;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.145	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,635:637:99:21687,1860,0
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chr3	1010340	.	A	G	9262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.845;ClippingRankSum=1.036;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.715;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,302:582:99:9291,0,7386
chr3	1010370	.	T	C	8459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=-0.442;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=2.073;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.323;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,261:500:99:8488,0,7437
chr3	1010686	.	GTATCTTCCCTCTCACTTCCGA	G	5626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.288;ClippingRankSum=-0.125;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-2.467;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,159:379:99:5664,0,8670
chr3	1011541	.	T	C	7449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.578;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=0.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.475;QD=19.40;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,195:384:99:7478,0,7317
chr3	1011543	.	T	C	7449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.346;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.877;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.625;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,189:375:99:7478,0,7317
chr3	1011570	.	G	A	5888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.336;ClippingRankSum=-1.029;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.829;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,193:382:99:5917,0,6204
chr3	1011804	.	G	A	7646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.939;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=4.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.256;QD=19.46;ReadPosRankSum=2.627;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,201:393:99:7675,0,7347
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chr3	1015904	.	C	T	11242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.161;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-2.194;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.493;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,293:596:99:11271,0,12344
chr3	1015954	.	A	G	11535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=-0.031;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.433;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,291:560:99:11564,0,10414
chr3	1015958	.	G	A	11943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.709;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.079;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,295:561:99:11972,0,11033
chr3	1015966	.	C	T	11902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=2.328;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.179;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,299:565:99:11931,0,10716
chr3	1015979	.	C	T	11688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=-1.602;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.897;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,288:543:99:11717,0,10282
chr3	1015993	.	C	T	10927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.020;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.128;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,282:516:99:10956,0,8921
chr3	1016262	.	A	G	9945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=-0.111;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.063;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,258:533:99:9974,0,14734
chr3	1016264	.	T	C	9945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.805;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.214;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,260:539:99:9974,0,14734
chr3	1017074	.	T	C	9799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-2.411;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.032;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,306:534:99:9828,0,8358
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chr3	1017326	.	T	C	10229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=1.617;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.289;QD=17.85;ReadPosRankSum=3.325;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,327:573:99:10258,0,6969
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chr3	1023239	.	G	A	10035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.440;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.780;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,257:517:99:10064,0,9877
chr3	1023249	.	G	A	10596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.915;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.372;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,266:519:99:10625,0,10176
chr3	1023273	.	T	C	10624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.289;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.279;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.205;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,283:539:99:10653,0,9423
chr3	1023813	.	A	T	8935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=-0.014;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.735;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,242:503:99:8964,0,10083
chr3	1023829	.	G	A	9053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.664;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.485;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,242:517:99:9082,0,10655
chr3	1024166	.	C	T	10354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-0.211;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.928;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,284:594:99:10383,0,11481
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chr3	1024220	.	C	A	8164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=1.739;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.715;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,265:543:99:8193,0,8670
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chr3	1027825	.	AAAGTAGTAGTCTTAATATTAAGTACAGCAAATAG	A	5473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;ClippingRankSum=0.610;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-1.109;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,153:400:99:5511,0,9802
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chr3	1027927	.	C	T	9101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.669;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=6.330;QD=16.98;ReadPosRankSum=-2.517;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,256:536:99:9130,0,10462
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chr3	1029357	.	C	CCCTGCT	8809.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.197;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.200;QD=18.99;ReadPosRankSum=-3.029;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,216:464:99:8847,0,9562
chr3	1029767	.	T	C	9090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.255;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.448;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,291:580:99:9119,0,9122
chr3	1029922	.	G	C	8074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.124;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.083;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,261:503:99:8103,0,7218
chr3	1030000	.	G	C	10063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-2.228;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.301;QD=20.41;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,257:493:99:10092,0,9157
chr3	1030001	.	G	T	10063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=1.321;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.262;QD=20.29;ReadPosRankSum=2.604;SOR=0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,258:496:99:10092,0,9157
chr3	1030986	.	T	C	7225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.141;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.226;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,191:396:99:7254,0,8010
chr3	1030999	.	C	T	7672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.310;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.991;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.346;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,193:388:99:7701,0,7911
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chr3	1031038	.	A	AT	3504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.186;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.840;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,161:320:99:3542,0,3558
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chr3	1034608	.	TATTTCATTTTATTTTTTACA	T	6728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.947;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-2.859;QD=16.57;ReadPosRankSum=-3.894;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,179:406:99:6766,0,8918
chr3	1034685	.	G	T	6786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.168;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.956;QD=16.63;ReadPosRankSum=2.258;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,213:408:99:6815,0,5985
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chr3	1034787	.	C	T	7709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-1.018;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=6.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.016;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,189:362:99:7738,0,6879
chr3	1034797	.	T	C	7486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-1.704;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.677;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=1.028	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,196:381:99:7515,0,6994
chr3	1034835	.	A	AT	8202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.626;ClippingRankSum=-1.031;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.123;QD=20.46;ReadPosRankSum=-2.477;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,196:401:99:8240,0,7956
chr3	1034836	.	C	CTTTAT	8202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.287;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.395;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.909;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,193:402:99:8240,0,7956
chr3	1034865	.	A	G	8519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.639;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=4.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.254;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,225:459:99:8548,0,8862
chr3	1034881	.	C	T	9487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.232;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.631;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=1.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,238:474:99:9516,0,9476
chr3	1034901	.	A	C	9122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.418;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.142;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,244:488:99:9151,0,9370
chr3	1035265	.	T	C	10161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-0.177;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.742;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,277:586:99:10190,0,11631
chr3	1035280	.	A	G	9965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.978;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.202;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,267:556:99:9994,0,11065
chr3	1035920	.	A	G	9987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=1.080;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.436;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,262:547:99:10016,0,11020
chr3	1035928	.	C	T	10263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.282;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.536;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,269:552:99:10292,0,11017
chr3	1036112	.	G	T	12053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.539;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.380;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,318:647:99:12082,0,12713
chr3	1036124	.	T	C	12226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.892;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.122;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,304:616:99:12255,0,12640
chr3	1036142	.	A	T	11165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=1.902;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.157;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,295:623:99:11194,0,12248
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chr3	1036381	.	A	G	10088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.999;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.043;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,257:523:99:10117,0,10384
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chr3	1038960	.	T	C	10199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=1.135;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.381;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,269:530:99:10228,0,10918
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chr3	1039014	.	A	G	10864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=2.187;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.139;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,275:509:99:10893,0,10259
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chr3	1040061	.	T	C	11168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=1.170;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.743;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.100;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,289:578:99:11197,0,11180
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chr3	1041435	.	TTTAATTTAATACTGATC	T	9560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=2.283;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.936;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,251:513:99:9598,0,10265
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chr3	1041490	.	T	C	7544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.144;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.215;QD=15.98;ReadPosRankSum=3.441;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,229:472:99:7573,0,7735
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chr3	1041603	.	A	G	8178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.147;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.461;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,213:467:99:8207,0,10078
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chr3	1041676	.	T	C	9908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.812;ClippingRankSum=0.411;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.185;QD=19.06;ReadPosRankSum=3.524;SOR=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,247:520:99:9937,0,11118
chr3	1041677	.	A	C	9940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.279;ClippingRankSum=-0.222;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.829;QD=19.01;ReadPosRankSum=3.207;SOR=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,251:523:99:9969,0,11244
chr3	1041679	.	T	C	10232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=-0.166;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.307;QD=19.49;ReadPosRankSum=2.603;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,257:525:99:10261,0,11166
chr3	1041681	.	TTTA	T	10611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.439;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.526;QD=19.98;ReadPosRankSum=2.680;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,260:531:99:10649,0,11100
chr3	1041690	.	C	T	10376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-1.206;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.265;QD=19.80;ReadPosRankSum=3.169;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,259:524:99:10405,0,10874
chr3	1041704	.	A	G	10470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.056;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.938;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.655;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,276:546:99:10499,0,10266
chr3	1041735	.	A	G	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.898;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.939;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,290:585:99:8921,0,9426
chr3	1041812	.	T	C	9470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.554;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.547;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.047;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,265:563:99:9499,0,11052
chr3	1041829	.	TATG	T	10189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.741;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.492;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,259:547:99:10227,0,11505
chr3	1041840	.	C	T	9936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.924;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.734;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,263:540:99:9965,0,11056
chr3	1042017	.	A	G	12154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.869;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.947;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,310:604:99:12183,0,11478
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chr3	1043492	.	G	A	10874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.109;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=6.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.406;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,270:576:99:10903,0,12253
chr3	1043498	.	G	A	10346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=-1.164;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.107;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,271:576:99:10375,0,11944
chr3	1043539	.	G	A	8102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-1.206;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.665;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,259:507:99:8131,0,7767
chr3	1043565	.	G	A	7489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.274;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=3.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.714;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,248:524:99:7518,0,8637
chr3	1043646	.	T	C	6248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=-0.378;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=13.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.645;QD=14.91;ReadPosRankSum=6.549;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,223:419:99:6286,0,5639
chr3	1043706	.	G	A	7396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.484;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=6.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.537;QD=16.08;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,202:460:99:7425,0,9731
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chr3	1045259	.	A	C	9703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.194;ClippingRankSum=0.193;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.167;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,245:541:99:9732,0,12252
chr3	1045266	.	A	T	9481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;ClippingRankSum=2.212;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.035;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,239:530:99:9510,0,11850
chr3	1045272	.	T	A	9346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.805;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.629;QD=17.64;ReadPosRankSum=-2.036;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,239:530:99:9375,0,11985
chr3	1045273	.	T	A	9346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.440;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=2.029;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.915;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,242:539:99:9375,0,11985
chr3	1045276	.	T	C	9340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.625;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.550;QD=17.52;ReadPosRankSum=-2.270;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,239:533:99:9369,0,12069
chr3	1045280	.	ACTG	A	9340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.165;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.421;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,231:538:99:9378,0,12528
chr3	1045287	.	A	T	9943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-0.034;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.205;QD=18.83;ReadPosRankSum=-1.879;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,234:528:99:9972,0,11817
chr3	1045288	.	G	A	9946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.661;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.079;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.581;SOR=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,235:531:99:9975,0,11775
chr3	1045301	.	C	T	9899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=-0.876;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.330;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,252:546:99:9928,0,11754
chr3	1045310	.	G	A	9162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.572;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.742;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,239:520:99:9191,0,11158
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chr3	1047697	.	C	A	9678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.302;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.500;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,248:511:99:9707,0,10439
chr3	1047919	.	A	G	8791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.092;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.189;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.498;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,283:539:99:8820,0,7929
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chr3	1049786	.	G	A	8225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-1.477;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.207;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,213:455:99:8254,0,9392
chr3	1049922	.	G	A	10088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.940;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.378;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.993;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,260:538:99:10117,0,13647
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chr3	1050024	.	C	T	10835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=-0.324;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=4.664;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,260:524:99:10864,0,10815
chr3	1050031	.	AATTAAATAGCCTATTTATGAATAGTGTTT	A	10339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.176;ClippingRankSum=0.388;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.719;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,266:618:99:10377,0,14113
chr3	1050110	.	T	A	9887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=-1.165;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.198;QD=17.85;ReadPosRankSum=-4.862;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,254:554:99:9916,0,11869
chr3	1050113	.	T	TAA	10307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=-1.495;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.505;QD=18.81;ReadPosRankSum=-4.268;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,249:548:99:10345,0,11959
chr3	1050116	.	G	T	10164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-2.207;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=2.126;QD=17.90;ReadPosRankSum=-4.877;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,268:568:99:10193,0,11883
chr3	1050316	.	G	C	10819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=1.800;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.556;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,275:546:99:10848,0,10534
chr3	1050317	.	C	T	10819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.110;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.285;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,281:554:99:10848,0,10534
chr3	1050408	.	G	T	11509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.289;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.332;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,305:608:99:11538,0,11428
chr3	1050425	.	A	G	11463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.561;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.185;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,304:604:99:11492,0,11370
chr3	1050677	.	G	A	9343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.369;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.144;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,301:575:99:9372,0,8339
chr3	1050711	.	C	T	9168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-0.488;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.245;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,290:563:99:9197,0,8221
chr3	1050738	.	ATTGAATAAAATAAAGG	A	9897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=1.033;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.621;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,267:628:99:9935,0,14122
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chr3	1051912	.	T	C	5732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-0.096;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.024;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,154:274:99:5761,0,4319
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chr3	1051998	.	A	G	8181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.133;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.891;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,199:414:99:8210,0,9020
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chr3	1052039	.	T	C	8239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=-0.350;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=9.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.596;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,211:433:99:8268,0,9034
chr3	1052041	.	T	C	8255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-1.074;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=8.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.291;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,207:431:99:8284,0,8784
chr3	1052256	.	T	C	9765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.330;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.080;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,252:533:99:9794,0,11019
chr3	1052263	.	G	A	10333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.089;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.456;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,257:537:99:10362,0,11274
chr3	1052268	.	T	G	10263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=1.306;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.082;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.207;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,269:551:99:10292,0,10997
chr3	1052412	.	C	T	8166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.329;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.252;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.975;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,219:516:99:8195,0,11536
chr3	1052418	.	C	T	8086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=1.194;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.706;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,212:492:99:8115,0,11304
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chr3	1054628	.	CT	C	5228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=1.560;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=7.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.496;QD=13.41;ReadPosRankSum=3.027;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,156:390:99:5266,0,8879
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chr3	1054818	.	C	T	10986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=-1.201;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.362;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.622;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,283:504:99:11015,0,8412
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chr3	1054842	.	C	T	10679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=-0.477;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.980;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,267:490:99:10708,0,8670
chr3	1054872	.	A	G	8219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=-1.474;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.881;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,257:487:99:8248,0,6875
chr3	1054978	.	A	T	11041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.810;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.571;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,285:510:99:11070,0,8396
chr3	1055001	.	C	G	10763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=2.112;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.541;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,291:520:99:10792,0,8408
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chr3	1055030	.	T	C	8225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;ClippingRankSum=-0.234;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.109;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,211:485:99:8254,0,10911
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chr3	1058304	.	C	T	6582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=-0.342;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.974;QD=15.31;ReadPosRankSum=-3.430;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,181:430:99:6611,0,10078
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chr3	1058319	.	G	GATC	5519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;ClippingRankSum=-0.773;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.772;QD=13.43;ReadPosRankSum=-2.306;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,162:411:99:5557,0,10339
chr3	1058321	.	T	TTCTTGC	5515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.765;ClippingRankSum=-0.490;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=3.210;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,162:413:99:5553,0,10334
chr3	1058322	.	A	AATC	6739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.528;ClippingRankSum=0.067;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-1.461;QD=16.09;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,169:419:99:6777,0,10248
chr3	1058326	.	C	T	6551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=-0.123;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-0.460;QD=15.64;ReadPosRankSum=-2.152;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,170:419:99:6580,0,10765
chr3	1058344	.	C	T	6744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.082;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=8.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-0.528;QD=15.87;ReadPosRankSum=-5.488;SOR=1.224	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,173:425:99:6773,0,10418
chr3	1058354	.	G	A	7286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.528;ClippingRankSum=-1.108;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=6.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.445;QD=16.60;ReadPosRankSum=-8.802;SOR=1.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,190:439:99:7315,0,10420
chr3	1058362	.	A	G	7514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.778;ClippingRankSum=0.367;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=10.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=1.732;QD=16.09;ReadPosRankSum=-8.428;SOR=1.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,194:467:99:7543,0,11323
chr3	1058364	.	A	ATCAATAAGCAGGTAGGACCC	9560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-1.129;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=9.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-1.786;QD=20.34;ReadPosRankSum=-8.633;SOR=1.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,194:470:99:9598,0,11211
chr3	1058375	.	C	T	7617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;ClippingRankSum=-0.726;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.505;QD=14.88;ReadPosRankSum=-7.181;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,226:512:99:7646,0,11278
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chr3	1061428	.	T	C	7417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-1.137;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=2.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.941;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,193:375:99:7446,0,7172
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chr3	1061554	.	T	C	7435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.646;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.762;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,200:405:99:7464,0,9511
chr3	1061835	.	G	A	7494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.813;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.702;QD=17.93;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,194:418:99:7523,0,9026
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chr3	1063123	.	T	C	6635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=-0.523;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.331;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,210:461:99:6664,0,9131
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chr3	1063478	.	TTTTCACACTTTCTTCTTTTC	T	10429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=-0.101;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=0.558;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:348,262:610:99:10467,0,14247
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chr3	1063504	.	C	A	10153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.112;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-3.454;QD=19.16;ReadPosRankSum=2.898;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,254:530:99:10182,0,11802
chr3	1063507	.	ATCTACTC	A	10207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=1.056;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=8.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-3.820;QD=18.70;ReadPosRankSum=3.267;SOR=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,250:546:99:10245,0,12090
chr3	1063519	.	T	C	10583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;ClippingRankSum=-1.562;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=8.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-1.554;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,262:523:99:10612,0,10477
chr3	1063524	.	A	G	11178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.524;ClippingRankSum=-0.860;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=10.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.795;QD=21.09;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=1.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,275:530:99:11207,0,10112
chr3	1063535	.	G	A	11157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.547;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=9.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=2.524;QD=20.62;ReadPosRankSum=-3.425;SOR=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,289:541:99:11186,0,9691
chr3	1063642	.	C	G	10939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.752;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.252;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,350:653:99:10968,0,12331
chr3	1063699	.	T	C	7068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.374;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=7.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.499;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.538;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,257:604:99:7097,0,10949
chr3	1063788	.	T	C	9397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.553;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.007;QD=16.63;ReadPosRankSum=3.593;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,256:565:99:9426,0,11412
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chr3	1064799	.	T	C	12007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-0.016;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.521;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,290:602:99:12036,0,12371
chr3	1064814	.	T	G	11468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.408;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.641;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,295:611:99:11497,0,12218
chr3	1065434	.	T	A	22843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-0.946;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQRankSum=-1.216;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,613:616:99:22872,1760,0
chr3	1065462	.	T	C	11952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.320;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.197;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,320:626:99:11981,0,10839
chr3	1065485	.	A	G	10838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=1.125;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.173;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,301:603:99:10867,0,11369
chr3	1066276	.	T	C	7909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.387;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.172;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,269:530:99:7938,0,9668
chr3	1066608	.	T	C	11630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.908;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.524;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,303:566:99:11659,0,9953
chr3	1066618	.	G	A	11339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.471;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.327;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,291:550:99:11368,0,9912
chr3	1066648	.	A	G	8101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-0.112;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.653;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,260:553:99:8130,0,8947
chr3	1066782	.	A	ATTGTGC	12055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=1.665;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.449;QD=21.38;ReadPosRankSum=-2.823;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,288:564:99:12093,0,10720
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chr3	1066798	.	G	A	10874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-1.750;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.111;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.878;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,279:547:99:10903,0,10821
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chr3	1070613	.	A	AG	7699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.962;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.178;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,231:482:99:7737,0,8268
chr3	1070969	.	GT	G	7267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-2.458;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.771;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,249:508:99:7305,0,7614
chr3	1070997	.	T	TCTTATACA	10302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=1.747;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.090;QD=20.86;ReadPosRankSum=-3.319;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,250:494:99:10340,0,9478
chr3	1071000	.	T	TC	9816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=1.573;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.128;QD=18.99;ReadPosRankSum=-3.979;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,268:517:99:9854,0,9544
chr3	1071042	.	TTCAACTAGTGCTG	T	10094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.960;ClippingRankSum=1.212;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=3.356;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,260:572:99:10132,0,12475
chr3	1071073	.	C	A	10816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.860;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.530;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,270:559:99:10845,0,11880
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chr3	1071091	.	A	ATTG	12040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.642;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-1.283;QD=21.31;ReadPosRankSum=-2.368;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,282:565:99:12078,0,11583
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chr3	1072682	.	A	G	11399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.171;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.680;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,299:564:99:11428,0,10205
chr3	1072711	.	A	T	9591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.232;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.871;QD=15.42;ReadPosRankSum=-1.753;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,312:622:99:9620,0,9613
chr3	1072748	.	C	A	12935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.386;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.049;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,334:681:99:12964,0,13168
chr3	1072763	.	G	A	15157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.141;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.706;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,370:723:99:15186,0,14242
chr3	1072784	.	T	C	15761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=1.094;DP=754;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.632;QD=21.47;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,384:734:99:15790,0,13990
chr3	1072785	.	A	G	15752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.139;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=4.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.747;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,388:735:99:15781,0,14116
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chr3	1073890	.	A	G	6293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.495;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.420;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,207:473:99:6322,0,8399
chr3	1074272	.	A	T	11811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.409;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.896;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,306:635:99:11840,0,13026
chr3	1074274	.	C	T	12171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.887;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.254;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,299:627:99:12200,0,13251
chr3	1074281	.	T	C	12027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.784;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.287;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,300:635:99:12056,0,13611
chr3	1074294	.	T	C	11368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-0.207;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.083;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,289:619:99:11397,0,13234
chr3	1074295	.	G	A	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.063;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.970;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,293:622:99:11325,0,13072
chr3	1074433	.	G	A	10004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-2.060;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.319;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,262:585:99:10033,0,12875
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chr3	1079810	.	T	TGTATGATTACCTCACTTTATTTTCCTTTTTATTTTTACTTTACTTTA	3698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.012;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=84.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.413;QD=9.22;ReadPosRankSum=-15.627;SOR=4.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,117:401:99:3736,0,11504
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chr3	1080133	.	A	G	9558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.620;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.007;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.438;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,318:625:99:9587,0,9496
chr3	1080443	.	T	C	12140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.090;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.183;QD=20.10;ReadPosRankSum=4.133;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,303:604:99:12169,0,31902
chr3	1080444	.	G	C	12260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-0.908;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.320;QD=20.03;ReadPosRankSum=2.680;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,304:612:99:12289,0,32035
chr3	1080448	.	T	C	12277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.550;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.062;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,317:637:99:12306,0,32100
chr3	1080646	.	G	T	10928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.192;ClippingRankSum=-0.254;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.371;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,289:585:99:10957,0,11368
chr3	1080652	.	G	A	11075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.294;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.632;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,294:584:99:11104,0,11301
chr3	1080807	.	T	C	10932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.081;DP=801;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQRankSum=-0.806;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,281:562:99:10961,0,10880
chr3	1080813	.	G	T	10843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.113;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQRankSum=1.092;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,277:555:99:10872,0,10849
chr3	1080933	.	A	G	8177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.950;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-0.114;QD=15.61;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,267:524:99:8206,0,8171
chr3	1082849	.	A	C	7153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-2.037;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=6.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.408;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=1.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,226:480:99:7182,0,8150
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chr3	1097131	.	G	A	11864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-0.043;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.301;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,299:567:99:11893,0,10518
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chr3	1097157	.	G	A	11173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=-0.861;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.815;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,271:528:99:11202,0,10392
chr3	1097173	.	A	C	10598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=2.615;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.793;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,260:501:99:10627,0,9682
chr3	1097176	.	A	G	10547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.819;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.285;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,255:500:99:10576,0,9811
chr3	1097179	.	C	T	10712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.120;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.754;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,259:501:99:10741,0,9841
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chr3	1102125	.	T	C	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=-0.146;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.033;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,313:597:99:9930,0,8531
chr3	1102226	.	T	C	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.322;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.669;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,254:529:99:8559,0,10371
chr3	1102265	.	A	G	11831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=1.934;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.083;QD=21.47;ReadPosRankSum=-1.564;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,298:551:99:11860,0,9673
chr3	1102270	.	A	G	11836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=-0.103;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.233;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,303:565:99:11865,0,9888
chr3	1102638	.	G	A	8466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.449;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.161;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,279:578:99:8495,0,9356
chr3	1103104	.	TA	T	5588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-0.554;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.515;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,233:480:99:5626,0,6094
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chr3	1103149	.	C	CA	10755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=2.657;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.514;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.960;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,265:556:99:10793,0,11922
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chr3	1104953	.	CT	C	7965.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.114;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.559;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,214:448:99:8003,0,8928
chr3	1104970	.	G	C	9203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-1.610;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.151;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,231:483:99:9232,0,10416
chr3	1104976	.	C	T	9398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.552;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.821;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,234:486:99:9427,0,10102
chr3	1104993	.	T	G	8322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.877;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.389;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,219:467:99:8351,0,10129
chr3	1105005	.	T	C	9143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=-0.273;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.202;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,232:488:99:9172,0,10747
chr3	1105008	.	A	T	9149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.315;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.364;QD=19.06;ReadPosRankSum=1.463;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,225:480:99:9178,0,10663
chr3	1105026	.	G	C	9592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=1.026;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.876;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,238:496:99:9621,0,10454
chr3	1105029	.	T	A	9375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.463;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.281;QD=18.64;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,245:503:99:9404,0,10235
chr3	1105294	.	T	A	11742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.107;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.785;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,301:572:99:11771,0,10816
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chr3	1106651	.	C	CTTTT	4935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-0.414;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=16.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-2.602;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,103:331:99:4973,0,9489
chr3	1106657	.	T	C	8566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.584;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.938;QD=20.69;ReadPosRankSum=8.658;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,224:414:99:8595,0,7533
chr3	1106684	.	CT	C	3433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=-0.273;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=11.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.493;QD=10.41;ReadPosRankSum=-4.837;SOR=1.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,151:330:99:3471,0,4278
chr3	1106791	.	C	CT	4364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=-1.114;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.603;QD=11.37;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,193:384:99:4402,0,4269
chr3	1106934	.	C	T	8337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.929;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.389;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,222:482:99:8366,0,10091
chr3	1106945	.	TC	T	8843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-0.921;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.497;QD=18.27;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,222:484:99:8881,0,10565
chr3	1106947	.	TATAGTTC	T	8732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.600;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.863;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,219:498:99:8770,0,11518
chr3	1106971	.	C	T	8967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-1.449;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.738;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,243:509:99:8996,0,10353
chr3	1107024	.	G	A	10798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.601;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.506;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,272:534:99:10827,0,10023
chr3	1107030	.	G	A	10866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.355;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.422;QD=20.90;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,271:520:99:10895,0,10004
chr3	1107042	.	A	T	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=1.501;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.194;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,266:517:99:10209,0,9537
chr3	1107454	.	C	A	7893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.579;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.950;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,251:530:99:7922,0,9099
chr3	1107483	.	G	A	9089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.495;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.085;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,242:526:99:9118,0,11001
chr3	1107504	.	G	A	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-0.917;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.763;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,251:539:99:9241,0,10861
chr3	1107759	.	C	T	11961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.312;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.057;QD=21.40;ReadPosRankSum=4.320;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,304:559:99:11990,0,9516
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chr3	1110804	.	T	C	7301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=1.163;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.176;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,237:476:99:7330,0,7430
chr3	1110939	.	AGCAGGCGGTGCAGAAGGAGTAGTAGGT	A	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=-0.958;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=43.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=1.324;QD=0.47;ReadPosRankSum=-4.562;SOR=4.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,22:217:99:139,0,7519
chr3	1110965	.	GTGC	G	7331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.161;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=1.657;QD=23.20;ReadPosRankSum=-2.083;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,195:316:99:7369,0,4082
chr3	1110969	.	AGGCGGTGCAGAAGGAGTAGTAGGTGCAGGCGGTGCAGAAGGAGTAGTAGGT	A	7081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=-0.157;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=1.726;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.441;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,201:405:99:7119,0,7047
chr3	1111088	.	GAGGAGCCAGAGGAGCCGGAGGAGCCGC	G	6147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=-0.062;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=13.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.390;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,165:380:99:6185,0,8666
chr3	1111175	.	CAGG	C	7598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.026;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.768;QD=17.08;ReadPosRankSum=2.429;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,196:445:99:7636,0,10300
chr3	1111194	.	C	T	8928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.390;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.188;QD=18.26;ReadPosRankSum=-2.158;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,230:489:99:8957,0,10367
chr3	1111208	.	A	C	9237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.643;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.205;QD=19.17;ReadPosRankSum=-2.305;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,232:482:99:9266,0,10236
chr3	1111210	.	G	A	9051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.138;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.674;QD=18.82;ReadPosRankSum=-2.388;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,234:481:99:9080,0,9877
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chr3	1111322	.	C	T	7739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;ClippingRankSum=-1.309;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=93.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.563;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=3.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,165:372:99:7768,0,14881
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chr3	1112289	.	G	A	8335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=1.654;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.087;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.684;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,266:507:99:8364,0,7489
chr3	1112757	.	C	T	9569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=-1.139;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.585;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.693;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,238:508:99:9598,0,11218
chr3	1112760	.	T	A	9716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.772;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.620;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,243:514:99:9745,0,10915
chr3	1112772	.	C	T	9296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.760;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.012;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,236:507:99:9325,0,10945
chr3	1112783	.	G	A	9203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=1.438;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.193;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,226:482:99:9232,0,10492
chr3	1112806	.	ACAAAC	A	7966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=-0.549;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.141;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.727;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,199:441:99:8004,0,9784
chr3	1112822	.	C	T	7680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-0.115;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=1.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.716;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,194:421:99:7709,0,9088
chr3	1112833	.	C	A	7136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.639;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=1.001;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,187:393:99:7165,0,8184
chr3	1112860	.	G	A	6054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=-0.431;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.090;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,185:340:99:6083,0,4698
chr3	1112875	.	ATTTTT	A	5469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-0.829;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.701;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,145:285:99:5507,0,4945
chr3	1112936	.	T	C	3702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.451;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.006;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,134:334:99:3731,0,6108
chr3	1113074	.	A	T	10270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.947;ClippingRankSum=-0.618;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.755;QD=17.92;ReadPosRankSum=-1.373;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,279:573:99:10299,0,11307
chr3	1113094	.	T	C	12248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.560;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.792;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,305:616:99:12277,0,12443
chr3	1113101	.	C	T	12070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.324;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.652;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,296:602:99:12099,0,12333
chr3	1113102	.	T	C	12597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.152;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.900;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,301:611:99:12635,0,12545
chr3	1113118	.	T	G	12528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=-1.154;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.349;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,310:612:99:12557,0,12467
chr3	1113128	.	A	G	12961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.555;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.761;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,320:628:99:12990,0,12259
chr3	1113138	.	A	G	12505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.369;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.976;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,319:623:99:12534,0,11774
chr3	1113197	.	G	A	11043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.106;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.218;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,289:585:99:11072,0,11809
chr3	1113207	.	G	A	11544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.634;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.754;QD=20.01;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,287:577:99:11573,0,11936
chr3	1113210	.	T	C	11056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.563;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.119;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,282:576:99:11085,0,11524
chr3	1113241	.	G	A	9157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.621;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.767;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,290:573:99:9186,0,8883
chr3	1113445	.	C	T	9852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=-2.073;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.015;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,329:636:99:9881,0,9647
chr3	1113589	.	C	T	9688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.825;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.091;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,246:485:99:9717,0,9358
chr3	1113597	.	G	A	9589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.378;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.374;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,237:484:99:9618,0,9729
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chr3	1113619	.	ATATAAC	A	9870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.556;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.353;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,247:509:99:9908,0,10275
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chr3	1116373	.	A	G	13978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.526;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.593;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,353:708:99:14007,0,13920
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chr3	1116551	.	G	A	11674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=1.442;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.265;QD=20.55;ReadPosRankSum=-1.104;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,297:568:99:11703,0,10577
chr3	1116552	.	G	A	11755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.469;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.084;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,294:565:99:11784,0,10612
chr3	1116555	.	C	T	11773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=1.110;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.673;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,289:552:99:11802,0,10767
chr3	1116565	.	T	TA	11338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=-0.607;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.693;QD=20.92;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,276:542:99:11376,0,10881
chr3	1116568	.	A	AT	10978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-1.635;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.498;QD=20.83;ReadPosRankSum=-1.089;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,264:527:99:11016,0,10656
chr3	1116574	.	T	A	10853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.098;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.498;QD=20.87;ReadPosRankSum=-2.147;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,266:520:99:10882,0,10207
chr3	1116593	.	C	T	10318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.583;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.313;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,256:538:99:10347,0,11247
chr3	1116607	.	C	T	10783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=-2.665;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.480;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.810;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,264:562:99:10812,0,12342
chr3	1116613	.	G	T	10837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=-0.908;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.317;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,266:558:99:10866,0,12171
chr3	1116624	.	G	A	11248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-0.323;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.643;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,279:566:99:11277,0,11682
chr3	1116639	.	T	G	11112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-1.817;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.026;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,276:581:99:11141,0,12360
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chr3	1118724	.	CAGAAATGAGGTTGGGAA	C	12081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.837;ClippingRankSum=-0.918;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-1.988;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.692;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:389,305:694:99:12119,0,16133
chr3	1118761	.	C	T	12237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-0.405;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-1.024;QD=18.83;ReadPosRankSum=-2.894;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,301:650:99:12266,0,14201
chr3	1118763	.	T	A	12369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=-0.018;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.917;QD=18.83;ReadPosRankSum=-3.738;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,306:657:99:12398,0,14108
chr3	1118778	.	A	C	11667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.142;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-2.244;QD=18.85;ReadPosRankSum=-5.930;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,293:619:99:11696,0,13991
chr3	1118791	.	T	TTCAA	11320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.208;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-1.263;QD=18.84;ReadPosRankSum=-4.969;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,274:601:99:11358,0,13431
chr3	1118793	.	T	TTAC	11536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.870;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=2.649;QD=19.20;ReadPosRankSum=-5.157;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,275:601:99:11574,0,13332
chr3	1118804	.	A	G	10909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.461;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=2.784;QD=18.65;ReadPosRankSum=-4.366;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,269:585:99:10938,0,12938
chr3	1118810	.	A	G	10445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.466;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.168;QD=17.67;ReadPosRankSum=-2.728;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,272:591:99:10474,0,12615
chr3	1118837	.	C	T	8516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-2.058;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.212;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,274:573:99:8545,0,9598
chr3	1118933	.	A	AG	12311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=-2.380;DP=738;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.230;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,373:713:99:12349,0,10492
chr3	1118970	.	A	G	14363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=1.001;DP=752;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.047;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,372:730:99:14392,0,13441
chr3	1118979	.	G	T	14473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.511;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.720;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,361:691:99:14502,0,13339
chr3	1118995	.	A	C	14255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-0.504;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.029;QD=20.81;ReadPosRankSum=2.149;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,353:685:99:14284,0,13320
chr3	1119001	.	A	G	13730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.831;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.455;QD=19.90;ReadPosRankSum=2.082;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,357:690:99:13759,0,12953
chr3	1119032	.	TA	T	5653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.216;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.042;QD=10.02;ReadPosRankSum=2.114;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,277:564:99:5691,0,6314
chr3	1119711	.	CA	C	9795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.858;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.165;QD=21.16;ReadPosRankSum=-1.555;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,252:463:99:9833,0,4770
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chr3	1119894	.	A	G	9397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=1.098;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.734;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,255:563:99:9426,0,17216
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chr3	1120524	.	C	T	8236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.784;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.640;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,265:518:99:8265,0,7861
chr3	1120535	.	T	C	7521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.200;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.329;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,239:476:99:7550,0,7371
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chr3	1120770	.	T	C	6758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.001;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-2.113;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,182:353:99:6787,0,6281
chr3	1120793	.	T	C	7036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.516;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=5.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-1.384;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,168:323:99:7065,0,6116
chr3	1120802	.	C	T	6751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.740;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=3.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-1.326;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,171:330:99:6780,0,6240
chr3	1120811	.	TGCCTGC	T	6930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.658;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-0.473;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,165:331:99:6968,0,6518
chr3	1120827	.	T	C	6712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=1.647;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-1.456;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,169:322:99:6741,0,6201
chr3	1120832	.	C	T	6633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=-0.162;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=0.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-0.778;QD=20.80;ReadPosRankSum=2.493;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,169:319:99:6662,0,5955
chr3	1120835	.	CGCCTGTGCCTGCGCCTGAGCCTGTGCCTGA	C	6314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.788;ClippingRankSum=0.275;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=0.124;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.750;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,161:353:99:6352,0,7959
chr3	1120900	.	A	G	5974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=-0.245;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=1.535;QD=17.27;ReadPosRankSum=3.448;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,158:346:99:6003,0,7971
chr3	1120916	.	T	C	6396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.433;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.521;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.488;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,168:373:99:6425,0,8270
chr3	1120926	.	G	C	6741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.168;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=7.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.084;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,170:370:99:6770,0,8120
chr3	1120931	.	T	C	6693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=1.602;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=6.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.027;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.631;SOR=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,169:369:99:6722,0,8207
chr3	1120935	.	A	G	6891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.481;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.448;QD=18.48;ReadPosRankSum=-2.771;SOR=0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,171:373:99:6920,0,8360
chr3	1120936	.	T	C	6852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.912;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.214;QD=18.08;ReadPosRankSum=-2.805;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,174:379:99:6881,0,8321
chr3	1120939	.	G	A	6858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.870;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.274;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.685;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,174:378:99:6887,0,8237
chr3	1120963	.	T	G	7245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-1.636;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.034;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,184:412:99:7274,0,9254
chr3	1120969	.	G	A	7608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.462;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.134;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.310;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,188:411:99:7637,0,9428
chr3	1120988	.	A	G	7593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.157;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=7.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.160;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.432;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,184:399:99:7622,0,9052
chr3	1121006	.	C	T	7137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.591;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.040;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,194:401:99:7166,0,7988
chr3	1121042	.	C	T	8346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.518;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.135;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,217:419:99:8375,0,12529
chr3	1121053	.	T	C	8810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-0.905;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.113;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,215:435:99:8839,0,13912
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chr3	1121254	.	T	C	7227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.394;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.314;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,190:371:99:7256,0,6758
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chr3	1122127	.	ATGAAGGTTTCTGCGCGGCGGGCGCCGCAGCGTCGCTCGTGGAG	A	4544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.462;ClippingRankSum=-0.435;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-3.679;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.338;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,146:416:99:4582,0,11637
chr3	1122240	.	G	A	8506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.239;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.680;QD=21.43;ReadPosRankSum=-2.002;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,217:397:99:8535,0,7552
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chr3	1122275	.	G	A	9476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.659;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.459;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,235:461:99:9505,0,8994
chr3	1122298	.	C	T	10087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=1.017;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.024;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,250:473:99:10116,0,8845
chr3	1122306	.	G	A	10120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.633;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.008;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,261:492:99:10149,0,8848
chr3	1122452	.	G	T	7904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.918;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.034;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,253:511:99:7933,0,8065
chr3	1122610	.	G	A	12365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=-0.527;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.175;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,332:614:99:12394,0,10241
chr3	1122628	.	AG	A	11709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.709;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.467;QD=17.93;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,342:653:99:11747,0,11171
chr3	1122730	.	CA	C	6348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-0.459;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.764;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,282:494:99:6386,0,4147
chr3	1122745	.	A	G	10367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.589;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.510;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,346:590:99:10396,0,6470
chr3	1122895	.	GA	G	5707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.061;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=4.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.894;QD=11.26;ReadPosRankSum=2.087;SOR=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,234:507:99:5745,0,6992
chr3	1123013	.	T	C	10223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.586;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=9.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.942;QD=20.53;ReadPosRankSum=-2.470;SOR=0.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,259:498:99:10252,0,9490
chr3	1123021	.	A	G	10631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.268;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=11.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.015;QD=21.01;ReadPosRankSum=-2.937;SOR=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,265:506:99:10660,0,9652
chr3	1123023	.	A	ATT	10742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.119;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=11.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.197;QD=20.82;ReadPosRankSum=-2.388;SOR=0.288	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,269:516:99:10780,0,9556
chr3	1123147	.	G	A	11632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.902;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=1.674;QD=18.32;ReadPosRankSum=2.224;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,289:635:99:11661,0,13851
chr3	1123170	.	G	A	11154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=-0.218;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-1.179;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,286:631:99:11183,0,14153
chr3	1123176	.	GGAAAAT	G	6794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.046;ClippingRankSum=0.957;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-4.175;QD=11.80;ReadPosRankSum=2.965;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,206:576:99:6832,0,15394
chr3	1123185	.	GGAGAATATGGAA	G	7261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-1.496;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-1.936;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,211:590:99:7299,0,15863
chr3	1123202	.	A	C	7528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.039;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-2.784;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.070;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:392,225:617:99:7557,0,16053
chr3	1123215	.	AAATAAGGAG	A	8591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-0.538;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-3.615;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:401,239:640:99:8629,0,16610
chr3	1123238	.	TGGAGAATAA	T	8330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.260;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQRankSum=-3.087;QD=14.19;ReadPosRankSum=-5.918;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,229:587:99:8368,0,14858
chr3	1123277	.	A	G	11327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;QD=19.73;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,291:574:99:11365,0,11111
chr3	1123292	.	A	T	10359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.081;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=4.735;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,277:546:99:10388,0,10905
chr3	1123343	.	C	T	8419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-0.761;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.255;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,269:536:99:8448,0,9731
chr3	1123470	.	G	A	8791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=1.512;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.143;QD=17.62;ReadPosRankSum=-2.300;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,233:499:99:8820,0,10211
chr3	1123485	.	T	C	8589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.566;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.369;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.338;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,232:501:99:8618,0,10532
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chr3	1126541	.	TG	T	9524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-0.848;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=1.329;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,242:501:99:9562,0,10318
chr3	1126543	.	C	A	9332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.670;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.731;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,238:497:99:9361,0,10207
chr3	1126635	.	T	C	5833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.828;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.295;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,199:420:99:5862,0,8720
chr3	1126638	.	C	CAA	6449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.336;ClippingRankSum=0.569;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.604;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,194:392:99:6487,0,8392
chr3	1126666	.	GTATCTGT	G	7996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=1.232;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.913;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,210:468:99:8034,0,10223
chr3	1126710	.	T	C	10756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=-0.593;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.511;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,265:491:99:10785,0,9043
chr3	1126712	.	T	C	11119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.294;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.777;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.573;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,273:506:99:11148,0,9226
chr3	1126719	.	T	A	11396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.560;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.693;QD=21.71;ReadPosRankSum=2.396;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,281:525:99:11425,0,9625
chr3	1126722	.	C	T	11539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.567;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.402;QD=21.49;ReadPosRankSum=2.090;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,289:537:99:11568,0,9948
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chr3	1129213	.	T	C	11606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.702;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.490;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.555;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,302:636:99:11635,0,12975
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chr3	1129494	.	G	T	10507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.254;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.083;QD=20.56;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,260:511:99:10536,0,9997
chr3	1129510	.	G	A	9593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-1.048;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.015;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.566;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,255:502:99:9622,0,9388
chr3	1130758	.	A	G	11275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.179;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.407;QD=18.39;ReadPosRankSum=2.285;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,293:613:99:11304,0,12496
chr3	1130761	.	G	T	11333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-0.766;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.342;QD=18.46;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,296:614:99:11362,0,12512
chr3	1131019	.	TAAGAA	T	9061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.625;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.353;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.834;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,245:512:99:9099,0,9938
chr3	1131094	.	C	CAAAA	11166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.904;ClippingRankSum=0.084;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=8.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.837;QD=21.43;ReadPosRankSum=-7.901;SOR=1.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,250:521:99:11204,0,10701
chr3	1131104	.	C	G	9723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.952;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=4.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.509;QD=17.78;ReadPosRankSum=5.069;SOR=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,303:547:99:9752,0,11696
chr3	1131136	.	A	G	8386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=1.895;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.550;QD=14.48;ReadPosRankSum=2.037;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,270:579:99:8415,0,9235
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chr3	1131195	.	G	GAGCAAT	11977.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.165;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.589;QD=20.54;ReadPosRankSum=-3.090;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,291:583:99:12015,0,11409
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chr3	1133431	.	C	T	4095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.644;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.111;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,154:310:99:4124,0,4645
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chr3	1133626	.	C	G	6712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=2.071;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.385;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.060;SOR=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,164:342:99:6741,0,7139
chr3	1133630	.	C	T	6496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=0.411;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=6.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.865;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.928;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,169:353:99:6525,0,7144
chr3	1133734	.	A	C	6862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=1.211;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=7.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.390;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,177:352:99:6891,0,6860
chr3	1133735	.	G	T	6862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-1.636;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.352;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,177:355:99:6891,0,6860
chr3	1133772	.	C	G	6279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.289;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,205:410:99:6308,0,6314
chr3	1133834	.	A	T	7545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.907;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.868;QD=16.88;ReadPosRankSum=3.502;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,204:447:99:7574,0,9481
chr3	1133842	.	G	T	7653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-1.303;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.917;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.905;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,207:455:99:7682,0,9690
chr3	1134169	.	T	C	9432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=1.312;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.537;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,245:559:99:9461,0,12498
chr3	1134173	.	T	C	9669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.562;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.461;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.159;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,245:555:99:9698,0,12653
chr3	1134179	.	T	G	9524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.045;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.941;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,246:562:99:9553,0,12427
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chr3	1134495	.	T	C	6292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=1.107;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.920;QD=16.87;ReadPosRankSum=-2.133;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,172:373:99:6321,0,7635
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chr3	1135542	.	CGATTGTTGATTGTT	C	8934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.548;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=4.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-1.876;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,243:556:99:8972,0,12194
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chr3	1135725	.	T	A	8975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.045;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.668;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,291:617:99:9004,0,10346
chr3	1135865	.	T	C	13964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-1.657;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.956;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,369:689:99:13993,0,11977
chr3	1135884	.	C	T	14187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.756;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.234;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,348:652:99:14216,0,11886
chr3	1135904	.	T	C	13591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-1.455;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.793;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,334:610:99:13620,0,11064
chr3	1135922	.	A	C	14079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.488;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.082;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,342:622:99:14108,0,11238
chr3	1135941	.	G	T	13358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.883;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.071;QD=22.26;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,325:600:99:13387,0,11312
chr3	1135961	.	C	T	11612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=-1.093;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.356;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,299:560:99:11641,0,10620
chr3	1136027	.	A	G	8549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.914;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.702;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,228:481:99:8578,0,9588
chr3	1136044	.	T	C	9388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.314;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.234;QD=19.81;ReadPosRankSum=-1.728;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,234:474:99:9417,0,9722
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chr3	1136621	.	C	T	7760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-0.150;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.401;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,264:606:99:7789,0,10580
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chr3	1138413	.	T	C	11891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=-1.080;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.864;QD=23.50;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,288:506:99:11920,0,8449
chr3	1138418	.	C	T	11189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.103;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.843;QD=22.25;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,282:503:99:11218,0,8426
chr3	1138489	.	T	C	9227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.097;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.807;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.276;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,242:512:99:9256,0,10837
chr3	1138496	.	T	C	9311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.919;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.256;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,243:525:99:9340,0,11041
chr3	1138691	.	C	T	7743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.226;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.619;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.031;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,250:521:99:7772,0,8541
chr3	1138794	.	C	G	8354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.370;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.231;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,261:510:99:8383,0,9385
chr3	1138825	.	A	G	10355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=1.136;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.464;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,272:525:99:10384,0,9659
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chr3	1140424	.	C	T	10696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=-1.111;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.698;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,265:514:99:10725,0,9950
chr3	1140427	.	A	G	10272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=-1.199;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.293;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,264:516:99:10301,0,9823
chr3	1140455	.	C	A	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=1.109;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.966;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,275:535:99:8559,0,7919
chr3	1140859	.	T	C	9762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-1.899;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.606;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,308:634:99:9791,0,10317
chr3	1141535	.	T	C	9774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.827;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.150;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,252:527:99:9803,0,10934
chr3	1141537	.	G	A	9738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.592;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.114;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,253:531:99:9767,0,10937
chr3	1141860	.	T	G	7506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-1.330;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.850;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.361;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,197:404:99:7535,0,12264
chr3	1141880	.	T	C	7195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.070;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.795;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,189:396:99:7224,0,12234
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chr3	1142005	.	T	C	8912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.545;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=1.002;QD=18.65;ReadPosRankSum=2.305;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,222:478:99:8941,0,10471
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chr3	1144276	.	A	G	9098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.814;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.017;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,232:472:99:9127,0,9361
chr3	1144279	.	A	T	9370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=1.125;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.937;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,237:479:99:9399,0,9714
chr3	1144288	.	T	C	9779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.015;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.206;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,241:486:99:9808,0,9938
chr3	1144310	.	T	C	9826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.552;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.231;QD=20.73;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,240:474:99:9855,0,9482
chr3	1144318	.	GA	G	9377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.221;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.071;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,252:490:99:9415,0,9005
chr3	1144395	.	C	T	10061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-1.799;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.277;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.482;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,256:507:99:10090,0,9865
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chr3	1144402	.	T	C	10379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=-0.454;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.516;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,262:520:99:10408,0,10408
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chr3	1144820	.	ATAAATTGTAT	A	9270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.048;ClippingRankSum=0.306;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-1.294;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,231:553:99:9308,0,13189
chr3	1144833	.	T	C	9136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.228;ClippingRankSum=-0.641;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.289;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,234:528:99:9165,0,12000
chr3	1144836	.	A	C	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;ClippingRankSum=-1.028;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.741;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,229:521:99:9168,0,11958
chr3	1144838	.	A	T	8885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.344;ClippingRankSum=1.619;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-2.128;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,228:522:99:8914,0,12019
chr3	1144839	.	GC	G	8957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;ClippingRankSum=-0.171;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=1.439;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,230:522:99:8995,0,12055
chr3	1144841	.	C	G	8840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.877;ClippingRankSum=0.254;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.605;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,226:513:99:8869,0,12064
chr3	1144844	.	T	TGC	9301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=1.132;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=1.924;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,219:510:99:9339,0,11904
chr3	1144851	.	C	T	8753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.222;ClippingRankSum=-0.602;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=2.137;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.461;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,221:501:99:8782,0,11329
chr3	1144858	.	G	A	8379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=-2.076;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=2.214;QD=16.93;ReadPosRankSum=-2.954;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,222:495:99:8408,0,10790
chr3	1144888	.	T	C	9324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.627;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.139;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,244:516:99:9353,0,10215
chr3	1144907	.	A	G	9656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.375;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.710;QD=18.08;ReadPosRankSum=2.043;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,255:534:99:9685,0,10618
chr3	1145334	.	C	T	8395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.073;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.205;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,229:487:99:8424,0,9973
chr3	1145344	.	T	C	9188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.122;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.651;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,245:507:99:9217,0,9366
chr3	1145541	.	G	C	8689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=-0.884;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=0.109;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.168;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,231:460:99:8718,0,9003
chr3	1145558	.	AGCTTGCCG	A	8067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.906;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=2.510;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,215:452:99:8105,0,8882
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chr3	1150071	.	C	T	8114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.188;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.919;QD=15.94;ReadPosRankSum=-2.646;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,227:509:99:8143,0,10858
chr3	1150086	.	A	G	8355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-1.976;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.377;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,224:510:99:8384,0,10910
chr3	1150301	.	C	T	6998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.672;ClippingRankSum=1.899;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.792;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,236:451:99:7027,0,7064
chr3	1150329	.	A	G	7248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.840;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.602;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.299;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,232:461:99:7277,0,7104
chr3	1152066	.	A	ATTTT	5101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-0.940;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.627;SOR=0.330	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:11,124:135:99:4727,210,0
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chr3	1157315	.	A	G	7979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=-0.023;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.354;QD=15.90;ReadPosRankSum=4.804;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,268:502:99:8008,0,7229
chr3	1157350	.	T	G	9369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.744;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.574;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,247:528:99:9398,0,10377
chr3	1157371	.	G	T	10458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.629;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.094;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,265:516:99:10487,0,9889
chr3	1157393	.	T	C	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-1.438;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.022;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,267:505:99:10209,0,8974
chr3	1157431	.	A	G	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=-1.257;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.648;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,256:495:99:10066,0,9203
chr3	1157432	.	C	T	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=-0.299;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.686;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,258:496:99:10066,0,9203
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chr3	1157493	.	T	C	7884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.185;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.289;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,266:548:99:7913,0,8495
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chr3	1159106	.	T	C	10729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.062;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.203;QD=20.56;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,266:522:99:10758,0,10180
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chr3	1159772	.	A	C	10480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-1.722;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.579;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,275:531:99:10509,0,9972
chr3	1159782	.	A	G	10574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.599;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.314;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.801;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,272:539:99:10603,0,10264
chr3	1160109	.	G	A	7354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.245;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.639;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,238:512:99:7383,0,10127
chr3	1160755	.	T	C	9763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-1.119;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.949;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,253:474:99:9792,0,7977
chr3	1160767	.	A	G	10271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-1.618;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.960;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,260:496:99:10300,0,9309
chr3	1160790	.	A	T	8779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.700;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.431;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,234:485:99:8808,0,9374
chr3	1160824	.	C	T	7012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.834;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.046;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,227:487:99:7041,0,8134
chr3	1160923	.	A	G	9264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.216;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.330;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,295:582:99:9293,0,8898
chr3	1160940	.	A	G	8527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-2.668;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.048;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,265:558:99:8556,0,9119
chr3	1161069	.	T	A	9255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=1.395;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.103;QD=14.86;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,300:623:99:9284,0,10403
chr3	1161207	.	C	T	10494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.278;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.594;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,273:550:99:10523,0,11022
chr3	1161214	.	A	T	10994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.613;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.671;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,273:551:99:11023,0,10921
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chr3	1163366	.	TAAA	T	8591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-0.693;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=6.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-4.217;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.513;SOR=1.137	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,220:456:99:8629,0,9375
chr3	1163511	.	G	A	7621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-0.185;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.853;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,189:371:99:7650,0,7337
chr3	1163517	.	G	A	7746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.376;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=3.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.477;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,190:371:99:7775,0,7204
chr3	1163529	.	T	C	7333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.219;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-1.212;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,190:371:99:7362,0,6840
chr3	1164094	.	AT	A	7195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.027;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=6.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.292;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,192:388:99:7233,0,11136
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chr3	1164286	.	C	A	10348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.667;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.551;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,267:523:99:10377,0,9678
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chr3	1164321	.	A	G	10346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-1.732;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.724;QD=20.94;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,255:494:99:10375,0,9700
chr3	1164336	.	C	T	10151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.028;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.025;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,247:486:99:10180,0,9598
chr3	1164343	.	A	C	9971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=1.832;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.081;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,261:516:99:10000,0,9917
chr3	1164443	.	T	C	10419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-1.297;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.037;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,260:516:99:10448,0,9946
chr3	1164444	.	G	A	10626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.138;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.917;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,261:513:99:10655,0,9973
chr3	1164459	.	T	C	7960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.394;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.807;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.343;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,256:494:99:7989,0,9656
chr3	1164461	.	T	C	7969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=0.753;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.522;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,259:495:99:7998,0,9530
chr3	1164462	.	G	A	7969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=-0.893;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.389;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,259:494:99:7998,0,9529
chr3	1164463	.	G	C	10833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.344;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.023;QD=21.71;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,265:499:99:10871,0,9305
chr3	1164484	.	T	C	10197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.872;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.101;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.180;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,264:511:99:10226,0,9424
chr3	1164647	.	A	C	8286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.010;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.429;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,263:499:99:8315,0,7494
chr3	1164680	.	G	T	9048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=1.498;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.101;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,283:526:99:9077,0,7603
chr3	1164723	.	T	G	9349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.232;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.988;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,248:530:99:9378,0,11209
chr3	1164733	.	A	ACTC	9975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=1.075;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.212;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,250:519:99:10013,0,10843
chr3	1164938	.	A	G	7838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=-0.261;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.946;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,250:465:99:7867,0,6886
chr3	1165560	.	G	A	9953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-0.807;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.474;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,318:643:99:9982,0,10194
chr3	1165971	.	A	G	7672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.227;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=14.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.512;QD=14.76;ReadPosRankSum=-3.883;SOR=1.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,210:520:99:7701,0,11801
chr3	1165989	.	A	G	9369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=-1.930;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.684;QD=17.07;ReadPosRankSum=-6.902;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,262:549:99:9398,0,10929
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chr3	1167074	.	GA	G	5332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.415;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.117;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,216:402:99:5370,0,4441
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chr3	1172479	.	T	C	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=1.184;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.492;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,241:489:99:9092,0,14205
chr3	1172803	.	C	T	8239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=-1.704;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.527;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.924;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,221:440:99:8268,0,8409
chr3	1172821	.	T	A	8666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-1.177;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.191;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,217:430:99:8695,0,8469
chr3	1172829	.	G	A	9029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=-0.218;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=5.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.443;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,218:419:99:9058,0,8020
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chr3	1175825	.	G	A	10078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.816;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-3.500;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,262:490:99:10107,0,8773
chr3	1175837	.	C	T	10783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=-1.847;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.093;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.293;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,263:504:99:10812,0,9611
chr3	1175852	.	G	A	10525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.657;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.212;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,278:525:99:10554,0,9334
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chr3	1177828	.	A	G	8914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.798;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.426;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,288:541:99:8943,0,8067
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chr3	1178451	.	GTCAGCAGATTTATGACTATGA	G	8309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.732;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-1.918;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,227:551:99:8347,0,12564
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chr3	1178530	.	A	G	10617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-1.190;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=0.419;QD=18.31;ReadPosRankSum=-4.151;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,280:580:99:10646,0,11870
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chr3	1178848	.	C	T	8496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=2.054;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.542;QD=16.53;ReadPosRankSum=-2.109;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,229:514:99:8525,0,10995
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chr3	1178958	.	C	T	9597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=1.907;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.087;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.235;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,253:504:99:9626,0,9456
chr3	1178988	.	T	C	8143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.131;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.724;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,261:551:99:8172,0,9150
chr3	1179915	.	T	C	7531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.584;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.600;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,242:512:99:7560,0,8429
chr3	1179927	.	C	T	7310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=-1.210;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.405;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,227:494:99:7339,0,8308
chr3	1180155	.	G	A	8333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.032;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.109;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,267:524:99:8362,0,7848
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chr3	1180866	.	G	A	10831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.558;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.182;QD=19.04;ReadPosRankSum=2.899;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,284:569:99:10860,0,16479
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chr3	1182018	.	A	G	9959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-1.147;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.942;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.997;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,252:515:99:9988,0,14744
chr3	1182021	.	T	C	10005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.933;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.336;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,261:512:99:10034,0,14735
chr3	1182528	.	G	A	10128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.830;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.070;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,272:544:99:10157,0,10139
chr3	1182543	.	G	A	10123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.809;ClippingRankSum=-0.893;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.669;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,256:519:99:10152,0,10691
chr3	1182546	.	T	C	9939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=3.760;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.110;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.730;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,255:518:99:9968,0,10191
chr3	1182609	.	G	A	9501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.350;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.035;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,247:514:99:9530,0,10226
chr3	1182621	.	T	C	9575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.506;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.705;QD=18.67;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,254:513:99:9604,0,9753
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chr3	1183100	.	A	G	10221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.607;ClippingRankSum=-0.977;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.366;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,260:533:99:10250,0,10720
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chr3	1187098	.	G	A	9090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.594;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=16.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.688;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.825;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,241:477:99:9119,0,8911
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chr3	1187134	.	A	T	9382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.630;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.460;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,213:436:99:9411,0,8559
chr3	1187215	.	G	A	8032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.370;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=8.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.988;QD=18.42;ReadPosRankSum=-2.548;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,206:436:99:8061,0,9199
chr3	1187219	.	G	A	8437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.086;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.248;QD=19.22;ReadPosRankSum=-2.579;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,207:439:99:8466,0,9263
chr3	1187220	.	G	A	8540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=-0.925;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.283;QD=19.50;ReadPosRankSum=-2.926;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,209:438:99:8569,0,9381
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chr3	1189817	.	C	A	9451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.906;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.317;QD=19.53;ReadPosRankSum=2.397;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,239:484:99:9480,0,9588
chr3	1189927	.	T	C	7504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.682;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.097;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,245:470:99:7533,0,6941
chr3	1190045	.	T	C	8763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-0.256;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.159;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,227:464:99:8792,0,9113
chr3	1190061	.	A	C	9170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.463;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.247;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,230:470:99:9199,0,9924
chr3	1190066	.	C	T	9378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.430;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.212;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,233:481:99:9407,0,10078
chr3	1190073	.	A	T	9137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-0.684;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.497;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,237:491:99:9166,0,9938
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chr3	1193177	.	T	G	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.619;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.363;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,239:489:99:9696,0,10068
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chr3	1193328	.	A	T	10534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.723;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.360;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,280:532:99:10563,0,10334
chr3	1193346	.	G	C	10336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.096;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.259;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,269:518:99:10365,0,9277
chr3	1193468	.	T	A	7591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.572;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.117;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,262:538:99:7620,0,10545
chr3	1193597	.	C	T	10597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.078;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.259;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,282:580:99:10626,0,12440
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chr3	1194263	.	T	C	12192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.168;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.311;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.062;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,302:628:99:12221,0,13076
chr3	1194269	.	T	C	11806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-1.269;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.677;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,288:609:99:11835,0,13068
chr3	1194279	.	C	T	11131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.985;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.357;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,284:608:99:11160,0,12761
chr3	1194395	.	TTCTTTTCAC	T	9479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.080;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=18.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-0.893;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.663;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,244:430:99:9517,0,6971
chr3	1194422	.	TTATTTTCAC	T	6885.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=2.527;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=38.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=1.482;QD=14.47;ReadPosRankSum=-2.171;SOR=1.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,181:476:99:6923,0,11990
chr3	1194454	.	TTCGTTCTTCTCGTTCTTC	T	7480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=-1.070;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=41.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=0.131;QD=14.64;ReadPosRankSum=6.335;SOR=1.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,195:511:99:7518,0,13372
chr3	1194489	.	T	C	8369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.786;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=22.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=0.218;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=1.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,214:485:99:8398,0,11053
chr3	1194504	.	G	T	9408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=1.467;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=13.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-0.188;QD=19.12;ReadPosRankSum=-3.485;SOR=1.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,237:492:99:9437,0,10267
chr3	1194505	.	G	C	9372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.023;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=13.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=1.297;QD=19.05;ReadPosRankSum=-3.378;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,237:492:99:9401,0,10186
chr3	1194513	.	G	A	9747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;ClippingRankSum=-0.301;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=10.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-1.293;QD=20.35;ReadPosRankSum=-2.444;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,241:479:99:9776,0,7632
chr3	1194514	.	G	C	9515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=1.228;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=9.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.552;QD=19.50;ReadPosRankSum=-2.405;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,247:488:99:9544,0,9470
chr3	1194586	.	T	C	8269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.725;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.543;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.396;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,220:489:99:8298,0,10388
chr3	1194598	.	A	G	8427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=1.859;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.117;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.964;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,223:493:99:8456,0,10342
chr3	1194675	.	A	T	10276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.967;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.219;QD=18.89;ReadPosRankSum=4.334;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,268:544:99:10305,0,10230
chr3	1194691	.	C	G	10808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.911;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.164;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,288:567:99:10837,0,10516
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chr3	1195968	.	T	G	8782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.056;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.208;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.447;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,216:360:99:8811,0,5466
chr3	1195970	.	C	T	8701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=1.275;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.677;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,219:363:99:8730,0,5430
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chr3	1196020	.	G	T	8244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-1.193;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=10.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.091;QD=25.06;ReadPosRankSum=3.701;SOR=0.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,200:329:99:8273,0,5213
chr3	1196022	.	T	C	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.406;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=10.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.847;QD=25.23;ReadPosRankSum=4.170;SOR=0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,198:328:99:8304,0,6881
chr3	1196023	.	C	CAAA	2918.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;ClippingRankSum=-0.521;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=5.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.112;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,98:298:99:2956,0,8565
chr3	1196034	.	A	T	8576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.271;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=1.091;QD=21.82;ReadPosRankSum=6.376;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,212:393:99:8605,0,7063
chr3	1196053	.	A	T	8290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.024;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.868;QD=22.41;ReadPosRankSum=1.216;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,214:370:99:8319,0,5793
chr3	1196089	.	C	T	6912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.438;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.512;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,182:326:99:6941,0,5246
chr3	1196105	.	G	A	7193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.670;ClippingRankSum=1.070;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.854;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.902;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,193:354:99:7222,0,5820
chr3	1196112	.	CT	C	2060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.749;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=10.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.290;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.673;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,127:255:99:2098,0,2043
chr3	1196292	.	C	T	8685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.951;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=6.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.223;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,221:448:99:8714,0,9163
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chr3	1199689	.	T	C	8785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.248;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.670;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,226:463:99:8814,0,9245
chr3	1199690	.	C	T	8785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=2.556;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.126;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,229:465:99:8814,0,9245
chr3	1199722	.	T	C	8156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=-0.017;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.192;QD=16.58;ReadPosRankSum=-1.181;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,266:492:99:8185,0,7013
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chr3	1202867	.	C	A	9512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-0.266;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.563;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.307;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,251:491:99:9541,0,9126
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chr3	1203603	.	CTGCTGTAAT	C	7692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=1.378;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.687;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.497;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,206:506:99:7730,0,12060
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chr3	1203688	.	A	G	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.051;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.089;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,219:465:99:8921,0,9805
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chr3	1203739	.	G	GA	8320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.920;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.385;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,206:419:99:8358,0,8415
chr3	1203746	.	T	C	8390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.472;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.511;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,221:439:99:8419,0,8465
chr3	1203772	.	A	C	8759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.743;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.365;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,231:458:99:8788,0,8759
chr3	1203780	.	A	G	8194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.193;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.680;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,212:427:99:8223,0,8483
chr3	1203839	.	G	A	9184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.381;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.144;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,232:444:99:9213,0,8836
chr3	1203841	.	G	GCT	9314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.577;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.002;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,225:438:99:9352,0,8812
chr3	1203846	.	AT	A	8541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-0.594;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.200;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.825;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,217:441:99:8579,0,8997
chr3	1203861	.	T	A	8143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.252;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.864;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,213:434:99:8172,0,8257
chr3	1203890	.	CA	C	4837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.662;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.158;QD=11.86;ReadPosRankSum=-2.171;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,191:408:99:4875,0,5681
chr3	1203999	.	C	T	8124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.198;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.025;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,218:445:99:8153,0,8810
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chr3	1207214	.	T	C	6805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=-0.183;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.344;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,224:466:99:6834,0,7242
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chr3	1207242	.	T	C	9294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.376;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.489;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,232:472:99:9323,0,9648
chr3	1207258	.	G	C	9088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.711;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.017;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,232:464:99:9117,0,8780
chr3	1207475	.	T	C	7127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-1.101;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.102;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,192:452:99:7156,0,10324
chr3	1207483	.	A	G	6893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=-1.266;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.855;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.039;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,184:441:99:6922,0,10104
chr3	1207510	.	G	A	7537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=-0.656;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.346;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,241:445:99:7566,0,6403
chr3	1207560	.	A	G	7376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.894;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.528;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,235:443:99:7405,0,6523
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chr3	1209327	.	TC	T	10171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=1.475;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=4.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.693;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,250:530:99:10209,0,11424
chr3	1209335	.	TCTTC	T	10701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.821;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.215;QD=20.15;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,251:531:99:10739,0,11220
chr3	1209340	.	T	TAAA	10445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=0.593;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.035;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,253:519:99:10483,0,10730
chr3	1209346	.	T	C	9844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.597;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.731;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.742;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,259:522:99:9873,0,10285
chr3	1209384	.	C	T	9615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.214;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.279;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,250:504:99:9644,0,9567
chr3	1209401	.	G	T	10102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.295;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.799;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,253:510:99:10131,0,10238
chr3	1209404	.	C	T	9755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.094;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.078;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,246:496:99:9784,0,10369
chr3	1209405	.	T	C	9815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.507;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.147;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,245:493:99:9844,0,10114
chr3	1209412	.	C	T	9748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=2.351;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.018;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,238:485:99:9777,0,9732
chr3	1209414	.	C	T	9376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.616;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.726;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,240:482:99:9405,0,9675
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chr3	1209487	.	C	A	7556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.125;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.541;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,195:410:99:7585,0,8855
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chr3	1213290	.	T	C	8340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.911;ClippingRankSum=-2.109;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.334;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.469;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,213:458:99:8369,0,9548
chr3	1213332	.	G	A	8621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.197;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.169;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,235:489:99:8650,0,9828
chr3	1213351	.	GGGTGGCTA	G	8306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=-0.009;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.798;QD=17.71;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,216:469:99:8344,0,10063
chr3	1213375	.	C	T	8483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.098;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.544;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,220:458:99:8512,0,9612
chr3	1213376	.	G	A	8487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-2.168;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.578;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,220:459:99:8516,0,9569
chr3	1213642	.	A	G	10132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=1.192;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.177;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,264:519:99:10161,0,9722
chr3	1213656	.	A	T	10025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-2.006;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.724;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,264:520:99:10054,0,9630
chr3	1213794	.	A	G	7034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.673;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.435;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.637;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,227:442:99:7063,0,6775
chr3	1213814	.	T	C	7140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=1.191;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.764;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,227:435:99:7169,0,6505
chr3	1214172	.	GT	G	5907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.970;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.231;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,230:435:99:5945,0,5109
chr3	1214212	.	C	T	6960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-1.699;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.446;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,220:409:99:6989,0,6033
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chr3	1214260	.	G	C	7901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.754;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.660;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,196:423:99:7930,0,8745
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chr3	1215443	.	G	C	9806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-2.647;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=13.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.225;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,254:434:99:9835,0,6691
chr3	1215507	.	ACACT	A	8622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.157;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.052;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.786;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,230:480:99:8660,0,9601
chr3	1215631	.	G	T	7151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.681;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.323;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,239:494:99:7180,0,9746
chr3	1215961	.	G	A	10441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.938;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.191;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,263:542:99:10470,0,11864
chr3	1215964	.	T	C	10608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.235;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.099;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,268:549:99:10637,0,11905
chr3	1215984	.	G	A	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.552;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.916;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.811;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,271:563:99:9947,0,11584
chr3	1216012	.	C	T	10352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.171;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.449;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,264:574:99:10381,0,14616
chr3	1216016	.	G	A	10372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.882;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.424;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,263:564:99:10401,0,14727
chr3	1216024	.	T	C	9682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-0.652;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.088;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,254:554:99:9711,0,14244
chr3	1216237	.	C	T	7056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=-0.043;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.868;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,233:434:99:7085,0,7540
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chr3	1216294	.	C	T	9741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-1.518;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.324;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,241:432:99:9770,0,7546
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chr3	1217125	.	T	C	8548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.094;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.645;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,225:440:99:8577,0,7969
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chr3	1217458	.	T	C	7329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.935;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-1.658;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.731;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,231:467:99:7358,0,7278
chr3	1217507	.	TAGAAAGGAG	T	7558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=-1.595;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.724;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,238:516:99:7596,0,10849
chr3	1217518	.	CTGGAAACGTAACTCCACTAG	C	7417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.147;ClippingRankSum=-3.133;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.558;QD=13.15;ReadPosRankSum=3.106;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,238:564:99:7455,0,12657
chr3	1217577	.	CGAAAGTAACTCACTAAATTTA	C	8981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-0.153;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=6.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-0.307;QD=17.21;ReadPosRankSum=8.029;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,239:522:99:9019,0,11022
chr3	1217701	.	A	G	10274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.106;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.930;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,273:566:99:10303,0,15748
chr3	1217710	.	C	T	10970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.218;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.946;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,274:577:99:10999,0,9485
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chr3	1217887	.	G	A	10874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=1.213;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.889;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,274:507:99:10903,0,8939
chr3	1217896	.	C	T	11164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=-0.635;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.845;QD=21.11;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,291:529:99:11193,0,8981
chr3	1217983	.	G	A	11665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.794;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.382;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,306:638:99:11694,0,15120
chr3	1217990	.	T	C	11617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.024;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.570;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,304:628:99:11646,0,15028
chr3	1218210	.	T	G	8474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.085;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.126;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,216:482:99:8503,0,10595
chr3	1218218	.	G	C	8905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=1.451;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.758;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,229:496:99:8934,0,10687
chr3	1218225	.	G	A	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.605;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.544;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,222:488:99:8559,0,10551
chr3	1218251	.	T	C	7894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=-0.324;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.088;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.553;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,267:493:99:7923,0,6751
chr3	1218337	.	T	A	8813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=-0.414;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.831;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.060;SOR=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,233:467:99:8842,0,9056
chr3	1218346	.	T	A	9014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-2.129;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.422;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,228:471:99:9043,0,9759
chr3	1218368	.	C	T	8190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.925;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.334;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,208:427:99:8219,0,8894
chr3	1218376	.	T	C	7884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=1.244;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.556;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,196:418:99:7913,0,9083
chr3	1218396	.	G	C	8998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.047;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.998;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,225:476:99:9027,0,9914
chr3	1218421	.	A	G	7871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=-0.387;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.460;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,218:456:99:7900,0,9165
chr3	1218451	.	C	G	7156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=1.215;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.403;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.330;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,235:435:99:7185,0,6124
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chr3	1218491	.	A	ATT	5377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=-0.051;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.353;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.675;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,162:377:99:5415,0,8380
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chr3	1221691	.	T	G	8183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.110;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.640;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,253:517:99:8212,0,8154
chr3	1222054	.	G	A	9091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.881;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.163;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,295:552:99:9120,0,7953
chr3	1222871	.	C	T	10904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.637;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.689;QD=19.13;ReadPosRankSum=-2.624;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,291:570:99:10933,0,10721
chr3	1222879	.	G	A	10986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.003;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.396;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,273:551:99:11015,0,11162
chr3	1222880	.	T	C	10898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.771;ClippingRankSum=0.592;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.164;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,273:550:99:10927,0,11033
chr3	1223294	.	C	T	8631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-0.882;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.860;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.070;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,224:454:99:8660,0,9085
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chr3	1223372	.	C	T	8607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.810;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.224;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,223:455:99:8636,0,9120
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chr3	1226071	.	C	T	9490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=1.091;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.826;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,246:515:99:9519,0,10771
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chr3	1226077	.	C	A	9383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.321;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.418;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.505;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,241:515:99:9412,0,10784
chr3	1226101	.	T	C	7762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=-0.610;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.599;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.916;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,245:473:99:7791,0,6682
chr3	1226215	.	C	T	9699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.178;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.186;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,250:513:99:9728,0,10275
chr3	1226218	.	C	A	9939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.680;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.441;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,251:514:99:9968,0,10167
chr3	1226229	.	A	C	8734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.054;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.909;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,237:498:99:8763,0,7967
chr3	1226242	.	G	T	7902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.701;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.085;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,252:514:99:7931,0,9093
chr3	1226266	.	C	A	8470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.632;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.489;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,276:551:99:8499,0,8517
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chr3	1229411	.	G	A	7880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=-0.788;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.563;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,259:486:99:7909,0,7218
chr3	1229437	.	G	A	8456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.182;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.304;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,270:487:99:8485,0,6801
chr3	1230476	.	CATCT	C	7653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.533;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.699;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,203:445:99:7691,0,9412
chr3	1230540	.	C	A	6851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.165;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.284;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,227:438:99:6880,0,6024
chr3	1230572	.	T	G	8319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=1.273;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.414;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,221:433:99:8348,0,7988
chr3	1230585	.	T	C	8198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.780;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.642;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.767;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,207:415:99:8227,0,8379
chr3	1230592	.	T	C	8022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.573;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.056;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.374;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,205:409:99:8051,0,8066
chr3	1230620	.	G	C	5980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.008;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=0.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.740;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,197:394:99:6009,0,5888
chr3	1230691	.	G	A	7765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.720;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.344;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,198:389:99:7794,0,12774
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chr3	1238067	.	G	A	5427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=-0.751;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.860;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,206:427:99:5456,0,6816
chr3	1238125	.	G	A	7912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=-0.872;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.482;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,218:475:99:7941,0,7729
chr3	1238127	.	T	TA	3998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.092;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.761;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,188:447:99:4036,0,9932
chr3	1238398	.	G	GC	8758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.442;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.045;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,218:407:99:8796,0,7367
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chr3	1247894	.	C	G	9274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.334;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.105;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,239:460:99:9303,0,8491
chr3	1247913	.	A	T	10277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.532;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.678;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,264:510:99:10306,0,9454
chr3	1247915	.	A	T	10277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.847;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.417;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,264:508:99:10306,0,9454
chr3	1248106	.	A	T	9662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-1.610;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.233;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,252:475:99:9691,0,8508
chr3	1248117	.	G	T	9674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.149;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.208;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,240:472:99:9703,0,9180
chr3	1248125	.	G	A	8711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.696;ClippingRankSum=0.097;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.201;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,225:445:99:8740,0,8591
chr3	1249835	.	C	T	6854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.547;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.252;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,185:393:99:6883,0,11771
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chr3	1263992	.	C	G	6682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=-0.811;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.380;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,212:445:99:6711,0,7200
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chr3	1269358	.	G	A	8874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=-0.829;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.258;QD=19.42;ReadPosRankSum=2.242;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,231:457:99:8903,0,10062
chr3	1269359	.	A	G	8874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.078;ClippingRankSum=-1.267;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.538;QD=19.59;ReadPosRankSum=2.068;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,229:453:99:8903,0,10062
chr3	1269917	.	AG	A	6522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=-0.663;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=7.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.629;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.452;SOR=1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,171:363:99:6560,0,7644
chr3	1269922	.	C	T	6631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.262;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.402;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,164:353:99:6660,0,7597
chr3	1269932	.	A	G	6238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.471;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=6.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.367;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,164:358:99:6267,0,7632
chr3	1270090	.	C	T	4674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=-1.645;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.754;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,155:336:99:4703,0,5410
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chr3	1282176	.	G	A	8064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.215;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.944;QD=17.05;ReadPosRankSum=-1.429;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,223:473:99:8093,0,9657
chr3	1282682	.	A	AT	1381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.578;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-0.269;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.564;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,117:174:99:1419,0,461
chr3	1282723	.	C	T	3891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.059;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=6.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.905;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,129:276:99:3920,0,4348
chr3	1282880	.	A	G	9573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.055;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.633;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,241:440:99:9602,0,7708
chr3	1282882	.	T	C	9558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.061;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.521;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,242:440:99:9587,0,7836
chr3	1282888	.	G	A	9540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.063;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.557;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,246:446:99:9569,0,7609
chr3	1283191	.	T	C	7191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.009;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.034;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.825;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,187:416:99:7220,0,15100
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chr3	1289160	.	A	AT	9006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-0.259;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=7.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.454;QD=22.40;ReadPosRankSum=-2.594;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,225:402:99:9044,0,6695
chr3	1289167	.	A	G	9088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.328;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.027;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,229:417:99:9117,0,7448
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chr3	1289173	.	CT	C	9234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.667;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.120;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,230:424:99:9272,0,7607
chr3	1289178	.	C	A	9257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=1.023;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.833;QD=21.94;ReadPosRankSum=1.944;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,226:422:99:9286,0,7982
chr3	1289187	.	C	T	9413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.227;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.381;QD=22.20;ReadPosRankSum=1.552;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,232:424:99:9442,0,7509
chr3	1289206	.	T	TTA	9295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.232;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.901;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,233:420:99:9333,0,7292
chr3	1289265	.	G	T	8397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=-1.226;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.357;QD=19.00;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,218:442:99:8426,0,8868
chr3	1289272	.	T	G	8346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.398;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.037;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.996	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,220:459:99:8375,0,9159
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chr3	1302792	.	C	T	9188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-0.270;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.335;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,289:586:99:9217,0,9141
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chr3	1303359	.	T	C	8805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.187;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.476;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,227:456:99:8834,0,8996
chr3	1303369	.	G	A	8732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.736;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=6.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.953;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,232:459:99:8761,0,8998
chr3	1303763	.	G	A	8684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-0.856;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.619;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,222:464:99:8713,0,9710
chr3	1303764	.	C	G	8717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.788;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.228;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,219:458:99:8746,0,9833
chr3	1303766	.	A	G	8569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-1.704;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.245;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,216:460:99:8598,0,9932
chr3	1303772	.	C	T	8495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=-1.770;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=2.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.267;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,224:475:99:8524,0,9834
chr3	1303807	.	G	A	8018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=1.232;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.204;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,214:459:99:8047,0,9381
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chr3	1309443	.	T	C	6794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=-1.148;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.033;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,176:354:99:6823,0,6840
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chr3	1310130	.	CAAACAACCCT	C	6557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;ClippingRankSum=-0.769;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-2.243;QD=13.22;ReadPosRankSum=-3.432;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,175:496:99:6595,0,13480
chr3	1310143	.	TCAGACTTACCAAACAACCC	T	6688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.411;ClippingRankSum=-0.417;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-2.106;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,178:543:99:6726,0,15141
chr3	1310165	.	TTCA	T	6642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.129;ClippingRankSum=-0.106;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-0.449;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,181:506:99:6680,0,13681
chr3	1310169	.	GACT	G	5883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.812;ClippingRankSum=-0.649;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.367;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,178:497:99:5921,0,13344
chr3	1310173	.	T	TGG	7436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.413;ClippingRankSum=0.617;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.034;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,185:485:99:7474,0,12530
chr3	1310175	.	C	T	5886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.700;ClippingRankSum=0.771;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.591;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,167:463:99:5915,0,12434
chr3	1310192	.	C	G	7345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=-1.328;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.540;QD=15.05;ReadPosRankSum=-5.984;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,201:488:99:7374,0,11398
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chr3	1311779	.	C	A	5086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.249;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=39.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.285;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.497;SOR=1.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,156:337:99:5115,0,5734
chr3	1312500	.	T	C	5334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.108;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.286;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,175:377:99:5363,0,6265
chr3	1313107	.	T	A	9082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-1.260;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.583;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,244:507:99:9111,0,10068
chr3	1313108	.	C	T	9082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.666;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.027;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,243:505:99:9111,0,10068
chr3	1313185	.	C	T	7914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.344;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.211;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,205:406:99:7943,0,7543
chr3	1313197	.	A	G	7986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.631;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.782;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.541;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,200:393:99:8015,0,7995
chr3	1313202	.	A	AATC	8077.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.658;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=2.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.254;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,198:382:99:8115,0,7349
chr3	1313204	.	GCA	G	8113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=1.639;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.792;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,196:378:99:8151,0,7417
chr3	1313208	.	A	G	7604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=1.751;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-2.067;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,197:376:99:7633,0,7085
chr3	1313235	.	G	GAT	7132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.350;ClippingRankSum=0.477;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.562;QD=19.87;ReadPosRankSum=-3.750;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,181:359:99:7170,0,6988
chr3	1313243	.	C	CAAAG	8061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.922;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.514;QD=21.67;ReadPosRankSum=-4.152;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,186:372:99:8099,0,7649
chr3	1313251	.	C	CG	7785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=1.317;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.409;QD=20.54;ReadPosRankSum=-3.817;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,187:379:99:7823,0,8003
chr3	1313268	.	G	T	7800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=-0.505;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.549;QD=20.00;ReadPosRankSum=-3.383;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,198:390:99:7829,0,7919
chr3	1313274	.	C	A	8166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.171;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=1.143;QD=20.26;ReadPosRankSum=-2.034;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,202:403:99:8195,0,8043
chr3	1313275	.	G	A	8199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.427;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.271;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,202:405:99:8228,0,8166
chr3	1313278	.	G	A	8330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.637;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.034;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,203:412:99:8359,0,8356
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chr3	1313299	.	G	A	8196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.678;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.526;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,209:411:99:8225,0,7979
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chr3	1322235	.	G	A	7531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.752;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=10.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.762;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,199:443:99:7560,0,9445
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chr3	1322574	.	G	A	7193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.685;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.698;QD=21.73;ReadPosRankSum=2.911;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,175:331:99:7222,0,6133
chr3	1322578	.	G	A	7239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.201;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.401;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,189:347:99:7268,0,6105
chr3	1322985	.	TAGGAAGTGA	T	6148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=-0.101;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.970;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,165:397:99:6186,0,9270
chr3	1323012	.	A	T	7581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=-0.905;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.406;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,194:438:99:7610,0,10138
chr3	1323028	.	A	G	8108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.482;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.043;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.385;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,209:469:99:8137,0,10768
chr3	1323033	.	GAAGTGAAGA	G	7922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.619;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.691;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.911;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,214:505:99:7960,0,11266
chr3	1323622	.	G	T	5328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.165;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=8.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.724;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,177:397:99:5357,0,7128
chr3	1324099	.	A	C	6769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.160;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.072;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,179:391:99:6798,0,11434
chr3	1324107	.	T	C	6634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=2.132;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.043;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,177:385:99:6663,0,11303
chr3	1324432	.	A	G	6739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=1.085;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.752;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,215:411:99:6768,0,5673
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chr3	1324494	.	T	C	8860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=2.412;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.934;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,225:461:99:8889,0,9229
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chr3	1330051	.	G	C	11905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.135;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.217;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,292:572:99:11934,0,11259
chr3	1330063	.	A	G	12371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.400;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.635;QD=21.37;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,294:579:99:12400,0,11520
chr3	1330064	.	A	G	12112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.449;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.374;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,289:575:99:12141,0,11487
chr3	1330071	.	A	G	10900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.516;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.207;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,286:589:99:10929,0,11681
chr3	1330148	.	T	C	9979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.461;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.097;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,314:651:99:10008,0,12562
chr3	1330324	.	A	G	8606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.312;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.338;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,227:477:99:8635,0,9655
chr3	1330334	.	C	T	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.252;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.583;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,218:478:99:8818,0,10639
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chr3	1334214	.	T	C	8491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.046;ClippingRankSum=0.180;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-1.952;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,211:437:99:8520,0,9220
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chr3	1334224	.	T	A	8642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.828;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-0.696;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,217:445:99:8671,0,8986
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chr3	1337961	.	A	G	11410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.958;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.648;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.938;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,278:546:99:11439,0,10584
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chr3	1337970	.	T	C	11347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=1.339;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.837;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,270:541:99:11376,0,10881
chr3	1337986	.	C	T	10939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-0.660;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.876;QD=20.68;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,269:529:99:10968,0,10570
chr3	1337988	.	C	G	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.297;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.534;QD=20.13;ReadPosRankSum=-2.007;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,264:524:99:10575,0,10222
chr3	1338093	.	C	T	7035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=1.259;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.258;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,186:414:99:7064,0,9063
chr3	1338094	.	A	G	7032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.866;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.108;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,185:416:99:7061,0,9085
chr3	1338110	.	C	T	6162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.302;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.184;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,165:395:99:6191,0,8932
chr3	1338138	.	C	CTTTTTTTT	2475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.404;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.048;QD=9.56;ReadPosRankSum=-3.105;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,86:259:99:2513,0,6956
chr3	1338151	.	T	C	5970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.184;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.015;QD=21.40;ReadPosRankSum=5.787;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,196:279:99:5999,0,3050
chr3	1338226	.	T	G	6690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.723;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=23.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.058;QD=16.77;ReadPosRankSum=4.249;SOR=1.280	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,176:399:99:6719,0,8945
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chr3	1338250	.	G	C	7549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.392;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=8.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.615;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.778;SOR=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,208:429:99:7578,0,8334
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chr3	1340074	.	C	T	5794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.685;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.235;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.842;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,141:269:99:5823,0,5598
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chr3	1340102	.	T	C	5497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.737;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.228;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,138:279:99:5526,0,5661
chr3	1340119	.	C	G	5392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-1.485;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.935;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,132:274:99:5421,0,5961
chr3	1340128	.	T	C	5725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.184;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=12.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.128;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=1.049	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,141:288:99:5754,0,5979
chr3	1340133	.	T	C	5761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.936;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=6.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.926;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,148:299:99:5790,0,6060
chr3	1340145	.	A	G	6259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=-1.168;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.730;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,149:297:99:6288,0,6108
chr3	1340147	.	A	G	6010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=1.384;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.353;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,150:304:99:6039,0,6084
chr3	1340156	.	A	G	5907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.511;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=2.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.719;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,145:296:99:5936,0,6132
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chr3	1343387	.	T	C	8692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-0.085;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.763;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.725;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,218:432:99:8721,0,8379
chr3	1343407	.	G	A	8089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;ClippingRankSum=-1.273;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.660;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,216:428:99:8118,0,7999
chr3	1343996	.	T	TC	5056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-1.050;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.237;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,230:480:99:5094,0,6151
chr3	1344815	.	A	G	8510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-2.086;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.265;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,221:425:99:8539,0,7774
chr3	1344830	.	C	G	9361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.995;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.424;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,227:444:99:9390,0,8716
chr3	1344841	.	G	A	8867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.849;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.683;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,222:437:99:8896,0,8751
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chr3	1349783	.	G	A	6835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=-1.340;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.876;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,194:406:99:6864,0,7847
chr3	1349824	.	TA	T	7156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-1.727;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.801;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,185:390:99:7194,0,8329
chr3	1349827	.	A	T	7180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-1.110;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.081;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,187:398:99:7209,0,8399
chr3	1349831	.	C	G	7201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.089;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.551;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,178:376:99:7230,0,8108
chr3	1349994	.	CTTTATT	C	8146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.218;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.599;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,211:430:99:8184,0,8810
chr3	1350002	.	TC	T	8173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.642;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.183;QD=19.10;ReadPosRankSum=2.477;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,211:428:99:8211,0,8497
chr3	1350051	.	C	T	9069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.818;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.921;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.804;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,237:473:99:9098,0,8908
chr3	1350061	.	A	G	9032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=1.230;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.097;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,236:461:99:9061,0,8631
chr3	1350386	.	T	C	7225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.063;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.797;QD=15.34;ReadPosRankSum=2.202;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,236:471:99:7254,0,7490
chr3	1351243	.	G	A	9898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.660;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.435;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.664;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,249:467:99:9927,0,8739
chr3	1351245	.	G	A	9913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.943;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.591;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,255:476:99:9942,0,8584
chr3	1351613	.	T	A	8393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.269;ClippingRankSum=0.115;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.265;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,217:460:99:8422,0,9508
chr3	1351630	.	C	A	8706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;ClippingRankSum=3.860;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=6.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.417;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,221:459:99:8735,0,9524
chr3	1351632	.	G	A	8638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.689;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.001;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,224:459:99:8667,0,9386
chr3	1351669	.	TTCTC	T	6959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=1.011;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=12.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.052;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=1.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,184:394:99:6997,0,8230
chr3	1351677	.	C	T	7069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.211;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=12.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.804;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,173:373:99:7098,0,7925
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chr3	1353739	.	C	T	9698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.385;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.621;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.629;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,244:492:99:9727,0,9997
chr3	1353751	.	T	G	9469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=1.176;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.156;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,240:491:99:9498,0,10180
chr3	1353754	.	ATTT	A	9227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=1.033;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.896;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,238:496:99:9265,0,10206
chr3	1354120	.	T	C	8725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-2.222;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=1.844;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.389;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,269:510:99:8754,0,7805
chr3	1354137	.	CTATCATCATCACTCAAATTGGTTG	C	8483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.356;ClippingRankSum=-1.056;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=10.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.030;QD=16.07;ReadPosRankSum=-1.136;SOR=0.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,227:528:99:8521,0,11849
chr3	1354211	.	C	T	11241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=-0.782;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=10.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.528;QD=21.58;ReadPosRankSum=-2.918;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,286:521:99:11270,0,9071
chr3	1354217	.	G	A	11022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=1.947;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=8.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-1.704;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.988;SOR=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,281:512:99:11051,0,8885
chr3	1355942	.	T	C	7345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=-1.101;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.301;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.461;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,235:471:99:7374,0,7049
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chr3	1356392	.	C	T	7749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.191;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.402;QD=18.81;ReadPosRankSum=-2.186;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,201:412:99:7778,0,9716
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chr3	1359701	.	ATGG	A	7731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.702;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.432;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=1.081	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,198:425:99:7769,0,9273
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chr3	1359925	.	C	A	8843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.442;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.596;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,236:474:99:8872,0,8924
chr3	1359940	.	G	A	9260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=1.017;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.584;QD=19.92;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,231:465:99:9289,0,9266
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chr3	1359962	.	C	T	8612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=-1.935;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.406;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,215:460:99:8641,0,9991
chr3	1359977	.	A	G	8015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.945;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.784;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,201:426:99:8044,0,9298
chr3	1359998	.	A	G	7746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.841;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.497;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,206:420:99:7775,0,8309
chr3	1360022	.	T	TA	3241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-1.468;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.114;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,171:331:99:3279,0,3098
chr3	1360099	.	C	T	9500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.857;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.260;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.051;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,236:481:99:9529,0,9527
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chr3	1364425	.	T	C	6953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.695;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.125;QD=17.69;ReadPosRankSum=-2.681;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,176:393:99:6982,0,8844
chr3	1364426	.	T	C	6758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.332;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.936;QD=17.24;ReadPosRankSum=-2.511;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,175:392:99:6787,0,8649
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chr3	1364786	.	A	G	9897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.378;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.136;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,255:494:99:9926,0,9186
chr3	1364795	.	C	G	8808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.677;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.597;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.435;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,262:497:99:8837,0,9370
chr3	1364813	.	C	T	10004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.291;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.981;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,248:499:99:10033,0,10299
chr3	1364835	.	T	C	7882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=3.149;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.346;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,263:516:99:7911,0,9494
chr3	1364888	.	A	G	9799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.672;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.398;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,256:500:99:9828,0,9392
chr3	1364896	.	T	G	9668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.483;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.259;QD=19.22;ReadPosRankSum=2.333;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,250:503:99:9697,0,9691
chr3	1364928	.	T	C	6850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-0.725;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.040;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,227:473:99:6879,0,7489
chr3	1366118	.	C	G	8911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.364;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.230;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,235:474:99:8940,0,9361
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chr3	1372168	.	T	C	9987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-1.907;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.323;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,249:499:99:10016,0,10010
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chr3	1372573	.	G	T	10353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.960;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.464;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,269:542:99:10382,0,10719
chr3	1372576	.	G	A	10435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.358;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.124;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.633;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,268:542:99:10464,0,10943
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chr3	1376943	.	T	C	5982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.503;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=2.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.187;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,153:326:99:6011,0,6849
chr3	1376960	.	C	G	6026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.424;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.492;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,153:309:99:6055,0,6223
chr3	1376969	.	C	T	5963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.783;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.612;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,154:313:99:5992,0,6067
chr3	1376996	.	C	T	4534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.288;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.885;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,152:304:99:4563,0,4600
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chr3	1382882	.	C	T	9185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.453;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.290;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,240:481:99:9214,0,9273
chr3	1382898	.	C	G	9571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.238;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.511;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,260:514:99:9600,0,9517
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chr3	1383641	.	AT	A	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-0.551;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.529;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,43:210:99:142,0,2963
chr3	1383741	.	T	C	4168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.423;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.079;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.338;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,138:290:99:4197,0,4722
chr3	1384703	.	T	A	8917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=1.620;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.426;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.115;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,238:490:99:8946,0,14323
chr3	1384711	.	T	C	8797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=1.515;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.004;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,229:466:99:8826,0,13940
chr3	1384855	.	GT	G	7651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.773;ClippingRankSum=-0.121;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.299;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,204:480:99:7689,0,10984
chr3	1384857	.	GTTCGCAGAGGTAGAAGTGTTCGCAGAAGTAGTAGC	G	7585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.460;ClippingRankSum=0.893;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=6.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=2.521;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.718;SOR=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,206:551:99:7623,0,13815
chr3	1384898	.	TAGAAGTAGCAGCATTTGC	CAGAAGTAGCAGCATTTGC,T	13906.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.07;QD=29.16;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,207,142:349:99:13944,5589,9716,8449,0,10189
chr3	1385017	.	C	T	6582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.964;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.613;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,215:475:99:6611,0,8318
chr3	1386126	.	C	T	6013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.035;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.098;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,199:426:99:6042,0,8621
chr3	1386250	.	C	T	7673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-2.050;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.183;QD=18.90;ReadPosRankSum=2.057;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,201:406:99:7702,0,7905
chr3	1386258	.	G	A	7525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.918;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.467;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,197:392:99:7554,0,7737
chr3	1386286	.	G	A	6898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=-0.077;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=7.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.052;QD=19.54;ReadPosRankSum=-1.537;SOR=1.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,175:353:99:6927,0,6936
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chr3	1389801	.	A	G	9585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.979;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.195;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,237:485:99:9614,0,10075
chr3	1389820	.	T	TCATGGA	9368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.850;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.324;QD=20.73;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,219:452:99:9406,0,9504
chr3	1390010	.	C	A	8003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.293;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.374;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,256:519:99:8032,0,8307
chr3	1390042	.	A	C	7348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.474;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.026;QD=15.37;ReadPosRankSum=1.091;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,243:478:99:7377,0,7365
chr3	1390172	.	C	G	7068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=2.885;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.161;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,230:482:99:7097,0,9655
chr3	1390442	.	G	A	7564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.364;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=5.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.078;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,203:385:99:7593,0,9599
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chr3	1401461	.	T	TC	5325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.354;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=5.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.473;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,184:382:99:5363,0,5898
chr3	1401505	.	T	A	6666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=-0.848;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.591;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,186:397:99:6695,0,8019
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chr3	1407856	.	G	A	7064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.178;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.205;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,182:368:99:7093,0,7121
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chr3	1407898	.	G	C	7334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.266;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.248;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,196:419:99:7363,0,8763
chr3	1407936	.	T	C	6545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.345;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=0.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.348;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,177:395:99:6574,0,8513
chr3	1407956	.	G	A	7323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=-0.046;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.343;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,189:412:99:7352,0,9184
chr3	1407980	.	T	A	6249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.021;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.443;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,169:375:99:6278,0,7751
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chr3	1414017	.	A	G	9028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.113;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.120;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,235:467:99:9057,0,8947
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chr3	1414359	.	G	C	8234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.481;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.565;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,216:464:99:8263,0,9679
chr3	1414363	.	G	A	8284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-1.389;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.807;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.861;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,216:458:99:8313,0,9563
chr3	1414504	.	G	T	6842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=0.030;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.483;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,219:425:99:6871,0,5877
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chr3	1414998	.	G	A	7981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.058;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.029;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.191;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,277:508:99:8010,0,6684
chr3	1415027	.	A	G	7809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.993;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.756;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,211:479:99:7838,0,9954
chr3	1415043	.	T	C	7837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=1.765;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.392;QD=18.36;ReadPosRankSum=-2.509;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,197:427:99:7866,0,9304
chr3	1415045	.	T	TTG	7687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=-0.548;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.653;QD=18.44;ReadPosRankSum=-2.456;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,191:417:99:7725,0,9053
chr3	1415048	.	T	C	7186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=-0.217;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.094;QD=17.66;ReadPosRankSum=-2.225;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,184:407:99:7215,0,8879
chr3	1415080	.	T	C	5986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=1.368;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-0.380;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,157:322:99:6015,0,6331
chr3	1415091	.	C	T	6105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-0.163;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=1.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-0.688;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,146:292:99:6134,0,5968
chr3	1415096	.	T	A	5287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.236;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=0.623;QD=19.73;ReadPosRankSum=2.386;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,134:268:99:5316,0,5676
chr3	1415100	.	G	A	5584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.016;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-0.142;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,133:248:99:5613,0,5028
chr3	1415103	.	A	AT	5638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=-0.651;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=1.525;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,132:241:99:5676,0,4731
chr3	1415107	.	T	A	4978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=-0.195;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=7.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=2.195;QD=20.24;ReadPosRankSum=4.206;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,125:246:99:5007,0,5322
chr3	1415110	.	T	A	5200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=-0.494;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=15.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=1.328;QD=21.06;ReadPosRankSum=5.103;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,121:247:99:5229,0,5134
chr3	1415111	.	T	TAA	5197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=-1.187;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=13.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=1.691;QD=21.13;ReadPosRankSum=4.884;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,122:246:99:5235,0,5050
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chr3	1415249	.	T	A	3998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.305;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.372;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,140:337:99:4027,0,6013
chr3	1415511	.	C	T	9885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.648;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.583;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,261:508:99:9914,0,9272
chr3	1415529	.	G	A	9822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=1.140;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.103;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,256:500:99:9851,0,9215
chr3	1416024	.	CCAGGGATATGGAAAT	C	6793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.442;ClippingRankSum=0.330;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-1.530;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,184:422:99:6831,0,9868
chr3	1416060	.	C	T	8406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-0.627;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-4.728;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.038;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,228:493:99:8435,0,9959
chr3	1416075	.	TTACGGAAATCAAGGA	T	4313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=-0.896;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-3.734;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,122:299:99:4351,0,6898
chr3	1416165	.	T	C	7456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=-1.020;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=2.595;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.627;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,242:505:99:7485,0,7938
chr3	1416357	.	G	A	10332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.875;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.112;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.974;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,278:530:99:10361,0,11929
chr3	1416375	.	T	G	9965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.004;ClippingRankSum=-1.002;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.990;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,245:496:99:9994,0,13670
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chr3	1416396	.	T	C	9975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.289;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.891;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,267:540:99:10004,0,13721
chr3	1417862	.	A	G	8664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=-0.301;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.299;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,223:447:99:8693,0,8910
chr3	1417864	.	A	C	8901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;ClippingRankSum=-0.741;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.093;QD=20.00;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,220:445:99:8930,0,9102
chr3	1417865	.	C	T	8936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.370;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.096;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,223:450:99:8965,0,9181
chr3	1417881	.	A	G	9359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=1.546;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.195;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,233:470:99:9388,0,9478
chr3	1417901	.	G	C	9299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=-0.126;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.328;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:9328,0,9928
chr3	1417903	.	A	G	9018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.569;ClippingRankSum=0.186;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.288;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,230:476:99:9047,0,9781
chr3	1417929	.	A	G	8778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=1.312;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.134;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,230:481:99:8807,0,9874
chr3	1417930	.	T	C	8778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=-1.116;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.234;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,227:480:99:8807,0,9874
chr3	1417959	.	C	T	9381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.962;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.862;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,239:460:99:9410,0,8618
chr3	1417962	.	G	A	9109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.426;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.035;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,230:448:99:9138,0,8549
chr3	1417999	.	CAA	C	7366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.307;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.997;QD=19.04;ReadPosRankSum=-2.100;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,186:387:99:7404,0,7995
chr3	1418011	.	C	G	8515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.218;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.595;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,213:436:99:8544,0,9161
chr3	1418029	.	G	A	8843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-2.385;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.423;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,216:436:99:8872,0,9084
chr3	1418046	.	A	C	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.070;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.304;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,219:434:99:8818,0,8683
chr3	1418057	.	A	T	8929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.081;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.992;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,223:427:99:8958,0,8297
chr3	1418106	.	A	G	8297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=1.266;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.699;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,204:435:99:8326,0,9721
chr3	1418113	.	AAAATT	A	8194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=1.553;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.344;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,208:464:99:8232,0,10438
chr3	1418130	.	G	A	8072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=-0.919;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.487;QD=18.18;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,201:444:99:8101,0,10032
chr3	1418141	.	T	A	3118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.677;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.552;QD=7.07;ReadPosRankSum=-3.241;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,175:441:99:3156,0,10049
chr3	1418557	.	G	T	7409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=1.523;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.189;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,229:472:99:7438,0,7850
chr3	1418570	.	C	T	6895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-0.460;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.073;QD=14.58;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,220:473:99:6924,0,8018
chr3	1418594	.	G	A	7082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.860;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.877;QD=15.30;ReadPosRankSum=-1.814;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,228:463:99:7111,0,7522
chr3	1419034	.	T	C	9059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.531;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.666;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,233:485:99:9088,0,9738
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chr3	1419524	.	C	T	6056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.179;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.285;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.910;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,191:425:99:6085,0,7703
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chr3	1424884	.	C	T	7145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.458;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.603;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,236:496:99:7174,0,15332
chr3	1425211	.	A	C	7362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.054;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.190;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,187:382:99:7391,0,7631
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chr3	1425217	.	G	A	7499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.931;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=2.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.299;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,184:381:99:7528,0,7850
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chr3	1428284	.	A	T	7500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.449;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.834;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,190:412:99:7529,0,8878
chr3	1428285	.	G	A	7472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=1.231;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.290;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,193:414:99:7501,0,8812
chr3	1428312	.	A	T	9168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.263;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.012;QD=21.93;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,233:418:99:9197,0,7194
chr3	1428317	.	C	T	9355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=1.966;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.378;QD=22.07;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,237:424:99:9384,0,7034
chr3	1428344	.	TAA	T	8561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.023;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.008;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,211:395:99:8599,0,7233
chr3	1428369	.	T	C	8943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=1.072;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.921;QD=21.50;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,225:416:99:8972,0,7475
chr3	1428379	.	C	T	8725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-1.159;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.467;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,228:422:99:8754,0,7497
chr3	1428474	.	A	ATACT	7852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.314;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.666;QD=19.20;ReadPosRankSum=-2.077;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,197:409:99:7890,0,8255
chr3	1428502	.	TG	T	7250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-1.283;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.135;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,193:421:99:7288,0,9073
chr3	1428512	.	A	T	7437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=1.997;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.054;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,196:428:99:7466,0,9142
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chr3	1428641	.	A	G	9438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.315;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.479;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.597;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,242:459:99:9467,0,11245
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chr3	1433162	.	T	C	9912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=3.086;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.001;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.384;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,266:510:99:9941,0,8996
chr3	1433182	.	C	T	9889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.304;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.265;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,259:491:99:9918,0,8841
chr3	1433244	.	T	C	8636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.660;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.467;QD=18.61;ReadPosRankSum=2.116;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,229:464:99:8665,0,8960
chr3	1433259	.	G	A	9043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-0.887;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.205;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.214;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,239:464:99:9072,0,8557
chr3	1434087	.	T	C	9286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.073;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.940;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,244:510:99:9315,0,14681
chr3	1434090	.	T	C	9332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.401;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.982;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,240:501:99:9361,0,14596
chr3	1434519	.	C	T	7236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=1.360;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=3.249;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,222:430:99:7265,0,6439
chr3	1435763	.	T	C	8917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.042;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.300;QD=17.35;ReadPosRankSum=2.174;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,286:514:99:8946,0,6977
chr3	1435801	.	A	G	8304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=-0.071;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.204;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,216:506:99:8333,0,11575
chr3	1435810	.	A	C	8616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.768;ClippingRankSum=0.324;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.567;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.216;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,225:528:99:8645,0,12388
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chr3	1436636	.	C	CA	8748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.994;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.150;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,225:423:99:8786,0,7525
chr3	1436672	.	G	A	8758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.855;ClippingRankSum=-0.609;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.854;QD=20.71;ReadPosRankSum=-4.256;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,225:423:99:8787,0,7962
chr3	1436676	.	C	CTAAATAT	9240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.560;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.811;QD=21.39;ReadPosRankSum=-3.417;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,224:432:99:9278,0,7938
chr3	1436747	.	T	C	8532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.093;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.237;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,221:432:99:8561,0,8125
chr3	1436760	.	A	T	8545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.674;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.210;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,225:445:99:8574,0,8259
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chr3	1436954	.	GA	G	7497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.544;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.058;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,204:408:99:7535,0,4525
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chr3	1437048	.	T	A	7826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=2.451;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.905;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,269:517:99:7855,0,7293
chr3	1437515	.	GAATA	G	9093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-0.376;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.944;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,239:481:99:9131,0,9379
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chr3	1437662	.	C	G	10690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.649;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.524;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.380;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,269:574:99:10719,0,12463
chr3	1437669	.	T	C	10459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.909;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=4.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.204;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,260:569:99:10488,0,12588
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chr3	1438455	.	C	A	7721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.594;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.592;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,201:386:99:7750,0,7124
chr3	1438463	.	A	T	8109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.244;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=20.64;ReadPosRankSum=-2.710;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,208:393:99:8138,0,7088
chr3	1438497	.	A	G	7884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-1.519;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.932;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,206:399:99:7913,0,7202
chr3	1438507	.	A	T	7944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=-0.237;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.041;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.899;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,194:373:99:7973,0,7183
chr3	1438521	.	T	C	8043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=-0.332;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.812;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,202:372:99:8072,0,6857
chr3	1438541	.	A	G	8397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.249;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=0.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.298;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,201:376:99:8426,0,7163
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chr3	1438552	.	A	G	8019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-1.018;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=3.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.433;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,205:392:99:8048,0,7278
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chr3	1449799	.	A	C	9737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.011;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.015;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,258:518:99:9766,0,9966
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chr3	1450195	.	T	C	8906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=0.270;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.863;QD=17.53;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,235:508:99:8935,0,10827
chr3	1450196	.	C	T	8909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=0.598;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.673;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,236:515:99:8938,0,10792
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chr3	1450334	.	T	C	8601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.533;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.200;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,270:560:99:8630,0,9031
chr3	1450384	.	T	C	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.147;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.862;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,318:580:99:10209,0,8017
chr3	1451350	.	C	T	7692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.292;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.411;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,254:497:99:7721,0,7400
chr3	1451384	.	G	A	7102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=1.306;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.787;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,229:466:99:7131,0,7472
chr3	1451742	.	T	C	12377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.411;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.067;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,320:624:99:12406,0,19525
chr3	1451748	.	G	A	12701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.797;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.176;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,310:612:99:12730,0,19764
chr3	1451754	.	G	T	12656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.936;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.772;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,314:611:99:12685,0,19502
chr3	1451777	.	C	T	11743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=1.361;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.481;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,312:594:99:11772,0,15431
chr3	1452848	.	A	G	7442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.690;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=10.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.682;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,238:450:99:7471,0,6801
chr3	1454640	.	A	C	8433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.849;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.924;QD=14.52;ReadPosRankSum=4.807;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,280:581:99:8462,0,9166
chr3	1455443	.	A	ATTT,ATTTT	2339.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.193;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=14.314;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=39.74;MQRankSum=-1.733;QD=28.92;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=6.592	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:4,11,16:31:99:2377,510,359,251,0,132
chr3	1456859	.	C	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.154;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=82.464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.35;MQRankSum=0.679;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.416;SOR=6.567	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,81:88:55:2344,55,0
chr3	1458275	.	AT	A	902.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.474;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.86;MQRankSum=-2.968;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,67:79:10:939,0,10
chr3	1458735	.	T	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.189;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=11.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.54;MQRankSum=-1.323;QD=22.28;ReadPosRankSum=-2.583;SOR=3.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:30:407,0,30
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chr3	1459493	.	G	T	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;QD=31.22;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:3338,318,0
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chr3	1466495	.	T	C	10082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=-1.741;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-1.308;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,336:704:99:10111,0,11053
chr3	1466537	.	TCTTCCAGTTCTC	T	9895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.320;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-7.384;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,287:645:99:9933,0,13141
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chr3	1466589	.	CT	C	11287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.018;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=3.976;QD=18.81;ReadPosRankSum=2.574;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,298:600:99:11325,0,11806
chr3	1466636	.	T	C	12817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.553;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.461;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.660;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,337:645:99:12846,0,11638
chr3	1466653	.	G	A	13403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.837;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.409;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,339:653:99:13432,0,12535
chr3	1466706	.	G	C	10248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.435;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.076;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,290:597:99:10277,0,11580
chr3	1467733	.	G	A	8949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.507;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.508;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.565;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,238:480:99:8978,0,9234
chr3	1467752	.	A	G	10294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-0.856;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.330;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,259:515:99:10323,0,10240
chr3	1467762	.	A	G	10610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=1.792;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.569;QD=20.89;ReadPosRankSum=-2.184;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,262:508:99:10639,0,10099
chr3	1467764	.	T	C	10381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=-0.040;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.094;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,261:509:99:10410,0,9886
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chr3	1471712	.	TAC	T	13913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.224;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=31.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=3.956;QD=28.93;ReadPosRankSum=7.780;SOR=0.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,339:481:99:13951,0,5081
chr3	1471716	.	T	TGC	14023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.456;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=30.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=5.290;QD=29.28;ReadPosRankSum=3.650;SOR=0.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,344:479:99:14061,0,4793
chr3	1472085	.	C	G	10869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.013;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.143;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,287:578:99:10898,0,11810
chr3	1472107	.	T	C	11199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=2.418;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=1.977;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,301:608:99:11228,0,12200
chr3	1472108	.	C	CA	9452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.880;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=2.226;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,275:584:99:9490,0,12320
chr3	1472109	.	G	A	12072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.026;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=1.580;QD=19.76;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,305:611:99:12101,0,11994
chr3	1472166	.	ATATT	A	10160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.278;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=4.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.917;QD=16.82;ReadPosRankSum=-2.646;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,279:604:99:10198,0,12730
chr3	1472171	.	CATGAGATATTATGGTATACTGTAT	C	10029.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.573;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=4.471;QD=15.48;ReadPosRankSum=-2.404;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,282:648:99:10067,0,14342
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chr3	1475643	.	T	C	10964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.860;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.398;QD=21.09;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,270:520:99:10993,0,9958
chr3	1475649	.	G	T	10526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;ClippingRankSum=0.595;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.751;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,269:523:99:10555,0,9777
chr3	1475801	.	G	A	7190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-0.619;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.521;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,228:440:99:7219,0,6563
chr3	1475854	.	GA	G	9137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.378;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.270;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,237:481:99:9175,0,9344
chr3	1475857	.	A	G	9146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.429;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.112;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,240:483:99:9175,0,9344
chr3	1475889	.	C	T	9590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-0.113;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.467;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,246:495:99:9619,0,9793
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chr3	1476098	.	A	G	6594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.025;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.284;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,221:460:99:6623,0,7664
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chr3	1478274	.	GAAAGGAAAGGAGGGA	G	5783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-0.717;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-2.325;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,190:449:99:5821,0,10212
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chr3	1478325	.	AAAAGAAGGAGAAT	A	8490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.113;ClippingRankSum=0.670;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=0.504;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,228:582:99:8528,0,14494
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chr3	1478530	.	A	G	9488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=1.108;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.712;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,310:651:99:9517,0,10229
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chr3	1478861	.	A	G	5195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.636;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=18.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.971;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,135:290:99:5224,0,6093
chr3	1478862	.	C	T	5195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=-2.145;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=20.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.317;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,134:289:99:5224,0,6093
chr3	1478874	.	T	G	5248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.841;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=8.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.988;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,131:277:99:5277,0,6208
chr3	1478888	.	A	G	5120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=1.323;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.282;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.296;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,131:297:99:5149,0,6603
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chr3	1478982	.	T	C	5123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-0.406;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=3.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.394;QD=17.67;ReadPosRankSum=2.024;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,132:290:99:5152,0,6270
chr3	1478992	.	T	C	5347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.824;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.097;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,144:313:99:5376,0,6455
chr3	1479031	.	C	A	5375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.455;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=7.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.986;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,171:326:99:5404,0,4659
chr3	1480025	.	A	G	7184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.867;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.633;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.883;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,192:413:99:7213,0,14518
chr3	1480033	.	C	T	7159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.392;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=2.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.268;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,182:398:99:7188,0,14540
chr3	1480813	.	A	G	8072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.190;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.618;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,260:520:99:8101,0,7936
chr3	1480842	.	T	C	7824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.901;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.553;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,257:519:99:7853,0,8080
chr3	1480933	.	C	G	7873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=-0.354;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.178;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,264:558:99:7902,0,9400
chr3	1481111	.	A	G	10453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=1.415;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=0.808;QD=20.95;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,265:499:99:10482,0,9222
chr3	1481118	.	A	G	10403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.452;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=3.137;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,251:496:99:10432,0,9670
chr3	1481122	.	A	T	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.810;ClippingRankSum=-0.150;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=8.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-1.000;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=1.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,231:479:99:9040,0,10255
chr3	1481125	.	CTGGTTAT	C	8978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.868;ClippingRankSum=0.302;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=7.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-3.289;QD=17.92;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=1.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,226:501:99:9016,0,11176
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chr3	1481174	.	GCTACAACT	G	8720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=-0.404;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-0.805;QD=19.73;ReadPosRankSum=-6.378;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,199:442:99:8758,0,10108
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chr3	1481200	.	AGC	A	7673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;ClippingRankSum=-1.179;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=1.489;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,193:411:99:7711,0,8853
chr3	1481244	.	C	T	8158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=-0.160;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.676;QD=18.01;ReadPosRankSum=2.978;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,226:453:99:8187,0,7226
chr3	1481256	.	C	T	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.230;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.718;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,254:484:99:8559,0,7080
chr3	1481293	.	T	TG	8271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=1.514;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.019;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,240:495:99:8309,0,8757
chr3	1481305	.	A	T	9847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=1.530;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.557;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,247:506:99:9876,0,10233
chr3	1481307	.	C	T	10336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.779;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.220;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.348;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,250:510:99:10365,0,10442
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chr3	1481323	.	G	A	10663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=-0.640;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.887;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,266:533:99:10692,0,11097
chr3	1481333	.	A	T	10711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=-0.174;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.265;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,269:546:99:10740,0,11595
chr3	1481339	.	T	C	10618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=0.516;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.174;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.276;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,266:545:99:10647,0,11385
chr3	1481345	.	C	A	10387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-0.223;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=2.244;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,270:562:99:10416,0,11246
chr3	1481373	.	CA	C	10478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=-2.296;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.336;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,272:545:99:10516,0,10710
chr3	1481383	.	CT	C	10500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.471;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.619;QD=18.89;ReadPosRankSum=2.596;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,272:556:99:10538,0,10969
chr3	1481472	.	T	C	10531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.079;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.697;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,272:561:99:10560,0,11337
chr3	1481483	.	G	A	11172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.881;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.688;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,282:576:99:11201,0,11776
chr3	1481490	.	G	A	11129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=-0.402;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.077;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.879;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,278:563:99:11158,0,11580
chr3	1481493	.	A	C	10827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=-0.938;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.897;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,275:566:99:10856,0,11314
chr3	1481523	.	G	A	8008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=1.210;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.293;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.632;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,266:510:99:8037,0,7111
chr3	1481937	.	G	A	6631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=1.006;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.937;QD=14.61;ReadPosRankSum=-1.250;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,218:454:99:6660,0,7411
chr3	1481955	.	A	G	7026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-0.626;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.883;QD=14.46;ReadPosRankSum=2.084;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,228:486:99:7055,0,8404
chr3	1482228	.	C	T	5842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.055;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=6.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.594;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,193:376:99:5871,0,5377
chr3	1482243	.	G	A	5545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=2.195;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.595;QD=16.26;ReadPosRankSum=2.135;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,170:341:99:5574,0,5237
chr3	1482977	.	C	G	9043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.624;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=6.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.262;QD=17.56;ReadPosRankSum=2.246;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,248:515:99:9072,0,9467
chr3	1482996	.	A	T	8511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.890;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.351;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,222:461:99:8540,0,9067
chr3	1483275	.	C	T	7270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.246;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.176;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.001;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,189:368:99:7299,0,9498
chr3	1483281	.	C	G	7191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.998;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.033;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,183:357:99:7220,0,9594
chr3	1483287	.	T	G	7245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=1.586;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.249;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,181:359:99:7274,0,9321
chr3	1483539	.	T	C	6517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.168;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.104;QD=18.84;ReadPosRankSum=2.292;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,171:346:99:6546,0,10522
chr3	1483540	.	G	A	6517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.089;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.409;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.428;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,170:345:99:6546,0,10522
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chr3	1486359	.	G	A	8912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.784;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.099;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,227:508:99:8941,0,11641
chr3	1486369	.	A	C	9035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.188;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.284;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,225:496:99:9064,0,11089
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chr3	1486383	.	G	T	8900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.301;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.848;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,222:495:99:8929,0,10916
chr3	1486698	.	C	T	8307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.477;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.276;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.878;SOR=1.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,216:427:99:8336,0,8057
chr3	1486710	.	T	C	8865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.107;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.604;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.789;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,221:444:99:8894,0,8875
chr3	1486733	.	C	T	8565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.001;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=13.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.490;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.772;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,216:448:99:8594,0,9599
chr3	1486734	.	G	A	8571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=1.723;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=13.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.338;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,221:461:99:8600,0,9515
chr3	1486760	.	G	A	7513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.339;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.676;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.550;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,238:502:99:7542,0,8333
chr3	1486788	.	G	T	9647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.309;ClippingRankSum=0.804;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.286;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,260:553:99:9676,0,11471
chr3	1486807	.	T	G	9957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-1.247;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.289;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,274:594:99:9986,0,12075
chr3	1486837	.	G	A	10821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-2.643;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.154;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,288:560:99:10850,0,9939
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chr3	1486870	.	G	T	9941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.198;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.085;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,263:514:99:9970,0,9717
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chr3	1488368	.	G	T	10560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.160;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.255;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,263:538:99:10589,0,11067
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chr3	1488581	.	A	T	11317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=1.052;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.150;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,290:590:99:11346,0,11833
chr3	1488629	.	GCACAGTAGGCATATGCTTT	G	10397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.530;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.460;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,279:643:99:10435,0,14312
chr3	1489323	.	G	A	11314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.087;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.866;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,290:544:99:11343,0,9660
chr3	1489325	.	T	G	11314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-0.828;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.374;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,290:543:99:11343,0,9660
chr3	1489372	.	A	G	10241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.552;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.943;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,265:558:99:10270,0,11358
chr3	1489380	.	G	A	10196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.572;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.718;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,263:566:99:10225,0,11629
chr3	1489417	.	GAGTACGTAATCGGGTGTTTGA	G	6506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;ClippingRankSum=-0.678;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=5.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.558;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,212:518:99:6544,0,11834
chr3	1489532	.	G	C	9749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-1.933;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.455;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,254:545:99:9778,0,12501
chr3	1489536	.	T	C	9802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.663;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.780;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,252:545:99:9831,0,12504
chr3	1490327	.	T	TGCGCTC	7012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.078;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.569;QD=23.61;ReadPosRankSum=-1.809;SOR=0.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,174:297:99:7050,0,4617
chr3	1491358	.	T	C	6446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.954;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=3.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.041;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,164:307:99:6475,0,5648
chr3	1491361	.	G	C	6577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-0.247;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=6.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.378;QD=21.57;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,162:305:99:6606,0,5766
chr3	1491368	.	A	C	6595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=1.153;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.013;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,168:322:99:6624,0,5831
chr3	1491430	.	G	C	7069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.569;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=3.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.363;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,172:322:99:7098,0,5996
chr3	1491431	.	A	T	7138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.815;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=4.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.156;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,175:330:99:7167,0,6075
chr3	1491443	.	T	A	6880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-1.973;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=2.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.324;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,179:329:99:6909,0,5628
chr3	1491482	.	G	A	4399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.267;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.251;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,148:298:99:4428,0,4822
chr3	1491741	.	C	CT	2970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.272;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.040;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,144:374:99:3008,0,5423
chr3	1491788	.	T	A	10127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.255;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.469;QD=21.55;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,267:470:99:10156,0,7599
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chr3	1492413	.	T	C	12792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.948;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.768;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,327:624:99:12821,0,11454
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chr3	1493728	.	CCAGTTTTCTTACAATCTTGA	C	6314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.848;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-3.179;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,178:488:99:6352,0,12236
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chr3	1494382	.	A	AT	8718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-1.768;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.917;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,231:471:99:8756,0,9181
chr3	1494385	.	G	T	9047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-1.605;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.442;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,236:481:99:9076,0,9361
chr3	1494393	.	C	T	8836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.533;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.020;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,233:472:99:8865,0,9633
chr3	1494415	.	C	T	7463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=1.142;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.320;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,230:482:99:7492,0,9557
chr3	1494490	.	T	C	6490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=1.425;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.579;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.154;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,221:449:99:6519,0,7163
chr3	1494590	.	T	C	9976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.543;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.179;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,266:501:99:10005,0,8820
chr3	1494606	.	A	T	10001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.391;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.654;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,266:491:99:10030,0,8660
chr3	1494660	.	TTCGATATTATC	T	8407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.967;ClippingRankSum=-0.201;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.784;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,225:525:99:8445,0,11792
chr3	1495069	.	G	C	11052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-0.465;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.308;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,298:591:99:11081,0,11027
chr3	1495083	.	T	C	10846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.887;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.171;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,284:562:99:10875,0,10714
chr3	1495173	.	G	A	8924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-2.293;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.153;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.220;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,280:551:99:8953,0,8517
chr3	1495365	.	C	T	5799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.819;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=4.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.944;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,201:472:99:5828,0,7809
chr3	1495453	.	G	T	11496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.795;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.136;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.247;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,292:523:99:11525,0,8654
chr3	1495476	.	G	C	11449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=2.340;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.702;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,307:559:99:11478,0,9193
chr3	1495534	.	T	C	8638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.565;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.292;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.941;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,248:542:99:8667,0,10734
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chr3	1496391	.	GCTT	G	8209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.598;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-3.126;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,218:486:99:8247,0,10458
chr3	1496401	.	CTT	C	8524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.366;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.408;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.626;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,214:459:99:8562,0,10289
chr3	1496409	.	C	CCG	7879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=1.207;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.306;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,189:407:99:7917,0,8915
chr3	1496437	.	A	G	5281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-0.372;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=6.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.293;QD=13.44;ReadPosRankSum=-2.448;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,177:393:99:5310,0,6675
chr3	1496534	.	G	A	7632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=-0.034;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=9.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.843;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,220:436:99:7661,0,8114
chr3	1496570	.	G	C	7454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.257;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.645;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,237:470:99:7483,0,6987
chr3	1496620	.	A	G	10166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.918;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.785;QD=19.51;ReadPosRankSum=-2.212;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,251:521:99:10195,0,10749
chr3	1496623	.	A	T	10455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.373;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.010;QD=19.58;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,257:534:99:10484,0,11006
chr3	1496628	.	CA	C	10342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.541;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.916;QD=19.22;ReadPosRankSum=-2.478;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,259:538:99:10380,0,11370
chr3	1496635	.	C	T	5215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=1.582;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.165;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,236:519:99:5244,0,11565
chr3	1496642	.	T	G	10816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.510;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.283;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,266:548:99:10845,0,11880
chr3	1496647	.	G	A	10828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=-0.881;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.062;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,270:558:99:10857,0,11712
chr3	1496653	.	A	G	11061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.192;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.221;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,274:564:99:11090,0,9274
chr3	1496661	.	T	TATGAC	12181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.773;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.089;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,286:577:99:12219,0,11728
chr3	1496668	.	ACT	A	11785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.474;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.149;QD=19.61;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,303:601:99:11823,0,11621
chr3	1496760	.	C	T	12496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.188;ClippingRankSum=-1.226;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.154;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,322:681:99:12525,0,14558
chr3	1496761	.	T	A	12496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.274;ClippingRankSum=1.476;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.517;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,325:684:99:12525,0,14558
chr3	1496901	.	G	GT	5261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.810;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=8.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.134;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.599;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,234:497:99:5299,0,5718
chr3	1497404	.	C	T	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=-1.209;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=4.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.379;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.352;SOR=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,209:420:99:8192,0,11507
chr3	1497406	.	C	T	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.484;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=7.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.039;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.232;SOR=1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,209:417:99:8192,0,11507
chr3	1498234	.	T	C	8392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.449;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.646;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,220:415:99:8421,0,7899
chr3	1498238	.	A	G	8562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=-0.339;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.065;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,209:405:99:8591,0,7987
chr3	1498242	.	T	C	8065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=1.891;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=4.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.955;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,203:394:99:8094,0,7602
chr3	1498362	.	A	G	8859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.424;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.055;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,223:468:99:8888,0,13768
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chr3	1498369	.	C	A	9153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.111;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.722;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,221:468:99:9182,0,14614
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chr3	1499391	.	C	T	9175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.273;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.340;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,227:510:99:9204,0,12039
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chr3	1499420	.	A	C	9279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.511;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.451;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,230:522:99:9308,0,11904
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chr3	1499482	.	G	C	8905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.982;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.305;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,287:598:99:8934,0,9805
chr3	1499892	.	A	C	8732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-0.524;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.948;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,230:489:99:8761,0,10108
chr3	1499909	.	A	C	9146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=-0.099;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.029;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,229:471:99:9175,0,9633
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chr3	1500222	.	C	T	9861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.591;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.215;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,258:553:99:9890,0,11597
chr3	1500289	.	C	T	10901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.386;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.652;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,285:596:99:10930,0,12583
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chr3	1500299	.	G	T	11031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.591;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.257;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,278:586:99:11060,0,9849
chr3	1500307	.	G	A	10271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.135;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.358;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.933;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,276:596:99:10300,0,12367
chr3	1500352	.	TTGATTATTTCCATACTGACGAGGC	T	10186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.503;ClippingRankSum=-2.508;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.428;QD=17.27;ReadPosRankSum=2.973;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,271:590:99:10224,0,12413
chr3	1500424	.	G	A	11599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=-0.371;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.914;QD=19.73;ReadPosRankSum=3.537;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,295:588:99:11628,0,11530
chr3	1500425	.	G	A	11731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.173;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.264;QD=19.95;ReadPosRankSum=2.539;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,297:588:99:11760,0,11579
chr3	1500445	.	A	G	11537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.505;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.583;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,301:605:99:11566,0,11495
chr3	1500817	.	C	A	11882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=1.695;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.953;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,304:571:99:11911,0,10433
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chr3	1501977	.	G	A	6564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.644;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.927;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,162:378:99:6593,0,8843
chr3	1501984	.	T	G	6273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.820;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.233;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,161:375:99:6302,0,8822
chr3	1501997	.	C	T	6678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.775;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=3.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.242;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,166:398:99:6707,0,9587
chr3	1502015	.	T	A	6525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.876;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=7.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.210;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.774;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,162:388:99:6554,0,9389
chr3	1502016	.	GT	G	6636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=1.160;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=8.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.373;QD=17.02;ReadPosRankSum=2.186;SOR=1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,162:390:99:6674,0,9464
chr3	1502033	.	G	A	6884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-0.277;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=13.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.877;QD=18.71;ReadPosRankSum=6.455;SOR=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,173:368:99:6913,0,8402
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chr3	1505332	.	A	G	11953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.031;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.331;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=1.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,294:580:99:11982,0,11757
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chr3	1505392	.	T	C	10149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=-1.276;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.819;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,269:536:99:10178,0,10050
chr3	1505411	.	G	A	9866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.449;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.108;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,263:526:99:9895,0,10156
chr3	1505590	.	G	A	9981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.649;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.173;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,253:511:99:10010,0,10767
chr3	1505594	.	A	C	10122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.222;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.709;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,257:520:99:10151,0,10882
chr3	1505603	.	T	C	9880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.981;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.024;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,251:523:99:9909,0,11095
chr3	1505612	.	T	C	9419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-0.907;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.052;QD=18.26;ReadPosRankSum=2.248;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,242:516:99:9448,0,10614
chr3	1505638	.	T	C	9432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.175;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.105;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,250:509:99:9461,0,9979
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chr3	1506289	.	GAAT	G	9143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-1.638;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.704;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,226:453:99:9181,0,9214
chr3	1506295	.	GT	G	8919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.362;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.651;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,230:461:99:8957,0,8980
chr3	1506333	.	G	A	6571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.446;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.914;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,219:442:99:6600,0,6648
chr3	1506477	.	TA	T	5501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.932;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.133;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,224:488:99:5539,0,6726
chr3	1506588	.	C	A	7746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.665;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.614;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.996	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,240:469:99:7775,0,7283
chr3	1506602	.	C	T	7398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=2.022;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.404;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,230:449:99:7427,0,7059
chr3	1506699	.	G	A	7872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=1.428;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.709;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,253:530:99:7901,0,8503
chr3	1506763	.	G	C	11517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-0.642;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.023;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.640;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,291:578:99:11546,0,11315
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chr3	1506770	.	C	T	11386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.793;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.477;QD=19.91;ReadPosRankSum=-2.552;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,294:572:99:11415,0,10996
chr3	1506803	.	G	GA	10526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.348;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.224;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,269:542:99:10564,0,10779
chr3	1506809	.	A	G	10814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=1.287;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.273;QD=19.07;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,276:567:99:10843,0,11109
chr3	1506847	.	C	A	8180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=1.122;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.011;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,263:573:99:8209,0,9679
chr3	1507008	.	C	T	11174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=1.720;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.922;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.883;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,291:545:99:11203,0,9467
chr3	1507025	.	T	C	10962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.298;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.644;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,291:548:99:10991,0,9426
chr3	1507061	.	C	T	9041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.216;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.660;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.894;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,244:547:99:9070,0,11784
chr3	1507080	.	C	T	9231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=-0.686;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.519;QD=17.13;ReadPosRankSum=3.204;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,247:539:99:9260,0,11523
chr3	1507141	.	T	A	11907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=-0.934;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.151;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,308:550:99:11936,0,13063
chr3	1507142	.	A	C	11907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-2.078;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.356;QD=21.93;ReadPosRankSum=-1.182;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,303:543:99:11936,0,13063
chr3	1507280	.	A	G	9550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.192;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.657;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.368;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,259:589:99:9579,0,12727
chr3	1507293	.	T	C	9652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=-0.023;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.546;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.982;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,257:587:99:9681,0,13009
chr3	1507625	.	C	CAAA	6754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.876;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.020;QD=16.36;ReadPosRankSum=-2.118;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,188:413:99:6792,0,9026
chr3	1507639	.	T	TA	7873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.590;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.955;QD=17.01;ReadPosRankSum=-1.669;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,194:463:99:7911,0,10943
chr3	1507640	.	GTGCGT	G	7677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.446;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-2.201;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.581;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,193:477:99:7715,0,11453
chr3	1507905	.	T	G	9853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.082;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.438;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,262:508:99:9882,0,9672
chr3	1507917	.	A	G	10133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-1.343;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.077;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,271:531:99:10162,0,9969
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chr3	1510215	.	T	TAAA	7740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=1.548;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-0.032;QD=14.61;ReadPosRankSum=-2.830;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,202:530:99:7778,0,13588
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chr3	1510248	.	G	GGA	9085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.279;ClippingRankSum=-1.483;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=2.652;QD=16.64;ReadPosRankSum=-10.092;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,223:546:99:9123,0,13173
chr3	1510250	.	AGT	A	8932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=-0.558;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.135;QD=16.70;ReadPosRankSum=-10.590;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,215:535:99:8970,0,13560
chr3	1510254	.	T	G	8159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=2.252;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.813;QD=15.69;ReadPosRankSum=-10.833;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,207:520:99:8188,0,12854
chr3	1510266	.	G	A	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=-0.866;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=2.910;QD=7.74;ReadPosRankSum=3.136;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,96:394:99:3077,0,12749
chr3	1510267	.	C	A	3048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=-0.563;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.209;QD=7.76;ReadPosRankSum=3.762;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,96:393:99:3077,0,12749
chr3	1510269	.	T	G	3039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;ClippingRankSum=-0.127;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.538;QD=7.70;ReadPosRankSum=4.874;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,96:395:99:3068,0,12875
chr3	1510273	.	A	G	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;ClippingRankSum=0.709;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.577;QD=7.54;ReadPosRankSum=6.531;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,96:401:99:3051,0,13088
chr3	1510278	.	A	G	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.433;ClippingRankSum=1.461;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.510;QD=7.39;ReadPosRankSum=7.665;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,96:409:99:3050,0,13128
chr3	1510279	.	G	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.010;ClippingRankSum=0.187;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.294;QD=7.35;ReadPosRankSum=8.296;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,96:411:99:3050,0,13128
chr3	1510281	.	G	A	3017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.108;ClippingRankSum=-1.763;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.061;QD=7.41;ReadPosRankSum=9.117;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,96:407:99:3046,0,13143
chr3	1510282	.	C	T	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;ClippingRankSum=0.157;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.975;QD=7.50;ReadPosRankSum=8.633;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,96:403:99:3052,0,13060
chr3	1510285	.	C	A	9416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.026;ClippingRankSum=0.053;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.445;QD=18.46;ReadPosRankSum=6.388;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,204:510:99:9445,0,12366
chr3	1510303	.	A	G	10753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-0.085;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-3.157;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.982;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,277:562:99:10782,0,11665
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chr3	1516208	.	T	C	8453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=-1.302;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-2.196;QD=17.54;ReadPosRankSum=-8.077;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,212:482:99:8482,0,11047
chr3	1516210	.	C	CTTT	9558.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.116;ClippingRankSum=1.747;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-3.150;QD=19.75;ReadPosRankSum=-7.955;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,213:484:99:9596,0,11134
chr3	1516219	.	T	C	9713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.587;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-4.089;QD=18.72;ReadPosRankSum=-7.563;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,243:519:99:9742,0,11164
chr3	1516222	.	C	T	9539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-1.077;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-0.679;QD=18.56;ReadPosRankSum=-6.680;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,240:514:99:9568,0,10874
chr3	1516226	.	T	C	9111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.535;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-2.812;QD=18.15;ReadPosRankSum=-5.163;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,233:502:99:9140,0,10749
chr3	1516284	.	T	C	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=-0.545;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.156;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,247:512:99:9241,0,9943
chr3	1516301	.	T	G	9137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=-0.584;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.996;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,238:493:99:9166,0,9798
chr3	1516520	.	G	A	9165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-1.112;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.152;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,291:597:99:9194,0,9324
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chr3	1548617	.	T	C	8854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.401;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.218;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,278:529:99:8883,0,8098
chr3	1548934	.	T	A	8315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.442;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.269;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,214:448:99:8344,0,9274
chr3	1548938	.	A	G	8433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.316;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=4.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.045;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,220:465:99:8462,0,9577
chr3	1549517	.	G	A	9608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.632;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.066;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,257:533:99:9637,0,16915
chr3	1549537	.	C	G	9460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.282;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.248;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.950;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,256:543:99:9489,0,17186
chr3	1550017	.	A	T	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.760;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.563;QD=7.91;ReadPosRankSum=6.384;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,138:336:99:2686,0,6236
chr3	1550026	.	T	TCC	2619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=-0.311;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=20.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.591;QD=7.99;ReadPosRankSum=-4.750;SOR=1.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,111:328:99:2657,0,8272
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chr3	1555187	.	G	A	10378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.985;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.054;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,270:560:99:10407,0,11295
chr3	1555190	.	C	T	10450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.585;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.470;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,272:559:99:10479,0,11258
chr3	1558292	.	T	C	8866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.287;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.286;QD=18.87;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,240:470:99:8895,0,8629
chr3	1558306	.	T	C	8364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=-0.036;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.008;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,217:442:99:8393,0,8367
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chr3	1561850	.	G	A	6963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.361;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.118;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,190:415:99:6992,0,8593
chr3	1562494	.	G	T	8223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=1.403;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.451;QD=15.72;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,267:523:99:8252,0,7552
chr3	1562562	.	C	CTTTTT	1666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.637;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=1.472;QD=34.72;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,5:48:99:1704,0,4389
chr3	1562578	.	T	TTTGGA	4842.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.565;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=56.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-0.668;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,137:291:99:4880,0,5709
chr3	1562955	.	A	T	10980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-0.591;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.485;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.346;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,285:586:99:11009,0,11600
chr3	1562956	.	C	T	10980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.852;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.529;QD=18.97;ReadPosRankSum=2.102;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,283:579:99:11009,0,11600
chr3	1564686	.	T	A	9483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-1.291;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.077;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,252:501:99:9512,0,9511
chr3	1564695	.	T	C	9481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.021;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.964;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,245:498:99:9510,0,9865
chr3	1564722	.	C	T	7553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=1.285;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=5.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.975;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,239:494:99:7582,0,8125
chr3	1564749	.	C	T	8922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-0.500;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.637;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.010;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,232:465:99:8951,0,9008
chr3	1564762	.	T	A	9501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-2.761;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.263;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,233:469:99:9530,0,9653
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chr3	1571523	.	G	T	7022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.045;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.106;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,239:465:99:7051,0,8135
chr3	1571526	.	C	CA	5265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=1.123;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.205;QD=12.36;ReadPosRankSum=2.914;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,186:426:99:5303,0,9283
chr3	1571570	.	TA	T	5412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.569;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.999;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,233:469:99:5450,0,5430
chr3	1571611	.	GGAAT	G	9478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.273;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.896;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,247:501:99:9516,0,9777
chr3	1571675	.	T	G	10207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.134;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.018;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,264:516:99:10236,0,9761
chr3	1571682	.	G	A	10242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=-1.601;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.189;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,268:515:99:10271,0,9635
chr3	1571720	.	A	T	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.489;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.095;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,244:498:99:9356,0,9935
chr3	1571730	.	C	T	9326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=-0.711;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.380;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,232:484:99:9355,0,10107
chr3	1571735	.	C	T	9120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.178;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.639;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,237:490:99:9149,0,9925
chr3	1571894	.	C	T	7922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.565;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.834;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,204:441:99:7951,0,9361
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chr3	1571928	.	T	C	9163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-2.225;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.595;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,229:461:99:9192,0,9190
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chr3	1575521	.	T	G	10147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.395;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.997;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,262:540:99:10176,0,10837
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chr3	1575569	.	T	A	8897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=1.892;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.120;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.867;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,229:504:99:8926,0,11174
chr3	1575571	.	T	G	9008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.116;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.312;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.848;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,232:513:99:9037,0,11375
chr3	1575580	.	T	A	9098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.661;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.453;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,231:495:99:9127,0,10792
chr3	1575598	.	TC	T	8988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=1.035;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.016;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,216:491:99:9026,0,11489
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chr3	1575647	.	T	C	7324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.496;ClippingRankSum=0.834;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.232;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,234:521:99:7353,0,8458
chr3	1575727	.	C	CT	7329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-1.172;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.722;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,197:427:99:7367,0,8992
chr3	1575743	.	A	T	7775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-1.011;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.758;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,210:475:99:7804,0,10294
chr3	1575790	.	T	C	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-0.647;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.839;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,240:501:99:9241,0,10037
chr3	1575800	.	C	CG	9211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.585;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.615;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,239:498:99:9249,0,10103
chr3	1575973	.	G	T	8168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.232;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,275:545:99:8197,0,7916
chr3	1576044	.	G	C	10052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.093;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.598;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,261:534:99:10081,0,10750
chr3	1576054	.	C	T	10220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.588;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.055;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,259:535:99:10249,0,11046
chr3	1576074	.	G	C	9446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.719;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.849;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,251:526:99:9475,0,10529
chr3	1576218	.	G	A	7922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-0.638;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.705;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,243:491:99:7951,0,7929
chr3	1578395	.	G	GTTTTTT	4943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;QD=29.55;SOR=4.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,66:67:99:4981,407,0
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chr3	1594505	.	A	G	7154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.640;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.145;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,240:528:99:7183,0,9191
chr3	1594540	.	T	G	9114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=1.386;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.369;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,286:531:99:9143,0,7385
chr3	1596836	.	C	T	10221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.315;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.392;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,266:538:99:10250,0,14454
chr3	1596843	.	G	A	10153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-0.280;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.822;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.314;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,257:524:99:10182,0,14470
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chr3	1613984	.	C	T	9797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-0.218;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.327;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,261:556:99:9826,0,11609
chr3	1614417	.	A	G	9786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.948;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.685;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,263:534:99:9815,0,10481
chr3	1614438	.	T	C	9815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=2.169;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.225;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,257:525:99:9844,0,10134
chr3	1615909	.	G	A	8655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.950;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.060;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,223:420:99:8684,0,7620
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chr3	1616255	.	G	A	8875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=-0.962;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.404;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.683;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,297:552:99:8904,0,7699
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chr3	1619641	.	CTCTTCCTTCTCT	C	8917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-0.720;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.988;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,242:581:99:8955,0,13275
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chr3	1619725	.	G	A	10197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.586;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-0.738;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,251:532:99:10226,0,11429
chr3	1619749	.	G	A	8601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.693;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.149;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,271:542:99:8630,0,10200
chr3	1619843	.	GA	G	6700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.333;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.095;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,258:560:99:6738,0,8124
chr3	1620215	.	T	C	7736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.682;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.476;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.890;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,246:498:99:7765,0,7349
chr3	1620715	.	A	G	8099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.316;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=6.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.118;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,272:576:99:8128,0,9646
chr3	1621155	.	C	T	9993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.644;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.066;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,262:553:99:10022,0,16084
chr3	1621156	.	C	T	9993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.495;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.572;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.610;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,261:553:99:10022,0,16084
chr3	1621678	.	A	G	7756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.578;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.399;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.885;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,260:561:99:7785,0,9461
chr3	1622712	.	A	G	9695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.472;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.437;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.523;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,253:510:99:9724,0,9771
chr3	1622729	.	C	G	10489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.474;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.148;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,264:533:99:10518,0,10528
chr3	1622731	.	C	T	10394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.100;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.824;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,267:534:99:10423,0,10539
chr3	1629483	.	C	T	8447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;ClippingRankSum=-0.822;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.233;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,233:492:99:8476,0,9857
chr3	1629502	.	A	G	8866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.628;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.621;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,243:509:99:8895,0,9987
chr3	1629595	.	A	G	7809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.561;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=1.421;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,259:549:99:7838,0,9223
chr3	1631079	.	G	A	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-0.456;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.122;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,294:566:99:9092,0,8654
chr3	1631617	.	A	T	7804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.095;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.246;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,243:526:99:7833,0,8856
chr3	1632679	.	G	A	9127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.250;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.755;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,292:538:99:9156,0,7333
chr3	1634016	.	A	C	9346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.279;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.301;QD=15.90;ReadPosRankSum=-2.279;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,296:588:99:9375,0,9133
chr3	1634844	.	C	A	8110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.097;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.838;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,212:429:99:8139,0,14970
chr3	1634850	.	C	T	8020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.240;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.929;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,204:410:99:8049,0,14696
chr3	1634923	.	C	CT	4292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-0.343;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.907;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,136:286:99:4330,0,5835
chr3	1634930	.	A	T	5396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.939;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=1.204;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.785;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,141:291:99:5425,0,5805
chr3	1634962	.	A	ATTT,ATTTT	3712.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=1.559;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=10.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.52;MQRankSum=0.606;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=4.452	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:4,24,21:49:99:3750,643,300,572,0,273
chr3	1635001	.	GA	G	2485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.086;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=0.095;QD=11.89;ReadPosRankSum=2.675;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,104:209:99:2523,0,2397
chr3	1635054	.	G	A	5119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.808;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.607;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,183:378:99:5148,0,5582
chr3	1637302	.	G	T	7994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=0.155;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.671;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.797;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,246:512:99:8023,0,8348
chr3	1643225	.	A	ATT	5422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.379;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.310;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,184:448:99:5460,0,10120
chr3	1643229	.	T	A	4700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.564;ClippingRankSum=0.669;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.674;QD=8.79;ReadPosRankSum=6.734;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,237:535:99:4729,0,11101
chr3	1644140	.	A	G	10953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.154;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.963;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,289:578:99:10982,0,15212
chr3	1644153	.	A	G	11168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-1.522;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.339;QD=19.09;ReadPosRankSum=2.064;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,292:585:99:11197,0,15512
chr3	1644714	.	T	C	10601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.845;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.022;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.659;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,287:594:99:10630,0,12486
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chr3	1645732	.	A	AGG	9181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.576;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.388;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,216:415:99:9219,0,8039
chr3	1645735	.	ATAT	A	8785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.868;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.143;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,218:433:99:8823,0,8679
chr3	1645746	.	T	C	8313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-0.648;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.078;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,214:429:99:8342,0,8469
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chr3	1648503	.	T	G	8104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-0.170;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.533;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,213:472:99:8133,0,10063
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chr3	1654530	.	G	A	10576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-1.025;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.540;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,274:576:99:10605,0,11701
chr3	1655438	.	T	C	7755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.139;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.684;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,254:532:99:7784,0,8747
chr3	1655585	.	T	C	10471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.870;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.589;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,265:536:99:10500,0,10628
chr3	1655588	.	T	C	10527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=1.424;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.264;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.786;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,276:542:99:10556,0,10589
chr3	1655840	.	C	T	9394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.711;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.357;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,305:577:99:9423,0,8483
chr3	1656124	.	A	T	11112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=1.656;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.220;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,285:555:99:11141,0,11660
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chr3	1657287	.	G	A	9502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-1.368;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.637;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,304:608:99:9531,0,9255
chr3	1659935	.	G	A	12366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-0.477;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.686;QD=19.91;ReadPosRankSum=2.139;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,332:621:99:12395,0,10323
chr3	1659959	.	G	A	12786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.112;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.953;QD=20.86;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,341:613:99:12815,0,10155
chr3	1659998	.	T	C	9422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-1.564;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.422;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,300:621:99:9451,0,10383
chr3	1667962	.	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.375;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.096;QD=2.08;ReadPosRankSum=-7.436;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,39:274:99:598,0,8203
chr3	1681325	.	G	T	6976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.026;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.706;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,226:486:99:7005,0,8514
chr3	1681789	.	A	AT,ATT	4584.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-1.521;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-0.923;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:47,115,104:266:99:4622,1100,1217,1284,0,2171
chr3	1681867	.	C	G	6335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.127;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.402;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,206:420:99:6364,0,6558
chr3	1683634	.	A	ATT	5387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.690;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.723;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.425;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,189:437:99:5425,0,8080
chr3	1685416	.	T	G	18607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=-1.888;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQRankSum=-1.343;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.180	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,477:482:99:18636,1356,0
chr3	1685440	.	T	C	7162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.960;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=2.593;QD=14.18;ReadPosRankSum=-2.669;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,244:505:99:7191,0,8304
chr3	1685466	.	TGGCTCCACACCAGATGTGGCTTCATCTCC	T	5204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.823;ClippingRankSum=2.525;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.082;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,151:366:99:5242,0,8389
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chr3	1713027	.	A	C	11182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.187;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,297:593:99:11211,0,11318
chr3	1713038	.	T	C	11468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.222;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.969;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,284:576:99:11497,0,11808
chr3	1713057	.	T	C	11199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.449;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.534;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,291:584:99:11228,0,11043
chr3	1713083	.	T	C	8989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.655;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.669;QD=15.21;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,295:591:99:9018,0,9095
chr3	1713364	.	A	G	9984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.039;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.245;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.679;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,258:557:99:10013,0,11665
chr3	1713372	.	T	C	9883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.551;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.495;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,263:560:99:9912,0,11611
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chr3	1714481	.	A	C	7217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=2.180;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.218;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.902;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,194:422:99:7246,0,8720
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chr3	1736448	.	TA	T	8966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.074;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=5.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.345;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,228:459:99:9004,0,9078
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chr3	1736540	.	A	ATGC	10070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=1.761;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.273;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,254:493:99:10108,0,9119
chr3	1736759	.	T	TA	4385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.333;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.786;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,208:478:99:4423,0,6638
chr3	1736828	.	G	GA	8545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.125;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.187;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,272:553:99:8583,0,11400
chr3	1736838	.	A	G	11772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-2.175;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.352;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,315:638:99:11810,0,12208
chr3	1738725	.	C	T	7463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=2.594;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.063;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,252:533:99:7492,0,8901
chr3	1739435	.	C	T	8962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=1.762;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.477;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,279:542:99:8991,0,8045
chr3	1739467	.	A	ATTTTT	5950.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.769;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.544;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.380;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,186:368:99:5988,0,7223
chr3	1739480	.	G	T	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.724;ClippingRankSum=1.160;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.538;QD=7.48;ReadPosRankSum=5.255;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,165:378:99:2854,0,9517
chr3	1739499	.	C	T	9294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=1.336;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=2.399;QD=21.87;ReadPosRankSum=1.346;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,230:425:99:9323,0,7351
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chr3	1739532	.	C	A	9136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.654;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.854;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,229:438:99:9165,0,8047
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chr3	1745717	.	G	A	7537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=-0.621;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.106;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,253:522:99:7566,0,8425
chr3	1745882	.	T	G	7613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=-0.770;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.011;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,252:491:99:7642,0,7746
chr3	1746299	.	GA	G	4410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.324;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.514;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,187:391:99:4448,0,4703
chr3	1746749	.	A	T	7367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.576;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.212;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,241:504:99:7396,0,8089
chr3	1747927	.	C	G	9956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.865;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.301;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,261:554:99:9985,0,12465
chr3	1747928	.	C	T	9956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=-1.296;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.512;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,258:550:99:9985,0,12465
chr3	1748284	.	A	ATGC	8994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.360;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.264;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,232:507:99:9032,0,10754
chr3	1748357	.	C	G	6468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=1.401;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.099;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.268;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,168:380:99:6497,0,8385
chr3	1748372	.	G	A	6912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=1.433;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.235;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,173:403:99:6941,0,9338
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chr3	1748379	.	GTT	G	6567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.254;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.702;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,170:387:99:6605,0,8951
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chr3	1753452	.	GCAGGGA	G	6525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=1.845;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.209;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,173:392:99:6563,0,8536
chr3	1754205	.	G	T	6933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.327;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.218;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.119;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,221:445:99:6962,0,6955
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chr3	1756034	.	G	T	11535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=1.165;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.020;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.001;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,295:591:99:11564,0,15191
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chr3	1756046	.	T	C	11187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.116;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.139;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,287:589:99:11216,0,15146
chr3	1756158	.	A	C	6148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-0.733;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.110;QD=13.94;ReadPosRankSum=3.984;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,211:441:99:6177,0,6823
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chr3	1756368	.	G	A	8487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.437;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.607;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,271:559:99:8516,0,8922
chr3	1756512	.	AAT	A	8255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.574;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.263;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,209:439:99:8293,0,9114
chr3	1756530	.	C	T	9921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.498;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.680;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,252:508:99:9950,0,10401
chr3	1756545	.	T	C	10222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.639;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.567;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.744;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,258:539:99:10251,0,11166
chr3	1756569	.	T	C	9304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=-0.193;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.669;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,249:504:99:9333,0,9515
chr3	1756598	.	G	A	8547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=-1.135;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.295;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,285:562:99:8576,0,8766
chr3	1756782	.	G	C	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.410;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.690;QD=18.64;ReadPosRankSum=4.125;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,233:475:99:8884,0,9177
chr3	1756793	.	C	T	8993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.314;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.942;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.305;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,239:482:99:9022,0,9324
chr3	1757160	.	G	T	8840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.268;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.306;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,227:428:99:8869,0,7843
chr3	1757165	.	G	A	9054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.282;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.368;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,222:428:99:9083,0,8106
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chr3	1757185	.	C	T	6964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.876;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.175;QD=16.01;ReadPosRankSum=1.737;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,215:435:99:6993,0,7038
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chr3	1760375	.	T	C	7096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.409;ClippingRankSum=0.711;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.101;QD=15.81;ReadPosRankSum=-2.027;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,179:449:99:7125,0,10691
chr3	1760411	.	T	A	9897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.735;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.418;QD=21.33;ReadPosRankSum=3.827;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,251:464:99:9926,0,8088
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chr3	1760455	.	T	C	10571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.165;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.978;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,258:496:99:10600,0,9475
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chr3	1760477	.	T	C	9770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.310;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.208;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,242:491:99:9799,0,9945
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chr3	1760479	.	T	C	9572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.362;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.446;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,242:488:99:9601,0,9793
chr3	1760554	.	A	G	10511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.577;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.356;QD=21.41;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,265:491:99:10540,0,8651
chr3	1760568	.	G	C	10576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-1.859;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.432;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,262:496:99:10605,0,9169
chr3	1760580	.	T	C	9848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.449;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.017;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,262:503:99:9877,0,9135
chr3	1760616	.	C	T	9378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=1.352;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.796;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,248:500:99:9407,0,9402
chr3	1760635	.	T	C	9723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=1.180;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.519;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,257:505:99:9752,0,9262
chr3	1763355	.	A	C	9946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=-1.281;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=13.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.229;QD=18.95;ReadPosRankSum=2.495;SOR=1.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,257:525:99:9975,0,10327
chr3	1763365	.	G	A	10513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.249;ClippingRankSum=0.186;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=8.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.049;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.062;SOR=1.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,274:537:99:10542,0,10032
chr3	1764391	.	C	T	3103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=1.983;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=33.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.007;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.812;SOR=1.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,120:355:99:3132,0,7921
chr3	1764459	.	G	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-0.287;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=14.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=1.148;QD=0.04;ReadPosRankSum=-5.618;SOR=1.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,25:290:39:39,0,8708
chr3	1764643	.	A	G	8111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=1.600;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.623;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,263:528:99:8140,0,8218
chr3	1764840	.	CACAACAACA	C	6166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-0.339;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-1.744;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,202:494:99:6204,0,11979
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chr3	1771423	.	T	G	8796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=-0.503;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.862;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.154;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,219:477:99:8825,0,10264
chr3	1771424	.	G	A	8709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.858;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.558;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.965;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,220:478:99:8738,0,10309
chr3	1771442	.	A	G	8467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.584;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.309;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,226:469:99:8496,0,9363
chr3	1771510	.	TTC	T	4053.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.521;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.685;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,189:430:99:4091,0,9103
chr3	1771542	.	CGG	C	8097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.335;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.089;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,214:455:99:8135,0,9453
chr3	1771545	.	G	C	8106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-1.230;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.059;QD=17.94;ReadPosRankSum=2.124;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,214:452:99:8135,0,9453
chr3	1771660	.	GTGCA	G	9268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.647;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.399;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,242:512:99:9306,0,10649
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chr3	1777806	.	T	C	10174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-3.291;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.473;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,270:542:99:10203,0,10275
chr3	1777821	.	ATGTCTCCTCTATACACTTTGTT	A	10013.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=-1.142;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.153;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,268:617:99:10051,0,13763
chr3	1777930	.	A	ATTTTT	6871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.863;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=3.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.138;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.531;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,188:375:99:6909,0,7032
chr3	1778126	.	C	T	8953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.861;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.218;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,236:474:99:8982,0,12484
chr3	1778144	.	T	C	9361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.705;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.734;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,248:499:99:9390,0,12949
chr3	1778804	.	C	T	7001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=-0.879;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,258:540:99:7030,0,8968
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chr3	1786356	.	A	G	9344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.194;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.551;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,247:578:99:9373,0,13155
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chr3	1787276	.	GA	G	6275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.284;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.558;QD=16.74;ReadPosRankSum=-4.921;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,178:375:99:6313,0,7661
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chr3	1788238	.	A	G	8302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.704;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.647;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,219:439:99:8331,0,9898
chr3	1788252	.	G	A	8545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.603;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.299;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,222:450:99:8574,0,10215
chr3	1788408	.	A	G	8665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.277;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.938;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,224:424:99:8694,0,7717
chr3	1788417	.	T	C	8810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.459;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.283;QD=21.54;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,214:409:99:8839,0,7843
chr3	1788434	.	C	T	8923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.242;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.132;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,218:423:99:8952,0,8158
chr3	1788451	.	G	C	7629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-1.438;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.789;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,199:393:99:7658,0,7548
chr3	1789759	.	A	G	9437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.654;ClippingRankSum=-0.251;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.304;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,244:539:99:9466,0,47620
chr3	1789763	.	G	C	9492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.768;ClippingRankSum=-1.845;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.671;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.876;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,245:547:99:9521,0,48383
chr3	1789771	.	A	T	9360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-0.403;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.376;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,241:539:99:9389,0,48649
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chr3	1789775	.	G	T	9224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.508;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.847;QD=17.27;ReadPosRankSum=2.250;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,240:534:99:9253,0,48213
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chr3	1793382	.	T	TG	6772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.168;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.249;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,216:428:99:6810,0,6518
chr3	1793503	.	AT	A	4050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=2.118;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.124;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,123:303:99:4088,0,6785
chr3	1793513	.	T	C	1581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-1.558;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.081;QD=5.40;ReadPosRankSum=-4.780;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,98:293:99:1619,0,7213
chr3	1793526	.	G	A	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=-0.708;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=19.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.347;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=1.290	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,95:269:99:2790,0,6625
chr3	1793600	.	GT	G	4373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.687;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.138;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,187:394:99:4411,0,4781
chr3	1794138	.	GCAGCAACAGCAGCAATCGCAACAACAACAA	G	6912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;QD=32.40;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:6950,657,0
chr3	1805088	.	T	C	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-0.634;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQRankSum=0.915;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,122:123:99:3583,358,0
chr3	1806410	.	G	A	5903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.30;QD=29.97;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:5932,591,0
chr3	1806552	.	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;QD=29.97;SOR=8.662	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:2276,224,0
chr3	1806569	.	T	C	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;QD=27.89;SOR=8.380	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2925,196,0
chr3	1806572	.	T	C	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;QD=27.93;SOR=8.410	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:3001,202,0
chr3	1806575	.	C	T	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;QD=30.15;SOR=8.410	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:3031,205,0
chr3	1807338	.	G	A	10556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;QD=34.97;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:10585,710,0
chr3	1807340	.	A	T	10669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.06;QD=33.09;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,233:233:99:10698,722,0
chr3	1807354	.	T	C	9258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.21;QD=35.40;SOR=1.274	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:9287,644,0
chr3	1808567	.	C	CTT	408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.085;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.254;QD=31.44;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:37:446,0,37
chr3	1812501	.	A	G	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.83;SOR=7.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1881,129,0
chr3	1812507	.	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.57;SOR=7.378	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1755,117,0
chr3	1813058	.	A	G	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=24.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
chr3	1813073	.	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=18.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
chr3	1813413	.	G	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.403;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;MQRankSum=-1.238;QD=28.38;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,41:42:94:1220,94,0
chr3	1813430	.	T	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.438;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.91;MQRankSum=0.425;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.749;SOR=5.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,59:61:99:1804,120,0
chr3	1814281	.	C	G	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=22.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
chr3	1814949	.	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.07;SOR=6.043	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1302,123,0
chr3	1815338	.	G	A	3518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.202;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=381.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.05;MQRankSum=-0.639;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.615;SOR=9.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,92:202:99:3547,0,4212
chr3	1815342	.	T	TA	3606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=-0.695;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=380.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.96;MQRankSum=-0.774;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.339;SOR=9.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,92:199:99:3644,0,4239
chr3	1815343	.	T	G	3586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.512;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=402.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQRankSum=0.753;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.185;SOR=9.108	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,94:199:99:3615,0,4242
chr3	1815367	.	G	A	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.035;ClippingRankSum=-1.900;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=321.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.07;MQRankSum=-0.143;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.230;SOR=8.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,75:211:99:2619,0,5546
chr3	1815374	.	GA	G	2508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.956;ClippingRankSum=-0.635;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=307.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.34;MQRankSum=-1.704;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.498;SOR=8.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,71:217:99:2546,0,5758
chr3	1815391	.	T	C	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;ClippingRankSum=-0.146;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=227.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.85;MQRankSum=-1.022;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.922;SOR=8.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,64:246:99:2049,0,7613
chr3	1815400	.	T	C	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.351;ClippingRankSum=-0.106;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=202.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.08;MQRankSum=-1.883;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.699;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,60:266:99:1883,0,8087
chr3	1821718	.	TACCGATGCACTGGTGTCTGCA	T	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.43;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
chr3	1821742	.	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.44;SOR=6.273	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:963,66,0
chr3	1821773	.	C	T	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.86;QD=30.24;SOR=7.276	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1147,111,0
chr3	1822748	.	A	AT	2806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;QD=28.90;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2844,192,0
chr3	1822763	.	T	G	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;QD=30.27;SOR=8.789	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3628,244,0
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chr3	1822820	.	T	C	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.09;QD=29.11;SOR=5.622	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:3909,279,0
chr3	1822833	.	T	C	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.37;QD=25.57;SOR=2.641	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:4982,334,0
chr3	1822842	.	T	C	6042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.92;QD=29.90;SOR=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:6071,409,0
chr3	1822843	.	G	A	5997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.91;QD=34.12;SOR=1.592	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,132:132:99:6026,406,0
chr3	1822959	.	TTGCCTGACA	T	5838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.22;QD=26.94;SOR=1.170	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,130:130:99:5876,398,0
chr3	1822989	.	A	G	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.39;QD=26.78;SOR=1.791	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,108:108:99:4747,328,0
chr3	1823834	.	CG	C	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-0.551;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=87.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.91;MQRankSum=2.064;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.905;SOR=2.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,13:51:99:239,0,949
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chr3	1823908	.	T	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.088;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=110.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.77;MQRankSum=0.522;QD=0.45;ReadPosRankSum=-2.351;SOR=4.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,8:94:71:71,0,3642
chr3	1823910	.	A	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-1.186;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=111.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.78;MQRankSum=0.696;QD=0.45;ReadPosRankSum=-2.920;SOR=4.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,8:96:71:71,0,3642
chr3	1824733	.	T	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.762;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.762;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:36:195,0,36
chr3	1825704	.	A	T	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.358;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=0.083;QD=25.79;ReadPosRankSum=1.129;SOR=5.376	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,43:45:75:1189,75,0
chr3	1829075	.	C	T	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;QD=27.53;SOR=6.518	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:81:1215,81,0
chr3	1829091	.	T	TATG	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.33;QD=31.13;SOR=7.614	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:2358,160,0
chr3	1829098	.	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.10;QD=22.41;SOR=8.255	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2659,183,0
chr3	1829459	.	A	T	7012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=1.937;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=5.498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQRankSum=2.131;QD=33.88;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,204:207:99:7041,526,0
chr3	1831145	.	T	A	2703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=1.287;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=151.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.91;MQRankSum=0.493;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.699;SOR=8.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,69:114:99:2732,0,1575
chr3	1831156	.	T	A	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.577;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=139.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.91;MQRankSum=0.130;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.329;SOR=8.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,74:113:99:2910,0,1501
chr3	1831587	.	A	T	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.029;ClippingRankSum=2.452;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=288.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.00;MQRankSum=-5.848;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.102;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,60:196:99:2146,0,5375
chr3	1831595	.	T	C	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;ClippingRankSum=0.383;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=331.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.64;MQRankSum=-3.970;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.499;SOR=8.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,63:188:99:2431,0,5104
chr3	1831600	.	GCAGT	G	2630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-0.962;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=380.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.73;MQRankSum=-6.022;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.345;SOR=8.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,67:174:99:2668,0,4734
chr3	1831628	.	GGA	G	4782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.292;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=377.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.70;MQRankSum=-0.886;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=4.319	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,114:181:99:4820,0,2684
chr3	1831631	.	A	AGG	4761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;ClippingRankSum=1.470;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=364.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.59;MQRankSum=-0.765;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=4.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,113:177:99:4799,0,2393
chr3	1831660	.	T	A	4667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.455;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=147.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.12;MQRankSum=1.390;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.449;SOR=2.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,177:213:99:4696,0,811
chr3	1831663	.	CT	C	4318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.895;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=93.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.46;MQRankSum=-0.869;QD=21.92;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=1.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,171:197:99:4356,0,147
chr3	1831949	.	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-1.147;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=42.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.67;MQRankSum=-0.229;QD=28.78;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=7.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,46:49:99:1939,0,231
chr3	1831951	.	G	C	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.940;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=42.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQRankSum=-0.123;QD=35.15;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=7.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,47:50:99:1939,0,231
chr3	1831972	.	A	G	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.293;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=45.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQRankSum=1.432;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=8.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,56:59:99:2425,0,195
chr3	1831975	.	A	G	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.577;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=45.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQRankSum=0.407;QD=30.58;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=8.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,57:60:99:2394,0,198
chr3	1832395	.	C	G	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=-2.423;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=138.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.27;MQRankSum=-10.736;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=4.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,90:274:99:2002,0,5436
chr3	1833284	.	G	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;QD=29.54;SOR=5.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:560,54,0
chr3	1833296	.	AC	A	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;QD=28.40;SOR=5.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:486,36,0
chr3	1833314	.	G	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;QD=27.47;SOR=4.407	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:248,24,0
chr3	1834836	.	A	G	4511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.833;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=204.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.66;MQRankSum=0.688;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=2.007	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,121:185:99:4540,0,2253
chr3	1834847	.	T	A	4140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=1.640;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=221.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.13;MQRankSum=0.911;QD=25.25;ReadPosRankSum=-2.518;SOR=2.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,102:164:99:4169,0,2494
chr3	1834849	.	G	A	4038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.055;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=192.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.85;MQRankSum=0.184;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.667;SOR=2.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,98:165:99:4067,0,2639
chr3	1834853	.	T	A	3497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.241;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=182.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.36;MQRankSum=2.084;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=2.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,88:158:99:3526,0,2623
chr3	1834885	.	T	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=-0.956;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=171.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.18;MQRankSum=-2.067;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.500;SOR=7.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,46:171:99:1394,0,4792
chr3	1834909	.	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=-0.486;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=137.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.54;MQRankSum=-4.230;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=7.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,40:197:99:1186,0,6753
chr3	1834912	.	T	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=-0.852;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=134.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQRankSum=-1.237;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.737;SOR=7.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,40:206:99:1168,0,6944
chr3	1834918	.	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.114;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=116.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.79;MQRankSum=-4.150;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=7.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,37:211:99:1056,0,7034
chr3	1836070	.	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.397;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=27.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQRankSum=-1.496;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=4.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,22:118:99:344,0,2842
chr3	1838288	.	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.27;SOR=5.670	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
chr3	1838291	.	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=24.88;SOR=5.670	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
chr3	1838296	.	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.43;SOR=5.784	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:60:900,60,0
chr3	1838299	.	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.06;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:63:945,63,0
chr3	1838304	.	A	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=27.98;SOR=6.273	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:75:1125,75,0
chr3	1838307	.	TATATA	T	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=27.55;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1170,78,0
chr3	1838313	.	CATA	C	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=33.16;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1170,78,0
chr3	1838318	.	A	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=32.53;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1170,78,0
chr3	1841707	.	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=-0.646;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=18.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQRankSum=-3.277;QD=2.58;ReadPosRankSum=2.761;SOR=3.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,22:167:99:459,0,5214
chr3	1841732	.	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=1.265;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.05;MQRankSum=-1.265;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.732;SOR=0.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,21:114:99:615,0,3721
chr3	1841760	.	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.031;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.13;MQRankSum=0.302;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,14:82:99:317,0,2566
chr3	1841772	.	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.344;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.16;MQRankSum=-0.977;QD=2.44;ReadPosRankSum=-1.683;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,9:68:99:194,0,2381
chr3	1841909	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-0.392;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.37;MQRankSum=-1.986;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.961;SOR=0.006	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,4:70:54:54,0,4559
chr3	1841911	.	C	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.028;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.13;MQRankSum=-3.082;QD=0.35;ReadPosRankSum=-3.288;SOR=0.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,7:73:54:54,0,4559
chr3	1842193	.	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=1.915;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=21.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.98;MQRankSum=2.153;QD=3.06;ReadPosRankSum=2.643;SOR=3.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,19:136:99:445,0,6484
chr3	1842196	.	C	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.351;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=18.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.13;MQRankSum=0.657;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.722;SOR=3.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,19:134:99:454,0,6415
chr3	1842616	.	T	C	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=-0.384;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.86;MQRankSum=-1.084;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.845;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,65:152:99:2541,0,8152
chr3	1842638	.	G	C	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-0.197;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.87;MQRankSum=0.301;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,79:169:99:3079,0,8905
chr3	1842657	.	C	T	2849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.982;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=90.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.29;MQRankSum=-1.830;QD=13.25;ReadPosRankSum=3.556;SOR=7.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,78:215:99:2878,0,11806
chr3	1842669	.	C	T	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-0.701;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=20.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQRankSum=-2.338;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=1.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,98:257:99:3258,0,11429
chr3	1843027	.	AATATAATGAGAACAG	A	2160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.69;QD=27.23;SOR=5.507	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2198,150,0
chr3	1843058	.	ATAGGTAACTCAGAGTGTTGAATAAGGTGAAC	A	2932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.75;QD=30.99;SOR=6.123	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2970,199,0
chr3	1843107	.	G	A	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.86;QD=34.16;SOR=8.739	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:3543,238,0
chr3	1843121	.	T	A	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.22;QD=34.43;SOR=5.235	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:3705,260,0
chr3	1843405	.	A	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;QD=29.54;SOR=5.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:560,54,0
chr3	1845442	.	G	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;QD=27.37;SOR=6.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:87:1305,87,0
chr3	1845466	.	CAT	C	1794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.72;QD=27.50;SOR=7.476	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1832,123,0
chr3	1845469	.	GTTGTTCA	G	1795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.72;QD=24.69;SOR=7.476	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1833,124,0
chr3	1845583	.	C	T	6759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;QD=30.18;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,150:150:99:6788,466,0
chr3	1845592	.	C	T	6967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.61;QD=30.46;SOR=1.165	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:6996,487,0
chr3	1845919	.	T	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.866;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=15.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQRankSum=-0.217;QD=32.14;ReadPosRankSum=1.516;SOR=6.932	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,31:32:72:1415,72,0
chr3	1845923	.	G	A	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;QD=30.59;SOR=7.168	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1540,108,0
chr3	1846315	.	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.133;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.72;MQRankSum=0.854;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.164;SOR=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,42:133:99:894,0,2467
chr3	1846451	.	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.20;MQRankSum=-1.221;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.322;SOR=2.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:71:71,0,155
chr3	1848539	.	TACA	T	2270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.40;SOR=7.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2308,157,0
chr3	1851078	.	GTT	G	1154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=32.90;SOR=6.869	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1192,90,0
chr3	1851436	.	A	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.49;SOR=6.273	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:699,66,0
chr3	1853410	.	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.90;QD=27.67;SOR=7.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2385,160,0
chr3	1853417	.	GCAT	G	2623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.91;QD=31.37;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2661,181,0
chr3	1853493	.	A	C	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.25;QD=31.24;SOR=5.283	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,163:163:99:5121,489,0
chr3	1854429	.	A	G	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.104;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=287.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.19;MQRankSum=0.206;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.674;SOR=3.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,81:143:99:2800,0,2234
chr3	1854451	.	G	T	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.027;ClippingRankSum=0.482;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=178.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.05;MQRankSum=0.320;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.037;SOR=5.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,53:138:99:1988,0,3510
chr3	1854471	.	G	C	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.444;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=119.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.11;MQRankSum=-0.782;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=5.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,35:169:99:1109,0,4719
chr3	1854586	.	T	C	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.52;QD=33.43;SOR=1.276	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:6765,473,0
chr3	1854592	.	T	C	6406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;QD=31.84;SOR=1.270	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:6435,442,0
chr3	1854757	.	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.94;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
chr3	1854760	.	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=33.79;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
chr3	1856813	.	T	C	533.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.959;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.77;MQRankSum=1.598;QD=23.18;ReadPosRankSum=1.780;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,20:23:4:560,0,4
chr3	1858037	.	A	C	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=-0.580;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-1.356;QD=25.15;ReadPosRankSum=-1.038;SOR=1.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,66:105:99:2669,0,1751
chr3	1858038	.	G	A	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.102;ClippingRankSum=0.620;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=1.157;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.149;SOR=1.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,66:105:99:2711,0,1748
chr3	1858044	.	C	T	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.048;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=1.793;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.070;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,63:94:99:2662,0,1583
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chr3	1863688	.	G	C	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;QD=31.84;SOR=8.789	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3573,241,0
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chr3	1863692	.	T	A	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;QD=28.68;SOR=8.714	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:3510,235,0
chr3	1863702	.	G	T	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;QD=30.73;SOR=8.439	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:3084,211,0
chr3	1863782	.	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.34;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:635,60,0
chr3	1863797	.	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.85;SOR=5.549	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:476,45,0
chr3	1865005	.	CT	C	5247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.069;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.86;MQRankSum=1.345;QD=27.91;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,187:188:99:5285,536,0
chr3	1865466	.	G	A	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.32;QD=28.31;SOR=2.476	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:3803,262,0
chr3	1865468	.	T	C	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;QD=33.61;SOR=2.531	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:3803,262,0
chr3	1866767	.	C	A	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.80;QD=33.51;SOR=2.391	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:3785,256,0
chr3	1866774	.	T	C	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.19;QD=28.03;SOR=1.954	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:4330,301,0
chr3	1866780	.	G	A	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.69;QD=27.37;SOR=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:4508,325,0
chr3	1866817	.	ATT	A	7337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.01;QD=31.68;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:7375,506,0
chr3	1866825	.	C	T	7632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.01;QD=23.28;SOR=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:7661,535,0
chr3	1872636	.	A	G	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.71;QD=30.92;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:2440,234,0
chr3	1872655	.	A	G	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;QD=29.68;SOR=1.458	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,136:136:99:4065,408,0
chr3	1872671	.	A	G	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.68;QD=30.10;SOR=1.193	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,164:164:99:4965,492,0
chr3	1872831	.	G	A	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;QD=30.95;SOR=8.554	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:2226,213,0
chr3	1872958	.	A	G	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;QD=27.47;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:248,24,0
chr3	1873132	.	G	A	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.38;QD=24.63;SOR=2.114	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:7047,490,0
chr3	1873142	.	C	T	7500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.26;QD=26.47;SOR=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,177:177:99:7529,536,0
chr3	1875875	.	G	A	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.23;QD=31.72;SOR=3.365	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:2756,258,0
chr3	1875902	.	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.70;QD=30.03;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1620,158,0
chr3	1875918	.	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.56;QD=31.35;SOR=2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2182,147,0
chr3	1875919	.	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;QD=27.45;SOR=2.208	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2182,147,0
chr3	1875937	.	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.46;QD=30.39;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1244,120,0
chr3	1876111	.	T	A	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.80;QD=35.87;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:4583,316,0
chr3	1876116	.	TGG	T	4597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;QD=30.48;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,99:99:99:4635,316,0
chr3	1876119	.	G	GTAAA	4438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.61;QD=24.33;SOR=1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:4476,301,0
chr3	1876131	.	A	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.05;QD=31.95;SOR=1.819	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3229,217,0
chr3	1876137	.	A	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;QD=31.42;SOR=2.998	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2686,186,0
chr3	1921245	.	AT	A	9093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-1.037;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.577;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,274:542:99:9131,0,10640
chr3	1921247	.	AG	A	4942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.127;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.175;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.329;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,230:513:99:4980,0,10871
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chr3	1924286	.	A	C	7858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-0.581;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.062;QD=14.58;ReadPosRankSum=2.022;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,254:539:99:7887,0,9071
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chr3	1933499	.	AT	A	6207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.004;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.202;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,268:575:99:6245,0,7193
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chr3	1933530	.	C	T,CTTT	15157.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.978;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.018;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:8,231,235:474:99:15195,8954,9057,6030,0,11308
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chr3	1935000	.	A	AT	8035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.091;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.855;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,208:405:99:8073,0,7410
chr3	1935004	.	G	T	8147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.243;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.443;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,213:415:99:8176,0,7448
chr3	1935297	.	C	CT	7014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-1.757;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.145;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.840;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,263:514:99:7052,0,6680
chr3	1935674	.	A	C	22480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-1.021;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=-1.281;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,624:631:99:22509,1667,0
chr3	1935990	.	C	A	9067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.086;ClippingRankSum=0.720;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.006;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,245:510:99:9096,0,10000
chr3	1936009	.	C	T	9648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.111;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.136;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,258:531:99:9677,0,10205
chr3	1936152	.	T	C	12184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-1.451;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.169;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,324:605:99:12213,0,10644
chr3	1936173	.	T	C	11882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=-0.393;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.052;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,313:596:99:11911,0,10491
chr3	1936206	.	C	T	12949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.567;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.800;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,335:637:99:12978,0,11489
chr3	1936212	.	T	C	12835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.175;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.854;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,329:618:99:12864,0,11287
chr3	1937202	.	C	T	8619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=-0.364;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.077;QD=15.07;ReadPosRankSum=-2.141;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,283:572:99:8648,0,9273
chr3	1937241	.	T	C	8707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.864;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.714;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,282:588:99:8736,0,9969
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chr3	1937307	.	T	C	11856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-1.697;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.160;QD=17.83;ReadPosRankSum=2.782;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,307:665:99:11885,0,14068
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chr3	1947932	.	A	C	10723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.947;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.098;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,279:566:99:10752,0,11245
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chr3	1950526	.	C	T	10625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.580;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.804;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,324:594:99:10654,0,8267
chr3	1950641	.	T	C	10046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.043;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.948;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,262:544:99:10075,0,11165
chr3	1950643	.	C	T	10145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-1.315;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.769;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,259:541:99:10174,0,11365
chr3	1950662	.	T	C	9131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.997;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.311;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,241:493:99:9160,0,9661
chr3	1950689	.	TA	T	8309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=1.739;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.068;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,211:418:99:8347,0,8218
chr3	1950697	.	A	C	8872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.039;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.130;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,229:454:99:8901,0,9223
chr3	1950717	.	C	T	9585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.406;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.660;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,238:467:99:9614,0,9169
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chr3	1958423	.	T	C	7920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-1.447;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.627;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,219:444:99:7949,0,9989
chr3	1958549	.	C	CA	4776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-0.673;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.104;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,212:417:99:4814,0,8114
chr3	1958558	.	G	A	9398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=-1.330;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.372;QD=19.95;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,251:471:99:9427,0,6666
chr3	1958723	.	A	T	8458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=-0.276;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=5.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.375;QD=13.41;ReadPosRankSum=4.723;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,292:631:99:8496,0,12552
chr3	1959179	.	A	G	11888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.434;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.305;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,323:698:99:11917,0,14283
chr3	1959197	.	C	T	12226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.007;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.293;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,322:685:99:12255,0,13548
chr3	1960217	.	G	A	8806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.918;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.097;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,282:553:99:8835,0,7990
chr3	1960247	.	A	G	9167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=-0.671;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.555;QD=17.01;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,248:539:99:9196,0,11141
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chr3	1969204	.	T	C	9746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.277;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.549;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,257:521:99:9775,0,9842
chr3	1969311	.	ATT	A	9762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.601;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.233;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,257:504:99:9800,0,9623
chr3	1969328	.	G	A	10192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=1.412;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.848;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,268:534:99:10221,0,9968
chr3	1969355	.	T	C	10358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.380;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.006;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,266:533:99:10387,0,10377
chr3	1969357	.	T	C	10431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=-1.332;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.367;QD=19.87;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,263:525:99:10460,0,10473
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chr3	1975194	.	T	A	8397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=-0.312;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.807;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,286:552:99:8426,0,8128
chr3	1975774	.	G	A	6563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=-0.629;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.364;QD=17.09;ReadPosRankSum=2.819;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,196:384:99:6592,0,6155
chr3	1975803	.	C	T	6420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.168;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.771;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,199:387:99:6449,0,6196
chr3	1975844	.	A	C	5872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.063;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=1.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.558;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,186:385:99:5901,0,6212
chr3	1976139	.	ATGCAT	A	7916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.848;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.420;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,209:410:99:7954,0,8998
chr3	1976258	.	G	A	11459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=1.876;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.501;QD=18.69;ReadPosRankSum=-2.324;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,304:613:99:11488,0,12194
chr3	1976264	.	C	T	11369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.918;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.465;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,281:584:99:11398,0,12129
chr3	1976285	.	A	G	10203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.212;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.461;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.148;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,279:570:99:10232,0,10889
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chr3	1976322	.	A	G	10982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=1.015;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.139;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,290:592:99:11011,0,11554
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chr3	1981275	.	C	G	5471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.496;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=4.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.697;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,169:323:99:5500,0,4832
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chr3	1981371	.	T	A	7135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.737;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=12.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-0.440;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.353	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:172,182:354:99:7164,0,6897
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chr3	1984379	.	G	T	9923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.259;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.047;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.600;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,258:500:99:9952,0,9308
chr3	1984966	.	G	A	11022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.207;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=8.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.274;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.776;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,289:556:99:11051,0,13904
chr3	1984984	.	C	T	11116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.854;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.172;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,297:569:99:11145,0,14039
chr3	1985517	.	T	C	4126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.536;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.221;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.955;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,201:458:99:4155,0,8118
chr3	1985702	.	A	G	4928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.476;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.345;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,157:297:99:4957,0,4291
chr3	1985732	.	TTATATATATA	T	5332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.384;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.863;QD=23.49;ReadPosRankSum=-1.737;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,137:227:99:5370,0,3158
chr3	1985761	.	C	T	6392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.179;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.310;QD=23.08;ReadPosRankSum=2.265;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,167:277:99:6421,0,3120
chr3	1986013	.	C	T	7246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.733;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.779;QD=14.52;ReadPosRankSum=2.244;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,231:499:99:7275,0,8542
chr3	1986209	.	A	T	9301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.703;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.599;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,253:527:99:9330,0,11032
chr3	1986223	.	T	C	9284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.054;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.836;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,242:494:99:9313,0,10540
chr3	1986652	.	T	C	8883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.380;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=4.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.615;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,233:507:99:8912,0,11212
chr3	1986653	.	T	C	8883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=1.024;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=4.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.309;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,232:504:99:8912,0,11212
chr3	1989020	.	AT	A	5127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=1.058;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.706;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,217:440:99:5165,0,5065
chr3	1990027	.	C	A	11592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-2.324;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.635;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,296:563:99:11621,0,10486
chr3	1990033	.	A	G	11827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.761;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.465;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.329;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,302:583:99:11856,0,10682
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chr3	1992786	.	G	C	9473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.287;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.132;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.599;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,247:499:99:9502,0,15959
chr3	1994142	.	G	A	6573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.393;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-1.590;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.552;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,227:521:99:6611,0,9210
chr3	1994171	.	A	G	9432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-1.654;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=2.232;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,298:600:99:9461,0,9262
chr3	1994213	.	A	T	8318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=2.604;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.409;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,269:595:99:8347,0,10334
chr3	1994281	.	AC	A	9321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=-0.200;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.647;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.464;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,329:611:99:9359,0,8867
chr3	1997337	.	T	C	10085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-1.207;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.389;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.363;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,264:548:99:10114,0,13267
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chr3	2007472	.	G	C	7761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.353;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.136;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,238:456:99:7790,0,6924
chr3	2007566	.	A	C	9629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.131;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.107;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,248:463:99:9658,0,8412
chr3	2007573	.	TA	T	10014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.415;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.891;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,253:482:99:10052,0,9128
chr3	2007585	.	C	CTT	10035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.688;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.199;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,245:479:99:10073,0,9435
chr3	2007591	.	G	A	9353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.884;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.175;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,244:482:99:9382,0,9508
chr3	2009367	.	G	T	9631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.811;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.363;QD=19.23;ReadPosRankSum=-3.127;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,248:501:99:9660,0,10100
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chr3	2017600	.	A	G	8889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.936;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=0.560;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,232:490:99:8918,0,10459
chr3	2017605	.	T	G	9016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-1.224;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=0.071;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.625;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,237:490:99:9045,0,10241
chr3	2017622	.	TGTTATCAGATGCGAGTTGTGCGCTCGTAGTAATTATTAAAGGTTAATAATATAATATA	T	12309.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;QD=35.23;SOR=1.138	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,278:278:99:12347,926,0
chr3	2018354	.	G	T	5542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.465;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,188:366:99:5571,0,6880
chr3	2018355	.	A	T	7282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.433;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.414;QD=19.90;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,189:366:99:7320,0,6827
chr3	2018449	.	G	C	6083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.103;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.722;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,208:423:99:6112,0,6385
chr3	2019780	.	C	T	9543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=1.027;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.215;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,306:593:99:9572,0,9118
chr3	2020181	.	GT	G	6436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.287;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.716;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,260:515:99:6474,0,6400
chr3	2020663	.	TTTC	T	8805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-0.450;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.174;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,238:496:99:8843,0,9738
chr3	2020711	.	C	A	9601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.182;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-1.578;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,319:624:99:9630,0,9509
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chr3	2021865	.	C	T	8170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.001;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=7.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.932;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.997;SOR=1.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,276:570:99:8199,0,14465
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chr3	2038302	.	C	CATATAA	5581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.253;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=-3.179;SOR=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,144:318:99:5619,0,6639
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chr3	2039375	.	T	C	8349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-0.940;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.352;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.467;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,279:529:99:8378,0,7297
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chr3	2042266	.	AT	A	4236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=1.029;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.435;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,200:413:99:4274,0,4706
chr3	2042439	.	C	T	6643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.636;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.736;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,217:481:99:6672,0,8204
chr3	2042697	.	A	G	8998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=1.382;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.646;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,243:502:99:9027,0,15992
chr3	2042713	.	A	G	9098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=2.242;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.774;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,242:499:99:9127,0,16078
chr3	2042980	.	T	A	8078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.864;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.637;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,271:544:99:8107,0,7914
chr3	2044297	.	CT	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-0.225;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=0.818;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.110;SOR=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,20:61:99:106,0,516
chr3	2045589	.	C	CTTT	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.060;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=8.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-0.716;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.908;SOR=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,18:47:99:747,0,448
chr3	2046656	.	CGAGGAT	C	7475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=-0.085;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.450;QD=17.63;ReadPosRankSum=2.286;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,196:424:99:7513,0,8952
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chr3	2048278	.	C	G	8937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.640;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.970;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,234:485:99:8966,0,13557
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chr3	2058492	.	GA	G	5601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=1.199;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.963;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,225:443:99:5639,0,5435
chr3	2059910	.	T	C	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.503;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.115;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,254:508:99:8304,0,8048
chr3	2066545	.	T	A	10009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.251;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.956;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.813;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,257:544:99:10038,0,11244
chr3	2066554	.	G	C	10659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.641;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.231;QD=19.60;ReadPosRankSum=-2.488;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,261:544:99:10688,0,11434
chr3	2066574	.	G	A	9825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.777;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.558;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,262:553:99:9854,0,11103
chr3	2066615	.	T	A	11459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.378;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.251;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,294:591:99:11488,0,11786
chr3	2066621	.	A	C	11694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.488;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.258;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,292:592:99:11723,0,12165
chr3	2066627	.	A	G	11626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.166;ClippingRankSum=-0.602;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.362;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,286:593:99:11655,0,12240
chr3	2066640	.	A	G	12417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=2.182;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.290;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,307:623:99:12446,0,12851
chr3	2066645	.	C	T	12232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.377;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.663;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,302:621:99:12261,0,12983
chr3	2066655	.	G	A	11642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.024;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.974;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,302:610:99:11671,0,11950
chr3	2066681	.	C	T	11664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.958;ClippingRankSum=0.971;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.414;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,300:607:99:11693,0,11804
chr3	2066686	.	G	C	11703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=1.498;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.007;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,299:600:99:11732,0,11818
chr3	2066749	.	CATCT	C	10155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.106;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.027;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,266:558:99:10193,0,11351
chr3	2066784	.	C	T	9708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.009;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.415;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,253:541:99:9737,0,11763
chr3	2066785	.	G	A	9834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-0.562;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=5.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.137;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.996	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,248:539:99:9863,0,11754
chr3	2066801	.	T	A	10603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.228;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.431;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.658;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,259:556:99:10632,0,11927
chr3	2066815	.	G	A	9805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-0.581;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.174;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,243:551:99:9834,0,12569
chr3	2066830	.	G	C	9297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.848;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.382;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,240:535:99:9326,0,11948
chr3	2066831	.	A	C	9222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-1.132;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.184;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,239:536:99:9251,0,11828
chr3	2067049	.	ATACTT	A	8670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.314;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.861;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,230:468:99:8708,0,9150
chr3	2069224	.	A	G	8170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-0.864;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.962;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,263:543:99:8199,0,9302
chr3	2069764	.	T	C	9618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.446;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.052;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,250:519:99:9647,0,10489
chr3	2069776	.	T	C	10680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.152;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.584;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,267:543:99:10709,0,11034
chr3	2069788	.	C	T	10642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.564;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.419;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,276:547:99:10671,0,10337
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chr3	2085855	.	G	A	6058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.031;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=0.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.170;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,160:349:99:6087,0,7421
chr3	2085857	.	T	C	6052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.039;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.317;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,157:346:99:6081,0,7464
chr3	2086359	.	T	C	7153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.307;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.260;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.315;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,234:475:99:7182,0,7402
chr3	2086605	.	A	G	8959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-1.189;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.089;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,241:492:99:8988,0,9660
chr3	2086623	.	T	C	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.308;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.542;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,249:492:99:9414,0,9246
chr3	2086660	.	T	A	9577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.890;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.050;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,255:522:99:9606,0,10022
chr3	2086675	.	T	C	9292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=-0.628;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.265;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,244:504:99:9321,0,9945
chr3	2087661	.	C	A	10093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=1.949;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.900;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,270:572:99:10122,0,11337
chr3	2087678	.	A	C	9490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.155;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.569;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,257:534:99:9519,0,10766
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chr3	2089289	.	AC	A	7543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=-1.251;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.664;QD=18.40;ReadPosRankSum=-2.854;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,198:410:99:7581,0,8262
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chr3	2098897	.	G	A	7979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.308;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.547;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.698;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,249:474:99:8008,0,6919
chr3	2099359	.	T	C	7797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.880;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.148;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,240:457:99:7826,0,6727
chr3	2100412	.	G	GAA	4956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.297;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.115;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,177:381:99:4994,0,6502
chr3	2101615	.	C	T	9267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.139;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.153;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.826;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,251:511:99:9296,0,13484
chr3	2101634	.	T	A	8753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-1.134;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.702;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.633;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,229:452:99:8782,0,12282
chr3	2101797	.	CT	C	4487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.231;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.160;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,186:377:99:4525,0,4615
chr3	2103978	.	C	T	9408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.729;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.767;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,306:586:99:9437,0,8245
chr3	2104246	.	C	T	11352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-2.049;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.495;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,288:560:99:11381,0,10630
chr3	2104251	.	C	T	11518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-1.597;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.517;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,288:562:99:11547,0,11095
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chr3	2110460	.	A	G	8140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-0.666;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.036;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.916;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,207:404:99:8169,0,7575
chr3	2110465	.	G	A	7930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.194;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.086;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,207:403:99:7959,0,7626
chr3	2110537	.	GAAA	G	7403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-0.435;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.152;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,190:398:99:7441,0,7915
chr3	2110556	.	C	T	9000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-1.122;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.075;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,221:456:99:9029,0,9456
chr3	2110560	.	A	T	8825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.405;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.116;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,224:458:99:8854,0,9347
chr3	2110561	.	A	G	8825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=-1.126;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.438;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,222:453:99:8854,0,9319
chr3	2110574	.	T	TA	8344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=-0.599;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.435;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,214:443:99:8382,0,7999
chr3	2110587	.	AGCCCTTTAT	A	6312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.910;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.378;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.915;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,174:436:99:6350,0,10398
chr3	2111013	.	T	C	9733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.086;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.369;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,251:518:99:9762,0,10729
chr3	2111017	.	T	C	9842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.521;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.891;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.560;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,247:525:99:9871,0,11164
chr3	2111022	.	C	T	9770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=1.072;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.658;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,251:530:99:9799,0,11081
chr3	2111433	.	G	A	11287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.132;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.436;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,290:627:99:11316,0,13357
chr3	2111436	.	T	A	11321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.914;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,298:640:99:11350,0,13431
chr3	2111545	.	C	T	8598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=-1.176;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.830;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,264:500:99:8627,0,8924
chr3	2112183	.	G	A	10049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.206;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.344;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,263:527:99:10078,0,16133
chr3	2112192	.	G	A	10208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.217;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,260:520:99:10237,0,16470
chr3	2112197	.	C	G	9953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.125;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.863;QD=19.48;ReadPosRankSum=-2.401;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,254:511:99:9982,0,16006
chr3	2115211	.	T	C	9078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.526;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.969;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,235:487:99:9107,0,14168
chr3	2115222	.	G	A	9663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.115;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.591;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,243:488:99:9692,0,14497
chr3	2115237	.	C	T	9439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.490;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.220;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,245:498:99:9468,0,14136
chr3	2115808	.	T	G	8537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.862;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.959;QD=15.96;ReadPosRankSum=3.559;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,274:535:99:8566,0,7776
chr3	2116094	.	A	T	10806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.102;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,284:588:99:10835,0,11775
chr3	2116096	.	T	C	10806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-1.341;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.662;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,275:576:99:10835,0,11775
chr3	2116321	.	C	T	6418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.839;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.453;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.946;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,209:474:99:6447,0,8480
chr3	2116347	.	T	G	8788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-1.262;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.115;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,281:518:99:8817,0,6848
chr3	2116373	.	C	T	10797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=1.073;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.153;QD=21.77;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,278:496:99:10826,0,8248
chr3	2116374	.	T	C	10771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.552;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.288;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,278:493:99:10800,0,8548
chr3	2116458	.	CACAAATGTT	C	9177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.818;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.319;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.731;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,242:543:99:9215,0,11792
chr3	2118972	.	A	T	7803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=1.897;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.245;QD=13.81;ReadPosRankSum=2.144;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,262:565:99:7832,0,9389
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chr3	2118988	.	A	G	10103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.335;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.699;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,261:550:99:10132,0,11515
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chr3	2130617	.	C	G	11029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.758;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.231;QD=20.54;ReadPosRankSum=3.747;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,281:537:99:11058,0,19328
chr3	2130624	.	G	A	11029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-2.002;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.087;QD=20.85;ReadPosRankSum=3.003;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,269:529:99:11058,0,19550
chr3	2130630	.	G	A	10711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.124;ClippingRankSum=-1.026;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.330;QD=20.29;ReadPosRankSum=2.862;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,274:528:99:10740,0,19032
chr3	2130700	.	G	A	6922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.254;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.533;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,217:412:99:6951,0,5821
chr3	2130803	.	T	C	7209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.196;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.786;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,223:450:99:7238,0,7247
chr3	2130838	.	A	G	7206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=-0.113;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.614;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,242:494:99:7235,0,7813
chr3	2130896	.	T	C	10747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.075;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.717;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.790;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,281:545:99:10776,0,9909
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chr3	2132908	.	T	C	10858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.517;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.338;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.639;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,279:554:99:10887,0,11083
chr3	2135659	.	C	T	8085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-1.192;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.605;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,270:543:99:8114,0,8288
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chr3	2136489	.	A	C	7490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.980;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.212;QD=16.01;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,242:468:99:7519,0,6881
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chr3	2136749	.	C	T	10757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.930;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.417;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.352;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,281:567:99:10786,0,10807
chr3	2136751	.	T	C	10757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-2.626;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.209;QD=18.71;ReadPosRankSum=-1.517;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,288:575:99:10786,0,10807
chr3	2136773	.	CT	C	8038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.072;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.410;QD=17.21;ReadPosRankSum=2.490;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,226:467:99:8076,0,8878
chr3	2136782	.	ATTT	A	8445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=-0.180;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.324;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,240:502:99:8483,0,9267
chr3	2136867	.	A	T	18873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=-0.155;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.046;QD=39.31;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,472:476:99:18902,1344,0
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chr3	2137182	.	A	T	6835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=1.013;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.811;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,235:465:99:6864,0,7095
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chr3	2143670	.	AGTT	A	9100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-1.131;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.253;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,231:467:99:9138,0,9286
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chr3	2143903	.	T	A	6735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=0.321;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=9.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.285;QD=17.27;ReadPosRankSum=4.376;SOR=1.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,183:390:99:6764,0,8232
chr3	2143906	.	T	A	7183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.709;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=11.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.198;QD=18.61;ReadPosRankSum=2.843;SOR=1.125	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,189:386:99:7212,0,8131
chr3	2143910	.	G	A	7333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=-0.506;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.469;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,190:359:99:7362,0,7280
chr3	2144122	.	CAGAGATGTAT	C	11015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.474;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.252;QD=19.60;ReadPosRankSum=2.471;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,287:562:99:11053,0,10610
chr3	2145001	.	G	T	6664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-0.775;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.824;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,213:428:99:6693,0,6770
chr3	2145038	.	T	C	7786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.183;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.688;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,207:405:99:7815,0,8467
chr3	2145060	.	T	C	8412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;ClippingRankSum=1.735;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.990;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,209:416:99:8441,0,9470
chr3	2145077	.	G	A	8176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.891;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.615;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,214:430:99:8205,0,9011
chr3	2145174	.	T	G	10526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.437;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.497;QD=20.93;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,266:503:99:10555,0,9343
chr3	2145176	.	C	T	10883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-1.062;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.489;QD=21.34;ReadPosRankSum=1.661;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,269:510:99:10912,0,9437
chr3	2145193	.	T	C	10293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-2.810;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.733;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,267:500:99:10322,0,8826
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chr3	2145238	.	C	T	10744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.236;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.784;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,267:531:99:10773,0,10718
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chr3	2155682	.	A	G	8939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.878;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.207;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.644;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,242:510:99:8968,0,10277
chr3	2155697	.	G	C	9184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-0.242;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.082;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,232:503:99:9213,0,11019
chr3	2155714	.	AG	A	4202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.041;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.862;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,198:481:99:4240,0,11892
chr3	2155717	.	A	T	4354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-0.292;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.949;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,199:479:99:4383,0,11490
chr3	2155730	.	A	T	8389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.372;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.100;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,221:497:99:8418,0,10877
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chr3	2158636	.	C	A	8726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=1.153;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.050;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,283:548:99:8755,0,8053
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chr3	2167687	.	G	A	9124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.748;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.969;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,237:495:99:9153,0,14640
chr3	2167957	.	A	C	11582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.113;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.310;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,350:657:99:11611,0,11462
chr3	2167978	.	A	G	12982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.483;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.137;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,342:644:99:13011,0,11206
chr3	2168605	.	C	T	10912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.279;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.219;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.414;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,283:551:99:10941,0,17077
chr3	2168617	.	T	C	11051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.627;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.239;QD=20.13;ReadPosRankSum=-1.281;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,287:549:99:11080,0,17156
chr3	2170238	.	C	T	7823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-2.015;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.137;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,250:484:99:7852,0,7270
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chr3	2181512	.	T	C	8728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=2.026;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.283;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,266:537:99:8757,0,8743
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chr3	2198518	.	TA	T	11790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.380;ClippingRankSum=0.532;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=3.229;QD=17.14;ReadPosRankSum=4.258;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,335:688:99:11828,0,13696
chr3	2198522	.	TCTCTCTTTTGCCCTTTTATCCCGTTGTCAACTTAACGTATTAGCTATCTTAACGAATGTGACTTTTTCCTGTTTCC	T	11079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=15.922;ClippingRankSum=-0.567;DP=986;ExcessHet=3.0103;FS=0.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=3.115;QD=11.97;ReadPosRankSum=4.017;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:589,337:926:99:11117,0,23687
chr3	2198905	.	G	C	11463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.465;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.848;QD=20.01;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,296:573:99:11492,0,11710
chr3	2198912	.	G	A	11425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-0.207;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.259;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.596;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,295:573:99:11454,0,11903
chr3	2199817	.	C	CATAG	7730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.561;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.003;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,232:449:99:7768,0,8161
chr3	2201532	.	T	TA	2872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=1.004;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=5.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.495;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.996	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,141:336:99:2910,0,4434
chr3	2201982	.	T	C	8686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.318;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.918;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,274:536:99:8715,0,8069
chr3	2202142	.	C	T	10426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.333;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.689;QD=20.13;ReadPosRankSum=-1.709;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,267:518:99:10455,0,9724
chr3	2202143	.	A	T	10426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.220;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=8.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.637;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,266:517:99:10455,0,9724
chr3	2202285	.	C	T	10486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.744;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.413;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.211;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,272:553:99:10515,0,15489
chr3	2202290	.	G	A	10361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.407;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.345;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.528;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,267:549:99:10390,0,15397
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chr3	2214388	.	G	T	7945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.645;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.582;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,253:532:99:7974,0,10819
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chr3	2214491	.	T	C	12242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-1.180;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.327;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,296:588:99:12271,0,11712
chr3	2214493	.	C	G	11795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.807;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.747;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,296:588:99:11824,0,11539
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chr3	2214682	.	A	G	10356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.903;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.740;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,275:598:99:10385,0,10082
chr3	2217074	.	C	T	25792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.586;DP=731;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.631;QD=31.26;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.402	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,705:708:99:25821,2042,0
chr3	2217315	.	A	G	10821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.159;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.463;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.770;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,281:595:99:10850,0,13819
chr3	2217317	.	T	C	10821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.961;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.009;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,285:596:99:10850,0,13819
chr3	2217623	.	T	C	9507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=-0.033;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.004;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.034;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,300:619:99:9536,0,10178
chr3	2217963	.	T	C	10380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=-0.043;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.178;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,330:649:99:10409,0,9578
chr3	2218283	.	A	G	10571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.606;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.884;QD=17.86;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,274:592:99:10600,0,12211
chr3	2218290	.	A	G	11009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-0.684;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.064;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.860;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,271:576:99:11038,0,12628
chr3	2218296	.	G	A	10934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.461;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.187;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.455;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,269:574:99:10963,0,12495
chr3	2218312	.	C	G	11023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=-0.189;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.204;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,293:582:99:11052,0,11197
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chr3	2218496	.	ATTTTTTTTT	A	10146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.910;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=5.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.308;QD=23.87;ReadPosRankSum=1.133;SOR=0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,260:425:99:10184,0,6126
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chr3	2218520	.	T	TAA	11790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.618;ClippingRankSum=1.696;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=2.029;QD=27.23;ReadPosRankSum=6.613;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,266:433:99:11828,0,7180
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chr3	2218590	.	G	GT	10047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=-0.269;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.524;QD=21.15;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,258:475:99:10085,0,8317
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chr3	2218853	.	A	G	11994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.116;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.757;QD=19.54;ReadPosRankSum=2.171;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,307:614:99:12023,0,14540
chr3	2218863	.	T	G	12831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=2.323;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.427;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,318:626:99:12860,0,14925
chr3	2218878	.	A	G	12100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=1.804;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.878;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,318:624:99:12129,0,14598
chr3	2221031	.	C	T	13303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.651;DP=742;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.276;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,345:724:99:13332,0,14665
chr3	2221032	.	C	T	13303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.180;DP=738;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.082;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,345:720:99:13332,0,14665
chr3	2221971	.	C	T	10731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-0.551;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.104;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,280:562:99:10760,0,10946
chr3	2221976	.	T	C	10528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-0.246;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.105;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,273:555:99:10557,0,11031
chr3	2222087	.	G	A	9129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.041;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.128;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,290:572:99:9158,0,9055
chr3	2222099	.	A	T	23961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.859;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.699;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,586:589:99:23990,1711,0
chr3	2223074	.	G	A	10711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.649;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.251;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,290:622:99:10740,0,12499
chr3	2223089	.	T	G	10178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.936;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.677;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,271:595:99:10207,0,12460
chr3	2223255	.	C	T	11999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-1.034;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.045;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,313:641:99:12028,0,13859
chr3	2223256	.	C	T	11999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=-1.886;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.347;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.786;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,307:630:99:12028,0,13859
chr3	2223666	.	A	AAAG	11744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.045;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.304;QD=18.10;ReadPosRankSum=-2.760;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,305:649:99:11782,0,13268
chr3	2223777	.	T	C	12034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.459;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.257;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.905;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,309:611:99:12063,0,12095
chr3	2223779	.	G	C	12034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.238;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.398;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,311:606:99:12063,0,12095
chr3	2224131	.	G	A	11933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-1.155;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.268;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,319:600:99:11962,0,10650
chr3	2224149	.	A	G	11730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.061;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.416;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,312:611:99:11759,0,11083
chr3	2224972	.	C	T	10900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.175;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.534;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,278:557:99:10929,0,10977
chr3	2224975	.	CTCACAATAGACAT	C	10649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=-0.892;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.206;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.490;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,271:595:99:10687,0,12769
chr3	2225116	.	A	T	9422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.367;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.133;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,246:530:99:9451,0,11109
chr3	2225119	.	T	C	9329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=1.161;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.006;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,246:528:99:9358,0,11174
chr3	2225294	.	T	C	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.842;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.787;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,215:433:99:8192,0,11249
chr3	2225301	.	T	C	7974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.417;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.062;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.187;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,210:438:99:8003,0,11511
chr3	2225531	.	C	T	11716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.911;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.266;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,318:673:99:11745,0,13959
chr3	2225543	.	A	G	12258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.815;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.463;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,309:670:99:12287,0,11227
chr3	2225550	.	T	A	11424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.217;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.400;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,310:677:99:11453,0,14403
chr3	2226170	.	C	T	10302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.971;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.817;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,325:628:99:10331,0,9740
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chr3	2226886	.	A	G	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=2.562;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.632;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,276:589:99:10167,0,18992
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chr3	2228462	.	C	A	9435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.308;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.304;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,247:492:99:9464,0,9439
chr3	2228540	.	AT	A	6561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.753;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.079;QD=12.13;ReadPosRankSum=-2.097;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,270:541:99:6599,0,6601
chr3	2228961	.	G	A	10504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.184;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.447;QD=19.60;ReadPosRankSum=2.669;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,270:536:99:10533,0,10247
chr3	2228985	.	A	G	12049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.386;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.681;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,306:619:99:12078,0,12424
chr3	2228988	.	T	C	11799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.241;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.871;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.715;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,305:612:99:11828,0,12290
chr3	2229256	.	TATTAC	T	10643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.894;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.296;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,282:599:99:10681,0,13815
chr3	2231280	.	GT	G	5865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.932;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.288;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,258:565:99:5903,0,7257
chr3	2231421	.	A	G	10164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.653;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.182;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,268:556:99:10193,0,11271
chr3	2231437	.	T	A	10207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=1.875;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.325;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,276:574:99:10236,0,11429
chr3	2232296	.	G	A	11449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=-1.077;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.924;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,294:585:99:11478,0,11771
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chr3	2255701	.	G	A	9629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-0.447;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.220;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,251:511:99:9667,0,10146
chr3	2255822	.	A	C	9121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=1.887;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.795;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,248:557:99:9150,0,11832
chr3	2255840	.	G	A	9378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.611;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.257;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.378;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,241:554:99:9407,0,12923
chr3	2255849	.	T	C	8968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=1.923;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.050;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,237:543:99:8997,0,12770
chr3	2255946	.	T	C	6292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;ClippingRankSum=1.055;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.390;QD=15.39;ReadPosRankSum=-2.072;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,200:409:99:6321,0,5912
chr3	2255975	.	G	A	6029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=1.738;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.057;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,205:422:99:6058,0,5874
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chr3	2256030	.	T	C	8771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.468;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.431;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,220:435:99:8800,0,8582
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chr3	2256310	.	T	C	10612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-1.614;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.143;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,281:570:99:10641,0,11359
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chr3	2256416	.	T	A	9093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=1.182;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.531;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,299:617:99:9122,0,11910
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chr3	2257369	.	C	T	10692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.081;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.706;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,275:535:99:10721,0,10129
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chr3	2260941	.	A	G	12088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=1.236;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=0.747;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.498;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,316:633:99:12117,0,11973
chr3	2260954	.	GATAAA	G	12324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.880;ClippingRankSum=1.197;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=2.046;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.747;SOR=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,312:662:99:12362,0,14088
chr3	2260971	.	ACAATCAATAAGCAATAACTTACTTATCAATC	A	11464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.045;ClippingRankSum=0.642;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=9.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-3.124;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.861;SOR=1.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:416,297:713:99:11502,0,16864
chr3	2261085	.	C	G	10965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=2.220;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.698;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,295:653:99:10994,0,13779
chr3	2261100	.	T	C	11068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.415;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.188;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,295:649:99:11097,0,13753
chr3	2263436	.	C	T	21934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.111;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-1.081;QD=28.05;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,582:584:99:21963,1733,0
chr3	2263470	.	T	C	10725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.285;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.163;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,291:592:99:10754,0,11270
chr3	2263482	.	C	T	10057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-1.322;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.314;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,270:570:99:10086,0,11521
chr3	2264152	.	TAA	T	7116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.545;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.079;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.713;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,227:461:99:7154,0,7155
chr3	2264745	.	T	G	8018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.914;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.538;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,273:567:99:8047,0,8642
chr3	2265700	.	T	C	11222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=-2.598;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.200;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,289:577:99:11251,0,11363
chr3	2265713	.	G	T	11691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.859;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.810;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,308:599:99:11720,0,11121
chr3	2266416	.	T	C	11678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.591;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.263;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,314:632:99:11707,0,11840
chr3	2266433	.	T	G	11391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.159;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.167;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,305:590:99:11420,0,10892
chr3	2266470	.	C	T	8866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.549;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.208;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,296:557:99:8895,0,8206
chr3	2267034	.	C	A	9672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.926;DP=820;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.757;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,262:550:99:9701,0,11422
chr3	2267045	.	C	T	9364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=2.479;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.787;QD=17.84;ReadPosRankSum=-2.487;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,254:525:99:9393,0,10431
chr3	2267083	.	T	TAATCAGGCAGTAATCCTCATCGTCCTTCCTAATGTTACTGTAAAAAAAAAACATGGCCATCAGTCAGGGGTTAAACCAAAA	5219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=-1.345;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.793;QD=19.70;ReadPosRankSum=-13.638;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,141:265:99:5257,0,4821
chr3	2267855	.	G	A	11245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.976;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.076;QD=19.16;ReadPosRankSum=1.635;SOR=0.947	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,296:587:99:11274,0,11172
chr3	2267867	.	A	G	11088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.101;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=6.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.070;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.581;SOR=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,291:569:99:11117,0,10582
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chr3	2273584	.	T	G	13508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.283;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.614;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,354:697:99:13537,0,13180
chr3	2273586	.	C	T	13508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=1.181;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.523;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,341:671:99:13537,0,13180
chr3	2274327	.	C	T	9563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.618;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.578;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,307:621:99:9592,0,9725
chr3	2274605	.	GAAGTGCTTTTCGTATTGTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	2424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=-0.351;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=2.678;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,133:353:99:2462,0,8025
chr3	2274631	.	TTTTTTTTTTTTTTTAAGTGCTTTTCGTATTGTCCC	T	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.696;ClippingRankSum=0.531;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=12.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=0.284;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.680;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,59:301:99:375,0,9148
chr3	2274969	.	A	T,ATTTT	16185.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.039;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.419;QD=31.92;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:6,272,229:507:99:16223,7048,6560,7210,0,11133
chr3	2275053	.	G	A	9293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=-0.346;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.241;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,243:549:99:9322,0,11859
chr3	2275062	.	T	A	9388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.487;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.307;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,243:557:99:9417,0,13040
chr3	2275067	.	T	G	9436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.136;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.372;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,241:558:99:9465,0,13065
chr3	2275074	.	T	G	9754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=1.608;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.667;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,244:564:99:9783,0,13293
chr3	2275087	.	A	G	8938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.611;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=4.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.446;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.091;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,226:540:99:8967,0,13017
chr3	2275094	.	A	C	8872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.311;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.215;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.937;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,224:538:99:8901,0,12771
chr3	2275115	.	G	A	8233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-1.104;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.077;QD=15.62;ReadPosRankSum=-3.109;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,214:527:99:8262,0,12942
chr3	2275116	.	G	A	8362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=-0.997;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=5.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.251;QD=16.02;ReadPosRankSum=-2.886;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,210:522:99:8391,0,12891
chr3	2275120	.	C	CTATTAA	8884.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-0.307;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=7.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.018;QD=16.73;ReadPosRankSum=-3.392;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,216:531:99:8922,0,12650
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chr3	2278566	.	G	A	8868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.903;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.756;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,230:495:99:8897,0,10438
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chr3	2278736	.	G	A	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.216;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.086;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,268:564:99:9947,0,11176
chr3	2278976	.	C	T	13368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.134;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.237;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,337:668:99:13397,0,12826
chr3	2278978	.	T	C	13368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-0.196;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.928;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,345:673:99:13397,0,12826
chr3	2279012	.	G	A	13114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.033;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.163;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,340:684:99:13143,0,13163
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chr3	2279864	.	T	C	10492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.124;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.692;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,274:548:99:10521,0,10623
chr3	2279876	.	C	T	10108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.620;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.401;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.869;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,274:564:99:10137,0,10891
chr3	2280086	.	C	T	5191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.507;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=2.279;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,176:383:99:5220,0,6153
chr3	2280124	.	CATAT	C	4807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.903;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.402;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,133:230:99:4845,0,3501
chr3	2280170	.	G	A	6404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-0.474;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=5.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.256;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.485;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,190:338:99:6433,0,4654
chr3	2280335	.	T	C	9702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.565;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.022;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.180;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,296:597:99:9731,0,9526
chr3	2280375	.	A	G	9825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=-0.719;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=8.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.786;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,258:553:99:9854,0,11898
chr3	2280384	.	A	G	10133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.422;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=7.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.475;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,251:549:99:10162,0,11971
chr3	2280390	.	G	A	10101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.297;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.524;QD=18.60;ReadPosRankSum=-1.507;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,260:543:99:10130,0,11539
chr3	2280979	.	C	T	9944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.321;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.467;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,257:504:99:9973,0,12632
chr3	2280989	.	C	T	10410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=-1.332;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.722;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,255:502:99:10439,0,13149
chr3	2281000	.	C	T	9979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=-0.123;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.459;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,259:511:99:10008,0,12848
chr3	2281481	.	T	C	8997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.602;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.476;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,293:665:99:9026,0,14543
chr3	2282159	.	C	T	12385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=1.103;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.919;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,319:605:99:12414,0,10879
chr3	2282168	.	T	C	12189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-1.695;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.822;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,318:610:99:12218,0,11156
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chr3	2284676	.	T	C	9608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.504;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=1.134;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,323:668:99:9637,0,10522
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chr3	2286503	.	C	G	11054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.713;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.133;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,297:635:99:11083,0,16117
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chr3	2288683	.	G	A	13069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.315;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.089;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,340:628:99:13098,0,11037
chr3	2288694	.	C	T	13179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.420;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.272;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,327:607:99:13208,0,11116
chr3	2288718	.	G	C	12514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=2.293;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.431;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,312:607:99:12543,0,12084
chr3	2288729	.	A	G	12613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=2.767;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.053;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,308:603:99:12642,0,11877
chr3	2288730	.	AAATC	A	12840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.669;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.879;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,302:602:99:12878,0,12258
chr3	2288735	.	G	GCT	12017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.991;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.460;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,299:593:99:12055,0,12027
chr3	2288743	.	A	G	11484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.860;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.814;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,299:596:99:11513,0,11556
chr3	2288779	.	T	G	11685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-2.049;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.841;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,308:609:99:11714,0,11340
chr3	2288800	.	T	C	12271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=1.329;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.901;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,307:622:99:12300,0,12646
chr3	2288801	.	A	G	12341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.396;ClippingRankSum=1.741;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.372;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,304:622:99:12370,0,12728
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chr3	2288825	.	G	C	11237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.444;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,282:604:99:11266,0,12928
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chr3	2294247	.	C	A	7663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.678;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.129;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,240:450:99:7692,0,6773
chr3	2294279	.	C	T	8080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.224;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.902;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,214:438:99:8109,0,8593
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chr3	2295343	.	C	CTT,CTTT	6098.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.426;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=2.566;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.476;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.262;SOR=1.155	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:3,43,37:83:99:6136,1224,641,1160,0,708
chr3	2295909	.	T	C	10177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.881;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.160;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,269:608:99:10206,0,13472
chr3	2295915	.	A	G	10318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.255;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.968;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,270:615:99:10347,0,13511
chr3	2296419	.	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.838;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.740;QD=0.71;ReadPosRankSum=-5.586;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,27:272:99:220,0,14022
chr3	2296420	.	T	C	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.751;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.156;QD=0.69;ReadPosRankSum=-6.982;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,25:270:99:224,0,13681
chr3	2296639	.	T	C	8154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=-0.132;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.659;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,212:456:99:8183,0,14787
chr3	2296649	.	C	T	8339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=-0.148;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.143;QD=17.56;ReadPosRankSum=-2.160;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,221:475:99:8368,0,15014
chr3	2297241	.	T	C	8187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.167;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.425;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,250:492:99:8216,0,7846
chr3	2297277	.	G	A	8567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.121;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.125;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.739;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,224:481:99:8596,0,10043
chr3	2297286	.	T	C	8825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.093;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.704;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,235:491:99:8854,0,10095
chr3	2297310	.	T	C	7802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.291;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.169;QD=15.21;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,250:513:99:7831,0,8197
chr3	2297480	.	G	T	13122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-1.005;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.368;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,343:705:99:13151,0,14108
chr3	2297487	.	C	T	13379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.967;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.200;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,339:697:99:13408,0,14405
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chr3	2304571	.	T	G	9374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=1.466;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.982;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,244:476:99:9403,0,11407
chr3	2304826	.	T	A	10145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.868;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.478;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,322:629:99:10174,0,9645
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chr3	2304989	.	T	C	12213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.671;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.412;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.110;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,318:635:99:12242,0,12326
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chr3	2305316	.	C	T	8555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.512;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.027;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,284:597:99:8584,0,9613
chr3	2305352	.	G	A	8875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.305;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.696;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,297:611:99:8904,0,9960
chr3	2305378	.	A	G	10253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.277;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.517;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,277:595:99:10282,0,12068
chr3	2305396	.	T	C	10352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.338;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.015;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.619;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,283:596:99:10381,0,11895
chr3	2305675	.	T	A	11485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-0.746;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.198;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,306:621:99:11514,0,12084
chr3	2305691	.	A	C	11934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.476;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.117;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,294:599:99:11963,0,12469
chr3	2305698	.	G	A	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.349;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.005;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.425;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,299:598:99:11648,0,11650
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chr3	2305747	.	A	G	10591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.415;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.467;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,282:565:99:10620,0,10508
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chr3	2308537	.	T	C	9074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;ClippingRankSum=-1.425;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=10.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.920;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.438;SOR=1.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,229:510:99:9103,0,11713
chr3	2308546	.	TAAA	T	8902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=1.041;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=7.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.421;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,225:515:99:8940,0,12225
chr3	2308560	.	TAA	T	8390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.485;ClippingRankSum=-0.403;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=9.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.929;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,199:505:99:8428,0,12919
chr3	2308568	.	A	T	8146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=-0.049;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=5.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.354;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,200:511:99:8175,0,12990
chr3	2308576	.	A	T	8617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.593;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=4.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-2.171;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,216:541:99:8646,0,13416
chr3	2308594	.	C	T	9319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=-1.417;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-1.143;QD=15.88;ReadPosRankSum=-1.119;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,231:587:99:9348,0,14703
chr3	2308601	.	G	A	9448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;ClippingRankSum=1.149;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.077;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,243:613:99:9477,0,15237
chr3	2308608	.	T	A	9759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.412;ClippingRankSum=-0.651;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.006;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,253:630:99:9788,0,15548
chr3	2308611	.	A	G	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;ClippingRankSum=1.173;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.382;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,260:644:99:9947,0,15662
chr3	2308624	.	C	T	10710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-3.761;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.340;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:381,276:657:99:10739,0,15689
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chr3	2308644	.	A	C	11089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=-0.614;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=3.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.086;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:411,291:702:99:11118,0,16401
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chr3	2308997	.	A	AAT	9386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.777;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-0.007;QD=17.35;ReadPosRankSum=-2.886;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,235:541:99:9424,0,12900
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chr3	2309122	.	C	G	11854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.288;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.619;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,309:675:99:11883,0,14488
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chr3	2309199	.	T	G	14596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.588;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.160;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,385:707:99:14625,0,12350
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chr3	2309265	.	A	AGAGT	13783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.196;DP=715;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.242;QD=19.86;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,347:694:99:13821,0,13741
chr3	2309271	.	C	T	13387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=1.846;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.489;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,347:690:99:13416,0,13327
chr3	2309302	.	A	T	10548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.362;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.568;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.591;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,337:649:99:10577,0,9689
chr3	2309323	.	AT	A	5845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.003;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.374;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.080;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,267:509:99:5883,0,5290
chr3	2309342	.	A	T	25334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.473;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.131;QD=31.99;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,587:588:99:25363,1798,0
chr3	2309363	.	A	AC	6289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.267;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.021;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,249:493:99:6327,0,6272
chr3	2309770	.	T	C	7619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.136;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.125;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.436;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,244:477:99:7648,0,7623
chr3	2310978	.	A	G	11962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=1.341;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.365;QD=17.34;ReadPosRankSum=-2.451;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,384:690:99:11991,0,9298
chr3	2311006	.	A	G	11613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.392;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.481;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,305:666:99:11642,0,13976
chr3	2311017	.	T	C	11576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.015;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.260;QD=17.28;ReadPosRankSum=3.405;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,309:670:99:11605,0,14062
chr3	2311141	.	C	T	10752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.865;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.054;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.398;SOR=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,282:585:99:10781,0,11754
chr3	2311150	.	C	T	10960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.030;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-4.171;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,289:596:99:10989,0,11782
chr3	2311774	.	A	G	8550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.217;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.687;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.681;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,266:537:99:8579,0,9021
chr3	2311866	.	T	C	9808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.619;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.441;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,258:564:99:9837,0,11842
chr3	2311867	.	C	T	9808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.031;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.967;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,259:563:99:9837,0,11842
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chr3	2312308	.	A	G	10208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.031;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.203;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,261:511:99:10237,0,9644
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chr3	2317497	.	TTTTAAGGA	T	12607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=-0.199;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.425;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,329:688:99:12645,0,14244
chr3	2317530	.	T	C	11380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.278;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=8.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.749;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=1.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,304:609:99:11409,0,11551
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chr3	2317672	.	C	CTT	9756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=1.912;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.259;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,279:539:99:9794,0,8968
chr3	2317821	.	A	G	13081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.023;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.917;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,337:682:99:13110,0,18395
chr3	2317825	.	G	A	13149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=0.032;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.623;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,342:693:99:13178,0,18508
chr3	2318370	.	T	C	9589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.666;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.338;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,250:569:99:9618,0,12617
chr3	2318371	.	T	G	9589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=1.332;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.079;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,254:573:99:9618,0,12617
chr3	2318414	.	G	T	11889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.990;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.784;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,308:598:99:11918,0,11224
chr3	2318423	.	A	T	12521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=0.331;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.533;QD=21.12;ReadPosRankSum=-1.969;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,310:593:99:12550,0,11330
chr3	2318441	.	G	A	11649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-1.228;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.371;QD=19.32;ReadPosRankSum=-1.953;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,311:603:99:11678,0,10843
chr3	2318486	.	T	A	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.274;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.373;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,306:649:99:11648,0,12893
chr3	2318504	.	A	G	12517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=-0.585;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.221;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,314:644:99:12546,0,13374
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chr3	2318858	.	GA	G	3764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.433;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.820;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,196:402:99:3802,0,4202
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chr3	2324808	.	T	C	10714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=-1.363;DP=738;ExcessHet=3.0103;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.356;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.454;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,343:703:99:10743,0,10860
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chr3	2325322	.	A	G	8241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-0.246;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.185;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,277:594:99:8270,0,9785
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chr3	2327733	.	G	A	6143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.028;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.100;QD=10.65;ReadPosRankSum=2.553;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,294:577:99:6172,0,7786
chr3	2327952	.	A	AC	5347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.752;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.291;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,212:424:99:5385,0,5296
chr3	2328850	.	TA	T	3888.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.977;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.164;QD=9.48;ReadPosRankSum=3.364;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,187:410:99:3926,0,7094
chr3	2328939	.	A	G	9650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.380;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.466;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.305;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,245:498:99:9679,0,9934
chr3	2328940	.	C	A	9767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.316;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.497;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.331;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,245:499:99:9796,0,10051
chr3	2328943	.	A	G	10217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.245;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.551;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,250:506:99:10246,0,10336
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chr3	2328967	.	T	G	10335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=1.020;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.310;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,259:499:99:10364,0,9549
chr3	2328981	.	C	T	9132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-0.099;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.733;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,235:451:99:9161,0,8248
chr3	2329050	.	T	C	9144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.361;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.055;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,241:492:99:9173,0,9746
chr3	2329059	.	TA	T	9197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-0.860;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.035;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.892;SOR=0.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,233:482:99:9235,0,9951
chr3	2329066	.	G	T	9278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=-0.458;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=5.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.466;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.523;SOR=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,232:482:99:9307,0,10139
chr3	2329070	.	A	G	9397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.723;ClippingRankSum=1.246;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=6.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.474;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,240:493:99:9426,0,10445
chr3	2329088	.	C	G	8945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.277;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.434;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,230:510:99:8974,0,10589
chr3	2329130	.	A	G	8022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.427;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-2.514;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,212:465:99:8051,0,10072
chr3	2329139	.	C	T	8350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=1.308;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-2.761;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,209:459:99:8379,0,10283
chr3	2329142	.	T	C	7964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=-0.851;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-3.588;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,207:455:99:7993,0,10267
chr3	2329147	.	C	T	8015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=-0.499;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-2.936;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,207:458:99:8044,0,10159
chr3	2329156	.	C	T	8528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.393;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-3.365;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.044;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,220:480:99:8557,0,10582
chr3	2329163	.	TTCATTGACATGAAAAAAAA	T	8551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.499;ClippingRankSum=0.515;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-2.089;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,221:554:99:8589,0,13629
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chr3	2339755	.	T	C	13109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.996;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.124;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,341:641:99:13138,0,11451
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chr3	2343591	.	T	C	10571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.495;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.981;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,257:522:99:10600,0,10433
chr3	2343593	.	T	G	10751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.467;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.190;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,269:533:99:10780,0,10838
chr3	2343600	.	A	G	10913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.404;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.930;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,274:539:99:10942,0,10785
chr3	2343611	.	T	A	10608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-1.562;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.178;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,279:551:99:10637,0,10951
chr3	2343635	.	T	C	10603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=-2.202;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.560;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,277:554:99:10632,0,11309
chr3	2343648	.	G	A	10717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.059;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.439;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,287:557:99:10746,0,10577
chr3	2344467	.	G	C	13886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.194;DP=735;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.617;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,360:716:99:13915,0,16630
chr3	2344478	.	T	C	14430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.314;DP=751;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.380;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,374:732:99:14459,0,16811
chr3	2345034	.	C	T	11527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=-1.283;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.227;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.069;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,306:578:99:11556,0,10365
chr3	2345037	.	T	TA	11906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=1.782;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.172;QD=20.05;ReadPosRankSum=-2.243;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,310:594:99:11944,0,11093
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chr3	2345277	.	A	T	12355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=-0.456;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.520;QD=18.84;ReadPosRankSum=3.672;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,322:656:99:12384,0,12864
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chr3	2347100	.	A	ATCCTATGAACTTGCAGCTGCTGGGGTGGATGAGTGCGAGGATGATGATGCTGTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTTGCTTGTTTG	3681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.713;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=14.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=0.502;QD=12.44;ReadPosRankSum=-14.511;SOR=1.363	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,128:296:99:3719,0,6361
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chr3	2347572	.	C	T	9253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-1.535;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.597;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,249:511:99:9282,0,9990
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chr3	2347600	.	C	T	9553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.258;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.290;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,250:512:99:9582,0,10006
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chr3	2347780	.	C	T	9463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.964;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.878;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.901;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,251:515:99:9492,0,10668
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chr3	2347801	.	A	G	10568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.826;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.691;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,270:536:99:10597,0,11254
chr3	2348050	.	A	C	10446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-7.021;DP=767;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.114;QD=14.08;ReadPosRankSum=4.386;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:396,346:742:99:10475,0,11996
chr3	2348080	.	T	A	11104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.058;DP=735;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.138;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,371:712:99:11133,0,10297
chr3	2348187	.	C	T	9802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.397;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.510;QD=17.05;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,307:575:99:9831,0,8075
chr3	2348217	.	G	C	8316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.483;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.741;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,279:563:99:8345,0,8790
chr3	2348459	.	G	C	10999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.720;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.778;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.442;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,282:597:99:11028,0,12417
chr3	2348463	.	A	G	11344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.070;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.140;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,286:603:99:11373,0,12746
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chr3	2354164	.	T	G	11493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.415;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.884;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,293:588:99:11522,0,11187
chr3	2354467	.	T	C	12039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.687;DP=794;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.468;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,390:769:99:12068,0,11449
chr3	2354492	.	T	TCA	10336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.508;DP=803;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.770;QD=14.58;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,323:709:99:10374,0,15063
chr3	2354493	.	T	TG	12250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-0.653;DP=807;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.750;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:385,391:776:99:12288,0,14815
chr3	2354499	.	T	G	10484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.241;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.877;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:395,349:744:99:10513,0,15401
chr3	2354669	.	G	C	10547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.057;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.156;QD=16.48;ReadPosRankSum=2.148;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,324:640:99:10576,0,10049
chr3	2355151	.	G	A	9889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.433;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.240;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,320:654:99:9918,0,10461
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chr3	2355456	.	G	GAAA	1267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=-1.185;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=0.139;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.295;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,80:224:99:1305,0,4278
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chr3	2363185	.	GT	G	6372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=2.040;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.050;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,220:449:99:6410,0,6824
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chr3	2363490	.	T	C	5820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.337;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.076;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.265;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,265:555:99:5849,0,10930
chr3	2364189	.	A	AG	7805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=2.488;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.667;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,249:511:99:7843,0,8174
chr3	2366052	.	C	T	10850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=1.622;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.058;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,287:572:99:10879,0,10542
chr3	2366071	.	A	G	11281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.021;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.149;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,300:577:99:11310,0,10584
chr3	2366482	.	T	C	10515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-1.864;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.164;QD=20.26;ReadPosRankSum=2.790;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,270:519:99:10544,0,9806
chr3	2366493	.	G	T	11452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-0.382;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.051;QD=21.57;ReadPosRankSum=2.516;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,278:531:99:11481,0,10134
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chr3	2369686	.	T	A	11625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.211;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.651;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,297:596:99:11654,0,11631
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chr3	2370109	.	G	A	12713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.126;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.036;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,347:716:99:12742,0,13991
chr3	2370133	.	G	A	12959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.633;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.902;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,335:717:99:12988,0,15600
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chr3	2373223	.	C	T	11741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=-2.110;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.073;QD=20.11;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,296:584:99:11770,0,11330
chr3	2373292	.	A	G	9687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.409;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.069;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,313:608:99:9716,0,9146
chr3	2373314	.	TCA	T	12129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.352;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.078;QD=20.39;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,307:595:99:12167,0,11293
chr3	2373324	.	C	T	11914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.315;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.737;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,308:594:99:11943,0,11127
chr3	2373351	.	A	T	10410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-1.327;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.957;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,272:543:99:10439,0,10678
chr3	2373360	.	G	A	10299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.704;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.694;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.656;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,271:550:99:10328,0,10694
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chr3	2380477	.	C	A	8853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-1.173;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.140;QD=19.99;ReadPosRankSum=2.244;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,226:443:99:8882,0,8637
chr3	2380482	.	A	G	8799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.103;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.688;QD=19.82;ReadPosRankSum=3.363;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,224:444:99:8828,0,8873
chr3	2380483	.	T	C	8955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.502;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.585;QD=19.95;ReadPosRankSum=2.905;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,229:449:99:8984,0,8433
chr3	2380514	.	C	T	8400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.677;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.038;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.629;SOR=1.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,219:449:99:8429,0,8861
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chr3	2380767	.	G	A	11422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.679;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.621;QD=21.04;ReadPosRankSum=3.987;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,291:543:99:11451,0,16742
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chr3	2381127	.	G	A	10826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=-0.115;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.438;QD=20.86;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,280:519:99:10855,0,9121
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chr3	2381271	.	A	G	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=1.143;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,233:528:99:8818,0,11519
chr3	2381273	.	T	C	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.363;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.223;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,234:525:99:8818,0,11519
chr3	2381316	.	T	C	9099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=0.338;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.673;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.632;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,241:531:99:9128,0,11327
chr3	2381319	.	C	T	9027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.179;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=4.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.033;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,235:520:99:9056,0,11271
chr3	2381451	.	A	C	9835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=-0.072;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.975;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,261:595:99:9864,0,12860
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chr3	2381517	.	T	G	10052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.942;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.104;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.908;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,262:573:99:10081,0,12235
chr3	2381520	.	C	T	9992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.499;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.565;QD=17.50;ReadPosRankSum=-1.903;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,261:571:99:10021,0,12299
chr3	2381607	.	G	A	9708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.011;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.230;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,251:558:99:9737,0,12303
chr3	2381608	.	A	G	9853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=-1.647;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.471;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,252:557:99:9882,0,12369
chr3	2381617	.	A	G	9652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.452;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.501;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.858;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,259:563:99:9681,0,12133
chr3	2382510	.	C	T	9846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.470;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.944;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,319:627:99:9875,0,9271
chr3	2382579	.	C	G	11073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.507;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.033;QD=18.52;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,286:598:99:11102,0,12302
chr3	2382581	.	A	G	11073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=-0.308;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.052;QD=18.39;ReadPosRankSum=-2.076;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,288:602:99:11102,0,12302
chr3	2382615	.	C	T	11877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.458;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.281;QD=19.54;ReadPosRankSum=-1.132;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,307:608:99:11906,0,11803
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chr3	2383526	.	C	T	11164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-2.928;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.593;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,281:553:99:11193,0,10678
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chr3	2383537	.	A	G	11288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.793;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.444;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,290:570:99:11317,0,10705
chr3	2383563	.	G	A	8968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.144;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.062;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,288:567:99:8997,0,10420
chr3	2383594	.	A	G	11523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=1.428;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.616;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,323:605:99:11552,0,8629
chr3	2383635	.	C	T	10724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.129;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.384;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,283:592:99:10753,0,11715
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chr3	2384815	.	C	T	12576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.848;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.165;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,316:594:99:12605,0,10910
chr3	2384834	.	G	A	11757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.084;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.136;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.627;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,304:577:99:11786,0,10437
chr3	2384948	.	G	A	10602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.381;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.508;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.931;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,276:575:99:10631,0,11641
chr3	2384952	.	A	G	10563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.223;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.159;QD=18.57;ReadPosRankSum=2.947;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,268:569:99:10592,0,11677
chr3	2384981	.	G	A	11450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.573;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.226;QD=19.54;ReadPosRankSum=2.867;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,293:586:99:11479,0,11228
chr3	2384990	.	G	A	10684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=1.924;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.064;QD=17.81;ReadPosRankSum=2.868;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,298:600:99:10713,0,12437
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chr3	2387140	.	AAATTAGG	A	10019.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=2.399;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.503;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.763;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,264:570:99:10057,0,11995
chr3	2387186	.	G	C	10338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.504;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.077;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,272:563:99:10367,0,11368
chr3	2387194	.	T	C	10827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.914;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.195;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,273:567:99:10856,0,11777
chr3	2387197	.	G	A	10952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.637;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.499;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.927;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,276:562:99:10981,0,11868
chr3	2387215	.	C	T	10660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.882;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.546;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,265:555:99:10689,0,11724
chr3	2387221	.	A	C	10459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-1.053;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.367;QD=19.26;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,254:543:99:10488,0,11613
chr3	2387223	.	T	C	10237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=-0.859;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.004;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,254:539:99:10266,0,11919
chr3	2387232	.	T	C	9776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=-1.444;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.382;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.614;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,253:538:99:9805,0,11736
chr3	2387256	.	T	G	11142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.985;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.067;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,280:526:99:11171,0,9730
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chr3	2387332	.	T	C	8904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.211;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.704;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.702;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,232:504:99:8933,0,10714
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chr3	2390770	.	C	A	9464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.419;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=5.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.128;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,238:439:99:9493,0,8031
chr3	2390787	.	C	T	8708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.439;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.643;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.921;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,233:441:99:8737,0,7746
chr3	2391499	.	G	GCAC	9283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.679;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.073;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,242:509:99:9321,0,10750
chr3	2391528	.	C	CT	5825.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.089;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.085;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,214:424:99:5863,0,5937
chr3	2391743	.	A	T	10029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=2.095;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.645;QD=18.17;ReadPosRankSum=3.402;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,263:552:99:10058,0,11453
chr3	2391748	.	A	G	10004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=-0.635;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.021;QD=18.12;ReadPosRankSum=3.691;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,259:552:99:10033,0,11563
chr3	2391943	.	T	G	8997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=1.511;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.903;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,237:519:99:9026,0,11130
chr3	2391947	.	A	C	9016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.454;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.163;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.731;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,234:523:99:9045,0,11263
chr3	2391974	.	A	T	9261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.399;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.099;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.003;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,280:515:99:9290,0,7428
chr3	2392053	.	G	GTTT	9115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.095;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.569;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,229:476:99:9153,0,9711
chr3	2392056	.	TGG	T	9245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=-0.359;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.913;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,234:487:99:9283,0,10276
chr3	2392069	.	G	C	8601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=1.526;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.108;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,226:479:99:8630,0,9857
chr3	2392316	.	G	A	7129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.925;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.060;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,232:475:99:7158,0,7456
chr3	2392480	.	C	A	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.683;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.456;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,305:544:99:9414,0,7070
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chr3	2392519	.	G	C	9371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.137;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.067;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,246:550:99:9400,0,11863
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chr3	2393127	.	G	GAGGAACTAATCAAT	11910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=1.271;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.329;QD=23.68;ReadPosRankSum=-5.267;SOR=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,274:503:99:11948,0,8360
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chr3	2401889	.	C	CAA	2085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=-0.210;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=28.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=0.210;QD=12.27;ReadPosRankSum=2.547;SOR=4.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,107:170:99:2123,0,1390
chr3	2402787	.	A	G	8776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;ClippingRankSum=0.049;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.571;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,307:611:99:8805,0,9560
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chr3	2402951	.	C	T	11357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=1.768;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.116;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,287:562:99:11386,0,13142
chr3	2402957	.	C	T	11000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.989;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.872;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,277:533:99:11029,0,12364
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chr3	2403455	.	A	G	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-1.297;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.466;QD=20.00;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,255:496:99:9947,0,9285
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chr3	2403593	.	A	AG	5318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=-0.871;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.619;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,139:288:99:5356,0,5924
chr3	2403598	.	A	G	5450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.809;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.032;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,141:294:99:5479,0,5956
chr3	2403620	.	T	G	4283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=2.243;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=1.593;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,108:231:99:4312,0,5106
chr3	2403630	.	C	A	3775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=2.020;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-1.800;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,95:205:99:3804,0,4415
chr3	2403684	.	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.171;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=41.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=-3.871;QD=0.23;ReadPosRankSum=-4.634;SOR=4.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,29:184:70:70,0,6950
chr3	2403695	.	C	T	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.354;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=41.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQRankSum=0.652;QD=19.67;ReadPosRankSum=5.286;SOR=0.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,94:181:99:3589,0,3371
chr3	2403733	.	ATCAGCATGC	A	4752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.445;ClippingRankSum=-1.489;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=20.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=1.014;QD=19.72;ReadPosRankSum=-3.092;SOR=0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:124,117:241:99:4790,0,5169
chr3	2403745	.	ATGATATGGAGT	A	4654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.742;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=13.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-0.059;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.453;SOR=0.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,123:273:99:4692,0,6222
chr3	2403757	.	CTTTT	C	4717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=-1.859;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=11.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=0.153;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,123:281:99:4755,0,6510
chr3	2403762	.	CACTGAGGAGAT	C	4747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.571;ClippingRankSum=1.759;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=8.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=0.333;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,125:317:99:4785,0,7845
chr3	2403779	.	C	T	5080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;ClippingRankSum=-0.087;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=4.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=0.698;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.074;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,132:328:99:5109,0,7989
chr3	2403784	.	G	A	5793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.012;ClippingRankSum=-0.604;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=3.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=0.333;QD=16.89;ReadPosRankSum=-2.265;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,138:343:99:5822,0,8473
chr3	2403785	.	A	ATAT	5904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.413;ClippingRankSum=-0.105;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=0.382;QD=16.92;ReadPosRankSum=-2.179;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,142:349:99:5942,0,8597
chr3	2403787	.	C	T	6444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.658;ClippingRankSum=-1.577;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-0.591;QD=17.66;ReadPosRankSum=-2.953;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,150:365:99:6473,0,8768
chr3	2403813	.	C	T	8096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.340;ClippingRankSum=-1.399;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=0.691;QD=17.45;ReadPosRankSum=-5.875;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,202:464:99:8125,0,10780
chr3	2403816	.	T	C	8057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.713;ClippingRankSum=1.212;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=1.112;QD=17.56;ReadPosRankSum=-4.670;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,201:459:99:8086,0,10741
chr3	2403820	.	T	C	7910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.636;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.494;QD=17.70;ReadPosRankSum=-2.649;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,196:447:99:7939,0,10459
chr3	2403822	.	T	C	7772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=-0.153;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.586;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,200:450:99:7801,0,10286
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chr3	2403836	.	G	A	9234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=2.037;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.697;QD=18.43;ReadPosRankSum=2.622;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,248:501:99:9263,0,9593
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chr3	2405432	.	C	A	10036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.718;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.552;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.403;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,252:510:99:10065,0,10215
chr3	2405451	.	G	A	8918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.078;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=5.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.043;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,227:485:99:8947,0,10384
chr3	2405458	.	T	A	9113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-0.033;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.837;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,230:485:99:9142,0,10357
chr3	2405464	.	G	A	9138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.453;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.014;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,240:498:99:9167,0,10019
chr3	2405493	.	C	T	9830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=-0.432;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.006;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,256:501:99:9859,0,9197
chr3	2405512	.	T	G	10803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.378;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.378;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,273:530:99:10832,0,10308
chr3	2405530	.	C	T	10076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.614;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.039;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,269:525:99:10105,0,10316
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chr3	2405569	.	A	G	11761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.995;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=5.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.824;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,299:592:99:11790,0,11853
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chr3	2409419	.	T	A	8829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=1.669;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.083;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,288:575:99:8858,0,10729
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chr3	2412681	.	G	A	11523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.881;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.950;QD=20.88;ReadPosRankSum=-4.705;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,281:552:99:11552,0,10181
chr3	2412682	.	T	TTGAAATTCA	11514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.781;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.397;QD=20.67;ReadPosRankSum=-4.348;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,282:557:99:11552,0,10181
chr3	2412710	.	C	T	7570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.263;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.915;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,249:524:99:7599,0,8495
chr3	2417200	.	T	G	7484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.296;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.186;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,233:466:99:7513,0,7442
chr3	2424221	.	A	C	19777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=1.808;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.659;QD=30.28;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,543:547:99:19806,1477,0
chr3	2425385	.	T	G	8346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.892;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.101;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,268:505:99:8375,0,7644
chr3	2425413	.	G	A	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.125;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.206;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,291:558:99:9408,0,8144
chr3	2425530	.	T	C	8451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=1.977;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.786;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,264:538:99:8480,0,10620
chr3	2425552	.	G	A	10629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.371;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.225;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,270:511:99:10658,0,9627
chr3	2425555	.	A	T	11000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.688;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.006;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,271:516:99:11029,0,9610
chr3	2425573	.	T	A	9995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=1.171;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.870;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,262:500:99:10024,0,8844
chr3	2427347	.	TCACTTTAC	T	7224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.200;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.683;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.426;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,192:414:99:7262,0,8665
chr3	2427356	.	GT	G	2553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.270;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=17.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.128;QD=8.93;ReadPosRankSum=-2.639;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,149:286:99:2591,0,2366
chr3	2436775	.	A	AT	6562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=-0.035;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.085;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,215:428:99:6600,0,6750
chr3	2437485	.	G	A	9555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=1.834;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.206;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,247:498:99:9584,0,9739
chr3	2437493	.	T	C	9216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=-0.375;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.034;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,239:492:99:9245,0,9675
chr3	2437635	.	G	A	10557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=1.020;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.472;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.242;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,266:519:99:10586,0,9937
chr3	2437637	.	A	G	10672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-1.512;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.511;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,265:519:99:10701,0,10010
chr3	2437660	.	G	A	9412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.042;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.190;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,250:478:99:9441,0,8646
chr3	2437857	.	G	A	7430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.905;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.196;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.783;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,230:457:99:7459,0,7046
chr3	2439195	.	T	G	7637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.359;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.226;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,247:487:99:7666,0,7777
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chr3	2441147	.	T	TA	2928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=-0.458;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.035;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.297;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,168:305:99:2966,0,2328
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chr3	2445501	.	GAA	G	9151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.299;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.275;QD=21.58;ReadPosRankSum=5.438;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,226:424:99:9189,0,6907
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chr3	2449523	.	T	C	6847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.577;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.834;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,220:452:99:6876,0,7535
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chr3	2450165	.	C	T	11866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-2.324;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.391;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,312:634:99:11895,0,12248
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chr3	2450442	.	A	T	7958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.465;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.288;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.414;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,259:504:99:7987,0,7725
chr3	2450483	.	C	T	9978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.349;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.568;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,264:507:99:10007,0,9315
chr3	2450503	.	A	G	10054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.508;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.871;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,252:513:99:10083,0,10444
chr3	2450504	.	C	T	9894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=-0.587;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.053;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,252:513:99:9923,0,10344
chr3	2450531	.	C	T	8803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.231;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.298;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,286:553:99:8832,0,9838
chr3	2450552	.	A	C	9058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=1.283;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.270;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,245:529:99:9087,0,11335
chr3	2450562	.	G	A	9864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.423;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.097;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,255:531:99:9893,0,8831
chr3	2450738	.	T	C	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.270;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.556;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,273:554:99:10550,0,11013
chr3	2450740	.	CTA	C	10632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.094;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.367;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,274:560:99:10670,0,11352
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chr3	2450793	.	C	A	10769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=1.384;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.764;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,282:602:99:10798,0,13031
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chr3	2462808	.	CT	C	5114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-2.435;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.024;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,226:426:99:5152,0,4367
chr3	2463518	.	C	T	7761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.975;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.052;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,249:468:99:7790,0,7023
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chr3	2466563	.	G	A	7727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-1.108;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.042;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,252:536:99:7756,0,8755
chr3	2466577	.	A	C	7537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.998;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.396;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.190;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,245:529:99:7566,0,9038
chr3	2466872	.	T	C	6020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=1.418;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=0.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.907;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.691;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,155:357:99:6049,0,8018
chr3	2466875	.	A	T	6086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.294;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-1.513;QD=16.95;ReadPosRankSum=-2.477;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,157:359:99:6115,0,8277
chr3	2466885	.	TC	T	7187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.332;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-2.047;QD=19.27;ReadPosRankSum=-4.678;SOR=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,169:373:99:7225,0,8273
chr3	2466898	.	TG	T	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-1.057;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=7.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.816;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,60:288:99:434,0,9365
chr3	2466905	.	G	T	6139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=-0.402;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-0.635;QD=17.80;ReadPosRankSum=-3.132;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,151:345:99:6168,0,8094
chr3	2466919	.	C	G	5339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.246;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=4.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.172;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,149:343:99:5368,0,7540
chr3	2468576	.	G	A	8908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.674;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.264;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,242:500:99:8937,0,9754
chr3	2468597	.	C	T	8700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=2.684;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.498;QD=18.01;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,236:483:99:8729,0,9900
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chr3	2473571	.	T	C	7830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.850;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.224;QD=19.63;ReadPosRankSum=-2.784;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,212:399:99:7859,0,7338
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chr3	2473610	.	C	T	9163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.800;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.246;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,239:498:99:9192,0,10084
chr3	2473749	.	A	G	11476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.942;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.771;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,291:549:99:11505,0,9835
chr3	2473757	.	G	A	12292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.686;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.331;QD=22.03;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,305:558:99:12321,0,9923
chr3	2473762	.	A	G	12303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=1.159;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.852;QD=21.78;ReadPosRankSum=-1.505;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,310:565:99:12332,0,9796
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chr3	2490979	.	CT	C	7694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-1.603;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=9.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.270;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,191:381:99:7732,0,8043
chr3	2491003	.	T	A	7222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.823;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.800;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.729;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,185:389:99:7251,0,8199
chr3	2491013	.	TTTC	T	2427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;ClippingRankSum=-0.875;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.821;QD=6.80;ReadPosRankSum=5.789;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,134:357:99:2465,0,8935
chr3	2491019	.	T	G	6398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=1.515;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.182;QD=18.28;ReadPosRankSum=3.303;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,169:350:99:6427,0,7514
chr3	2491111	.	T	G	6431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.729;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=4.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.357;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.897;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,169:329:99:6460,0,5972
chr3	2491125	.	G	A	6413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.395;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=7.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.778;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:156,161:317:99:6442,0,6259
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chr3	2491144	.	GA	G	6556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=1.524;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=0.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.283;QD=20.75;ReadPosRankSum=-2.104;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,155:316:99:6594,0,6504
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chr3	2498493	.	A	G	10862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.473;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.771;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.942;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,269:542:99:10891,0,10902
chr3	2498496	.	C	A	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.942;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=6.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.633;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.846;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,266:533:99:10516,0,10910
chr3	2498502	.	T	G	10218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.892;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=6.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.430;QD=18.96;ReadPosRankSum=2.303;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,264:539:99:10247,0,10739
chr3	2499027	.	T	C	9199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-1.433;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.063;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,234:458:99:9228,0,8732
chr3	2499031	.	C	A	9247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.970;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.013;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,232:454:99:9276,0,9005
chr3	2499047	.	G	A	8834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=-1.187;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.871;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.114;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,226:435:99:8863,0,8024
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chr3	2511387	.	GT	G	5202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-1.149;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.791;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,227:504:99:5240,0,6526
chr3	2511467	.	G	A	8713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-1.441;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.201;SOR=1.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,225:442:99:8742,0,8449
chr3	2511472	.	A	T	8893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.156;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.763;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.358;SOR=1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,223:439:99:8922,0,9024
chr3	2511479	.	T	G	8834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=-1.121;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.302;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.856;SOR=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,211:422:99:8863,0,8638
chr3	2511502	.	T	C	8595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.841;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.453;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,214:414:99:8624,0,7904
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chr3	2522687	.	T	G	8114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.646;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.516;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,259:491:99:8143,0,7288
chr3	2522753	.	G	A	5908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.442;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.465;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,196:449:99:5937,0,7943
chr3	2522773	.	A	G	6568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=-0.071;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.405;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.251;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,211:478:99:6597,0,8187
chr3	2522939	.	A	G	6745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-0.301;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.510;QD=14.48;ReadPosRankSum=-1.598;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,224:466:99:6774,0,7517
chr3	2522957	.	T	C	6989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=1.713;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.601;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,226:477:99:7018,0,7882
chr3	2525262	.	A	C	6684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.150;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.004;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,172:362:99:6713,0,7335
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chr3	2525273	.	A	T	6635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.148;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.645;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,169:349:99:6664,0,7345
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chr3	2525690	.	TA	T	7579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.622;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.369;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,202:423:99:7617,0,8332
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chr3	2526295	.	G	A	8890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.739;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.110;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,234:467:99:8919,0,9032
chr3	2526430	.	A	G	9892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.039;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.891;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=0.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,255:521:99:9921,0,10960
chr3	2526435	.	C	CA	10361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.622;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.099;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.346;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,259:535:99:10399,0,11188
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chr3	2526456	.	C	T	11486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.833;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.185;QD=20.15;ReadPosRankSum=-2.395;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,285:570:99:11515,0,11421
chr3	2526465	.	C	T	10315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.293;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.185;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,267:541:99:10344,0,10756
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chr3	2526549	.	C	CA	4528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.522;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.717;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,198:412:99:4566,0,5181
chr3	2526596	.	C	T	8567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-1.217;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.630;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,224:455:99:8596,0,8709
chr3	2526607	.	C	T	8640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.093;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.093;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,224:449:99:8669,0,8602
chr3	2527088	.	GATAT	G	7231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.420;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.054;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,247:474:99:7269,0,9908
chr3	2528019	.	G	A	9257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=2.020;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.004;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,244:516:99:9286,0,10622
chr3	2528033	.	C	T	9186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-1.313;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.993;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,248:531:99:9215,0,10874
chr3	2528112	.	C	T	7784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=1.103;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.578;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.499;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,254:489:99:7813,0,7434
chr3	2528329	.	C	A	8929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=1.533;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.315;QD=20.29;ReadPosRankSum=2.018;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,227:440:99:8958,0,8178
chr3	2528334	.	T	C	9270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=-1.471;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.437;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.971;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,232:441:99:9299,0,8332
chr3	2528340	.	A	T	9186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.989;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.291;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,238:442:99:9215,0,7812
chr3	2528385	.	A	G	9603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.790;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.486;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,252:494:99:9632,0,8832
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chr3	2538284	.	G	T	9290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-2.353;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.523;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,241:530:99:9319,0,11525
chr3	2538318	.	C	T	10050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=1.938;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.065;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,304:567:99:10079,0,8212
chr3	2538538	.	C	T	7261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.933;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.721;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,233:478:99:7290,0,7935
chr3	2538553	.	A	C	6755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.614;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.016;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,222:461:99:6784,0,7749
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chr3	2539436	.	A	G	10320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=-0.331;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.307;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.630;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,267:546:99:10349,0,10996
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chr3	2539464	.	C	T	10464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=1.873;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.734;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,265:525:99:10493,0,10039
chr3	2539497	.	A	G	8421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.747;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.997;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,257:497:99:8450,0,7744
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chr3	2540730	.	AT	A	3220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=-0.679;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=49.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.128;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.856;SOR=2.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,141:351:99:3258,0,5461
chr3	2542971	.	T	C	12702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.347;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.025;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,330:682:99:12731,0,18626
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chr3	2544363	.	AT	A	4858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.412;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.001;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.790;SOR=0.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,197:401:99:4896,0,5086
chr3	2544432	.	CTT	C	7447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.468;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.729;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.321;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,196:403:99:7485,0,7899
chr3	2544718	.	ATAAG	A	7802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.273;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.646;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,212:478:99:7840,0,10281
chr3	2545594	.	T	C	10076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=1.173;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.649;QD=17.77;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,265:567:99:10105,0,11759
chr3	2545599	.	T	C	10154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.222;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.414;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,267:564:99:10183,0,11665
chr3	2546448	.	G	A	6912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=-0.299;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.235;QD=15.60;ReadPosRankSum=2.876;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,206:443:99:6941,0,7674
chr3	2546534	.	T	C	7232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.165;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.528;QD=14.32;ReadPosRankSum=-8.673;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,241:505:99:7261,0,8246
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chr3	2546691	.	T	C	8627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.100;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.290;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,227:459:99:8656,0,15682
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chr3	2559062	.	G	T	8035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.537;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.464;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,197:415:99:8064,0,9029
chr3	2559065	.	T	A	7844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-0.519;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.365;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,195:415:99:7873,0,8996
chr3	2559081	.	T	A	7318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-1.022;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.249;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,196:426:99:7347,0,9474
chr3	2559105	.	T	C	8850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.627;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.205;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,222:407:99:8879,0,7631
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chr3	2563766	.	C	A	9927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.510;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.078;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,254:513:99:9956,0,10126
chr3	2563771	.	A	T	10102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.952;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.956;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.672;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,260:522:99:10131,0,10246
chr3	2563792	.	G	A	8457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-1.828;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.318;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,283:558:99:8486,0,8516
chr3	2564293	.	C	T	7421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-1.404;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.630;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,235:482:99:7450,0,7704
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chr3	2582524	.	A	G	7430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=2.037;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.635;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,246:486:99:7459,0,7430
chr3	2582701	.	C	A	7308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.723;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.767;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.889;SOR=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,243:467:99:7337,0,7010
chr3	2582774	.	GTAGAC	G	7632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-0.725;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.480;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,202:431:99:7670,0,8928
chr3	2582916	.	C	T	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=1.891;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.219;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,235:493:99:7117,0,7864
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chr3	2594139	.	G	C	9443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.311;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=13.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.30;MQRankSum=-7.718;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.702;SOR=0.285	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,230:316:99:9472,0,2499
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chr3	2617967	.	T	TG	6388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.195;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.397;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,242:500:99:6426,0,8362
chr3	2617969	.	G	GA	6418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.014;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.199;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,259:505:99:6456,0,7777
chr3	2618694	.	G	T	5632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.357;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.600;QD=14.37;ReadPosRankSum=2.560;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,189:392:99:5661,0,6328
chr3	2618938	.	T	A	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.930;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.933;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.280;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,238:486:99:9356,0,9705
chr3	2618945	.	T	C	9442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.935;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.161;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,246:501:99:9471,0,9884
chr3	2619007	.	G	A	6406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=-0.473;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.102;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,219:442:99:6435,0,6747
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chr3	2619522	.	G	A	8531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-1.282;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.037;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,275:535:99:8560,0,7870
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chr3	2621265	.	G	A	9441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.566;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.181;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.594;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,250:471:99:9470,0,8311
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chr3	2621487	.	G	T	7537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.441;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.934;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,253:500:99:7566,0,7104
chr3	2621933	.	C	T	6884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.214;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.767;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,230:481:99:6913,0,7873
chr3	2622304	.	A	C	7897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.320;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.848;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,255:497:99:7926,0,7613
chr3	2622728	.	A	G	6893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-1.177;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.206;QD=15.08;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,229:457:99:6922,0,6876
chr3	2623179	.	C	T	8824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.230;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.842;QD=16.22;ReadPosRankSum=2.585;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,285:544:99:8853,0,8061
chr3	2623418	.	G	A	7687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.164;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.778;QD=15.16;ReadPosRankSum=3.202;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,239:507:99:7716,0,8798
chr3	2623993	.	A	T	8625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.066;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.475;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,271:525:99:8654,0,7887
chr3	2624164	.	C	T	8865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.001;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.878;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.373;SOR=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,280:541:99:8894,0,7995
chr3	2624350	.	C	T	7867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.778;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.915;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,260:494:99:7896,0,7246
chr3	2624383	.	A	T	9545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-2.582;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.075;QD=20.01;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,254:477:99:9574,0,8376
chr3	2624403	.	TCCCC	T,TCCCCC	11423.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.327;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.629;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:2,217,212:431:99:11461,6507,9451,6103,0,9886
chr3	2624408	.	T	TTCA	4658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.917;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.164;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,217:443:99:4696,0,9037
chr3	2624412	.	C	CG	9146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.878;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.157;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,221:437:99:9184,0,8652
chr3	2624487	.	T	G	6541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.204;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.086;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,216:440:99:6570,0,7187
chr3	2624661	.	G	C	6307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.395;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.397;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,211:469:99:6336,0,7990
chr3	2625222	.	T	G	7770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-1.185;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.087;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,244:490:99:7799,0,7445
chr3	2626370	.	A	G	6624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.284;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.181;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,220:434:99:6653,0,6557
chr3	2626534	.	T	C	7543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.276;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.454;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.883;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,264:524:99:7572,0,7461
chr3	2626694	.	A	G	4444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.253;ClippingRankSum=0.942;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=6.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=1.012;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.530;SOR=1.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,143:302:99:4473,0,4594
chr3	2626840	.	T	C	7660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.023;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.832;QD=15.48;ReadPosRankSum=4.123;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,251:495:99:7689,0,7791
chr3	2627359	.	C	T	8599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.693;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.617;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,279:550:99:8628,0,8570
chr3	2627681	.	T	A	7788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.165;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.273;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,246:506:99:7817,0,8106
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chr3	2629438	.	C	T	7868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.331;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.671;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,240:457:99:7897,0,6791
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chr3	2633325	.	G	T	8587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.609;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,276:539:99:8616,0,8137
chr3	2633383	.	C	T	10874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=-0.060;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.588;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,283:573:99:10903,0,11205
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chr3	2633470	.	G	T	8276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.509;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.824;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,255:482:99:8305,0,7148
chr3	2633602	.	G	A	7438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.209;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.809;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,253:554:99:7467,0,9008
chr3	2633672	.	T	A	10730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.654;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.537;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,278:504:99:10759,0,8673
chr3	2633693	.	A	C	11394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-2.513;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.013;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,285:534:99:11423,0,9837
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chr3	2636166	.	G	T	9295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.462;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.259;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.487;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,311:606:99:9324,0,8825
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chr3	2636277	.	A	G	7969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.441;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.656;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,266:540:99:7998,0,8430
chr3	2636352	.	G	A	9195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.171;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.582;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,292:568:99:9224,0,8756
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chr3	2641705	.	T	A	10061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.827;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.176;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,260:492:99:10090,0,8973
chr3	2641709	.	A	T	10031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-1.440;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.891;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,260:493:99:10060,0,8929
chr3	2641748	.	A	AT	4754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-1.030;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=5.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.083;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,219:410:99:4792,0,4078
chr3	2641785	.	G	A	6557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.428;ClippingRankSum=-0.498;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.067;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,235:440:99:6586,0,6256
chr3	2642756	.	C	A	8936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=2.034;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.425;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,286:509:99:8965,0,6618
chr3	2643077	.	A	G	7499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.940;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.316;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,239:476:99:7528,0,7582
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chr3	2658198	.	G	A	8395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.102;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.170;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,259:499:99:8424,0,7718
chr3	2667030	.	C	CA	11403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-1.581;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQRankSum=0.311;QD=30.99;ReadPosRankSum=1.563;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,367:368:99:11441,1112,0
chr3	2668253	.	AC	A	4299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.023;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.131;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,216:497:99:4337,0,9568
chr3	2668319	.	CA	C	9369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.024;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.958;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,259:499:99:9407,0,9257
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chr3	2672236	.	T	C	12020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.608;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.116;QD=21.54;ReadPosRankSum=2.122;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,307:558:99:12049,0,11144
chr3	2672240	.	T	C	11982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=1.472;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.328;QD=21.63;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,304:554:99:12011,0,11128
chr3	2672354	.	A	G	8741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.473;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=5.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.728;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,274:526:99:8770,0,7669
chr3	2672655	.	T	A	5933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-1.355;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.206;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,196:409:99:5971,0,6456
chr3	2672738	.	C	T	7523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.041;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,239:466:99:7552,0,7331
chr3	2672953	.	C	T	9087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.646;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.621;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,241:461:99:9116,0,6872
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chr3	2675217	.	C	CT	3751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=2.099;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.414;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,182:438:99:3789,0,9994
chr3	2675220	.	C	T	8067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=1.277;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.960;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,226:479:99:8096,0,9607
chr3	2675226	.	TTC	T	9113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.128;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.272;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.334;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,249:486:99:9151,0,8900
chr3	2675470	.	T	TC	9443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=-1.014;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.105;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,299:580:99:9481,0,10318
chr3	2675471	.	C	CT	6857.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.320;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.039;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,271:579:99:6895,0,11613
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chr3	2678213	.	TTTATTCTTTC	T	6556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.844;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.970;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,174:390:99:6594,0,8553
chr3	2678223	.	C	CACT	8515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=2.242;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.012;QD=21.84;ReadPosRankSum=-2.373;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,216:390:99:8553,0,6601
chr3	2678285	.	C	CA	6194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.411;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.180;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,232:466:99:6232,0,6184
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chr3	2679533	.	GA	G	5128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.086;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.157;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,194:443:99:5166,0,9315
chr3	2679804	.	A	G	8804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.124;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.347;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,273:549:99:8833,0,8705
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chr3	2679975	.	T	C	8438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-2.382;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.139;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,274:516:99:8467,0,7264
chr3	2680233	.	C	T	7653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=1.036;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.177;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.056;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,240:490:99:7682,0,7736
chr3	2680291	.	G	A	8170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.274;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.412;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,270:531:99:8199,0,7829
chr3	2680332	.	G	A	11324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.233;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.499;QD=21.33;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,288:531:99:11353,0,9462
chr3	2680334	.	T	C	11291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.432;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.926;QD=21.39;ReadPosRankSum=2.012;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,283:528:99:11320,0,9465
chr3	2680437	.	C	T	8839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=-0.745;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.322;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,233:447:99:8868,0,7859
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chr3	2682327	.	G	GA	7262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.777;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.418;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.198;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,235:467:99:7300,0,8675
chr3	2682342	.	C	A	8847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.775;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.014;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,236:483:99:8876,0,9332
chr3	2682489	.	G	A	6249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-2.301;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.278;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,212:492:99:6278,0,8871
chr3	2682667	.	ACT	A	11135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=1.875;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=7.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.096;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,282:531:99:11173,0,9726
chr3	2682676	.	A	G	11447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.657;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=9.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.138;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.310;SOR=1.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,296:559:99:11476,0,9819
chr3	2683654	.	A	ATGGATC	8265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.063;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.234;QD=19.18;ReadPosRankSum=-2.604;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,210:431:99:8303,0,8554
chr3	2683737	.	A	G	7553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=1.283;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.284;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.787;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,237:480:99:7582,0,7711
chr3	2683784	.	G	A	8386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.133;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.228;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,275:537:99:8415,0,8053
chr3	2683838	.	G	A	8453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.756;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.032;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.862;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,294:577:99:8482,0,8369
chr3	2683901	.	C	T	10217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.356;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.307;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.246;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,326:591:99:10246,0,7999
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chr3	2693028	.	CTCATTATCATCATCA	C	9362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.543;ClippingRankSum=0.601;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-1.789;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.897;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,274:646:99:9400,0,13713
chr3	2693320	.	T	G	9445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.526;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.213;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,292:558:99:9474,0,8063
chr3	2693412	.	C	T	9805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.132;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.293;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,249:474:99:9834,0,15094
chr3	2693413	.	G	A	9805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=1.924;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.296;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.265;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,250:468:99:9834,0,15094
chr3	2693725	.	T	G	7820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-1.606;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.732;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,262:527:99:7849,0,8326
chr3	2693809	.	G	A	8928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.806;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.537;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,234:460:99:8957,0,9026
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chr3	2695972	.	T	TC	6373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.545;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.172;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.996;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,246:526:99:6411,0,9167
chr3	2695974	.	C	CT	6896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-1.000;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.188;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.708;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,271:520:99:6934,0,7735
chr3	2696428	.	G	A	7800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.685;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.938;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,254:517:99:7829,0,8277
chr3	2696924	.	C	T	7791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=2.004;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.084;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,250:521:99:7820,0,8793
chr3	2697026	.	T	C	7772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.847;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.072;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,240:476:99:7801,0,7432
chr3	2697134	.	A	G	8346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.232;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.664;QD=16.08;ReadPosRankSum=-1.423;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,264:519:99:8375,0,7851
chr3	2697277	.	C	G	8603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-1.956;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.446;QD=15.28;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,280:563:99:8632,0,9114
chr3	2697324	.	C	G	8097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.492;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.602;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.417;SOR=0.432	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,255:550:99:8126,0,9530
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chr3	2704445	.	T	A	8634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.424;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.359;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,217:458:99:8663,0,9618
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chr3	2704771	.	T	C	9069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=1.129;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.244;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,288:572:99:9098,0,8734
chr3	2704973	.	G	T	7877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.135;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.398;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,251:465:99:7906,0,6469
chr3	2705246	.	C	T	9459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=-1.760;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.625;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,302:575:99:9488,0,8655
chr3	2705605	.	C	A	7219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.659;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.232;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,237:484:99:7248,0,7600
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chr3	2709529	.	A	G	9075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.734;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.936;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,294:563:99:9104,0,8285
chr3	2709568	.	A	G	10029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=-0.046;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.590;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,317:602:99:10058,0,8315
chr3	2709925	.	AT	A	5942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.431;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.351;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,230:498:99:5980,0,8810
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chr3	2712189	.	T	C	7548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=1.350;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.040;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,199:442:99:7577,0,9424
chr3	2712223	.	G	A	8187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=-1.164;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.340;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,218:460:99:8216,0,9032
chr3	2712245	.	T	A	9620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.931;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.503;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,243:475:99:9649,0,9167
chr3	2712248	.	T	C	9499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=1.069;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.003;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.786;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,238:460:99:9528,0,8863
chr3	2712551	.	A	AT	10073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.459;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.006;QD=19.30;ReadPosRankSum=2.030;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,264:522:99:10111,0,9970
chr3	2712567	.	C	G	10873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.234;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.844;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,289:573:99:10902,0,10434
chr3	2712648	.	T	C	13422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.125;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.350;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,339:627:99:13451,0,10753
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chr3	2712679	.	G	C	13875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.261;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.607;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,336:604:99:13904,0,11397
chr3	2712696	.	C	T	12911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.765;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.441;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,330:604:99:12940,0,10230
chr3	2712731	.	T	A	10466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=1.260;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.450;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,330:626:99:10495,0,9357
chr3	2712803	.	G	A	9858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-0.342;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.029;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,305:590:99:9887,0,8783
chr3	2712867	.	A	G	9238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.358;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.323;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,296:567:99:9267,0,8115
chr3	2712916	.	G	GT	6784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.030;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.199;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,273:536:99:6822,0,8410
chr3	2712919	.	T	TG	7372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.675;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.059;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,263:549:99:7410,0,8841
chr3	2713029	.	A	C	9454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.453;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.643;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,315:674:99:9483,0,11190
chr3	2713140	.	C	T	12405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=1.513;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.657;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.771;SOR=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,323:651:99:12434,0,12565
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chr3	2713177	.	C	T	12297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.315;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.928;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,309:643:99:12326,0,13459
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chr3	2721391	.	T	A	10603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=-2.838;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-2.158;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,284:560:99:10632,0,11120
chr3	2721403	.	G	GACAACA	11151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.354;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-3.386;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,273:558:99:11189,0,12177
chr3	2721421	.	G	A	10315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=-0.840;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-2.957;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=1.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,257:546:99:10344,0,12608
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chr3	2721445	.	T	C	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.176;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=6.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-0.661;QD=18.33;ReadPosRankSum=-2.234;SOR=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,221:483:99:8884,0,10684
chr3	2721449	.	A	T	8654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.116;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-1.194;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.699;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,213:472:99:8683,0,10573
chr3	2721456	.	C	T	8210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.389;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-0.065;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,198:439:99:8239,0,10354
chr3	2721457	.	C	A	8126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.862;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-2.430;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,200:445:99:8155,0,10360
chr3	2721470	.	G	T	7940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.895;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-1.795;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,200:443:99:7969,0,10039
chr3	2721476	.	A	G	7754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.765;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-3.887;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,193:431:99:7783,0,9718
chr3	2721481	.	A	G	7537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.646;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-2.974;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,191:427:99:7566,0,9790
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chr3	2721593	.	A	T	6630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.682;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=1.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.012;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.854;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,212:399:99:6659,0,5913
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chr3	2724284	.	ATT	A	5124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-2.073;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.788;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,177:339:99:5162,0,4429
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chr3	2726598	.	TC	T	6559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.146;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.227;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,222:502:99:6597,0,8961
chr3	2726599	.	CT	C	8409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.919;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.069;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,280:503:99:8447,0,7024
chr3	2726867	.	G	GA	9133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-1.710;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.098;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,269:564:99:9171,0,10143
chr3	2726898	.	T	C	7915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.353;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.588;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.859;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,255:539:99:7944,0,9108
chr3	2727011	.	G	A	6374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.598;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.291;QD=15.14;ReadPosRankSum=3.263;SOR=0.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,198:421:99:6403,0,7220
chr3	2727126	.	T	A	9071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=-0.973;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.948;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,232:434:99:9100,0,7662
chr3	2727132	.	G	A	9118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-1.655;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.066;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,231:433:99:9147,0,7806
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chr3	2727171	.	GA	G	7393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=1.008;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.755;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.409;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,231:438:99:7431,0,6512
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chr3	2734602	.	G	T	7858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.546;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.679;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.573;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,206:468:99:7887,0,10333
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chr3	2734653	.	A	T	6808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-0.055;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.272;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,222:510:99:6837,0,9219
chr3	2734692	.	G	A	7100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-1.843;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.710;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,235:511:99:7129,0,8636
chr3	2734789	.	C	T	10531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=2.187;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.131;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,277:559:99:10560,0,10869
chr3	2734802	.	A	G	10763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.074;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.265;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,280:560:99:10792,0,10635
chr3	2734842	.	A	G	9249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-0.791;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.914;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,302:574:99:9278,0,8480
chr3	2734878	.	G	A	11554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=2.444;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.702;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,302:579:99:11583,0,10590
chr3	2734885	.	A	G	11553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.495;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.992;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,299:577:99:11582,0,10608
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chr3	2737281	.	G	C	11212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.162;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.300;QD=21.44;ReadPosRankSum=2.213;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,281:523:99:11241,0,9483
chr3	2737317	.	T	TC	6489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-0.584;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.422;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,203:462:99:6527,0,8562
chr3	2737318	.	C	CG	8463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.990;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.119;QD=17.93;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,266:472:99:8501,0,6527
chr3	2737351	.	C	T	9752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=1.447;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.002;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,258:526:99:9781,0,10163
chr3	2737370	.	C	T	10557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-0.243;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.375;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,264:539:99:10586,0,11004
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chr3	2741403	.	T	C	8160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.862;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.310;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,263:537:99:8189,0,8683
chr3	2741460	.	A	G	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.324;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.358;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.794;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,279:549:99:8973,0,8328
chr3	2741505	.	T	G	11516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=1.178;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.767;QD=19.93;ReadPosRankSum=1.041;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,295:578:99:11545,0,10764
chr3	2741510	.	C	T	11852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=1.298;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.675;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,294:562:99:11881,0,11031
chr3	2741520	.	A	G	12559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.504;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.020;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,307:583:99:12588,0,11149
chr3	2741523	.	A	G	12092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-1.035;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.893;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,310:594:99:12121,0,10928
chr3	2741570	.	T	C	12602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.568;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.886;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,317:619:99:12631,0,11648
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chr3	2748871	.	GAAAAAAAAAAAA	G	8533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=-1.029;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=94.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=5.846;QD=32.45;ReadPosRankSum=6.249;SOR=0.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,201:263:99:8571,0,2115
chr3	2748923	.	AT	A	4464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=-0.523;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=17.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=0.058;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.749;SOR=1.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,122:368:99:4502,0,10025
chr3	2748924	.	TA	T	9632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.766;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=15.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-1.213;QD=26.39;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,239:365:99:9670,0,4869
chr3	2748926	.	G	T	9695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=-0.444;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=16.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.620;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.421;SOR=0.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,241:368:99:9724,0,5030
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chr3	2753730	.	T	G	7886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=-1.282;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.289;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.640;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,266:537:99:7915,0,8412
chr3	2753838	.	C	T	8795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.756;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.856;QD=16.02;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,278:549:99:8824,0,8817
chr3	2753954	.	T	A	8265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=-1.670;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.078;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,272:557:99:8294,0,8112
chr3	2754042	.	C	T	8964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.108;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.261;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,287:615:99:8993,0,10644
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chr3	2756277	.	TG	T	6793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=2.666;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=6.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.003;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,245:523:99:6831,0,8561
chr3	2756279	.	GA	G	7086.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.034;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.701;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,271:519:99:7124,0,7812
chr3	2756981	.	T	C	8757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.388;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.878;QD=19.42;ReadPosRankSum=-2.638;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,231:451:99:8786,0,11033
chr3	2756992	.	C	T	8740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.321;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.048;QD=19.51;ReadPosRankSum=-2.689;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,228:448:99:8769,0,11044
chr3	2757092	.	G	T	3698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.477;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.679;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,176:390:99:3727,0,6449
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chr3	2762148	.	C	T	8501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=1.040;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.464;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,210:410:99:8530,0,7891
chr3	2762152	.	C	T	8081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.321;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.668;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,205:399:99:8110,0,7660
chr3	2762185	.	G	T	8791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.714;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.179;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,224:436:99:8820,0,8350
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chr3	2764840	.	T	C	7581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.001;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.103;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,248:512:99:7610,0,8131
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chr3	2772439	.	A	T	8400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.079;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.869;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,275:565:99:8429,0,8904
chr3	2772497	.	CG	C	9049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.753;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.392;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,240:519:99:9087,0,10776
chr3	2772498	.	GA	G	7621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-2.168;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.257;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,271:514:99:7659,0,9276
chr3	2772511	.	G	T	9740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.939;ClippingRankSum=0.394;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.390;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,240:517:99:9769,0,11425
chr3	2772513	.	G	A	9537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.371;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.061;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,242:520:99:9566,0,11170
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chr3	2775123	.	A	C	9072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.741;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.998;QD=17.79;ReadPosRankSum=-2.593;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,234:510:99:9101,0,14135
chr3	2775125	.	C	A	9072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.181;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.660;QD=17.79;ReadPosRankSum=-2.996;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,238:510:99:9101,0,14135
chr3	2775431	.	A	G	10834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-1.322;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.491;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,291:573:99:10863,0,10311
chr3	2775455	.	G	A	10868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-0.847;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.169;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,291:569:99:10897,0,10363
chr3	2775499	.	G	A	10055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.836;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.970;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,266:525:99:10084,0,9835
chr3	2775522	.	C	G	9755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.732;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.361;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,262:535:99:9784,0,10079
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chr3	2779970	.	A	G	13230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.214;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.372;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,329:626:99:13259,0,13983
chr3	2779983	.	G	A	12785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=1.639;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.339;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,314:603:99:12814,0,13451
chr3	2779986	.	TAC	T	12505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.874;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.669;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,312:602:99:12543,0,13473
chr3	2779990	.	T	C	12185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=1.744;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.718;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,314:595:99:12214,0,12718
chr3	2780264	.	A	G	8307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.346;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.498;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,274:616:99:8336,0,10198
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chr3	2780624	.	C	T	6780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-1.700;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.406;QD=14.43;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,215:470:99:6809,0,8102
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chr3	2785332	.	CA	C	5607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.716;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.702;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.680;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,234:439:99:5645,0,4564
chr3	2785425	.	T	C	10410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.789;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.264;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,271:514:99:10439,0,9309
chr3	2785435	.	C	T	9767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.398;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.977;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.628;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,254:498:99:9796,0,9878
chr3	2785456	.	C	T	9704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=-1.160;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.984;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,258:488:99:9733,0,8649
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chr3	2798019	.	A	G	6828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.819;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=4.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.311;QD=16.30;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,216:419:99:6857,0,6359
chr3	2798101	.	GC	G	5779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.282;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.478;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,208:416:99:5817,0,6783
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chr3	2801714	.	C	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.890;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.42;MQRankSum=0.350;QD=34.18;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=5.709	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,51:53:90:1840,90,0
chr3	2806382	.	TATTG	T	6292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.94;QD=35.12;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,141:141:99:6330,425,0
chr3	2806462	.	C	T	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;QD=30.02;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:5607,385,0
chr3	2806470	.	G	C	5962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.09;QD=29.27;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:5991,409,0
chr3	2806474	.	A	G	5716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.99;QD=22.17;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,128:128:99:5745,394,0
chr3	2806486	.	A	G	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.01;QD=30.32;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:4212,414,0
chr3	2806749	.	T	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.39;QD=33.85;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2052,159,0
chr3	2806762	.	G	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.34;QD=27.80;SOR=4.103	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2283,178,0
chr3	2807596	.	C	T	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.68;QD=30.97;SOR=5.943	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:2506,240,0
chr3	2809738	.	T	C	2906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.080;ClippingRankSum=0.851;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=33.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.75;MQRankSum=3.410;QD=30.60;ReadPosRankSum=-2.695;SOR=3.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,73:95:99:2935,0,704
chr3	2809747	.	G	A	3125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.703;ClippingRankSum=0.270;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=28.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.18;MQRankSum=4.314;QD=31.26;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=3.316	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,78:100:99:3154,0,683
chr3	2809976	.	C	T	6783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;QD=34.79;SOR=1.007	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:6812,584,0
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chr3	2812688	.	TA	T	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.517;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQRankSum=-4.070;QD=2.37;ReadPosRankSum=-4.132;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,11:72:99:208,0,2528
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chr3	2822636	.	T	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.685;ClippingRankSum=1.339;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=97.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.08;MQRankSum=0.026;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.538;SOR=6.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:114,23:137:99:648,0,5566
chr3	2823127	.	TC	T	4046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.38;QD=24.11;SOR=1.995	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:4084,274,0
chr3	2823137	.	G	T	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.22;QD=30.71;SOR=1.436	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:4761,319,0
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chr3	2823141	.	G	C	4878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;QD=26.15;SOR=1.526	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,111:111:99:4907,334,0
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chr3	2828506	.	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.507;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=87.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.51;MQRankSum=-3.597;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.952;SOR=2.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,46:226:99:798,0,5545
chr3	2828557	.	C	G	3206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.499;ClippingRankSum=2.018;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=10.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.73;MQRankSum=-2.571;QD=17.24;ReadPosRankSum=-5.773;SOR=1.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,106:186:99:3235,0,1612
chr3	2828587	.	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=0.801;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.21;MQRankSum=-5.559;QD=15.69;ReadPosRankSum=-2.310;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,85:156:99:2476,0,2560
chr3	2828596	.	G	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=1.323;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=34.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.68;MQRankSum=3.625;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=2.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,64:152:99:1483,0,3380
chr3	2828630	.	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.265;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=39.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.46;MQRankSum=1.494;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.545;SOR=3.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,19:167:99:184,0,4542
chr3	2828684	.	GA	G	7686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.20;QD=28.29;SOR=1.556	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,174:174:99:7724,524,0
chr3	2828693	.	G	A	8038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.45;QD=28.63;SOR=1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:8067,545,0
chr3	2828710	.	A	C	7794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.48;QD=34.79;SOR=1.233	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,172:172:99:7823,548,0
chr3	2828898	.	C	CTT	372.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.42;MQRankSum=-1.109;QD=31.04;ReadPosRankSum=-2.034;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,9:12:7:409,7,0
chr3	2829216	.	C	T	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.827;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQRankSum=2.493;QD=12.28;ReadPosRankSum=3.423;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:80,81:161:99:2005,0,2037
chr3	2830818	.	TC	T	5104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.49;QD=28.50;SOR=1.591	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:5142,388,0
chr3	2830854	.	GA	G	4545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;QD=28.23;SOR=1.207	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:4583,484,0
chr3	2831473	.	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-1.281;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=71.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.30;MQRankSum=-5.236;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.752;SOR=2.279	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,43:243:99:812,0,6053
chr3	2831514	.	C	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;ClippingRankSum=0.180;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=70.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.21;MQRankSum=0.180;QD=9.88;ReadPosRankSum=4.648;SOR=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,80:190:99:1906,0,3501
chr3	2831536	.	A	C,AT	3284.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=41.50;QD=26.92;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,89,33:122:99:3322,1045,1686,2568,0,3474
chr3	2832266	.	GA	G	9049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;QD=28.96;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,245:245:99:9087,738,0
chr3	2833527	.	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.673;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.81;MQRankSum=-0.441;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:297,0,416
chr3	2838203	.	C	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.57;QD=34.55;SOR=2.584	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:581,48,0
chr3	2839344	.	G	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-1.576;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=55.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.55;MQRankSum=1.741;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.088;SOR=2.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,36:100:99:939,0,1853
chr3	2839413	.	C	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.459;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=33.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.94;MQRankSum=-0.634;QD=12.90;ReadPosRankSum=5.579;SOR=1.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,54:104:99:1370,0,1835
chr3	2839424	.	A	AT	1043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.977;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=83.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.03;MQRankSum=1.190;QD=10.65;ReadPosRankSum=-3.770;SOR=3.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,48:98:99:1081,0,1919
chr3	2841476	.	G	T	4110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;ClippingRankSum=0.330;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=131.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.24;MQRankSum=-1.023;QD=31.38;ReadPosRankSum=-2.120;SOR=1.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,102:131:99:4139,0,1005
chr3	2841484	.	T	A	4290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.472;ClippingRankSum=0.494;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=105.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.51;MQRankSum=0.778;QD=31.78;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,109:135:99:4319,0,959
chr3	2841504	.	T	C	4047.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=-0.479;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=62.391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQRankSum=2.047;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.388;SOR=1.210	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:15,148:163:13:4076,13,0
chr3	2841516	.	C	T	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.104;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=32.670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQRankSum=1.030;QD=27.03;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:9,161:170:99:4624,225,0
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chr3	2841975	.	TC	T	2568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.580;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=58.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.37;MQRankSum=-9.163;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=2.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,79:223:99:2606,0,5803
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chr3	2844361	.	G	C	6628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.501;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.475;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,218:434:99:6657,0,6587
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chr3	2844514	.	T	C	9649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.184;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.098;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,250:475:99:9678,0,8571
chr3	2844565	.	T	C	9286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-1.039;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.652;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,236:458:99:9315,0,8498
chr3	2844568	.	A	G	9250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-3.062;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.106;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,237:456:99:9279,0,8572
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chr3	2857487	.	CCAAAATATATCGAAAATATATCGAAAATATATACAAAGTATAT	C	5487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;ClippingRankSum=0.597;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=9.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.622;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,147:386:99:5525,0,9328
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chr3	2858618	.	C	T	6502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.996;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.372;QD=14.32;ReadPosRankSum=2.678;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,216:454:99:6531,0,7117
chr3	2858675	.	T	C	8404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-0.443;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.549;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.507;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,222:447:99:8433,0,8864
chr3	2858684	.	A	C	8488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.158;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.104;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,214:439:99:8517,0,8983
chr3	2858687	.	G	A	8388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=1.438;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.204;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,215:439:99:8417,0,8866
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chr3	2867390	.	C	A	11658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=1.018;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.738;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,300:558:99:11687,0,9990
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chr3	2867619	.	G	A	9590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.578;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.486;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,308:608:99:9619,0,9464
chr3	2867645	.	G	A	8116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.055;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.005;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.694;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,265:563:99:8145,0,9530
chr3	2867801	.	A	G	7388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.934;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.071;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,234:509:99:7417,0,8793
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chr3	2888973	.	A	G	8441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.934;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.162;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,223:482:99:8470,0,9907
chr3	2888995	.	C	T	9466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.846;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.476;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,243:507:99:9495,0,10582
chr3	2889002	.	A	G	9233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.317;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.518;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.376;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,233:505:99:9262,0,11218
chr3	2889017	.	G	T	9296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.331;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.474;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,237:514:99:9325,0,11530
chr3	2889025	.	A	G	9044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.994;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.051;QD=17.88;ReadPosRankSum=2.283;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,225:506:99:9073,0,11548
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chr3	2890612	.	C	T	9662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.754;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.268;QD=19.36;ReadPosRankSum=-2.423;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,247:499:99:9691,0,9851
chr3	2890677	.	G	GT	3843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.840;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.064;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.454;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,185:416:99:3881,0,5235
chr3	2895931	.	C	T	8912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.281;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.265;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.476;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,285:535:99:8941,0,7806
chr3	2904169	.	T	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.019;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=6.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.720;QD=6.32;ReadPosRankSum=-4.820;SOR=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,88:257:99:1653,0,4400
chr3	2906443	.	GC	G	7182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.177;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.319;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,255:556:99:7220,0,9115
chr3	2906444	.	CT	C	8580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.051;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.162;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,298:557:99:8618,0,7626
chr3	2906764	.	C	T	7749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.796;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.295;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,244:498:99:7778,0,8337
chr3	2907235	.	G	A	8107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=1.614;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.459;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.860;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,212:436:99:8136,0,8698
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chr3	2910187	.	A	G	9128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=1.502;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.401;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,241:501:99:9157,0,9949
chr3	2910200	.	G	A	9591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=1.876;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.219;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,244:491:99:9620,0,10043
chr3	2910215	.	GC	G	9730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=-0.658;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.760;QD=19.70;ReadPosRankSum=2.568;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,251:494:99:9768,0,9895
chr3	2910216	.	CT	C	9371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-0.458;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.231;QD=19.01;ReadPosRankSum=-2.543;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,240:493:99:9409,0,10336
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chr3	2913166	.	CT	C	6594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.551;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.754;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,254:527:99:6632,0,9052
chr3	2913169	.	TC	T	8266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.605;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.553;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,274:536:99:8304,0,8170
chr3	2913418	.	G	T	8671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=-0.766;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.258;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,281:500:99:8700,0,6355
chr3	2914062	.	G	T	7201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.051;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.394;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,225:491:99:7230,0,8352
chr3	2914892	.	G	A	11697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=-0.558;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.017;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,296:525:99:11726,0,21996
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chr3	2917116	.	ATTGCCACCTTCT	A	6049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-0.664;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-4.228;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.312;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,168:441:99:6087,0,10910
chr3	2917244	.	G	T	6340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=-0.115;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.834;QD=14.95;ReadPosRankSum=2.676;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,214:424:99:6369,0,6812
chr3	2917305	.	C	G	7225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.749;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,239:442:99:7254,0,6011
chr3	2917334	.	A	G	6756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=1.013;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.706;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,225:423:99:6785,0,5787
chr3	2917394	.	T	C	6368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.289;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.311;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,211:430:99:6397,0,6751
chr3	2917432	.	C	T	7195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=1.475;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=16.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.732;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,187:400:99:7224,0,8294
chr3	2917433	.	C	G	7195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.016;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=17.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.849;QD=17.99;ReadPosRankSum=2.684;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,187:400:99:7224,0,8294
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chr3	2920061	.	T	A	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.699;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.567;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.604;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,111:371:99:2815,0,8597
chr3	2920126	.	C	CG	5922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.474;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.122;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,209:436:99:5960,0,8516
chr3	2920128	.	G	GA	8661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.093;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.360;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,230:448:99:8699,0,8065
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chr3	2923223	.	A	G	8353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.337;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.904;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,222:482:99:8382,0,10099
chr3	2923229	.	A	G	8370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-0.478;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.633;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.136;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,222:478:99:8399,0,10224
chr3	2923540	.	A	T	7365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-1.120;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.375;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,230:467:99:7394,0,7433
chr3	2923573	.	A	AT	6263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.492;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.562;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,233:455:99:6301,0,7144
chr3	2923574	.	T	TC	6734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.283;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.846;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,222:463:99:6772,0,7693
chr3	2923629	.	T	C	7622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-0.788;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.449;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,245:492:99:7651,0,7605
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chr3	2925167	.	C	T	9615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.231;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.009;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,307:606:99:9644,0,9501
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chr3	2928288	.	T	C	9266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-2.068;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.848;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,240:500:99:9295,0,10106
chr3	2928302	.	A	T	10131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.438;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.307;QD=19.91;ReadPosRankSum=-1.127;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,248:509:99:10160,0,10641
chr3	2928324	.	A	T	10439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.396;ClippingRankSum=0.691;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.246;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,261:528:99:10468,0,10703
chr3	2928332	.	T	TAA	10264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=-0.598;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.322;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,257:522:99:10302,0,10418
chr3	2928367	.	A	ATT	10339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.962;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.975;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,255:555:99:10377,0,12140
chr3	2928369	.	T	A	10672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.605;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.869;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,266:575:99:10701,0,12284
chr3	2928378	.	T	C	11588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.367;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.721;QD=19.19;ReadPosRankSum=-2.248;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,289:604:99:11617,0,12660
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chr3	2932897	.	T	C	12071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=1.327;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.375;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,314:584:99:12100,0,10183
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chr3	2932903	.	T	TG	7718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-0.138;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.189;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,253:561:99:7756,0,12267
chr3	2933212	.	G	A	10024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-1.561;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.376;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,319:599:99:10053,0,8588
chr3	2933350	.	G	A	10753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=1.242;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.354;QD=20.03;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,277:537:99:10782,0,9751
chr3	2933366	.	GC	G	8895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=1.058;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.466;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.712;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,270:558:99:8933,0,10992
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chr3	2938362	.	A	C	8868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.794;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.477;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.360;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,287:576:99:8897,0,8815
chr3	2939367	.	C	T	8867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.099;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.704;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,280:536:99:8896,0,7763
chr3	2939641	.	C	T	8479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.321;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.257;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,277:563:99:8508,0,8930
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chr3	2944194	.	C	T	11468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.607;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.750;QD=20.48;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,295:560:99:11497,0,10195
chr3	2944203	.	CA	C	11260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.428;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.011;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,279:556:99:11298,0,10914
chr3	2944204	.	AT	A	9125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.684;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.265;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,275:557:99:9163,0,11242
chr3	2944219	.	TTGC	T	10363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-1.401;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.217;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.417;SOR=1.095	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,258:528:99:10401,0,10672
chr3	2944355	.	T	C	7879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=1.134;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.933;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.925;SOR=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,263:507:99:7908,0,7165
chr3	2944514	.	G	T	10184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-0.619;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.673;QD=17.35;ReadPosRankSum=-2.352;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,318:587:99:10213,0,10322
chr3	2944516	.	A	C	8074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.559;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.116;QD=13.78;ReadPosRankSum=2.549;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,269:586:99:8103,0,12642
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chr3	2944918	.	TCC	T,CCC	4990.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=2.492;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=13.376;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-2.190;QD=27.57;ReadPosRankSum=2.341;SOR=1.346	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:12,143,26:181:99:5028,267,1498,4680,0,7118
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chr3	2951542	.	TG	T	10699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=1.372;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=5.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.040;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.280;SOR=0.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,316:608:99:10737,0,11233
chr3	2951544	.	AT	A	9845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.164;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=5.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.982;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,293:621:99:9883,0,12438
chr3	2951669	.	A	G	9767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.693;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.955;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,312:547:99:9796,0,6979
chr3	2953404	.	C	T	8007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.320;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.706;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,259:526:99:8036,0,8140
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chr3	2959308	.	A	AG	6464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-0.723;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.634;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,175:384:99:6502,0,8051
chr3	2959311	.	G	GA	4919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=2.041;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.097;QD=12.85;ReadPosRankSum=2.151;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,197:383:99:4957,0,7013
chr3	2959328	.	G	T	7985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.647;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.486;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,199:438:99:8014,0,9747
chr3	2959351	.	G	A	8076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.211;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.311;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,202:430:99:8105,0,9440
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chr3	2965651	.	A	AT	5307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.393;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.409;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,206:423:99:5345,0,7306
chr3	2965654	.	T	TG	6251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-1.073;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.731;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,221:444:99:6289,0,6981
chr3	2965854	.	G	A	9195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.647;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.146;QD=15.46;ReadPosRankSum=-2.553;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,300:595:99:9224,0,9385
chr3	2965897	.	G	A	9683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.025;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.889;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.816;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,306:628:99:9712,0,10240
chr3	2966460	.	TG	T	6990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=1.006;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.314;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,234:485:99:7028,0,7834
chr3	2966461	.	GA	G	7305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.000;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.051;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,249:483:99:7343,0,7413
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chr3	2966795	.	C	T	7752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.451;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.085;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,260:542:99:7781,0,8896
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chr3	2971437	.	T	A	10900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.527;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.706;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,270:496:99:10929,0,9085
chr3	2971462	.	C	T	10480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.201;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=1.477;QD=20.39;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,270:514:99:10509,0,8901
chr3	2971490	.	T	A	8628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=1.183;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-2.393;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,265:515:99:8657,0,7727
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chr3	2973030	.	G	A	6299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.323;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.752;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,169:382:99:6328,0,8520
chr3	2973065	.	A	ATT	6025.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-0.328;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=3.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.467;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,155:353:99:6063,0,8017
chr3	2973069	.	G	A	6181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-0.273;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=14.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.342;QD=16.89;ReadPosRankSum=-2.309;SOR=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,160:366:99:6210,0,8265
chr3	2973077	.	A	G	6021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-0.806;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=10.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.250;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=1.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,151:352:99:6050,0,8255
chr3	2973091	.	A	G	6495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.369;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=10.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.606;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=1.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,166:364:99:6524,0,8054
chr3	2973095	.	C	A	6570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.067;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=10.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.211;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.002;SOR=1.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,169:369:99:6599,0,8174
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chr3	2975881	.	A	C	10668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.113;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.239;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,272:525:99:10697,0,11768
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chr3	2976005	.	T	C	9623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=-1.120;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.093;QD=18.98;ReadPosRankSum=4.437;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,258:507:99:9652,0,12567
chr3	2976029	.	A	G	9437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=2.069;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.675;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.838;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,254:509:99:9466,0,12520
chr3	2976130	.	C	A	8112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.785;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.156;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.184;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,247:468:99:8141,0,7053
chr3	2976333	.	C	T	13239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=1.366;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.645;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,352:678:99:13268,0,12498
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chr3	2978686	.	G	A	8396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.088;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.325;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,212:447:99:8425,0,23288
chr3	2978704	.	A	T	8150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.462;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.889;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.619;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,218:461:99:8179,0,22051
chr3	2978838	.	C	T	8614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.620;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.880;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,277:553:99:8643,0,8704
chr3	2979303	.	G	A	9509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.467;ClippingRankSum=1.448;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.225;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.482;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,303:602:99:9538,0,8213
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chr3	2984986	.	A	G	9548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=-1.490;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.745;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,307:600:99:9577,0,9404
chr3	2985023	.	A	G	9000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=1.053;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.542;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,289:566:99:9029,0,8582
chr3	2985120	.	T	C	10024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-1.244;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.973;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,260:533:99:10053,0,10521
chr3	2985132	.	G	C	10604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-0.426;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.802;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,263:533:99:10633,0,11020
chr3	2985147	.	C	T	10558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.026;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.170;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,263:521:99:10587,0,10411
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chr3	2985196	.	TC	T	4723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.053;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.278;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,224:467:99:4761,0,7895
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chr3	2987345	.	GA	G	10200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=0.355;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.518;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,255:523:99:10238,0,10542
chr3	2987355	.	G	GA	7954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.299;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.971;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,254:533:99:7992,0,8657
chr3	2987357	.	A	AG	8494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.422;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.088;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,282:546:99:8532,0,7998
chr3	2987421	.	G	A	9083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.122;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.267;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,282:537:99:9112,0,7818
chr3	2987435	.	A	G	7945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=1.375;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.361;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,265:555:99:7974,0,8848
chr3	2987582	.	T	C	12086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.163;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.858;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,330:657:99:12115,0,12808
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chr3	2991169	.	T	A	8618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.432;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.273;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,289:610:99:8647,0,9782
chr3	2991348	.	C	T	7414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=-0.026;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.311;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,243:496:99:7443,0,8008
chr3	2991474	.	AT	A	5670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.059;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.173;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,255:500:99:5708,0,5312
chr3	2991535	.	T	C	8039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=1.217;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.326;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,270:507:99:8068,0,6565
chr3	2991631	.	A	G	7855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.141;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.363;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,256:502:99:7884,0,7607
chr3	2991662	.	C	T	8074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.329;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.200;QD=15.86;ReadPosRankSum=-2.611;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,250:509:99:8103,0,8427
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chr3	2994723	.	T	C	6970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-0.443;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.780;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,181:382:99:6999,0,7985
chr3	2995030	.	T	TA	4698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.281;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=8.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.050;QD=12.14;ReadPosRankSum=10.913;SOR=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,213:387:99:4736,0,4209
chr3	2995102	.	C	T	9405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.441;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.856;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,250:439:99:9434,0,7343
chr3	2995125	.	G	A	10098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.811;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.935;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,246:468:99:10127,0,8894
chr3	2995129	.	T	C	9918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=-1.071;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=5.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.418	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,257:491:99:9947,0,8847
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chr3	2999547	.	C	T	6024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.598;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-4.661;QD=12.71;ReadPosRankSum=-3.426;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,212:474:99:6053,0,8151
chr3	2999588	.	C	A	7682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.545;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.555;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.889;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,246:463:99:7711,0,6475
chr3	2999626	.	A	G	7805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.541;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.072;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.814;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,211:419:99:7834,0,7842
chr3	2999649	.	AG	A,TG	17101.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=28.72;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,205,207:412:99:17139,8812,8168,8449,0,8226
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chr3	3003661	.	G	A	9305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.961;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.285;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,236:458:99:9334,0,8583
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chr3	3005953	.	C	CAA	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.876;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQRankSum=-3.765;QD=2.37;ReadPosRankSum=-2.407;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,32:170:99:440,0,5344
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chr3	3006531	.	C	T	10092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.327;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.228;QD=21.25;ReadPosRankSum=4.093;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,259:475:99:10121,0,12885
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chr3	3006637	.	C	T	9184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.200;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.819;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,244:471:99:9213,0,8764
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chr3	3006658	.	G	A	9885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.705;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.091;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,255:485:99:9914,0,9044
chr3	3006760	.	G	A	7820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=-0.578;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.601;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,259:495:99:7849,0,7338
chr3	3006790	.	C	A	10355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.921;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.275;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,271:506:99:10384,0,12669
chr3	3006799	.	A	G	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.649;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.590;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,270:518:99:10516,0,13027
chr3	3006955	.	C	T	7641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=-1.347;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.398;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,260:513:99:7670,0,7934
chr3	3006982	.	C	T	7693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.906;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.517;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,251:526:99:7722,0,8741
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chr3	3011185	.	G	A	7317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=1.128;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=8.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.166;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,240:491:99:7346,0,7910
chr3	3011272	.	C	T	8983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.994;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.931;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.786;SOR=0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,233:492:99:9012,0,10226
chr3	3011274	.	C	A	8983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-2.125;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.183;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,233:490:99:9012,0,10226
chr3	3011305	.	G	A	6959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.280;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=4.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.129;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=1.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,234:517:99:6988,0,8806
chr3	3011471	.	TC	T	5928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.048;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.442;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,214:450:99:5966,0,7562
chr3	3011473	.	CT	C	7176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.183;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.825;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,240:457:99:7214,0,6681
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chr3	3011682	.	TTA	T	10672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.917;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.338;QD=18.59;ReadPosRankSum=3.343;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,273:574:99:10710,0,12278
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chr3	3011709	.	T	C	11113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.428;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.710;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,294:602:99:11142,0,11825
chr3	3011771	.	G	C	7638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.543;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.195;QD=14.92;ReadPosRankSum=3.166;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,247:512:99:7667,0,8093
chr3	3011902	.	ATTAATATAC	A	8858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.144;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=1.185;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,241:494:99:8896,0,9527
chr3	3011961	.	A	G	10682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.812;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.442;QD=20.70;ReadPosRankSum=-2.487;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,268:516:99:10711,0,9704
chr3	3011970	.	A	T	11318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=1.228;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.017;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,282:533:99:11347,0,10105
chr3	3011984	.	G	C	11260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.672;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.830;QD=21.57;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,273:522:99:11289,0,9892
chr3	3011996	.	C	G	10747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=0.525;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.394;QD=20.24;ReadPosRankSum=1.359;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,277:531:99:10776,0,9651
chr3	3012023	.	G	T	11458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-1.191;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.644;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,291:551:99:11487,0,9867
chr3	3012025	.	C	T	11369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-0.420;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.029;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,291:550:99:11398,0,9918
chr3	3012135	.	G	A	8493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.630;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.379;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,273:532:99:8522,0,8273
chr3	3012220	.	C	T	7998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=1.514;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.347;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,254:502:99:8027,0,7844
chr3	3012408	.	G	A	7256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=1.311;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.524;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,237:491:99:7285,0,7360
chr3	3012451	.	G	C	6276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=1.488;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.550;QD=14.94;ReadPosRankSum=-1.435;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,211:420:99:6305,0,6368
chr3	3012483	.	C	T	6333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.440;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.231;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,210:420:99:6362,0,6333
chr3	3012515	.	TA	T	7807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.302;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=7.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.882;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,198:393:99:7845,0,7559
chr3	3012523	.	A	G	7975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.262;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.596;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.765;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,206:410:99:8004,0,7847
chr3	3012555	.	C	T	7083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.731;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.152;QD=19.09;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,184:371:99:7112,0,7303
chr3	3012562	.	C	T	7686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.167;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=0.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.021;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,191:390:99:7715,0,8117
chr3	3012575	.	A	AG	7143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.490;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.966;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.719;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,215:411:99:7181,0,7657
chr3	3012578	.	G	GTT	7691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.318;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.311;QD=18.14;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,197:424:99:7729,0,8919
chr3	3012645	.	AG	A,AGG	19691.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.93;QD=34.19;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,234,207:441:99:19729,8831,8135,10012,0,9275
chr3	3012649	.	GAGA	G	9712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.032;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.545;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,241:470:99:9750,0,9085
chr3	3012657	.	A	G	10342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-0.019;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.104;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,256:472:99:10371,0,9026
chr3	3012670	.	TTAA	T	8624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.734;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.628;QD=18.08;ReadPosRankSum=-2.397;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,224:477:99:8662,0,10280
chr3	3012680	.	C	T	9431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.317;ClippingRankSum=0.217;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.315;QD=20.82;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,249:453:99:9460,0,8133
chr3	3012798	.	T	G	6428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-0.430;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.467;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,211:464:99:6457,0,7924
chr3	3012856	.	C	T	7109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.797;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.272;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,198:448:99:7138,0,9405
chr3	3012877	.	T	C	7221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.295;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.350;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.577;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,180:414:99:7250,0,9898
chr3	3012884	.	C	T	6803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.587;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.626;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,174:403:99:6832,0,9659
chr3	3012889	.	C	A	6739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.424;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.630;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,176:412:99:6768,0,9303
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chr3	3013041	.	A	G	7832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=1.160;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.104;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,259:553:99:7861,0,9042
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chr3	3014698	.	G	T	7018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=1.114;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.415;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,231:479:99:7047,0,7215
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chr3	3015177	.	G	GGGAACCAAAAAGGGAACGAAAAAA	11308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.265;ClippingRankSum=-0.428;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-3.742;QD=23.13;ReadPosRankSum=-7.628;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,225:489:99:11346,0,9767
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chr3	3015507	.	A	C	5892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.912;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.696;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.336;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,193:388:99:5921,0,5894
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chr3	3015645	.	G	A	9788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.450;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.172;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,246:465:99:9817,0,8737
chr3	3015668	.	A	T	8640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.859;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.113;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,214:421:99:8669,0,8444
chr3	3015682	.	T	C	8031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-0.896;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.539;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,198:392:99:8060,0,7855
chr3	3015683	.	C	T	7875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.111;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.388;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,199:393:99:7904,0,7699
chr3	3015787	.	G	A	10696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.166;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.489;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,276:541:99:10725,0,10340
chr3	3015794	.	A	G	11141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=-1.490;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.813;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,289:559:99:11170,0,10290
chr3	3015895	.	C	T	10947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-2.275;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.128;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,365:683:99:10976,0,9347
chr3	3016300	.	T	C	8825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-1.951;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.905;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,232:537:99:8854,0,16310
chr3	3016310	.	T	C	9485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.039;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.243;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,253:556:99:9514,0,16115
chr3	3016439	.	C	T	9500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.351;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.980;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,319:645:99:9529,0,10440
chr3	3017719	.	CT	C	6675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-1.812;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.161;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,252:499:99:6713,0,7533
chr3	3017722	.	TC	T	7015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=1.328;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.160;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,245:503:99:7053,0,8008
chr3	3017750	.	C	T	7321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.553;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.259;QD=14.91;ReadPosRankSum=-2.156;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,243:491:99:7350,0,7832
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chr3	3017875	.	CG	C	6624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=-0.516;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.042;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,220:435:99:6662,0,6862
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chr3	3018540	.	A	AC	8980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.123;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=6.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.573;QD=16.39;ReadPosRankSum=2.676;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,225:548:99:9018,0,13477
chr3	3018541	.	C	CT	10369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=-2.066;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=7.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=1.932;QD=19.17;ReadPosRankSum=-2.329;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,315:541:99:10407,0,8871
chr3	3018543	.	T	C	8668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.030;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=8.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=2.481;QD=15.99;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,224:542:99:8697,0,13292
chr3	3018561	.	C	T	8255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=1.046;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=9.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=1.124;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,213:521:99:8284,0,12653
chr3	3018562	.	C	T	8210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=-0.517;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=9.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.210;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,208:512:99:8239,0,12698
chr3	3018568	.	T	G	8147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.188;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=9.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.280;QD=16.04;ReadPosRankSum=-2.543;SOR=1.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,211:508:99:8176,0,12410
chr3	3018569	.	A	T	8066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.607;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=10.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.677;QD=16.10;ReadPosRankSum=-2.795;SOR=1.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,209:501:99:8095,0,12374
chr3	3018573	.	T	C	7964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=-0.040;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=12.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.615;QD=15.99;ReadPosRankSum=-2.412;SOR=1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,202:498:99:7993,0,12047
chr3	3018574	.	C	T	7916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.855;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=10.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.550;QD=16.03;ReadPosRankSum=-2.616;SOR=1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,201:494:99:7945,0,12134
chr3	3018580	.	C	T	7366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.264;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=9.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-1.421;QD=16.30;ReadPosRankSum=-2.879;SOR=1.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,180:452:99:7395,0,11543
chr3	3018586	.	T	C	6644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.497;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=11.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-1.834;QD=15.10;ReadPosRankSum=-2.768;SOR=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,173:440:99:6673,0,11223
chr3	3018597	.	A	G	6006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.082;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=0.238;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=1.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,157:417:99:6035,0,10801
chr3	3018606	.	TC	T	10272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.557;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=8.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.146;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,267:433:99:10310,0,6272
chr3	3018610	.	CT	C	6272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.866;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.555;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,166:441:99:6310,0,11606
chr3	3018620	.	CA	C	6040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=-0.475;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=10.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=1.521;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,158:423:99:6078,0,10788
chr3	3018638	.	T	C	5543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=-0.178;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=18.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.480;QD=14.11;ReadPosRankSum=-4.140;SOR=1.407	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,146:393:99:5572,0,10252
chr3	3018660	.	A	C	7949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-0.660;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.437;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,250:423:99:7978,0,5136
chr3	3018695	.	A	T	8001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.144;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.768;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,248:431:99:8030,0,5449
chr3	3018741	.	G	C	7195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.305;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.334;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,225:422:99:7224,0,6092
chr3	3018944	.	A	C	7495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.896;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.547;QD=14.47;ReadPosRankSum=2.573;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,254:518:99:7524,0,8045
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chr3	3019646	.	A	G	7211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.395;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.392;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,237:494:99:7240,0,7866
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chr3	3021145	.	G	A	9150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.365;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.194;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,293:523:99:9179,0,6889
chr3	3021251	.	T	TTATCCATATTTATTC	1503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;QD=14.46;SOR=1.094	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:89:1541,89,0
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chr3	3022074	.	C	T	6800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.963;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.044;QD=15.93;ReadPosRankSum=2.770;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,213:427:99:6829,0,6836
chr3	3022207	.	T	C	8191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.191;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.736;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.447;SOR=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,281:601:99:8220,0,9483
chr3	3022226	.	C	CA	5580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.511;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.254;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,255:549:99:5618,0,11042
chr3	3022244	.	GA	G	11900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=1.215;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.915;QD=19.23;ReadPosRankSum=-2.845;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,305:619:99:11938,0,12067
chr3	3022262	.	A	G	12382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-1.053;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.078;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,312:659:99:12411,0,13750
chr3	3022282	.	A	T	12031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=1.447;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.871;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,296:638:99:12060,0,14056
chr3	3022287	.	T	C	11367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;ClippingRankSum=-0.267;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.122;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,290:625:99:11396,0,14096
chr3	3022288	.	GAAA	G,GAAAA	21343.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.608;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.195;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,290,313:604:99:21381,9605,14751,12636,0,11723
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chr3	3022298	.	GAAAAA	G	11839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.267;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.766;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,306:671:99:11877,0,14729
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chr3	3024878	.	A	G	9450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=-0.031;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.018;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.304;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,246:497:99:9479,0,9904
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chr3	3024905	.	T	C	7145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.252;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=4.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.277;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.974	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,231:486:99:7174,0,10295
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chr3	3025156	.	AC	A	6171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.763;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.588;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,214:458:99:6209,0,7716
chr3	3025157	.	CT	C	7166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=1.452;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.725;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,242:457:99:7204,0,6588
chr3	3025722	.	G	GCCTAATGGGTTAATCACTAGTAA	12883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.452;ClippingRankSum=0.978;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-2.016;QD=23.73;ReadPosRankSum=-7.535;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,281:543:99:12921,0,9840
chr3	3026063	.	A	G	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.958;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=0.881;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.400;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,119:265:99:3139,0,4226
chr3	3026064	.	C	CA	1466.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.328;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=29.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-0.365;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.238	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,120:150:16:1504,0,16
chr3	3026107	.	C	T	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.526;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=6.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=0.300;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,160:293:99:5387,0,4315
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chr3	3026328	.	C	T	7307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-0.754;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.938;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,239:492:99:7336,0,7854
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chr3	3027059	.	C	A	12070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.494;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.043;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.950;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,299:579:99:12099,0,11283
chr3	3027082	.	C	T	10993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=1.076;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.012;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.926;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,294:579:99:11022,0,10686
chr3	3027194	.	G	A	9713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-1.293;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.393;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,323:626:99:9742,0,9196
chr3	3027393	.	C	CTGTTTTCATTCTCCT	14589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=-0.235;DP=761;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.279;QD=22.24;ReadPosRankSum=-7.024;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,350:656:99:14627,0,11529
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chr3	3027662	.	G	C	10103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.987;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.149;QD=20.54;ReadPosRankSum=4.019;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,269:492:99:10132,0,13867
chr3	3027687	.	A	T	10131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=2.189;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.909;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,277:506:99:10160,0,13772
chr3	3027784	.	G	A	8435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-1.188;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.201;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,271:516:99:8464,0,7658
chr3	3028067	.	C	T	9272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.790;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.912;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,248:495:99:9301,0,9344
chr3	3028079	.	C	T	9395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=1.062;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.574;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,239:482:99:9424,0,9399
chr3	3028409	.	G	A	7179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-1.565;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.236;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,232:474:99:7208,0,7523
chr3	3028439	.	G	A	7372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.194;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.024;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,234:465:99:7401,0,7264
chr3	3028526	.	C	G	8928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.517;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.093;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,236:491:99:8957,0,9702
chr3	3028547	.	C	T	8663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.095;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.478;QD=17.50;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,231:495:99:8692,0,10051
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chr3	3028637	.	A	C	9521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-0.410;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.125;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,250:471:99:9550,0,8463
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chr3	3030970	.	ATC	A	10523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.920;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.711;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,279:592:99:10561,0,12658
chr3	3030981	.	GC	CC,G	25068.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=28.67;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,272,300:572:99:25106,13182,12315,11966,0,11190
chr3	3030997	.	C	T	10310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.341;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.450;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,264:563:99:10339,0,12117
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chr3	3031028	.	C	T	10815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=1.083;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.481;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.847;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,270:527:99:10844,0,10180
chr3	3031039	.	A	G	10809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.093;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.750;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.308;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,281:531:99:10838,0,9670
chr3	3031076	.	CA	C	7964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.095;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.048;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,217:470:99:8002,0,9189
chr3	3031077	.	AT	A	9165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;ClippingRankSum=-0.208;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.706;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,253:471:99:9203,0,8224
chr3	3031101	.	TG	T	8238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.019;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.012;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,227:460:99:8276,0,8764
chr3	3031102	.	GA	G	8553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.070;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.570;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.620;SOR=1.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,231:459:99:8591,0,8476
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chr3	3031205	.	C	A	7751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.520;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.080;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.313;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,251:487:99:7780,0,8959
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chr3	3040469	.	G	A	7482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.024;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.027;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.119;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,243:483:99:7511,0,7596
chr3	3040789	.	G	C	7957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=1.508;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.210;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.100;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,210:422:99:7986,0,8196
chr3	3040796	.	T	C	7750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=1.823;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.982;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.455;SOR=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,196:401:99:7779,0,8113
chr3	3040860	.	GAATGGCACACATCCAATGC	G	5986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=0.521;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-0.818;QD=15.63;ReadPosRankSum=4.526;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,162:383:99:6024,0,8579
chr3	3040968	.	T	A	9459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-0.720;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.965;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.458;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,307:583:99:9488,0,8343
chr3	3041178	.	T	C	7459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.001;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.514;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,237:474:99:7488,0,7438
chr3	3041560	.	A	C	5531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-1.045;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.443;QD=16.08;ReadPosRankSum=-1.435;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,181:344:99:5560,0,5100
chr3	3044336	.	C	CT	5481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=1.074;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.323;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,243:483:99:5519,0,5466
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chr3	3044535	.	A	G	11473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.086;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.269;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,292:531:99:11502,0,9279
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chr3	3046273	.	TTAGAATAGAATCATATCTGATGTAAATAAAGAGTCAGTTCCTGGTAATG	T	8812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.466;ClippingRankSum=-0.550;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-1.825;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,231:608:99:8850,0,15778
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chr3	3046327	.	A	G	8933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.896;ClippingRankSum=-1.585;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-1.660;QD=18.16;ReadPosRankSum=-4.014;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,230:492:99:8962,0,10762
chr3	3046331	.	A	G	9536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;ClippingRankSum=-1.959;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-2.690;QD=19.62;ReadPosRankSum=-5.900;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,230:486:99:9565,0,10510
chr3	3046351	.	T	A	10681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.987;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-1.014;QD=20.35;ReadPosRankSum=-8.265;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:10710,0,10845
chr3	3046358	.	T	C	10477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.309;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.546;QD=20.38;ReadPosRankSum=-6.568;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,251:514:99:10506,0,10776
chr3	3046359	.	G	A	10216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.679;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-2.320;QD=19.80;ReadPosRankSum=-6.017;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,251:516:99:10245,0,10920
chr3	3046370	.	A	G	10099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.158;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=1.931;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,254:522:99:10128,0,10705
chr3	3046382	.	G	C	10347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.106;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=9.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=1.373;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,268:532:99:10376,0,10246
chr3	3046410	.	A	G	11190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.439;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=6.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.443;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,287:552:99:11219,0,10201
chr3	3046417	.	C	A	11349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=-0.214;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.497;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,283:548:99:11378,0,10530
chr3	3046436	.	G	A	11528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=-0.586;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.326;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,306:579:99:11557,0,10035
chr3	3046477	.	T	C	11007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=2.356;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.337;QD=20.12;ReadPosRankSum=2.064;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,288:547:99:11036,0,14166
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chr3	3048613	.	TA	T	3915.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-2.370;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.743;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.406;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,177:382:99:3953,0,4837
chr3	3048667	.	C	CA	4111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-1.748;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=5.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.812;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,182:369:99:4149,0,4209
chr3	3048736	.	T	C	8844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.311;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.504;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,238:497:99:8873,0,9865
chr3	3048746	.	CAA	C	9290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.700;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.467;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,240:495:99:9328,0,10324
chr3	3048768	.	AGG	A	9885.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.015;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.195;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,248:512:99:9923,0,10643
chr3	3048771	.	A	AAT	9624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.276;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.564;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,247:503:99:9662,0,10202
chr3	3048846	.	T	TC	6684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.578;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.563;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.526;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,244:477:99:6722,0,6539
chr3	3048949	.	G	A	9086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.026;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.707;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,289:535:99:9115,0,7482
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chr3	3048995	.	G	T	11501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.036;ClippingRankSum=-2.343;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.271;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,286:563:99:11530,0,11073
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chr3	3051271	.	T	C	5889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=-1.542;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.435;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,190:410:99:5918,0,7286
chr3	3051469	.	A	C	9247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-0.171;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.014;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,232:543:99:9276,0,12311
chr3	3051476	.	C	T	9980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=1.376;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.782;QD=17.67;ReadPosRankSum=-2.507;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,249:565:99:10009,0,13034
chr3	3051499	.	T	C	10097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.410;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.514;QD=17.81;ReadPosRankSum=-2.050;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,256:567:99:10126,0,12696
chr3	3051523	.	C	G	9001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=0.159;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.424;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.640;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,244:532:99:9030,0,11030
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chr3	3052971	.	C	A	9549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=1.820;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.846;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,247:466:99:9578,0,8269
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chr3	3053082	.	T	A	8354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=2.242;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.785;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,260:500:99:8383,0,7372
chr3	3053127	.	T	C	10788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=1.190;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.762;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,280:542:99:10817,0,10292
chr3	3053133	.	T	C	10933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.238;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.282;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,273:545:99:10962,0,10882
chr3	3053149	.	T	C	8926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=1.383;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.192;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.157;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,273:558:99:8955,0,10932
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chr3	3055730	.	C	CT	4511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-0.393;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.175;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.313;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,190:395:99:4549,0,6623
chr3	3055735	.	T	TC	5931.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.526;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.196;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.532;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,211:411:99:5969,0,6192
chr3	3055768	.	A	G	7152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=-1.063;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.285;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,229:436:99:7181,0,6227
chr3	3056823	.	C	CA	7835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.188;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=5.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.489;QD=19.74;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,198:397:99:7873,0,7566
chr3	3056842	.	A	G	9507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.516;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.053;QD=21.41;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,229:444:99:9536,0,8490
chr3	3056845	.	G	A	9548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=1.663;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.667;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,231:445:99:9577,0,8521
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chr3	3059404	.	T	C	7187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=0.523;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.209;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,241:467:99:7216,0,7179
chr3	3059510	.	G	A	7168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-2.014;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.505;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,234:474:99:7197,0,7408
chr3	3059572	.	A	G	8056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.083;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.514;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,226:517:99:8085,0,11067
chr3	3059595	.	G	A	8813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=-0.269;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.277;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,223:494:99:8842,0,10856
chr3	3059596	.	G	A	8701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.696;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.384;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,224:497:99:8730,0,10830
chr3	3059790	.	G	A	9936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.475;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.194;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,258:553:99:9965,0,11844
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chr3	3060797	.	T	C	8134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.359;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.287;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,259:503:99:8163,0,7566
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chr3	3061365	.	G	GC	6389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.602;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.100;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.305;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,242:461:99:6427,0,6728
chr3	3061366	.	C	CG	6352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.551;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.540;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,220:467:99:6390,0,7679
chr3	3061570	.	A	G	7663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.437;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.737;QD=14.79;ReadPosRankSum=2.731;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,252:518:99:7692,0,8167
chr3	3061633	.	T	A	7422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.691;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.570;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,239:498:99:7451,0,8069
chr3	3061747	.	T	C	6381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.018;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.657;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,214:479:99:6410,0,8066
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chr3	3061811	.	GA	G	8552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=0.674;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.541;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,216:476:99:8590,0,10556
chr3	3061813	.	AG	A	7977.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.041;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.699;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,255:478:99:8015,0,8790
chr3	3061835	.	C	T	8702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.157;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.984;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,239:482:99:8731,0,9273
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chr3	3062017	.	C	A	13078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-2.057;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.346;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.430;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,336:664:99:13107,0,12131
chr3	3062059	.	T	A	9931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.305;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.034;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,325:690:99:9960,0,11483
chr3	3062122	.	G	T	8572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=-1.693;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.172;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,279:636:99:8601,0,10900
chr3	3062159	.	G	T	8710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.182;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.417;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,292:616:99:8739,0,10097
chr3	3062227	.	GAAAC	G	9780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-1.236;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.040;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.899;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,251:519:99:9818,0,10686
chr3	3062234	.	A	ATT	9968.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.164;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.308;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.997;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,256:527:99:10006,0,10693
chr3	3062264	.	C	T	9427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.117;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.076;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,244:500:99:9456,0,9898
chr3	3062272	.	T	C	9362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=1.801;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.009;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,248:508:99:9391,0,9971
chr3	3062502	.	GC	G	7394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.546;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.450;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,261:509:99:7432,0,7906
chr3	3062503	.	CT	C	7094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=0.854;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.631;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,244:509:99:7132,0,8026
chr3	3062675	.	A	T	7978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.342;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.848;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.703;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,248:538:99:8007,0,9491
chr3	3062738	.	T	C	8475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.197;ClippingRankSum=-0.875;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=1.539;QD=27.61;ReadPosRankSum=7.390;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:88,219:307:99:8504,0,2066
chr3	3062766	.	GTAATTAGA	G	8622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=-0.242;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=15.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQRankSum=-1.839;QD=30.89;ReadPosRankSum=6.732;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,208:226:99:8660,0,162
chr3	3062776	.	CATG	C	9128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.545;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=6.732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQRankSum=-0.387;QD=30.50;SOR=0.123	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,203:209:99:9166,462,0
chr3	3062783	.	TGTAAA	T	8948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.218;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=9.510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.86;MQRankSum=-1.491;QD=32.65;SOR=0.266	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,201:207:99:8986,450,0
chr3	3062809	.	TTAGAGCATGAAAATGGTAAA	T	7297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.93;QD=31.42;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,157:157:99:7335,491,0
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chr3	3062910	.	G	A	6597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.170;ClippingRankSum=-0.347;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-2.787;QD=27.84;ReadPosRankSum=5.756;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,148:237:99:6626,0,3405
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chr3	3063133	.	C	T	9298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.352;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.094;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,252:503:99:9327,0,9239
chr3	3063158	.	T	C	9021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.810;ClippingRankSum=0.595;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.449;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,242:507:99:9050,0,9740
chr3	3063186	.	T	C	8169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.886;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.777;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,271:535:99:8198,0,8333
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chr3	3063310	.	T	TG	7868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.618;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.399;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.395;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,282:579:99:7906,0,11622
chr3	3063311	.	G	GA	7794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=1.189;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.044;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,285:574:99:7832,0,9173
chr3	3063689	.	TA	T	10194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-0.271;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.592;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,289:594:99:10232,0,11597
chr3	3063690	.	AT	A	11247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=-0.652;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.733;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,295:586:99:11285,0,11156
chr3	3063696	.	C	A	11376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.919;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.188;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,288:578:99:11405,0,11241
chr3	3063749	.	AT	A	10871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=1.532;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.716;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,286:577:99:10909,0,11224
chr3	3063750	.	TC	T	10363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.420;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.385;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,291:579:99:10401,0,10957
chr3	3063758	.	A	G	10779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.091;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.436;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,274:564:99:10808,0,11651
chr3	3063777	.	A	G	10268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.385;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.362;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,271:567:99:10297,0,11363
chr3	3063821	.	G	A	9071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-0.991;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.315;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=1.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,236:494:99:9100,0,10308
chr3	3063824	.	C	T	9107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.051;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=9.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.389;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.931;SOR=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,230:493:99:9136,0,10722
chr3	3063835	.	T	C	8566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-0.946;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=18.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.442;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.472;SOR=1.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,220:489:99:8595,0,10633
chr3	3063897	.	G	C	8826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.558;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.549;QD=16.29;ReadPosRankSum=5.865;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,281:542:99:8855,0,8212
chr3	3063993	.	CCTAAGATAGATAT	C	7316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=-0.293;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.467;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.249;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,198:437:99:7354,0,9113
chr3	3064144	.	A	C	6367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.378;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.954;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,212:458:99:6396,0,7811
chr3	3064195	.	T	C	9471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.127;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.459;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,240:475:99:9500,0,9195
chr3	3064199	.	T	C	9750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.259;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.316;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,240:474:99:9779,0,9718
chr3	3064221	.	C	A	9975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-1.605;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.364;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,248:510:99:10004,0,10906
chr3	3064240	.	T	C	9238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=-0.880;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.442;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,250:537:99:9267,0,10829
chr3	3064280	.	C	T	9285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-3.958;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.665;QD=16.58;ReadPosRankSum=-5.770;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,242:560:99:9314,0,12522
chr3	3064284	.	A	G	10183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.249;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=0.482;QD=18.38;ReadPosRankSum=-7.326;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,243:554:99:10212,0,12728
chr3	3064288	.	G	GATACTTC	10663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.692;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-1.278;QD=18.74;ReadPosRankSum=-9.477;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,261:569:99:10701,0,12726
chr3	3064292	.	T	TAGATACTTCAGATAGATAC	12359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-3.971;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=3.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-1.935;QD=21.95;ReadPosRankSum=-5.297;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,251:563:99:12397,0,12205
chr3	3064480	.	AT	A	11729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=1.648;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-1.712;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,300:612:99:11767,0,12661
chr3	3064483	.	T	C	12272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-1.555;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=1.260;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,298:609:99:12301,0,12790
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chr3	3064490	.	T	C	12747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.456;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.943;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,310:614:99:12776,0,12686
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chr3	3066017	.	T	G	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.083;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.639;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,59:152:99:2030,0,3769
chr3	3066038	.	AT	A	4136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.047;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.092;QD=21.43;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,122:193:99:4174,0,2476
chr3	3066039	.	TC	T	2381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.717;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.016;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:127,69:196:99:2419,0,4734
chr3	3066112	.	G	C	5634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=-0.134;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.499;QD=24.93;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,139:226:99:5663,0,3429
chr3	3066117	.	A	G	5892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=-0.231;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=5.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.568;QD=24.66;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,145:239:99:5921,0,3544
chr3	3066118	.	C	G	5935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.338;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.574;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,145:240:99:5964,0,3624
chr3	3066132	.	C	T	3725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.331;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.685;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,99:235:99:3754,0,5743
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chr3	3067620	.	TTTATCACCATACTGCAA	T	4212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.081;ClippingRankSum=-0.187;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=2.281;QD=22.41;ReadPosRankSum=6.039;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,109:188:99:4250,0,3090
chr3	3067637	.	A	AT	1696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=1.068;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-2.833;QD=4.75;ReadPosRankSum=-7.989;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,79:357:99:1734,0,10908
chr3	3067659	.	TCACCATACTGCAATTTATCACCATACTGCAATTTAC	T	2559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;ClippingRankSum=0.544;DP=742;ExcessHet=3.0103;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=2.309;QD=4.70;ReadPosRankSum=7.425;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:439,106:545:99:2597,0,17046
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chr3	3067985	.	TC	T	11525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.581;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.045;QD=20.26;ReadPosRankSum=-1.388;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,304:569:99:11563,0,10516
chr3	3067987	.	CT	C	10203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.688;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.944;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,261:562:99:10241,0,12213
chr3	3068008	.	G	A	10155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.169;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.237;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,268:567:99:10184,0,11416
chr3	3068101	.	T	C	8851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.479;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.224;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,283:592:99:8880,0,10049
chr3	3068168	.	G	C	10840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-0.304;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.959;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,285:616:99:10869,0,12736
chr3	3068181	.	T	C	10669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=-0.161;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.368;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,272:602:99:10698,0,13278
chr3	3068184	.	G	T	10294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.311;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.623;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,267:591:99:10323,0,12933
chr3	3068216	.	A	C	9874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.357;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.727;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,301:550:99:9903,0,7641
chr3	3068270	.	TG	T	7140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=1.059;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.261;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,235:487:99:7178,0,8184
chr3	3068271	.	GT	G	7555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.604;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.047;QD=15.45;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,252:489:99:7593,0,7710
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chr3	3071872	.	T	TG	5634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.077;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.703;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,220:418:99:5672,0,6506
chr3	3071875	.	G	GC	6256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.471;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.622;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,206:437:99:6294,0,7234
chr3	3071918	.	GC	G	7194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-1.003;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.719;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,247:489:99:7232,0,7349
chr3	3071919	.	CA	C	6597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=1.686;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.014;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.651;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,241:492:99:6635,0,7741
chr3	3072188	.	C	T	7071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-0.869;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.150;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,225:458:99:7100,0,6906
chr3	3072287	.	C	T	6386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.053;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.661;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,207:388:99:6415,0,5548
chr3	3072320	.	T	C	8796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.079;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.245;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.484;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,229:433:99:8825,0,7639
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chr3	3076021	.	G	C	10418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.155;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=5.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.874;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,273:568:99:10447,0,14230
chr3	3076022	.	A	G	10418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.379;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=6.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.237;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,269:561:99:10447,0,14230
chr3	3076300	.	G	A	7632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;ClippingRankSum=0.393;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.283;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,262:488:99:7661,0,7052
chr3	3076609	.	G	T	9434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=1.116;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.556;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.152;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,304:563:99:9463,0,8144
chr3	3076778	.	CT	C,CTT	3478.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.964;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-1.155;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.432;SOR=1.460	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:6,46,76:128:99:3516,2634,2883,842,0,2537
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chr3	3080266	.	G	A	7565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=1.621;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.256;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,241:495:99:7594,0,8222
chr3	3080291	.	AG	A	9404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=1.849;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.048;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.652;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,241:487:99:9442,0,9758
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chr3	3083143	.	CA	C	9092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.551;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.329;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,228:476:99:9130,0,10164
chr3	3083148	.	T	A	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-1.486;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.726;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,221:460:99:8783,0,9713
chr3	3083179	.	T	C	4808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.603;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=0.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.679;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,128:362:99:4837,0,8972
chr3	3083393	.	ATAAAGCAACATATAG	A	6100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.389;ClippingRankSum=-0.205;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=8.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQRankSum=-12.070;QD=12.63;ReadPosRankSum=-7.329;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,168:483:99:6138,0,12892
chr3	3083419	.	T	A	7463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;ClippingRankSum=-0.457;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-8.823;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.998;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,190:462:99:7492,0,11454
chr3	3083422	.	G	C	7634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.657;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=4.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-8.317;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.060;SOR=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,192:462:99:7663,0,11432
chr3	3083438	.	T	G	7673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.939;ClippingRankSum=0.553;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-2.821;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,196:463:99:7702,0,10885
chr3	3083449	.	G	GTAAA	8852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.385;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=0.510;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,206:464:99:8890,0,10291
chr3	3083460	.	A	G	7877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.804;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.705;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.819;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,209:468:99:7906,0,10294
chr3	3083505	.	G	GA	7788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.113;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=11.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.077;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.805;SOR=1.070	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,231:470:99:7826,0,7890
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chr3	3083539	.	C	T	7645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.015;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=6.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.201;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,230:502:99:7674,0,9007
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chr3	3085922	.	G	A	10976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-1.298;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.791;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,268:562:99:11005,0,11814
chr3	3085923	.	G	A	10856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=2.191;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.068;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,272:563:99:10885,0,11738
chr3	3086035	.	A	T	8781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-0.397;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.965;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,290:612:99:8810,0,9351
chr3	3086350	.	G	C	6493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.648;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.646;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,209:452:99:6522,0,7660
chr3	3086399	.	T	A	6333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.375;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.015;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.909;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,212:439:99:6362,0,6977
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chr3	3087864	.	C	T	11944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.063;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.114;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,317:638:99:11973,0,12550
chr3	3088120	.	A	G	8480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.853;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.876;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,220:440:99:8509,0,8570
chr3	3088127	.	C	T	8636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=-3.030;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.234;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,216:440:99:8665,0,9069
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chr3	3088144	.	A	C	9695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.066;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.047;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,239:458:99:9724,0,8859
chr3	3088153	.	T	A	10247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.326;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.199;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,249:468:99:10276,0,8746
chr3	3088157	.	T	C	10538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.119;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.336;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,256:478:99:10567,0,8767
chr3	3088173	.	C	G	6707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-1.100;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.483;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,242:445:99:6736,0,8495
chr3	3088182	.	A	T	9688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.572;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.520;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,248:459:99:9717,0,8036
chr3	3088211	.	A	G	7659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.025;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.653;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,250:471:99:7688,0,6631
chr3	3088240	.	A	C	8696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.927;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.007;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,288:537:99:8725,0,7367
chr3	3088558	.	AT	A	1922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=-0.200;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.405;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,128:236:99:1960,0,1581
chr3	3088594	.	T	C	5700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=-0.320;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.652;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,200:403:99:5729,0,5987
chr3	3088756	.	G	A	5289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=1.259;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.957;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,187:400:99:5318,0,6782
chr3	3088826	.	TCGTC	T	7027.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.313;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.345;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,180:414:99:7065,0,9386
chr3	3088850	.	T	C	8921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.881;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=5.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.060;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.722;SOR=1.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,225:460:99:8950,0,9448
chr3	3088862	.	T	C	8437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.496;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=7.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.051;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.920;SOR=1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,225:473:99:8466,0,9714
chr3	3088989	.	CT	C,CTT	12181.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.126;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.841;QD=26.66;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.469	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,223,233:457:99:12219,6610,8019,6610,0,7473
chr3	3089018	.	A	T	3489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-0.703;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.309;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,189:442:99:3527,0,7442
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chr3	3089068	.	T	G	7623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=3.742;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.695;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,225:475:99:7652,0,9588
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chr3	3090133	.	G	T	7098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=1.289;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.936;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,226:474:99:7127,0,7976
chr3	3090624	.	TA	T	5812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.624;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.046;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,227:487:99:5850,0,8106
chr3	3090626	.	AG	A	7391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.456;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.337;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.369;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,252:484:99:7429,0,6672
chr3	3091344	.	G	C	8092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.385;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.311;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.669;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,261:557:99:8121,0,9491
chr3	3092302	.	G	T	7119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=1.119;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.468;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,232:472:99:7148,0,7591
chr3	3096656	.	G	T	9671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=1.713;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.073;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,313:592:99:9700,0,8464
chr3	3096995	.	AAAGT	A	4129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.231;ClippingRankSum=0.560;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=2.107;QD=15.88;ReadPosRankSum=3.018;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,128:260:99:4167,0,5614
chr3	3096999	.	T	TAATTTGCTTAAAGTAAGATGCTCA	5569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=-0.280;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-2.015;QD=21.42;ReadPosRankSum=-5.639;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,132:260:99:5607,0,4175
chr3	3097132	.	C	T	8427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.335;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.509;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.511;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,280:547:99:8456,0,8301
chr3	3099409	.	C	CT	6255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.170;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.511;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.660;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,246:500:99:6293,0,7910
chr3	3099412	.	T	TC	6797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.021;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.411;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,246:501:99:6835,0,8176
chr3	3099494	.	CA	C	6682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.470;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.339;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,250:513:99:6720,0,8564
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chr3	3102056	.	TGCGCATGGGGTACTTCA	T	6990.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.516;ClippingRankSum=-0.529;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.319;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.356;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,182:383:99:7028,0,7733
chr3	3102062	.	T	TG	5898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=-0.291;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.882;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,167:367:99:5936,0,7875
chr3	3102086	.	A	G	8192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=-1.220;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.090;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,199:362:99:8221,0,6587
chr3	3102104	.	GC	G	7740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-0.065;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-3.030;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,191:376:99:7778,0,7455
chr3	3102105	.	CT	C	6930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=1.093;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.162;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,177:366:99:6968,0,7679
chr3	3102116	.	A	T	7114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.820;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=2.283;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,175:365:99:7143,0,7508
chr3	3102119	.	GC	G	7240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=1.992;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.939;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,189:363:99:7278,0,7114
chr3	3102122	.	AT	A	6651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.553;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.472;QD=18.17;ReadPosRankSum=-1.424;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,174:366:99:6689,0,7532
chr3	3102510	.	C	T	7703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=-0.553;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.105;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,254:528:99:7732,0,8043
chr3	3102532	.	G	A	7638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;ClippingRankSum=1.032;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.669;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,283:540:99:7667,0,7841
chr3	3102669	.	G	A	9566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.627;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.175;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,243:456:99:9595,0,10426
chr3	3102670	.	C	T	9595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.168;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.525;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,242:455:99:9624,0,10466
chr3	3102673	.	G	A	9568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-1.101;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.081;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,242:460:99:9597,0,10427
chr3	3102792	.	T	C	8587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=1.365;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.442;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,286:544:99:8616,0,9862
chr3	3102809	.	A	G	7942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-0.999;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.436;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,256:539:99:7971,0,10786
chr3	3102846	.	GATGAGAATGAGAGGAGAGATGAGAATAAGGAGGATGA	G,GAATGAGAATGAGAGGAGAGATGAGAATAAGGAGGATGA	29655.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=793;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.61;QD=26.57;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,242,431:673:99:29693,17510,17082,10036,0,8511
chr3	3102857	.	G	GA	11922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.141;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=0.123;QD=22.33;ReadPosRankSum=4.762;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,292:534:99:11960,0,8881
chr3	3102860	.	G	GC	11887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.781;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=1.930;QD=22.86;ReadPosRankSum=4.317;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,278:520:99:11925,0,8893
chr3	3102862	.	G	GGGGAAGA	12896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.273;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.120;QD=24.61;ReadPosRankSum=4.006;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,282:524:99:12934,0,8812
chr3	3102883	.	A	AG	10961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.749;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.497;QD=20.64;ReadPosRankSum=-2.098;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,289:531:99:10999,0,8931
chr3	3103042	.	A	T	11579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.976;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.755;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,370:671:99:11608,0,11557
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chr3	3103082	.	A	C	8964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.353;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.433;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,291:643:99:8993,0,11004
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chr3	3105242	.	C	CA	10297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.882;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=2.412;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,278:544:99:10335,0,10070
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chr3	3105477	.	C	G	5533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-0.595;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=5.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.396;QD=14.05;ReadPosRankSum=3.849;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,156:394:99:5562,0,9624
chr3	3105479	.	A	AT	5504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.224;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=5.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.488;QD=13.97;ReadPosRankSum=4.070;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,156:394:99:5542,0,9917
chr3	3105480	.	T	TC	7538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=-0.241;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.271;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,240:458:99:7576,0,8153
chr3	3105488	.	A	T	5468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.764;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.140;QD=13.44;ReadPosRankSum=4.739;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,156:407:99:5497,0,10565
chr3	3105492	.	C	T	7734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=-0.545;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.316;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,211:461:99:7772,0,9961
chr3	3105671	.	C	T	5623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.854;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=26.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.291;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,195:393:99:5652,0,6036
chr3	3105853	.	T	G	8440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.277;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.582;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,220:428:99:8469,0,7986
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chr3	3105910	.	G	C	7565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.670;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.206;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,199:421:99:7594,0,8626
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chr3	3107142	.	A	G	9799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.665;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.514;QD=17.53;ReadPosRankSum=5.764;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,277:559:99:9828,0,11383
chr3	3107156	.	C	T	8398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-0.212;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-1.740;QD=14.79;ReadPosRankSum=-9.489;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,274:568:99:8427,0,11761
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chr3	3107162	.	C	CGGATACATAGCAGAAAGTATTGAAGATCATATCT	15030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-1.003;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=0.535;QD=25.48;ReadPosRankSum=-5.081;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,297:590:99:15068,0,11612
chr3	3107183	.	A	G	11058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-0.569;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-2.240;QD=19.23;ReadPosRankSum=-6.683;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,272:575:99:11087,0,12275
chr3	3107197	.	G	A	10651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-2.424;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-2.168;QD=18.62;ReadPosRankSum=-3.862;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,276:572:99:10680,0,12181
chr3	3107216	.	G	A	9731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.795;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.931;QD=16.47;ReadPosRankSum=2.014;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,277:591:99:9760,0,12065
chr3	3107291	.	G	A	12755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.557;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.533;QD=19.30;ReadPosRankSum=3.050;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,350:661:99:12784,0,13300
chr3	3107328	.	T	A	13264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=1.091;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.271;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.081;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,333:610:99:13293,0,13378
chr3	3107336	.	A	G	12539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=2.045;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.331;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.925;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,313:594:99:12568,0,13150
chr3	3107434	.	G	A	10156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=2.094;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.198;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,264:500:99:10185,0,9009
chr3	3107446	.	T	A	10215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.723;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.012;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.951;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,270:526:99:10244,0,9606
chr3	3107535	.	T	C	7188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.543;ClippingRankSum=0.723;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.641;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,223:479:99:7217,0,7407
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chr3	3109424	.	A	T	12232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.346;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.289;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,303:601:99:12261,0,11946
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chr3	3109456	.	G	A	13364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.037;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.530;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,332:633:99:13393,0,12296
chr3	3109457	.	G	A	13283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.544;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.776;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,330:629:99:13312,0,12260
chr3	3109479	.	T	C	13394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=-1.088;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.395;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.460;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,338:637:99:13423,0,12181
chr3	3109493	.	T	C	12873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.427;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=2.048;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,336:647:99:12902,0,11536
chr3	3109554	.	T	C	9408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.621;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.642;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,297:578:99:9437,0,8585
chr3	3109770	.	T	C	7066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.102;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.867;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,229:462:99:7095,0,7243
chr3	3109874	.	A	AGAAGGATAG	11347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.558;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.172;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.471;SOR=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,260:520:99:11385,0,10075
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chr3	3109919	.	G	A	10606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=-0.372;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-3.422;QD=18.10;ReadPosRankSum=-2.343;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,289:586:99:10635,0,11236
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chr3	3111213	.	T	A	7640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-0.439;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.611;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,190:417:99:7669,0,9148
chr3	3111221	.	CT	C	7434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=2.727;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.924;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,192:420:99:7472,0,9195
chr3	3111227	.	CT	C	7233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.051;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.657;QD=18.27;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,182:396:99:7271,0,8809
chr3	3111271	.	G	C	7040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.733;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.639;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,187:392:99:7069,0,7834
chr3	3111284	.	CA	C	7180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.580;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.121;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,192:400:99:7218,0,7885
chr3	3111540	.	T	C	12239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=1.878;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.554;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,319:639:99:12268,0,12138
chr3	3111564	.	T	A	13314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.514;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.260;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,330:647:99:13343,0,12884
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chr3	3114177	.	A	G	8185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.166;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.888;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,271:585:99:8214,0,9679
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chr3	3114423	.	T	C	5195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.795;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=5.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.548;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.000;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,185:390:99:5224,0,5999
chr3	3114891	.	AT	A	7430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-0.696;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=9.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.270;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,191:354:99:7468,0,6238
chr3	3114897	.	A	AT	5662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.038;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=6.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.460;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,160:368:99:5700,0,7992
chr3	3114900	.	TTTTA	T	3409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.327;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=5.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.687;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.818;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,174:361:99:3447,0,6971
chr3	3114904	.	A	AT	5806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.663;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.992;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,164:376:99:5844,0,7776
chr3	3114939	.	A	AT	4394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.625;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.040;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.946;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,173:416:99:4432,0,6806
chr3	3114943	.	T	TG	6803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=-0.916;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=2.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.525;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,251:428:99:6841,0,5174
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chr3	3115006	.	T	TTTG	9479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.086;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.642;QD=21.74;ReadPosRankSum=3.762;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,253:436:99:9517,0,5632
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chr3	3115189	.	CG	C	12397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.172;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=2.503;QD=21.83;ReadPosRankSum=6.060;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,312:568:99:12435,0,10590
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chr3	3115201	.	T	TAC	11160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=-0.419;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-2.761;QD=18.51;ReadPosRankSum=-4.892;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,269:603:99:11198,0,13468
chr3	3115224	.	T	C	9964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.076;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=0.940;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,286:614:99:9993,0,12364
chr3	3115257	.	C	T	9891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-1.227;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.005;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,319:629:99:9920,0,9256
chr3	3115288	.	A	G	12671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=1.510;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.114;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.509;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,321:639:99:12700,0,12204
chr3	3115291	.	C	T	12746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=1.089;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.289;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,325:631:99:12775,0,12089
chr3	3115329	.	C	A	13045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-1.760;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.270;QD=21.28;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,330:613:99:13074,0,11126
chr3	3115331	.	T	G	13200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.951;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.378;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,324:611:99:13229,0,11282
chr3	3115335	.	T	C	12940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.929;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.191;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,323:612:99:12969,0,11394
chr3	3115340	.	T	A	12595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.404;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.600;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,315:601:99:12624,0,11544
chr3	3115344	.	A	C	12921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.468;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.795;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,320:605:99:12950,0,9683
chr3	3115347	.	T	A	13057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.350;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.223;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,316:604:99:13086,0,11511
chr3	3115349	.	A	G	12979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.769;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.407;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,321:611:99:13008,0,11388
chr3	3115356	.	G	A	9110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-1.279;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.666;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,282:608:99:9139,0,13627
chr3	3115373	.	C	T	12467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.455;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.446;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,326:626:99:12496,0,11401
chr3	3115436	.	A	T	11822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.470;ClippingRankSum=1.896;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.122;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,309:616:99:11851,0,11619
chr3	3115453	.	CACTTT	C	11623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.948;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.105;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,303:636:99:11661,0,12941
chr3	3115455	.	C	CT	8637.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=-1.141;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.328;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,304:601:99:8675,0,11574
chr3	3115684	.	C	T	8854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.475;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=2.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.045;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.137;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,273:521:99:8883,0,7796
chr3	3115783	.	T	A	8505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.584;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.460;QD=13.31;ReadPosRankSum=2.120;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,294:639:99:8534,0,10701
chr3	3115845	.	T	C	8634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=1.368;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.508;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,288:626:99:8663,0,10127
chr3	3115888	.	G	A	8530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-0.159;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.237;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,286:596:99:8559,0,9722
chr3	3115954	.	T	C	9237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-1.618;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.098;QD=14.48;ReadPosRankSum=3.606;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,298:638:99:9266,0,10548
chr3	3116149	.	T	TACATACATACATACATATACTTACCTAATACATAC	1068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;QD=3.65;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,0:293:99:1106,0,11147
chr3	3116158	.	G	A	13786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-0.319;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-3.134;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,379:711:99:13815,0,11840
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chr3	3116220	.	G	A	17096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;ClippingRankSum=-0.302;DP=794;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-5.278;QD=21.78;ReadPosRankSum=-2.577;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,434:785:99:17125,0,13742
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chr3	3117605	.	T	A	7018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.832;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.131;QD=14.21;ReadPosRankSum=1.759;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,233:494:99:7047,0,7851
chr3	3117830	.	A	G	8107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.327;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.592;QD=16.12;ReadPosRankSum=3.786;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,255:503:99:8136,0,8243
chr3	3118081	.	TA	T	10162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.056;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.202;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,256:479:99:10200,0,8586
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chr3	3118158	.	AT	A	8488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=-0.811;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.851;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,269:510:99:8526,0,7663
chr3	3118203	.	ATGG	A	10859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.230;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.145;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,275:567:99:10897,0,11414
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chr3	3118209	.	A	AAG	11038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.785;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.869;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,285:570:99:11076,0,11306
chr3	3118519	.	T	C	8976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.026;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.093;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,314:616:99:9005,0,8626
chr3	3118708	.	G	A	7333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.050;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.758;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,239:489:99:7362,0,7687
chr3	3118900	.	C	G	9173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.720;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.289;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,300:602:99:9202,0,9411
chr3	3119043	.	C	G	8632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.229;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.725;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,290:602:99:8661,0,9192
chr3	3119371	.	C	T	7264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-0.064;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.288;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,233:461:99:7293,0,7044
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chr3	3119800	.	T	C	4589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.274;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.120;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,119:211:99:4618,0,3440
chr3	3119812	.	G	A	5236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-1.295;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.917;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,123:220:99:5265,0,4009
chr3	3119820	.	C	T	5296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.176;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=4.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.006;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.469	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,130:236:99:5325,0,4380
chr3	3119823	.	C	A	5197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=-0.337;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.682;QD=21.57;ReadPosRankSum=1.327;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:110,131:241:99:5226,0,4596
chr3	3119826	.	G	C	5389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=-1.365;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.476;QD=22.27;ReadPosRankSum=2.571;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,125:242:99:5418,0,4833
chr3	3119831	.	A	G	5644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.422;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.802;QD=22.67;ReadPosRankSum=2.042;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:119,130:249:99:5673,0,4804
chr3	3119832	.	T	C	5677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.055;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.067;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,134:255:99:5706,0,4910
chr3	3119844	.	C	T	5912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.542;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.084;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.715;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,149:283:99:5941,0,5752
chr3	3119845	.	C	G	5828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.193;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=2.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.357;QD=20.60;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,146:283:99:5857,0,5758
chr3	3119873	.	G	A	6098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.735;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=6.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.456;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,157:324:99:6127,0,7287
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chr3	3121882	.	TCATCATTAGCATTTCCTAGATTC	T	5424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.097;ClippingRankSum=-0.859;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-3.025;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,181:499:99:5462,0,12353
chr3	3121902	.	A	AT	8487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.625;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=3.162;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.010;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,278:462:99:8525,0,6585
chr3	3121955	.	C	T	7041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=-0.429;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=4.535;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.491;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,231:441:99:7070,0,6733
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chr3	3122347	.	T	C	6460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=-0.543;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.200;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,212:445:99:6489,0,7293
chr3	3122712	.	C	T	7312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.540;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=5.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-4.235;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,195:452:99:7341,0,16851
chr3	3122717	.	T	C	7159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.178;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=5.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=-4.581;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,184:428:99:7188,0,16646
chr3	3123128	.	A	G	4942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.624;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=13.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.351;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.523;SOR=1.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,167:334:99:4971,0,5256
chr3	3123325	.	C	T	3217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.136;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=24.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.005;QD=24.38;ReadPosRankSum=2.705;SOR=2.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,86:132:99:3246,0,2088
chr3	3123347	.	G	A	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.386;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=1.087;QD=23.37;ReadPosRankSum=1.840;SOR=1.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,91:134:99:3160,0,1875
chr3	3123669	.	T	C	7608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.449;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.565;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,246:469:99:7637,0,6743
chr3	3123736	.	T	TA	4272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=1.682;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=4.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=2.374;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:172,188:360:99:4310,0,3738
chr3	3123957	.	A	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.794;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=6.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=-4.433;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:1159,0,837
chr3	3123961	.	T	TA	1235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=-0.429;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=10.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQRankSum=-4.307;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.452;SOR=1.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,34:70:99:1273,0,1090
chr3	3124111	.	TG	T	13260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.472;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=2.306;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,344:688:99:13298,0,13814
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chr3	3124121	.	T	TA	13241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-0.485;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=2.029;QD=19.73;ReadPosRankSum=-2.844;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,329:671:99:13279,0,13686
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chr3	3124381	.	A	AT	10899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.223;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.085;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,311:652:99:10937,0,13137
chr3	3124562	.	TTAA	T	8674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.050;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.020;QD=16.40;ReadPosRankSum=4.625;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,234:529:99:8712,0,12836
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chr3	3124716	.	T	G	13585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-0.644;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.652;QD=20.07;ReadPosRankSum=-2.398;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,352:677:99:13614,0,12102
chr3	3124726	.	G	A	13419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=-2.360;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.374;QD=20.49;ReadPosRankSum=-3.517;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,344:655:99:13448,0,11965
chr3	3124806	.	T	A	11583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.617;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.401;QD=20.01;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,304:579:99:11612,0,10495
chr3	3124819	.	C	T	11067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-1.316;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.068;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,289:566:99:11096,0,10433
chr3	3124852	.	C	T	10136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.041;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.381;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.543;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,317:583:99:10165,0,8149
chr3	3124978	.	AC	A	11760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-0.330;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.173;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,317:609:99:11798,0,10425
chr3	3125007	.	G	T	11467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.063;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.873;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,314:629:99:11496,0,11464
chr3	3125181	.	C	T	9296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-1.730;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.127;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,297:561:99:9325,0,8173
chr3	3125230	.	T	C	10702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.580;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.333;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,268:503:99:10731,0,9672
chr3	3125240	.	C	T	11598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.845;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.181;QD=22.22;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,283:522:99:11627,0,9944
chr3	3125259	.	G	A	10984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.677;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.622;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,288:521:99:11013,0,8579
chr3	3125348	.	C	A	4091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.304;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.417;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.893;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,197:438:99:4120,0,7161
chr3	3125550	.	A	G	6109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.810;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.054;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,201:433:99:6138,0,7374
chr3	3125592	.	A	C	6592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.118;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.312;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,219:479:99:6621,0,7950
chr3	3125764	.	T	A	9183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.345;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.485;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,243:462:99:9212,0,8317
chr3	3125779	.	G	C	9364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.823;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.317;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,239:481:99:9393,0,9655
chr3	3125793	.	A	G	9320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.008;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.362;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,242:499:99:9349,0,9773
chr3	3125841	.	T	TC	7680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.456;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.221;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,251:544:99:7718,0,9064
chr3	3125842	.	C	CT	7289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.512;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.814;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.997;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,286:543:99:7327,0,7747
chr3	3125883	.	G	A	11030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.379;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=19.22;ReadPosRankSum=2.664;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,279:574:99:11059,0,11570
chr3	3125892	.	C	T	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=1.291;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.638;QD=19.54;ReadPosRankSum=2.396;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,286:578:99:11325,0,11605
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chr3	3125923	.	G	A	11377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.836;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.891;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,273:544:99:11406,0,11046
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chr3	3126391	.	AT	A	10963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.915;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.664;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,291:549:99:11001,0,9827
chr3	3126445	.	T	C	8677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-0.198;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.275;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,290:543:99:8706,0,7737
chr3	3126510	.	G	A	7379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=2.350;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=8.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.413;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,234:470:99:7408,0,7604
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chr3	3126729	.	C	T	7794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.697;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.500;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,241:487:99:7823,0,7949
chr3	3126765	.	G	T	7565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.214;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.681;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,247:505:99:7594,0,8051
chr3	3126812	.	A	G	8629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=1.452;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.597;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,283:565:99:8658,0,8577
chr3	3126853	.	G	A	8761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.592;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.145;QD=16.14;ReadPosRankSum=-1.680;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,276:543:99:8790,0,8257
chr3	3126891	.	CG	C	9732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.207;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.098;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.610;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,249:504:99:9770,0,10124
chr3	3126893	.	AAT	A	10300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.715;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.188;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.653;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,258:514:99:10338,0,9864
chr3	3126895	.	TC	T	9938.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-1.344;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.406;QD=19.41;ReadPosRankSum=-2.503;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,252:512:99:9976,0,10306
chr3	3126912	.	G	A	9444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-0.479;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.274;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,249:518:99:9473,0,10096
chr3	3126943	.	T	G	8784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=-0.899;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.711;QD=16.93;ReadPosRankSum=-1.775;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,289:519:99:8813,0,7470
chr3	3126994	.	GT	G	10696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.315;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.328;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,274:502:99:10734,0,8751
chr3	3126995	.	TC	T	7532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=-2.595;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.747;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,226:502:99:7570,0,10831
chr3	3127001	.	A	G	10694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.537;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.099;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,275:514:99:10723,0,9137
chr3	3127046	.	T	TA	5837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.494;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.032;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.532;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,244:526:99:5875,0,6964
chr3	3127100	.	A	G	9972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.012;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.588;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.563;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,330:617:99:10001,0,8692
chr3	3127126	.	A	T	9659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.362;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.366;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,314:615:99:9688,0,9324
chr3	3127168	.	A	G	8426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.178;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.210;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,269:547:99:8455,0,8733
chr3	3127227	.	A	C	9839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=-0.256;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.639;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.817;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,260:563:99:9868,0,11630
chr3	3127249	.	C	T	10843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.600;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.793;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,275:577:99:10872,0,12003
chr3	3127266	.	G	GA	8818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.490;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.176;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,268:572:99:8856,0,12314
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chr3	3127277	.	G	C	10622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=1.159;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.322;QD=18.87;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,275:563:99:10651,0,8715
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chr3	3129463	.	AT	A	11055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.204;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.327;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,286:627:99:11093,0,14249
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chr3	3129470	.	A	G	10739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.276;ClippingRankSum=-0.383;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.246;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,277:623:99:10768,0,14522
chr3	3129479	.	T	A	10986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=1.279;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.403;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,271:615:99:11015,0,10129
chr3	3129480	.	T	C	10732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.355;ClippingRankSum=0.293;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.101;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,276:622:99:10761,0,14165
chr3	3129489	.	T	C	10300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.103;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-1.697;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,284:627:99:10329,0,13558
chr3	3129518	.	A	AC	7641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.887;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=1.671;QD=14.23;ReadPosRankSum=6.641;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,275:537:99:7679,0,11214
chr3	3129519	.	C	CCCCATCAAATTACT	11131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.690;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-1.847;QD=20.09;ReadPosRankSum=-5.801;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,267:554:99:11169,0,10693
chr3	3129662	.	A	G	8054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=-0.026;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.630;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,268:541:99:8083,0,8729
chr3	3129731	.	T	C	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.106;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.370;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,242:463:99:9462,0,8554
chr3	3129740	.	T	A	10196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.312;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.177;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,253:477:99:10225,0,8956
chr3	3129743	.	A	G	9919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.634;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.578;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,249:473:99:9948,0,8842
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chr3	3130049	.	T	C	6654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.457;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.140;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.708;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,222:473:99:6683,0,7635
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chr3	3131749	.	A	G	9229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.503;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.519;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,244:465:99:9258,0,8272
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chr3	3132080	.	T	C	6700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.052;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.959;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,221:474:99:6729,0,7788
chr3	3132674	.	T	C	6907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.514;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.587;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,233:471:99:6936,0,7351
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chr3	3133255	.	CT	C	4221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.106;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.241;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,197:419:99:4259,0,5072
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chr3	3133430	.	G	A	6005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.978;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.367;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,204:440:99:6034,0,7153
chr3	3133459	.	A	G	6061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.559;ClippingRankSum=-0.097;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.938;QD=14.61;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,198:415:99:6090,0,5752
chr3	3133675	.	G	GA	4188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-0.115;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=9.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.657;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,186:377:99:4226,0,4577
chr3	3133712	.	G	A	8309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.945;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.271;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.324;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,216:429:99:8338,0,8383
chr3	3133723	.	T	C	8457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.447;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.648;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.880;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,214:437:99:8486,0,8732
chr3	3133726	.	T	A	8281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=-0.448;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.669;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,214:431:99:8310,0,8601
chr3	3133878	.	A	G	5363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.166;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.435;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,192:421:99:5392,0,6816
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chr3	3133925	.	G	T	7842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.464;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.461;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,201:402:99:7871,0,7740
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chr3	3136139	.	G	C	6651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-0.651;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=5.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.278;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.663;SOR=1.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,229:406:99:6680,0,4490
chr3	3136254	.	A	AT	4215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.432;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.904;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,200:428:99:4253,0,8160
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chr3	3136764	.	G	GT	3999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.598;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.071;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,182:382:99:4037,0,4551
chr3	3136778	.	A	AT	2074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.286;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.037;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.899;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,123:276:99:2112,0,2923
chr3	3136811	.	T	TG	4627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.422;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.490;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.112;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,173:380:99:4665,0,6382
chr3	3136812	.	G	GA	5231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.203;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.206;QD=13.73;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,207:381:99:5269,0,4967
chr3	3136845	.	C	G	6378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=1.634;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.777;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.413;SOR=1.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,209:419:99:6407,0,6102
chr3	3136909	.	T	C	9659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=1.312;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.768;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,254:515:99:9688,0,9872
chr3	3136926	.	T	C	9954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.301;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.586;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,260:533:99:9983,0,10295
chr3	3137104	.	T	C	10323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.512;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.425;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,328:664:99:10352,0,10115
chr3	3137143	.	A	G	10712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.359;DP=715;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.055;QD=15.53;ReadPosRankSum=2.510;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,343:690:99:10741,0,10756
chr3	3137170	.	G	A	11150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.704;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.634;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,350:692:99:11179,0,10924
chr3	3137278	.	T	C	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.342;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.242;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,290:569:99:9168,0,8762
chr3	3137627	.	C	CT	6487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.161;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.569;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,299:651:99:6525,0,8033
chr3	3137860	.	C	T	9531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.084;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.930;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,313:658:99:9560,0,10262
chr3	3137886	.	T	C	8860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.333;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.840;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,296:621:99:8889,0,10200
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chr3	3137970	.	C	A	5611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.155;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=6.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.865;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,154:311:99:5640,0,6036
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chr3	3140210	.	T	C	6254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-2.395;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.102;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,209:443:99:6283,0,7160
chr3	3140964	.	G	A	9030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.110;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.027;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.491;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,294:609:99:9059,0,9712
chr3	3141496	.	A	G	5508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.276;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.137;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,187:401:99:5537,0,6328
chr3	3141545	.	C	T	8837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=-0.442;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.876;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,229:488:99:8866,0,10041
chr3	3141552	.	G	A	8739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;ClippingRankSum=-1.424;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.645;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,228:480:99:8768,0,9919
chr3	3141726	.	A	G	6158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.074;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.734;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,202:440:99:6187,0,7645
chr3	3141811	.	C	T	7835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.892;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.480;QD=14.51;ReadPosRankSum=2.836;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,255:540:99:7864,0,8963
chr3	3141857	.	G	A	8494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-0.813;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.148;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,260:485:99:8523,0,8291
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chr3	3141880	.	C	T	8674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.006;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.318;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,220:493:99:8703,0,11229
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chr3	3142170	.	AC	A	9458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.392;ClippingRankSum=1.182;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.527;QD=17.91;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,239:528:99:9496,0,11476
chr3	3142176	.	CACTT	C	9507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.711;ClippingRankSum=0.513;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.697;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,234:522:99:9545,0,11491
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chr3	3142224	.	C	T	9255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.878;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.353;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.844;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,239:493:99:9284,0,9995
chr3	3142239	.	T	C	8721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.692;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.855;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,249:482:99:8750,0,8802
chr3	3142315	.	C	CT	10992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-2.228;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.453;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,284:541:99:11030,0,9806
chr3	3142321	.	C	CA	9579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.566;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.161;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,246:536:99:9617,0,11750
chr3	3142327	.	T	TCC	11875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.872;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.697;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,297:556:99:11913,0,10306
chr3	3142329	.	C	CT	9993.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.540;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.029;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,263:565:99:10031,0,11868
chr3	3142356	.	TCAG	T	10006.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=1.101;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.517;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,262:561:99:10044,0,11794
chr3	3142366	.	C	CA	10984.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.465;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.373;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,261:551:99:11022,0,11742
chr3	3142368	.	A	AT	11968.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.545;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.303;QD=21.45;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,288:558:99:12006,0,10836
chr3	3142371	.	C	G	10762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.717;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.861;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,268:562:99:10791,0,12051
chr3	3142383	.	G	GC	11548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=-0.811;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.358;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.821;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,281:552:99:11586,0,10866
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chr3	3142389	.	TC	T	11695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=1.648;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.699;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,280:542:99:11733,0,10537
chr3	3142392	.	TC	T	9974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=1.210;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.137;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,258:539:99:10012,0,11278
chr3	3142397	.	C	T	10976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=1.565;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.987;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,279:533:99:11005,0,10042
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chr3	3142499	.	G	A	8486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.122;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.838;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,274:570:99:8515,0,9122
chr3	3142706	.	G	GTTTTTT	3422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.622;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=23.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-3.651;QD=22.23;ReadPosRankSum=-2.093;SOR=0.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,111:154:99:3460,0,1069
chr3	3143031	.	T	C	6934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=-1.587;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.766;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,226:452:99:6963,0,6583
chr3	3143083	.	C	T	7592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.950;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.150;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,247:488:99:7621,0,7410
chr3	3143115	.	T	C	7991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.749;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.866;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,263:509:99:8020,0,7619
chr3	3143177	.	C	T	12898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.069;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.214;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,333:630:99:12927,0,11563
chr3	3143185	.	G	A	12800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.532;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.216;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,330:639:99:12829,0,11734
chr3	3143244	.	A	G	12734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.013;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.381;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,332:643:99:12763,0,11855
chr3	3143254	.	G	A	12457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.010;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.719;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,329:639:99:12486,0,11798
chr3	3143402	.	C	T	9510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=1.721;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.476;QD=15.59;ReadPosRankSum=3.761;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,315:610:99:9539,0,8464
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chr3	3145664	.	T	C	10263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.070;DP=750;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.631;QD=14.24;ReadPosRankSum=2.349;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:373,348:721:99:10292,0,10533
chr3	3146556	.	A	G	9017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-1.070;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.364;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,296:566:99:9046,0,8283
chr3	3146856	.	C	G	11143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.650;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.422;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.878;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,350:638:99:11172,0,8846
chr3	3146935	.	G	T	10274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.323;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.648;QD=16.13;ReadPosRankSum=-2.267;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,326:637:99:10303,0,9831
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chr3	3150118	.	T	A	9064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.217;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.340;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,240:484:99:9093,0,9450
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chr3	3150153	.	C	CT	4814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=1.165;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=15.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.333;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.878;SOR=0.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,176:346:99:4852,0,6716
chr3	3150156	.	T	TC	6749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.270;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=14.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.272;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=1.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,173:355:99:6787,0,7428
chr3	3150163	.	T	C	6849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=-0.870;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=13.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.582;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.920;SOR=1.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,172:349:99:6878,0,7193
chr3	3150166	.	G	A	7157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.973;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=12.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.758;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.025;SOR=1.314	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,177:358:99:7186,0,7337
chr3	3150172	.	T	G	7071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=0.946;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=6.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.175;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=1.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,184:372:99:7100,0,7554
chr3	3150175	.	GA	G	7263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=-0.958;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.654;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,184:368:99:7301,0,4450
chr3	3150224	.	A	AATT	6741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.670;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=2.355;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,175:366:99:6779,0,7197
chr3	3150401	.	T	A	10450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.522;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.367;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,333:622:99:10479,0,8628
chr3	3150589	.	T	C	9295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=-1.260;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.668;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,293:564:99:9324,0,8263
chr3	3150714	.	C	A	7525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-0.556;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.225;QD=16.01;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,253:470:99:7554,0,6190
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chr3	3155250	.	T	TA	5827.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.281;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.244;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,254:524:99:5865,0,6479
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chr3	3155370	.	G	C	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.441;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.094;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,293:545:99:9356,0,8206
chr3	3155512	.	A	G	8025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.872;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.387;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,250:509:99:8054,0,7898
chr3	3155857	.	C	T	7939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=-1.482;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.704;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,283:578:99:7968,0,9083
chr3	3156286	.	A	G	8044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.132;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.530;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,265:512:99:8073,0,7327
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chr3	3157259	.	TC	T	7800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-1.249;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=0.882;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,258:503:99:7838,0,7936
chr3	3157280	.	ATAATTCAAAGTATTTGTATGTAT	A	4860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.966;ClippingRankSum=0.739;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=5.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-2.765;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.987	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,135:368:99:4898,0,9063
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chr3	3157483	.	G	C	7367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.275;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.986;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,237:515:99:7396,0,8639
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chr3	3158408	.	G	A	11113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.974;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.783;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,354:652:99:11142,0,9385
chr3	3158731	.	T	TA	4802.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.687;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.204;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,210:451:99:4840,0,7840
chr3	3158734	.	A	AG	7468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=2.050;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.134;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,253:473:99:7506,0,6802
chr3	3158953	.	C	T	9176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-1.098;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.272;QD=13.84;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,305:663:99:9205,0,11299
chr3	3159007	.	G	A	8586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.119;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.275;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.526;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,278:648:99:8615,0,11664
chr3	3159031	.	G	GT	13210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-0.681;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.306;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,338:609:99:13248,0,10330
chr3	3159033	.	CTGTT	C,CTTGTT	26866.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.98;QD=30.59;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,272,347:619:99:26904,14735,13854,11781,0,10662
chr3	3159035	.	G	GT	13589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.950;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.400;QD=22.84;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,325:595:99:13627,0,10280
chr3	3159044	.	T	TA	11062.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=-0.944;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.396;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,272:576:99:11100,0,12405
chr3	3159047	.	A	AT	12565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.634;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.595;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,300:569:99:12603,0,10668
chr3	3159048	.	A	G	12568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.805;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.446;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,300:566:99:12597,0,10752
chr3	3159057	.	G	A	12562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.531;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.468;QD=21.62;ReadPosRankSum=2.314;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,299:581:99:12591,0,11421
chr3	3159067	.	T	C	12637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-2.839;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.229;QD=21.49;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,310:588:99:12666,0,11121
chr3	3159072	.	TG	TGG,T	25106.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.98;QD=29.85;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,275,303:578:99:25144,13121,12294,11798,0,10872
chr3	3159103	.	G	A	8608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-0.364;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.056;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,263:546:99:8637,0,9183
chr3	3159173	.	G	GGA	9742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.645;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.059;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,260:515:99:9780,0,9350
chr3	3159265	.	A	G	10228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.297;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.837;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,268:554:99:10257,0,15207
chr3	3159273	.	T	A	10529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=-1.703;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.647;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,262:547:99:10558,0,15787
chr3	3159277	.	T	C	10183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-1.752;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.141;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,262:557:99:10212,0,15471
chr3	3159364	.	T	C	9446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=-0.092;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.241;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,263:579:99:9475,0,11888
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chr3	3159841	.	A	G	8716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.775;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.075;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,274:564:99:8745,0,8919
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chr3	3160477	.	C	T	11383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-1.016;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.696;QD=20.59;ReadPosRankSum=2.650;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,294:553:99:11412,0,9871
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chr3	3160598	.	G	C	7697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-2.037;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.381;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,257:546:99:7726,0,8836
chr3	3160632	.	C	T	7469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.677;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.792;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,244:503:99:7498,0,8001
chr3	3160711	.	T	G	7423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.604;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.729;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,238:495:99:7452,0,8113
chr3	3160765	.	G	A	8650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.333;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.472;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,284:550:99:8679,0,7956
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chr3	3161592	.	C	T	9907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=1.931;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.079;QD=15.93;ReadPosRankSum=3.097;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,320:622:99:9936,0,9099
chr3	3162183	.	G	A	10614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.462;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.947;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,264:493:99:10643,0,10813
chr3	3162184	.	G	A	10614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-0.960;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.171;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,272:500:99:10643,0,10813
chr3	3162337	.	C	A	10232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.655;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.869;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,329:585:99:10261,0,7635
chr3	3162633	.	A	G	8978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.341;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.012;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,288:594:99:9007,0,9269
chr3	3162810	.	G	A	9580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.384;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.139;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,252:580:99:9609,0,12978
chr3	3162815	.	T	C	9768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.883;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.026;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,260:598:99:9797,0,13088
chr3	3162923	.	A	G	7456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=2.138;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.925;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.789;SOR=0.443	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,244:531:99:7485,0,9255
chr3	3163169	.	G	A	8296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.151;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.227;QD=14.48;ReadPosRankSum=3.067;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,272:573:99:8325,0,9564
chr3	3163518	.	C	A	9614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.625;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.935;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,310:601:99:9643,0,9086
chr3	3163824	.	G	T	8637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.864;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.565;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,293:595:99:8666,0,9169
chr3	3164267	.	C	T	9821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.497;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.250;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,257:513:99:9850,0,11661
chr3	3164279	.	T	C	9935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.496;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.859;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,252:502:99:9964,0,11940
chr3	3164282	.	A	G	9986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.134;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.187;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,257:506:99:10015,0,11767
chr3	3164312	.	G	A	8677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.593;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.571;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,277:536:99:8706,0,8255
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chr3	3164339	.	A	G	10199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.026;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=5.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.263;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.799;SOR=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,260:492:99:10228,0,10260
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chr3	3166437	.	C	CAAATAAA	11489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.941;ClippingRankSum=0.574;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.499;QD=23.16;ReadPosRankSum=-4.415;SOR=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,261:496:99:11527,0,9367
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chr3	3166452	.	T	C	5194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.485;ClippingRankSum=-0.654;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=13.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.250;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,225:459:99:5223,0,9452
chr3	3166453	.	TA	T	5190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.239;ClippingRankSum=-0.227;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=14.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=1.105;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,230:466:99:5228,0,9369
chr3	3166648	.	G	A	7227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.794;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.500;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,243:464:99:7256,0,6695
chr3	3166757	.	C	T	8924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.431;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.466;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.149;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,281:561:99:8953,0,8855
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chr3	3167827	.	G	A	7852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.704;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.847;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,252:576:99:7881,0,10222
chr3	3168112	.	T	C	9955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.946;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.666;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,311:601:99:9984,0,9116
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chr3	3168866	.	A	G	9109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.336;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.103;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,290:595:99:9138,0,9597
chr3	3168917	.	A	C	10104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.040;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.713;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,262:512:99:10133,0,9594
chr3	3168930	.	A	T	10025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.671;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.330;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,265:530:99:10054,0,10626
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chr3	3168963	.	G	A	7732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.004;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.902;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,253:492:99:7761,0,9143
chr3	3169157	.	G	GC	3640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.129;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.170;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,152:303:99:3678,0,3689
chr3	3169427	.	T	A	9505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.956;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.903;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,241:477:99:9534,0,9180
chr3	3169432	.	G	C	9601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.720;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.340;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,248:485:99:9630,0,9176
chr3	3169475	.	G	A	7499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=-1.181;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.177;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,242:471:99:7528,0,7407
chr3	3169529	.	G	C	10224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=-0.615;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.877;QD=20.01;ReadPosRankSum=1.106;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,264:511:99:10253,0,9409
chr3	3169540	.	C	T	10156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=1.800;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.979;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.772;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,269:520:99:10185,0,9492
chr3	3169570	.	G	A	8971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.077;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.245;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,289:564:99:9000,0,8713
chr3	3169682	.	TG	T	9385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.802;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.238;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.461;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,274:543:99:9423,0,9144
chr3	3169766	.	TC	T	3243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.311;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-6.026;QD=7.87;ReadPosRankSum=5.660;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,163:412:99:3281,0,9601
chr3	3169783	.	T	C	8129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.293;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-6.404;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,210:453:99:8158,0,9853
chr3	3169786	.	A	T	8258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=-1.802;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-6.789;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,219:459:99:8287,0,9485
chr3	3169918	.	T	TCC	5404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.257;ClippingRankSum=-0.516;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.060;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,179:474:99:5442,0,11553
chr3	3169919	.	T	C	7610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.220;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.054;QD=15.31;ReadPosRankSum=-2.043;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,204:497:99:7639,0,11352
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chr3	3170316	.	C	A	12929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=-1.592;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.283;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,344:665:99:12958,0,12330
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chr3	3173300	.	A	G	10443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.581;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.711;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.870;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,283:544:99:10472,0,9715
chr3	3173467	.	GATAAATGAAATAAATGAA	G,GATAAATGAAATAAATGAAATAAATGAAATAAATGAA	13511.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.70;QD=31.81;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,150,190:340:99:13549,7661,11845,5905,0,5372
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chr3	3173704	.	T	G	9629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.540;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.576;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,309:645:99:9658,0,10358
chr3	3173803	.	C	T	8748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.030;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.261;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,273:561:99:8777,0,9143
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chr3	3173910	.	T	G	8314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.327;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.405;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.902;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,282:586:99:8343,0,11523
chr3	3173954	.	G	A	7678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=-0.431;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.638;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,243:533:99:7707,0,9030
chr3	3174155	.	T	C	9614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.686;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.490;QD=16.27;ReadPosRankSum=2.729;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,307:591:99:9643,0,8000
chr3	3174326	.	A	AT	7986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=-1.261;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.286;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,322:593:99:8024,0,6455
chr3	3174446	.	A	C	7641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-1.480;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.035;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,254:520:99:7670,0,8118
chr3	3174526	.	A	G	7981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.607;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.945;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,257:517:99:8010,0,8441
chr3	3174577	.	T	C	8303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.277;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.368;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,276:556:99:8332,0,8141
chr3	3175301	.	G	A	9405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.006;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.997;QD=16.27;ReadPosRankSum=5.091;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,318:578:99:9434,0,8024
chr3	3175567	.	A	ATC	19394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=1.151;DP=882;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-2.068;QD=22.84;ReadPosRankSum=-7.171;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:428,421:849:99:19432,0,33155
chr3	3175568	.	A	AACAGCAAATGCAT	19643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=1.069;DP=896;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-3.347;QD=22.66;ReadPosRankSum=-7.404;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:435,432:867:99:19681,0,33366
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chr3	3178741	.	T	C	9192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.221;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.241;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,305:660:99:9221,0,10853
chr3	3178824	.	A	G	10001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=-0.510;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.183;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,324:640:99:10030,0,10181
chr3	3179133	.	G	T	8372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=1.974;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.330;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.104;SOR=1.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,260:530:99:8401,0,8490
chr3	3179494	.	T	C	9402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.695;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.541;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,303:593:99:9431,0,9028
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chr3	3184492	.	C	T	5765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.894;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=11.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.088;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.924;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,178:363:99:5794,0,5755
chr3	3184653	.	C	T	6735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.139;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.003;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,224:428:99:6764,0,6279
chr3	3186079	.	A	T	8924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.914;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.304;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,286:555:99:8953,0,8038
chr3	3186146	.	C	A	9822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.703;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.238;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,298:570:99:9851,0,8684
chr3	3186309	.	CT	C	6223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.852;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.510;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,256:526:99:6261,0,6650
chr3	3186358	.	A	AATATTTCCTATTTTTTTATATTT	5759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=-0.882;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.953;QD=10.75;ReadPosRankSum=-5.622;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,241:536:99:5797,0,10742
chr3	3186359	.	G	GAA	12299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.492;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.588;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.496;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,269:562:99:12337,0,10305
chr3	3186517	.	G	A	7253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=-0.904;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.503;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,250:511:99:7282,0,8182
chr3	3187446	.	C	G	9949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.134;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.298;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,315:598:99:9978,0,8850
chr3	3187521	.	C	T	9158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;ClippingRankSum=0.242;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.177;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,297:566:99:9187,0,8487
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chr3	3195948	.	T	C	9956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=-1.720;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.347;QD=17.53;ReadPosRankSum=-4.088;SOR=1.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,265:568:99:9985,0,11812
chr3	3195955	.	C	CA	3385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;ClippingRankSum=0.143;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.938;QD=6.51;ReadPosRankSum=-2.174;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,205:520:99:3423,0,12817
chr3	3195962	.	G	A	12041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.757;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.744;QD=19.30;ReadPosRankSum=-5.678;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,307:624:99:12070,0,12631
chr3	3195968	.	G	A	12242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.131;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.617;QD=19.16;ReadPosRankSum=-5.476;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,316:639:99:12271,0,12750
chr3	3195973	.	G	A	10184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.043;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.315;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,269:589:99:10213,0,9936
chr3	3196253	.	C	T	10585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=-0.616;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.119;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.640;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,335:645:99:10614,0,10029
chr3	3196300	.	G	A	11526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-0.049;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.367;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,360:693:99:11555,0,10148
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chr3	3202828	.	G	C	9453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.295;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.147;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.345;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,307:597:99:9482,0,9084
chr3	3202923	.	C	T	9255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=-0.330;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.159;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.364;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,291:586:99:9284,0,8977
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chr3	3207132	.	TA	T	7134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=1.068;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.008;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,257:544:99:7172,0,9024
chr3	3207134	.	AG	A	8431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=-0.596;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.332;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,291:554:99:8469,0,8375
chr3	3207225	.	AT	A	7608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.381;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.398;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,261:531:99:7646,0,8566
chr3	3207226	.	TG	T	7388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.522;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.834;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,267:529:99:7426,0,8114
chr3	3207315	.	T	TC	7552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.790;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.112;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,287:592:99:7590,0,9410
chr3	3207316	.	C	CT	7718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=-0.313;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.986;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,297:587:99:7756,0,8323
chr3	3207388	.	C	T	7267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-1.523;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.666;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,239:502:99:7296,0,8384
chr3	3207434	.	A	T	8783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.500;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.057;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,232:491:99:8812,0,10078
chr3	3207442	.	G	A	9475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-1.349;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.740;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,241:494:99:9504,0,10341
chr3	3207454	.	A	G	9421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.522;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.562;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,251:508:99:9450,0,9837
chr3	3207598	.	C	T	9454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=-0.190;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.199;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,246:553:99:9483,0,12396
chr3	3207600	.	A	T	9605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.061;ClippingRankSum=-0.478;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-0.666;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.847;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,246:556:99:9634,0,12636
chr3	3207606	.	T	TTTTCATGA	10186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.398;ClippingRankSum=-0.557;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-2.411;QD=18.66;ReadPosRankSum=-2.809;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,240:546:99:10224,0,12381
chr3	3207613	.	C	A	9151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.299;ClippingRankSum=-0.511;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.341;QD=17.40;ReadPosRankSum=-2.674;SOR=1.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,227:526:99:9180,0,12318
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chr3	3207637	.	TC	T	7898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;ClippingRankSum=0.287;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=1.273;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.810;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,206:479:99:7936,0,11211
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chr3	3210982	.	A	G	8929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.264;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.236;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,286:566:99:8958,0,10572
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chr3	3211089	.	A	AG	6308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.728;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.331;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,234:518:99:6346,0,9214
chr3	3211126	.	C	T	8833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-1.414;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.360;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,279:497:99:8862,0,6516
chr3	3211287	.	G	A	9502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.821;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.143;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,306:587:99:9531,0,8294
chr3	3211413	.	G	C	9674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.478;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.665;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,309:596:99:9703,0,8754
chr3	3211464	.	G	A	9157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.794;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.573;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,297:605:99:9186,0,9450
chr3	3211524	.	C	T	8671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.047;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.181;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,271:562:99:8700,0,9528
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chr3	3211797	.	G	T	9473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=1.257;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.396;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,252:482:99:9502,0,8552
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chr3	3212736	.	C	A	9795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.564;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.664;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,263:554:99:9824,0,11293
chr3	3212762	.	G	GA	9849.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-0.243;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.350;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,249:516:99:9887,0,10520
chr3	3212766	.	T	C	10007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.653;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.205;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,261:535:99:10036,0,10606
chr3	3212922	.	A	G	11408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=1.521;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.560;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,297:538:99:11437,0,8966
chr3	3212941	.	A	G	11841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.778;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.752;QD=21.69;ReadPosRankSum=1.265;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,290:546:99:11870,0,10137
chr3	3212944	.	G	A	11944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.982;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.979;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,294:542:99:11973,0,9834
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chr3	3212960	.	C	T	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.029;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.345;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,291:533:99:11450,0,9339
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chr3	3213973	.	G	GT	8992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-1.497;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.262;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,233:456:99:9030,0,8728
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chr3	3213978	.	A	G	9053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-0.318;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.867;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,236:474:99:9082,0,9046
chr3	3214126	.	G	T	10289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=1.794;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.733;QD=20.42;ReadPosRankSum=1.641;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,267:504:99:10318,0,8948
chr3	3214133	.	C	CT	10130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.589;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.385;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.782;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,255:492:99:10168,0,9489
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chr3	3214135	.	C	CG	10085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=1.593;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.849;QD=21.14;ReadPosRankSum=2.876;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,240:477:99:10123,0,9318
chr3	3214147	.	C	T	7353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=-0.529;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.615;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,245:478:99:7382,0,7153
chr3	3214228	.	T	A	7672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.183;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.478;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.573;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,244:510:99:7701,0,8376
chr3	3214273	.	G	T	8103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=0.152;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.007;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,273:566:99:8132,0,8441
chr3	3214341	.	G	A	8297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.320;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.319;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,285:590:99:8326,0,9222
chr3	3214438	.	T	C	7784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=1.660;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.007;QD=14.83;ReadPosRankSum=3.377;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,254:525:99:7813,0,8768
chr3	3214474	.	C	T	10907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.226;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.105;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,290:569:99:10936,0,10843
chr3	3214489	.	T	C	11494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=1.456;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.011;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,282:562:99:11523,0,11277
chr3	3214510	.	C	G	12388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.640;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.534;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,300:586:99:12417,0,11517
chr3	3214517	.	T	G	13120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=1.373;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.419;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,309:588:99:13149,0,11214
chr3	3214519	.	C	T	12919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=-2.118;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.704;QD=21.46;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,322:602:99:12948,0,11103
chr3	3214528	.	A	G	12856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=2.105;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.601;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,312:593:99:12885,0,11400
chr3	3214546	.	C	T	11983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.618;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.208;QD=20.84;ReadPosRankSum=1.563;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,297:575:99:12012,0,11337
chr3	3214570	.	C	T	12826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=1.421;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.389;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,318:595:99:12855,0,11027
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chr3	3215940	.	G	A	6408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.647;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.608;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,200:403:99:6437,0,7989
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chr3	3215977	.	CT	C,CTTT	5344.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.011;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.33;MQRankSum=1.317;QD=30.37;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:12,77,87:176:99:5382,1949,2852,2133,0,2423
chr3	3215996	.	G	GT	5340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=2.000;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=0.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=1.801;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.374;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,147:259:99:5378,0,4410
chr3	3215998	.	TTA	T	4303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.233;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=0.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=0.173;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.956;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,131:301:99:4341,0,6393
chr3	3216058	.	A	G	8009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.689;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.440;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,210:417:99:8038,0,7910
chr3	3216077	.	A	G	8872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.309;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.617;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,223:456:99:8901,0,9457
chr3	3216090	.	A	G	8722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.829;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.974;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,235:489:99:8751,0,9698
chr3	3216160	.	A	G	7026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.213;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.456;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,231:478:99:7055,0,7754
chr3	3216198	.	C	T	8466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.214;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.633;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.243;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,217:453:99:8495,0,9258
chr3	3216200	.	T	C	8763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.644;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.281;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,217:452:99:8792,0,9780
chr3	3216206	.	G	A	9053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=-0.002;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.033;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,223:472:99:9082,0,10252
chr3	3216209	.	T	C	8961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.570;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.670;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,227:482:99:8999,0,10219
chr3	3216230	.	TG	T	9935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.118;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.047;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,255:467:99:9973,0,8206
chr3	3216231	.	GA	G	7858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-1.092;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.442;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,207:463:99:7896,0,10573
chr3	3216254	.	A	C	9760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=1.315;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.316;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,239:429:99:9789,0,7567
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chr3	3216261	.	GA	G	7143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.845;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.411;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,186:429:99:7181,0,9757
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chr3	3218547	.	TC	T	8873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.730;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.227;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,305:642:99:8911,0,10650
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chr3	3218649	.	CA	C	10334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.308;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.523;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,318:681:99:10372,0,13700
chr3	3218650	.	AG	A	13253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.452;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.328;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,354:679:99:13291,0,12174
chr3	3218669	.	T	C	14726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-2.338;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.942;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,367:692:99:14755,0,12844
chr3	3218678	.	GC	G	14709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.455;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.380;QD=21.70;ReadPosRankSum=-1.373;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,359:678:99:14747,0,12924
chr3	3218679	.	CT	C	11556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=-0.183;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.613;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.207;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,316:674:99:11594,0,14673
chr3	3218694	.	C	T	14532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.526;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.487;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,353:658:99:14561,0,12492
chr3	3218707	.	G	A	13928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=-0.796;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.382;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,349:668:99:13957,0,12609
chr3	3218725	.	G	A	12559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=-1.751;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.310;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.781;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,327:627:99:12588,0,11442
chr3	3218802	.	C	T	13069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.200;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.786;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,330:647:99:13098,0,12424
chr3	3218803	.	T	C	13216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.834;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.813;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.536;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,327:646:99:13245,0,12409
chr3	3218807	.	A	C	12951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.877;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.608;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,334:648:99:12980,0,12330
chr3	3218867	.	GC	G	13026.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=-1.215;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.326;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,339:669:99:13064,0,12556
chr3	3218868	.	CT	C	12518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-1.116;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.182;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,330:672:99:12556,0,13108
chr3	3218870	.	AT	A	12582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.241;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.296;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,328:669:99:12620,0,13099
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chr3	3218938	.	A	G	10256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=1.124;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.269;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,319:612:99:10285,0,9143
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chr3	3219538	.	T	TCCATA	10932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.194;ClippingRankSum=-1.050;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.777;QD=22.78;ReadPosRankSum=-3.129;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,257:480:99:10970,0,8967
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chr3	3219544	.	C	CT	10169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.131;ClippingRankSum=-0.101;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.481;QD=21.82;ReadPosRankSum=-2.724;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,244:466:99:10207,0,8540
chr3	3219552	.	T	A	9000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=1.101;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.251;QD=19.65;ReadPosRankSum=2.859;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,223:458:99:9029,0,9796
chr3	3219555	.	TTGC	T	8578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.256;ClippingRankSum=1.281;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.131;QD=18.53;ReadPosRankSum=3.431;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,216:463:99:8616,0,10048
chr3	3219558	.	C	CA	9818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=-0.368;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.865;QD=21.72;ReadPosRankSum=-3.953;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,240:452:99:9856,0,8169
chr3	3219559	.	AT	A	8149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=1.181;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.189;QD=17.87;ReadPosRankSum=3.981;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,214:456:99:8187,0,9658
chr3	3219616	.	A	T	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=1.458;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.812;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,232:474:99:8973,0,9454
chr3	3219617	.	T	C	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.134;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=3.123;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,230:468:99:8973,0,9454
chr3	3219619	.	C	T	9108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.876;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.364;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,239:473:99:9137,0,9134
chr3	3219659	.	T	A	9844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.247;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.071;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,261:526:99:9873,0,10058
chr3	3219675	.	C	T	10538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.218;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.308;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,264:537:99:10567,0,11141
chr3	3219689	.	T	A	11516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.198;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.581;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,290:585:99:11545,0,11856
chr3	3219707	.	C	T	11616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-1.674;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.180;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.550;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,310:611:99:11645,0,11503
chr3	3219774	.	T	A	10945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-1.156;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.070;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.869;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,296:588:99:10974,0,10904
chr3	3219798	.	A	G	10854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-1.008;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.800;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,272:550:99:10883,0,11140
chr3	3219801	.	C	T	10573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.885;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.118;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,265:538:99:10602,0,11169
chr3	3219806	.	G	A	10799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.084;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.446;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,263:529:99:10828,0,10608
chr3	3219807	.	G	A	10625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.406;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.342;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,259:525:99:10654,0,10639
chr3	3219820	.	G	A	10068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-1.344;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.926;QD=18.96;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,267:531:99:10097,0,10155
chr3	3219849	.	C	A	8787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.693;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.954;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.551;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,269:544:99:8816,0,10864
chr3	3219860	.	A	G	8363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=2.707;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.470;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,274:541:99:8392,0,10433
chr3	3219972	.	T	C	8796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=-0.448;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.413;QD=17.45;ReadPosRankSum=2.670;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,273:504:99:8825,0,6931
chr3	3220279	.	TCGC	T	10402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.459;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.248;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.675;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,272:555:99:10440,0,10804
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chr3	3222660	.	T	C	10127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-0.877;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.439;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,321:616:99:10156,0,8988
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chr3	3223329	.	G	A	8992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.541;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.153;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,300:594:99:9021,0,8684
chr3	3223948	.	G	GA	10644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-0.217;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=8.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.154;QD=23.14;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,266:460:99:10682,0,7540
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chr3	3223950	.	G	A	10653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=1.011;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=8.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.375;QD=22.57;ReadPosRankSum=1.399;SOR=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,270:472:99:10682,0,7540
chr3	3223995	.	A	T	11416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=-0.496;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.508;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,298:534:99:11445,0,8886
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chr3	3224029	.	G	A	10855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-0.606;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.792;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,284:539:99:10884,0,9648
chr3	3224162	.	C	T	5701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=-0.672;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=1.048;QD=14.73;ReadPosRankSum=-2.399;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,178:387:99:5730,0,7216
chr3	3224200	.	A	G	6742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=1.537;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=11.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.119;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.672;SOR=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,175:400:99:6771,0,8579
chr3	3224225	.	T	A	7947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.688;ClippingRankSum=-0.105;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.186;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,206:436:99:7976,0,9142
chr3	3224234	.	C	T	8109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.086;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=10.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.544;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,207:434:99:8138,0,9232
chr3	3224242	.	C	T	7897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.034;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=13.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.283;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,203:439:99:7926,0,9050
chr3	3224487	.	G	T	11476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.728;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.414;QD=16.40;ReadPosRankSum=-2.177;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,361:700:99:11505,0,10259
chr3	3224697	.	G	A	7478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.996;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.901;QD=13.17;ReadPosRankSum=2.541;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,282:568:99:7507,0,8533
chr3	3225140	.	CAT	C	12094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=1.031;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,312:594:99:12132,0,10682
chr3	3225143	.	CT	C	12096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.769;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.459;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,316:599:99:12134,0,10654
chr3	3225177	.	C	T	10755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=-2.119;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.344;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,334:626:99:10784,0,8723
chr3	3225476	.	C	G	10038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.442;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=9.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.024;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,263:562:99:10067,0,11468
chr3	3225490	.	A	G	10875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.674;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.421;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,279:580:99:10904,0,11993
chr3	3225511	.	G	A	11193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.147;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.748;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,284:584:99:11222,0,12438
chr3	3225532	.	A	G	12100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=-0.087;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.868;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,302:602:99:12129,0,12039
chr3	3225549	.	T	A	11621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-1.315;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.645;QD=20.00;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,285:581:99:11650,0,12095
chr3	3225560	.	C	T	10965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.752;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.903;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,287:591:99:10994,0,11731
chr3	3225593	.	G	A	8898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.611;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.158;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,283:588:99:8927,0,9318
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chr3	3225755	.	C	T	9123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.169;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.311;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,286:581:99:9152,0,9338
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chr3	3229996	.	A	G	9871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-1.418;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.647;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,266:579:99:9900,0,12556
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chr3	3230009	.	AG	A	10180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-0.854;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.922;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,280:615:99:10218,0,12691
chr3	3230097	.	T	C	9155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.046;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=9.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.647;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.820;SOR=0.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,284:549:99:9184,0,8553
chr3	3230241	.	A	C	9483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=1.777;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.575;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,303:600:99:9512,0,9207
chr3	3230286	.	A	G	9611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.545;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=5.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.276;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.455;SOR=1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,316:651:99:9640,0,10359
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chr3	3233411	.	T	A	9136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.790;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.410;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,297:575:99:9165,0,8564
chr3	3233707	.	A	G	9275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.031;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.114;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,313:643:99:9304,0,9973
chr3	3233816	.	T	C	9487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=-0.389;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.053;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,310:616:99:9516,0,9116
chr3	3234347	.	T	C	9391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-1.276;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.676;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,300:598:99:9420,0,9270
chr3	3234364	.	A	G	9370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-0.182;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.700;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.627;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,301:606:99:9399,0,9387
chr3	3234400	.	T	C	11869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.287;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.151;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,306:595:99:11898,0,11008
chr3	3234407	.	T	C	11730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.011;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.483;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,297:594:99:11759,0,11381
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chr3	3234768	.	C	T	10216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.866;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.943;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,326:619:99:10245,0,8921
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chr3	3238205	.	TC	T	9633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-1.464;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=5.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.115;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,325:686:99:9671,0,11689
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chr3	3239192	.	G	A	10432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-2.188;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.757;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,271:535:99:10461,0,13416
chr3	3239200	.	C	T	10512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.244;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.827;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,268:519:99:10541,0,13288
chr3	3239339	.	T	C	9392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-1.285;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.718;QD=15.71;ReadPosRankSum=3.043;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,300:598:99:9421,0,9046
chr3	3239428	.	C	T	12313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.785;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.558;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,331:644:99:12342,0,11947
chr3	3239449	.	G	A	11687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-0.182;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.707;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,312:614:99:11725,0,11477
chr3	3239568	.	G	A	9314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.367;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.266;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,297:596:99:9343,0,9120
chr3	3239697	.	G	A	10934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.484;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.796;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,293:609:99:10963,0,12221
chr3	3239704	.	A	G	10920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=1.041;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.128;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,284:593:99:10949,0,12091
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chr3	3239749	.	ATAAG	A	11532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.193;ClippingRankSum=0.913;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.692;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.734;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,307:651:99:11570,0,13381
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chr3	3240906	.	G	C	6319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.377;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.234;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,219:437:99:6348,0,6833
chr3	3240986	.	A	AAG,ATG	22828.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.23;QD=29.76;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,228,296:524:99:22866,10894,9688,7523,0,6145
chr3	3240990	.	A	AGGGGAATGGGAGAGAGGAGGAAAGTGAAGAGG	5185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.897;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=5.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-5.583;QD=15.67;ReadPosRankSum=-4.899;SOR=1.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,58:331:99:5223,0,11193
chr3	3240992	.	GATGGAGGA	G	11191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.273;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=8.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=4.518;QD=24.71;ReadPosRankSum=12.842;SOR=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,279:453:99:11229,0,6267
chr3	3241004	.	AT	A	6870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=1.647;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=9.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-2.067;QD=14.34;ReadPosRankSum=-11.163;SOR=1.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,187:479:99:6908,0,11486
chr3	3241019	.	AAGGAGAGAGGAGGAGGGAGAGAGG	A	7657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=0.787;DP=868;ExcessHet=3.0103;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=1.875;QD=10.79;ReadPosRankSum=10.383;SOR=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:437,273:710:99:7695,0,16550
chr3	3241020	.	A	AG	14685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-0.336;DP=803;ExcessHet=3.0103;FS=8.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-1.153;QD=21.89;ReadPosRankSum=3.624;SOR=1.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,379:671:99:14723,0,10887
chr3	3241032	.	G	GA	13717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.240;DP=742;ExcessHet=3.0103;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=0.250;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.318;SOR=1.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,333:613:99:13755,0,10545
chr3	3241043	.	G	GAGGA	10729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.174;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=1.796;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.054;SOR=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,285:566:99:10767,0,10777
chr3	3241188	.	C	CG	8462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.094;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=4.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.509;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,314:649:99:8500,0,10392
chr3	3241189	.	G	GA	8188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.734;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=6.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.359;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.857;SOR=1.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,330:652:99:8226,0,9684
chr3	3241393	.	T	C	7839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.119;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.214;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,202:405:99:7868,0,7774
chr3	3241397	.	T	C	7662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.101;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.529;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,199:405:99:7691,0,7984
chr3	3241445	.	C	T	6012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.505;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.088;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,186:392:99:6041,0,6667
chr3	3241803	.	A	T	7542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-1.014;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.660;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,238:489:99:7571,0,7853
chr3	3241867	.	G	GAACT	10855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.288;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.306;QD=19.99;ReadPosRankSum=-3.218;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,268:543:99:10893,0,10789
chr3	3241868	.	G	A	11029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.306;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.641;QD=20.31;ReadPosRankSum=-2.870;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,266:543:99:11058,0,10817
chr3	3241871	.	TTC	T,TGCTC	23609.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.91;QD=27.20;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,272,273:545:99:23647,12073,11235,11574,0,11006
chr3	3241873	.	C	CG	11041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.790;ClippingRankSum=0.555;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.135;QD=20.41;ReadPosRankSum=-3.146;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,268:541:99:11079,0,10851
chr3	3241875	.	ATG	A,ATTG	24206.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.91;QD=25.82;SOR=0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,276,280:556:99:24244,12644,11797,11573,0,10724
chr3	3241877	.	G	GA	11390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.154;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.065;QD=20.82;ReadPosRankSum=-3.024;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,272:547:99:11428,0,10648
chr3	3241899	.	G	A	11508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.483;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.610;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.799;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,314:598:99:11537,0,10570
chr3	3241977	.	G	T	13276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=-0.792;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.059;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,345:665:99:13305,0,20587
chr3	3241991	.	T	C	14125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.661;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.167;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,342:678:99:14154,0,22085
chr3	3242015	.	C	T	14148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.007;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.093;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.707;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,351:686:99:14177,0,19742
chr3	3242030	.	A	C	13068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.930;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.052;QD=19.56;ReadPosRankSum=2.866;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,335:668:99:13097,0,17435
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chr3	3242109	.	TTGCTTTAATATAATCACTGAATGGTCAATCTAAGC	T	16355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.046;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.84;MQRankSum=-0.744;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:30,416:446:99:16393,590,0
chr3	3242177	.	AAGTTGCTTTAATATATCACTGAATGCTCATCAGTTGCTTTATATCACTGATGCTCATCTAGTTGCTTTATATCACTGAAGTTCATC	A	17004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.345;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=3.513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.41;MQRankSum=-4.008;QD=31.60;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:17,403:420:99:17042,750,0
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chr3	3242490	.	A	G	10549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=1.541;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.547;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,271:520:99:10578,0,9676
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chr3	3242830	.	A	G	9525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.716;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.756;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,248:565:99:9554,0,13207
chr3	3242834	.	T	C	9489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=1.362;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.880;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,247:559:99:9518,0,13133
chr3	3242955	.	A	T	8228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.912;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.557;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.191;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,259:502:99:8257,0,7818
chr3	3243651	.	C	CT	10509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=-0.405;DP=765;ExcessHet=3.0103;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=7.603;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,398:721:99:10547,0,12405
chr3	3243721	.	ATTTT	A,ATTTTT	8381.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-1.377;DP=949;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-0.764;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.320	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,35,286:322:99:8419,8525,17324,701,0,6809
chr3	3243756	.	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.445;ClippingRankSum=0.612;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=2.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-6.616;QD=0.78;ReadPosRankSum=2.963;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,35:311:99:270,0,12046
chr3	3243776	.	A	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.600;ClippingRankSum=-0.348;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQRankSum=-6.827;QD=0.17;ReadPosRankSum=-3.940;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,35:386:94:94,0,15288
chr3	3243783	.	A	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.192;ClippingRankSum=1.468;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQRankSum=-7.128;QD=1.42;ReadPosRankSum=-3.639;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,35:284:99:432,0,10444
chr3	3243806	.	T	C	7698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;ClippingRankSum=-0.294;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-6.940;QD=14.61;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,202:527:99:7736,0,13444
chr3	3243814	.	G	C	7320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.603;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-2.081;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.343;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,196:510:99:7349,0,12968
chr3	3243819	.	T	C	7414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.263;ClippingRankSum=0.262;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-0.226;QD=14.31;ReadPosRankSum=2.421;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,204:518:99:7443,0,12501
chr3	3244017	.	G	A	8337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.364;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.131;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,270:492:99:8366,0,6772
chr3	3244037	.	T	A	8417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.383;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.436;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,264:496:99:8446,0,7146
chr3	3244240	.	C	CT	6074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.212;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.168;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,226:460:99:6112,0,8828
chr3	3244241	.	T	TC	8755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=1.850;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.986;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.140;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,235:475:99:8793,0,9013
chr3	3244254	.	C	T	9858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.602;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.007;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,243:482:99:9887,0,9643
chr3	3244260	.	T	C	9591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-0.616;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.315;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,245:499:99:9620,0,9804
chr3	3244297	.	T	A	8249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-2.303;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.620;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,256:495:99:8278,0,7713
chr3	3244339	.	T	C	9730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=-1.141;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.586;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,264:477:99:9759,0,7728
chr3	3244360	.	G	A	9495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.068;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.701;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,257:487:99:9524,0,8323
chr3	3244522	.	G	A	10385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.856;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.925;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,341:656:99:10414,0,9601
chr3	3244552	.	G	T	10773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-1.135;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.509;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,349:663:99:10802,0,9447
chr3	3244594	.	C	T	10309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-3.362;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.519;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,330:642:99:10338,0,9863
chr3	3244835	.	T	C	7071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.613;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.014;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,243:512:99:7100,0,8133
chr3	3245038	.	G	A	9050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.579;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.876;QD=15.19;ReadPosRankSum=5.251;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,293:596:99:9079,0,9402
chr3	3245074	.	G	A	8747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.553;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.049;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,305:600:99:8776,0,8636
chr3	3245279	.	G	A	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.292;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.240;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,263:572:99:10167,0,12018
chr3	3245285	.	GA	G	9370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-1.461;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.338;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.735;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,299:573:99:9408,0,10384
chr3	3245287	.	AG	A	10151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=1.092;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.496;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,273:577:99:10189,0,11940
chr3	3245592	.	TG	T	10680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.807;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.519;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,271:594:99:10718,0,13094
chr3	3245597	.	C	G	11216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=-0.035;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.085;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.197;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,279:609:99:11245,0,13289
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chr3	3245614	.	T	C	11471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-1.595;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.843;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,297:627:99:11500,0,12715
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chr3	3248035	.	GA	G	9315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.506;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.732;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.902;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,245:488:99:9353,0,9364
chr3	3248107	.	A	T	7392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.138;ClippingRankSum=-0.086;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.372;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,257:547:99:7421,0,9443
chr3	3248242	.	C	T	9917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-0.728;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.855;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,265:545:99:9946,0,10691
chr3	3248248	.	G	A	8297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=1.445;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.295;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,272:531:99:8326,0,10559
chr3	3248263	.	G	A	9830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.862;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.539;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.992;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,261:522:99:9859,0,9882
chr3	3248545	.	A	G	8028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.129;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.312;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.533;SOR=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,256:493:99:8057,0,7352
chr3	3248605	.	C	G	7150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=-0.401;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.987;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,242:483:99:7179,0,7480
chr3	3248950	.	G	A	8615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;ClippingRankSum=-1.058;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.563;QD=14.91;ReadPosRankSum=-2.464;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,295:578:99:8644,0,8758
chr3	3249039	.	T	C	11180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.811;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.955;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,292:578:99:11209,0,11016
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chr3	3249097	.	T	C	8583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-0.394;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.512;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.027;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,270:554:99:8612,0,8841
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chr3	3249928	.	A	T	18926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=1.050;DP=1035;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.366;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:552,469:1021:99:18955,0,22360
chr3	3249936	.	A	G	16409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.674;DP=1044;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.075;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:562,444:1006:99:16438,0,23042
chr3	3249940	.	G	A	15728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=1.784;DP=1040;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-0.754;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:558,426:984:99:15757,0,23109
chr3	3249952	.	TTTATA	T	13796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.003;DP=1040;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=4.017;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:560,366:926:99:13834,0,23423
chr3	3249960	.	TTC	T	13121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.736;DP=1019;ExcessHet=3.0103;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=2.524;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.446;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:543,348:891:99:13159,0,22636
chr3	3249968	.	TTCG	T	18453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=-0.048;DP=998;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-0.398;QD=18.73;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:530,455:985:99:18491,0,21776
chr3	3249971	.	G	GAA	17697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=-0.210;DP=967;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-1.565;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:505,449:954:99:17735,0,20660
chr3	3250002	.	CGTACGTTT	C	16434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-1.876;DP=916;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQRankSum=-7.810;QD=18.18;ReadPosRankSum=-4.457;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:493,411:904:99:16472,0,20207
chr3	3250026	.	T	C	18102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.147;DP=908;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-0.697;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:457,440:897:99:18131,0,18833
chr3	3250040	.	TTTGTATATTCGTATATTCGTATGC	T	16368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;ClippingRankSum=-0.291;DP=964;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-0.358;QD=17.38;ReadPosRankSum=7.764;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:526,416:942:99:16406,0,21716
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chr3	3250083	.	C	T	15285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-1.856;DP=803;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=0.809;QD=19.65;ReadPosRankSum=-4.568;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:385,393:778:99:15314,0,15089
chr3	3250183	.	G	T	9193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=2.056;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.619;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.548;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,291:575:99:9222,0,9063
chr3	3250343	.	A	G	8794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.326;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.096;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,283:586:99:8823,0,9706
chr3	3251905	.	C	T	13250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=2.391;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.230;QD=18.74;ReadPosRankSum=-2.147;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,347:707:99:13279,0,14277
chr3	3251913	.	C	T	13787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;ClippingRankSum=-0.646;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.676;QD=19.04;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,352:724:99:13816,0,15173
chr3	3251932	.	G	T	11132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=1.104;DP=749;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.895;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:395,341:736:99:11161,0,15007
chr3	3252212	.	T	C	12648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.084;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.714;QD=21.47;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,314:589:99:12677,0,10628
chr3	3252214	.	C	T	12869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.243;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.037;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,319:590:99:12898,0,10926
chr3	3252216	.	G	A	12741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-1.723;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.255;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,324:602:99:12770,0,10867
chr3	3252230	.	CA	C	12717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=1.054;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.586;QD=21.41;ReadPosRankSum=1.447;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,342:594:99:12755,0,5227
chr3	3252338	.	G	T	14815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.944;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=5.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=1.678;QD=32.71;ReadPosRankSum=9.562;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,394:453:99:14844,0,600
chr3	3252384	.	G	T	16711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.495;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQRankSum=1.906;QD=26.79;ReadPosRankSum=3.090;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,368:373:99:16740,1010,0
chr3	3252445	.	TC	T	17043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.403;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=3.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQRankSum=0.502;QD=30.90;ReadPosRankSum=2.299;SOR=0.110	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,372:374:99:17081,1111,0
chr3	3252452	.	A	G	16463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;QD=29.19;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,365:365:99:16492,1120,0
chr3	3252623	.	G	A	7929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=-1.959;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.069;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,266:499:99:7958,0,7137
chr3	3252846	.	A	C	10298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.639;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.166;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,266:497:99:10327,0,8900
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chr3	3254594	.	GCCCA	G	7217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=-1.413;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=2.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.469;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,181:356:99:7255,0,6777
chr3	3254651	.	T	C	6206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.105;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.338;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,209:401:99:6235,0,5570
chr3	3254778	.	T	C	6935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-1.604;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.181;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,221:443:99:6964,0,7059
chr3	3254807	.	T	C	7485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=-1.215;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.767;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,229:449:99:7514,0,6956
chr3	3254858	.	T	C	8160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=1.457;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.290;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,259:491:99:8189,0,7100
chr3	3254897	.	A	G	7089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.598;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.622;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,225:444:99:7118,0,6417
chr3	3255122	.	C	T	7029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=-0.295;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.218;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,237:436:99:7058,0,5829
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chr3	3255311	.	G	A	8405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=1.427;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.710;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,275:530:99:8434,0,9918
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chr3	3255998	.	T	G	8062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.392;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.511;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,259:490:99:8091,0,6859
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chr3	3256052	.	A	AT	3719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.854;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.046;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.393;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,176:402:99:3757,0,6600
chr3	3256053	.	T	TC	6158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=2.287;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.211;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,228:420:99:6196,0,5446
chr3	3256162	.	A	AGGGG	3875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=-0.689;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=8.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.864;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,96:231:99:3913,0,5274
chr3	3256245	.	T	A	4318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-0.891;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=6.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.470;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,146:331:99:4347,0,5953
chr3	3256320	.	T	C	5913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.299;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=8.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.673;QD=15.05;ReadPosRankSum=1.569;SOR=1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,184:393:99:5942,0,6704
chr3	3256410	.	G	C	5516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.974;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.115;QD=14.56;ReadPosRankSum=2.159;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,191:379:99:5545,0,5379
chr3	3256484	.	C	A	8132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-0.455;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.019;QD=19.32;ReadPosRankSum=-2.435;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,211:421:99:8161,0,8307
chr3	3256486	.	A	T	8132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.661;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.381;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.719;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,209:423:99:8161,0,8307
chr3	3256587	.	C	CAA	10156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.287;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.149;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,257:529:99:10194,0,10883
chr3	3256591	.	C	T	10210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.299;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.598;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,261:537:99:10239,0,10876
chr3	3256637	.	A	G	8363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=1.811;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.699;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,262:552:99:8392,0,8518
chr3	3256720	.	T	A	10177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-0.289;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.208;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,268:567:99:10206,0,11296
chr3	3256738	.	C	T	10011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-1.464;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.086;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.854;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,265:553:99:10040,0,10862
chr3	3257210	.	A	G	8622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.158;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.435;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,290:586:99:8651,0,8819
chr3	3257605	.	GC	G	8634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.346;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.655;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,295:561:99:8672,0,8131
chr3	3257606	.	CT	C	7571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.430;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.844;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,263:562:99:7609,0,9191
chr3	3257670	.	G	A	8488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.540;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.657;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,277:554:99:8517,0,10680
chr3	3257682	.	T	C	8571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.048;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.527;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,275:545:99:8600,0,10467
chr3	3257796	.	G	C	12061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.063;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.008;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,311:583:99:12090,0,10311
chr3	3257805	.	G	T	12538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.420;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.371;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,317:590:99:12567,0,10690
chr3	3257825	.	C	T	11129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.873;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.361;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,284:547:99:11158,0,10105
chr3	3257896	.	A	G	10878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.807;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.547;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,281:558:99:10907,0,10397
chr3	3257912	.	A	C	11353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=1.468;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.096;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,304:586:99:11382,0,10514
chr3	3257939	.	T	C	12972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.338;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.611;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,330:616:99:13001,0,11086
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chr3	3257942	.	C	G	13208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.236;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.311;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,326:608:99:13237,0,11082
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chr3	3258132	.	T	C	13978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.140;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.182;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,355:696:99:14007,0,13267
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chr3	3258220	.	CG	C	15641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.409;ClippingRankSum=-0.267;DP=820;ExcessHet=3.0103;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.248;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.838;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:390,397:787:99:15679,0,15285
chr3	3258223	.	CTT	C	11105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-1.227;DP=813;ExcessHet=3.0103;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.077;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:398,370:768:99:11143,0,15892
chr3	3258225	.	T	TCGA	11108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.570;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.134;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:397,370:767:99:11146,0,15850
chr3	3258226	.	C	T	15728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=-0.257;DP=800;ExcessHet=3.0103;FS=2.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.252;QD=20.53;ReadPosRankSum=1.447;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:373,393:766:99:15757,0,15037
chr3	3258228	.	A	C	16001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.188;DP=793;ExcessHet=3.0103;FS=3.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.421;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,392:758:99:16030,0,14599
chr3	3258231	.	TCTCTCGTC	T	14755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.322;ClippingRankSum=-0.067;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.980;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:404,366:770:99:14793,0,16234
chr3	3258241	.	T	TC	14954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.296;DP=773;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.628;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.519;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,370:737:99:14992,0,14665
chr3	3258255	.	T	TC	13612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.453;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.095;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.923;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,349:692:99:13650,0,13411
chr3	3258267	.	C	CT	18627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.098;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQRankSum=-0.549;QD=33.38;ReadPosRankSum=2.040;SOR=1.428	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,554:558:99:18665,1627,0
chr3	3258303	.	T	C	7508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.309;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=6.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.927;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.367;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,195:429:99:7537,0,9210
chr3	3258306	.	T	G	7393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.467;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=0.156;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.641;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,188:413:99:7422,0,9318
chr3	3258311	.	A	G	7437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.038;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=9.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-1.795;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,189:416:99:7466,0,9113
chr3	3258316	.	C	T	7188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.211;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=12.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-0.551;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,182:395:99:7217,0,8882
chr3	3258323	.	A	G	6780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.144;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=9.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.963;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,172:388:99:6809,0,8744
chr3	3258324	.	T	G	6777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=2.087;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=9.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.404;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,173:390:99:6806,0,8786
chr3	3258337	.	T	C	7092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.090;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-0.040;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,180:404:99:7121,0,9056
chr3	3258355	.	G	A	7425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.042;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.971;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,189:424:99:7454,0,9659
chr3	3258356	.	C	T	7428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.238;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.667;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,189:424:99:7457,0,9617
chr3	3258359	.	A	C	7392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.033;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.448;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,177:409:99:7421,0,9536
chr3	3258363	.	A	G	7032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=2.456;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.032;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,176:404:99:7061,0,9311
chr3	3258377	.	A	G	4871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-1.477;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.040;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,161:401:99:4900,0,9961
chr3	3258379	.	A	G	6316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.562;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=1.056;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,167:402:99:6345,0,9738
chr3	3258380	.	G	C	4880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.831;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-0.200;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.191;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,164:400:99:4909,0,9752
chr3	3258429	.	T	G	5577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.389;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.426;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,185:421:99:5606,0,7600
chr3	3258455	.	A	G	6252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.008;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.017;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,198:421:99:6281,0,7425
chr3	3258785	.	C	T	8907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.536;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.905;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,229:452:99:8936,0,8622
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chr3	3258809	.	G	A	8542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=1.317;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=6.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.535;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,221:438:99:8571,0,8217
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chr3	3261454	.	GT	G	4556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.916;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=10.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.966;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.714;SOR=1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,175:359:99:4594,0,5315
chr3	3261515	.	GT	G	8468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.372;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.119;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,228:460:99:8506,0,8505
chr3	3261518	.	TC	T	8536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.276;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.039;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,234:465:99:8574,0,8715
chr3	3261542	.	TC	T	8925.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.619;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.540;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,227:477:99:8963,0,10031
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chr3	3261563	.	GC	G	8220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.114;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.003;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,222:466:99:8258,0,9408
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chr3	3263226	.	G	A	11749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.238;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.675;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,305:614:99:11778,0,11937
chr3	3263237	.	T	A	12671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.027;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.731;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,316:637:99:12700,0,12838
chr3	3263272	.	C	T	12563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.529;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.372;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,315:616:99:12592,0,12464
chr3	3263276	.	T	G	12199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=-0.387;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.815;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,303:613:99:12228,0,12408
chr3	3263279	.	C	T	12244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=0.931;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.304;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,300:602:99:12273,0,12363
chr3	3263280	.	A	G	12376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.554;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.137;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,299:602:99:12405,0,12270
chr3	3263283	.	T	A	12343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.536;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.682;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,300:603:99:12372,0,12147
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chr3	3263293	.	G	A	12100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.463;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.374;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,305:603:99:12129,0,12039
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chr3	3264647	.	T	C	10584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.262;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.040;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,277:594:99:10613,0,12235
chr3	3264653	.	G	A	10274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.625;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.348;QD=17.87;ReadPosRankSum=-2.162;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,275:575:99:10303,0,11940
chr3	3264684	.	G	C	7918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.810;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.864;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.277;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,256:563:99:7947,0,9439
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chr3	3264812	.	G	A	10236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.949;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.431;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.933;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,346:669:99:10265,0,9594
chr3	3264858	.	A	G	13048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.077;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.462;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,338:645:99:13077,0,11923
chr3	3264861	.	A	G	13069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.069;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.294;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,326:638:99:13098,0,11967
chr3	3264960	.	T	C	10357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.529;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.903;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,322:610:99:10386,0,9059
chr3	3265117	.	A	G	9466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.259;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.412;QD=16.73;ReadPosRankSum=2.839;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,297:566:99:9495,0,8413
chr3	3265237	.	AT	A	9355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=2.036;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.016;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,314:653:99:9393,0,10772
chr3	3265238	.	TG	T	8869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=2.271;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.334;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,332:648:99:8907,0,9835
chr3	3265310	.	A	C	9892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.121;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.684;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,324:689:99:9921,0,11211
chr3	3265374	.	C	T	11044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-0.222;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.135;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,289:606:99:11073,0,12602
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chr3	3265389	.	ACTACT	A	11049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=2.394;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.065;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.605;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,286:603:99:11087,0,12529
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chr3	3268025	.	T	C	8542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.595;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.197;QD=16.18;ReadPosRankSum=3.471;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,284:528:99:8571,0,7324
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chr3	3268266	.	C	T	5649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.594;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.733;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,187:384:99:5678,0,6266
chr3	3268527	.	G	A	7142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.152;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=4.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.372;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,246:445:99:7171,0,5940
chr3	3268556	.	A	G	7105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.592;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.013;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.471;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,221:412:99:7134,0,6162
chr3	3268592	.	CT	C	19708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;QD=31.14;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,432:432:99:19746,1341,0
chr3	3268605	.	AT	A	19728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;QD=30.27;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,427:427:99:19766,1327,0
chr3	3268625	.	GT	G	5429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-1.193;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.914;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,181:400:99:5467,0,7373
chr3	3268628	.	TC	T	7260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.393;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.309;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.642;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,223:408:99:7298,0,5467
chr3	3268659	.	A	G	5526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=-0.487;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=2.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.086;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,194:421:99:5555,0,7107
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chr3	3268728	.	A	G	6454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.648;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.501;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,215:394:99:6483,0,6830
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chr3	3269560	.	T	TG	6675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=1.085;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=5.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.679;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,226:479:99:6713,0,8096
chr3	3269627	.	A	T	6514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.325;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,210:450:99:6543,0,7655
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chr3	3269699	.	C	CA	9770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-2.114;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.997;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,255:512:99:9808,0,10229
chr3	3269729	.	A	G	9080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.345;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.337;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,296:566:99:9109,0,8706
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chr3	3270849	.	C	T	8719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.830;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.975;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,273:510:99:8748,0,7435
chr3	3270906	.	A	G	8125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.397;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.294;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,269:535:99:8154,0,7941
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chr3	3271840	.	C	A	14159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.672;DP=756;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.925;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.719;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,373:742:99:14188,0,14203
chr3	3271941	.	G	GA	4789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.497;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.798;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,225:485:99:4827,0,8692
chr3	3271947	.	A	AG	8163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.931;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.837;QD=14.98;ReadPosRankSum=2.285;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,272:545:99:8201,0,8680
chr3	3272125	.	T	A	8037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.827;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.496;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,307:648:99:8066,0,10139
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chr3	3272862	.	G	C	8232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=1.653;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.835;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,264:565:99:8261,0,9396
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chr3	3273154	.	G	GAATTTAAAGTATCCA	9962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.026;ClippingRankSum=1.071;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-0.130;QD=19.16;ReadPosRankSum=-10.682;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,220:520:99:10000,0,12372
chr3	3273174	.	T	TCAAGTATTTGAATTTGAAGCAGTTAAATTC	8837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.221;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=12.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-1.468;QD=17.54;ReadPosRankSum=-15.474;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,200:504:99:8875,0,12342
chr3	3273183	.	T	TGAATTTGACAATTGAATTCAAAGAATTCGAATTTGACAATTGAATTCAAAGAATTC	9997.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.608;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=33.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-5.907;QD=23.30;ReadPosRankSum=-15.348;SOR=1.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,136:429:99:10035,0,12105
chr3	3273193	.	G	A	6644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.115;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=5.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-2.045;QD=14.38;ReadPosRankSum=-11.275;SOR=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,171:462:99:6673,0,12388
chr3	3273196	.	A	C	6869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=2.166;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=5.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-1.451;QD=14.97;ReadPosRankSum=-9.622;SOR=1.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,170:459:99:6898,0,12163
chr3	3273204	.	G	A	7571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.949;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=1.300;QD=15.55;ReadPosRankSum=-5.435;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,200:487:99:7600,0,12070
chr3	3273206	.	T	A	7806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-1.801;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=1.667;QD=15.77;ReadPosRankSum=-3.655;SOR=1.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,203:495:99:7835,0,12199
chr3	3273216	.	C	A	8299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=1.851;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-0.598;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,227:520:99:8328,0,11597
chr3	3273312	.	T	C	8736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-1.150;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.716;QD=17.00;ReadPosRankSum=2.167;SOR=0.459	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,269:514:99:8765,0,7722
chr3	3273448	.	C	CA	4586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.778;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=5.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.626;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,249:303:99:4624,0,314
chr3	3274067	.	G	A	9125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.233;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.920;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,304:635:99:9154,0,10198
chr3	3274345	.	G	A	9270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.246;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.566;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,324:657:99:9299,0,10271
chr3	3274444	.	G	C	9630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.210;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.464;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,321:689:99:9659,0,11418
chr3	3274507	.	C	A	8764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=1.473;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.378;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,279:605:99:8793,0,10155
chr3	3274804	.	T	C	9439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=1.216;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.275;QD=16.47;ReadPosRankSum=2.919;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,302:573:99:9468,0,8488
chr3	3275145	.	T	C	11965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.387;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=1.724;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,336:706:99:11994,0,23606
chr3	3275192	.	C	G	9759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=1.135;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-0.659;QD=21.93;ReadPosRankSum=1.961;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,246:445:99:9788,0,18140
chr3	3275223	.	CATCCATCCATCTATCTATCTATTATCTATCTATCCATCATCTATCTATCTATT	C	5882.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.560;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQRankSum=-0.014;QD=25.92;ReadPosRankSum=3.196;SOR=0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,140:227:99:5920,0,11158
chr3	3275650	.	A	C	12132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.896;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.034;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.571;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,321:626:99:12161,0,11726
chr3	3275653	.	TG	T	12092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.930;ClippingRankSum=-0.813;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.637;QD=19.57;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,315:618:99:12130,0,11659
chr3	3275654	.	GC	G	8983.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.164;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.775;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,295:610:99:9021,0,12292
chr3	3275836	.	CG	C	8846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=-0.447;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.089;QD=14.92;ReadPosRankSum=-2.276;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,300:593:99:8884,0,9520
chr3	3275837	.	GT	G	8324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.113;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.384;QD=14.13;ReadPosRankSum=2.024;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,289:589:99:8362,0,9348
chr3	3275861	.	A	AT	11952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.031;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.389;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,313:619:99:11990,0,11687
chr3	3275863	.	T	TG	9532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.564;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.836;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,304:626:99:9570,0,12524
chr3	3275875	.	C	T	12242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=1.838;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=6.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.033;QD=19.16;ReadPosRankSum=1.624;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,323:639:99:12271,0,12099
chr3	3276061	.	A	G	11345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-0.157;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.944;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,295:594:99:11374,0,11786
chr3	3276063	.	T	C	11379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=1.515;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.240;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,295:595:99:11408,0,11883
chr3	3276087	.	TC	T	8416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=-1.211;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.840;QD=14.69;ReadPosRankSum=2.327;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,283:573:99:8454,0,10985
chr3	3276088	.	CG	C	7437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.080;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.315;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,266:551:99:7475,0,9049
chr3	3276239	.	T	C	8173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.933;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.093;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,266:587:99:8202,0,10494
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chr3	3277720	.	T	C	10679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.009;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.802;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,286:563:99:10708,0,10319
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chr3	3277890	.	G	A	11393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.958;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.251;QD=20.24;ReadPosRankSum=-2.613;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,290:563:99:11431,0,10665
chr3	3277894	.	A	AT	11392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.348;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.186;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,298:579:99:11430,0,10657
chr3	3279284	.	A	T	9737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.989;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.931;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,335:660:99:9766,0,9744
chr3	3279376	.	C	T	8597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=-0.610;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.061;QD=14.43;ReadPosRankSum=2.134;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,286:596:99:8626,0,9549
chr3	3279740	.	T	C	9133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-2.563;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.648;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,287:582:99:9162,0,9322
chr3	3279815	.	G	A	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.862;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.272;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,321:599:99:9930,0,8529
chr3	3279929	.	G	A	10282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.637;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.468;QD=15.82;ReadPosRankSum=4.633;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,331:650:99:10311,0,10008
chr3	3280238	.	TA	T	8367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.936;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=19.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.002;QD=21.85;ReadPosRankSum=-3.051;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,210:383:99:8405,0,6786
chr3	3280254	.	C	A	9236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.765;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=5.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=1.258;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,225:411:99:9265,0,7648
chr3	3280255	.	GTTTTATTTTTT	G	8952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.444;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=0.291;QD=19.55;ReadPosRankSum=2.951;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,239:458:99:8990,0,8887
chr3	3280285	.	C	T	7932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.090;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=1.448;QD=22.41;ReadPosRankSum=3.468;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,210:354:99:7961,0,5127
chr3	3280440	.	T	C	9371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=2.130;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.478;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.004;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,250:530:99:9400,0,10593
chr3	3280460	.	G	A	10504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.059;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.196;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.122;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,259:546:99:10533,0,11718
chr3	3280462	.	A	G	10522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.607;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.517;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,265:556:99:10551,0,11901
chr3	3280471	.	G	A	10507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=-0.514;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.328;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.004;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,263:565:99:10536,0,12111
chr3	3280486	.	C	G	10612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.746;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.804;QD=19.09;ReadPosRankSum=-1.144;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,266:556:99:10641,0,11811
chr3	3280487	.	T	A	10552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.786;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.099;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,265:557:99:10581,0,12066
chr3	3280495	.	A	G	10525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.082;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.594;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,260:566:99:10554,0,12499
chr3	3280504	.	C	T	10069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.848;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.670;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,261:557:99:10098,0,11827
chr3	3280536	.	C	T	8119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.702;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.891;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,268:569:99:8148,0,9517
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chr3	3280600	.	A	G	10667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=2.123;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.201;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,282:569:99:10696,0,10959
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chr3	3283244	.	TC	T	8673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=-0.056;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.066;QD=13.94;ReadPosRankSum=2.831;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,284:622:99:8711,0,13444
chr3	3283246	.	CG	C	13085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.031;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.920;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.988;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,325:620:99:13123,0,11462
chr3	3283433	.	G	T	15104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-0.001;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.368;QD=22.96;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,380:658:99:15133,0,14997
chr3	3283436	.	C	T	15074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=2.041;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.119;QD=23.09;ReadPosRankSum=-2.521;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,382:653:99:15103,0,14885
chr3	3283525	.	A	G	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.158;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.662;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,334:645:99:10315,0,9390
chr3	3283577	.	G	T	9891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=-0.510;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.876;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.242;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,314:609:99:9920,0,9404
chr3	3283830	.	C	T	7926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.350;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.248;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,272:567:99:7955,0,8883
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chr3	3286073	.	C	A	13107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-2.031;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.197;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,333:606:99:13136,0,10513
chr3	3286074	.	G	T	13143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.354;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.243;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,330:602:99:13172,0,10594
chr3	3286079	.	G	A	13114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.889;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.074;QD=21.82;ReadPosRankSum=0.551;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,330:601:99:13143,0,10709
chr3	3286081	.	G	A	13228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=-0.107;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.225;QD=22.20;ReadPosRankSum=1.017;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,323:596:99:13257,0,10872
chr3	3286090	.	C	T	13594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-1.566;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.277;QD=22.66;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,328:600:99:13623,0,11013
chr3	3286092	.	A	G	13354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-0.661;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.277;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,325:599:99:13383,0,10863
chr3	3286107	.	C	T	12948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=1.087;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.962;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,321:598:99:12977,0,10990
chr3	3286114	.	G	A	12065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.700;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.145;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,309:588:99:12094,0,10736
chr3	3286184	.	A	C	11583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.190;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.447;QD=20.36;ReadPosRankSum=3.424;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,295:569:99:11612,0,35966
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chr3	3286199	.	T	C	11479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.296;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.269;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,278:541:99:11508,0,36323
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chr3	3287591	.	G	A	9569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=1.152;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.388;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,246:540:99:9598,0,11744
chr3	3287856	.	A	C	8262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.323;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.486;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,278:549:99:8291,0,8326
chr3	3287880	.	C	T	7944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.674;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.242;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.827;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,258:522:99:7973,0,10321
chr3	3287887	.	C	T	8049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.262;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.100;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,262:518:99:8078,0,10407
chr3	3287895	.	C	T	7663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.134;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.408;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,246:506:99:7692,0,10093
chr3	3287927	.	GT	G	8630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=1.423;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.736;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.833;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,276:502:99:8668,0,6889
chr3	3287928	.	TC	T	6403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=-1.570;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.665;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.797;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,223:503:99:6441,0,9324
chr3	3288096	.	GC	G	9248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.850;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.162;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,316:641:99:9286,0,10015
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chr3	3288179	.	A	G	12167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.013;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.398;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.600;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,317:597:99:12196,0,10631
chr3	3288188	.	C	T	11940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.213;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.386;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,307:583:99:11969,0,10544
chr3	3288269	.	T	C	8410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-0.803;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.264;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,268:561:99:8439,0,8809
chr3	3288430	.	T	C	9131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.723;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.806;QD=20.80;ReadPosRankSum=-2.091;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,233:439:99:9160,0,7767
chr3	3288437	.	A	G	9115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.299;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.580;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.744;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,230:435:99:9144,0,7846
chr3	3288868	.	A	G	11575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.907;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.021;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,329:651:99:11604,0,12139
chr3	3288889	.	G	A	10914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.042;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.325;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,298:624:99:10943,0,13265
chr3	3288911	.	T	C	11150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=1.354;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.342;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,302:633:99:11179,0,13418
chr3	3288916	.	A	C	12129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.804;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.437;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.839;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,319:624:99:12158,0,12351
chr3	3288934	.	A	G	12449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.224;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.088;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,325:625:99:12478,0,11320
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chr3	3289006	.	G	A	10305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=-0.139;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.215;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.642;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,322:624:99:10334,0,9925
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chr3	3290169	.	AT	A,ATT	18693.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.354;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.062;QD=34.75;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.256	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,274,263:538:99:18731,7878,12384,11570,0,10808
chr3	3290179	.	T	C	10408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.306;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.981;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,263:543:99:10437,0,11138
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chr3	3290231	.	T	C	9411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.046;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.557;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,243:489:99:9440,0,9494
chr3	3290244	.	T	C	10273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.199;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.073;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,258:511:99:10302,0,10091
chr3	3290245	.	G	A	10343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-0.103;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.097;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.902;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,259:510:99:10372,0,10105
chr3	3290257	.	G	A	9727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.304;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.376;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,252:502:99:9756,0,10042
chr3	3290291	.	G	A	10021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=1.189;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.391;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,263:534:99:10050,0,10418
chr3	3290303	.	T	C	10137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=-0.565;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.309;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,256:535:99:10166,0,11171
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chr3	3290329	.	C	G	10381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=-1.510;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.306;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,265:549:99:10410,0,11444
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chr3	3292017	.	G	A	11990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=1.363;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.501;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,317:615:99:12019,0,11379
chr3	3292182	.	T	C	8161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.612;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=9.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.186;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=1.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,272:534:99:8190,0,8118
chr3	3292242	.	G	A	7715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-0.570;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.072;QD=15.88;ReadPosRankSum=-1.777;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,240:486:99:7744,0,7781
chr3	3292362	.	A	G	7172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-1.340;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.279;QD=13.46;ReadPosRankSum=3.218;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,238:533:99:7201,0,8822
chr3	3292398	.	C	T	7008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.509;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.897;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,243:564:99:7037,0,10118
chr3	3292495	.	C	A	10543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.050;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.787;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,347:650:99:10572,0,9260
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chr3	3294690	.	G	A	10634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=2.272;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.273;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,278:567:99:10663,0,14529
chr3	3294726	.	A	G	10338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=-0.874;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.050;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,268:589:99:10367,0,15151
chr3	3294728	.	C	A	10338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=-0.794;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.994;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.830;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,269:585:99:10367,0,15151
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chr3	3294864	.	G	A	11163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-1.333;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.308;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,339:646:99:11192,0,12078
chr3	3294885	.	A	G	8838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=1.513;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.241;QD=14.37;ReadPosRankSum=3.511;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,286:615:99:8867,0,12433
chr3	3295029	.	C	G	8713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.015;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.262;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,284:580:99:8742,0,9047
chr3	3295098	.	A	G	9950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-0.691;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.058;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,293:565:99:9979,0,10342
chr3	3295109	.	T	C	8575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=1.809;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.543;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,268:571:99:8604,0,11456
chr3	3295171	.	G	A	9791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=-1.211;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.007;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,314:589:99:9820,0,8600
chr3	3295218	.	T	C	13007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.278;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.336;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,333:633:99:13036,0,11867
chr3	3295227	.	T	C	11637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.332;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.174;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.649;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,309:639:99:11666,0,13301
chr3	3295250	.	CG	C	11502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.071;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.226;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,301:616:99:11540,0,11945
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chr3	3295304	.	A	AC	8886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.168;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.259;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,281:571:99:8924,0,9051
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chr3	3296345	.	ATTTT	A,ATTTTTT	15354.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-1.226;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.601;QD=29.29;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=0.227	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,253,168:422:99:15392,5499,8687,10293,0,9824
chr3	3296385	.	TA	T	6084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.148;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.604;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,250:436:99:6122,0,4044
chr3	3296448	.	C	T	8996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=-0.431;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.252;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,284:530:99:9025,0,7307
chr3	3296567	.	G	C	12333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=-0.840;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.695;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,319:619:99:12362,0,11843
chr3	3296573	.	GCAGCGGAAA	G	12388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.347;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.079;QD=18.60;ReadPosRankSum=-1.845;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,326:666:99:12426,0,13263
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chr3	3296706	.	C	T	9352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-2.679;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.829;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,315:612:99:9381,0,8990
chr3	3296745	.	A	G	8507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=-0.533;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.678;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.112;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,303:588:99:8536,0,8248
chr3	3296780	.	T	TA	5621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.587;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.509;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,250:532:99:5659,0,6429
chr3	3296826	.	C	T	10411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=1.087;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.347;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,334:647:99:10440,0,9645
chr3	3296887	.	A	G	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.761;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=18.41;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,289:573:99:10575,0,10533
chr3	3296904	.	TA	T	9709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-1.607;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=8.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.753;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.090;SOR=1.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,258:537:99:9747,0,10254
chr3	3296936	.	A	T	8006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.034;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.540;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.076;SOR=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,262:538:99:8035,0,8424
chr3	3296987	.	TGA	T	8696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.042;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.209;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,227:484:99:8734,0,10091
chr3	3296990	.	A	AGG	8696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.154;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.792;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,227:478:99:8734,0,10091
chr3	3297245	.	AG	A	8734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-1.328;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.436;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,299:562:99:8772,0,8188
chr3	3297246	.	GC	G	7584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.883;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.177;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,261:563:99:7622,0,9411
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chr3	3297324	.	G	A	12046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.764;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.269;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.697;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,316:650:99:12075,0,12864
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chr3	3298918	.	T	C	7874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.860;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.713;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,275:541:99:7903,0,7296
chr3	3299062	.	A	G	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-1.355;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.055;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,235:476:99:9164,0,9879
chr3	3299065	.	A	G	9337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-1.811;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.450;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,234:476:99:9366,0,10446
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chr3	3300972	.	T	C	10486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.214;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.179;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,256:459:99:10515,0,8107
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chr3	3300984	.	C	T	10232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.653;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.317;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,265:482:99:10261,0,8310
chr3	3301023	.	G	A	8152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.204;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.666;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.907;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,262:498:99:8181,0,7054
chr3	3301086	.	GT	G	9714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=-0.429;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.148;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,251:533:99:9752,0,11362
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chr3	3301148	.	A	G	13491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.818;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=8.134;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=1.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,354:671:99:13520,0,12542
chr3	3301149	.	T	A	11987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=-1.287;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=7.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=2.048;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.454;SOR=0.363	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,319:670:99:12016,0,13769
chr3	3301150	.	A	T	13486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=-0.297;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=9.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=7.344;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,347:664:99:13515,0,12703
chr3	3301196	.	T	TG	14377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.759;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=3.479;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,340:536:99:14415,0,7637
chr3	3301238	.	T	G	56.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQRankSum=-0.727;QD=14.10;SOR=1.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:8:84,0,8
chr3	3301241	.	AAATT	A	30.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQRankSum=-0.727;QD=7.69;SOR=1.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:25:68,0,25
chr3	3301250	.	GC	G	14.87	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQRankSum=-0.727;QD=3.72;SOR=1.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:41:52,0,41
chr3	3301287	.	GA	G	4370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.839;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=5.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=3.879;QD=12.97;ReadPosRankSum=-7.265;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,138:337:99:4408,0,7486
chr3	3301289	.	C	T	5126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=-1.038;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=2.779;QD=15.26;ReadPosRankSum=-6.182;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,138:336:99:5164,0,7503
chr3	3301291	.	G	A	7370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.134;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQRankSum=-1.349;QD=20.94;ReadPosRankSum=5.302;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,204:352:99:7399,0,5473
chr3	3301366	.	T	A	9694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=1.222;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.705;QD=16.89;ReadPosRankSum=1.743;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,302:574:99:9723,0,8697
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chr3	3302403	.	CTGCCATTA	C	13275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-0.069;DP=814;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.432;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:407,351:758:99:13313,0,15900
chr3	3302443	.	G	A	12121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=1.457;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.013;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,324:702:99:12150,0,14263
chr3	3302459	.	TAG	T	12024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.985;ClippingRankSum=1.033;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.366;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:385,305:690:99:12062,0,15264
chr3	3302530	.	G	T	12769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=-1.539;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.584;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,333:682:99:12798,0,13670
chr3	3302554	.	C	T	14900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=0.687;DP=780;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.018;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.293;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,371:755:99:14929,0,15659
chr3	3302557	.	C	G	11727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.140;DP=777;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.145;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,377:751:99:11756,0,15050
chr3	3302567	.	C	A	14548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.059;DP=786;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.026;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:381,380:761:99:14577,0,14663
chr3	3302694	.	CG	C	9073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=-1.667;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.085;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,306:645:99:9111,0,10350
chr3	3302695	.	GA	G	8964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-0.208;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.649;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,330:643:99:9002,0,9953
chr3	3302804	.	G	A	11425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.414;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.032;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.197;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,311:621:99:11454,0,11695
chr3	3302823	.	AT	A	8716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=-1.270;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.396;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,292:615:99:8754,0,12263
chr3	3302825	.	TC	T	11763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.248;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.479;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,313:618:99:11801,0,11347
chr3	3303018	.	A	G	8721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.554;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.797;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,279:520:99:8750,0,7807
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chr3	3303935	.	T	A	10722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=-1.199;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.102;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.656;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,283:601:99:10751,0,12563
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chr3	3303991	.	G	A	11177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.635;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.032;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,292:578:99:11206,0,11152
chr3	3304054	.	T	C	10116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.541;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.293;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,264:531:99:10145,0,10264
chr3	3304068	.	T	A	10703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=-1.187;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.189;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:10732,0,10545
chr3	3304085	.	G	A	10767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-1.039;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.612;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,270:520:99:10796,0,9931
chr3	3304089	.	T	C	10693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=-0.740;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.208;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,269:512:99:10722,0,9451
chr3	3304212	.	C	T	5288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.537;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.070;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,168:381:99:5317,0,6860
chr3	3304248	.	T	C	4715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.073;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=6.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.579;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,154:342:99:4744,0,6013
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chr3	3306331	.	T	C	13700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.991;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.307;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,350:642:99:13729,0,11583
chr3	3306334	.	G	A	14022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.597;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.124;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,350:636:99:14051,0,11844
chr3	3306347	.	T	A	13920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.698;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.626;QD=22.03;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,341:632:99:13949,0,12129
chr3	3306370	.	T	C	13618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=1.353;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.332;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,333:620:99:13647,0,11262
chr3	3306376	.	G	T	13989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=1.603;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.050;QD=22.49;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,337:622:99:14018,0,11318
chr3	3306382	.	G	A	13956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.576;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.770;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,339:617:99:13985,0,11195
chr3	3306385	.	AATATGCAGGCGAT	A	13586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=-1.176;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.545;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,336:656:99:13624,0,12712
chr3	3306417	.	T	A	12872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.041;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.834;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,345:636:99:12901,0,10640
chr3	3306739	.	G	C	36308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=-1.278;DP=1235;ExcessHet=3.0103;FS=66.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.94;MQRankSum=-0.627;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.473;SOR=11.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,941:1235:99:36337,0,8558
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chr3	3312253	.	A	C	14513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.297;ClippingRankSum=-0.226;DP=753;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQRankSum=-20.008;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.434;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,359:728:99:14542,0,15082
chr3	3312254	.	G	A	14555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.290;ClippingRankSum=-0.343;DP=754;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQRankSum=-20.158;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:371,358:729:99:14584,0,15079
chr3	3312258	.	A	AAG	14276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.405;ClippingRankSum=1.168;DP=758;ExcessHet=3.0103;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=-19.543;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.437;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,356:730:99:14314,0,15349
chr3	3312261	.	G	GT	13970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.429;ClippingRankSum=0.058;DP=757;ExcessHet=3.0103;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQRankSum=-20.559;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.966;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,348:730:99:14008,0,15538
chr3	3312265	.	AAGGG	A	14288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.441;ClippingRankSum=-0.468;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQRankSum=-20.026;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:417,363:780:99:14326,0,16936
chr3	3312275	.	A	G	15158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;ClippingRankSum=-0.125;DP=822;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.38;MQRankSum=-19.398;QD=19.16;ReadPosRankSum=-3.226;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:408,383:791:99:15187,0,16582
chr3	3312276	.	G	A	15413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.245;ClippingRankSum=-0.770;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQRankSum=-19.056;QD=19.46;ReadPosRankSum=-3.772;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:408,384:792:99:15442,0,16522
chr3	3312284	.	C	A	11572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.113;DP=805;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQRankSum=-15.302;QD=15.51;ReadPosRankSum=-4.970;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:405,341:746:99:11601,0,16760
chr3	3312299	.	C	A	12974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=-0.295;DP=737;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQRankSum=-12.586;QD=18.25;ReadPosRankSum=-5.807;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:392,319:711:99:13003,0,16153
chr3	3312319	.	A	C	11892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-1.745;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-8.236;QD=17.36;ReadPosRankSum=-3.177;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,299:685:99:11921,0,16106
chr3	3312326	.	AGC	A	11797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=-1.252;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=1.426;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:394,286:680:99:11835,0,16260
chr3	3312329	.	A	AGAG	11662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=-0.415;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=1.393;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:397,288:685:99:11700,0,16127
chr3	3312339	.	C	T	12061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.946;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=1.836;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:407,331:738:99:12090,0,15773
chr3	3312719	.	G	GAACTAATGAATCAATGAGTCAGTTAATTAATCATTAATCAATGAATGACAATCAAAATCAATGAGAT	8401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.006;ClippingRankSum=-1.458;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=8.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.320;QD=18.11;ReadPosRankSum=-13.772;SOR=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,126:464:99:8439,0,13578
chr3	3312743	.	T	C	3971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.425;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=14.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-9.507;QD=7.94;ReadPosRankSum=-5.128;SOR=1.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,124:500:99:4000,0,16176
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chr3	3312850	.	C	T	10641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;ClippingRankSum=-0.592;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.233;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,290:644:99:10670,0,13647
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chr3	3315766	.	T	C	9506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.656;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.173;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,252:549:99:9535,0,11829
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chr3	3315833	.	T	A	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.762;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,263:543:99:8192,0,11084
chr3	3315908	.	G	A	8714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=-0.850;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.383;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,289:586:99:8743,0,9488
chr3	3316004	.	C	T	10764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.806;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.392;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,284:568:99:10793,0,10906
chr3	3316020	.	G	A	10939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=1.200;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.742;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,279:574:99:10968,0,11895
chr3	3316035	.	C	G	11880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=1.717;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.003;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,279:583:99:11909,0,12387
chr3	3316059	.	C	A	11874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.199;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.480;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,302:625:99:11903,0,13294
chr3	3316070	.	T	G	11403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;ClippingRankSum=-0.040;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.207;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,300:635:99:11432,0,13234
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chr3	3316141	.	G	C	10282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-1.138;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.296;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,324:652:99:10311,0,10516
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chr3	3316659	.	G	A	12042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=-0.048;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.371;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,290:522:99:12071,0,9157
chr3	3316663	.	G	T	11799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.154;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.400;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,297:541:99:11828,0,9175
chr3	3316719	.	A	G	8438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.350;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.368;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,268:517:99:8467,0,7644
chr3	3316776	.	C	T	8827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.030;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.105;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.618;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,285:545:99:8856,0,7658
chr3	3316805	.	T	A	10595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.859;ClippingRankSum=1.423;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.476;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,273:502:99:10624,0,8378
chr3	3316810	.	C	T	10614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.528;ClippingRankSum=0.202;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.203;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.550;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,264:479:99:10643,0,8479
chr3	3316821	.	G	A	10858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.440;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.367;QD=22.62;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,263:480:99:10887,0,8866
chr3	3316834	.	T	TA	5554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.268;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.174;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,220:495:99:5592,0,11135
chr3	3316838	.	A	AG	10838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=1.837;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.533;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.222;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,290:534:99:10876,0,8708
chr3	3316990	.	C	CT	13490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=1.583;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.103;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.790;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,350:700:99:13528,0,13533
chr3	3316992	.	C	T	13633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.232;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.703;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,348:700:99:13662,0,13871
chr3	3317000	.	G	A	13338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.266;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.403;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.168;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,341:691:99:13367,0,13471
chr3	3317115	.	C	A	13191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.478;DP=774;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.504;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:395,342:737:99:13220,0,15432
chr3	3317124	.	C	T	13415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.482;DP=772;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.129;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:403,339:742:99:13444,0,16510
chr3	3317145	.	G	C	12945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.034;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.013;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:396,321:717:99:12974,0,16094
chr3	3317146	.	C	A	12705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=-0.566;DP=746;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.240;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:397,322:719:99:12734,0,15944
chr3	3317195	.	T	C	10462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.045;DP=748;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.555;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,339:721:99:10491,0,11905
chr3	3317229	.	C	CT	7986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-0.100;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.034;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,328:656:99:8024,0,10007
chr3	3317233	.	T	TC	8745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-0.528;DP=701;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.204;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,334:678:99:8783,0,10698
chr3	3317361	.	T	C	10486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=1.144;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.690;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,325:642:99:10515,0,10035
chr3	3317407	.	C	A	10146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.194;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.105;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,345:698:99:10175,0,10421
chr3	3317457	.	C	T	10128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.843;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.140;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,339:681:99:10157,0,9989
chr3	3317498	.	T	C	9723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.297;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.921;QD=16.65;ReadPosRankSum=-1.594;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,299:584:99:9752,0,8922
chr3	3317604	.	C	T	11847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.088;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.243;QD=22.40;ReadPosRankSum=-2.548;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,304:529:99:11876,0,8599
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chr3	3318508	.	A	AT	6616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.356;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.775;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:6654,0,8218
chr3	3318510	.	T	TC	7784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-0.448;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.850;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,268:540:99:7822,0,8647
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chr3	3318558	.	A	T	8764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=-0.416;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.943;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.223;SOR=1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,275:574:99:8793,0,11836
chr3	3318684	.	C	A	10013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-1.442;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.948;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,329:667:99:10042,0,12978
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chr3	3318707	.	T	C	12796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.379;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.536;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,317:629:99:12825,0,12616
chr3	3318727	.	A	G	11971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.071;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.047;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,295:602:99:12000,0,11539
chr3	3318748	.	T	C	11322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.130;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.072;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,287:590:99:11351,0,12252
chr3	3318754	.	T	C	11668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=1.839;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.017;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,296:608:99:11697,0,12657
chr3	3318762	.	C	T	11266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.450;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.132;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,292:587:99:11295,0,11764
chr3	3318811	.	G	A	10216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=1.474;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.745;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,272:515:99:10245,0,8807
chr3	3318833	.	A	C	10110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.052;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.735;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,266:470:99:10139,0,7545
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chr3	3320498	.	C	T	9197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.102;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.872;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,236:472:99:9226,0,10212
chr3	3320504	.	T	A	9272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-0.728;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.208;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,243:483:99:9301,0,10169
chr3	3320534	.	A	G	7225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.937;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.421;QD=14.39;ReadPosRankSum=2.355;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,235:502:99:7254,0,8211
chr3	3320669	.	C	T	12276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.978;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.550;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,311:580:99:12305,0,10333
chr3	3320676	.	T	C	12760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.147;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.260;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,316:584:99:12789,0,10491
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chr3	3321140	.	AT	A	12222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.766;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.202;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,311:627:99:12260,0,12695
chr3	3321163	.	CA	C	11245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.073;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.526;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,283:580:99:11283,0,12183
chr3	3321165	.	TCC	T	11101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.464;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.614;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.784;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,280:574:99:11139,0,11859
chr3	3321172	.	CT	C	11362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=-0.438;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.390;QD=20.15;ReadPosRankSum=3.091;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,283:564:99:11400,0,11130
chr3	3321177	.	T	TTTTTCC	11737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=-0.414;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.683;QD=21.66;ReadPosRankSum=-2.346;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,268:542:99:11775,0,11079
chr3	3321185	.	G	A	10731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.494;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.420;QD=20.40;ReadPosRankSum=-4.885;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,266:526:99:10760,0,10599
chr3	3321193	.	T	C	10316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;ClippingRankSum=-0.298;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.163;QD=19.43;ReadPosRankSum=-4.393;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,271:531:99:10345,0,10160
chr3	3321225	.	G	T	8067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.230;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.179;QD=15.49;ReadPosRankSum=-2.692;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,276:521:99:8096,0,7548
chr3	3321265	.	G	A	9978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=1.468;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.557;QD=19.34;ReadPosRankSum=3.059;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,254:516:99:10007,0,10606
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chr3	3322059	.	C	G	8158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.568;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.575;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,210:429:99:8187,0,8903
chr3	3322060	.	G	GA	8767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.319;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.582;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,221:429:99:8805,0,8224
chr3	3322090	.	C	G	8337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.003;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.748;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,219:414:99:8366,0,7579
chr3	3322095	.	AT	A	7949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.880;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.182;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,202:408:99:7987,0,6277
chr3	3322097	.	TC	T	6231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.496;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.703;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,208:416:99:6269,0,8183
chr3	3322111	.	G	A	8365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.070;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.495;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,208:415:99:8394,0,8337
chr3	3322114	.	A	G	7590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.628;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.472;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,202:408:99:7619,0,8314
chr3	3322127	.	A	G	7815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;ClippingRankSum=0.104;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.443;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,201:415:99:7844,0,8137
chr3	3322215	.	G	A	5912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=2.758;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.819;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,187:377:99:5941,0,5887
chr3	3322293	.	C	T	5487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.397;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.695;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,182:402:99:5516,0,6716
chr3	3322383	.	A	G	6915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.866;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=10.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.149;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.214;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,215:446:99:6944,0,7044
chr3	3322466	.	C	T	7349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=1.210;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.081;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.375;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,208:471:99:7378,0,9900
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chr3	3323508	.	T	C	7685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.332;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.953;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,198:394:99:7714,0,7541
chr3	3323536	.	A	AG	16293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=22.86;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,431:431:99:16331,1317,0
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chr3	3323783	.	C	T	9495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-1.664;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.859;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,254:479:99:9524,0,8405
chr3	3323806	.	CA	C	10084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.794;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.556;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,250:489:99:10122,0,9619
chr3	3323807	.	AG	A	7875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-1.404;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.537;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,230:483:99:7913,0,10282
chr3	3323826	.	C	T	10071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.931;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=10.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.605;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,240:495:99:10100,0,10348
chr3	3323842	.	G	A	8733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.663;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=10.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-3.074;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.585;SOR=1.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,228:514:99:8762,0,10763
chr3	3323863	.	AGCAAAGATAAC	A	6880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.999;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=0.235;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.351;SOR=1.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,193:468:99:6918,0,11406
chr3	3323874	.	C	CG	11121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=-0.335;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=4.721;QD=23.76;ReadPosRankSum=-2.473;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,275:468:99:11159,0,7487
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chr3	3325593	.	C	G	16093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.453;DP=849;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.627;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.288;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:396,424:820:99:16122,0,15048
chr3	3325609	.	T	C	15945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-2.125;DP=845;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.976;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:397,423:820:99:15974,0,15060
chr3	3325713	.	A	G	11599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.363;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.480;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.330;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,361:666:99:11628,0,9389
chr3	3325746	.	A	G	11422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.671;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.599;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,353:642:99:11451,0,8894
chr3	3325792	.	G	C	12333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.848;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.099;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,314:561:99:12362,0,10034
chr3	3325793	.	A	G	12333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.865;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.094;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,309:557:99:12362,0,10034
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chr3	3327160	.	T	C	12196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.211;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.256;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,318:634:99:12225,0,12129
chr3	3327169	.	C	T	12207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.767;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,303:608:99:12236,0,12460
chr3	3327170	.	C	T	12242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.702;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.484;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,299:607:99:12271,0,12588
chr3	3327171	.	C	G	12235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.145;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.046;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,299:609:99:12264,0,12488
chr3	3327176	.	C	T	11830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=1.037;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.783;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,299:602:99:11859,0,12260
chr3	3327177	.	C	T	11773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=-0.404;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.638;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,295:597:99:11802,0,10608
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chr3	3327765	.	G	A	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.712;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=75.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.08;MQRankSum=-0.976;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=8.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:413,90:503:99:2475,0,17528
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chr3	3328116	.	A	T	7638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=1.220;DP=1097;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.217;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:524,282:806:99:7667,0,16711
chr3	3328186	.	A	AT	5911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=-1.895;DP=812;ExcessHet=3.0103;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.719;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:481,257:738:99:5949,0,13221
chr3	3328257	.	G	A	9487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=1.145;DP=969;ExcessHet=3.0103;FS=0.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.238;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:613,325:938:99:9516,0,19912
chr3	3328287	.	C	T	9030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.181;DP=990;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.645;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:630,330:960:99:9059,0,20273
chr3	3328323	.	T	C	9109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-2.177;DP=957;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.327;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:607,326:933:99:9138,0,19897
chr3	3328447	.	A	G	10482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.028;DP=855;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.098;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:522,299:821:99:10511,0,24702
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chr3	3331222	.	A	G	7454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.812;ClippingRankSum=0.389;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.209;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.287;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,193:437:99:7483,0,9823
chr3	3331226	.	C	A	7541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;ClippingRankSum=2.141;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.304;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.881;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,186:423:99:7570,0,9775
chr3	3331241	.	TGAA	T	7626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;ClippingRankSum=-1.093;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.872;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.775;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,186:423:99:7664,0,9934
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chr3	3333731	.	T	G	11779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.637;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.203;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,302:643:99:11808,0,13405
chr3	3333734	.	G	A	11883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.632;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.222;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,304:642:99:11912,0,13755
chr3	3333739	.	C	T	11701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-0.140;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.476;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,300:635:99:11730,0,13486
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chr3	3334928	.	A	G	12062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=-2.091;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.577;QD=20.83;ReadPosRankSum=-6.286;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,307:579:99:12091,0,10513
chr3	3337723	.	A	C	9340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.127;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.019;QD=18.21;ReadPosRankSum=5.288;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,242:513:99:9369,0,17630
chr3	3337729	.	T	C	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.990;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.089;QD=17.93;ReadPosRankSum=2.691;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,246:526:99:9462,0,17845
chr3	3337850	.	GAAGTTGGTTTGGGTGTTAATGCAACTAATTCAATTAATGATGTTACAGATA	G	8307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.916;ClippingRankSum=-0.202;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=5.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=2.758;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:439,251:690:99:8345,0,16315
chr3	3338005	.	TAATACTGAGAAGGCTAATACACTCAATCCA	T	8368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=1.714;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=6.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=8.864;QD=25.83;ReadPosRankSum=7.151;SOR=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,250:324:99:8406,0,5841
chr3	3338250	.	C	T	9226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.382;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.261;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,298:593:99:9255,0,9199
chr3	3338285	.	G	C	10191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=1.438;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.887;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.607;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,266:540:99:10220,0,10343
chr3	3338309	.	A	G	10558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.248;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.611;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.154;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,277:556:99:10587,0,10369
chr3	3338338	.	C	G	9767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.635;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-2.729;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,257:528:99:9796,0,10465
chr3	3338352	.	C	T	9140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-2.316;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.308;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,232:511:99:9169,0,11418
chr3	3338355	.	A	C	8984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;ClippingRankSum=-0.700;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-1.246;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.993;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,224:501:99:9013,0,11803
chr3	3338366	.	G	A	8957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.087;ClippingRankSum=1.139;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-0.261;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,218:505:99:8986,0,11596
chr3	3338369	.	G	A	8657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;ClippingRankSum=1.161;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-1.257;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.510;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,218:506:99:8686,0,11701
chr3	3338370	.	T	C	8573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.397;ClippingRankSum=-0.037;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.580;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,218:503:99:8602,0,11707
chr3	3338373	.	C	G	8201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;ClippingRankSum=1.506;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.217;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,212:503:99:8230,0,11650
chr3	3338377	.	A	C	8198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.659;ClippingRankSum=-1.504;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-3.358;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,211:488:99:8227,0,11479
chr3	3338381	.	G	A	8489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.551;ClippingRankSum=1.490;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.577;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,215:488:99:8518,0,11128
chr3	3338387	.	AAGG	A	8660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.812;ClippingRankSum=1.177;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-1.040;QD=17.50;ReadPosRankSum=-2.556;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,218:495:99:8698,0,11533
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chr3	3341696	.	C	G	11896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.650;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.460;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,322:700:99:11925,0,14387
chr3	3341715	.	T	C	11875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.887;ClippingRankSum=-1.170;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.808;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,313:668:99:11904,0,13833
chr3	3341748	.	G	A	12791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.050;ClippingRankSum=-1.700;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.866;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,339:677:99:12820,0,12950
chr3	3341763	.	A	C	12534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.224;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.198;QD=19.46;ReadPosRankSum=-2.310;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,324:644:99:12563,0,12445
chr3	3341797	.	T	C	12280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.217;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.642;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,326:603:99:12309,0,10175
chr3	3341815	.	G	A	12292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.117;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.335;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,306:582:99:12321,0,10956
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chr3	3343053	.	G	A	11059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=-0.476;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.244;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,283:610:99:11088,0,13158
chr3	3343058	.	T	TA	11423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.372;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.551;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.267;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,281:605:99:11461,0,13193
chr3	3343061	.	CT	C	10964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=2.495;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.744;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,280:611:99:11002,0,13089
chr3	3343088	.	G	T	10630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=0.440;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.318;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.677;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,273:602:99:10659,0,12972
chr3	3343095	.	C	T	11025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.509;ClippingRankSum=0.689;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.482;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,274:596:99:11054,0,13286
chr3	3343099	.	A	G	11306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=-1.300;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.286;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.644;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,281:609:99:11335,0,13296
chr3	3343107	.	A	G	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=1.503;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.658;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,295:630:99:11648,0,13493
chr3	3343109	.	C	A	11521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.085;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.137;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.212;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,293:624:99:11550,0,13353
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chr3	3343760	.	G	A	9706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-0.439;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.589;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.741;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,251:546:99:9735,0,14134
chr3	3344062	.	A	C	10155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.099;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.102;QD=18.27;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,266:556:99:10184,0,11446
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chr3	3344075	.	C	G	10493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=1.449;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.497;QD=18.57;ReadPosRankSum=-2.047;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,275:565:99:10522,0,11520
chr3	3344147	.	A	G	10341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-1.280;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.081;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,278:564:99:10370,0,10762
chr3	3344165	.	T	A	10524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=-0.446;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.554;QD=18.66;ReadPosRankSum=-2.107;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,286:564:99:10553,0,10367
chr3	3344381	.	G	A	8922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.483;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.166;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,238:472:99:8951,0,9041
chr3	3344402	.	G	A	9608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.777;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.358;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,241:494:99:9637,0,10336
chr3	3344408	.	C	T	9393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-2.192;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.786;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,244:500:99:9422,0,10047
chr3	3344504	.	T	C	10230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=-0.235;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.245;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.009;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,282:593:99:10259,0,11680
chr3	3344522	.	CAGTGTTTCG	C	10694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.205;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.899;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,272:608:99:10732,0,13618
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chr3	3347772	.	A	G	11481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=-1.283;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.111;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,298:580:99:11510,0,10758
chr3	3347790	.	T	C	11402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-1.018;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.815;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,294:574:99:11431,0,10501
chr3	3348063	.	T	G	7142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=-1.304;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.016;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,233:473:99:7171,0,6717
chr3	3348093	.	G	A	8835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.611;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.867;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,232:488:99:8864,0,12999
chr3	3348096	.	A	C	8853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.745;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.261;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,230:492:99:8882,0,13112
chr3	3348165	.	T	C	9949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-0.161;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.313;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,252:487:99:9978,0,8958
chr3	3348174	.	A	G	10253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.305;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.062;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,267:498:99:10282,0,8796
chr3	3348579	.	T	C	8925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=-0.425;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.758;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,281:564:99:8954,0,10458
chr3	3348626	.	CTGA	C	10224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-2.078;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.685;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,271:573:99:10262,0,11721
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chr3	3348995	.	C	T	12532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.238;ClippingRankSum=0.549;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.386;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.892;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,319:640:99:12561,0,12356
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chr3	3350149	.	A	C	12978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=-0.638;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.107;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,320:633:99:13007,0,12602
chr3	3350165	.	C	T	13041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.210;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.757;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,328:662:99:13070,0,13475
chr3	3350172	.	A	G	13061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.986;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.071;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,326:657:99:13090,0,13356
chr3	3350178	.	A	T	12897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.815;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.788;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,327:657:99:12926,0,12847
chr3	3350247	.	C	T	11920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-1.879;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=5.316;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,326:652:99:11949,0,18072
chr3	3350269	.	G	T	12167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.825;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=3.997;QD=19.28;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,300:631:99:12196,0,19072
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chr3	3352968	.	G	A	12150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.604;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=8.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=3.493;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,301:651:99:12179,0,14259
chr3	3352980	.	G	A	12393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.418;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.122;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.996;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,318:669:99:12422,0,14367
chr3	3352987	.	C	T	12282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=-0.076;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=5.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.990;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.788;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,306:652:99:12311,0,14166
chr3	3352995	.	G	A	11757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=-0.676;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.860;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.606;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,296:642:99:11786,0,14496
chr3	3353011	.	T	C	11139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.575;ClippingRankSum=1.077;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.814;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,286:643:99:11168,0,14948
chr3	3353012	.	CTG	C	11148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.930;ClippingRankSum=-0.553;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=6.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.046;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,280:646:99:11186,0,15281
chr3	3353017	.	G	GAA	11496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.165;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-2.645;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,282:639:99:11534,0,14504
chr3	3353022	.	G	A	11625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.244;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.482;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,290:645:99:11654,0,14579
chr3	3353039	.	T	C	11838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.775;ClippingRankSum=-0.383;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.266;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,295:651:99:11867,0,14522
chr3	3353041	.	C	A	11999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=-0.891;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.134;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,301:656:99:12028,0,14849
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chr3	3355795	.	G	A	5982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.722;ClippingRankSum=-0.662;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=5.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.196;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,212:399:99:6011,0,5674
chr3	3356074	.	T	C	3784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=-0.374;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=6.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.103;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.866;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,125:268:99:3813,0,5351
chr3	3356775	.	C	T	7715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=1.135;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.953;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.969;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,248:426:99:7744,0,5134
chr3	3357039	.	T	G	11114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.927;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.598;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,340:470:99:11143,0,4924
chr3	3357046	.	T	C	11325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-2.739;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.313;QD=22.03;ReadPosRankSum=-4.750;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,359:514:99:11354,0,5965
chr3	3357048	.	T	TACTTGGCAATGCATTCCG	17594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=1.727;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.239;QD=33.51;ReadPosRankSum=-4.502;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,358:525:99:17632,0,5942
chr3	3357053	.	G	A	13868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.683;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.953;QD=26.77;ReadPosRankSum=-5.549;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,336:518:99:13897,0,6510
chr3	3357131	.	T	A	25476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-0.154;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.389;QD=30.23;ReadPosRankSum=-1.637;SOR=0.126	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,689:691:99:25505,1982,0
chr3	3357188	.	C	A	9670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-0.960;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-2.021;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,303:624:99:9699,0,9985
chr3	3357246	.	GACTTGATAATTGTCC	G	7713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.684;ClippingRankSum=0.093;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-3.314;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,210:487:99:7751,0,10699
chr3	3357327	.	G	C	7303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-1.231;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=9.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.085;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.785;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,185:401:99:7332,0,9032
chr3	3357331	.	A	G	7197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=1.252;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=8.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=2.215;QD=17.39;ReadPosRankSum=2.757;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,185:414:99:7226,0,9337
chr3	3357343	.	C	T	7396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.429;ClippingRankSum=1.350;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=12.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=0.003;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,187:415:99:7425,0,9482
chr3	3357361	.	T	C	6758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.539;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=13.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.125;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,188:436:99:6787,0,9277
chr3	3357399	.	C	T	7539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=1.356;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.468;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,198:442:99:7568,0,9944
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chr3	3358016	.	TTGTTGTTTCTTCATAATTTA	T	9446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=-0.088;DP=768;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.648;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.620;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:405,262:667:99:9484,0,15910
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chr3	3359444	.	T	C	12392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.164;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.191;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.287;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,307:610:99:12421,0,15573
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chr3	3359825	.	C	G	11000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.562;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.681;QD=18.18;ReadPosRankSum=2.068;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,287:605:99:11029,0,12348
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chr3	3359944	.	C	T	8365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.487;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.543;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,291:666:99:8394,0,11669
chr3	3359993	.	C	T	10121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.101;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.524;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,331:698:99:10150,0,11942
chr3	3360422	.	T	C	9515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-0.044;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.955;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,246:555:99:9544,0,12211
chr3	3360428	.	T	C	9363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.082;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.007;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,245:560:99:9392,0,12309
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chr3	3363687	.	G	A	8363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.148;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.542;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,279:558:99:8392,0,8328
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chr3	3363882	.	T	C	9364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=-1.104;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.751;QD=17.94;ReadPosRankSum=2.242;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,241:522:99:9393,0,11109
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chr3	3364065	.	T	C	7602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.595;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.718;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.341;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,246:476:99:7631,0,7200
chr3	3364288	.	G	GAA	3892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.591;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.931;QD=12.09;ReadPosRankSum=-2.680;SOR=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,146:322:99:3930,0,5203
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chr3	3365373	.	A	G	8689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.390;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.514;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,271:573:99:8718,0,9521
chr3	3365524	.	C	T	13648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=-1.621;DP=764;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.432;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,359:739:99:13677,0,14422
chr3	3365542	.	C	T	14105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-0.303;DP=759;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.217;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,357:734:99:14134,0,15382
chr3	3365566	.	C	A	13257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.014;DP=751;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.239;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,354:723:99:13286,0,13948
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chr3	3365840	.	G	C	9726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.025;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.728;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.527;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,252:559:99:9755,0,12389
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chr3	3366429	.	A	T	8317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.673;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.316;QD=16.74;ReadPosRankSum=2.355;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,218:497:99:8346,0,10948
chr3	3366534	.	A	T	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.510;ClippingRankSum=0.791;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.647;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.887;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,231:453:99:9164,0,14589
chr3	3366535	.	C	T	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-1.016;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.445;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,235:455:99:9164,0,14589
chr3	3366680	.	G	A	9140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=2.180;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.698;QD=16.56;ReadPosRankSum=-2.817;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,299:552:99:9169,0,7494
chr3	3366814	.	T	TA	8553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.371;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.734;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,325:622:99:8591,0,7708
chr3	3367159	.	G	T	8529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.897;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.307;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,334:692:99:8558,0,10785
chr3	3368158	.	T	G	3988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.377;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.414;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,135:298:99:4017,0,5047
chr3	3368725	.	TA	T	6213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=-0.513;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.640;QD=10.64;ReadPosRankSum=4.384;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,272:584:99:6251,0,12681
chr3	3368728	.	A	G	6264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.489;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.654;QD=10.58;ReadPosRankSum=4.132;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,279:592:99:6293,0,13213
chr3	3368741	.	A	G	11853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=-1.072;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.686;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.936;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,320:656:99:11882,0,12683
chr3	3368780	.	T	C	13577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.225;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.914;QD=20.24;ReadPosRankSum=2.232;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,356:671:99:13606,0,11784
chr3	3368795	.	A	C	13389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.232;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.077;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,353:668:99:13418,0,11804
chr3	3369269	.	C	T	9951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.627;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.676;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.984;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,261:531:99:9980,0,10564
chr3	3369274	.	T	A	9707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=1.540;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.129;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.854;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,255:519:99:9736,0,10430
chr3	3369378	.	GA	G	6444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.333;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.215;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,283:546:99:6482,0,6337
chr3	3369407	.	G	C	8841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=1.206;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.034;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.443	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,293:616:99:8870,0,10084
chr3	3369442	.	G	A	10831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=-1.550;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.956;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,279:583:99:10860,0,11987
chr3	3369448	.	A	C	11024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.806;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.110;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,285:589:99:11053,0,12056
chr3	3369449	.	C	A	11027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-2.946;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.438;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,285:595:99:11056,0,12034
chr3	3369526	.	A	G	10266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.902;ClippingRankSum=0.636;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.778;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,299:588:99:10295,0,10847
chr3	3369599	.	G	A	8375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-0.003;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.477;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,221:494:99:8404,0,10769
chr3	3369603	.	T	A	8332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=1.498;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.311;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,222:492:99:8361,0,10517
chr3	3369754	.	T	G	6748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-1.244;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=4.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-3.960;QD=14.61;ReadPosRankSum=-2.207;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,199:462:99:6777,0,10054
chr3	3369765	.	TTG	T	2876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-0.681;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQRankSum=-6.232;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,168:447:99:2914,0,10537
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chr3	3369921	.	A	T	8679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-2.098;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.286;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,228:504:99:8708,0,10854
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chr3	3370996	.	T	C	11955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=-2.239;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.738;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,315:644:99:11984,0,20062
chr3	3372146	.	A	C	10384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=1.268;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.101;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,267:592:99:10413,0,13270
chr3	3372151	.	T	C	10309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.306;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.880;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.748;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,264:580:99:10338,0,12999
chr3	3372153	.	A	C	10444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.490;ClippingRankSum=-0.329;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.180;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,254:574:99:10473,0,12993
chr3	3372171	.	T	C	9839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.026;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.071;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,253:568:99:9868,0,13158
chr3	3372178	.	C	T	10081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.022;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.108;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.902;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,256:567:99:10110,0,12810
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chr3	3374280	.	C	T	10495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.338;DP=764;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.789;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.643;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:388,345:733:99:10524,0,17108
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chr3	3374429	.	T	C	13606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.286;DP=771;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.534;QD=18.00;ReadPosRankSum=5.355;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:398,358:756:99:13635,0,38627
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chr3	3375089	.	C	T	9679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.670;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.745;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,247:517:99:9708,0,11001
chr3	3375098	.	A	G	9179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.481;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.531;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,240:518:99:9208,0,10856
chr3	3375204	.	T	C	10886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=1.474;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.191;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,273:530:99:10915,0,9782
chr3	3375216	.	ATT	A	11522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.969;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-2.422;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,284:547:99:11560,0,10682
chr3	3375220	.	C	CTAA	11653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.131;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-1.726;QD=21.27;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,283:548:99:11691,0,10566
chr3	3375227	.	A	G	11503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.791;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-0.846;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,286:560:99:11532,0,11037
chr3	3375232	.	C	A	11743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.917;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-1.210;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,295:575:99:11772,0,11187
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chr3	3376661	.	T	C	11805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.912;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.751;QD=20.82;ReadPosRankSum=1.720;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,297:567:99:11834,0,10429
chr3	3376667	.	C	A	12331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=-0.332;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.991;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,307:570:99:12360,0,10510
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chr3	3377097	.	C	A	8541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.221;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.097;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,222:475:99:8570,0,9843
chr3	3377110	.	T	C	5297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.572;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.433;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,206:457:99:5326,0,9950
chr3	3377120	.	T	A	8887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.552;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.344;QD=18.52;ReadPosRankSum=-2.328;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,235:480:99:8916,0,9449
chr3	3377271	.	TAA	T	9850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.438;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.734;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,252:517:99:9888,0,10290
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chr3	3378348	.	A	G	11689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=1.809;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.504;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,309:626:99:11718,0,11955
chr3	3378360	.	C	T	11954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-1.247;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.991;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,295:609:99:11983,0,12997
chr3	3378379	.	G	C	10808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.296;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.231;QD=18.41;ReadPosRankSum=-1.254;SOR=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,283:587:99:10837,0,11920
chr3	3378455	.	A	G	11643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=-1.124;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.753;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,311:637:99:11672,0,12541
chr3	3378462	.	T	C	11536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=-0.261;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.205;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,300:626:99:11565,0,12752
chr3	3378601	.	GAT	G	11473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.358;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.222;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,300:639:99:11511,0,13652
chr3	3378610	.	T	A	11503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.755;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.439;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.005;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,297:638:99:11532,0,13716
chr3	3378611	.	C	G	11464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-0.042;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.515;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.160;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,297:636:99:11493,0,13677
chr3	3378713	.	T	G	12557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=1.093;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.328;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,338:659:99:12586,0,11956
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chr3	3379410	.	G	A	8910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=-0.528;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.642;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,234:499:99:8939,0,10111
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chr3	3379857	.	T	C	10221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=2.285;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.514;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,264:547:99:10250,0,11227
chr3	3379867	.	G	T	10361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.950;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.314;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,275:573:99:10390,0,11381
chr3	3379907	.	C	T	7959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=2.263;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=7.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.401;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.325;SOR=1.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,213:521:99:7988,0,12275
chr3	3379914	.	T	A	8068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.883;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=7.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.440;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.107;SOR=1.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,207:515:99:8097,0,12625
chr3	3379920	.	G	A	8400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=-0.531;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.135;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.977;SOR=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,220:521:99:8429,0,12652
chr3	3379928	.	T	C	9365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-1.181;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.225;QD=17.28;ReadPosRankSum=-4.347;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,249:542:99:9394,0,11731
chr3	3379980	.	G	C	11107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-0.757;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.061;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,291:586:99:11136,0,11492
chr3	3379984	.	CACATG	C	11244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.152;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.649;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,282:612:99:11282,0,13136
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chr3	3383067	.	G	C	10236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-2.280;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.489;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.013;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,267:580:99:10265,0,12459
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chr3	3383338	.	A	G	11883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.014;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.658;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,290:553:99:11912,0,10442
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chr3	3383373	.	T	C	10595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.740;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.966;QD=21.58;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,258:491:99:10624,0,9139
chr3	3383376	.	A	G	10556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.004;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.606;QD=21.77;ReadPosRankSum=-2.098;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,256:485:99:10585,0,9100
chr3	3383392	.	G	A	10625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-2.230;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.262;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.610;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,261:488:99:10654,0,9178
chr3	3383416	.	A	ACC	9516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-1.251;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.767;QD=21.10;ReadPosRankSum=2.329;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,234:451:99:9554,0,8702
chr3	3383419	.	T	G	10189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.345;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.358;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,253:471:99:10218,0,8528
chr3	3383421	.	ACCT	A	10319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.426;ClippingRankSum=-0.155;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.695;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,255:478:99:10357,0,9157
chr3	3383431	.	T	G	10199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.133;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.593;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,265:475:99:10228,0,8071
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chr3	3383480	.	TG	T	8011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=1.489;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.146;QD=17.61;ReadPosRankSum=2.683;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,204:455:99:8049,0,9940
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chr3	3384228	.	T	TG	7108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-0.189;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.781;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,279:577:99:7146,0,7684
chr3	3384358	.	A	G	9447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.529;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.055;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,308:625:99:9476,0,9809
chr3	3384445	.	AAG	A	10276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.721;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.644;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,301:613:99:10314,0,12254
chr3	3384449	.	A	ATAT	9461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.890;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.738;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,287:600:99:9499,0,12249
chr3	3384493	.	T	C	8843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.088;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.550;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,294:576:99:8872,0,8525
chr3	3384682	.	C	T	9403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=1.029;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-0.084;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,306:659:99:9432,0,13708
chr3	3384697	.	A	T	8074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.010;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-2.153;QD=12.66;ReadPosRankSum=3.970;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,264:638:99:8103,0,15364
chr3	3384701	.	AAGTGTAG	A	7613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;ClippingRankSum=0.763;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=1.753;QD=11.50;ReadPosRankSum=4.348;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:406,256:662:99:7651,0,16988
chr3	3384712	.	ATTGAAAAGGTAGATG	A	7289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.395;ClippingRankSum=1.509;DP=737;ExcessHet=3.0103;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-5.276;QD=10.63;ReadPosRankSum=4.286;SOR=1.111	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:440,246:686:99:7327,0,18604
chr3	3384760	.	A	C	10995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=1.117;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=8.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-1.876;QD=17.59;ReadPosRankSum=-5.332;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,274:625:99:11024,0,14624
chr3	3384762	.	AAGACTAATGTAAAATATTGAG	A	10803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.791;ClippingRankSum=-0.155;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-2.150;QD=16.12;ReadPosRankSum=2.407;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:402,268:670:99:10841,0,16601
chr3	3384789	.	T	A	10649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=-0.345;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-1.746;QD=17.93;ReadPosRankSum=6.417;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,263:594:99:10678,0,13722
chr3	3384804	.	A	C	9450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.715;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.137;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,254:561:99:9479,0,13037
chr3	3384832	.	A	G	9289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=-0.883;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.570;QD=15.77;ReadPosRankSum=3.169;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,298:589:99:9318,0,10530
chr3	3385131	.	T	C	8410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.860;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.331;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,264:534:99:8439,0,8398
chr3	3385585	.	C	T	7743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=1.930;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.040;QD=16.94;ReadPosRankSum=2.001;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,202:457:99:7772,0,10094
chr3	3385588	.	C	A	7927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.977;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.001;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,209:461:99:7956,0,10057
chr3	3386428	.	A	C	6827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.712;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.295;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.742;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,223:455:99:6856,0,7300
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chr3	3386770	.	G	A	11390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.037;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.319;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,291:569:99:11419,0,10739
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chr3	3387981	.	T	C	13380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=1.378;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.265;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,348:682:99:13409,0,13236
chr3	3388357	.	G	A	7728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.227;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.078;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.946;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,243:469:99:7757,0,7061
chr3	3388640	.	G	A	10348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.236;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.008;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,343:706:99:10377,0,10976
chr3	3388687	.	C	T	11946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.223;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.547;QD=18.41;ReadPosRankSum=-3.333;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,305:649:99:11975,0,13752
chr3	3388688	.	T	G	11986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.707;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.211;QD=18.56;ReadPosRankSum=-3.399;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,302:646:99:12015,0,13790
chr3	3388695	.	C	T	11747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-1.623;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.873;QD=18.38;ReadPosRankSum=-5.147;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,298:639:99:11776,0,13859
chr3	3388699	.	C	T	11744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.398;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.345;QD=18.91;ReadPosRankSum=-6.947;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,292:621:99:11773,0,13901
chr3	3388716	.	A	AGGTGATAGTTCATGGATGGACATGC	13962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.191;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.494;QD=22.27;ReadPosRankSum=-9.262;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,272:627:99:14000,0,14259
chr3	3388734	.	A	G	9775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-1.063;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.038;QD=15.77;ReadPosRankSum=-6.901;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,277:620:99:9804,0,13529
chr3	3388768	.	A	G	11941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-1.865;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.208;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,322:676:99:11970,0,13758
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chr3	3388782	.	C	G	13112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=1.946;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.402;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,331:684:99:13141,0,14382
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chr3	3389353	.	G	C	9785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=1.973;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.859;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.557;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,239:493:99:9814,0,10534
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chr3	3389385	.	T	A	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.262;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.058;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,234:479:99:9164,0,9504
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chr3	3389568	.	C	T	10790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.970;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.188;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.081;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,279:575:99:10819,0,9301
chr3	3389572	.	A	G	8545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=-1.019;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.499;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,279:582:99:8574,0,14058
chr3	3389800	.	C	T	8202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.154;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.827;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,210:422:99:8231,0,8397
chr3	3389803	.	G	T	8311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.018;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.562;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,209:424:99:8340,0,8580
chr3	3389812	.	G	C	8109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-2.225;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.408;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,206:412:99:8138,0,8273
chr3	3389820	.	GTACTA	G	8481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.414;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.154;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,199:425:99:8519,0,8933
chr3	3389825	.	A	AGGTGG	8022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.965;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.222;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,194:406:99:8060,0,8339
chr3	3389968	.	T	C	4775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=-1.996;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.090;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,168:363:99:4804,0,6087
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chr3	3390049	.	C	G	6697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.692;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.086;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,163:325:99:6726,0,39208
chr3	3390050	.	A	G	6733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.333;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.897;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,165:329:99:6762,0,39535
chr3	3390058	.	C	T	7335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.040;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.162;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,182:361:99:7364,0,42431
chr3	3390066	.	G	A	8179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.344;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.550;QD=21.14;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,200:387:99:8208,0,42664
chr3	3390075	.	C	T	8299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-0.593;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.837;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,205:410:99:8328,0,42029
chr3	3390078	.	T	C	8098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=1.468;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.282;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.673;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,210:421:99:8127,0,41934
chr3	3390193	.	C	T	8234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.642;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.711;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,219:487:99:8263,0,10460
chr3	3390204	.	C	T	9280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.240;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.925;QD=18.49;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,236:502:99:9309,0,11029
chr3	3390207	.	A	T	9299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=1.536;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.145;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,234:507:99:9328,0,10881
chr3	3390215	.	G	A	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.940;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.664;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.508;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,239:503:99:9408,0,10595
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chr3	3391719	.	G	A	12487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-1.151;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.753;QD=20.68;ReadPosRankSum=-3.341;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,315:604:99:12516,0,11533
chr3	3391735	.	G	T	11921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-1.980;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.051;QD=19.97;ReadPosRankSum=-2.324;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,308:597:99:11950,0,11019
chr3	3391754	.	CCATAG	C	10536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.139;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.666;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,267:542:99:10574,0,10945
chr3	3391772	.	C	G	12306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.835;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.231;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,310:618:99:12335,0,12315
chr3	3391780	.	C	T	12448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.449;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.162;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.827;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,311:619:99:12477,0,12432
chr3	3391783	.	C	G	12673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=1.611;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.901;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.737;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,312:611:99:12702,0,12207
chr3	3391788	.	C	T	12888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.408;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.409;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,306:609:99:12917,0,12107
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chr3	3391828	.	G	A	10321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.385;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.005;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.338;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,265:551:99:10350,0,11124
chr3	3391905	.	T	A	10540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.015;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.429;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,260:529:99:10569,0,11064
chr3	3391920	.	G	T	10306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.108;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.148;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,256:534:99:10335,0,11415
chr3	3391933	.	C	T	9499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.996;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.836;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,238:520:99:9528,0,11598
chr3	3391941	.	G	A	9032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.815;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.043;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,223:510:99:9061,0,11716
chr3	3391955	.	TC	T	9158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-1.850;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=4.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.013;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,227:509:99:9196,0,11581
chr3	3391959	.	T	A	9299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.930;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.541;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.902;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,234:512:99:9328,0,11488
chr3	3391979	.	GTGAATGT	G	7275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=-0.440;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.407;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,236:568:99:7313,0,13364
chr3	3392052	.	T	C	3685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-1.768;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=16.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.347;QD=8.05;ReadPosRankSum=-6.772;SOR=1.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,114:458:99:3714,0,14056
chr3	3392053	.	G	A	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=-0.288;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=17.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.854;QD=8.09;ReadPosRankSum=-7.294;SOR=1.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,109:451:99:3676,0,14059
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chr3	3392222	.	A	G	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=1.265;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=0.947;QD=5.50;ReadPosRankSum=-5.993;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,73:403:99:2246,0,14175
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chr3	3392856	.	C	T	12403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.392;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.406;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,308:613:99:12432,0,12477
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chr3	3393571	.	G	A	9829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.050;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.430;QD=15.83;ReadPosRankSum=3.053;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,317:621:99:9858,0,9617
chr3	3393604	.	A	G	12735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-1.548;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.685;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.812;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,329:660:99:12764,0,12742
chr3	3393609	.	A	C	12567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.908;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.086;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.666;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,323:650:99:12596,0,12737
chr3	3393880	.	A	T	10827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=1.178;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.747;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,285:568:99:10856,0,11002
chr3	3393888	.	A	G	10605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-0.589;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.820;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,267:561:99:10634,0,11789
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chr3	3395770	.	G	A	10691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.313;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=6.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.967;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,278:518:99:10720,0,8984
chr3	3395913	.	G	A	10333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=1.116;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=9.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.732;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.549;SOR=1.320	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,272:574:99:10362,0,11823
chr3	3395924	.	A	G	10709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-1.013;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.272;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.034;SOR=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,292:609:99:10738,0,12008
chr3	3395955	.	AG	A	11712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.026;ClippingRankSum=-0.053;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.200;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,304:627:99:11750,0,12795
chr3	3395958	.	G	C	11685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=-1.953;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.898;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,311:638:99:11714,0,13295
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chr3	3399652	.	A	C	11054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.922;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.336;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,286:575:99:11083,0,10768
chr3	3399654	.	A	C	8571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.939;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.937;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,278:573:99:8600,0,11575
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chr3	3401813	.	T	C	11025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-1.766;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.018;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,287:542:99:11054,0,9608
chr3	3401831	.	T	C	12144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-0.095;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.146;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,301:558:99:12173,0,10272
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chr3	3401866	.	G	A	11947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.586;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.446;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,313:605:99:11976,0,10854
chr3	3402043	.	G	A	10827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.281;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.547;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,281:558:99:10856,0,10511
chr3	3402059	.	T	C	8769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.447;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.484;QD=15.36;ReadPosRankSum=2.068;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,285:571:99:8798,0,11562
chr3	3402060	.	C	T	8769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.141;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.916;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.908;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,286:569:99:8798,0,11593
chr3	3402079	.	A	G	11573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.170;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.308;QD=20.38;ReadPosRankSum=1.862;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,291:568:99:11602,0,10940
chr3	3402097	.	C	T	10939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-1.326;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.599;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,289:556:99:10968,0,9981
chr3	3402872	.	C	T	6580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=1.947;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.668;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,183:395:99:6609,0,8232
chr3	3402891	.	A	G	9078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.944;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.392;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,231:471:99:9107,0,9681
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chr3	3404507	.	G	A	8142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-1.673;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.620;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,264:552:99:8171,0,8973
chr3	3404771	.	A	C	8263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=1.111;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.441;QD=17.36;ReadPosRankSum=2.419;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,215:476:99:8292,0,10412
chr3	3404775	.	A	G	8246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.519;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.733;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.956;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,216:483:99:8275,0,10433
chr3	3404826	.	G	A	7717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.995;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.180;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,249:552:99:7746,0,9055
chr3	3404859	.	G	A	9592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-1.085;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.199;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=1.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,255:556:99:9621,0,11529
chr3	3404868	.	T	G	9727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.102;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=6.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.229;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,259:560:99:9756,0,11719
chr3	3405132	.	T	C	10915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-1.599;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.123;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,282:591:99:10944,0,12100
chr3	3405137	.	G	C	11227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-1.268;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.046;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,289:596:99:11256,0,12169
chr3	3405138	.	C	T	11163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.604;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.677;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,289:594:99:11192,0,12020
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chr3	3406875	.	G	A	6716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.693;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.224;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,219:499:99:6745,0,8767
chr3	3406889	.	A	G	6897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.405;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.111;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,220:494:99:6926,0,8740
chr3	3406908	.	G	T	9301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=1.853;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.025;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,250:510:99:9330,0,9960
chr3	3406956	.	C	CT	5448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.371;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.620;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,228:486:99:5486,0,6374
chr3	3407006	.	T	C	7782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=0.510;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.227;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,255:534:99:7811,0,8038
chr3	3407046	.	T	C	11338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.166;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.141;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,301:588:99:11367,0,10916
chr3	3407065	.	A	G	12080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.393;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.824;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,308:600:99:12109,0,11657
chr3	3407067	.	T	C	12259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.453;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.686;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,297:588:99:12288,0,11636
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chr3	3415134	.	T	C	13174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.289;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.491;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,327:657:99:13203,0,13225
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chr3	3415167	.	T	G	12244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=-0.393;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.243;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,324:636:99:12273,0,11679
chr3	3415312	.	C	A	7403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.343;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.308;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,242:526:99:7432,0,8923
chr3	3415344	.	TGTTTCTAGAATATTCATTGCAACTGAATAACGCCTCATAAGAATTTCACCCACATAG	T	7658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=-0.331;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.666;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:437,245:682:99:7696,0,17813
chr3	3415417	.	C	T	10198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.744;ClippingRankSum=0.597;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=2.217;QD=18.89;ReadPosRankSum=-8.309;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,254:540:99:10227,0,11757
chr3	3415425	.	T	C	10177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.165;ClippingRankSum=-0.763;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.632;QD=19.20;ReadPosRankSum=-8.350;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,253:530:99:10206,0,11466
chr3	3415438	.	C	T	10270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=-1.303;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.543;QD=19.06;ReadPosRankSum=-5.056;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,260:539:99:10299,0,11334
chr3	3415457	.	A	G	10825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.942;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.399;QD=20.62;ReadPosRankSum=1.683;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,264:525:99:10854,0,10441
chr3	3415458	.	A	T	10587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.225;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.156;QD=20.17;ReadPosRankSum=1.750;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,265:525:99:10616,0,10289
chr3	3415497	.	T	A	10568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.234;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=6.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.276;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,273:585:99:10597,0,12342
chr3	3415499	.	A	G	10626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.226;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.925;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,270:574:99:10655,0,12528
chr3	3415509	.	T	C	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.411;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.461;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,269:571:99:10315,0,11871
chr3	3415643	.	T	TC	11096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=1.021;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.198;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,297:575:99:11134,0,10324
chr3	3415664	.	C	T	12762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.214;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.955;QD=20.39;ReadPosRankSum=2.041;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,316:626:99:12791,0,12471
chr3	3415671	.	A	G	12452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.456;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.836;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.602;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,319:629:99:12481,0,12050
chr3	3415701	.	C	T	12152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.749;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.704;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,311:637:99:12181,0,12648
chr3	3415706	.	A	G	12678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.009;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.309;QD=19.87;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,315:638:99:12707,0,13115
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chr3	3416336	.	A	G	11725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.269;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.331;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,304:561:99:11754,0,9798
chr3	3416384	.	A	T	11233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=-0.065;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.584;QD=23.80;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,281:472:99:11262,0,7047
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chr3	3416398	.	T	C	11975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=-1.143;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.020;QD=25.48;ReadPosRankSum=-2.507;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,289:470:99:12004,0,7061
chr3	3416421	.	A	G	12560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.829;ClippingRankSum=-1.346;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.139;QD=27.25;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,302:461:99:12589,0,6199
chr3	3416429	.	CTTTT	C	12239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.317;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=7.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.856;QD=26.44;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,295:463:99:12277,0,6155
chr3	3416439	.	T	A	12123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=-0.664;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.387;QD=27.74;ReadPosRankSum=7.821;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,285:437:99:12152,0,5698
chr3	3416440	.	T	TGC	11910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.197;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=2.697;QD=27.83;ReadPosRankSum=8.313;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,276:428:99:11948,0,5655
chr3	3416458	.	T	C	11151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;ClippingRankSum=-0.860;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.228;QD=25.87;ReadPosRankSum=6.589;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,289:431:99:11180,0,4599
chr3	3416508	.	T	C	9060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.770;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.776;QD=18.38;ReadPosRankSum=-5.102;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,302:493:99:9089,0,5466
chr3	3416599	.	A	AC	8258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.122;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.795;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,274:555:99:8296,0,8537
chr3	3416748	.	T	C	8442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-1.663;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.700;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,273:553:99:8471,0,8802
chr3	3416775	.	T	A	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.097;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.019;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,253:529:99:9164,0,10744
chr3	3416791	.	T	C	9317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.077;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.112;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,251:536:99:9346,0,10809
chr3	3416834	.	G	GA	9855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.019;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.261;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.346;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,251:490:99:9893,0,9212
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chr3	3419538	.	C	G	10439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-0.384;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.995;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.440;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,271:600:99:10468,0,12559
chr3	3419547	.	A	G	10446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=1.447;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.707;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,277:590:99:10475,0,12382
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chr3	3419853	.	T	G	9130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.779;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.151;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,293:612:99:9159,0,12033
chr3	3420211	.	T	C	8240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.504;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.938;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,269:531:99:8269,0,7884
chr3	3420287	.	G	T	7866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.641;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.719;QD=15.01;ReadPosRankSum=-3.011;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,249:524:99:7895,0,8939
chr3	3420320	.	C	T	9708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.091;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.933;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,260:564:99:9737,0,11465
chr3	3420342	.	T	G	10973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.680;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.398;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,274:565:99:11002,0,11934
chr3	3420360	.	T	G	10510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.089;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.593;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,263:533:99:10539,0,10899
chr3	3420367	.	A	G	10585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-1.006;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.126;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,257:530:99:10614,0,11019
chr3	3420384	.	A	G	10846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-1.206;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.081;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,262:533:99:10875,0,10875
chr3	3420404	.	AG	A	10960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.140;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.449;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,274:547:99:10998,0,10908
chr3	3420412	.	G	A	11134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-1.218;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-2.025;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,274:544:99:11163,0,10896
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chr3	3421813	.	T	C	9320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=-0.893;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.856;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,239:544:99:9349,0,12443
chr3	3421831	.	T	C	9673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.064;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.761;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,248:565:99:9702,0,12747
chr3	3421846	.	C	T	9677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=1.925;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.115;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,249:554:99:9706,0,11884
chr3	3422017	.	C	A	11949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.353;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.559;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,310:625:99:11978,0,12076
chr3	3422034	.	C	T	13268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.284;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.371;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,330:657:99:13297,0,13124
chr3	3422055	.	G	A	13533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.080;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.352;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.678;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,335:661:99:13562,0,13022
chr3	3422063	.	T	C	13869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.420;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-2.135;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,340:677:99:13898,0,13583
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chr3	3422096	.	G	A	9778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.322;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=12.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-1.146;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.010;SOR=1.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,326:643:99:9807,0,12874
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chr3	3422861	.	A	C	10624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.342;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.934;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,264:571:99:10653,0,12654
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chr3	3422989	.	A	G	11094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.203;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.162;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,270:521:99:11123,0,10233
chr3	3423000	.	T	G	11284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.230;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.839;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.862;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,279:528:99:11313,0,10008
chr3	3423012	.	T	G	11869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.505;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.479;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,288:549:99:11898,0,10593
chr3	3423031	.	T	C	10885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.912;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.697;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.612;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,270:551:99:10914,0,11499
chr3	3423039	.	GA	G	11072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=2.566;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.523;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,273:563:99:11110,0,11695
chr3	3423051	.	G	A	11165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.649;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.585;QD=18.89;ReadPosRankSum=-5.947;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,299:591:99:11194,0,11152
chr3	3423094	.	G	A	11487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-1.048;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=7.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.228;QD=24.92;ReadPosRankSum=-2.365;SOR=0.343	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,297:461:99:11516,0,6392
chr3	3423108	.	C	T	12096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=-0.996;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.438;QD=24.49;ReadPosRankSum=-4.665;SOR=0.459	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,288:494:99:12125,0,7852
chr3	3423112	.	A	G	12242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.583;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.525;QD=24.83;ReadPosRankSum=-5.234;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,281:493:99:12271,0,8101
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chr3	3423836	.	T	C	10349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=-1.078;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.059;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,355:670:99:10378,0,9503
chr3	3423863	.	T	TTCAG	10509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=-0.786;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.506;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,307:589:99:10547,0,10826
chr3	3423878	.	G	A	13230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=2.353;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.001;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,324:615:99:13259,0,11581
chr3	3423879	.	T	C	13068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.080;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.103;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,319:607:99:13097,0,11489
chr3	3423893	.	T	A	9921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;ClippingRankSum=-0.986;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.409;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,300:572:99:9950,0,10803
chr3	3423898	.	T	G	11685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=-0.227;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.010;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.147;SOR=1.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,299:565:99:11714,0,10188
chr3	3423945	.	T	C	10620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.618;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.947;QD=23.34;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,268:455:99:10649,0,6574
chr3	3423960	.	A	C	8424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.595;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.378;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.300;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,254:391:99:8453,0,5304
chr3	3423961	.	A	G	8433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.310;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.536;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,249:381:99:8462,0,5202
chr3	3423962	.	T	C	8451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=1.407;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.035;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,248:378:99:8480,0,4971
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chr3	3424342	.	C	T	10473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.239;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.194;QD=21.33;ReadPosRankSum=-2.320;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,267:491:99:10502,0,8269
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chr3	3428756	.	T	C	9043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=-0.849;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.330;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.935;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,283:577:99:9072,0,8957
chr3	3429075	.	G	GGTGTAGAAGAA	8267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.435;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.034;QD=21.59;ReadPosRankSum=-4.434;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,206:383:99:8305,0,6754
chr3	3429128	.	TA	T	4625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.679;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.849;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,125:277:99:4663,0,5969
chr3	3429133	.	TAAAA	T	4636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.757;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.054;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,130:296:99:4674,0,6377
chr3	3429177	.	G	A	4702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.767;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.504;QD=16.00;ReadPosRankSum=-1.494;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,124:294:99:4731,0,6731
chr3	3429201	.	G	A	6102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-1.537;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.883;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.753;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,159:388:99:6131,0,9414
chr3	3429205	.	T	TAAAA	6392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=-0.714;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=2.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.217;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.680;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,161:390:99:6430,0,9563
chr3	3429214	.	A	T	6468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;ClippingRankSum=0.875;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.375;QD=15.40;ReadPosRankSum=-2.237;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,179:420:99:6497,0,9272
chr3	3429242	.	A	G	4609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.121;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.686;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,185:433:99:4638,0,7645
chr3	3429283	.	C	T	11580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.269;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.455;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,290:502:99:11609,0,8174
chr3	3429287	.	GT	G	3608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.344;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.088;QD=8.18;ReadPosRankSum=3.928;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,199:441:99:3646,0,9525
chr3	3429304	.	A	G	11629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.244;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.654;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,289:515:99:11658,0,8587
chr3	3429398	.	T	C	9058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.264;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.372;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,243:572:99:9087,0,18358
chr3	3429410	.	A	T	9237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.495;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.691;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,248:565:99:9266,0,18118
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chr3	3430039	.	C	T	11891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=1.145;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.345;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,308:585:99:11920,0,10433
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chr3	3435108	.	G	A	7143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.248;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.766;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,230:499:99:7172,0,8533
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chr3	3435197	.	C	T	11233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.401;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.770;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,301:630:99:11262,0,12652
chr3	3435482	.	C	T	10473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-1.078;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.948;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.222;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,343:684:99:10502,0,10698
chr3	3435718	.	G	C	8649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.334;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.224;QD=18.52;ReadPosRankSum=2.576;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,227:467:99:8678,0,9132
chr3	3435732	.	T	C	9048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-0.438;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.586;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,235:465:99:9077,0,9015
chr3	3435780	.	C	T	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=1.644;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.516;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,244:493:99:9040,0,9389
chr3	3435798	.	G	A	9055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.978;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.478;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,239:492:99:9084,0,9581
chr3	3435939	.	C	T	10980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=2.522;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.677;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,285:569:99:11009,0,15260
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chr3	3447331	.	C	T	17456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=2.732;DP=1813;ExcessHet=3.0103;FS=3.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.625;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1168,496:1664:99:17485,0,57315
chr3	3447334	.	T	C	17613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.651;DP=1834;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.712;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1182,507:1689:99:17642,0,56652
chr3	3447359	.	C	G	64414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.744;DP=1941;ExcessHet=3.0103;FS=0.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.958;QD=29.24;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,1535:1834:99:64443,0,13259
chr3	3447373	.	C	A	64341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.085;DP=1958;ExcessHet=3.0103;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.843;QD=34.74;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,1544:1852:99:64370,0,12503
chr3	3447402	.	A	G	39812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.343;DP=1869;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.348;QD=22.61;ReadPosRankSum=2.851;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:740,1021:1761:99:39841,0,32161
chr3	3454152	.	ATG	A	29690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.929;ClippingRankSum=0.707;DP=916;ExcessHet=3.0103;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.193;QD=34.73;ReadPosRankSum=2.850;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,705:855:99:29728,0,4221
chr3	3454175	.	A	G	24516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=-0.426;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.046;QD=34.19;ReadPosRankSum=0.560;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,583:717:99:24545,0,3791
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chr3	3469893	.	T	C	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-1.200;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-0.173;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.110;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,106:446:99:3410,0,14133
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chr3	3470200	.	C	T	8250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.247;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.085;QD=14.35;ReadPosRankSum=-3.990;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,220:575:99:8279,0,14598
chr3	3470202	.	A	G	8403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.010;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.738;QD=14.80;ReadPosRankSum=-4.124;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,222:568:99:8432,0,14245
chr3	3470204	.	G	A	8593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-0.078;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.495;QD=15.43;ReadPosRankSum=-3.388;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,217:557:99:8622,0,13810
chr3	3470215	.	C	T	8423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=-1.993;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.642;QD=16.23;ReadPosRankSum=-3.149;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,230:519:99:8452,0,11859
chr3	3474323	.	T	TTA	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.427;DP=850;ExcessHet=3.0103;FS=9.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-1.770;QD=0.55;ReadPosRankSum=-5.321;SOR=5.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:582,28:610:99:372,0,24331
chr3	3474491	.	T	C	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=1.028;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=109.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-7.799;QD=9.14;ReadPosRankSum=-2.056;SOR=2.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,70:257:99:2376,0,7355
chr3	3474503	.	ATGTTTTTTATTATTATTATTATTAT	A	3378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.665;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=78.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-6.017;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=2.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,86:307:99:3416,0,9213
chr3	3474536	.	A	T	3934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.186;ClippingRankSum=1.184;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=18.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-3.969;QD=16.39;ReadPosRankSum=3.374;SOR=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,94:240:99:3963,0,5898
chr3	3474539	.	C	T	3970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=-0.898;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=17.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=-4.794;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.080;SOR=1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,102:243:99:3999,0,5979
chr3	3474551	.	T	C	4546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.414;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-1.225;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.695;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,114:253:99:4575,0,5520
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chr3	3476928	.	T	A	24164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-1.683;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=0.343;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.389;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,574:576:99:24193,1720,0
chr3	3476929	.	T	C	10981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-0.230;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.930;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,277:581:99:11010,0,12325
chr3	3476941	.	T	C	10518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.468;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.207;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,276:576:99:10547,0,11403
chr3	3476956	.	GA	G	5586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-0.407;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.747;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.272;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,260:541:99:5624,0,6316
chr3	3477068	.	A	G	10490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.534;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.486;QD=15.18;ReadPosRankSum=2.204;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,345:691:99:10519,0,10455
chr3	3477467	.	A	T	12333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.159;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.734;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,320:647:99:12362,0,13364
chr3	3477475	.	C	T	12300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=2.382;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.476;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,318:637:99:12329,0,13068
chr3	3478282	.	A	C	21977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.167;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.176;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.891;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,591:593:99:22006,1726,0
chr3	3478431	.	A	G	7824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.020;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.903;QD=14.74;ReadPosRankSum=2.876;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,254:531:99:7853,0,8413
chr3	3478468	.	A	G	9450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.654;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.578;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,255:561:99:9479,0,11865
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chr3	3481286	.	G	A	9719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-1.026;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.347;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,255:567:99:9748,0,12257
chr3	3481420	.	CAT	C	4920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=0.279;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.515;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.008;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,230:521:99:4958,0,11502
chr3	3481426	.	T	A	4954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.687;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.754;QD=8.94;ReadPosRankSum=5.185;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,236:554:99:4983,0,11868
chr3	3481485	.	G	C	10738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=-0.238;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.983;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.353;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,285:555:99:10767,0,10171
chr3	3481505	.	C	T	10599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.057;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.092;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,284:557:99:10628,0,10086
chr3	3481559	.	G	T	11432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=-0.178;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.232;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,293:565:99:11461,0,10367
chr3	3481579	.	C	T	12137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-1.217;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.277;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,323:617:99:12166,0,11040
chr3	3481615	.	G	A	12110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.951;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.775;QD=18.49;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,316:655:99:12139,0,13347
chr3	3481622	.	T	C	12104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=2.283;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.501;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,305:646:99:12133,0,13689
chr3	3481624	.	T	C	12177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.081;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.817;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,305:649:99:12206,0,13775
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chr4	58540	.	T	C	9192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.256;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.995;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,296:585:99:9221,0,11040
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chr4	59160	.	T	G	9538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.501;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.848;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,307:596:99:9567,0,9501
chr4	59901	.	A	G	10231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.381;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.410;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,334:599:99:10260,0,8094
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chr4	70828	.	G	T	9477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-0.931;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.132;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,251:496:99:9506,0,9017
chr4	70842	.	A	G	9552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.184;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.666;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,251:502:99:9581,0,9347
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chr4	77634	.	A	AGAG	9150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.168;ClippingRankSum=0.332;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.355;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,234:527:99:9188,0,11496
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chr4	77813	.	C	T	8570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=2.053;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=5.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.577;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,223:480:99:8599,0,10174
chr4	77817	.	A	G	8672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-1.143;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=8.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.413;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.363	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,223:481:99:8701,0,10165
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chr4	103706	.	G	A	9679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=1.554;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.518;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,251:476:99:9708,0,8387
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chr4	131069	.	C	T	10884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.923;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.443;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,285:590:99:10913,0,11988
chr4	131078	.	T	C	11016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.819;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.208;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,291:608:99:11045,0,12208
chr4	131173	.	T	C	10504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.010;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=4.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.983;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,270:512:99:10533,0,9104
chr4	131182	.	A	C	10263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=-0.012;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.500;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,260:491:99:10292,0,8628
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chr4	141437	.	A	T	9171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=2.200;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=7.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.673;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.047;SOR=1.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,287:537:99:9200,0,7508
chr4	141605	.	A	G	12265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.365;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.633;QD=21.59;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,310:568:99:12294,0,9895
chr4	141614	.	C	T	12720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.069;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.148;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,327:586:99:12749,0,9931
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chr4	146747	.	C	T	8224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-0.044;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.307;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,207:425:99:8253,0,8973
chr4	146763	.	G	C	7111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.393;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=9.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.900;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,185:389:99:7140,0,8076
chr4	146799	.	C	T	8241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=1.358;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.146;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,216:431:99:8270,0,8236
chr4	146809	.	AT	A	7916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.116;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.122;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,208:430:99:7954,0,8376
chr4	147165	.	T	C	8416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.863;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.020;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,271:566:99:8445,0,11645
chr4	147168	.	T	A	8413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.803;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.255;QD=15.00;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,268:561:99:8442,0,11624
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chr4	147226	.	GACTATTCCTGCACATTTTATTTCATGTTAA	G	9663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.719;ClippingRankSum=-2.058;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.715;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.959;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,248:575:99:9701,0,13074
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chr4	151503	.	A	AGGTT	13179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.558;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQRankSum=-11.093;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,329:606:99:13217,0,11124
chr4	151505	.	A	AG	13516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.645;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQRankSum=-10.009;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,322:605:99:13554,0,11142
chr4	151514	.	AT	A	13270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=1.314;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-10.177;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,331:607:99:13308,0,11076
chr4	151517	.	T	G	13034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=1.324;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-9.607;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,323:597:99:13063,0,11010
chr4	151521	.	A	G	13147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.768;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQRankSum=-10.256;QD=22.02;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,323:597:99:13176,0,10836
chr4	151524	.	GTTAATAT	G	12718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-2.249;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQRankSum=-9.560;QD=20.38;ReadPosRankSum=-2.438;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,324:624:99:12756,0,12036
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chr4	153659	.	C	G	11477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=1.392;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.142;QD=22.20;ReadPosRankSum=1.743;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,294:517:99:11506,0,8426
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chr4	159261	.	A	G	7478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.156;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.533;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,190:408:99:7507,0,8728
chr4	159278	.	A	AAG	7275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.160;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=6.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.495;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=0.411	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,189:406:99:7313,0,8649
chr4	159630	.	CAGGGTGCGCTAAGGAGGTT	C	6474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.985;ClippingRankSum=1.892;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=25.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=1.105;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.126;SOR=1.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,172:383:99:6512,0,8120
chr4	159677	.	T	C	7363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-0.648;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.183;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,196:421:99:7392,0,8790
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chr4	160222	.	GTACTTTTTTACTTTTTACTTCT	G	7952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-1.036;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.995;QD=15.18;ReadPosRankSum=4.189;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,213:524:99:7990,0,11938
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chr4	163330	.	T	C	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.551;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.878;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,258:499:99:10167,0,9449
chr4	163332	.	T	C	10219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-1.188;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.596;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,255:496:99:10248,0,9485
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chr4	168387	.	A	T	8112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.006;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-1.544;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.933;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,245:483:99:8141,0,7569
chr4	168404	.	C	G	7768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.328;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-3.722;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,209:450:99:7797,0,9777
chr4	168410	.	TC	T	7588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=-0.275;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-2.656;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.600;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,199:448:99:7626,0,9971
chr4	168416	.	T	C	7168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.149;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-4.181;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,167:417:99:7197,0,10177
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chr4	175229	.	A	G	9189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.414;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.139;QD=19.23;ReadPosRankSum=3.204;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,232:478:99:9218,0,9924
chr4	175235	.	A	G	9183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-2.521;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.049;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.947;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,239:490:99:9212,0,9835
chr4	175268	.	G	A	8734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=1.297;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.764;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,226:471:99:8763,0,9701
chr4	175275	.	G	A	8858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.753;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.803;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,230:491:99:8887,0,10031
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chr4	181124	.	G	A	8898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.235;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.623;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,229:456:99:8927,0,8881
chr4	181125	.	A	C	8898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.571;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.059;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,228:458:99:8927,0,8881
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chr4	186655	.	T	G	3497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.004;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=0.276;QD=15.34;ReadPosRankSum=7.214;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,149:228:99:3526,0,2487
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chr4	213018	.	C	T	7932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.345;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.872;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,214:445:99:7961,0,9001
chr4	213027	.	T	C	7900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.788;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.812;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,206:437:99:7929,0,8972
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chr4	224533	.	A	G	9538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=1.440;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.540;QD=18.10;ReadPosRankSum=-4.174;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,256:527:99:9567,0,10099
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chr4	230789	.	T	C	12307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.120;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.071;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,304:571:99:12336,0,10499
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chr4	236507	.	A	G	8929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-1.105;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.751;QD=18.15;ReadPosRankSum=2.191;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,234:492:99:8958,0,10178
chr4	236515	.	TC	T	9459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.565;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.513;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,241:509:99:9497,0,10611
chr4	236517	.	C	A	9334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.196;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.746;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.421;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,244:508:99:9363,0,10510
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chr4	242369	.	T	C	11566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;ClippingRankSum=-1.803;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.445;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,298:576:99:11595,0,14054
chr4	242374	.	T	C	11483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.138;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.259;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,294:566:99:11512,0,14029
chr4	242620	.	C	T	8538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-0.584;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.111;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,279:547:99:8567,0,10012
chr4	244781	.	G	T	7998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=-2.030;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=8.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.432;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,266:495:99:8027,0,7202
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chr4	270437	.	C	A	8823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.136;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.555;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,296:596:99:8852,0,11199
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chr4	313973	.	C	T	5904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.118;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.984;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:172,186:358:99:5933,0,5215
chr4	314991	.	A	G	8828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.701;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.630;QD=18.39;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,228:480:99:8857,0,9866
chr4	315001	.	T	C	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=-0.689;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.525;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,234:495:99:9241,0,10414
chr4	315014	.	C	T	8757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.605;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.897;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,228:499:99:8786,0,10572
chr4	315228	.	A	G	7616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-0.228;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.229;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,240:496:99:7645,0,8440
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chr4	317700	.	G	T	6247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.261;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.021;QD=21.69;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,159:288:99:6276,0,4985
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chr4	327909	.	G	A	10659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=1.353;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.042;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.412;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,275:563:99:10688,0,11032
chr4	327986	.	G	T	6885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.711;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.975;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,245:549:99:6914,0,9314
chr4	328350	.	G	C	8591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.220;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.638;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,271:540:99:8620,0,8661
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chr4	328424	.	CAAAAATCATATA	C	8604.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=1.138;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.621;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,230:516:99:8642,0,11097
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chr4	337927	.	T	G	9232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.040;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.234;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.213;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,239:473:99:9261,0,9314
chr4	337935	.	G	A	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.507;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.101;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,238:470:99:9356,0,8875
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chr4	345886	.	C	T	9992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.356;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.730;QD=15.79;ReadPosRankSum=2.562;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,326:633:99:10021,0,9234
chr4	364762	.	A	C	23617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=35.26;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,631:631:99:23646,1895,0
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chr4	401189	.	G	A	8590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=-1.813;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.314;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,284:600:99:8619,0,10147
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chr4	409651	.	C	T	11077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.424;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.257;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.409;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,294:587:99:11106,0,11066
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chr4	435969	.	G	T	13856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=9.195;ClippingRankSum=-0.611;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=94.402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQRankSum=0.198;QD=28.51;ReadPosRankSum=-2.627;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:67,419:486:99:13885,614,0
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chr4	441812	.	T	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=1.770;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.294;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,58:199:99:1932,0,5398
chr4	441825	.	T	C	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.118;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=3.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.074;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.970	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:140,62:202:99:2150,0,5412
chr4	441862	.	C	G	5126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=1.736;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=6.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.980;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,162:258:99:5155,0,2584
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chr4	486676	.	T	A	8175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.733;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.187;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,264:523:99:8204,0,10071
chr4	486679	.	C	T	10517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=-0.348;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.974;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,269:518:99:10546,0,9913
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chr4	496570	.	T	C	7844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.287;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.336;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,245:508:99:7873,0,8560
chr4	496586	.	C	T	8150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=1.398;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.322;QD=16.11;ReadPosRankSum=2.538;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,253:506:99:8179,0,8100
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chr4	503867	.	T	C	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.019;ClippingRankSum=-0.840;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-4.834;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,253:556:99:10167,0,12597
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chr4	513209	.	C	T	10573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.804;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.318;QD=18.65;ReadPosRankSum=-2.678;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,282:567:99:10602,0,11262
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chr4	569656	.	T	G	11122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.240;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.772;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,299:638:99:11151,0,13094
chr4	569666	.	GC	G	11574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.957;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.474;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,295:644:99:11612,0,14094
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chr4	645009	.	T	C	21351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.460;DP=1139;ExcessHet=3.0103;FS=48.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQRankSum=-14.864;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=2.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:547,536:1083:99:21380,0,22134
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chr4	654192	.	T	A	9927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.478;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.299;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.343;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,255:502:99:9956,0,9651
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chr4	685172	.	G	A	9033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-2.085;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.839;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,305:609:99:9062,0,9162
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chr4	710478	.	T	C	8308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.030;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.141;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,222:439:99:8337,0,8089
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chr4	731283	.	C	T	7883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-1.278;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.200;QD=17.29;ReadPosRankSum=2.436;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,247:456:99:7912,0,6423
chr4	731300	.	C	T	7633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-2.622;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.029;QD=16.63;ReadPosRankSum=2.080;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,237:459:99:7662,0,7088
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chr4	736647	.	G	A	10464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=1.536;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.057;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,264:510:99:10493,0,9661
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chr4	747021	.	G	A	3390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.590;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=1.542;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,102:193:99:3419,0,2914
chr4	747441	.	A	G	7639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-0.695;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.898;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,245:482:99:7668,0,7291
chr4	747629	.	A	G	8469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.537;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.010;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,221:441:99:8498,0,8910
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chr4	810089	.	A	T	8273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.152;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.855;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,219:456:99:8302,0,9169
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chr4	830420	.	A	G	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-0.408;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.374;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,273:561:99:10550,0,11393
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chr4	862575	.	TAAATTGTTTTTATTCCTCCAACCA	T	9716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-0.192;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.525;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,262:597:99:9754,0,13126
chr4	864611	.	T	A	7958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-2.528;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.654;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,259:494:99:7987,0,7222
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chr4	872180	.	G	A	9413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-2.385;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.514;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,245:556:99:9442,0,11717
chr4	872226	.	A	G	10215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.621;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.225;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,270:592:99:10244,0,12441
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chr4	917706	.	A	G	9310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-2.677;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.389;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,253:516:99:9339,0,9934
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chr4	956744	.	A	T	10911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.314;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.677;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.127;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,278:559:99:10940,0,11126
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chr4	958283	.	A	G	10134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.754;ClippingRankSum=-0.988;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.507;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,262:552:99:10163,0,18496
chr4	958289	.	G	A	10098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.431;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.073;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,260:550:99:10127,0,18596
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chr4	964080	.	A	G	9994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.944;ClippingRankSum=-1.988;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.915;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.935;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,246:567:99:10023,0,13022
chr4	964083	.	A	G	9661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.330;ClippingRankSum=1.090;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=1.550;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.013;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,244:556:99:9690,0,12840
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chr4	984529	.	C	T	12274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.092;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-5.263;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,324:683:99:12303,0,14114
chr4	984588	.	A	G	11743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=2.091;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.935;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,376:696:99:11772,0,9675
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chr4	994361	.	CA	C	5753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.582;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.655;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,220:405:99:5791,0,4649
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chr4	1103653	.	G	A	11275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.269;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.579;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,296:602:99:11304,0,11896
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chr4	1103977	.	G	A	10941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.151;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.228;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.502;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,289:564:99:10970,0,10289
chr4	1104058	.	T	C	11120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-1.808;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.273;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,284:566:99:11149,0,10957
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chr4	1109279	.	C	G	11290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.960;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=2.361;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,273:581:99:11319,0,12264
chr4	1109293	.	T	C	11602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.719;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.982;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.319;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,283:584:99:11631,0,12576
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chr4	1113479	.	A	G	11137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.988;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.030;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,278:579:99:11166,0,12066
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chr4	1116490	.	G	A	10670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.282;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.448;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,277:542:99:10699,0,10363
chr4	1116517	.	T	C	10603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.961;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.677;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,270:522:99:10632,0,9671
chr4	1116524	.	A	G	10691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.391;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.445;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,270:525:99:10720,0,10254
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chr4	1119406	.	G	A	10184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.933;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.092;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,268:537:99:10213,0,15593
chr4	1119522	.	T	C	7928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-3.007;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.883;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,256:501:99:7957,0,7693
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chr4	1123667	.	G	T	12001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.273;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.733;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.137;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,305:563:99:12030,0,9864
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chr4	1132424	.	G	A	7753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.599;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.178;QD=14.57;ReadPosRankSum=2.178;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,246:532:99:7782,0,9219
chr4	1132493	.	ATT	A	8796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-1.163;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.526;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,225:522:99:8834,0,11760
chr4	1132496	.	A	AAT	8796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.961;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.153;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,229:523:99:8834,0,11760
chr4	1132581	.	T	TATC	9675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.085;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.610;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,252:504:99:9713,0,9721
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chr4	1136621	.	G	T	3775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.498;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.187;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,195:461:99:3813,0,7815
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chr4	1141548	.	A	G	9381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.613;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.451;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,244:548:99:9410,0,12059
chr4	1141557	.	G	A	9693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.953;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.739;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,255:561:99:9722,0,12299
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chr4	1144134	.	C	G	9047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.151;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.463;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,239:481:99:9076,0,9165
chr4	1144153	.	A	G	9607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.685;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.929;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.960;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,263:518:99:9636,0,9311
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chr4	1148935	.	A	AT	9038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=-1.326;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.390;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.159;SOR=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,227:512:99:9076,0,11506
chr4	1148942	.	G	A	8909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.363;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=5.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.011;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,228:515:99:8938,0,11683
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chr4	1151967	.	A	C	9652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.050;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.349;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,245:486:99:9681,0,9199
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chr4	1154330	.	T	C	6240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=-0.463;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.799;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,200:432:99:6269,0,7065
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chr4	1154376	.	T	A	9101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.418;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.942;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,231:479:99:9130,0,10136
chr4	1154390	.	T	A	8964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=1.523;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.960;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,238:484:99:8993,0,9506
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chr4	1160173	.	G	T	7614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.557;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.055;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.744;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,254:516:99:7643,0,8124
chr4	1160320	.	G	T	9020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.045;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.337;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,301:589:99:9049,0,8666
chr4	1160347	.	G	A	11732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.248;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=3.662;QD=19.69;ReadPosRankSum=2.112;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,304:596:99:11761,0,11305
chr4	1160348	.	A	G	11732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=1.164;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-1.886;QD=19.79;ReadPosRankSum=2.394;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,300:593:99:11761,0,11305
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chr4	1161547	.	C	G	8306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=-0.053;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.213;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,277:516:99:8335,0,7485
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chr4	1163199	.	G	A	8932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.193;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.515;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,238:513:99:8961,0,10560
chr4	1163212	.	C	T	9454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.182;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.274;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.361;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,252:508:99:9483,0,9924
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chr4	1169634	.	A	G	9056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.783;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.645;QD=15.92;ReadPosRankSum=-3.845;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,294:569:99:9085,0,8477
chr4	1169802	.	T	C	8952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.299;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.535;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,283:575:99:8981,0,8844
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chr4	1171443	.	T	A	9293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.780;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.726;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,229:431:99:9322,0,8145
chr4	1171458	.	A	T	8766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=1.527;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.518;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,232:450:99:8795,0,8242
chr4	1171614	.	A	G	9455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=-0.945;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.634;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,245:521:99:9484,0,10772
chr4	1171626	.	T	G	10021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.283;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.542;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,250:533:99:10050,0,11407
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chr4	1175933	.	G	T	8186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=1.883;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.349;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,215:413:99:8215,0,7387
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chr4	1178975	.	A	G	12044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=-2.029;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-6.048;QD=20.35;ReadPosRankSum=-5.810;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,279:592:99:12073,0,12708
chr4	1178997	.	GGT	G	12640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.662;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.207;QD=20.76;ReadPosRankSum=-6.150;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,316:609:99:12678,0,11958
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chr4	1179005	.	T	G	13383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.090;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-3.379;QD=21.90;ReadPosRankSum=-5.588;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,329:611:99:13412,0,11531
chr4	1179336	.	A	C	7111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=-0.534;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.327;QD=14.69;ReadPosRankSum=-2.027;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,239:484:99:7140,0,7767
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chr4	1183875	.	C	T	9260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.302;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=10.326;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.659;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,248:529:99:9289,0,11333
chr4	1183887	.	TTCTGCTCATTAC	T	7038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.358;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=-13.100;QD=14.08;ReadPosRankSum=6.529;SOR=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,200:500:99:7076,0,11983
chr4	1183945	.	T	C	8447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=2.395;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-4.577;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,238:507:99:8476,0,10208
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chr4	1186132	.	C	A	7210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=-0.593;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.930;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,191:409:99:7239,0,8372
chr4	1186158	.	C	CTGTA	7947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=-0.190;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.479;QD=18.74;ReadPosRankSum=-2.604;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,196:424:99:7985,0,8810
chr4	1186169	.	C	G	8005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.105;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.010;QD=17.83;ReadPosRankSum=-2.357;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,211:449:99:8034,0,9303
chr4	1186176	.	G	A	8046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=-0.030;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.627;QD=18.33;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,203:439:99:8075,0,9526
chr4	1186181	.	G	T	8075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.508;ClippingRankSum=-0.854;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.498;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,209:452:99:8104,0,9808
chr4	1186184	.	A	C	7856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=-0.907;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.092;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,201:439:99:7885,0,9732
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chr4	1188852	.	A	T	9840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.129;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.563;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,252:526:99:9869,0,11074
chr4	1188867	.	T	C	9400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=1.078;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.892;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,239:503:99:9429,0,10777
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chr4	1198650	.	T	A	7535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.192;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.913;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,202:488:99:7564,0,11273
chr4	1198654	.	G	A	7689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-1.350;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.071;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,199:475:99:7718,0,11503
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chr4	1200439	.	T	C	9538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.602;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=2.446;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.677;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,243:529:99:9567,0,11507
chr4	1200443	.	A	G	9396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.809;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.074;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.511;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,243:532:99:9425,0,11342
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chr4	1207724	.	A	G	9441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.677;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.151;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,241:479:99:9470,0,9243
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chr4	1211267	.	C	A	11006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.023;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.032;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,289:581:99:11035,0,11279
chr4	1211277	.	A	G	11663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=1.032;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.866;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,295:593:99:11692,0,11793
chr4	1211297	.	T	C	11765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-0.028;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.198;QD=20.82;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,289:565:99:11794,0,11394
chr4	1211320	.	T	C	10559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.304;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.433;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,261:515:99:10588,0,10228
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chr4	1213531	.	TCCCACCGTGTACGATTACCTAATCGTGCATC	T	9657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;ClippingRankSum=0.024;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-1.050;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,242:544:99:9695,0,12131
chr4	1213583	.	A	G	8909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=-0.811;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=1.978;QD=19.71;ReadPosRankSum=-4.368;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,231:452:99:8938,0,8157
chr4	1213613	.	C	A	8467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=-0.783;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.002;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,222:435:99:8496,0,8189
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chr4	1215713	.	A	G	10175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=-0.741;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.026;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,263:534:99:10204,0,10484
chr4	1215774	.	G	A	8394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=-0.750;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.689;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,275:553:99:8423,0,8804
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chr4	1217596	.	T	C	9452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.629;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.986;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,246:516:99:9481,0,10863
chr4	1217666	.	G	C	7740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.039;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.937;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,245:505:99:7769,0,7880
chr4	1217691	.	G	GCT	10018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.966;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.217;QD=20.83;ReadPosRankSum=-2.034;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,245:481:99:10056,0,9285
chr4	1217694	.	GAA	G	10071.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.299;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.119;QD=20.02;ReadPosRankSum=-2.122;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,257:503:99:10109,0,9590
chr4	1217697	.	A	G	10050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=1.128;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.959;QD=20.06;ReadPosRankSum=-2.330;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,258:501:99:10079,0,9467
chr4	1217731	.	C	G	8370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.236;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.062;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,219:462:99:8399,0,9360
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chr4	1220600	.	T	C	12440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=1.115;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.183;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,311:604:99:12469,0,11858
chr4	1220607	.	A	G	11814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.302;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.729;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,304:596:99:11843,0,11346
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chr4	1225639	.	A	G	8578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.698;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.921;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,224:468:99:8607,0,9643
chr4	1225685	.	C	T	7188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.292;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.294;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,223:465:99:7217,0,7697
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chr4	1228475	.	T	C	5811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.493;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,187:383:99:5840,0,6176
chr4	1228494	.	T	A	5617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=2.336;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.374;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,188:377:99:5646,0,5898
chr4	1228641	.	A	T	7830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-1.292;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.821;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,204:440:99:7859,0,13795
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chr4	1236246	.	G	A	10595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.248;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.207;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,270:517:99:10624,0,9495
chr4	1236854	.	G	A	7232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.780;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.008;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,230:445:99:7261,0,6718
chr4	1236888	.	A	C	7586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.952;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.303;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,196:411:99:7615,0,8439
chr4	1236889	.	T	C	7586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.113;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.850;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,199:414:99:7615,0,8439
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chr4	1240946	.	A	G	8607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.101;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.104;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,227:470:99:8636,0,9844
chr4	1240970	.	C	G	8463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-2.062;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.185;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,223:449:99:8492,0,9224
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chr4	1248430	.	C	G	4371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.122;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.578;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.528;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,148:341:99:4400,0,5828
chr4	1248995	.	G	C	5627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-0.454;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.395;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.626;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,186:385:99:5656,0,6370
chr4	1249006	.	AGGAGGTAGAAAT	A	7021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-1.156;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.677;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,185:413:99:7059,0,8919
chr4	1249928	.	G	T	9889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.335;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-1.525;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,261:563:99:9918,0,12077
chr4	1249941	.	ACG	A	10960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.147;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=0.410;QD=18.15;ReadPosRankSum=-3.882;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,275:604:99:10998,0,13361
chr4	1249945	.	GAATGT	G	10957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=-0.547;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.867;QD=17.73;ReadPosRankSum=-5.287;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,278:618:99:10995,0,13868
chr4	1249954	.	A	G	10732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.081;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.566;QD=17.83;ReadPosRankSum=-9.288;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,272:602:99:10761,0,13641
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chr4	1251886	.	A	G	10274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.059;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.565;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,268:524:99:10303,0,11992
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chr4	1258665	.	T	G	9411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=-0.139;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.338;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,239:504:99:9449,0,10710
chr4	1258668	.	G	C	9422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.146;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,238:502:99:9451,0,10936
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chr4	1266244	.	C	T	7924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.219;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.529;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,205:445:99:7953,0,9413
chr4	1266272	.	C	T	6674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.311;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.078;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,212:442:99:6703,0,7492
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chr4	1271930	.	C	G	7861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.665;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.499;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,203:435:99:7890,0,9171
chr4	1272074	.	T	C	7475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=1.264;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.870;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.697;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,241:465:99:7504,0,6614
chr4	1272247	.	CG	C	7106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=1.990;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.029;QD=15.45;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,230:460:99:7144,0,7076
chr4	1272638	.	A	G	6352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.554;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.995;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,199:409:99:6381,0,6846
chr4	1272919	.	T	C	8934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;ClippingRankSum=0.883;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.340;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,237:505:99:8963,0,12127
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chr4	1274668	.	G	A	7443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.665;ClippingRankSum=-0.934;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=6.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.156;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,200:395:99:7472,0,7410
chr4	1274682	.	C	G	8052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.032;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=11.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.384;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,204:389:99:8081,0,7632
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chr4	1279653	.	T	C	11236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.806;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=1.690;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,283:513:99:11265,0,8767
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chr4	1279768	.	A	G	6762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=1.436;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.212;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,179:398:99:6791,0,8514
chr4	1279769	.	C	G	6762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.791;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.624;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,179:398:99:6791,0,8514
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chr4	1281828	.	T	C	7528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.598;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.813;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,205:481:99:7557,0,10714
chr4	1281847	.	T	C	7815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.395;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.376;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,214:486:99:7844,0,10482
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chr4	1285046	.	A	C	7880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=-0.342;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=11.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.337;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=1.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,244:521:99:7909,0,8748
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chr4	1285183	.	C	T	16395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=1.226;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQRankSum=1.847;QD=27.01;ReadPosRankSum=-4.147;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,410:607:99:16424,0,7018
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chr4	1293889	.	C	T	9379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.279;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.147;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.089;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,244:503:99:9408,0,10166
chr4	1293927	.	A	G	9976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.440;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,266:526:99:10005,0,9881
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chr4	1295239	.	T	C	8145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.641;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.913;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,198:411:99:8174,0,8393
chr4	1295243	.	C	T	7767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.616;ClippingRankSum=0.907;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.834;QD=19.62;ReadPosRankSum=-2.071;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,194:396:99:7796,0,8118
chr4	1295249	.	G	T	7450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-0.453;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.461;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.814;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,186:382:99:7479,0,7846
chr4	1295464	.	C	T	9344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-0.787;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.917;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,285:575:99:9373,0,10760
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chr4	1299545	.	G	A	9894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=1.427;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.225;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,250:484:99:9923,0,9430
chr4	1299558	.	C	T	10449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-2.211;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.160;QD=20.61;ReadPosRankSum=-1.578;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,263:507:99:10478,0,9626
chr4	1299562	.	G	GA	10111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.397;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.036;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.219;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,253:497:99:10149,0,9541
chr4	1299611	.	T	A	9001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=-0.964;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.501;QD=17.69;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,238:509:99:9030,0,10603
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chr4	1303919	.	C	T	9907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=-1.050;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.234;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,253:542:99:9936,0,11224
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chr4	1310807	.	G	A	10928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-0.905;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.814;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,289:603:99:10957,0,12223
chr4	1310869	.	C	T	8940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.421;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.103;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,296:621:99:8969,0,9994
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chr4	1314183	.	C	T	10903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.654;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.128;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,275:587:99:10932,0,13002
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chr4	1314194	.	A	G	10668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.900;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.592;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.781;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,264:578:99:10697,0,12715
chr4	1314200	.	C	T	10801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.394;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.677;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,271:585:99:10830,0,12642
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chr4	1316846	.	T	C	11172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.363;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.021;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,287:577:99:11201,0,11297
chr4	1316847	.	A	G	11172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.511;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.968;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,290:580:99:11201,0,11297
chr4	1317414	.	G	T	4838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-0.833;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=0.793;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.461;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,157:414:99:4867,0,14402
chr4	1317476	.	A	G	4812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.455;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=11.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=0.623;QD=13.26;ReadPosRankSum=-2.141;SOR=1.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,146:363:99:4841,0,19680
chr4	1317510	.	A	ATGTGTCAATTCCATTTAATATAAATAGAGGTCCTTACCCTCTGGTAATGAGAGAAGGATGGAAAGAAATC	2430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=1.333;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=15.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-0.109;QD=12.47;ReadPosRankSum=-11.752;SOR=2.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,83:195:99:2468,0,11751
chr4	1319614	.	TGTC	T	9765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.268;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.529;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,257:530:99:9803,0,10559
chr4	1319736	.	C	T	8093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-0.185;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.571;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,261:534:99:8122,0,8813
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chr4	1326854	.	T	C	8266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=2.041;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.183;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,272:552:99:8295,0,9016
chr4	1327271	.	G	A	7639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.464;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.224;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,258:486:99:7668,0,7911
chr4	1327337	.	GCCTAAAGCAGGCAGTGGTGCACCTAAAGCAGGCAGTGGTGCACCTAAAGCAGGCAGTGGTGCACCTAAAGCAGGCAGTGGTGCA	G,GCCTAAAGCAGGCAGTGGTGCACCTAAAGCAGGCAGTGGTGCACCTAAAGCAGGCAGTGGTGCA	8077.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.09;QD=34.82;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,203,29:232:99:8115,1005,14554,7217,0,7058
chr4	1327512	.	A	G	7650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-0.184;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.882;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,244:534:99:7679,0,9535
chr4	1328479	.	C	T	12004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.924;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.740;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,314:650:99:12033,0,13001
chr4	1328484	.	C	G	12267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.095;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.390;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,321:656:99:12296,0,12993
chr4	1328832	.	ACTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGACAGCAAACAATTTGCAGAAGCAGCGTCAATATCAAG	A	3234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.508;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=4.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=3.792;QD=10.08;ReadPosRankSum=-5.459;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,94:321:99:3272,0,9107
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chr4	1437557	.	T	A	10051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.961;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.377;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,266:546:99:10080,0,10759
chr4	1437810	.	G	T	8851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-0.024;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.819;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.041;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,284:594:99:8880,0,9888
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chr4	1443441	.	C	T	16943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=-0.389;DP=810;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-3.102;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,414:791:99:16972,0,14992
chr4	1443445	.	A	G	16874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.119;ClippingRankSum=-1.982;DP=810;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-4.316;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,413:792:99:16903,0,15373
chr4	1443452	.	T	C	17105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.577;ClippingRankSum=0.497;DP=805;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-5.394;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.904;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,416:791:99:17134,0,15064
chr4	1443465	.	CATTGGAAAAATTAAAATAAGAGA	C	17110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.009;ClippingRankSum=0.031;DP=1041;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-0.384;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.628;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:547,446:993:99:17148,0,22460
chr4	1443492	.	GTAAATAATGGAATAAGAAGAGCAGTATAGACAATAAGAGTAGCAATA	G	13786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.766;ClippingRankSum=-0.914;DP=1049;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=-3.246;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.510;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:564,423:987:99:13824,0,22575
chr4	1443569	.	A	G	12414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=-1.185;DP=807;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=5.454;QD=15.73;ReadPosRankSum=7.913;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:409,380:789:99:12443,0,12784
chr4	1443604	.	A	G	3066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.742;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=2.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.009;QD=6.16;ReadPosRankSum=-3.478;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,123:498:99:3095,0,12482
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chr4	1447303	.	C	T	14078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.626;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=0.375;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,357:649:99:14107,0,11132
chr4	1449380	.	A	C	8811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-1.387;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.719;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.780;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,283:565:99:8840,0,8374
chr4	1449537	.	T	G	18570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=2.103;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQRankSum=-0.547;QD=30.35;ReadPosRankSum=-1.753;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,512:515:99:18599,1483,0
chr4	1449566	.	T	A	6887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.078;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=5.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.303;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.272;SOR=1.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,183:404:99:6916,0,8635
chr4	1449569	.	C	T	6840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.317;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=8.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=2.028;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,175:387:99:6869,0,8482
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chr4	1456044	.	C	A	11992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.563;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.799;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,321:609:99:12021,0,10860
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chr4	1465226	.	A	G	9297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.571;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.464;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,305:584:99:9326,0,8704
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chr4	1466315	.	G	C	4670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;ClippingRankSum=-0.099;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=4.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-4.565;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,209:519:99:4699,0,12886
chr4	1466344	.	T	C	9302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.942;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=2.201;QD=18.46;ReadPosRankSum=4.302;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,241:504:99:9331,0,10673
chr4	1466348	.	A	G	9359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.908;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=1.465;QD=17.97;ReadPosRankSum=4.001;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,241:521:99:9388,0,10778
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chr4	1472836	.	C	T	8253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.007;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.310;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,268:515:99:8282,0,7287
chr4	1472871	.	C	T	8114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=1.952;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.657;QD=15.28;ReadPosRankSum=-1.801;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,284:531:99:8143,0,7111
chr4	1473723	.	T	C	9581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.659;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.118;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,248:462:99:9610,0,6113
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chr4	1481779	.	GA	G	4765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.046;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.680;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,201:402:99:4803,0,4646
chr4	1481822	.	T	A	8724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.531;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.674;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,228:445:99:8753,0,8327
chr4	1481832	.	C	T	8923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.685;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.329;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.109;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,234:462:99:8952,0,8681
chr4	1482704	.	T	C	8948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.475;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.279;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,236:482:99:8977,0,9589
chr4	1482706	.	CGGCAAACTTGGG	C	5992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.497;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.283;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.094;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,210:488:99:6030,0,11183
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chr4	1486011	.	G	A	11988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.293;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.257;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,296:603:99:12017,0,15707
chr4	1486018	.	C	T	11971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.874;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.347;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,291:594:99:12000,0,15374
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chr4	1486521	.	G	A	8990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.727;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=7.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-0.644;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,202:417:99:9019,0,9377
chr4	1486526	.	AGG	A	8559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.125;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=4.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=1.357;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,219:454:99:8597,0,9264
chr4	1486565	.	G	T	7661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=1.401;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.427;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,248:492:99:7690,0,7470
chr4	1487284	.	G	T	9544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=-1.235;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=6.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.431;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.430;SOR=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,250:498:99:9573,0,9663
chr4	1487287	.	G	A	9488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.177;ClippingRankSum=1.997;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=4.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.327;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.674;SOR=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,246:494:99:9517,0,9904
chr4	1487308	.	T	A	7997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.603;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.559;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,254:534:99:8026,0,10464
chr4	1487509	.	G	A	9715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.980;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.152;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.233;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,263:511:99:9744,0,9531
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chr4	1492987	.	GCTCTATACTCTCCTGCGACTCTATGCGCTCCTGCGA	G	8095.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=-0.023;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=5.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.974;QD=15.91;ReadPosRankSum=2.490;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,220:509:99:8133,0,11136
chr4	1493235	.	A	G	8256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-1.110;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=4.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.766;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.785;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,261:524:99:8285,0,8101
chr4	1493353	.	T	C	7902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.179;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.729;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,208:429:99:7931,0,8788
chr4	1493356	.	C	T	7828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=1.266;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.475;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,205:425:99:7857,0,8796
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chr4	1497135	.	C	A	8571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.063;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.089;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.874;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,279:568:99:8600,0,8779
chr4	1497594	.	CTA	C	10390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.641;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=0.088;QD=18.33;ReadPosRankSum=2.277;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,270:567:99:10428,0,11692
chr4	1497599	.	G	A	23705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.780;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQRankSum=0.065;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,566:569:99:23734,1630,0
chr4	1497612	.	TA	T	10349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.787;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.733;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,263:599:99:10387,0,13707
chr4	1497631	.	G	C	10554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;ClippingRankSum=-0.028;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-2.273;QD=16.81;ReadPosRankSum=-2.006;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,265:628:99:10583,0,14948
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chr4	1497658	.	GTCTATTTATTCCA	G	9409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=0.633;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-1.243;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:393,255:648:99:9447,0,15876
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chr4	1499996	.	G	GT	8744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.502;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.325;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,228:515:99:8782,0,11147
chr4	1499998	.	C	T	8846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=-0.726;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.013;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,233:524:99:8875,0,11211
chr4	1500008	.	A	G	8463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.638;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.851;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,221:496:99:8492,0,10784
chr4	1500101	.	T	C	10544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.453;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.124;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,269:548:99:10573,0,15364
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chr4	1507154	.	G	A	10370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.855;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.913;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,274:573:99:10399,0,11647
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chr4	1615428	.	T	A	8806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.142;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.284;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,239:489:99:8835,0,9287
chr4	1615450	.	A	T	8876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.821;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.612;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,221:430:99:8905,0,8372
chr4	1615474	.	C	T	7171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-3.583;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=9.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.530;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,186:344:99:7200,0,6064
chr4	1615514	.	C	CTTTT	6018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.404;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQRankSum=0.943;QD=28.40;ReadPosRankSum=-2.451;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,94:98:99:6056,482,0
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chr4	1622622	.	C	G	6346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.190;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.038;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.832;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,159:313:99:6375,0,6105
chr4	1622623	.	A	G	6310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.743;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.341;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.915;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,160:315:99:6339,0,6069
chr4	1622833	.	GTTTTGAGCGTTCGACCTAATATCATTGTTGTCCCTA	G	4183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.885;ClippingRankSum=-1.293;DP=896;ExcessHet=3.0103;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=1.208;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:412,170:582:99:4221,0,16125
chr4	1622901	.	CCCTATTTTGAGCATTCGACCTAATATCATTGTTCAT	C	5104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.329;ClippingRankSum=-0.261;DP=830;ExcessHet=3.0103;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-1.382;QD=9.07;ReadPosRankSum=11.178;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:405,158:563:99:5142,0,15841
chr4	1623591	.	C	A	10099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.528;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.112;QD=16.24;ReadPosRankSum=-2.109;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,313:622:99:10128,0,9952
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chr4	1625134	.	T	A	12686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.945;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=2.829;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,324:671:99:12715,0,13866
chr4	1625136	.	C	T	12609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-0.201;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=3.999;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.985;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,324:670:99:12638,0,13787
chr4	1625163	.	T	C	12874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.118;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=1.016;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.344;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,338:682:99:12903,0,13111
chr4	1625174	.	G	C	12950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-0.122;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.316;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,322:646:99:12979,0,13161
chr4	1625179	.	G	A	13179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=1.091;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.406;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.390	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,327:649:99:13208,0,13298
chr4	1625191	.	A	AT	12819.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-1.140;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=3.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.693;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,306:625:99:12857,0,12947
chr4	1625200	.	C	T	12456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.064;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.971;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,312:624:99:12485,0,12890
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chr4	1633926	.	T	C	11188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.298;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.221;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,299:621:99:11217,0,12142
chr4	1634379	.	C	A	8581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.819;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.849;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,267:499:99:8610,0,7509
chr4	1634670	.	AT	A	9690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.041;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.430;QD=18.53;ReadPosRankSum=2.187;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,251:523:99:9728,0,10715
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chr4	1639615	.	T	C	7128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.988;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=2.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.530;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,180:363:99:7157,0,7368
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chr4	1646142	.	T	C	10993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.399;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.384;QD=20.43;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,284:538:99:11022,0,9649
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chr4	1659963	.	C	T	6551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.850;ClippingRankSum=0.235;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.175;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.704;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,227:465:99:6580,0,7738
chr4	1661025	.	T	C	6813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.537;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.389;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,217:455:99:6842,0,9196
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chr4	1667334	.	T	C	9969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.844;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.544;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,264:572:99:9998,0,12064
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chr4	1671329	.	C	A	10287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.278;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.172;QD=16.51;ReadPosRankSum=-2.131;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,269:623:99:10316,0,13878
chr4	1671593	.	A	G	9856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-1.111;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.387;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.216;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,254:499:99:9885,0,9482
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chr4	1679517	.	A	G	6565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.833;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.601;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,213:496:99:6594,0,8952
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chr4	1684956	.	T	C	6858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.822;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.279;QD=16.85;ReadPosRankSum=-2.004;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,184:407:99:6887,0,8601
chr4	1685214	.	A	G	6792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.037;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=5.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.062;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.627;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,182:353:99:6821,0,6139
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chr4	1688850	.	G	C	7603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-1.275;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.598;QD=17.36;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,206:438:99:7632,0,8473
chr4	1688867	.	A	C	7245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=2.568;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.566;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,184:414:99:7274,0,9382
chr4	1688886	.	T	C	6930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.605;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.472;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.164;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,184:416:99:6959,0,8749
chr4	1688917	.	T	C	5887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-1.155;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.179;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,193:436:99:5916,0,7470
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chr4	1691402	.	T	C	8035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.801;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=16.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.191;QD=28.10;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,192:286:99:8064,0,3474
chr4	1691404	.	G	A	8161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.213;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=12.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.148;QD=28.24;ReadPosRankSum=-1.577;SOR=0.308	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,195:289:99:8190,0,3465
chr4	1691419	.	G	A	8497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=1.501;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=21.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.218;QD=28.61;ReadPosRankSum=-1.688;SOR=0.218	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,202:297:99:8526,0,3484
chr4	1691421	.	T	C	8332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.656;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=22.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.308;QD=27.68;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,203:301:99:8361,0,3454
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chr4	1692800	.	T	C	11318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=-1.071;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.679;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,279:563:99:11347,0,11314
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chr4	1692845	.	A	G	11060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.407;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.427;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,293:561:99:11089,0,9895
chr4	1692863	.	C	A	11290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.103;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.623;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,279:537:99:11319,0,10387
chr4	1692864	.	A	C	11195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.275;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.219;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,282:540:99:11224,0,10255
chr4	1693046	.	C	T	9570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.474;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.748;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.283;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,252:567:99:9599,0,12542
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chr4	1697093	.	C	T	10951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.172;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.958;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.492;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,290:594:99:10980,0,11697
chr4	1697099	.	C	T	10942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.684;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.144;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,283:579:99:10971,0,11533
chr4	1697741	.	C	T	10090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;ClippingRankSum=0.773;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.322;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,339:650:99:10119,0,10017
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chr4	1699020	.	T	A	8527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.723;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.168;QD=13.58;ReadPosRankSum=3.373;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:393,235:628:99:8556,0,15578
chr4	1699093	.	C	G	12696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.832;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-2.027;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,323:618:99:12725,0,11334
chr4	1699102	.	T	C	12795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.710;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.186;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.413;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,317:620:99:12824,0,11209
chr4	1699106	.	C	A	13071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.301;ClippingRankSum=-1.157;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.291;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,320:603:99:13100,0,11186
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chr4	1703627	.	C	T	9279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.151;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.197;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,240:502:99:9308,0,10202
chr4	1704117	.	A	G	13363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.274;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.012;QD=19.71;ReadPosRankSum=-2.837;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,353:678:99:13392,0,12448
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chr4	1704217	.	G	A	14195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=1.782;DP=780;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.642;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,376:748:99:14224,0,14022
chr4	1704238	.	A	G	13732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=1.539;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.931;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,359:714:99:13761,0,13866
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chr4	1710190	.	G	T	12220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-1.210;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.822;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,312:565:99:12249,0,9722
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chr4	1713718	.	T	C	13032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.360;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.453;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,327:672:99:13061,0,11040
chr4	1713721	.	T	A	12631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-0.040;DP=701;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.320;QD=18.83;ReadPosRankSum=-1.350;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,333:671:99:12660,0,13515
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chr4	1716183	.	A	T	8105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.385;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.778;QD=16.02;ReadPosRankSum=-1.934;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,257:506:99:8134,0,7798
chr4	1716223	.	G	C	7391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.906;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=4.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.174;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,254:543:99:7420,0,9045
chr4	1716264	.	A	C	19338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=1.148;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.945;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.340;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,537:541:99:19367,1521,0
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chr4	1720545	.	T	TC	9243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.175;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.007;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,244:530:99:9281,0,11209
chr4	1720547	.	A	G	9248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.479;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.522;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,240:531:99:9277,0,11288
chr4	1720780	.	G	C	12199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.750;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.382;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.453;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,319:588:99:12228,0,9975
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chr4	1750276	.	T	C	8998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.293;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=9.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.441;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.873;SOR=1.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,295:578:99:9027,0,8873
chr4	1750313	.	T	C	8083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.729;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=10.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.408;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.689;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,251:504:99:8112,0,9583
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chr4	1771673	.	A	G	8230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.455;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.991;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,206:459:99:8259,0,10387
chr4	1771696	.	T	C	7527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.198;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.831;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,205:451:99:7556,0,9240
chr4	1771758	.	CATAT	C	6100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.712;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.561;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,192:422:99:6138,0,8886
chr4	1771837	.	G	A	8486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=-0.475;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.835;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,222:448:99:8515,0,8716
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chr4	1784094	.	G	T	7418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=2.365;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=2.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.007;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.923;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,190:382:99:7447,0,7589
chr4	1784571	.	C	A	8349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.276;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.491;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,263:513:99:8378,0,7698
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chr4	1793584	.	A	T	7738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.740;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.144;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,253:526:99:7767,0,8693
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chr4	1809662	.	G	A	8397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.556;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.434;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,219:436:99:8426,0,8488
chr4	1809668	.	G	A	9015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.173;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.637;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,226:454:99:9044,0,9001
chr4	1809676	.	A	G	8642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.053;ClippingRankSum=-1.199;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.858;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,216:438:99:8671,0,8985
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chr4	1813599	.	G	A	8350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-1.001;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.098;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,215:398:99:8379,0,7395
chr4	1813614	.	G	A	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.300;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.791;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,226:420:99:9092,0,8228
chr4	1813617	.	T	C	8912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-1.218;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.703;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,219:406:99:8941,0,8011
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chr4	1819796	.	C	T	10058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-0.540;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.230;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,246:478:99:10087,0,9311
chr4	1819803	.	T	C	9381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.039;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.074;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,245:495:99:9410,0,9425
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chr4	1824913	.	C	A	9545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-1.462;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.832;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,246:479:99:9574,0,9004
chr4	1824986	.	T	C	8868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=1.539;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-1.303;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,227:464:99:8897,0,8868
chr4	1824996	.	AATATAGAATTACTACAC	A	8768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.627;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.725;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,230:513:99:8806,0,11037
chr4	1825042	.	C	T	7246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.396;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.048;QD=15.65;ReadPosRankSum=2.470;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,233:463:99:7275,0,6787
chr4	1826659	.	G	A	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.924;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.649;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,281:518:99:8783,0,7348
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chr4	1828597	.	TC	T	8829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.856;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.602;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,226:448:99:8867,0,8749
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chr4	1836288	.	T	C	8419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.417;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.062;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.897;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,222:450:99:8448,0,12894
chr4	1836903	.	T	C	11459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=-0.796;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.063;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,296:575:99:11488,0,10659
chr4	1836913	.	A	G	12269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.226;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.099;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,303:593:99:12298,0,11493
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chr4	1851824	.	A	G	8112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=1.450;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.442;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.361;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,202:393:99:8141,0,7646
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chr4	1858549	.	A	C	9893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.498;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.480;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,237:451:99:9922,0,8349
chr4	1858553	.	G	A	10148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.690;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.786;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,249:457:99:10177,0,8377
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chr4	1861782	.	C	A	6063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.664;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.821;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,156:321:99:6092,0,6609
chr4	1861783	.	C	T	6072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.484;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.757;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.202;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,158:325:99:6101,0,6527
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chr4	1869773	.	A	G	7968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.151;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.828;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,205:400:99:7997,0,7528
chr4	1869880	.	ATC	A	7007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.553;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.284;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,180:354:99:7045,0,6781
chr4	1869887	.	GCAACCACTATAATGCA	G	7022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=-0.914;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.162;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,182:382:99:7060,0,8053
chr4	1869940	.	C	T	6956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.305;DP=397;ExcessHet=3.0103;FS=5.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.181;QD=18.07;ReadPosRankSum=-2.139;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,215:385:99:6985,0,5380
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chr4	1874722	.	T	C	8598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.687;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.736;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.436;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,270:472:99:8627,0,6378
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chr4	1877929	.	G	A	9530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.684;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.339;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,236:406:99:9559,0,6748
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chr4	1887128	.	T	C	7074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.018;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=7.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.558;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,166:324:99:7103,0,6383
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chr4	1891402	.	GATGCTTTAACCTAATGCTTTAACCTAATGCTTTAACCTA	G	4233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.075;ClippingRankSum=-0.571;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=3.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.412;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,120:354:99:4271,0,45548
chr4	1891862	.	C	T	4602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.297;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=4.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.179;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.469	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,125:264:99:4631,0,5237
chr4	1891864	.	CA	C	4581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=1.054;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.523;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,124:262:99:4619,0,5335
chr4	1892187	.	T	C	7525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.362;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.800;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.980;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,206:448:99:7554,0,9232
chr4	1892204	.	T	C	7503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=-1.761;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.086;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,204:450:99:7532,0,9238
chr4	1892907	.	G	T	5168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-2.214;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.148;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,133:266:99:5197,0,5171
chr4	1892908	.	G	A	5168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=2.277;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.105;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,133:263:99:5197,0,5171
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chr4	1904837	.	G	A	7908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.626;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.117;QD=18.88;ReadPosRankSum=-2.833;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,210:419:99:7937,0,8054
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chr4	1911893	.	C	T	7601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=1.026;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.533;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.728;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,203:445:99:7630,0,9611
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chr4	1930932	.	T	C	5578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.580;ClippingRankSum=0.387;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.397;QD=18.00;ReadPosRankSum=2.156;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,142:310:99:5607,0,6787
chr4	1930952	.	A	G	4071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=1.379;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.652;QD=14.59;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,109:279:99:4100,0,7266
chr4	1930960	.	GAAAAAAAA	G	3316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;ClippingRankSum=1.304;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.026;QD=11.64;ReadPosRankSum=-4.050;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,85:285:99:3354,0,7725
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chr4	1950593	.	C	T	9001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.055;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.136;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,230:462:99:9030,0,9007
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chr4	1953511	.	C	T	8902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.433;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.611;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,240:481:99:8931,0,9060
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chr4	1958447	.	C	T	12603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.068;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.709;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,315:619:99:12632,0,11975
chr4	1958456	.	G	A	12577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-1.872;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.985;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,311:606:99:12606,0,12158
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chr4	1960933	.	T	G	8179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.984;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.425;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,254:473:99:8208,0,7204
chr4	1961199	.	G	GTT	8455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=-1.748;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=6.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.598;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,246:525:99:8493,0,11124
chr4	1961209	.	A	G	12197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.556;ClippingRankSum=-0.329;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.113;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,312:581:99:12226,0,10622
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chr4	2021893	.	G	A	9679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-1.140;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.125;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,248:481:99:9708,0,8999
chr4	2021926	.	C	G	6889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.448;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.037;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,227:476:99:6918,0,7717
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chr4	2029910	.	C	T	12240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.968;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.544;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,325:653:99:12269,0,12601
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chr4	2030251	.	G	A	10424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=-1.019;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.311;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,271:592:99:10453,0,12813
chr4	2030257	.	T	C	10527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.100;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.643;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,267:583:99:10556,0,12744
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chr4	2035965	.	T	TTTG	10124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.728;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.480;QD=18.85;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,251:537:99:10162,0,11795
chr4	2035979	.	A	G	9574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=2.059;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.849;QD=17.60;ReadPosRankSum=-2.395;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,259:544:99:9603,0,11021
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chr4	2036036	.	T	A	11057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=1.737;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.947;QD=20.00;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,272:553:99:11086,0,11602
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chr4	2036109	.	G	A	11974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=-0.867;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.482;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.222;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,302:611:99:12003,0,12633
chr4	2036117	.	C	T	12486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.024;ClippingRankSum=-0.109;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.060;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,308:623:99:12515,0,12470
chr4	2036120	.	ATATTTTT	A	12369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;ClippingRankSum=-0.440;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.759;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,311:637:99:12407,0,13397
chr4	2036132	.	C	CT	12394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.821;ClippingRankSum=-0.279;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.197;QD=20.35;ReadPosRankSum=2.271;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,304:609:99:12432,0,12477
chr4	2036147	.	A	C	12604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=-0.515;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.360;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,310:606:99:12633,0,11820
chr4	2036153	.	T	C	12105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.499;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.105;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,305:596:99:12134,0,11402
chr4	2036188	.	T	A	10672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.108;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.916;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,280:546:99:10701,0,10213
chr4	2036198	.	C	A	10750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.016;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.884;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.422;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,284:539:99:10779,0,9710
contig2	16273	.	T	A	15.88	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.822;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.091;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=1.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:44:44,0,401
contig3	2452	.	A	G	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.936;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.758;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.082;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,93:209:99:2720,0,3554
contig3	2605	.	T	G	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=-0.746;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.434;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,77:200:99:2962,0,7196
contig3	2610	.	T	C	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=-0.009;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.718;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,78:201:99:2871,0,7219
contig3	3679	.	T	A	6187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.252;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.840;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,195:355:99:6216,0,5955
contig3	3892	.	T	C	5497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=-1.412;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.146;QD=16.86;ReadPosRankSum=2.022;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,168:326:99:5526,0,4940
contig3	4189	.	T	C	7567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.737;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.521;QD=15.35;ReadPosRankSum=2.904;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,241:493:99:7596,0,7736
contig3	5058	.	C	G	6664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.921;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.849;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,223:463:99:6693,0,7538
contig3	5074	.	G	C	8624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-1.175;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.867;QD=18.96;ReadPosRankSum=-3.146;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,225:455:99:8653,0,11455
contig3	5083	.	C	T	8591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.048;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.778;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.788;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,223:452:99:8620,0,11563
contig3	5248	.	G	A	8363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.275;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-2.831;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,226:511:99:8392,0,11234
contig3	5263	.	G	A	8999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=-0.647;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-4.047;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,223:502:99:9028,0,11531
contig3	5264	.	G	C	8939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-0.137;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=-3.750;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,217:499:99:8968,0,11621
contig3	5270	.	C	G	8294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=-0.238;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-4.923;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,208:496:99:8323,0,12103
contig3	5274	.	CT	C	8555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=-0.660;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-3.405;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,212:501:99:8593,0,12418
contig3	5276	.	A	ACT	8540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=-1.431;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=2.124;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,210:496:99:8578,0,12043
contig3	5279	.	A	G	8399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=0.666;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-5.027;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,213:497:99:8428,0,11803
contig3	5284	.	A	T	8201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=-0.128;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-2.055;QD=16.60;ReadPosRankSum=-2.355;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,215:494:99:8230,0,11650
contig3	5286	.	G	T	8339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.128;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-3.032;QD=17.05;ReadPosRankSum=-2.241;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,211:489:99:8368,0,11473
contig3	5302	.	G	T	8447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=1.942;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQRankSum=-5.517;QD=17.17;ReadPosRankSum=-2.829;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,211:492:99:8476,0,11716
contig3	5311	.	AT	A	9706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=1.118;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQRankSum=-9.243;QD=18.25;ReadPosRankSum=-3.562;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,235:532:99:9744,0,12084
contig3	5331	.	T	A	5922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=-0.181;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-10.370;QD=11.41;ReadPosRankSum=-2.173;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,239:519:99:5951,0,11308
contig3	5332	.	C	T	9825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=-0.062;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-10.762;QD=18.54;ReadPosRankSum=-2.599;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,255:530:99:9854,0,11150
contig3	5333	.	T	G	9813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.088;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-11.088;QD=18.59;ReadPosRankSum=-2.455;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,253:528:99:9842,0,11318
contig3	5339	.	T	TTCC	9879.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;ClippingRankSum=1.597;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-7.669;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.766;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,250:518:99:9917,0,10826
contig3	5341	.	CT	C	9863.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.368;ClippingRankSum=0.534;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-7.322;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,245:516:99:9901,0,10772
contig3	5343	.	ATACT	A	9601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.552;ClippingRankSum=-1.478;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=-8.164;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.444;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,248:519:99:9639,0,10979
contig3	5351	.	G	A	9868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.802;ClippingRankSum=-0.117;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=3.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-4.966;QD=19.13;ReadPosRankSum=-2.185;SOR=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,262:516:99:9897,0,10040
contig3	5449	.	A	T	6522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=2.633;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=13.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.309;QD=19.36;ReadPosRankSum=1.936;SOR=1.028	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,171:337:99:6551,0,6293
contig3	5451	.	T	C	6592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.424;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=13.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.001;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.966;SOR=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,165:326:99:6621,0,6325
contig3	5465	.	C	T	5630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.818;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=4.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=1.112;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,141:272:99:5659,0,5264
contig3	5474	.	CT	C	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.211;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=11.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=0.418;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.773;SOR=2.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,26:120:99:119,0,1445
contig3	5739	.	A	C	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.735;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.204;QD=30.92;ReadPosRankSum=4.959;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,235:303:99:9397,0,1768
contig3	5748	.	TCCCCCCCCCCTCC	T	9326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=-1.094;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=25.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.606;QD=33.79;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,226:276:99:9364,0,1309
contig3	5790	.	T	C	2827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.783;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=4.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.634;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.850;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,84:325:99:2856,0,9620
contig3	5809	.	T	G	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-0.576;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=11.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.977;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.470;SOR=1.238	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,110:349:99:3690,0,9399
contig3	5878	.	T	C	5606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.976;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=9.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.955;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.201;SOR=1.291	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,197:448:99:5635,0,7490
contig3	5930	.	G	T	9680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.840;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.027;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,250:471:99:9709,0,8442
contig3	5939	.	C	T	9489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.153;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.063;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,249:470:99:9518,0,8386
contig3	6312	.	C	T	7801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=1.325;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=5.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.972;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.075;SOR=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,202:421:99:7830,0,14507
contig3	6318	.	A	C	7701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-0.667;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.017;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,201:411:99:7730,0,14219
contig3	6834	.	T	C	9253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=2.159;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.185;QD=17.93;ReadPosRankSum=4.205;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,242:516:99:9282,0,10464
contig3	6843	.	A	G	9283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.548;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.935;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,243:501:99:9312,0,9987
contig3	7536	.	G	A	9771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.905;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.238;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.136;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,254:534:99:9800,0,11626
contig3	7551	.	T	C	9706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.999;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.560;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.922;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,260:554:99:9735,0,11164
contig3	7612	.	T	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.202;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=11.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-2.454;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.377;SOR=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,53:335:99:1435,0,11760
contig3	7618	.	A	T	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.077;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=13.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-1.478;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.730;SOR=1.305	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,57:346:99:1631,0,12292
contig3	7628	.	T	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.744;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=21.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-2.506;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.021;SOR=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,69:349:99:1939,0,12136
contig3	7636	.	C	T	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.570;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=17.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=0.383;QD=6.27;ReadPosRankSum=2.283;SOR=1.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,85:365:99:2318,0,11898
contig3	7641	.	TCACCAC	T	2285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.636;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=15.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-3.198;QD=6.23;ReadPosRankSum=4.817;SOR=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,85:367:99:2323,0,11775
contig3	7648	.	T	TG	2279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.894;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=14.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-0.508;QD=6.18;ReadPosRankSum=5.149;SOR=1.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,85:369:99:2317,0,11820
contig3	7650	.	T	C	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=1.308;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=14.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-3.273;QD=6.10;ReadPosRankSum=5.399;SOR=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,85:373:99:2302,0,12030
contig3	7653	.	TTAC	T	2246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.206;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=17.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-1.987;QD=5.87;ReadPosRankSum=5.722;SOR=1.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,85:383:99:2284,0,12243
contig3	7691	.	T	C	7823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.352;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-1.758;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.970	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,199:447:99:7852,0,10286
contig3	7717	.	A	G	7023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=1.700;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-1.431;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,183:427:99:7052,0,10010
contig3	7733	.	CAATTCCGCT	C	7120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=-0.017;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=0.139;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,192:446:99:7158,0,10243
contig3	7771	.	C	G	6673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=-0.399;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.462;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,215:399:99:6702,0,7308
contig3	7883	.	G	A	6869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.249;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.101;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,180:407:99:6898,0,8794
contig3	7888	.	C	T	6641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.406;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.930;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,176:387:99:6670,0,8633
contig3	7899	.	A	T	5337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.384;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.550;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,173:369:99:5366,0,6063
contig3	7901	.	CT	C	3621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=1.031;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.091;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,154:329:99:3659,0,4082
contig3	7928	.	TGCGATATTTTTCGCCGGCTA	T	6438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;ClippingRankSum=1.368;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.014;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,173:405:99:6476,0,9172
contig3	10504	.	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=32.35;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig3	10509	.	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=30.73;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig3	10517	.	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=30.13;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig3	10530	.	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.17;QD=30.90;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig3	10538	.	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.17;QD=27.13;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig3	10581	.	T	A	48.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.58;MQRankSum=-0.727;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.727;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:77,0,26
contig3	11170	.	A	G	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.57;QD=30.31;SOR=1.072	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,208:208:99:6333,622,0
contig4	298	.	C	G	103.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=34.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
contig4	310	.	G	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=31.34;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig4	317	.	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=35.13;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
contig4	333	.	T	C	172.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=34.58;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
contig4	346	.	T	G	255.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.74;QD=29.84;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
contig4	4996	.	C	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,545
contig4	5002	.	C	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.589;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.532;SOR=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,578
contig5	19	.	C	CA	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.212;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.47;MQRankSum=-2.927;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:236,0,934
contig5	23	.	G	GT	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-2.219;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=2.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,946
contig5	24	.	C	CG	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-2.219;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=2.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,946
contig5	26	.	T	TCAACGTGGGCCA	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-2.219;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=2.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,1216
contig5	29	.	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=-2.520;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.278;SOR=3.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:147,0,1173
contig5	31	.	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=-2.520;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=3.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,1207
contig5	33	.	G	GCGCGAC	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.536;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQRankSum=-2.637;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.000;SOR=3.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,1207
contig5	43	.	A	AGCTCGGTGACGTGGGT	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.231;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQRankSum=-2.855;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.855;SOR=3.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,1267
contig6	12994	.	G	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-1.346;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.952;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:79:79,0,718
contig8	386	.	A	G	8821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.816;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.383;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,234:524:99:8850,0,11054
contig8	401	.	G	A	9573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.357;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.298;QD=17.80;ReadPosRankSum=-1.898;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,257:538:99:9602,0,10879
contig8	929	.	AT	A	10564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.312;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.653;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,278:616:99:10602,0,13179
contig8	943	.	G	T	11776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.346;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.341;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,300:666:99:11805,0,15108
contig8	947	.	C	A	11796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=2.707;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.344;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.286;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,300:663:99:11825,0,15110
contig8	971	.	T	C	11334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.227;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.098;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,283:632:99:11363,0,14206
contig8	979	.	A	G	10637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.836;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.376;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.480;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,275:622:99:10666,0,13825
contig8	1005	.	A	G	12346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.704;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.485;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,330:616:99:12375,0,10761
contig8	1023	.	G	A	12241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.484;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.844;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,326:625:99:12270,0,11167
contig8	1173	.	C	CA	8701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.158;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.562;QD=13.73;ReadPosRankSum=-2.739;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,301:634:99:8739,0,9943
contig8	1305	.	G	C	6654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.250;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.356;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,235:490:99:6683,0,6778
contig8	1988	.	C	T	8781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=-1.017;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.324;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,299:593:99:8810,0,9259
contig8	2005	.	C	A	9383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.254;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.217;QD=15.26;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,312:615:99:9412,0,9188
contig8	2283	.	A	T	8056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=1.989;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.789;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,266:587:99:8085,0,9835
contig8	5469	.	C	A	12616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.010;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-1.225;QD=18.02;ReadPosRankSum=5.774;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,335:700:99:12645,0,20876
contig8	5500	.	A	T	12811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.850;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=4.002;QD=17.45;ReadPosRankSum=-2.117;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,355:734:99:12840,0,20866
contig8	6081	.	A	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.247;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=10.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.59;MQRankSum=-9.451;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.039;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,45:264:99:1249,0,9068
contig8	6083	.	A	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=-0.309;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=8.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.53;MQRankSum=-9.743;QD=4.75;ReadPosRankSum=-2.096;SOR=0.392	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,45:264:99:1282,0,9160
contig8	6087	.	C	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=-1.211;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=10.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.70;MQRankSum=-9.321;QD=5.07;ReadPosRankSum=-2.945;SOR=0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,46:255:99:1322,0,8709
contig8	6101	.	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.474;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=6.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.65;MQRankSum=-8.154;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.610;SOR=0.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,32:194:99:997,0,6665
contig8	6103	.	C	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.795;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.55;MQRankSum=-7.108;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.902;SOR=0.293	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,29:189:99:853,0,6680
contig8	6130	.	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=-0.856;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.38;MQRankSum=-4.929;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.149;SOR=1.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,20:129:99:475,0,4434
contig8	6132	.	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.024;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.35;MQRankSum=-5.038;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:102,20:122:99:475,0,4434
contig8	6134	.	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.139;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.40;MQRankSum=-5.411;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,19:115:99:499,0,4223
contig8	6153	.	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.346;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.23;MQRankSum=-5.741;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,20:92:99:347,0,2596
contig8	6174	.	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.042;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.98;MQRankSum=-4.356;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.418;SOR=0.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,13:63:99:275,0,1791
contig8	6213	.	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.374;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.61;MQRankSum=-2.576;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.418;SOR=0.084	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,7:33:99:216,0,1047
contig8	6221	.	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.127;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.90;MQRankSum=-1.300;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:228,0,903
contig8	6261	.	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.77;QD=29.69;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:236,21,0
contig8	6292	.	C	T	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.44;QD=22.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
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contig8	7259	.	GA	G	5644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.326;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=23.656;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQRankSum=3.753;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.418	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,205:212:99:5682,436,0
contig8	7283	.	T	C	8314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=1.256;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=27.225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.40;MQRankSum=3.814;QD=34.50;ReadPosRankSum=-2.936;SOR=0.435	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:8,233:241:99:8343,471,0
contig8	7297	.	T	C	8155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=1.341;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=25.851;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQRankSum=3.675;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.288	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:8,228:236:99:8184,404,0
contig8	7425	.	C	T	4933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.602;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=175.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQRankSum=-2.681;QD=21.08;ReadPosRankSum=-4.395;SOR=3.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,133:234:99:4962,0,4001
contig8	7430	.	C	T	4818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=1.109;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=221.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.44;MQRankSum=-3.176;QD=21.04;ReadPosRankSum=-4.672;SOR=3.987	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,123:229:99:4847,0,4118
contig8	7453	.	C	T	4200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.284;ClippingRankSum=0.357;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=238.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.24;MQRankSum=7.094;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.431;SOR=1.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,117:193:99:4229,0,2875
contig8	7476	.	A	T	4139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.548;ClippingRankSum=0.841;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=112.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.90;MQRankSum=7.526;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=0.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,102:157:99:4168,0,2116
contig8	7485	.	A	C	3860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.224;ClippingRankSum=0.658;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=84.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQRankSum=6.744;QD=26.63;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,96:145:99:3889,0,1836
contig8	7500	.	T	G	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;ClippingRankSum=-1.095;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=30.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.01;MQRankSum=3.657;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,73:115:99:2984,0,1373
contig8	7588	.	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=1.198;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=98.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.54;MQRankSum=1.363;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.068;SOR=6.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,23:44:99:735,0,929
contig8	7613	.	TAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAA	T	3143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=-0.109;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=131.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.45;MQRankSum=-0.898;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.610;SOR=8.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,71:82:99:3181,0,243
contig8	7668	.	TA	T	4892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=-0.371;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=20.492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.54;MQRankSum=0.897;QD=26.43;SOR=9.437	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,111:112:99:4930,304,0
contig8	7680	.	A	G	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.36;QD=33.04;SOR=5.752	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,129:129:99:5627,398,0
contig8	10113	.	A	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.582;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.74;MQRankSum=-0.689;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,30:81:99:703,0,1357
contig8	10124	.	G	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=1.037;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.83;MQRankSum=0.045;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,39:96:99:917,0,1510
contig8	10159	.	A	G	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.870;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=3.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.87;MQRankSum=1.040;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.589;SOR=1.293	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,79:152:99:2077,0,1859
contig8	10889	.	A	G	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.489;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=328.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.92;MQRankSum=-8.171;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.565;SOR=5.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,69:133:99:2812,0,2435
contig8	10898	.	A	G	3562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.515;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=268.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.30;MQRankSum=-7.496;QD=24.91;ReadPosRankSum=-3.058;SOR=3.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:56,87:143:99:3591,0,2109
contig8	10905	.	A	G	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.622;ClippingRankSum=-2.131;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=235.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.84;MQRankSum=-7.305;QD=25.71;ReadPosRankSum=-2.965;SOR=2.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,93:143:99:3705,0,1811
contig8	11017	.	A	G	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.714;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=6.002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.57;MQRankSum=0.758;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,176:179:99:5147,448,0
contig8	11030	.	A	G	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-1.018;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=8.156;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.28;MQRankSum=0.656;QD=28.40;ReadPosRankSum=2.095;SOR=0.081	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,160:164:99:4686,371,0
contig8	12734	.	A	G	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.18;SOR=8.439	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2117,201,0
contig8	12950	.	G	A	6201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.19;QD=24.10;SOR=2.288	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:6230,489,0
contig8	12972	.	C	T	4981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.33;QD=28.00;SOR=5.038	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:5010,340,0
contig8	12987	.	A	T	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;QD=29.78;SOR=8.955	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:3915,262,0
contig8	13000	.	G	T	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;QD=25.66;SOR=8.714	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:3456,238,0
contig8	13056	.	T	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.38;QD=33.10;SOR=7.168	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1426,105,0
contig8	13075	.	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.10;QD=25.42;SOR=6.439	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:75:1108,75,0
contig13	904	.	TTGTCCTATTCTCCCATGTCCTATTCTCCCA	T,TTGTCCTATTCTCCCA	10906.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.106;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.34;MQRankSum=0.686;QD=31.89;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.086	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:3,194,145:342:99:10944,5017,9891,6293,0,7118
contig13	972	.	TTTTCTCATTTTCTAA	T	8502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.040;ClippingRankSum=-1.060;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-2.340;QD=15.54;ReadPosRankSum=-3.735;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,233:547:99:8540,0,12165
contig13	1042	.	ATTTTCTATTTCCATTTTCTATTTCCG	A	8351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;ClippingRankSum=-1.379;DP=815;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-2.702;QD=13.67;ReadPosRankSum=-3.113;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,235:611:99:8389,0,14874
contig13	1110	.	CTCTATTTCCATTTT	C	13064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.322;ClippingRankSum=1.290;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=4.146;QD=19.10;ReadPosRankSum=4.247;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,335:684:99:13102,0,13944
contig13	1130	.	C	CT	13503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=0.076;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=2.625;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.480;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,336:682:99:13541,0,13649
contig13	1138	.	T	C	13284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.806;ClippingRankSum=-0.500;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=1.715;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.745;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,333:695:99:13313,0,14753
contig13	1141	.	TC	T	13533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.066;ClippingRankSum=1.677;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-0.788;QD=19.31;ReadPosRankSum=-3.016;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,338:701:99:13571,0,14651
contig13	1145	.	T	C	13782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.417;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-1.702;QD=19.83;ReadPosRankSum=-4.132;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,339:695:99:13811,0,14216
contig13	1148	.	T	C	13679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.861;ClippingRankSum=0.340;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.922;QD=19.88;ReadPosRankSum=-4.858;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,341:688:99:13708,0,14171
contig13	1159	.	G	T	13796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;ClippingRankSum=1.224;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.965;QD=19.51;ReadPosRankSum=-3.302;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,347:707:99:13825,0,10732
contig13	1165	.	C	A	12428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=-0.529;DP=733;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.475;QD=17.83;ReadPosRankSum=-2.330;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,335:697:99:12457,0,14096
contig13	1228	.	T	A	23339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.931;ClippingRankSum=1.760;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.357;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.763;SOR=1.037	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,616:620:99:23368,1793,0
contig13	1264	.	T	C	8976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=1.326;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.842;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,286:592:99:9005,0,9507
contig13	1872	.	T	C	7885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.835;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.041;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,258:538:99:7914,0,8763
contig13	2086	.	A	ATTTTTTTTTT	5133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;ClippingRankSum=-0.902;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=11.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.382;QD=16.51;ReadPosRankSum=-6.386;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,107:311:99:5171,0,7957
contig13	2752	.	C	A	11105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.135;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.305;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.826;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,287:595:99:11134,0,12013
contig13	2753	.	A	G	11105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.187;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.335;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.660;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,290:600:99:11134,0,12013
contig13	2861	.	C	T	7540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.598;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.282;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,248:507:99:7569,0,8105
contig13	4071	.	A	T	18816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.292;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQRankSum=-0.116;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,508:511:99:18845,1443,0
contig13	4135	.	T	A	3637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.189;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=17.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=1.118;QD=9.70;ReadPosRankSum=7.746;SOR=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,192:375:99:3666,0,4619
contig13	6067	.	CTTTGCT	C	2870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;QD=29.19;SOR=8.287	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2908,196,0
contig13	6094	.	T	C	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;QD=33.97;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2840,195,0
contig13	7289	.	C	G	7700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;QD=29.12;SOR=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,176:176:99:7729,548,0
contig13	7304	.	A	G	7140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.23;QD=31.85;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:7169,497,0
contig13	7901	.	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=27.40;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
contig13	7902	.	G	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=36.91;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
contig13	7911	.	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=28.87;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
contig13	7912	.	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=26.40;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
contig13	7916	.	C	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;QD=31.92;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:405,27,0
contig13	7919	.	TTA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.77;QD=31.79;SOR=4.615	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
contig13	8316	.	T	A	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.84;QD=26.94;SOR=4.129	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:4279,292,0
contig13	8336	.	C	CCGCT	3682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.74;QD=31.40;SOR=2.777	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:3720,250,0
contig13	8370	.	T	C	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.59;QD=30.43;SOR=1.263	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2998,205,0
contig13	8648	.	T	C	7022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.07;QD=30.01;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,234:234:99:7051,702,0
contig13	8666	.	A	G	6537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.81;QD=30.69;SOR=1.152	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:213:99:6566,639,0
contig13	8684	.	A	G	5660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.05;QD=31.27;SOR=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:5689,543,0
contig13	8702	.	G	A	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.64;QD=31.12;SOR=1.460	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,153:153:99:4789,458,0
contig13	8741	.	C	T	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;QD=28.19;SOR=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,126:126:99:5526,379,0
contig13	8753	.	G	C	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;QD=31.81;SOR=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,120:120:99:5607,376,0
contig13	8759	.	G	A	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.77;QD=29.61;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,115:115:99:5445,364,0
contig13	8762	.	A	G	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.76;QD=28.92;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,112:112:99:5355,358,0
contig13	8774	.	T	C	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;QD=30.37;SOR=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,100:100:99:4545,310,0
contig13	8811	.	T	G	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.67;QD=31.70;SOR=1.040	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:5392,364,0
contig13	8814	.	G	T	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.70;QD=28.36;SOR=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,117:117:99:5571,376,0
contig13	8829	.	A	G	6045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.11;QD=33.95;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:6074,406,0
contig13	8835	.	GCCTCCGCCCGCA	G	6181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;QD=26.94;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:6219,419,0
contig13	9580	.	T	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=30.83;SOR=6.869	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:953,90,0
contig13	9773	.	A	G	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.05;QD=30.68;SOR=1.460	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,122:122:99:3771,365,0
contig13	10386	.	A	G	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-1.045;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=5.858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.82;MQRankSum=1.335;QD=34.01;ReadPosRankSum=0.965;SOR=2.147	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,130:131:99:4484,362,0
contig13	10778	.	C	T	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.78;QD=30.18;SOR=3.976	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:3977,315,0
contig13	10829	.	C	A	6761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.62;QD=32.02;SOR=1.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,187:187:99:6790,561,0
contig14	80	.	A	G	8018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-1.304;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.888;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,262:523:99:8047,0,8016
contig14	624	.	T	C	10876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.197;DP=701;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.239;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.075;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,343:678:99:10905,0,9976
contig14	639	.	T	A	10188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.881;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.619;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,339:658:99:10217,0,9719
contig14	1320	.	AT	A	4216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-0.737;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.673;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,188:435:99:4254,0,9690
contig14	1330	.	G	A	4617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=-0.647;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.162;QD=9.35;ReadPosRankSum=2.617;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,222:494:99:4646,0,10171
contig14	2191	.	C	T	9855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-1.241;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.502;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,317:653:99:9884,0,10085
contig14	2882	.	T	C	7309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-1.024;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.772;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,185:382:99:7338,0,8947
contig14	2884	.	G	A	7309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.345;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.063;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.234;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,190:390:99:7338,0,8947
contig14	2987	.	T	A	4599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.349;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.007;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.367;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,165:351:99:4628,0,5247
contig14	3105	.	AATAATAATAATT	A	4292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=1.244;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=7.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-4.373;QD=17.81;ReadPosRankSum=-2.747;SOR=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,108:241:99:4330,0,5532
contig14	3154	.	C	T	6604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=-0.162;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-0.849;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,167:360:99:6633,0,7917
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contig15	14440	.	C	A	4785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;ClippingRankSum=0.016;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=13.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-2.616;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.801;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,135:399:99:4814,0,10701
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contig16	4892	.	A	G	33897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-1.624;DP=1762;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.468;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:630,1060:1690:99:33926,0,18614
contig16	4918	.	G	T	34233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=-0.420;DP=1758;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.095;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.143;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:622,1069:1691:99:34262,0,18612
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contig16	5144	.	A	T	39391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-1.512;DP=1630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.237;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:596,956:1552:99:39420,0,32238
contig16	5155	.	T	C	39177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=-1.013;DP=1626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.618;QD=25.32;ReadPosRankSum=1.000;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:603,944:1547:99:39206,0,31252
contig16	5174	.	A	G	38679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.186;DP=1617;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.524;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:605,928:1533:99:38708,0,28551
contig16	5176	.	C	G	38487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.761;DP=1612;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.045;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.721;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:605,922:1527:99:38516,0,27946
contig16	5198	.	A	G	36931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.151;DP=1575;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.237;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:599,897:1496:99:36960,0,23095
contig16	5215	.	C	T	34751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=-0.169;DP=1511;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.677;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:560,878:1438:99:34780,0,20650
contig16	5303	.	G	A	8038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.667;DP=1649;ExcessHet=3.0103;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.178;QD=5.08;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1284,297:1581:99:8067,0,52972
contig16	5318	.	A	G	7879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=-0.294;DP=1655;ExcessHet=3.0103;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.113;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1294,294:1588:99:7908,0,52171
contig16	5344	.	A	G	39180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.013;DP=1623;ExcessHet=3.0103;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.229;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:603,958:1561:99:39209,0,22629
contig16	5347	.	A	G	41073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.118;DP=1620;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.607;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:600,959:1559:99:41102,0,22739
contig16	5359	.	T	C	47707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=-0.811;DP=1750;ExcessHet=3.0103;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.486;QD=28.26;ReadPosRankSum=-2.233;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:586,1102:1688:99:47736,0,22311
contig16	5375	.	G	A	8767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=-3.215;DP=1854;ExcessHet=3.0103;FS=5.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.728;QD=4.91;ReadPosRankSum=-3.345;SOR=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1473,314:1787:99:8796,0,62308
contig16	5378	.	C	A	9617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.339;ClippingRankSum=-0.424;DP=1874;ExcessHet=3.0103;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.290;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=1.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1476,328:1804:99:9646,0,62804
contig16	5381	.	C	T	33424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.254;DP=1886;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.451;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.287;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:852,962:1814:99:33453,0,31506
contig16	5383	.	T	C	57434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-2.169;DP=1899;ExcessHet=3.0103;FS=1.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=6.984;QD=31.44;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:538,1289:1827:99:57463,0,19483
contig16	5397	.	A	C	15816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.316;ClippingRankSum=-0.538;DP=2015;ExcessHet=3.0103;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.780;QD=8.20;ReadPosRankSum=4.273;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1415,515:1930:99:15845,0,58221
contig16	5401	.	C	T	61108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.331;DP=2064;ExcessHet=3.0103;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.582;QD=30.93;ReadPosRankSum=2.923;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:539,1437:1976:99:61137,0,18927
contig16	5406	.	T	G	63532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.153;DP=2132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.326;QD=31.25;ReadPosRankSum=2.289;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:530,1503:2033:99:63561,0,18774
contig16	8812	.	C	CT	4720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.201;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.798;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,221:491:99:4758,0,6129
contig16	9157	.	C	CAGTCT	11548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.112;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.664;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,284:516:99:11586,0,8696
contig16	9205	.	C	CAT	10532.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.459;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.911;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,277:558:99:10570,0,10654
contig18	581	.	A	G	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.12;QD=29.31;SOR=8.189	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2777,187,0
contig18	583	.	A	T	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.03;QD=26.22;SOR=8.255	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2822,190,0
contig18	587	.	C	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.98;QD=32.77;SOR=8.287	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2880,193,0
contig18	601	.	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.57;QD=33.02;SOR=8.439	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:3042,205,0
contig18	603	.	C	G	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.62;QD=25.50;SOR=8.410	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:3042,205,0
contig18	630	.	G	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.64;QD=28.54;SOR=8.318	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2827,190,0
contig18	632	.	G	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.45;QD=25.89;SOR=8.287	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2827,190,0
contig18	634	.	A	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.56;QD=29.77;SOR=8.189	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2790,187,0
contig18	653	.	A	G	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.05;QD=33.51;SOR=7.476	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1845,123,0
contig18	674	.	G	A	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.97;QD=33.40;SOR=6.666	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:87:1292,87,0
contig18	713	.	C	A	362.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.67;SOR=4.615	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
contig18	721	.	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=27.61;SOR=4.407	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
contig18	1925	.	T	C	4974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.140;ClippingRankSum=0.738;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=203.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQRankSum=-3.085;QD=20.90;ReadPosRankSum=-3.943;SOR=3.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,132:238:99:5003,0,4383
contig18	1930	.	T	C	4828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.442;ClippingRankSum=1.103;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=229.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.54;MQRankSum=-5.116;QD=21.56;ReadPosRankSum=-3.305;SOR=4.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:111,113:224:99:4857,0,4608
contig18	1953	.	C	T	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.637;ClippingRankSum=1.013;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=275.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQRankSum=-7.018;QD=15.77;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=8.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,87:209:99:3325,0,5107
contig18	1976	.	A	T	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;ClippingRankSum=-0.696;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=166.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.69;MQRankSum=-7.316;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.361;SOR=8.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,67:179:99:2590,0,4660
contig18	1985	.	A	C	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.064;ClippingRankSum=-1.489;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=131.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQRankSum=-6.857;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.512;SOR=8.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,61:158:99:2299,0,4034
contig18	2000	.	T	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.069;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=55.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.92;MQRankSum=-3.326;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.971;SOR=6.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,47:125:99:1755,0,3112
contig18	2088	.	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=64.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.16;MQRankSum=0.471;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=1.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,17:50:99:498,0,1202
contig18	2113	.	TAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAA	T	10.17	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.083;ClippingRankSum=0.060;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=83.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.69;MQRankSum=2.034;QD=0.11;ReadPosRankSum=2.263;SOR=4.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,7:90:47:47,0,3230
contig18	2430	.	C	T	6563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.494;ClippingRankSum=1.112;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=209.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.03;MQRankSum=3.356;QD=30.96;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=2.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,166:212:99:6592,0,2158
contig18	2439	.	G	A	6176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;ClippingRankSum=0.363;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=267.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.54;MQRankSum=2.956;QD=29.84;ReadPosRankSum=-2.263;SOR=2.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,153:207:99:6205,0,2362
contig18	2634	.	A	C	6295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.793;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=3.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.22;MQRankSum=0.863;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.701;SOR=0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,210:212:99:6324,571,0
contig18	2970	.	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.090;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=211.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=0.622;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.716;SOR=6.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,30:76:99:719,0,1233
contig18	3192	.	T	G	5450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.56;QD=30.45;SOR=1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,179:179:99:5479,537,0
contig18	3865	.	T	G	5447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=1.009;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=193.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQRankSum=7.972;QD=18.59;ReadPosRankSum=-1.609;SOR=1.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,173:293:99:5476,0,2660
contig18	4035	.	G	T	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.372;ClippingRankSum=-0.407;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=220.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.72;MQRankSum=0.087;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=7.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,53:82:83:1448,0,83
contig18	4219	.	G	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.470;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:123,0,129
contig18	4390	.	CT	C	187.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.290;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=0.579;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.448;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:13:225,13,0
contig18	4613	.	A	C	6503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-0.208;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=22.298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.94;MQRankSum=-0.574;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.754;SOR=2.150	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,217:223:99:6532,478,0
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contig18	5398	.	A	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=1.643;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=225.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.74;MQRankSum=-0.839;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.836;SOR=7.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,44:119:99:1702,0,6085
contig18	5405	.	A	G	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=-0.772;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=180.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.14;MQRankSum=-1.623;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.369;SOR=7.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,36:119:99:1511,0,6192
contig18	5575	.	C	T	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.422;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=63.064;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.13;MQRankSum=-0.239;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.114;SOR=8.813	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,81:85:99:2433,128,0
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contig18	5761	.	A	G	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.648;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=5.991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.71;MQRankSum=0.507;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,146:147:99:4517,408,0
contig18	5776	.	T	C	5254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.338;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.86;MQRankSum=0.145;QD=29.52;ReadPosRankSum=1.649;SOR=1.623	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,176:178:99:5283,460,0
contig18	5939	.	G	A	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=-0.922;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=454.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.75;MQRankSum=10.182;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.328;SOR=8.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,76:155:99:3028,0,3649
contig18	5944	.	G	A	3134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.326;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=469.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.04;MQRankSum=10.386;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=8.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,82:160:99:3163,0,3581
contig18	5989	.	A	C	4640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;ClippingRankSum=-0.166;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=150.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.73;MQRankSum=8.892;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,147:184:99:4669,0,624
contig18	6329	.	A	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.087;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=33.953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.38;MQRankSum=-2.415;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.122;SOR=8.497	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,69:71:99:2084,134,0
contig18	7186	.	T	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;QD=30.22;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:814,78,0
contig18	7330	.	T	G	5819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;QD=30.00;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,194:194:99:5848,582,0
contig18	7604	.	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.62;QD=27.20;SOR=5.421	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
contig18	7609	.	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;QD=32.79;SOR=5.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
contig18	7612	.	G	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;QD=29.96;SOR=4.977	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:36:540,36,0
contig18	7636	.	C	T	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=16.87;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:61,6,0
contig21	1535	.	C	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.196;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.457;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.979;SOR=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:96:96,0,386
contig22	996	.	G	GCGACCCGGT	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.592;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-2.725;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=2.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:81:81,0,2866
contig22	1001	.	T	TTCGTCA	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.212;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.752;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=2.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:75:75,0,2953
contig22	1003	.	C	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.509;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-2.739;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=2.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:75:75,0,2953
contig22	1007	.	A	ATCTCCGACG	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-0.050;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-2.764;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.174;SOR=2.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:69:69,0,3025
contig22	1010	.	A	ACCT	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=1.062;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.739;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.621;SOR=2.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:78:78,0,2872
contig22	1012	.	C	CGGCG	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.280;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.739;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.957;SOR=2.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:75:75,0,2915
contig22	1014	.	G	GCTCCTCGGCGGCCA	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.106;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-2.752;QD=1.89;ReadPosRankSum=-2.117;SOR=2.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:75:75,0,2915
contig22	1019	.	T	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.352;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-2.764;QD=2.08;ReadPosRankSum=-2.261;SOR=2.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:72:72,0,2958
contig22	1020	.	T	TCGG	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-0.955;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-2.764;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.462;SOR=2.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:72:72,0,2958
contig22	3654	.	C	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=1.416;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.416;QD=0.65;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,2:17:39:39,0,981
contig22	3659	.	C	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=1.118;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.522;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,2:17:39:39,0,981
contig23	94	.	C	CAAAATAGTACGAAGAGTGCA	12364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.643;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.263;QD=21.47;ReadPosRankSum=-6.771;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,260:576:99:12402,0,12532
contig23	110	.	T	A	11189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.304;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.223;QD=17.54;ReadPosRankSum=-5.686;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,303:638:99:11218,0,13019
contig23	160	.	G	GA	8966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=1.617;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.675;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,338:679:99:9004,0,9078
contig23	257	.	A	G	11111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.430;DP=750;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.205;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,364:720:99:11140,0,11156
contig23	307	.	A	G	12820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.178;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.391;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.659;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,328:646:99:12849,0,12208
contig23	310	.	T	C	13032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.597;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.182;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,329:643:99:13061,0,12240
contig23	311	.	G	T	13041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.538;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.005;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,328:640:99:13070,0,12164
contig23	4229	.	A	C	10046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=1.063;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.302;QD=19.28;ReadPosRankSum=2.485;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,256:521:99:10075,0,10186
contig23	4236	.	T	C	10554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.651;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.950;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.287;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,260:534:99:10583,0,11206
contig23	4249	.	A	G	11432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=-0.201;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.361;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,282:561:99:11461,0,11440
contig23	4264	.	T	C	11620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=-0.806;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.303;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,305:578:99:11649,0,10616
contig23	5389	.	T	A	23601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.546;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.665;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,639:642:99:23630,1836,0
contig23	5456	.	T	C	12022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-1.553;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.079;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.495;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,318:664:99:12051,0,13239
contig23	5468	.	A	C	12026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-0.593;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.419;QD=18.17;ReadPosRankSum=2.331;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,320:662:99:12055,0,13212
contig23	5559	.	C	T	10381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.989;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.740;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,279:567:99:10410,0,10740
contig23	5572	.	T	C	9843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=2.053;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.242;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,255:520:99:9872,0,10425
contig23	5604	.	G	A	8268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.729;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.074;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,267:523:99:8297,0,8018
contig23	5636	.	G	T	8462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-0.963;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.136;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,225:500:99:8491,0,10701
contig23	5649	.	A	T	9153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.006;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.774;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,229:502:99:9182,0,11016
contig23	5659	.	A	G	9131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.786;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.548;QD=18.45;ReadPosRankSum=-2.358;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,229:495:99:9160,0,10895
contig23	5667	.	T	A	9350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.531;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.722;QD=18.59;ReadPosRankSum=-2.904;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,236:503:99:9379,0,10774
contig23	5684	.	A	G	9424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.565;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.520;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.785;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,239:494:99:9453,0,10306
contig23	5699	.	G	A	8773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.733;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.586;QD=19.07;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,219:460:99:8802,0,9480
contig23	5704	.	A	G	8479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.376;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.311;QD=18.93;ReadPosRankSum=2.194;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,216:448:99:8508,0,9123
contig23	5732	.	T	TAAA	6896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=-0.579;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.257;QD=17.96;ReadPosRankSum=-2.634;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,204:384:99:6934,0,6585
contig23	5849	.	G	C	6950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.501;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=2.346;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.033;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,217:370:99:6979,0,4419
contig23	5873	.	A	AT,ATTTT	3445.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-0.050;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=0.874;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.92;MQRankSum=0.675;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:33,70,79:182:99:3483,1630,1770,846,0,2719
contig23	5980	.	G	C	9328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.391;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=3.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.539;QD=20.55;ReadPosRankSum=1.349;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,243:454:99:9357,0,12944
contig23	5997	.	G	A	10204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.788;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.183;QD=21.00;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,256:486:99:10233,0,15271
contig23	5999	.	A	T	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.096;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-1.342;QD=20.57;ReadPosRankSum=4.094;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,253:488:99:10066,0,15077
contig23	6060	.	GGGAAATGTATTCATATA	G	10055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.528;ClippingRankSum=-0.038;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-0.291;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.160;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,268:579:99:10093,0,12107
contig23	6103	.	C	G	9389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.030;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-1.978;QD=15.47;ReadPosRankSum=-2.888;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,311:607:99:9418,0,9089
contig23	6153	.	C	T	12153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-0.411;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=1.866;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.801;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,317:637:99:12182,0,11748
contig23	6176	.	G	T	13170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.304;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.009;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,333:661:99:13199,0,12227
contig23	6179	.	T	C	10217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.838;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.065;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,332:666:99:10246,0,12980
contig23	6205	.	A	G	11634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=-0.908;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.480;QD=18.50;ReadPosRankSum=4.677;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,304:629:99:11663,0,12175
contig23	6217	.	G	T	11595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=1.262;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=4.807;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.883;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,333:633:99:11624,0,16930
contig23	6245	.	T	A	11020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=1.430;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.056;QD=18.22;ReadPosRankSum=-2.769;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,297:605:99:11049,0,17483
contig23	6259	.	T	TTAAA	11352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-1.471;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.402;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.853;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,278:576:99:11390,0,17916
contig23	6277	.	T	A	10510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-2.407;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=2.224;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,266:558:99:10539,0,16196
contig23	6297	.	T	A	10478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.091;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=2.495;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,277:558:99:10507,0,12752
contig23	7159	.	G	T	11579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-0.209;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.822;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.782;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,296:596:99:11608,0,19428
contig23	7161	.	C	T	11579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-1.360;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.230;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,299:606:99:11608,0,19428
contig23	7553	.	A	G	7513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.449;ClippingRankSum=0.011;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.391;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,242:507:99:7542,0,8040
contig23	7658	.	A	G	9063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.713;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.009;QD=17.26;ReadPosRankSum=2.317;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,238:525:99:9092,0,11195
contig23	7668	.	C	A	9699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.381;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.257;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,257:539:99:9728,0,10891
contig23	7681	.	A	G	8090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.131;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.420;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.656;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,261:538:99:8119,0,8624
contig23	7714	.	G	A	8047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;ClippingRankSum=-0.913;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.364;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,271:517:99:8076,0,7851
contig23	7846	.	A	G	9851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.180;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.457;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,259:548:99:9880,0,11242
contig23	7855	.	A	G	10124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.187;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.612;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,263:558:99:10153,0,11459
contig23	7867	.	G	A	8438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.470;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.231;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,278:573:99:8467,0,9290
contig23	7885	.	T	C	9076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=-0.816;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.110;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.095;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,289:568:99:9105,0,8375
contig23	7996	.	G	T	9783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-1.568;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.164;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.122;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,329:656:99:9812,0,9926
contig23	8402	.	C	CT	6143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=1.042;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.529;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,225:484:99:6181,0,7436
contig23	8597	.	C	A	8581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=1.590;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.255;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.370;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,277:539:99:8610,0,8008
contig23	8726	.	A	G	6589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.269;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=0.463;QD=15.76;ReadPosRankSum=-15.823;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,187:418:99:6618,0,12741
contig23	8730	.	G	GGTT	6421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.384;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.086;QD=16.14;ReadPosRankSum=-16.166;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,174:398:99:6459,0,12703
contig24	33	.	T	A	6547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=1.133;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQRankSum=1.465;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.682;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,225:507:99:6576,0,8597
contig24	2451	.	T	C	504.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=1.369;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=12.788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.72;MQRankSum=-0.091;QD=26.57;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=5.890	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:25:533,25,0
contig24	4211	.	TCTTACAATGCATCTCTGCAAATTA	T	5241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.82;QD=26.65;SOR=9.558	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:5279,356,0
contig24	4318	.	CAT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-2.053;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=40.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.17;MQRankSum=-3.137;QD=2.95;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=3.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:108,0,819
contig24	4325	.	G	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-0.761;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=37.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.77;MQRankSum=-3.090;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=3.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:156,0,741
contig24	4329	.	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.880;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=48.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.64;MQRankSum=-3.575;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=3.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:204,0,654
contig24	4330	.	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.895;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=47.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.47;MQRankSum=-3.542;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=3.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:204,0,654
contig24	4339	.	C	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.050;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=40.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.59;MQRankSum=-3.367;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=3.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:219,0,444
contig24	4340	.	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=40.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.59;MQRankSum=-3.367;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=3.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:219,0,444
contig24	4733	.	G	A	5611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=-0.452;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=14.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.13;MQRankSum=4.902;QD=20.56;ReadPosRankSum=-6.933;SOR=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,212:273:99:5640,0,867
contig24	5120	.	C	G	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.20;QD=33.46;SOR=4.725	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:2976,237,0
contig24	5165	.	G	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.61;QD=31.61;SOR=8.255	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2336,182,0
contig24	5177	.	G	T	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.63;QD=26.46;SOR=8.015	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2129,162,0
contig24	5708	.	G	A	6004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.76;QD=30.48;SOR=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:6033,592,0
contig24	5787	.	T	C	6408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.20;QD=28.56;SOR=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,143:143:99:6437,439,0
contig24	5790	.	T	C	6471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;QD=31.76;SOR=1.308	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,146:146:99:6500,445,0
contig24	5889	.	T	A	7050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;QD=30.69;SOR=1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:7079,482,0
contig24	5891	.	G	T	7140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;QD=25.10;SOR=1.319	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,152:152:99:7169,488,0
contig24	5907	.	G	C	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.80;QD=32.38;SOR=2.100	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,123:123:99:5760,385,0
contig24	5912	.	C	T	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.46;QD=30.91;SOR=2.224	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:5355,358,0
contig24	5926	.	T	G	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.09;QD=29.23;SOR=3.180	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3960,265,0
contig24	5980	.	GAAAAAAA	G	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;QD=29.09;SOR=6.593	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:99:1530,102,0
contig24	6097	.	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=58.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.53;MQRankSum=3.122;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.231;SOR=5.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,19:26:99:676,0,137
contig24	6394	.	T	C	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-2.232;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=256.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.05;MQRankSum=7.292;QD=22.92;ReadPosRankSum=0.028;SOR=8.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,58:93:99:2160,0,823
contig24	6983	.	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=25.14;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:179,18,0
contig27	159	.	C	T	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.450;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=131.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQRankSum=0.968;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.674;SOR=3.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,91:325:99:2118,0,7262
contig27	1081	.	T	A	9859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;QD=28.55;SOR=1.251	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:9888,688,0
contig27	1090	.	G	T	9652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;QD=29.30;SOR=1.668	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,207:207:99:9681,619,0
contig27	1094	.	T	A	9177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;QD=35.04;SOR=1.755	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,202:202:99:9206,617,0
contig27	1097	.	A	C	9151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.38;QD=28.91;SOR=1.811	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:9180,614,0
contig27	1100	.	A	T	8746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.90;QD=31.34;SOR=1.859	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,191:191:99:8775,587,0
contig27	1109	.	AGAGCACATTAGATACATAGATCAAGCG	A	7477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;QD=39.23;SOR=2.484	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:7515,503,0
contig27	1188	.	GTGAAATACATTAAATACACACATCAGGTGAAATACATTAAATACACACATCAGA	G	3536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.52;QD=32.73;SOR=8.764	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3574,241,0
contig27	1544	.	T	C	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;QD=34.29;SOR=2.468	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,118:118:99:5443,376,0
contig27	1562	.	T	C	7258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;QD=32.64;SOR=1.717	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,158:158:99:7287,491,0
contig27	1583	.	C	T	8171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.17;QD=40.37;SOR=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:8200,605,0
contig27	2106	.	C	T	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;QD=16.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:60,6,0
contig27	5024	.	C	T	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.21;QD=34.66;SOR=1.171	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,155:155:99:5401,464,0
contig27	5141	.	C	T	5966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.69;QD=31.66;SOR=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,138:138:99:5995,418,0
contig27	5151	.	T	C	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.08;QD=29.58;SOR=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:5875,403,0
contig27	5165	.	G	C	5311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.92;QD=26.83;SOR=1.576	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:5340,421,0
contig27	5235	.	T	A	4896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.52;QD=28.54;SOR=1.336	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,121:121:99:4925,363,0
contig27	5286	.	G	A	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-1.437;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=4.502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.88;MQRankSum=-0.553;QD=33.69;ReadPosRankSum=1.708;SOR=1.291	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,140:141:99:4779,412,0
contig27	5627	.	G	A	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.35;SOR=7.864	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2250,151,0
contig27	5628	.	C	T	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=34.98;SOR=7.864	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2205,109,0
contig27	5646	.	A	G	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.353;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=18.062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQRankSum=-1.732;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.704;SOR=8.318	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,63:64:99:2880,154,0
contig27	5648	.	T	C	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-1.365;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=18.195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.24;MQRankSum=-1.732;QD=33.14;ReadPosRankSum=0.577;SOR=8.379	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,65:66:99:3060,166,0
contig27	5652	.	C	T	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.195;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=18.513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.23;MQRankSum=-1.732;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.171;SOR=8.525	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,70:71:99:3195,175,0
contig27	5659	.	T	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.178;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=18.921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQRankSum=-1.732;QD=30.05;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=8.713	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,77:78:99:3465,193,0
contig27	5680	.	T	G	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.375;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=19.868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQRankSum=-1.732;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.125;SOR=9.149	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,96:97:99:4466,265,0
contig27	5691	.	T	A	4987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.383;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=14.735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.52;MQRankSum=-1.412;QD=32.79;ReadPosRankSum=0.509;SOR=6.735	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,118:119:99:5016,316,0
contig27	5739	.	C	T	6334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.060;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.92;MQRankSum=0.691;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,202:203:99:6363,577,0
contig27	7417	.	A	G	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.96;QD=30.53;SOR=2.117	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,98:98:99:3630,294,0
contig31	609	.	G	GCAAC	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.551;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.919;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:444,0,3873
contig31	611	.	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.955;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.251;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:528,0,3867
contig31	613	.	GATGA	G	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.047;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.047;QD=27.26;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:528,0,3867
contig31	624	.	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.352;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.452;QD=26.93;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:486,0,3870
contig31	627	.	GGT	G	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.653;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.362;QD=23.75;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:441,0,4564
contig31	630	.	CCGGGCCCTTCGA	C	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=-0.836;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.152;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.540;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:435,0,5725
contig31	649	.	GGCGA	G	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.102;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.107;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:477,0,5722
contig31	660	.	AGCTG	A	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.880;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.176;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.415;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:432,0,6174
contig31	667	.	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.912;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.912;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:435,0,5724
contig31	668	.	G	GT	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.912;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.076;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:435,0,5724
contig31	670	.	CGACCGCGAGATG	C	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=1.796;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.669;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:429,0,6188
contig31	685	.	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=1.162;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.599;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:432,0,5292
contig31	697	.	C	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.164;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.905;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.600;SOR=0.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:267,0,4584
contig31	698	.	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.588;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.318;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:267,0,4584
contig31	703	.	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.058;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.289;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:270,0,3763
contig31	705	.	T	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.174;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.215;QD=16.18;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:271,0,3762
contig32	2957	.	G	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.283;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-3.001;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.396;SOR=3.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:129,0,1317
contig32	2965	.	C	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.057;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQRankSum=-3.001;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=3.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:126,0,1348
contig32	2966	.	G	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQRankSum=-3.027;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:126,0,1348
contig32	3237	.	C	A	12.99	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.734;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.269	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,398
contig36	2662	.	C	A	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.752;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.182;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,383
contig37	2360	.	CG	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.731;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:69:69,0,592
contig37	2365	.	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:75,0,334
contig39	197	.	A	G	9699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.226;ClippingRankSum=1.409;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.644;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,252:517:99:9728,0,10310
contig39	198	.	G	A	9699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.725;ClippingRankSum=1.337;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.271;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,254:517:99:9728,0,10310
contig39	971	.	A	G	7049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=0.649;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.178;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.863;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,235:504:99:7078,0,7937
contig39	989	.	G	T	7073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.560;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.567;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,235:496:99:7102,0,7880
contig39	1093	.	C	A	4423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-2.332;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=3.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.300;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,144:315:99:4452,0,5659
contig39	1129	.	A	G	5049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.742;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=4.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.178;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.210;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,163:291:99:5078,0,3483
contig39	1144	.	G	GA	1960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.070;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=7.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.184;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,136:209:99:1998,0,656
contig39	1185	.	G	T	7198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=-2.187;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=7.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.114;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,182:367:99:7227,0,7359
contig39	1188	.	T	C	7198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.248;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.369;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,186:376:99:7227,0,7324
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contig39	1400	.	C	T	7080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-1.418;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.812;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,183:418:99:7109,0,9330
contig39	1402	.	C	T	7080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-1.180;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.721;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.622;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,187:421:99:7109,0,9330
contig39	1429	.	A	C	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-1.186;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.888;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,190:437:99:7117,0,9486
contig39	1447	.	C	T	7452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.187;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.985;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.425;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,206:466:99:7481,0,9939
contig39	1665	.	C	A	7239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.371;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.184;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,191:422:99:7268,0,9159
contig39	1674	.	C	T	6680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.352;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.202;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.891;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,175:411:99:6709,0,9218
contig39	1752	.	A	G	9026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=1.707;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.171;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.621;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,298:577:99:9055,0,8221
contig39	2118	.	T	C	5789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.530;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.179;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.880;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,188:404:99:5818,0,6760
contig39	2154	.	A	G	7752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.479;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.761;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.421;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,234:445:99:7781,0,6864
contig39	2202	.	G	A	8443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.329;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.346;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,218:458:99:8472,0,9313
contig39	2212	.	T	C	9442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.204;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.839;QD=19.04;ReadPosRankSum=-2.674;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,252:496:99:9471,0,9142
contig39	2737	.	T	C	8190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.556;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.623;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,225:469:99:8219,0,12128
contig39	2757	.	C	T	8127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.058;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.398;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,213:449:99:8156,0,12001
contig39	2957	.	C	T	8133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.265;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.187;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.001;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,215:389:99:8162,0,6937
contig39	2980	.	T	G	7250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.218;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=3.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.185;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.016;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,181:343:99:7279,0,6308
contig39	3050	.	T	C	10118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.290;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.022;QD=18.60;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,262:544:99:10147,0,11127
contig39	3053	.	T	C	10183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=1.828;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.139;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,259:540:99:10212,0,11173
contig39	3069	.	T	C	9415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.633;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.540;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.566;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,249:532:99:9444,0,10999
contig39	3200	.	A	T	7820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.947;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.366;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,260:526:99:7849,0,8448
contig39	3372	.	C	T	8182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.748;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.254;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,216:491:99:8211,0,10835
contig39	3376	.	G	A	8435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.121;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.759;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,212:479:99:8464,0,11065
contig39	3388	.	T	C	8121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=-0.414;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.033;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,216:486:99:8150,0,10634
contig39	3423	.	C	T	11511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.495;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.513;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,290:519:99:11540,0,8849
contig39	3425	.	C	T	11586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.725;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.051;QD=22.41;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,289:517:99:11615,0,8969
contig39	3436	.	A	G	11461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.830;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.586;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,282:527:99:11490,0,9729
contig39	3443	.	A	G	10959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.130;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.413;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,275:510:99:10988,0,9139
contig39	3482	.	G	A	8125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.663;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.863;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,253:481:99:8154,0,7338
contig39	5296	.	T	G	9685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.220;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.031;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,259:524:99:9714,0,10044
contig39	5315	.	T	A	9969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.470;ClippingRankSum=-1.714;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.023;QD=19.21;ReadPosRankSum=2.043;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,254:519:99:9998,0,10628
contig39	5330	.	G	A	9375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.072;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.398;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,239:494:99:9404,0,9973
contig39	5362	.	G	A	8252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.674;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.227;QD=15.40;ReadPosRankSum=2.305;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,271:536:99:8281,0,8051
contig39	5821	.	G	GA	9910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.871;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.720;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,293:591:99:9948,0,10197
contig39	6009	.	C	T	5136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.020;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.295;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.792;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,171:325:99:5165,0,4680
contig40	97	.	G	A	10105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.821;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.434;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,339:660:99:10134,0,9261
contig40	813	.	G	A	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=1.973;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.396;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.429;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,233:477:99:8783,0,9271
contig40	826	.	T	C	8364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;ClippingRankSum=-1.164;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.012;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,218:459:99:8393,0,9607
contig40	827	.	TA	T	8361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=-0.719;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.320;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,213:455:99:8399,0,9563
contig40	868	.	TA	T	4914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.032;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.770;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.014;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,214:430:99:4952,0,4964
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contig40	1414	.	T	C	12500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=-1.230;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.507;QD=18.94;ReadPosRankSum=2.691;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,325:660:99:12529,0,12762
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contig40	1778	.	C	T	12373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.948;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.125;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,325:614:99:12402,0,10953
contig40	1801	.	T	C	12290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.849;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.969;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,304:561:99:12319,0,10227
contig40	1804	.	C	T	12122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.299;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.579;QD=21.80;ReadPosRankSum=-1.712;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,307:556:99:12151,0,9809
contig40	1847	.	T	C	9198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.862;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.679;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.975;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,249:550:99:9227,0,11704
contig40	1861	.	T	C	9025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.950;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.856;QD=16.50;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,246:547:99:9054,0,11564
contig40	1911	.	T	A	3567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.597;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=4.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.212;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.658;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,100:350:99:3596,0,10157
contig40	1917	.	T	A	4072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.431;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.566;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.769;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,113:356:99:4101,0,10261
contig40	1925	.	T	TTTG	4967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-1.453;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.085;QD=12.00;ReadPosRankSum=4.355;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,140:414:99:5005,0,11322
contig40	1932	.	TTTTGGCTGC	T	4584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-0.471;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.084;QD=12.13;ReadPosRankSum=5.411;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,130:378:99:4622,0,10477
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contig40	2040	.	T	C	9051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.054;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.593;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,292:564:99:9080,0,8147
contig40	2069	.	C	T	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.068;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.768;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.449;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,259:553:99:10167,0,11529
contig40	2080	.	T	C	10461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.364;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,268:571:99:10490,0,12340
contig40	2096	.	C	T	10500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=-0.640;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.730;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,275:600:99:10529,0,12624
contig40	2136	.	T	C	9659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.585;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.061;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,328:623:99:9688,0,8775
contig40	2580	.	G	T	7979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.828;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.459;QD=16.19;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,251:493:99:8008,0,7553
contig40	2606	.	A	G	6513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.817;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.611;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,217:462:99:6542,0,7697
contig40	2648	.	T	C	8879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-0.766;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=7.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.074;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,234:484:99:8908,0,9610
contig40	2660	.	C	T	9489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.853;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.141;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.360;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,235:489:99:9518,0,10366
contig40	2678	.	T	C	9813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.221;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.467;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,243:506:99:9842,0,10756
contig40	2699	.	T	G	9742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.576;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.387;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,258:520:99:9771,0,9846
contig40	3404	.	T	C	11930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=0.201;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.519;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,313:630:99:11959,0,11938
contig40	3411	.	C	T	12061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.255;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.047;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,315:625:99:12090,0,11846
contig40	3448	.	A	G	12128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.280;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.709;QD=18.63;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,326:651:99:12157,0,12280
contig40	3471	.	A	G	12732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.175;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.506;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,342:694:99:12761,0,14407
contig40	3472	.	T	A	13648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.514;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.290;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,348:702:99:13677,0,10763
contig40	3961	.	G	A	12159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;ClippingRankSum=-1.332;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.093;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,310:628:99:12188,0,12630
contig40	3962	.	G	A	12195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.582;ClippingRankSum=-0.467;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.073;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,309:629:99:12224,0,12711
contig40	3976	.	T	A	12451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.168;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.224;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,313:625:99:12480,0,12370
contig40	3990	.	C	T	11910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.519;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.366;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,312:621:99:11939,0,12013
contig40	4018	.	G	A	8416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=-0.462;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.367;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,293:588:99:8445,0,9119
contig40	4050	.	C	T	8081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.416;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.825;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,277:574:99:8110,0,9369
contig40	4471	.	G	C	14342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=-0.845;DP=790;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.150;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:381,370:751:99:14371,0,16189
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contig40	5206	.	T	C	9163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=0.403;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.086;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,299:582:99:9192,0,8425
contig40	5438	.	T	TATCC	9015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=-1.269;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.640;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,233:450:99:9053,0,8319
contig40	5482	.	A	AC	6505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.470;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=13.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.253;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,246:473:99:6543,0,5954
contig40	5698	.	A	G	8463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.473;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.835;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,224:501:99:8492,0,10918
contig40	5707	.	G	T	8933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.351;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.600;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,223:510:99:8962,0,11532
contig40	5716	.	A	T	8817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.299;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.278;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,235:511:99:8846,0,10951
contig41	5920	.	G	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.817;ClippingRankSum=0.672;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=12.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.61;MQRankSum=-6.157;QD=2.40;ReadPosRankSum=2.315;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,41:212:99:538,0,5595
contig42	306	.	C	A	9412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.854;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.250;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.131;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,297:582:99:9441,0,8557
contig42	1402	.	A	T	7553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.478;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.130;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,239:496:99:7582,0,8194
contig42	2460	.	A	G	7692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.174;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.230;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,236:476:99:7721,0,7592
contig42	3771	.	G	A	7577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.261;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.368;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,245:478:99:7606,0,8800
contig42	4019	.	C	A	10957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.775;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.905;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.869;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,275:564:99:10986,0,12172
contig42	4023	.	G	A	11970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.514;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.064;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,293:590:99:11999,0,13597
contig42	4037	.	T	C	11150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-0.042;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.874;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,274:577:99:11179,0,14279
contig42	4039	.	A	G	10745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=0.178;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.539;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,273:574:99:10774,0,14099
contig42	4068	.	G	A	8466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.686;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.695;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,275:575:99:8495,0,9377
contig42	4116	.	A	G	10428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.733;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.022;QD=19.57;ReadPosRankSum=-1.656;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,278:533:99:10457,0,9860
contig42	4135	.	A	G	10874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.489;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.427;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,273:517:99:10903,0,10139
contig42	4145	.	C	T	10107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.313;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.466;QD=20.80;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,252:486:99:10136,0,9144
contig42	4347	.	A	G	7695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.839;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.007;QD=15.45;ReadPosRankSum=3.871;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,247:498:99:7724,0,7949
contig42	4545	.	CT	C	8257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.646;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.150;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.264;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,216:454:99:8295,0,9393
contig42	4554	.	T	C	8049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.397;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.505;QD=17.89;ReadPosRankSum=2.668;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,207:450:99:8078,0,9406
contig42	4601	.	C	CT	4749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.615;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.174;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,191:415:99:4787,0,5677
contig42	4656	.	T	G	8751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.024;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.627;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,230:474:99:8780,0,9456
contig42	4659	.	C	T	8767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=1.214;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,226:466:99:8796,0,9450
contig42	4736	.	GA	G	8145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.263;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.069;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,208:429:99:8183,0,8885
contig42	4743	.	G	A	8514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.597;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.066;QD=18.96;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,216:449:99:8543,0,9393
contig42	4748	.	C	CTT	8503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.232;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.494;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,211:444:99:8541,0,9298
contig42	4826	.	A	G	7186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.017;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.316;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,227:445:99:7215,0,6844
contig42	4866	.	A	G	7042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.968;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.158;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,225:471:99:7071,0,7951
contig42	4913	.	C	G	9923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=-0.600;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.871;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,252:537:99:9952,0,11133
contig42	4915	.	C	A	10043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.330;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.593;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,255:534:99:10072,0,11327
contig42	4930	.	C	G	10284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-1.190;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.549;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,268:565:99:10313,0,11302
contig42	5045	.	T	C	10314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=1.437;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.869;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,264:537:99:10343,0,10689
contig42	5047	.	C	T	10314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.196;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.611;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,265:537:99:10343,0,10689
contig42	5313	.	C	G	7126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.595;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.451;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,231:467:99:7155,0,7182
contig42	5668	.	C	T	8977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.187;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.583;QD=17.88;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,234:502:99:9006,0,14002
contig42	5678	.	A	G	8873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.620;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.404;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,230:483:99:8902,0,13524
contig42	5946	.	T	C	3108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.895;ClippingRankSum=-0.793;DP=903;ExcessHet=3.0103;FS=97.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-0.513;QD=6.50;ReadPosRankSum=-6.786;SOR=2.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,100:478:99:3137,0,15274
contig42	5952	.	C	T	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.579;ClippingRankSum=1.228;DP=879;ExcessHet=3.0103;FS=105.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=2.755;QD=6.82;ReadPosRankSum=-4.115;SOR=2.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,102:462:99:3178,0,14949
contig42	5961	.	G	A	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.946;ClippingRankSum=-0.534;DP=816;ExcessHet=3.0103;FS=130.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=1.622;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=2.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,102:414:99:3326,0,13046
contig43	73	.	A	G	6967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=2.003;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.362;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.684;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,231:474:99:6996,0,7446
contig43	674	.	T	A	9575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.901;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.093;QD=17.97;ReadPosRankSum=3.454;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,258:533:99:9604,0,17640
contig43	685	.	G	A	9010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.902;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.511;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,245:524:99:9039,0,17917
contig43	1100	.	C	T	10344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.441;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.701;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,267:526:99:10373,0,10100
contig43	1109	.	T	C	10679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.176;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=3.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.199;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,278:547:99:10708,0,10306
contig43	2338	.	T	TA	9338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-1.815;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.096;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,241:502:99:9376,0,10376
contig43	2348	.	G	A	9912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.318;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.259;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.734;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,262:558:99:9941,0,11326
contig43	4595	.	C	T	6602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.215;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.714;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,217:429:99:6631,0,6479
contig43	4608	.	C	T	6736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=-0.710;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.870;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.482;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,218:423:99:6765,0,6505
contig43	4922	.	C	T	9854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.428;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,253:464:99:9883,0,8278
contig43	4928	.	A	G	9971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.187;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.382;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,245:460:99:10000,0,8685
contig43	4952	.	G	T	8902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=-0.322;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.337;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,233:472:99:8931,0,8798
contig43	5096	.	T	C	6546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.162;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.142;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,214:454:99:6575,0,7198
contig43	5450	.	C	T	6469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.326;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.202;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,207:423:99:6498,0,6582
contig44	1278	.	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.405;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQRankSum=-2.370;QD=5.34;ReadPosRankSum=-2.197;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,7:26:99:167,0,668
contig44	1289	.	G	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.196;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQRankSum=-1.372;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.588;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,6:28:99:117,0,729
contig44	1342	.	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.516;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.00;MQRankSum=-1.746;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,11:32:99:299,0,637
contig44	1402	.	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.33;MQRankSum=0.133;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:286,0,336
contig44	1436	.	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.49;MQRankSum=-0.684;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.956;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:201,0,111
contig44	1446	.	C	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.49;MQRankSum=0.956;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.221;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:201,0,111
contig44	1460	.	C	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.19;MQRankSum=0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.380;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:58:142,0,58
contig45	5012	.	G	C	15.88	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.274;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.456;SOR=1.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:44:44,0,454
contig46	133	.	C	CT	8446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=-1.318;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.327;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,270:559:99:8484,0,9051
contig46	591	.	G	GC	4703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.229;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=8.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.634;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,165:361:99:4741,0,7647
contig46	595	.	G	T	6435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.012;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=7.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.877;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,167:359:99:6464,0,7710
contig46	620	.	A	G	5624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-0.958;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.905;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,171:303:99:5653,0,5141
contig46	648	.	GC	G	3285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.558;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.964;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,114:213:99:3323,0,2674
contig46	676	.	T	C	4361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.460;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.078;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.775;SOR=1.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,110:219:99:4390,0,4246
contig46	677	.	G	A	4399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=-0.402;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.565;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.178;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,109:215:99:4428,0,4285
contig46	679	.	ACGACC	A	4312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-1.592;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.607;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,109:214:99:4350,0,4371
contig46	695	.	CA	C	5866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.124;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=0.593;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,175:340:99:5904,0,5657
contig46	811	.	C	T	8991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.762;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.484;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,232:484:99:9020,0,10080
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contig46	1170	.	C	T	8769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.749;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.539;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,233:489:99:8798,0,9811
contig46	1376	.	G	GGTTGGCGCC	5351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.161;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.041;QD=19.11;ReadPosRankSum=-4.088;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,135:280:99:5389,0,5610
contig46	2286	.	C	T	7679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.086;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.432;QD=16.62;ReadPosRankSum=-1.100;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,212:462:99:7708,0,9480
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contig46	2374	.	T	C	8428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.915;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.026;QD=17.90;ReadPosRankSum=2.182;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,222:471:99:8457,0,9811
contig46	2382	.	AC	A	8769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.483;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.850;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,226:476:99:8807,0,10049
contig46	2394	.	T	G	8655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=-0.532;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.012;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,227:480:99:8684,0,9954
contig46	3596	.	A	T	11646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=1.488;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.986;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.335;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,304:591:99:11675,0,16086
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contig46	4208	.	G	C	7868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.408;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.964;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,208:441:99:7897,0,9135
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contig46	4249	.	T	C	7604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.015;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.754;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,209:470:99:7633,0,7995
contig46	4301	.	GCAGAA	G	7994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.834;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.213;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.069;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,208:457:99:8032,0,9816
contig46	4310	.	AGGG	A	8916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.814;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.947;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,218:467:99:8954,0,10261
contig46	4321	.	G	A	3889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=1.609;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.023;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,186:432:99:3918,0,10133
contig46	4332	.	T	C	8791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.702;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.954;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,230:463:99:8820,0,8941
contig46	4542	.	T	A	8649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.412;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.538;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.989;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,221:480:99:8678,0,10280
contig46	4546	.	C	G	8900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-1.679;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.466;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,226:483:99:8929,0,10476
contig46	4562	.	G	A	9200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.682;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.276;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.791;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,229:482:99:9229,0,10500
contig46	4566	.	A	T	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.692;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.036;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,229:480:99:9040,0,10221
contig46	4571	.	G	A	9104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.702;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.721;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,225:471:99:9133,0,10123
contig46	4588	.	AC	A	8576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=-1.917;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.655;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,212:466:99:8614,0,10369
contig46	4591	.	A	C	8468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=1.629;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.227;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,206:458:99:8497,0,10252
contig46	4594	.	CCT	C	8198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=-0.068;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.801;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,204:461:99:8236,0,10396
contig46	4606	.	T	C	8426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=-0.247;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=2.507;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,209:462:99:8455,0,10255
contig46	4610	.	T	G	8714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.112;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-0.690;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,215:466:99:8743,0,10318
contig46	4617	.	T	C	8945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=1.133;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=0.943;QD=19.03;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,228:470:99:8974,0,10009
contig46	4619	.	GC	G	9041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.069;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=0.772;QD=19.16;ReadPosRankSum=-1.034;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,227:472:99:9079,0,10294
contig46	4642	.	A	C	9500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.699;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.007;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,235:498:99:9529,0,10429
contig46	4651	.	T	G	9632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=2.640;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.365;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.199;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,237:507:99:9661,0,10921
contig46	4668	.	G	C	9980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.049;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.032;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,249:518:99:10009,0,10729
contig46	4677	.	T	C	10237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=2.087;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.748;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.690;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,255:514:99:10266,0,10386
contig46	4681	.	C	T	10091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.004;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.200;QD=19.44;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,256:519:99:10120,0,10188
contig46	4682	.	A	C	7625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-1.204;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.070;QD=14.78;ReadPosRankSum=-1.233;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,253:516:99:7654,0,10408
contig46	4715	.	GA	G	10873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.720;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.634;QD=20.79;ReadPosRankSum=-2.348;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,276:523:99:10911,0,9833
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contig46	4721	.	T	C	11093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.191;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.692;QD=20.74;ReadPosRankSum=-1.336;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,277:535:99:11122,0,10272
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contig46	4748	.	G	A	10328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-0.264;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.820;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,261:532:99:10357,0,10950
contig46	4751	.	T	C	9995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=-2.091;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.091;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,252:523:99:10024,0,10626
contig46	4990	.	GACTATCTAAAGTAAAAGAGGAAGTTAC	G	10099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.951;ClippingRankSum=-0.748;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.414;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,271:621:99:10137,0,13793
contig46	5056	.	T	C	9676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.688;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.048;QD=16.57;ReadPosRankSum=6.137;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,313:584:99:9705,0,8655
contig47	168	.	T	C	8357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-0.271;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.654;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.035;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,214:450:99:8386,0,9135
contig47	171	.	C	T	8281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.355;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.787;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.860;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,213:448:99:8310,0,9242
contig47	275	.	GT	G	10817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=1.242;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.339;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,296:482:99:10855,0,3479
contig47	277	.	T	A	5036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-1.521;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.076;QD=10.20;ReadPosRankSum=3.313;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,243:494:99:5065,0,9215
contig47	379	.	A	G	8992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.695;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.160;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.354;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,232:469:99:9021,0,10370
contig47	380	.	T	C	8992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.270;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.309;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.404;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,235:475:99:9021,0,10370
contig47	1796	.	G	T	9974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=1.273;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.318;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,254:493:99:10003,0,9279
contig47	1797	.	T	C	9974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.971;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.064;QD=20.11;ReadPosRankSum=-2.021;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,256:496:99:10003,0,9279
contig47	1845	.	C	T	8919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.180;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.077;QD=18.82;ReadPosRankSum=-2.008;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,241:474:99:8948,0,8772
contig47	1862	.	C	T	8722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.520;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.580;QD=19.47;ReadPosRankSum=-1.540;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,229:448:99:8751,0,8384
contig47	2056	.	C	T	8425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=-1.274;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.869;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,301:558:99:8454,0,7405
contig47	2073	.	ATCATCC	A	8592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.480;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.788;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,226:511:99:8630,0,11430
contig47	2093	.	C	G	9590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.379;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.638;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,257:571:99:9619,0,12017
contig47	2138	.	G	A	9564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.451;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.692;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.053;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,250:522:99:9593,0,10697
contig47	2142	.	T	C	9787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.280;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.070;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,249:522:99:9816,0,11055
contig47	2165	.	C	A	9407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.365;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.737;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,250:526:99:9436,0,10379
contig47	2614	.	G	A	10849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-0.664;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.829;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.441;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,284:559:99:10878,0,10587
contig47	2630	.	A	T	10418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=1.233;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.196;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.813;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,275:553:99:10447,0,10489
contig47	2717	.	C	T	9640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.382;ClippingRankSum=1.004;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.072;QD=18.87;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,251:511:99:9669,0,11670
contig47	2727	.	TAA	T	10047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=1.094;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.845;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.808;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,259:531:99:10085,0,12529
contig47	2730	.	A	G	10152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.657;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.614;QD=19.23;ReadPosRankSum=2.394;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,258:528:99:10181,0,12448
contig47	2740	.	C	A	10350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=1.107;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.041;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,267:533:99:10379,0,12257
contig47	4317	.	A	T	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.263;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.849;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,244:509:99:9356,0,10385
contig47	4323	.	G	A	9516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.109;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.069;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.420;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,243:507:99:9545,0,10704
contig47	4331	.	C	T	9338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.105;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.257;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,233:484:99:9367,0,10357
contig47	4344	.	A	G	9408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=1.492;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.578;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,235:484:99:9437,0,10297
contig47	4357	.	T	A	9134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.050;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.117;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.693;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,235:475:99:9163,0,9469
contig47	4974	.	A	G	9694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.121;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.664;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,315:600:99:9723,0,8465
contig47	5131	.	T	C	8228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.812;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.107;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.051;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,261:489:99:8257,0,6952
contig47	5145	.	T	A	7958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.136;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.477;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,253:485:99:7987,0,6996
contig47	5260	.	A	C	8320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.718;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=10.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.995;QD=18.21;ReadPosRankSum=2.732;SOR=1.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,215:457:99:8349,0,9460
contig47	5265	.	C	T	8478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.357;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=13.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.199;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.646;SOR=1.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,219:459:99:8507,0,9384
contig47	5341	.	AAT	A	7033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=1.210;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.939;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,182:409:99:7071,0,8904
contig47	5353	.	C	T	7358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-1.919;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.676;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,198:415:99:7387,0,8499
contig47	5391	.	G	C	6521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-1.190;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=6.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.138;QD=16.81;ReadPosRankSum=-2.537;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,215:388:99:6550,0,5191
contig49	54	.	AT	A	875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.184;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.625;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.620;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:64,40:104:99:913,0,1726
contig49	221	.	GT	G	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.945;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.533;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.467;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,21:86:99:461,0,1902
contig49	1890	.	C	CT	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-1.475;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.489;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.598;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,23:65:99:622,0,1297
contig49	1928	.	A	ACG	1029.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.172;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.276;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,26:60:99:1067,0,1442
contig49	1931	.	TTC	T	1026.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=-1.404;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.104;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,28:63:99:1064,0,1484
contig49	1938	.	T	TC	1050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-0.066;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.016;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,27:56:99:1088,0,1194
contig49	1944	.	T	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.081;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.086;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,28:58:99:1062,0,881
contig49	1974	.	G	GA	1075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-0.205;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.300;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.186;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,28:50:99:1113,0,897
contig49	1977	.	G	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.331;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=5.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.596;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.312;SOR=1.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,28:51:99:1113,0,897
contig49	2197	.	C	T	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.003;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.632;QD=17.01;ReadPosRankSum=2.153;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,34:74:99:1287,0,2667
contig49	2199	.	T	C	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.147;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.192;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,33:72:99:1287,0,2667
contig49	4025	.	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.451;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.036;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.543;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,21:78:99:558,0,1882
contig49	5355	.	T	TC	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.400;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.030;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.155;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,21:91:99:672,0,5324
contig49	5356	.	T	TTG	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=-0.532;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.042;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:70,21:91:99:672,0,5324
contig51	1768	.	C	A	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=1.274;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=12.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.764;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=2.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:38:38,0,452
contig52	3047	.	C	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-1.164;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQRankSum=-3.387;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:264,0,693
contig52	3054	.	A	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.60;MQRankSum=-3.387;QD=14.92;ReadPosRankSum=-3.387;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:267,0,659
contig53	80	.	T	C	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.64;QD=34.68;SOR=8.862	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:3933,265,0
contig53	97	.	A	C	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.08;QD=34.10;SOR=9.308	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,104:104:99:4499,313,0
contig53	1959	.	TGGAAG	T	536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=33.70;SOR=5.283	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:40:574,40,0
contig53	1967	.	TCTACCTGTCCGTTTTCTGCCATCGA	T	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=28.89;SOR=5.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:572,39,0
contig53	1995	.	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=33.43;SOR=4.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:540,36,0
contig53	2001	.	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.91;SOR=4.615	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
contig53	2893	.	G	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.09;SOR=5.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:581,57,0
contig54	1168	.	T	TG	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.75;QD=34.75;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
contig54	1170	.	ATTTTCTAGTAAT	A	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.75;QD=34.75;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
contig54	1243	.	T	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.15;QD=30.57;SOR=6.666	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:99:1469,99,0
contig54	1266	.	T	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.52;QD=34.23;SOR=7.784	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2091,144,0
contig54	2887	.	C	T	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=22.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
contig54	3004	.	GATGCCAGAAAACGGACAGATGGAGAATAGT	G	2865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;QD=26.94;SOR=8.608	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:2903,221,0
contig54	3634	.	A	G	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;QD=30.84;SOR=7.378	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1231,117,0
contig54	4854	.	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=-0.227;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=105.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.23;MQRankSum=-3.412;QD=0.67;ReadPosRankSum=-3.516;SOR=2.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,12:83:84:84,0,4442
contig55	74	.	A	T	8019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=-0.900;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.694;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,216:440:99:8048,0,8435
contig55	89	.	C	G	7810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.767;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.074;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,208:442:99:7839,0,8847
contig55	1175	.	T	G	7894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.831;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.502;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,205:415:99:7923,0,9121
contig55	1188	.	C	A	8357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.199;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.405;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,223:448:99:8386,0,9467
contig55	1531	.	A	G	8643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.584;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.153;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,230:479:99:8672,0,9565
contig55	1551	.	C	T	9879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=1.562;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.403;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,245:509:99:9908,0,10627
contig55	1575	.	G	T	9418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.656;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.614;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,247:498:99:9447,0,9566
contig55	1968	.	T	A	8873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-0.160;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.945;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,239:488:99:8902,0,9554
contig55	1985	.	C	T	9641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-1.346;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.092;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,241:486:99:9670,0,9847
contig55	1996	.	C	A	10278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.198;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.287;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,251:482:99:10307,0,9393
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contig55	2952	.	A	G	7496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=1.519;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.331;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,237:453:99:7525,0,8207
contig55	2982	.	A	G	6442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.906;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.262;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,203:431:99:6471,0,7248
contig55	3010	.	TACTAAATA	T	8223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=1.337;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.867;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,213:407:99:8261,0,7394
contig55	3485	.	G	A	9628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.612;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.992;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.336;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,250:485:99:9657,0,9141
contig55	3499	.	G	A	9774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.108;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=2.508;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,247:497:99:9803,0,10235
contig55	3515	.	TACATCTAACACAGGGAAGC	T	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.723;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=5.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-4.331;QD=0.91;ReadPosRankSum=-4.697;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,36:294:99:306,0,10867
contig55	3517	.	C	T	9575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.168;ClippingRankSum=-0.200;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=3.696;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,242:481:99:9604,0,9388
contig55	3519	.	T	G	9749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;ClippingRankSum=-0.524;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=2.244;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.764;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,234:473:99:9778,0,9292
contig55	3524	.	CACAGGGAAGCACATCTAACACAGGGAAGCACATCTAACACAGGGAAGCACATCTAACACAGGG	C	9433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.567;ClippingRankSum=1.341;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=5.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=1.064;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.045;SOR=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,232:610:99:9471,0,15330
contig55	3594	.	A	T	9975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.478;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=3.031;QD=20.74;ReadPosRankSum=-7.967;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,245:481:99:10004,0,9626
contig55	3605	.	G	A	9645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.620;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=4.402;QD=19.14;ReadPosRankSum=-9.772;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,246:504:99:9674,0,9790
contig57	749	.	TCCGGTCTTCTCGAGAAGCTCGGGGTCCATCTGGACC	T	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.672;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=19.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.045;QD=3.27;ReadPosRankSum=-1.395;SOR=3.224	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:106,0,3875
contig63	857	.	A	G	4722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.432;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.970;QD=13.16;ReadPosRankSum=3.402;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,158:359:99:4751,0,6187
contig63	1088	.	G	A	7090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.540;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.894;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,184:369:99:7119,0,7878
contig63	1100	.	G	A	6835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.468;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.867;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,185:373:99:6864,0,8001
contig63	1136	.	C	T	5868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=1.402;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.201;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.601;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,196:390:99:5897,0,6186
contig63	3086	.	G	C	5600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.907;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.882;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,181:330:99:5629,0,4482
contig63	3715	.	C	T	8759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.086;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.699;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,227:484:99:8788,0,10054
contig63	3720	.	T	G	9175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.595;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.064;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,228:485:99:9204,0,10374
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contig63	4147	.	TA	T	8861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.179;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.422;QD=20.95;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,221:423:99:8899,0,7909
contig63	4158	.	C	A	9155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.879;ClippingRankSum=1.056;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.652;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,233:453:99:9184,0,8793
contig63	4160	.	T	C	9116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.178;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.763;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,232:452:99:9145,0,8626
contig63	4204	.	CT	C	6587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-0.883;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.100;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,226:448:99:6625,0,6465
contig63	4231	.	C	T	7399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.068;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.752;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,202:425:99:7428,0,8694
contig63	4249	.	C	A	7178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.454;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.294;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,197:440:99:7207,0,9152
contig64	4376	.	G	T	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.691;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:45:45,0,672
contig64	4384	.	G	T	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.104;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,672
contig68	59	.	A	G	6267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.248;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=18.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.340;QD=24.11;ReadPosRankSum=2.707;SOR=1.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:99,161:260:99:6296,0,6177
contig68	76	.	C	T	7097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-1.708;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=26.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.218;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=1.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,184:320:99:7126,0,6954
contig68	190	.	AT	A	680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-4.453;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=5.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.166;QD=1.95;ReadPosRankSum=-4.328;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,99:349:99:718,0,9641
contig68	196	.	T	A	3767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=1.072;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=3.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.445;QD=9.47;ReadPosRankSum=8.591;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,187:398:99:3796,0,8028
contig68	197	.	T	A	3767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-2.018;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.023;QD=9.30;ReadPosRankSum=8.226;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,191:405:99:3796,0,8028
contig68	1200	.	A	T	11087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.234;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,283:554:99:11116,0,10497
contig68	1203	.	T	C	11214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=1.183;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.718;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,281:551:99:11243,0,10921
contig68	1221	.	C	G	11100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=1.765;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.765;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=1.006	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,276:542:99:11129,0,10557
contig68	1227	.	A	G	10745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.484;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.861;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,279:546:99:10774,0,10141
contig68	1343	.	C	T	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.721;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.403;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.479;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,300:677:99:11450,0,14791
contig68	1346	.	C	T	11387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.366;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.832;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.949;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,298:665:99:11416,0,14838
contig68	2378	.	C	T	9451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-1.318;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.107;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.350;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,312:676:99:9480,0,14186
contig68	2379	.	A	G	12186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.830;ClippingRankSum=-0.220;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.076;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,320:680:99:12215,0,14095
contig68	2463	.	A	AT	2818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-0.739;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.187;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,165:389:99:2856,0,4306
contig68	2552	.	G	A	9210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=2.035;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.454;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,241:478:99:9239,0,8927
contig68	2572	.	A	T	10311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=1.318;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.296;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,282:550:99:10340,0,9653
contig68	3046	.	C	T	10380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.679;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.149;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,265:546:99:10409,0,15954
contig68	3049	.	T	C	10354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.536;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.409;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,270:562:99:10383,0,16070
contig68	3706	.	C	T	9689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.044;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.456;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,252:481:99:9718,0,12580
contig68	3720	.	A	G	10065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.406;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.686;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,252:492:99:10094,0,14307
contig68	3724	.	C	T	9795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.154;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.016;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,249:482:99:9824,0,14002
contig68	3819	.	T	G	7551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-2.218;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.234;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,244:517:99:7580,0,8613
contig68	3919	.	T	C	10253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.098;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.373;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,265:562:99:10282,0,11791
contig68	3922	.	T	A	10649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.305;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.457;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,265:559:99:10678,0,12050
contig68	3926	.	A	G	10960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.872;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-0.420;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.293;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,264:554:99:10989,0,12204
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contig68	3939	.	T	C	10390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.176;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=0.084;QD=18.69;ReadPosRankSum=1.939;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,271:556:99:10419,0,11224
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contig73	1205	.	G	T	3963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.197;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.046;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,107:228:99:3992,0,4719
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contig73	2147	.	A	G	6480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-1.049;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.085;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,176:367:99:6509,0,8777
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contig74	1074	.	G	A	8171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.923;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=6.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.771;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,216:405:99:8200,0,7042
contig74	1086	.	A	G	8518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.174;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=7.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.098;QD=22.48;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:172,207:379:99:8547,0,7075
contig74	1098	.	C	T	7549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=-1.906;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.000;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,188:351:99:7578,0,6263
contig74	1164	.	C	T	8091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-1.996;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.399;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.962;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,202:353:99:8120,0,5738
contig74	1167	.	C	T	8210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.820;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=0.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.404;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,197:349:99:8239,0,5846
contig74	1173	.	G	A	7752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.617;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.114;QD=22.41;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,195:346:99:7781,0,5834
contig74	1227	.	G	A	8048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.469;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=5.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.886;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,204:374:99:8077,0,6524
contig74	1239	.	G	A	8342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;ClippingRankSum=0.368;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=13.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.204;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,207:385:99:8371,0,6983
contig74	1254	.	C	T	8379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.564;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=16.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.794;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,205:386:99:8408,0,7048
contig74	1275	.	A	G	7384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-1.170;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=8.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.661;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.652;SOR=1.060	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,195:397:99:7413,0,7568
contig74	1308	.	G	A	5333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-1.768;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=10.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.636;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.033;SOR=1.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,174:364:99:5362,0,6108
contig74	1371	.	T	C	4927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.738;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=12.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.112;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.532;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,130:321:99:4956,0,12036
contig74	1385	.	A	G	4826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.099;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=4.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.121;QD=14.81;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,134:326:99:4855,0,11936
contig74	1524	.	T	C	4959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.590;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=9.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.221;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=1.108	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,157:339:99:4988,0,5861
contig76	71	.	T	A	8868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=-1.438;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.540;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.212;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,241:461:99:8897,0,8210
contig76	94	.	C	T	9502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-0.948;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.335;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,257:509:99:9531,0,9216
contig76	142	.	T	G	12767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=-0.454;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.142;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,329:630:99:12796,0,11640
contig76	150	.	C	T	12630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.708;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.496;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,327:641:99:12659,0,12023
contig76	225	.	CATATTATGAATACACACAGTATGGTATGTCCGCAGTATAGTAACTACTTAGTTCTTGCTTATAGTATAGCAATACTTAGTTCCTGCTT	C	17085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.763;ClippingRankSum=-0.825;DP=1199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-3.368;QD=14.54;ReadPosRankSum=3.850;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:709,466:1175:99:17123,0,28348
contig76	333	.	A	T	19185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.201;DP=881;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-4.273;QD=22.23;ReadPosRankSum=-8.930;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,498:863:99:19214,0,13497
contig76	501	.	A	G	12204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=2.486;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.003;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,317:632:99:12233,0,12290
contig76	507	.	A	C	12198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.612;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.522;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,308:622:99:12227,0,12677
contig76	514	.	T	C	11749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.734;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.299;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,297:605:99:11778,0,12858
contig76	522	.	GTC	G	9069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=1.106;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.259;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,282:602:99:9107,0,12793
contig76	596	.	C	CAA	10333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.973;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.773;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.690;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,248:514:99:10371,0,10551
contig76	612	.	G	A	10758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=-0.175;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.303;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,272:536:99:10787,0,10608
contig76	615	.	C	T	10567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.770;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.185;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,264:528:99:10596,0,10312
contig76	643	.	C	T	9980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.305;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.245;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,257:497:99:10009,0,9271
contig76	656	.	T	TTA	10340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.178;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.044;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,258:513:99:10378,0,10039
contig76	675	.	G	T	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.860;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.074;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.915;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,261:522:99:10315,0,10540
contig76	676	.	A	G	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.843;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.324;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,260:523:99:10315,0,10540
contig76	698	.	A	G	9781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.512;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.420;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,249:512:99:9810,0,10530
contig76	714	.	C	G	9208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=1.178;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.588;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.127;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,246:502:99:9237,0,9884
contig76	740	.	C	T	6989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=1.758;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.226;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.579;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,236:486:99:7018,0,7652
contig76	903	.	A	G	13251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.908;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.254;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,338:701:99:13280,0,14208
contig76	906	.	G	A	13697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.721;DP=752;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.335;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,344:707:99:13726,0,14442
contig76	924	.	A	G	13644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.713;DP=796;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.724;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:391,362:753:99:13673,0,16194
contig76	1431	.	A	G	6910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.409;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.253;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,231:502:99:6939,0,8321
contig76	1875	.	T	C	5953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=-1.476;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.142;QD=15.63;ReadPosRankSum=3.282;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,190:381:99:5982,0,5863
contig76	2051	.	G	A	5301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;ClippingRankSum=0.123;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=9.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.321;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.222;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,177:326:99:5330,0,4646
contig76	2091	.	C	T	5670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.271;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=8.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.749;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:130,149:279:99:5699,0,4892
contig76	2100	.	G	C	6024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.190;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=11.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.143;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.854;SOR=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,145:268:99:6053,0,4766
contig76	2103	.	G	C	5792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.473;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=10.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.446;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,149:271:99:5821,0,4616
contig77	1281	.	G	T	12.99	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.934;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.255;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:41:41,0,446
contig77	2803	.	G	T	12.05	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.456;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:40:40,0,442
contig81	1023	.	C	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.529;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.423;SOR=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:65:65,0,561
contig82	505	.	C	A	11126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=2.516;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.050;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,288:569:99:11155,0,10806
contig82	510	.	T	G	11022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.333;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.359;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.264;SOR=0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,283:559:99:11051,0,10870
contig82	1531	.	G	A	6623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.103;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=6.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.536;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,180:371:99:6652,0,9396
contig82	1541	.	A	T	6754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.508;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=15.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.392;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.335	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,181:385:99:6783,0,9847
contig82	1552	.	A	G	6372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.652;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.090;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,207:426:99:6401,0,6883
contig82	2249	.	T	C	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.222;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.518;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.026;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,53:165:99:1770,0,4495
contig82	2260	.	T	C	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-0.607;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.132;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.310;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,46:158:99:1627,0,4478
contig84	2198	.	G	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.118;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.354;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,333
contig86	2069	.	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.794;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=14.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.042;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=2.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,3:25:60:60,0,1039
contig86	2071	.	CG	C	16.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.161;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=14.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.562;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.125;SOR=2.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:54:54,0,1123
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contig86	2093	.	T	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.055;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=10.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.273;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.273;SOR=2.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,2:23:57:57,0,1110
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contig89	227	.	T	C	8311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.594;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.613;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.560;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,269:547:99:8340,0,8515
contig89	289	.	T	TAA	6345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.614;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.025;QD=15.00;ReadPosRankSum=-1.836;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,218:423:99:6383,0,6311
contig89	324	.	T	C	9906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=-0.892;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.566;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,259:518:99:9935,0,9541
contig89	344	.	A	C	10416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.213;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.175;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,282:540:99:10445,0,9472
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contig89	543	.	C	T	8348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.674;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.051;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,268:505:99:8377,0,7220
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contig89	1161	.	T	C	8176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.412;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.282;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,219:456:99:8205,0,8786
contig89	1281	.	T	C	3828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.444;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.009;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,128:248:99:3857,0,3531
contig89	1560	.	G	T	6954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.614;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.689;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,183:387:99:6983,0,8071
contig89	1562	.	CACAACGGGG	C	7057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=-1.411;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.130;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,183:406:99:7095,0,8817
contig89	1589	.	G	A	8085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=1.210;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.444;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,201:414:99:8114,0,8617
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contig89	2223	.	C	T	7386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.511;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.795;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,236:475:99:7415,0,7685
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contig89	2322	.	T	A	8085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.595;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.952;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,271:549:99:8114,0,8340
contig89	2359	.	CTG	C	8111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.182;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.013;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,219:486:99:8149,0,10442
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contig89	2395	.	G	A	8570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.699;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.632;QD=21.11;ReadPosRankSum=5.883;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,217:406:99:8599,0,7295
contig90	511	.	C	A	18.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.537;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.322;QD=1.57;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:47:47,0,374
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contig95	1011	.	C	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=11.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-2.725;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.014;SOR=2.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:60:60,0,610
contig95	1027	.	C	CA	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.072;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=13.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-2.670;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=2.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:91:91,0,494
contig95	1030	.	G	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.673;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-2.691;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:99:126,0,576
contig95	1032	.	GGC	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-1.752;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=16.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-3.027;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=3.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:126,0,576
contig95	1036	.	G	GA	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.510;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=18.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-3.001;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=3.224	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:168,0,573
contig95	1045	.	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-1.528;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=19.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-3.287;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.694;SOR=3.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:165,0,615
contig95	1051	.	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.900;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=18.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-3.633;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.167;SOR=3.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:198,0,738
contig95	1052	.	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.833;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=18.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-3.633;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.100;SOR=3.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:198,0,738
contig95	1053	.	G	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.100;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=18.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-3.633;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.300;SOR=3.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:198,0,738
contig95	1056	.	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.105;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=18.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-3.606;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.575;SOR=3.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:201,0,696
contig95	1063	.	A	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.129;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=17.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.542;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.596;SOR=3.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:207,0,612
contig95	1065	.	C	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.817;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=17.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.542;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.596;SOR=3.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:207,0,612
contig95	1066	.	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.428;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=17.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.542;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.674;SOR=3.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:207,0,612
contig95	1067	.	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.506;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=17.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.542;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.752;SOR=3.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:207,0,612
contig95	1091	.	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=1.528;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=21.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-3.873;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.959;SOR=4.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:342,0,477
contig95	1092	.	G	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.249;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=21.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-3.873;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=4.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:342,0,477
contig95	1096	.	T	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.688;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=21.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-3.802;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=4.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:297,0,522
contig95	1098	.	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-1.774;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=21.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-3.802;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=4.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:297,0,522
contig95	1105	.	T	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.733;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=18.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-3.742;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=4.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:294,0,564
contig95	1106	.	C	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=-0.326;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-3.802;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=4.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:297,0,522
contig95	1107	.	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.195;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-3.802;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=4.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:291,0,606
contig95	1110	.	G	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.155;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=12.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-3.606;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.435;SOR=3.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:285,0,690
contig95	1113	.	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.767;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=12.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-3.633;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.100;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:198,0,738
contig95	1117	.	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-0.078;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=9.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-3.369;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.410;SOR=3.407	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:198,0,738
contig95	1119	.	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=-0.708;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-3.391;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.379;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:156,0,741
contig95	1120	.	A	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.112;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-3.391;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.006;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:156,0,741
contig95	1121	.	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.261;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=9.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-3.391;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.081;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:156,0,741
contig95	1135	.	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-0.638;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-3.107;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=2.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:106,0,744
contig95	1140	.	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-0.478;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-2.775;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:69:69,0,789
contig97	1532	.	G	GAGCGCCTGCGCGGCACGTTCCCAGCTCCAGACGTCGTTCACGC	124.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=27.71;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:10:161,10,0
contig101	1319	.	C	A	12.99	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.639;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.187;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.917;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,456
contig103	1697	.	G	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.555;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-1.664;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:64:64,0,293
contig103	1724	.	C	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.778;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-1.626;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.485;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:125,0,586
contig103	1735	.	C	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.107;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-2.256;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,683
contig103	1736	.	G	C	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.322;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-2.256;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,683
contig103	1746	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.158;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-1.739;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,1:11:54:54,0,601
contig103	1747	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.474;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-1.739;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,1:11:54:54,0,601
contig105	363	.	C	T	6531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.928;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.777;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,220:427:99:6560,0,6092
contig105	385	.	C	T	8572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.818;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.377;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,222:432:99:8601,0,8165
contig105	388	.	G	C	8534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.482;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.083;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,216:426:99:8563,0,8149
contig105	484	.	C	T	6776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.440;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.675;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,236:503:99:6805,0,7853
contig105	1956	.	C	CT	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.481;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=12.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=1.016;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=1.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,83:103:48:1774,0,48
contig107	54	.	C	A	4326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.946;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.517;QD=20.51;ReadPosRankSum=3.200;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:98,113:211:99:4355,0,3798
contig107	60	.	A	G	4250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=1.567;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=3.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.439;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.716;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,109:209:99:4279,0,3859
contig107	123	.	G	A	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=-0.489;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=11.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.363;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.535;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,70:149:99:2560,0,3040
contig107	135	.	T	C	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.400;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=13.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.752;QD=18.84;ReadPosRankSum=-2.103;SOR=0.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,52:113:99:2157,0,2463
contig107	147	.	G	A	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-0.039;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=7.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.699;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.312;SOR=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,41:92:99:1545,0,2037
contig107	219	.	A	G	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.209;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=11.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.150;QD=18.41;ReadPosRankSum=-2.000;SOR=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,67:133:99:2477,0,2510
contig107	233	.	T	C	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.695;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=13.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.117;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.188	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,60:128:99:2381,0,2641
contig107	234	.	G	A	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=1.282;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=13.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.401;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.188	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,60:128:99:2307,0,2647
contig107	360	.	G	A	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-1.001;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=6.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.320;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.207;SOR=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,73:147:99:2037,0,2113
contig107	378	.	C	T	2402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=1.270;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.516;QD=14.74;ReadPosRankSum=-2.431;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:73,90:163:99:2431,0,2045
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contig107	1542	.	C	T	7319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=1.564;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=8.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.660;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,181:346:99:7348,0,6493
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contig107	1833	.	T	G	8292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.697;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.249;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.255;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,206:394:99:8321,0,8984
contig107	1834	.	G	A	8409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.128;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=8.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.576;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,206:393:99:8438,0,9192
contig107	1842	.	T	C	8595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=1.228;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=7.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.239;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.013;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,213:398:99:8624,0,9227
contig107	1851	.	A	G	8531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=-1.197;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=6.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.692;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,208:387:99:8560,0,9199
contig107	1869	.	T	C	8244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=-0.624;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=35.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.595;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,214:388:99:8273,0,8438
contig107	1902	.	A	G	7551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-1.818;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=45.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-0.118;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.951;SOR=0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,192:341:99:7580,0,8855
contig107	1908	.	C	T	7774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.410;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=44.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=1.092;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,195:347:99:7803,0,9037
contig107	1920	.	A	G	7098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.361;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=28.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=-0.699;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,177:313:99:7127,0,8353
contig109	832	.	G	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.278;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.198;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.040;SOR=2.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,11:32:99:385,0,2780
contig109	839	.	A	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.027;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=13.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.717;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=2.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:317,0,2889
contig109	841	.	C	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.528;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=10.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=1.694;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=2.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:279,0,2892
contig109	850	.	C	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=1.354;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=13.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-0.982;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.558;SOR=2.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:317,0,2917
contig109	859	.	C	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.108;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=10.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.808;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.054;SOR=3.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:314,0,2952
contig110	428	.	C	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.589;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:246,0,1204
contig110	429	.	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.589;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:246,0,1204
contig110	436	.	G	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:246,0,1204
contig110	440	.	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:243,0,1597
contig110	441	.	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.067;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:243,0,1597
contig110	457	.	CGCG	C	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=1.034;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.278;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,3609
contig110	466	.	C	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.382;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.978;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,3612
contig110	468	.	T	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.382;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.106;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,3612
contig110	485	.	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.268;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,3952
contig110	489	.	C	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.296;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=2.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,4351
contig110	490	.	G	C	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=9.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.822;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=2.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,4351
contig110	611	.	G	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.118;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.825;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=2.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:48:48,0,498
contig110	616	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.118;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-2.003;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=2.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,372
contig110	624	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.354;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.825;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.118;SOR=2.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,415
contig110	628	.	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.370;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-1.849;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=2.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,435
contig110	637	.	G	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.566;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.708;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=2.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,435
contig110	649	.	G	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-1.977;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=3.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:186,0,461
contig110	652	.	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.194;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-1.614;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=2.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:223,0,458
contig110	653	.	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.743;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-1.872;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=2.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:223,0,458
contig110	672	.	TAC	T	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.318;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-1.694;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.106;SOR=2.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:267,0,505
contig110	676	.	CGCCGCCGCTGCCGCCGAGG	C	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-2.536;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=1.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:258,0,631
contig110	706	.	G	GCAGGCCAA	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-1.845;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.528;QD=15.45;ReadPosRankSum=-1.528;SOR=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:300,0,636
contig110	713	.	GC	G	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-0.688;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.036;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.377;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:291,0,761
contig110	715	.	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.549;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.065;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:291,0,761
contig110	718	.	C	CCG	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.420;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.420;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:312,0,758
contig110	725	.	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=1.065;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.290;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.692;SOR=0.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:270,0,671
contig110	985	.	G	C	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=1.401;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=10.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.207;SOR=1.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,23:50:99:632,0,905
contig110	1247	.	G	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-0.714;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.501;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:37:99:641,0,1123
contig110	1270	.	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.018;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.091;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:508,0,1076
contig110	1651	.	C	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.153;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.284;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.637;SOR=0.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:479,0,428
contig110	1911	.	TCTG	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.648;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-1.709;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:225,0,360
contig110	1918	.	G	GACC	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-1.355;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-1.237;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=0.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:225,0,360
contig110	1936	.	C	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.296;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-0.296;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.166;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:90:90,0,285
contig111	902	.	G	GGGTCGACCAGGACGGCCGGGCAGGCACTCGCGATATATCTCGTTCCGCCAGACACGATATA	18.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.161;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=6.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-2.809;QD=0.72;ReadPosRankSum=-2.568;SOR=2.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:56:56,0,6089
contig113	1727	.	G	T	12.05	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.369;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.274;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:40:40,0,451
contig121	1247	.	C	A	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.589;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.061;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,234
contig122	830	.	C	T	11063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=-0.344;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.189;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,287:591:99:11092,0,12159
contig122	832	.	GCGAGTACT	G	11000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.014;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.258;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,283:607:99:11038,0,12915
contig122	866	.	A	G	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=-1.351;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.601;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,290:620:99:11325,0,13011
contig122	870	.	A	G	12033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.422;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.589;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,299:627:99:12062,0,13388
contig122	894	.	T	C	11564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.538;DP=701;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.295;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.591;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,313:667:99:11593,0,13177
contig122	921	.	C	T	9575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.817;ClippingRankSum=-0.865;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.711;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.982;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,325:672:99:9604,0,10801
contig122	1065	.	C	T	9399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.841;ClippingRankSum=1.134;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.139;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,244:483:99:9428,0,9097
contig122	1074	.	C	T	9107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=2.153;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.243;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,242:486:99:9136,0,9302
contig122	1095	.	G	A	7089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.694;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.183;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,243:486:99:7118,0,7237
contig122	1976	.	CTA	C	8031.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;ClippingRankSum=-0.296;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-1.734;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.683;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,248:532:99:8069,0,10982
contig122	1980	.	ATTCTACCTACAATCTACCTACAATCTACCTG	A	7954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.993;ClippingRankSum=-0.266;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.429;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,251:617:99:7992,0,14842
contig122	2029	.	G	A	9207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.795;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.364;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,281:581:99:9236,0,12122
contig122	2035	.	A	G	11491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.486;ClippingRankSum=-0.830;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-1.526;QD=20.02;ReadPosRankSum=-3.872;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,288:574:99:11520,0,11790
contig122	2042	.	C	T	11329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.966;ClippingRankSum=-0.877;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.040;QD=20.12;ReadPosRankSum=-5.700;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,285:563:99:11358,0,11453
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contig122	6789	.	C	T	12950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-1.051;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=8.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.793;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,314:595:99:12979,0,11100
contig122	6794	.	G	A	12474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=1.161;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.630;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,302:568:99:12503,0,10803
contig122	6800	.	C	T	11774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.283;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.016;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,300:565:99:11803,0,10209
contig122	6835	.	A	G	11509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.749;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.440;QD=21.00;ReadPosRankSum=1.099;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,288:548:99:11538,0,10274
contig122	6837	.	A	G	11992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=-0.190;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.204;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,291:553:99:12021,0,10531
contig122	6850	.	A	G	12070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.782;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.811;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,295:554:99:12099,0,10700
contig122	6867	.	G	T	10759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=1.270;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=8.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.031;QD=21.87;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,258:492:99:10788,0,9391
contig122	6872	.	T	C	10153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=-0.334;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=11.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.138;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,259:487:99:10182,0,8702
contig122	7913	.	C	G	8529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.025;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.543;QD=18.96;ReadPosRankSum=2.067;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,221:450:99:8558,0,8833
contig122	7924	.	G	T	8650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.164;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.650;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,227:468:99:8679,0,9102
contig122	7957	.	T	C	7410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=-1.066;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.998;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,240:447:99:7439,0,6512
contig122	8673	.	A	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.414;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=18.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.204;QD=5.03;ReadPosRankSum=-2.613;SOR=1.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,72:323:99:1653,0,8521
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contig122	16567	.	C	T	10392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.225;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.129;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,280:566:99:10421,0,8775
contig122	16576	.	A	G	8420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.271;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.040;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,279:570:99:8449,0,10935
contig122	17287	.	C	T	10836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.333;ClippingRankSum=0.175;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.162;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,279:580:99:10865,0,11703
contig122	17292	.	C	T	11104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;ClippingRankSum=0.741;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.949;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,279:584:99:11133,0,12352
contig122	17293	.	C	A	11110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=0.134;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.434;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,280:583:99:11139,0,12399
contig122	17298	.	T	C	11209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.299;ClippingRankSum=1.399;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.429;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,285:579:99:11238,0,12228
contig122	17300	.	T	A	11341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.287;ClippingRankSum=-0.818;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.490;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,280:577:99:11370,0,12135
contig122	17306	.	A	G	11552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-1.243;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.590;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,283:572:99:11581,0,11903
contig122	17309	.	A	T	11859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=1.317;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.444;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,295:584:99:11888,0,11750
contig122	17325	.	C	G	11625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=1.240;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.345;QD=19.81;ReadPosRankSum=-1.567;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,306:587:99:11654,0,10788
contig122	17396	.	A	ATTTTTTTTT	5144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.775;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=5.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-1.974;QD=14.66;ReadPosRankSum=-7.809;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,149:351:99:5182,0,7937
contig122	17415	.	G	T	9243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-1.122;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=3.586;QD=24.65;ReadPosRankSum=5.383;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,241:375:99:9272,0,4927
contig122	17436	.	T	C	9922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=2.601;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=1.086;QD=25.57;ReadPosRankSum=2.695;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,244:388:99:9951,0,5479
contig122	17444	.	G	A	9773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.575;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.016;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.498;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,241:378:99:9802,0,4944
contig122	17751	.	G	A	8905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.860;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.369;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,236:485:99:8934,0,9543
contig122	17757	.	T	C	8880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=1.860;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.696;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.477;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,229:487:99:8909,0,9827
contig122	18030	.	T	G	9417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-2.164;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.503;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,245:489:99:9446,0,12123
contig122	18037	.	A	G	9647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.509;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.077;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,245:485:99:9676,0,12519
contig122	18046	.	A	G	9349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=2.973;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.733;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,243:499:99:9378,0,12430
contig122	20974	.	A	ATTTTT	5210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=0.742;QD=26.51;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,84:88:99:5111,412,0
contig122	22726	.	A	G	10930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.179;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=3.009;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,294:619:99:10959,0,12044
contig122	22749	.	T	C	11024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=-0.305;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=3.596;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.623;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,294:595:99:11053,0,11319
contig122	22766	.	TTATCTGCTGCC	T	7023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=1.856;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-1.660;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,201:470:99:7061,0,10151
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contig122	22849	.	C	CGAAG	9807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=-0.215;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=2.199;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,237:507:99:9845,0,10600
contig122	23009	.	T	C	7600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.052;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.585;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,260:503:99:7629,0,7565
contig122	23081	.	A	T	5811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.271;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.011;QD=12.94;ReadPosRankSum=3.983;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,247:449:99:5840,0,7315
contig122	23092	.	C	T	10959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.001;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=15.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.644;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.235	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,281:473:99:10988,0,7304
contig122	23633	.	G	GAA	4597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=1.447;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.364;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,179:392:99:4635,0,6858
contig122	23644	.	A	AAT	6109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=1.863;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.088;QD=12.97;ReadPosRankSum=2.494;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,235:471:99:6147,0,6648
contig122	23718	.	T	C	7484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.945;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.175;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.722;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,250:513:99:7513,0,8010
contig122	24312	.	A	C	8339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.008;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.738;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.164;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,216:459:99:8368,0,11737
contig122	24320	.	G	T	9055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=-0.619;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.659;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.668;SOR=1.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,223:473:99:9084,0,12333
contig122	24323	.	T	C	9191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-1.415;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.190;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,225:469:99:9220,0,12268
contig122	24329	.	A	G	9103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.290;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=5.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.936;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.351;SOR=1.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,228:462:99:9132,0,11674
contig122	24332	.	A	G	8907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.925;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.032;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.108;SOR=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,227:463:99:8936,0,11497
contig122	24460	.	T	C	8837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.398;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.496;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.572;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,236:477:99:8866,0,9071
contig122	24480	.	C	G	8677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.495;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.511;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.689;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,235:478:99:8706,0,9210
contig122	24994	.	TGGTG	T	10576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.066;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.201;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,280:570:99:10614,0,11188
contig122	25032	.	CTTTAT	C	10348.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-2.964;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.240;QD=18.68;ReadPosRankSum=2.149;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,269:554:99:10386,0,11184
contig122	25044	.	A	G	10963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.897;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.794;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.199;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,270:546:99:10992,0,11065
contig122	25051	.	C	T	10412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.655;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.436;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.690;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,271:553:99:10441,0,11041
contig122	25101	.	G	A	8834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.632;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.596;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.526;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,281:537:99:8863,0,7658
contig122	25381	.	C	A	11713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.116;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.117;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,298:584:99:11742,0,8420
contig122	25384	.	G	A	9288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.076;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.316;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,305:595:99:9317,0,11231
contig122	25444	.	A	G	10596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;ClippingRankSum=-1.536;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.767;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,276:560:99:10625,0,11020
contig122	25453	.	A	G	11462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.257;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.107;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.352;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,287:586:99:11491,0,11911
contig122	25456	.	T	C	11209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.380;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.537;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.070;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,286:577:99:11238,0,11591
contig122	25663	.	T	C	10975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.322;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.020;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.196;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,286:576:99:11004,0,13917
contig122	25669	.	A	G	11178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.711;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.579;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,285:568:99:11207,0,13755
contig122	25975	.	G	T	16939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=8.190;ClippingRankSum=-0.335;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=69.687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQRankSum=-0.122;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.039;SOR=1.547	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:40,473:513:99:16968,990,0
contig122	25976	.	G	A	8595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=3.614;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.556;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,236:511:99:8624,0,9555
contig122	25992	.	GT	G	9154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.521;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.558;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.159;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,236:531:99:9192,0,11849
contig122	26003	.	C	T	9435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-1.522;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.195;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,245:521:99:9464,0,11273
contig122	26004	.	AT	A	9402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=-0.350;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.084;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,249:526:99:9440,0,11024
contig122	26099	.	T	C	9822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=-0.334;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.556;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,250:520:99:9851,0,10540
contig122	26100	.	C	A	9864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=1.704;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.132;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,249:516:99:9893,0,10537
contig122	26102	.	T	A	10029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.043;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.304;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,250:513:99:10058,0,10535
contig122	26105	.	G	GC	10018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-1.136;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.378;QD=19.61;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,250:511:99:10056,0,10483
contig122	26109	.	T	C	9586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.574;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.233;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.950;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,243:499:99:9615,0,10077
contig122	26261	.	C	T	12780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.563;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=1.820;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,324:692:99:12809,0,14391
contig122	26263	.	C	T	12780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.205;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=3.086;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.779;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,332:694:99:12809,0,14391
contig122	26287	.	CATCATTACCATTTACTATT	C	7634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.003;ClippingRankSum=0.213;DP=836;ExcessHet=3.0103;FS=5.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-5.420;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.850;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,255:598:99:7672,0,13363
contig122	26388	.	C	T	28801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.977;DP=771;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQRankSum=0.423;QD=29.12;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.096	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,738:741:99:28830,2195,0
contig123	967	.	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.580;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=10.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.307;QD=1.99;ReadPosRankSum=-2.355;SOR=3.243	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:82:82,0,1470
contig123	968	.	G	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.411;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=9.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.158;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=3.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,4:29:82:82,0,1470
contig128	72	.	C	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.091;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.639;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,739
contig128	78	.	C	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.639;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.004;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,739
contig128	1096	.	C	A	18.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.118;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.354;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.825;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:47:47,0,266
contig137	283	.	C	T	60.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=30.48;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
contig137	284	.	A	G	60.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=30.48;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
contig137	287	.	C	T	60.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=30.48;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
contig137	289	.	GTGCC	G	51.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=25.96;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
contig137	295	.	GCTC	G	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:80:80,0,198
contig137	301	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.736;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.804;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:80,0,198
contig137	304	.	CGG	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.736;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.804;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:80,0,198
contig137	308	.	CG	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.736;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.804;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:77,0,273
contig141	384	.	T	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,160
contig141	386	.	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,160
contig148	789	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=1.267;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-2.311;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,2:17:39:39,0,7728
contig148	803	.	G	A	13.95	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.079;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-2.302;QD=0.87;SOR=1.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,8053
contig148	805	.	T	A	13.95	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.079;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-2.302;QD=0.87;SOR=1.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,8053
contig148	814	.	GAC	G	13.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.888;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-2.270;QD=1.07;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,7216
contig155	830	.	T	G	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.145;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=9.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.372;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.531;SOR=1.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:92,83:175:99:3087,0,3366
contig155	845	.	T	C	2903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.268;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.588;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,75:158:99:2932,0,3306
contig155	857	.	A	G	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=-0.551;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.147;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.861;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,60:139:99:2397,0,3228
contig155	881	.	G	A	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=-0.808;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-1.100;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.757;SOR=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,55:91:99:1745,0,1346
contig155	1304	.	G	A	6024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.480;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.361;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:154,156:310:99:6053,0,6098
contig155	1313	.	T	C	5834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.314;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.364;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,147:305:99:5863,0,6103
contig155	1343	.	A	C	4100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=1.468;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.536;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,139:299:99:4129,0,4993
contig157	467	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.067;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:56:56,0,215
contig163	442	.	G	A	8459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.608;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.439;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,262:505:99:8488,0,7972
contig163	454	.	C	T	8555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.396;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.952;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,271:521:99:8584,0,7994
contig163	466	.	T	C	8227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-1.106;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.063;QD=15.67;ReadPosRankSum=2.073;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,266:525:99:8256,0,8114
contig163	787	.	C	T	9627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.166;ClippingRankSum=-0.100;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.729;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,255:512:99:9656,0,9789
contig163	796	.	T	C	9629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.540;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.940;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,248:504:99:9658,0,9840
contig163	1141	.	G	A	8836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=2.371;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.208;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,285:581:99:8865,0,9421
contig164	746	.	G	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.826;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:39:39,0,302
contig173	513	.	G	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.438;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-3.067;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,14:36:99:447,0,5529
contig173	523	.	A	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=-1.561;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-1.106;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=2.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,5:26:99:372,0,6003
contig173	525	.	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.852;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.927;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:147,0,6024
contig173	526	.	T	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.556;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.778;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:147,0,6024
contig173	528	.	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.039;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.588;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:105,0,6027
contig173	537	.	C	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.778;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=5.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.111;QD=3.07;ReadPosRankSum=-1.668;SOR=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:105,0,6172
contig173	543	.	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.959;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.320;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=1.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:63:63,0,6175
contig173	545	.	G	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-0.685;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.137;QD=1.64;ReadPosRankSum=-2.054;SOR=1.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:66:66,0,5946
contig173	546	.	C	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.861;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.191;QD=1.72;ReadPosRankSum=-2.392;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:66:66,0,5946
contig173	550	.	G	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.352;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.457;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.663;SOR=1.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:69:69,0,5752
contig174	450	.	G	T	12.99	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.187;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.822;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.004;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,417
contig181	849	.	C	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.566;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.382;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.715;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:54:54,0,289
contig188	1317	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.185;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.294;SOR=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:55:55,0,230
contig189	1305	.	TG	T	13.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.480;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,293
contig190	1187	.	C	CGACCACGCCTCTACCTCGCGAAACCGGGGCTCTACCTCGCGG	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=1.172;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=0.753;QD=14.92;ReadPosRankSum=-4.436;SOR=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:485,0,3263
contig191	1211	.	C	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.382;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:58:58,0,256
contig195	790	.	G	C	6449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.602;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.320;QD=17.11;ReadPosRankSum=3.443;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,173:377:99:6478,0,11290
contig195	793	.	C	T	6421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=-1.118;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.380;QD=17.31;ReadPosRankSum=2.313;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,170:371:99:6450,0,11271
contig195	928	.	G	A	4474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=-1.426;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.257;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,124:261:99:4503,0,5364
contig195	943	.	G	T	5225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-1.324;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.202;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,134:270:99:5254,0,5378
contig195	949	.	A	G	5002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.297;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.603;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,132:269:99:5031,0,5260
contig195	1192	.	G	C	4941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.140;DP=372;ExcessHet=3.0103;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.049;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,165:349:99:4970,0,5663
contig195	1222	.	T	C	6200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.091;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.321;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,199:378:99:6229,0,5358
contig203	541	.	C	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.056;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-2.739;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.062;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:64:64,0,460
contig205	1081	.	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.702;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=21.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=1.102;QD=27.08;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:651,0,1817
contig205	1087	.	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-1.019;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=21.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.495;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:690,0,1996
contig205	1088	.	ACGAG	A	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.459;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=20.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=1.317;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:732,0,1993
contig205	1095	.	C	CCGGG	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=-0.670;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=16.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=2.243;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:690,0,1996
contig205	1103	.	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=-0.702;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=21.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.038;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:693,0,1825
contig205	1104	.	G	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=-0.568;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=21.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.572;QD=27.08;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:651,0,1828
contig213	224	.	C	CGGAGAAGATCCACATGTGGGGCT	25.74	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-1.666;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.762;SOR=2.266	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,1009
contig213	226	.	G	GTCCGACTTCGAGGAGCGCTACCCGACGCTGACGAAGATGC	25.74	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-1.589;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,1009
contig214	880	.	C	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:99:123,0,125
contig214	882	.	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727;SOR=2.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:99:123,0,125
contig214	886	.	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.736;QD=30.59;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:99:120,0,158
contig214	889	.	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=2.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,161
contig215	151	.	G	T	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-0.493;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.691;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=2.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,393
contig220	173	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.296;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.166;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:56:56,0,227
contig232	1101	.	G	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.925;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:55:55,0,300
contig234	694	.	G	T	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=-0.254;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.099;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:48:48,0,379
contig238	1134	.	G	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.198;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:49:49,0,188
contig241	626	.	C	A	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=-0.425;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.594;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,958
contig241	636	.	C	A	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=1.274;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.425;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,958
contig245	47	.	C	G	12.99	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.594;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.594;QD=0.87;ReadPosRankSum=-1.274;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:41:41,0,398
contig245	140	.	G	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.927;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.579;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:389,0,345
contig245	174	.	G	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.026;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=12.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.231;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.283;SOR=1.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:420,0,351
contig245	278	.	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.937;SOR=2.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,288
contig245	284	.	G	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=1.517;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.221;SOR=2.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,312
contig245	417	.	C	A	14.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.715;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.715;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.106;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:43:43,0,229
contig245	686	.	C	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.227;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:130,0,316
contig245	1003	.	C	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.030;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.999;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.514;SOR=1.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:171,0,531
contig247	1063	.	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.898;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.488;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:209,0,739
contig247	1067	.	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=1.333;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.867;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:209,0,739
contig247	1068	.	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.800;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.533;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=1.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:212,0,704
contig247	1080	.	CCGT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,765
contig247	1087	.	C	CAT	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.447;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.741;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,765
contig247	1090	.	C	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.741;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,765
contig247	1091	.	CTG	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=1.447;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.447;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,765
contig247	1096	.	C	CGTG	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.365;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,765
contig247	1115	.	A	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,658
contig247	1117	.	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,658
contig247	1120	.	G	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.666;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,658
contig276	487	.	G	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:85:85,0,166
contig276	493	.	G	GA	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.026;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,169
contig276	494	.	C	CGGGCGGCGG	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.736;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=1.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,1:3:78:78,0,169
contig290	57	.	GCC	G	25.74	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,304
contig311	471	.	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.955;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-1.960;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.859;SOR=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:258,0,377
contig311	481	.	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.722;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-1.876;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.337;SOR=1.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:334,0,277
contig311	493	.	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.986;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-2.751;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.505;SOR=0.376	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:459,0,761
contig311	500	.	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.512;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-1.439;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.098;SOR=0.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:459,0,774
contig311	501	.	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.366;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-2.171;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:459,0,774
contig311	527	.	C	CCTGTGGAGCTTCGTACCGTTTCCGGTCCGTTTCTCCGGTGAGAACTCTACCTCATGTTTCTCGCGG	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.053;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=-1.212;QD=5.22;ReadPosRankSum=-3.215;SOR=0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:126,0,673
contig322	1437	.	C	T	4685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.269;ClippingRankSum=-1.246;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=229.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQRankSum=9.475;QD=20.37;ReadPosRankSum=-2.491;SOR=1.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:83,147:230:99:4714,0,1874
contig322	2217	.	GAA	G	4119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.03;QD=32.87;SOR=1.968	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:4157,283,0
contig322	2221	.	A	T	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;QD=30.81;SOR=2.019	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,94:94:99:4157,283,0
contig322	2361	.	A	T	15.88	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;ClippingRankSum=-0.556;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=20.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQRankSum=-5.503;QD=0.19;ReadPosRankSum=1.080;SOR=0.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,12:84:44:44,0,2569
contig323	707	.	GT	G	8282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.825;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.539;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,225:431:99:8320,0,7184
contig323	732	.	T	A	7955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.299;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.216;QD=20.83;ReadPosRankSum=4.059;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,198:382:99:7984,0,7259
contig323	737	.	TTTTTTA	T	3540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.105;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.810;QD=10.20;ReadPosRankSum=4.604;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,162:347:99:3578,0,7384
contig323	1209	.	C	T	7022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.556;DP=821;ExcessHet=3.0103;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.360;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:508,256:764:99:7051,0,16502
contig323	1441	.	T	TTA	8222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.819;DP=809;ExcessHet=3.0103;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.344;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:525,235:760:99:8260,0,21372
contig323	1532	.	T	C	6879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.694;DP=840;ExcessHet=3.0103;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.201;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:564,243:807:99:6908,0,19066
contig324	1750	.	T	C	8415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.402;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.028;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,226:470:99:8444,0,9211
contig324	1760	.	G	GA	8631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.047;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.032;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,229:470:99:8669,0,9023
contig324	3407	.	A	G	9829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.446;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.508;QD=17.40;ReadPosRankSum=4.318;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,259:565:99:9858,0,25485
contig324	3426	.	T	C	10350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.362;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.279;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,262:557:99:10379,0,26646
contig324	3450	.	A	G	9703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.208;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.471;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,253:531:99:9732,0,23855
contig324	3982	.	A	G	10187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=1.589;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.124;QD=14.72;ReadPosRankSum=2.164;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,339:692:99:10216,0,11013
contig324	4439	.	T	A	14467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-1.126;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.879;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,362:692:99:14496,0,17303
contig324	4445	.	T	C	14931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=1.559;DP=735;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.233;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,370:707:99:14960,0,17865
contig324	4448	.	A	T	14771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.378;DP=749;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.262;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.633;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,378:719:99:14800,0,17773
contig324	4560	.	T	C	11021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.130;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.717;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.683;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,293:592:99:11050,0,13091
contig324	4571	.	G	A	10714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=1.284;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.573;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.902;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,284:581:99:10743,0,13135
contig324	5162	.	C	T	8033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.870;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=6.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.563;QD=17.31;ReadPosRankSum=-2.422;SOR=1.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,241:464:99:8062,0,7459
contig324	5203	.	G	A	5218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.462;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.442;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,162:374:99:5247,0,6872
contig324	6108	.	G	A	10935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.585;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.893;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,283:586:99:10964,0,12164
contig324	6113	.	C	T	11197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.080;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.747;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,282:592:99:11226,0,12348
contig324	6119	.	T	C	11136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.020;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.111;QD=18.47;ReadPosRankSum=2.053;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,285:603:99:11165,0,12885
contig324	6122	.	T	G	10954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.567;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.889;QD=18.44;ReadPosRankSum=2.229;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,278:594:99:10983,0,12741
contig324	6719	.	C	T	9135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.675;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.227;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.126;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,293:555:99:9164,0,9868
contig324	6800	.	T	C	8567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=-0.217;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.220;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,231:482:99:8596,0,9347
contig324	6819	.	A	G	9324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=-0.475;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=4.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.670;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,234:459:99:9353,0,9149
contig324	6821	.	A	G	9244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=-0.423;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.350;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,234:462:99:9273,0,8960
contig324	6905	.	A	G	3425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.787;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=7.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.262;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.646;SOR=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,125:316:99:3454,0,6114
contig324	6946	.	AAAAAAAAATAATAAAATTTGGCTTACACC	A	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.464;ClippingRankSum=1.254;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=29.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.356;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,62:343:99:451,0,11298
contig324	7557	.	A	G	8600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=-0.211;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.110;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.481;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,221:433:99:8629,0,8297
contig324	7567	.	A	G	8799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.310;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.388;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,231:460:99:8828,0,8603
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contig324	8784	.	A	AGCGGAGAGG	11489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=1.386;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-1.542;QD=19.74;ReadPosRankSum=-4.969;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,276:582:99:11527,0,12021
contig324	8788	.	G	GAAA	12542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.502;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.877;QD=20.97;ReadPosRankSum=-4.973;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,286:598:99:12580,0,12468
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contig324	8804	.	A	G	11586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-1.036;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-2.987;QD=19.06;ReadPosRankSum=-2.332;SOR=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,286:608:99:11615,0,13370
contig324	8816	.	A	G	11638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.290;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=5.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=1.730;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=1.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,293:615:99:11667,0,13242
contig324	8838	.	G	A	10975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;ClippingRankSum=-0.218;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=1.963;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,296:627:99:11004,0,13328
contig324	8860	.	ATCTGAAAGATGAAGAGAAGGG	A	8811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.848;ClippingRankSum=-0.655;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-1.320;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.760;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:394,282:676:99:8849,0,16052
contig324	8905	.	T	A	11328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=-1.369;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-1.154;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.713;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,299:630:99:11357,0,12459
contig324	9062	.	G	A	7900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-1.172;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.595;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,271:555:99:7929,0,8636
contig324	10310	.	T	C	8957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.222;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.401;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,226:458:99:8986,0,12303
contig324	10313	.	G	A	9169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-1.053;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.351;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,232:470:99:9198,0,12349
contig324	10328	.	T	C	8923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.414;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.408;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.101;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,235:481:99:8952,0,12298
contig324	10466	.	A	G	10232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.958;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.472;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,260:500:99:10261,0,9438
contig324	10478	.	A	G	11341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=-0.528;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.786;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,285:545:99:11370,0,10195
contig324	10485	.	A	C	10997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-2.032;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.330;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,281:528:99:11026,0,9747
contig324	10514	.	A	G	10302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.360;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.168;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,269:557:99:10331,0,11080
contig324	10522	.	G	A	10083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-3.295;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.169;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,264:554:99:10112,0,11318
contig324	10618	.	C	T	14692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=-0.137;DP=780;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.811;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.431;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,372:744:99:14721,0,15033
contig324	10620	.	T	C	14967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.979;DP=784;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.012;QD=20.01;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:373,375:748:99:14996,0,15127
contig324	10625	.	A	G	15124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.166;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.433;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,386:752:99:15153,0,14715
contig324	10772	.	G	A	6087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.762;DP=733;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-0.128;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.658;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,219:464:99:6116,0,7201
contig324	11130	.	G	A	13452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=-0.329;DP=730;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.263;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,347:697:99:13481,0,13718
contig324	11137	.	C	T	13962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.047;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.643;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,345:695:99:13991,0,13902
contig324	11138	.	C	G	13694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=1.385;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.354;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:348,346:694:99:13723,0,13852
contig324	11850	.	G	A	12529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-2.851;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.543;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,331:670:99:12558,0,12780
contig324	11861	.	T	C	12333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=-0.242;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.455;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,321:638:99:12362,0,12307
contig324	13661	.	G	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=1.560;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=53.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.307;QD=6.54;ReadPosRankSum=-6.123;SOR=2.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,74:320:99:2122,0,10131
contig324	13677	.	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.868;ClippingRankSum=-1.201;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=50.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.668;QD=5.48;ReadPosRankSum=-6.188;SOR=5.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,21:284:99:1584,0,11302
contig324	13680	.	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=1.255;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=52.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.052;QD=0.19;ReadPosRankSum=-7.202;SOR=5.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,20:284:81:81,0,11102
contig324	15335	.	G	A	8439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=-0.778;DP=976;ExcessHet=3.0103;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.791;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:630,315:945:99:8468,0,19142
contig324	15366	.	T	C	9369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=1.690;DP=963;ExcessHet=3.0103;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.182;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.177;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:652,279:931:99:9398,0,26043
contig324	15375	.	C	G	9437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.176;DP=920;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.385;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:622,269:891:99:9466,0,25663
contig324	15396	.	A	T	10202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.341;DP=925;ExcessHet=3.0103;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.370;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:599,295:894:99:10231,0,24418
contig324	15405	.	C	T	10048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-0.838;DP=924;ExcessHet=3.0103;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.689;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:603,286:889:99:10077,0,25005
contig324	15426	.	G	A	9137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.313;DP=901;ExcessHet=3.0103;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.715;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:538,327:865:99:9166,0,19059
contig324	15452	.	T	C	9477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.647;DP=909;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.140;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:593,263:856:99:9506,0,24090
contig324	15462	.	A	G	9970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.170;DP=914;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.764;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:592,267:859:99:9999,0,25250
contig324	15463	.	G	A	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-1.163;DP=914;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.257;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:591,268:859:99:10066,0,25147
contig324	15464	.	C	T	9854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.522;DP=922;ExcessHet=3.0103;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.991;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:594,272:866:99:9883,0,25043
contig324	15471	.	AT	A	10780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.074;DP=924;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.600;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,282:594:99:10818,0,11896
contig324	15481	.	C	T	10063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.938;DP=895;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.180;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:556,283:839:99:10092,0,22528
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contig324	16841	.	T	A	8696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.103;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.234;QD=16.20;ReadPosRankSum=3.145;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,284:537:99:8725,0,9300
contig324	16865	.	A	ATT	9726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.493;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=6.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.058;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.993;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,246:466:99:9764,0,8640
contig324	16879	.	A	G	10357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.953;ClippingRankSum=-0.002;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.954;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.565;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,254:493:99:10386,0,9598
contig324	16896	.	GGAT	G	10673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.269;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.494;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,273:527:99:10711,0,9817
contig324	17527	.	C	T	7647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.294;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.383;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.594;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,206:469:99:7676,0,16439
contig324	17547	.	A	G	7635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.549;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=7.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.167;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.107;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,206:471:99:7664,0,16542
contig324	22626	.	T	TA	6599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-2.392;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.628;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.058;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,238:450:99:6637,0,5925
contig324	24256	.	T	C	10416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=-1.159;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.776;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,272:556:99:10445,0,16849
contig324	24262	.	T	C	10049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-0.281;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.402;QD=18.37;ReadPosRankSum=2.108;SOR=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,259:547:99:10078,0,16905
contig324	24722	.	A	T	7970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.093;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.128;QD=14.41;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,270:553:99:7999,0,8602
contig324	26991	.	ATTTTATTTT	A	7210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=-0.142;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-1.877;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.717;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,196:464:99:7248,0,10376
contig324	27730	.	T	C	10391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.451;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.942;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,270:555:99:10420,0,11546
contig324	27740	.	T	C	10158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=2.137;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.317;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,268:546:99:10187,0,11280
contig324	28110	.	T	C	11182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=1.089;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.994;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,291:566:99:11211,0,13989
contig324	28121	.	T	C	11440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=1.383;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.693;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,278:554:99:11469,0,14267
contig324	28136	.	A	G	10707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-1.145;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.148;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,284:566:99:10736,0,13948
contig324	28430	.	T	C	10523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.515;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.542;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,344:673:99:10552,0,10243
contig324	28529	.	T	C	10857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.401;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.628;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,276:564:99:10886,0,11113
contig324	28535	.	C	T	10863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.358;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.708;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,280:562:99:10892,0,11021
contig324	28574	.	G	A	8971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=1.273;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.331;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.056;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,303:632:99:9000,0,10003
contig324	28793	.	T	C	8167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.716;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.310;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,272:584:99:8196,0,9702
contig324	29617	.	C	T	9052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.746;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.927;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,281:531:99:9081,0,9237
contig324	32093	.	TA	T	6499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.949;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.463;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.982;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,292:522:99:6537,0,4850
contig324	32131	.	G	A	10532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=-1.040;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.158;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,340:642:99:10561,0,9627
contig324	34217	.	T	C	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.580;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.111;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.166;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,284:555:99:8818,0,8554
contig324	34259	.	G	A	7802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.993;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.397;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,241:502:99:7831,0,8336
contig324	34279	.	A	C	9316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-1.288;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.609;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,241:480:99:9345,0,9383
contig324	34280	.	A	T	9316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-1.013;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.540;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,239:480:99:9345,0,9383
contig324	34320	.	G	T	8029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-0.540;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.217;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,258:542:99:8058,0,9007
contig324	34360	.	A	G	7537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.542;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.889;QD=12.40;ReadPosRankSum=2.143;SOR=0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,286:608:99:7575,0,9490
contig324	34426	.	G	A	9418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.004;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.101;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,299:610:99:9447,0,9727
contig324	34443	.	C	T	9586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=1.213;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=5.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.843;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,304:595:99:9615,0,9560
contig324	34510	.	CA	C	7124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-0.942;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.191;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,273:566:99:7162,0,7825
contig324	34743	.	A	G	7954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.781;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.355;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.330;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,252:507:99:7983,0,8041
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contig324	35973	.	C	T	9006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=-0.965;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.968;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.303;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,242:488:99:9035,0,12179
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contig324	36038	.	C	A	7398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.044;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.806;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.988;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,202:426:99:7427,0,8337
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contig324	36090	.	T	A	6277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.973;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.985;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,161:335:99:6306,0,6811
contig324	36091	.	A	T	6242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-1.678;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.900;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,160:333:99:6271,0,6735
contig324	36139	.	G	GAA,GAAAA	4085.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.821;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=5.649;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.91;MQRankSum=0.060;QD=30.92;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:15,36,60:111:99:4123,1039,897,758,0,1076
contig324	36195	.	C	T	5347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-1.481;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.811;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,184:400:99:5376,0,6716
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contig324	37177	.	A	G	12442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.641;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.388;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,319:594:99:12471,0,10559
contig324	37183	.	G	A	12601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.125;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.744;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,324:604:99:12630,0,10560
contig324	37222	.	C	G	21179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.946;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQRankSum=0.065;QD=31.16;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.243	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,574:581:99:21208,1489,0
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contig324	38004	.	A	G	9390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.716;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.234;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,307:627:99:9419,0,9728
contig324	38033	.	A	T	9858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.653;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.473;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.765;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,321:636:99:9887,0,9681
contig324	38085	.	A	T	12054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=1.835;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.275;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.497;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,309:609:99:12083,0,11303
contig324	38096	.	A	G	12590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=1.858;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.708;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,314:599:99:12619,0,11335
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contig324	38309	.	A	C	11682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.244;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.796;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.989;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,318:647:99:11711,0,12276
contig324	38330	.	A	C	11338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-1.373;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.604;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,305:619:99:11367,0,11964
contig324	38396	.	T	C	9066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.115;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.286;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,301:561:99:9095,0,9652
contig324	38424	.	A	C	9691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.469;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.104;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.308;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,248:521:99:9720,0,10732
contig324	38428	.	G	A	9611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=1.290;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.160;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,249:528:99:9640,0,10843
contig324	38493	.	C	A	7136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.621;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.582;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,230:485:99:7165,0,9632
contig324	38504	.	T	C	9439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=-1.068;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.200;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,238:490:99:9468,0,10361
contig324	38510	.	G	GA	9407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=-0.139;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.295;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,242:495:99:9445,0,10150
contig324	38535	.	C	T	11275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.377;ClippingRankSum=-0.269;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.077;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,293:563:99:11304,0,10752
contig324	38554	.	A	G	12014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.661;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.187;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,323:610:99:12043,0,10632
contig324	38581	.	C	T	9547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.018;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=3.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.673;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.267;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,314:643:99:9576,0,9973
contig324	39253	.	A	T	12033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.691;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.444;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,311:621:99:12062,0,12260
contig324	39256	.	A	T	12074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=1.618;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.909;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,312:626:99:12103,0,12284
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contig324	42599	.	T	C	9716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=1.461;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.680;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,318:640:99:9745,0,10373
contig324	44321	.	T	A	8189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.589;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.037;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,260:514:99:8218,0,8075
contig324	44677	.	C	T	10371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=-1.056;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.699;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,351:700:99:10400,0,10669
contig324	44854	.	C	T	11505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.182;DP=719;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.698;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,359:679:99:11534,0,10231
contig324	44866	.	C	T	14129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.609;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.768;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,360:693:99:14158,0,12898
contig324	44872	.	G	C	14258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-1.319;DP=750;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.669;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,370:715:99:14287,0,13240
contig324	45911	.	C	A	7397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.335;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.515;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.887;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,239:484:99:7426,0,7681
contig324	46587	.	A	T	7201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-0.970;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.258;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,231:479:99:7230,0,7705
contig324	50649	.	A	ATT	2964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=-0.651;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.173;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.925;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,133:275:99:3002,0,3806
contig324	50778	.	G	T	5189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.485;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.319;QD=14.22;ReadPosRankSum=2.557;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,181:365:99:5218,0,5354
contig324	50824	.	TC	T	4329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.578;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=9.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.080;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.639;SOR=1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,175:352:99:4367,0,4331
contig324	51070	.	A	C	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.432;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.245;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,253:501:99:9930,0,9568
contig324	51071	.	G	C	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.449;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.868;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,252:499:99:9930,0,9568
contig324	51085	.	T	A	7840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.000;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.728;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,254:500:99:7869,0,7494
contig324	51102	.	CA	C	8759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.827;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.077;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.935;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,224:452:99:8797,0,8635
contig324	51108	.	T	G	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.151;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.311;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,238:471:99:8973,0,8730
contig324	51823	.	T	C	8085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.544;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.235;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,255:511:99:8114,0,9748
contig324	51830	.	A	T	7874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.891;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.283;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,241:484:99:7903,0,9345
contig324	51867	.	G	A	6773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.930;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=11.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.619;QD=13.49;ReadPosRankSum=-2.766;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,227:502:99:6802,0,8832
contig324	51895	.	A	C	8467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=-0.363;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.610;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,276:495:99:8496,0,6646
contig324	51932	.	A	C	7554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.294;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.272;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,252:471:99:7583,0,6880
contig324	53068	.	C	T	9577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.567;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.063;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,308:579:99:9606,0,8186
contig324	53361	.	T	A	10778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.557;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.135;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.581;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,291:600:99:10807,0,15117
contig324	53372	.	G	A	10409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.175;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.026;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.430;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,277:574:99:10438,0,14764
contig324	53937	.	T	A	8532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=1.504;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.177;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.970;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,221:436:99:8561,0,8454
contig324	53942	.	T	C	8357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-1.368;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=4.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.295;QD=19.04;ReadPosRankSum=2.054;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,217:439:99:8386,0,8576
contig324	54176	.	T	G	7207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.317;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.120;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,237:438:99:7236,0,10546
contig324	54196	.	G	A	9519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-1.313;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.614;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,254:455:99:9548,0,5969
contig324	54355	.	AT	A	11051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.321;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.198;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,298:589:99:11089,0,11311
contig324	54358	.	AG	A	4005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.486;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.590;QD=7.66;ReadPosRankSum=3.297;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,213:523:99:4043,0,11888
contig324	54387	.	T	C	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;ClippingRankSum=0.497;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.240;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,285:555:99:9462,0,7796
contig324	54578	.	T	G	10246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.767;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.237;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.977;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,327:601:99:10275,0,8267
contig324	54699	.	C	G	11110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.313;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.785;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,279:551:99:11139,0,10498
contig324	54703	.	C	T	11398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=1.008;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.307;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,283:552:99:11427,0,10679
contig324	54711	.	T	A	11076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.082;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.008;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,282:542:99:11105,0,10306
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contig324	54761	.	G	A	11065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.164;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-0.549;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,280:562:99:11094,0,11482
contig324	54766	.	C	T	11023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-0.646;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.031;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,269:551:99:11052,0,11322
contig324	54777	.	T	C	11767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.601;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.090;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,291:573:99:11796,0,11436
contig324	54788	.	A	T	12067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.231;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.018;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,295:590:99:12096,0,11916
contig324	54806	.	G	A	12997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-1.795;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.898;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,314:603:99:13026,0,11766
contig324	54826	.	T	G	12441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=1.613;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.281;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,309:614:99:12470,0,12515
contig324	54836	.	T	G	12462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.539;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.318;QD=19.78;ReadPosRankSum=2.028;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,310:630:99:12491,0,12806
contig324	54841	.	A	G	12366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.512;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.937;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.800;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,309:628:99:12395,0,12980
contig324	54852	.	T	C	12660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.284;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.982;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,311:626:99:12689,0,12374
contig324	54863	.	C	T	12636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.938;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.542;QD=20.32;ReadPosRankSum=-1.199;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,310:622:99:12665,0,12710
contig324	54865	.	T	G	12393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.428;ClippingRankSum=-0.580;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.701;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,313:628:99:12422,0,12602
contig324	54881	.	C	G	12499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.796;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.077;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.548;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,313:630:99:12528,0,12977
contig324	54884	.	C	T	12200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.045;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.914;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,315:637:99:12229,0,12528
contig324	54947	.	A	G	10694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=-1.568;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.032;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.287;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,340:650:99:10723,0,9285
contig324	54974	.	T	C	9226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=-0.211;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.015;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.692;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,296:621:99:9255,0,10079
contig324	55218	.	C	T	8594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.458;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.422;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,225:472:99:8623,0,9283
contig324	55237	.	G	T	8757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-0.800;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.246;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.374;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,237:493:99:8786,0,9676
contig324	56170	.	T	C	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=-0.232;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.342;QD=17.41;ReadPosRankSum=2.842;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,252:542:99:9462,0,11246
contig324	56187	.	C	T	9704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-0.031;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.001;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,268:561:99:9733,0,11013
contig324	56216	.	C	G	9755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.381;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.025;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,316:583:99:9784,0,8234
contig324	56246	.	G	T	7752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.712;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.448;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,259:579:99:7781,0,9923
contig324	56949	.	G	A	7574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.811;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.141;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,205:442:99:7603,0,9193
contig324	56951	.	TA	T	7553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.605;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.145;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,204:440:99:7591,0,9298
contig324	57111	.	G	A	9408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.879;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.843;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,251:519:99:9437,0,10117
contig324	57127	.	T	A	9910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-1.009;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.315;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,265:537:99:9939,0,10263
contig324	57248	.	C	T	11709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.997;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.081;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,303:622:99:11738,0,12394
contig324	57253	.	T	G	12119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=-0.316;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.985;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,307:626:99:12148,0,12913
contig324	57257	.	G	A	11825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.135;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.612;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,298:601:99:11854,0,12291
contig324	57287	.	A	G	9360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=1.323;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.735;QD=17.37;ReadPosRankSum=2.587;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,249:539:99:9389,0,11265
contig324	57303	.	C	T	9746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.204;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.527;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,260:561:99:9775,0,11606
contig324	57404	.	TA	T	5745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.104;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.145;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,229:504:99:5783,0,7219
contig324	57529	.	A	AG	8362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-1.161;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.074;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,249:501:99:8400,0,7959
contig324	57642	.	A	G	9431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=1.874;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.477;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,250:468:99:9460,0,8281
contig324	57656	.	A	G	9469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=1.049;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-3.033;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,242:453:99:9498,0,8059
contig324	57836	.	C	A	10608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=1.259;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.982;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,276:557:99:10637,0,10662
contig324	57848	.	C	T	10434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-1.196;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,274:539:99:10463,0,10229
contig324	58993	.	C	T,CT	10116.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.206;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.622;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.931	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:20,210,251:481:99:10154,6168,8780,4699,0,7580
contig324	59203	.	ATT	A	8020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.188;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=4.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.881;QD=18.23;ReadPosRankSum=1.340;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,227:440:99:8058,0,7431
contig324	60153	.	T	G	8834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-1.629;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.515;QD=17.81;ReadPosRankSum=2.013;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,237:496:99:8863,0,10628
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contig324	60203	.	C	A	9409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.454;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.853;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.312;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,231:478:99:9438,0,10481
contig324	60221	.	T	C	8412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.575;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.068;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,221:476:99:8441,0,9952
contig324	60264	.	A	G	10311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=-0.092;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.005;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.768;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,265:504:99:10340,0,8989
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contig324	60278	.	AG	A	10431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.051;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.434;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,278:525:99:10469,0,9520
contig324	60318	.	A	G	8733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.365;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.784;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,282:544:99:8762,0,7800
contig324	61065	.	A	G	6016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.771;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=9.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.348;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,203:384:99:6045,0,4843
contig324	61134	.	A	C	8450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-1.210;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.190;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.754;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,217:437:99:8479,0,8298
contig324	61144	.	G	A	8488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=1.094;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.242;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,221:427:99:8517,0,7793
contig324	61185	.	C	T	7162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.394;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.283;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,239:471:99:7191,0,6956
contig324	61845	.	C	G	11402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.379;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.055;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.635;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,376:754:99:11431,0,11998
contig324	61875	.	A	T	10624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=-0.423;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.051;QD=14.80;ReadPosRankSum=3.249;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,338:718:99:10653,0,11761
contig324	62246	.	T	C	8042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=1.936;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.312;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,242:486:99:8071,0,7695
contig324	62489	.	T	C	7603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.423;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.514;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,252:534:99:7632,0,8523
contig324	62594	.	C	T	7552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.633;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.872;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.173;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,242:507:99:7581,0,8725
contig324	62633	.	A	T	9359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.496;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.621;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,273:540:99:9388,0,8033
contig324	62659	.	GA	G	8289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.765;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.773;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,240:465:99:8327,0,5049
contig324	62699	.	C	CAA	8766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.330;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.687;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,261:516:99:8804,0,9621
contig324	62732	.	C	T	7602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=-0.114;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.094;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,254:555:99:7631,0,9388
contig324	62908	.	C	T	8570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.617;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.308;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,277:574:99:8599,0,9395
contig324	63807	.	C	T	10291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.999;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.997;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,263:531:99:10320,0,13531
contig324	63811	.	T	C	10385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.306;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.391;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,270:533:99:10414,0,13452
contig324	64209	.	T	C	9071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.816;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.930;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,291:600:99:9100,0,9539
contig324	64499	.	A	G	10153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.107;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.952;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.873;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,259:529:99:10182,0,10588
contig324	64505	.	G	A	10518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.223;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.140;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,278:556:99:10547,0,10634
contig324	64763	.	A	C	24917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.323;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-1.372;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.978;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,617:619:99:24946,1827,0
contig324	64784	.	T	C	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.744;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.755;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,317:603:99:10315,0,9060
contig324	65051	.	A	G	10807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.974;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.183;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,281:572:99:10836,0,19911
contig324	65066	.	A	G	11080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.453;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.599;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.778;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,279:580:99:11109,0,22333
contig324	65075	.	A	T	11324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=2.267;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.357;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,298:596:99:11353,0,21666
contig324	65313	.	T	C	11082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=1.214;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.877;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,283:566:99:11111,0,11092
contig324	65322	.	A	G	11155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=1.193;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.231;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,295:598:99:11184,0,11575
contig324	66038	.	T	C	9183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.105;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.767;QD=14.26;ReadPosRankSum=-1.775;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,308:644:99:9212,0,10353
contig324	66115	.	C	T	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.699;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.636;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.771;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,255:532:99:9696,0,10843
contig324	66123	.	T	C	9661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.581;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.992;QD=18.54;ReadPosRankSum=2.360;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,247:521:99:9690,0,11311
contig324	66124	.	T	C	9590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.143;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.835;QD=18.59;ReadPosRankSum=2.376;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,244:516:99:9619,0,11165
contig324	66145	.	A	T	9046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=-0.890;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.244;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.641;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,246:504:99:9075,0,10427
contig324	66167	.	C	T	9479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.127;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.924;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,257:507:99:9508,0,9538
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contig324	68584	.	TGTGAA	T	8492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.193;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.336;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,226:471:99:8530,0,9482
contig324	68834	.	A	AT	5073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-1.406;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.194;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,204:438:99:5111,0,5916
contig324	69037	.	C	T	9259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.809;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.350;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,246:507:99:9288,0,10173
contig324	69047	.	A	G	9226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.213;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.827;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,242:496:99:9255,0,9865
contig324	69152	.	C	T	6753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.771;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.750;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,223:467:99:6782,0,7499
contig324	69297	.	A	G	5090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.256;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.214;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.632;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,168:389:99:5119,0,7142
contig324	69364	.	GTA	G	7312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.875;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.434;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,194:422:99:7350,0,8901
contig324	69450	.	T	C	6563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.008;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.597;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.800;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,208:421:99:6592,0,6720
contig324	69550	.	G	GC	6354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.127;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.162;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.296;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,206:420:99:6392,0,6632
contig324	69621	.	G	T	7406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.750;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.237;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,244:507:99:7435,0,9794
contig324	69767	.	AAT	A	8611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.829;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.334;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,220:469:99:8649,0,9939
contig324	69775	.	G	A	9221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.234;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.171;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.620;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,228:487:99:9250,0,10320
contig324	69789	.	TAAA	T	8581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.193;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.767;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,219:486:99:8619,0,10624
contig324	69899	.	C	G	8879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-2.376;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.058;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,297:595:99:8908,0,9023
contig324	69950	.	G	T	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.877;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.386;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,289:582:99:11450,0,11301
contig324	69953	.	G	A	11430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.957;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.260;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.963;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,293:578:99:11459,0,11289
contig324	70587	.	A	G	7802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.874;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.708;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,206:435:99:7831,0,8795
contig324	70598	.	A	C	8036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=1.515;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.169;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.746;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,205:434:99:8065,0,9187
contig324	70622	.	G	T	8828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.521;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.883;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,212:425:99:8857,0,8722
contig324	70625	.	G	A	8858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=1.480;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.677;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,221:433:99:8887,0,8529
contig324	70634	.	C	T	8395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.110;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.109;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,221:437:99:8424,0,8438
contig324	70772	.	T	C	7183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.184;ClippingRankSum=0.535;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.117;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,231:485:99:7212,0,9256
contig324	71531	.	G	C	11347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.140;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.978;QD=20.56;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,291:552:99:11376,0,10129
contig324	71537	.	A	C	11079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=-1.468;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.095;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,276:532:99:11108,0,10223
contig324	71540	.	TC	T	6138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-0.597;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.426;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,256:514:99:6176,0,10232
contig324	72847	.	T	G	10057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=-0.258;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.246;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.889;SOR=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,269:557:99:10086,0,10842
contig324	72861	.	G	A	9901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-1.528;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.763;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,261:533:99:9930,0,10724
contig324	73545	.	A	G	6755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.603;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=5.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.129;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.737;SOR=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,222:490:99:6784,0,10459
contig324	73546	.	T	C	6755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-1.024;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=4.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.624;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.643;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,223:492:99:6784,0,10459
contig324	73592	.	A	T	5913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=1.533;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-0.654;QD=21.50;ReadPosRankSum=2.067;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,153:275:99:5942,0,7739
contig324	73594	.	A	G	6105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=1.547;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-2.348;QD=21.58;ReadPosRankSum=1.576;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,157:283:99:6134,0,8136
contig324	73623	.	TCTCA	T	8120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.620;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=6.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQRankSum=-1.044;QD=21.15;ReadPosRankSum=-2.342;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,207:384:99:8158,0,11573
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contig324	77050	.	T	TGGCTAGTTTGTGA	10767.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=1.371;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=4.063;QD=17.04;ReadPosRankSum=6.919;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,266:632:99:10805,0,17725
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contig324	77056	.	C	T	8858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.949;ClippingRankSum=-2.646;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=5.184;QD=14.76;ReadPosRankSum=5.534;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,231:600:99:8887,0,15356
contig324	77058	.	T	A	8921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;ClippingRankSum=1.098;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=3.227;QD=14.94;ReadPosRankSum=5.413;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,229:597:99:8950,0,15057
contig324	77060	.	AATC	A	8580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.911;ClippingRankSum=0.820;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=4.388;QD=14.35;ReadPosRankSum=5.524;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,230:598:99:8618,0,15034
contig324	77245	.	G	GGT	11401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.781;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.629;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,280:553:99:11439,0,10683
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contig324	87665	.	A	G	8008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-0.635;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.165;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,265:545:99:8037,0,8694
contig324	88239	.	A	G	8344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.081;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.249;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,251:482:99:8373,0,7406
contig324	88322	.	C	CT	9742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=-1.498;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.666;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,243:444:99:9780,0,7751
contig324	88331	.	C	T	10289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=-1.661;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.244;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,274:502:99:10318,0,7996
contig324	88359	.	T	C	9069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.652;ClippingRankSum=-0.052;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.029;QD=20.43;ReadPosRankSum=2.916;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,245:444:99:9098,0,7311
contig324	88361	.	TTC	T	9034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=2.386;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.412;QD=20.26;ReadPosRankSum=3.165;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,240:446:99:9072,0,7525
contig324	88395	.	GT	G	7112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.092;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.709;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,192:411:99:7150,0,8226
contig324	88397	.	A	G	7121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-1.486;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.178;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.171;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,192:413:99:7150,0,8226
contig324	88444	.	A	G	6477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.225;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.181;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,216:443:99:6506,0,7296
contig324	88472	.	A	C	8758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=-1.573;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.274;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,225:447:99:8787,0,8538
contig324	88490	.	A	T	8994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.124;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.952;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,240:488:99:9023,0,9374
contig324	88546	.	GTA	G	11670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=-0.417;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.961;QD=20.23;ReadPosRankSum=3.534;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,290:577:99:11708,0,11168
contig324	88550	.	C	A	12121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.722;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.539;QD=20.51;ReadPosRankSum=2.530;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,302:591:99:12150,0,11354
contig324	88570	.	A	G	12017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-0.764;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.984;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.869;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,314:595:99:12046,0,10728
contig324	88771	.	T	C	9602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.307;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.464;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,254:505:99:9631,0,9497
contig324	88790	.	T	C	9197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.445;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.270;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,246:518:99:9226,0,10253
contig324	88853	.	T	A	11216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.176;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.018;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,286:572:99:11245,0,11222
contig324	88854	.	C	G	11216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-0.592;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.318;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,292:581:99:11245,0,11222
contig324	88886	.	A	G	9296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=1.582;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.606;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.247;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,294:575:99:9325,0,8700
contig324	89388	.	G	A	10436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=1.479;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.414;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,275:558:99:10465,0,10964
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contig324	91353	.	C	T	8422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.656;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.958;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,214:475:99:8451,0,10752
contig324	91367	.	A	G	8100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.667;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.976;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,217:491:99:8129,0,10417
contig324	91431	.	G	C	9444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.571;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.239;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.290;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,252:559:99:9473,0,12133
contig324	91440	.	A	T	9510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.173;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.071;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,252:564:99:9539,0,12369
contig324	91466	.	A	G	9689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.416;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.847;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,254:560:99:9718,0,12066
contig324	91473	.	A	G	9623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.452;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.676;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,247:548:99:9652,0,12205
contig324	91476	.	T	C	9453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.102;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.047;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,244:529:99:9482,0,12002
contig324	91610	.	TTAA	T	10593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.110;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.794;QD=19.05;ReadPosRankSum=2.153;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,277:556:99:10631,0,10662
contig324	91614	.	CACACAGGTAATTT	C	10803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.115;ClippingRankSum=0.790;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.115;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.321;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,279:591:99:10841,0,12438
contig324	91641	.	G	A	10975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=2.172;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.219;QD=20.79;ReadPosRankSum=-2.161;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,264:528:99:11004,0,10383
contig324	91656	.	A	G	10309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=1.569;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.061;QD=19.90;ReadPosRankSum=-4.337;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,262:518:99:10338,0,9828
contig324	92464	.	T	A	10150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.369;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.001;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.975;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,267:562:99:10179,0,11194
contig324	92481	.	T	G	11041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.123;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.745;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,276:569:99:11070,0,12069
contig324	92485	.	C	T	10823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.526;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.220;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.121;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,278:580:99:10852,0,11789
contig324	93024	.	T	G	7764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.411;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.172;QD=16.21;ReadPosRankSum=4.184;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,248:479:99:7793,0,7256
contig324	93746	.	G	A	11483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-2.703;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.554;QD=20.04;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,295:573:99:11512,0,10543
contig324	93754	.	A	G	11792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.267;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.166;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,291:570:99:11821,0,11320
contig324	93772	.	C	T	11486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-0.419;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.158;QD=19.57;ReadPosRankSum=2.099;SOR=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,289:587:99:11515,0,12096
contig324	93782	.	C	G	10793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.481;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.364;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.979;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,282:567:99:10822,0,10918
contig324	94214	.	G	A	7710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.921;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.589;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.337;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,242:519:99:7739,0,8747
contig324	94233	.	A	G	9410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.153;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.290;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,241:506:99:9439,0,10419
contig324	94238	.	T	C	9733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.084;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.351;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,258:533:99:9762,0,10638
contig324	94259	.	C	T	8670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=1.884;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.426;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,275:521:99:8699,0,7244
contig324	94295	.	C	A	8735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.046;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.284;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,280:527:99:8764,0,7376
contig324	94684	.	C	CT	7778.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.422;DP=407;ExcessHet=3.0103;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.342;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,201:390:99:7816,0,7324
contig324	94686	.	A	T	7787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.293;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.762;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,205:401:99:7816,0,7324
contig324	94801	.	C	T	9917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=-0.294;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.824;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.932;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,254:492:99:9946,0,9407
contig324	94816	.	T	C	10856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.006;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.815;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,270:510:99:10885,0,9570
contig324	94835	.	C	T	10334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.935;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.047;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,251:476:99:10363,0,9137
contig324	94851	.	A	G	9701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-0.013;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.309;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,251:475:99:9730,0,8424
contig324	94950	.	A	G	10334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.544;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.391;QD=19.35;ReadPosRankSum=2.469;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,261:534:99:10363,0,17063
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contig324	101109	.	T	C	6182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.245;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.125;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.261;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,191:411:99:6211,0,7243
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contig324	101852	.	A	G	10655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=1.463;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.664;QD=18.09;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,291:589:99:10684,0,13699
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contig324	103588	.	C	T	8016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.635;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.685;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,260:514:99:8045,0,7523
contig324	103619	.	T	G	18517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.301;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.366;QD=24.40;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.300	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,500:501:99:18546,1461,0
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contig324	104022	.	A	G	11770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=-0.142;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.291;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,289:579:99:11799,0,11979
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contig324	104149	.	A	C	10539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-2.357;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.303;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,276:546:99:10568,0,10277
contig324	104160	.	G	A	10771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=-0.228;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.959;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,286:551:99:10800,0,10064
contig324	107514	.	C	CA	2755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-2.617;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.926;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,182:231:99:2793,0,301
contig324	115017	.	T	C	8857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-0.905;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.196;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.927;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,283:561:99:8886,0,8503
contig324	115380	.	A	G	8490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.912;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.070;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.909;SOR=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,281:561:99:8519,0,10334
contig324	116356	.	C	A	11289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.820;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.181;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,286:558:99:11318,0,10635
contig324	116357	.	A	G	11286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=1.425;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.117;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.792;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,284:558:99:11315,0,10657
contig324	116364	.	C	T	11225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=-1.009;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.730;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.148;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,288:558:99:11254,0,10403
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contig324	116449	.	GTGCGGT	G	11192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-1.606;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.101;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,293:595:99:11230,0,11655
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contig324	116629	.	A	ATT	8843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=1.483;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=4.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.684;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,228:467:99:8881,0,9240
contig324	116638	.	G	A	8908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-1.198;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.876;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,232:465:99:8937,0,9262
contig324	116852	.	T	G	9817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.985;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.162;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,253:481:99:9846,0,8893
contig324	116858	.	A	C	9788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=2.774;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.010;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,250:477:99:9817,0,8761
contig324	117311	.	C	T	12742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.085;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.461;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,337:662:99:12771,0,12203
contig324	117328	.	C	T	12646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.099;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.450;QD=19.02;ReadPosRankSum=2.122;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,335:665:99:12675,0,12297
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contig324	117708	.	G	T	8730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.788;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.424;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.209;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,230:467:99:8759,0,9114
contig324	117796	.	G	T	10259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=-1.082;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.757;QD=20.12;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,258:510:99:10288,0,10118
contig324	117800	.	C	T	10740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.041;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.038;QD=20.82;ReadPosRankSum=-1.288;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,263:516:99:10769,0,10154
contig324	117802	.	G	A	10629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.713;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.089;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,262:518:99:10658,0,10340
contig324	117808	.	A	G	9945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.373;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.474;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,256:518:99:9974,0,10047
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contig324	118188	.	A	AT	4674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;ClippingRankSum=-0.611;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.567;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,233:495:99:4712,0,9529
contig324	118191	.	T	C	8723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.649;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.504;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,251:549:99:8752,0,11064
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contig324	118296	.	ATT	A	5858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=1.444;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.738;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.379;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,187:377:99:5896,0,5726
contig324	118439	.	T	A	8786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=-0.341;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.418;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.560;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,233:444:99:8815,0,8283
contig324	118451	.	A	G	9845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.169;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.933;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,245:469:99:9874,0,8911
contig324	118469	.	G	C	9056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-1.041;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.680;QD=19.44;ReadPosRankSum=2.555;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,239:466:99:9085,0,8571
contig324	118502	.	A	C	7665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=-0.112;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.426;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,258:510:99:7694,0,7694
contig324	118560	.	A	AC	8404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.221;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.310;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.220;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,245:466:99:8442,0,7433
contig324	119327	.	A	G	10515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.554;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.101;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,272:507:99:10544,0,9016
contig324	119345	.	A	G	10047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.073;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.845;QD=19.40;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,264:518:99:10076,0,9437
contig324	119372	.	A	C	7487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.172;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.308;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,244:518:99:7516,0,8850
contig324	119504	.	T	C	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=2.543;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.735;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,293:547:99:9241,0,7767
contig324	120001	.	C	T	8062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.471;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.287;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,270:588:99:8091,0,10032
contig324	120019	.	G	C	8037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.123;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.996;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,260:573:99:8066,0,10226
contig324	120145	.	C	T	9895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.524;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.381;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,260:518:99:9924,0,10184
contig324	120157	.	A	G	10018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.448;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=3.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.085;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,262:526:99:10047,0,10141
contig324	120366	.	A	G	10108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=1.349;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.616;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,265:534:99:10137,0,10328
contig324	120380	.	C	A	9720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-1.086;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.407;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,250:515:99:9749,0,10261
contig324	120472	.	A	G	5545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.561;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.420;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,191:361:99:5574,0,4929
contig324	120604	.	C	T	9614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.313;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.439;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.566;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,250:470:99:9643,0,8394
contig324	120616	.	G	A	9939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=-0.591;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.779;QD=20.24;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,265:491:99:9968,0,8504
contig324	120766	.	G	A	11962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.397;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.322;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,308:561:99:11991,0,9875
contig324	120772	.	T	C	11680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.032;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.364;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,295:555:99:11709,0,9959
contig324	121022	.	CA	C	5378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.506;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.142;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,190:427:99:5416,0,7152
contig324	121452	.	C	T	9845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.380;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.240;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.236;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,254:513:99:9874,0,10196
contig324	121455	.	T	C	9860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=-1.956;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.687;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,252:509:99:9889,0,10042
contig324	121511	.	C	G	9968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.102;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.381;QD=20.26;ReadPosRankSum=2.141;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,252:492:99:9997,0,9347
contig324	121512	.	C	T	10008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.835;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.745;QD=20.26;ReadPosRankSum=2.160;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,253:494:99:10037,0,9380
contig324	121519	.	A	G	10010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.341;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.319;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.927;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,259:501:99:10039,0,9230
contig324	121607	.	A	G	9307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.936;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.203;QD=16.68;ReadPosRankSum=3.521;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,247:558:99:9336,0,12198
contig324	121622	.	A	G	9631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-1.364;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.281;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,248:553:99:9660,0,12294
contig324	121642	.	T	G	9094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-0.671;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.147;QD=17.66;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,229:515:99:9123,0,12003
contig324	121651	.	G	A	8931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-3.293;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.556;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,231:499:99:8960,0,11074
contig324	121661	.	A	G	8396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.190;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.562;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,223:490:99:8425,0,10444
contig324	121691	.	G	A	6266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=-0.603;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.129;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,214:469:99:6295,0,7923
contig324	122226	.	T	TA	7056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-2.316;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.483;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,281:564:99:7094,0,7980
contig324	122581	.	G	A	9068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.830;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.992;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,242:514:99:9097,0,10297
contig324	122598	.	T	C	9111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=1.395;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.992;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,239:502:99:9140,0,10118
contig324	122635	.	T	C	8199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-1.299;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.137;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,258:509:99:8228,0,8372
contig324	122841	.	G	A	7799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-2.423;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.910;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,212:465:99:7828,0,9696
contig324	122862	.	C	T	7631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=1.308;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.654;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,192:422:99:7660,0,9398
contig324	122878	.	G	A	7109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.068;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.074;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,187:409:99:7138,0,8739
contig324	123345	.	A	C	7325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-1.380;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.036;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,231:465:99:7354,0,7219
contig324	123374	.	T	A	10302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.270;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.384;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,267:504:99:10331,0,8865
contig324	123391	.	C	T	10659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.207;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.018;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,277:526:99:10688,0,9323
contig324	123478	.	A	G	8660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.028;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.535;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.128;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,240:492:99:8689,0,9377
contig324	123501	.	C	G	8753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.896;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.473;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,237:478:99:8782,0,9013
contig324	123846	.	G	A	7126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.511;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=11.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=3.426;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=1.142	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,245:468:99:7155,0,6862
contig324	123917	.	T	G	8381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.136;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.036;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,230:485:99:8410,0,9547
contig324	123940	.	A	C	8793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.762;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.540;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,241:487:99:8822,0,9254
contig324	124133	.	T	C	7024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.033;ClippingRankSum=0.804;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.529;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,190:413:99:7053,0,8847
contig324	124156	.	A	G	7415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-1.212;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=6.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.406;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.460;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,191:403:99:7444,0,8272
contig324	124183	.	A	G	6497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.874;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.889;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,210:423:99:6526,0,6632
contig324	124223	.	G	T	6237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.772;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.192;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,210:431:99:6266,0,6881
contig324	124354	.	A	G	10485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=-0.138;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.772;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,273:521:99:10514,0,9496
contig324	124367	.	A	G	10982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.597;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.177;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,289:552:99:11011,0,9950
contig324	124418	.	GA	G	6886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.626;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.221;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,288:620:99:6924,0,8406
contig324	124809	.	T	G	9287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-0.105;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.602;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,245:530:99:9316,0,10782
contig324	124829	.	T	C	9525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.673;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.554;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,258:546:99:9554,0,10970
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contig324	127259	.	C	T	7395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=1.045;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.838;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,228:411:99:7424,0,5400
contig324	127306	.	A	T	7728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.929;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.335;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,253:455:99:7757,0,6111
contig324	127354	.	A	C	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.591;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.135;QD=16.96;ReadPosRankSum=1.184;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,182:418:99:7117,0,9491
contig324	127355	.	A	C	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.590;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.229;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,185:422:99:7117,0,9491
contig324	127356	.	A	C	7088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.730;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.022;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,188:428:99:7117,0,9491
contig324	127556	.	T	G	9669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.168;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.958;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,257:527:99:9698,0,10376
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contig324	127617	.	G	A	9653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=1.223;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.858;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,242:498:99:9682,0,10380
contig324	127620	.	G	T	9581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.143;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.405;QD=19.09;ReadPosRankSum=-1.661;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,247:502:99:9610,0,10020
contig324	127682	.	TGA	T	8128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.965;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.137;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,211:461:99:8166,0,9752
contig324	127695	.	T	A	9204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=-0.528;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.054;QD=18.56;ReadPosRankSum=1.378;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,232:496:99:9233,0,10751
contig324	127701	.	A	T	9002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.864;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.471;QD=17.97;ReadPosRankSum=2.148;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,229:501:99:9031,0,10927
contig324	127859	.	A	G	9357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.024;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.509;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.835;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,309:592:99:9386,0,8622
contig324	127889	.	C	T	10383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=1.005;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.176;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,290:589:99:10412,0,10818
contig324	127913	.	C	T	10056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-1.049;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.037;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,272:544:99:10085,0,10318
contig324	127954	.	G	T	10913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=-2.128;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.338;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,278:550:99:10942,0,10774
contig324	127955	.	C	T	11008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.293;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.988;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,276:550:99:11037,0,11027
contig324	127969	.	A	C	10463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.935;ClippingRankSum=0.541;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.198;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.595;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,277:576:99:10492,0,11292
contig324	128080	.	C	T	10877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-1.139;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.257;QD=18.72;ReadPosRankSum=4.043;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,291:581:99:10906,0,10858
contig324	128098	.	A	G	11404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-1.147;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.620;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,285:566:99:11433,0,11287
contig324	128119	.	A	G	11210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=1.320;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.476;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,293:590:99:11239,0,11170
contig324	128234	.	A	G	10672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.277;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.011;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,289:601:99:10701,0,11688
contig324	128254	.	C	A	10234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.110;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.818;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.959;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,277:582:99:10263,0,11774
contig324	128564	.	G	A	8638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.954;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.074;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,231:540:99:8667,0,11893
contig324	128578	.	A	G	8393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=-1.089;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.193;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.084;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,225:522:99:8422,0,11626
contig324	128791	.	C	T	10602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=1.492;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.984;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,274:539:99:10631,0,10232
contig324	128797	.	G	A	10465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=1.654;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.396;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.287;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,269:532:99:10494,0,10164
contig324	128911	.	A	G	11422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=1.330;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.911;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,303:584:99:11451,0,10644
contig324	128925	.	T	C	10988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.335;ClippingRankSum=0.272;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.197;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.043;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,276:559:99:11017,0,11514
contig324	128946	.	G	C	10326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.959;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=4.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.096;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,257:541:99:10355,0,11656
contig324	128952	.	C	T	9881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.733;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.757;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,251:545:99:9910,0,11390
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contig324	129292	.	T	G	9881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.123;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.688;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,262:586:99:9910,0,12507
contig324	129303	.	T	C	10332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=-1.005;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.579;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,260:587:99:10361,0,13247
contig324	129313	.	A	T	10058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.033;ClippingRankSum=2.496;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.795;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,258:567:99:10087,0,12416
contig324	129364	.	A	G	10364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.120;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.713;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,272:608:99:10393,0,13065
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contig324	129984	.	TA	T	4669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.921;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.758;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.273;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,207:400:99:4707,0,4322
contig324	130076	.	A	G	7897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.223;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.426;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,213:459:99:7926,0,9389
contig324	130083	.	C	CA	8070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.432;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.969;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,203:443:99:8108,0,9603
contig324	130098	.	C	T	7549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.252;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.100;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,199:414:99:7578,0,8744
contig324	130155	.	C	T	5969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.195;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.926;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,195:434:99:5998,0,7408
contig324	130221	.	G	GTTT,GTTTTTTT	7729.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.466;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.333;QD=29.92;ReadPosRankSum=1.333;SOR=1.942	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:2,24,46:72:99:7767,2626,2062,1051,0,643
contig324	130254	.	G	A	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=-0.023;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=8.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-0.646;QD=12.53;ReadPosRankSum=-2.498;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,102:244:99:3086,0,4388
contig324	130357	.	G	A	6712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.849;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.823;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,172:372:99:6741,0,8260
contig324	130361	.	T	A	6743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=-0.342;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.416;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,179:391:99:6772,0,8565
contig324	130382	.	C	G	7179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-1.049;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.982;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,230:420:99:7208,0,6994
contig324	130416	.	A	G	8136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.551;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.209;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,216:460:99:8165,0,9142
contig324	130433	.	G	A	8631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.690;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.181;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,217:457:99:8660,0,9657
contig324	130439	.	T	A	8215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.628;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.214;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,217:453:99:8244,0,9257
contig324	130618	.	G	A	9373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.702;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.516;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,242:495:99:9402,0,9745
contig324	130628	.	G	T	10040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.320;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.240;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,249:504:99:10069,0,10242
contig324	130635	.	G	A	9835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.164;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.663;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,257:523:99:9864,0,10320
contig324	130741	.	C	T	6575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=1.594;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.022;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,219:422:99:6604,0,6106
contig324	130805	.	C	CTTT,CTTTTT	8739.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-1.155;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.11;MQRankSum=0.962;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,45,38:84:99:8777,1483,775,1585,0,903
contig324	130836	.	G	C	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.028;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=2.293;QD=15.25;ReadPosRankSum=2.405;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:103,115:218:99:3352,0,2978
contig324	130942	.	A	G	6513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=1.850;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=9.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.506;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,173:351:99:6542,0,6466
contig324	130959	.	G	A	6938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=1.608;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.374;QD=19.66;ReadPosRankSum=-2.657;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:170,183:353:99:6967,0,6341
contig324	131165	.	T	G	5207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.637;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.065;QD=12.17;ReadPosRankSum=3.913;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,180:428:99:5236,0,7638
contig324	131176	.	T	G	5263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=1.206;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.268;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.912;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,178:434:99:5292,0,8083
contig324	132157	.	A	G	6704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.822;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.360;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,223:417:99:6733,0,5775
contig324	132172	.	TA	T	4334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.249;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.192;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.354;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,198:372:99:4372,0,3475
contig324	132184	.	A	T	6460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.106;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.338;QD=14.23;ReadPosRankSum=3.809;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,228:454:99:6489,0,6557
contig324	132601	.	G	A	7054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-0.769;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.227;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,243:471:99:7083,0,6819
contig324	132684	.	C	T	8125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-2.092;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.031;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,250:479:99:8154,0,7457
contig324	132814	.	A	G	8956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-1.316;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.806;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,242:474:99:8985,0,8579
contig324	132833	.	C	T	9064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-2.316;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.250;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,237:451:99:9093,0,7992
contig324	132892	.	G	GA	8565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.049;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.352;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,224:429:99:8603,0,8005
contig324	132898	.	G	GT	8913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.823;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.210;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,231:457:99:8951,0,8415
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contig324	133165	.	C	A	6664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.071;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.467;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,217:455:99:6693,0,7522
contig324	133733	.	C	T	7259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=-1.179;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.902;QD=15.22;ReadPosRankSum=-2.791;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,243:477:99:7288,0,6828
contig324	133744	.	C	T	6775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.457;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.724;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,228:482:99:6804,0,7779
contig324	133922	.	A	G	7552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-0.150;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.306;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,253:504:99:7581,0,7772
contig324	134217	.	C	T	7681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.417;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.873;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,243:519:99:7710,0,9060
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contig324	134893	.	G	A	9192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.872;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.822;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,240:508:99:9221,0,10486
contig324	135201	.	C	A	7542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.274;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.755;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,248:543:99:7571,0,11189
contig324	135981	.	C	T	7304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.873;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=4.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.298;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=1.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,241:480:99:7333,0,7181
contig324	136101	.	T	C	7659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=1.050;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.894;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,245:496:99:7688,0,9674
contig324	136600	.	C	A	9252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.485;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.851;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.316;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,235:436:99:9281,0,7674
contig324	136604	.	G	A	9314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.249;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.495;QD=21.76;ReadPosRankSum=-1.874;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,235:428:99:9343,0,7504
contig324	136631	.	A	G	7376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.175;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.921;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,196:416:99:7405,0,8581
contig324	136648	.	A	T	7937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.882;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.284;QD=17.45;ReadPosRankSum=-2.034;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,219:455:99:7966,0,8870
contig324	136680	.	A	T	8223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.450;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.872;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,217:466:99:8252,0,9506
contig324	136690	.	G	A	8594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.648;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.500;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,210:460:99:8623,0,9667
contig324	136704	.	A	ATGAT	8282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.260;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.068;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,211:456:99:8320,0,9551
contig324	136820	.	AGG	A	10611.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.868;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.498;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,272:547:99:10649,0,10760
contig324	136827	.	A	C	11160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.499;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.147;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,276:547:99:11189,0,10922
contig324	136828	.	A	C	11077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-1.659;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.604;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.636;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,278:550:99:11106,0,10813
contig324	136861	.	C	T	8310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.216;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.473;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,261:550:99:8339,0,9080
contig324	137487	.	T	TC	5771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.238;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.396;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.513;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,238:467:99:5809,0,6048
contig324	137544	.	A	T	3513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=0.218;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=6.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.417;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.596;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,167:361:99:3542,0,5945
contig324	137709	.	T	A	9199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.256;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.228;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,238:453:99:9228,0,8004
contig324	137728	.	G	A	9368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=1.525;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.686;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,249:478:99:9397,0,8540
contig324	137761	.	G	T	9688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.714;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.464;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,257:469:99:9717,0,7869
contig324	137782	.	G	A	9677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=-0.805;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.367;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,256:478:99:9706,0,8380
contig324	138526	.	T	G	25561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.738;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQRankSum=-0.738;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,691:693:99:25590,2026,0
contig324	138570	.	GGATGAT	G	7060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.070;DP=830;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.559;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,234:550:99:7098,0,11655
contig324	138684	.	T	G	12173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.592;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.769;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.179;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:395,406:801:99:12202,0,11998
contig324	138867	.	AGCCTCTGAT	A	9987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.907;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.491;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,267:567:99:10025,0,11665
contig324	139237	.	G	A	6673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=1.242;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.382;QD=14.86;ReadPosRankSum=-2.152;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,218:449:99:6702,0,7163
contig324	139269	.	A	T	7034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.081;ClippingRankSum=-0.001;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.548;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,229:484:99:7063,0,7628
contig324	139326	.	CA	C	6544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=1.189;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.296;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,241:463:99:6582,0,4985
contig324	139340	.	T	C	7755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=1.231;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.087;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.881;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,245:494:99:7784,0,7547
contig324	139521	.	G	A	11076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=-0.291;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.144;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.869;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,286:587:99:11105,0,11862
contig324	139528	.	C	T	11070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=1.946;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.463;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,289:601:99:11099,0,12126
contig324	140070	.	C	A	8423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.429;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.161;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,220:473:99:8452,0,10226
contig324	140074	.	GC	G	8467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=-0.949;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.019;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,219:468:99:8505,0,10198
contig324	140076	.	A	T	8387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=-0.066;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.571;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,217:464:99:8416,0,10072
contig324	140096	.	A	G	9365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.332;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.082;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.164;SOR=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,246:509:99:9394,0,10449
contig324	140097	.	G	C	9365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.120;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.406;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,247:510:99:9394,0,10449
contig324	140205	.	T	A	10442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.108;ClippingRankSum=1.964;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.428;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.710;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,271:594:99:10471,0,12589
contig324	140207	.	T	A	10442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=-0.345;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.008;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,271:587:99:10471,0,12589
contig324	140249	.	T	G	8633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.503;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.014;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.725;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,290:568:99:8662,0,8292
contig324	140317	.	C	A	9643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.965;ClippingRankSum=-1.626;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=63.177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQRankSum=-0.818;QD=32.04;ReadPosRankSum=-2.305;SOR=0.229	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:21,280:301:99:9672,579,0
contig324	140328	.	C	CTTT	3751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.451;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=4.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=0.925;QD=27.59;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=1.409	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,133:136:99:3718,414,0
contig324	140397	.	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.613;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=23.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.526;QD=4.59;ReadPosRankSum=-4.093;SOR=1.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,41:199:99:942,0,4864
contig324	140485	.	A	AT	3711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-1.361;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=16.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.754;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.735;SOR=1.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,151:339:99:3749,0,4959
contig324	140541	.	CCA	C	7113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=1.002;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.953;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,189:399:99:7151,0,8090
contig324	140709	.	G	T	7735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-1.090;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.353;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,256:532:99:7764,0,8794
contig324	140872	.	C	A	7365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=-1.244;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.017;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,227:466:99:7394,0,7426
contig324	141269	.	C	A	11333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.501;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.939;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,300:637:99:11362,0,13371
contig324	141272	.	A	T	11215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.711;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.278;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,294:632:99:11244,0,13365
contig324	141320	.	T	C	8984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.786;ClippingRankSum=-0.740;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.136;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,244:527:99:9013,0,10819
contig324	141332	.	G	T	9186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-1.156;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.165;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,238:520:99:9215,0,10978
contig324	142287	.	C	A	6609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.206;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.319;QD=15.19;ReadPosRankSum=2.875;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,215:435:99:6638,0,6719
contig325	600	.	C	G	5777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.505;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.132;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.118;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,185:359:99:5806,0,6662
contig325	770	.	G	A	5918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.700;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=4.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.376;QD=18.10;ReadPosRankSum=2.329;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,152:327:99:5947,0,12040
contig325	771	.	G	A	5918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-0.292;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=5.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.619;QD=17.94;ReadPosRankSum=1.395;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,154:330:99:5947,0,12040
contig326	8934	.	T	C	9978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.292;ClippingRankSum=-1.506;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.121;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,335:696:99:10007,0,11696
contig327	271	.	ATAT	A	8643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.633;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.184;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,227:452:99:8681,0,8665
contig328	8031	.	T	C	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.084;ClippingRankSum=0.891;DP=805;ExcessHet=3.0103;FS=37.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-15.870;QD=2.73;ReadPosRankSum=-6.618;SOR=4.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:687,96:783:99:2168,0,28421
contig328	8043	.	C	T	4688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.302;ClippingRankSum=-1.805;DP=877;ExcessHet=3.0103;FS=49.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-18.252;QD=5.54;ReadPosRankSum=-5.001;SOR=4.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:694,152:846:99:4717,0,29741
contig328	8058	.	T	A	6132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=2.517;DP=972;ExcessHet=3.0103;FS=44.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-14.949;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.299;SOR=3.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:698,208:906:99:6161,0,28116
contig328	8094	.	C	A	9251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.866;DP=1222;ExcessHet=3.0103;FS=48.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-6.157;QD=8.69;ReadPosRankSum=2.804;SOR=2.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:710,355:1065:99:9280,0,23436
contig328	8177	.	C	T	20008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.667;DP=1319;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.953;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:658,523:1181:99:20037,0,26385
contig328	8179	.	A	G	20560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.640;DP=1303;ExcessHet=3.0103;FS=7.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.398;QD=17.50;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:656,519:1175:99:20589,0,26847
contig328	8201	.	G	A	22607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.674;DP=1305;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=1.097;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.428;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:646,568:1214:99:22636,0,26365
contig328	8205	.	A	G	22055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-1.362;DP=1289;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-2.077;QD=18.32;ReadPosRankSum=6.202;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:641,563:1204:99:22084,0,25320
contig328	8260	.	C	CAA	20983.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=-1.190;DP=1249;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-16.533;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:625,533:1158:99:21021,0,25979
contig328	8265	.	A	G	22937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.068;DP=1273;ExcessHet=3.0103;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQRankSum=-11.855;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:666,562:1228:99:22966,0,27546
contig328	8272	.	T	C	23807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.107;DP=1301;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-15.366;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.632;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:665,595:1260:99:23836,0,27728
contig328	8277	.	C	T	23115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.606;DP=1283;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-14.331;QD=18.57;ReadPosRankSum=-2.469;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:645,600:1245:99:23144,0,26402
contig328	8310	.	C	A	21754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.570;DP=1275;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-7.715;QD=17.57;ReadPosRankSum=2.784;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:667,571:1238:99:21792,0,25909
contig328	14157	.	C	G	24685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-1.417;DP=2639;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.160;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1653,854:2507:99:24714,0,56028
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contig328	14282	.	G	A	32335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=1.551;DP=2653;ExcessHet=3.0103;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.199;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1653,889:2542:99:32364,0,66868
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contig330	14141	.	TTTATTTATATTCATGTACAATCATCAATA	T	10424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.306;ClippingRankSum=-0.093;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.485;QD=16.34;ReadPosRankSum=-3.037;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,282:638:99:10462,0,13786
contig330	14511	.	G	A	8260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.251;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.965;QD=16.46;ReadPosRankSum=4.229;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,267:502:99:8289,0,6993
contig330	14636	.	C	T	7556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.899;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=9.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.115;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.325	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,239:466:99:7585,0,7516
contig330	14765	.	G	C	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.854;ClippingRankSum=0.249;DP=335;ExcessHet=3.0103;FS=81.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.990;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.723;SOR=3.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,76:315:99:2025,0,7789
contig330	15203	.	T	C	10813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.280;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-8.799;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.408;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,280:600:99:10842,0,14886
contig330	15206	.	A	C	10714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.470;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQRankSum=-11.281;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,279:597:99:10743,0,14865
contig330	22257	.	A	ATGATAAATTTGCC	3848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;ClippingRankSum=0.331;DP=1043;ExcessHet=3.0103;FS=28.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQRankSum=-2.944;QD=4.58;ReadPosRankSum=-17.667;SOR=2.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:686,154:840:99:3886,0,28681
contig330	22260	.	C	CCTCAAATTTTCCTTTATTGAGTCGTGTTACCTG	1739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.234;ClippingRankSum=0.770;DP=934;ExcessHet=3.0103;FS=45.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-4.637;QD=2.24;ReadPosRankSum=-15.109;SOR=8.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:687,91:778:99:1777,0,28877
contig330	25301	.	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.643;ClippingRankSum=-0.783;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=78.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQRankSum=-6.481;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.890;SOR=6.228	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,45:414:99:760,0,24108
contig330	25302	.	T	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.561;ClippingRankSum=0.310;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=74.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.51;MQRankSum=-6.747;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.818;SOR=6.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,44:414:99:760,0,24108
contig330	27420	.	T	C	8489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=-0.065;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.552;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.427;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,263:551:99:8518,0,8952
contig330	27500	.	A	C	63344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;ClippingRankSum=0.489;DP=2180;ExcessHet=3.0103;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQRankSum=-20.222;QD=30.95;ReadPosRankSum=6.439;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:524,1523:2047:99:63373,0,17483
contig330	27502	.	T	A	63935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=1.778;DP=2194;ExcessHet=3.0103;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQRankSum=-23.103;QD=30.96;ReadPosRankSum=7.787;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:524,1541:2065:99:63964,0,17983
contig330	27505	.	C	CCGG	65766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.341;ClippingRankSum=-1.523;DP=2222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQRankSum=-24.694;QD=31.35;ReadPosRankSum=10.038;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:526,1572:2098:99:65804,0,17920
contig330	27513	.	CA	C	69101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;ClippingRankSum=-1.631;DP=2305;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQRankSum=-24.359;QD=31.55;ReadPosRankSum=9.387;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:524,1666:2190:99:69139,0,18019
contig330	27519	.	A	G	80544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;ClippingRankSum=1.119;DP=2335;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQRankSum=-13.836;QD=32.96;ReadPosRankSum=3.497;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,1978:2222:99:80573,0,2015
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contig330	27529	.	T	A	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.342;ClippingRankSum=-0.076;DP=2353;ExcessHet=3.0103;FS=7.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQRankSum=-7.202;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.364;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1729,496:2225:99:11648,0,66358
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contig330	27563	.	A	C	41475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-0.545;DP=1580;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQRankSum=-22.296;QD=27.20;ReadPosRankSum=-8.543;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:533,992:1525:99:41504,0,20084
contig330	27565	.	A	G	39987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.344;ClippingRankSum=-0.223;DP=1513;ExcessHet=3.0103;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQRankSum=-22.230;QD=27.33;ReadPosRankSum=-9.044;SOR=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:534,929:1463:99:40016,0,19856
contig330	27569	.	G	A	20366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.821;ClippingRankSum=0.213;DP=1327;ExcessHet=3.0103;FS=12.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQRankSum=-18.316;QD=15.79;ReadPosRankSum=-9.886;SOR=1.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:706,584:1290:99:20395,0,27167
contig330	27572	.	T	C	29418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=-1.302;DP=1236;ExcessHet=3.0103;FS=15.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQRankSum=-24.331;QD=24.41;ReadPosRankSum=-11.538;SOR=1.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:507,698:1205:99:29447,0,19862
contig330	27579	.	A	G	19998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=1.165;DP=968;ExcessHet=3.0103;FS=69.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQRankSum=-25.730;QD=21.21;ReadPosRankSum=-8.718;SOR=3.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:504,439:943:99:20027,0,20158
contig330	27580	.	G	A	18339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.402;ClippingRankSum=1.070;DP=942;ExcessHet=3.0103;FS=72.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQRankSum=-25.458;QD=20.00;ReadPosRankSum=-8.934;SOR=3.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:501,416:917:99:18368,0,20551
contig330	27584	.	G	C	14803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;ClippingRankSum=-0.404;DP=902;ExcessHet=3.0103;FS=79.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.39;MQRankSum=-24.793;QD=16.92;ReadPosRankSum=-9.273;SOR=4.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:511,364:875:99:14832,0,20717
contig330	27622	.	T	C	9975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=-1.093;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.110;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,268:518:99:10004,0,9219
contig330	27640	.	C	CA	9855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.092;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.298;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,241:470:99:9893,0,9174
contig330	27663	.	T	C	9546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=2.605;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.138;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,254:469:99:9575,0,7968
contig330	28383	.	T	C	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.508;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.052;QD=6.62;ReadPosRankSum=4.101;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,189:491:99:3281,0,9500
contig330	29023	.	A	G	9781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=-0.710;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.281;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,251:518:99:9810,0,12545
contig330	29026	.	C	T	9618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=-0.872;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.678;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,247:512:99:9647,0,12508
contig330	29152	.	A	C	7723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=1.530;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.822;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,252:539:99:7752,0,13417
contig330	29161	.	T	C	9543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-0.111;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.452;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,250:531:99:9572,0,8637
contig330	30867	.	A	G	9546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.641;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.167;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,253:551:99:9575,0,11923
contig330	30878	.	C	A	9829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-0.182;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.756;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,261:573:99:9858,0,12138
contig330	31237	.	CGGT	C	10738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.110;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.522;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,283:583:99:10776,0,11809
contig330	36702	.	G	A	5823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.764;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=5.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.314;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,176:364:99:5852,0,7601
contig330	36721	.	CTT	C	2040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.707;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.517;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.822;SOR=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,83:189:99:2078,0,2502
contig330	36803	.	A	G	6802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-2.179;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.108;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:178,218:396:99:6831,0,5520
contig330	37029	.	G	A	12894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=1.553;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.021;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,328:657:99:12923,0,12669
contig330	37030	.	G	A	12894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.465;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.142;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.998;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,333:658:99:12923,0,12669
contig330	37699	.	T	C	10849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-0.054;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.340;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,295:640:99:10878,0,17181
contig330	37718	.	A	G	10462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.098;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.268;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,282:621:99:10491,0,17227
contig330	38806	.	G	A	11974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=1.854;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.672;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,315:601:99:12003,0,11531
contig330	38823	.	T	C	12353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=-0.518;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.768;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.214;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,323:622:99:12382,0,11522
contig330	38967	.	A	T	19922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.675;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQRankSum=-0.736;QD=26.02;ReadPosRankSum=-1.613;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,548:551:99:19951,1559,0
contig330	39632	.	T	C	9170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.311;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.032;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,305:623:99:9199,0,10066
contig330	40076	.	T	C	10576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.869;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.301;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.339;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,283:594:99:10605,0,11521
contig330	40089	.	C	G	10805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.717;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.165;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,294:600:99:10834,0,11585
contig330	40106	.	G	GA	5850.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-1.201;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.549;QD=11.00;ReadPosRankSum=-2.935;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,271:532:99:5888,0,5616
contig330	40270	.	G	T	9644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-0.453;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.508;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,249:477:99:9673,0,8799
contig330	40276	.	T	C	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-0.341;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.790;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,250:481:99:9696,0,8870
contig330	40306	.	GT	G	5112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.130;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.961;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,227:441:99:5150,0,4768
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contig330	41518	.	GGCAGCCTTGGCA	G	5980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.138;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-2.773;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.509;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,198:417:99:6018,0,8251
contig330	41557	.	G	A	7846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.179;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=2.580;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,253:485:99:7875,0,7062
contig330	42232	.	T	C	7810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=-0.530;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.204;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.388;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,258:559:99:7839,0,9503
contig330	42605	.	GA	G	4920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.590;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.373;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.934;SOR=1.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,248:433:99:4958,0,3545
contig330	43523	.	A	G	10731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.778;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=3.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.360;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,275:548:99:10760,0,10619
contig330	43524	.	T	C	10731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.322;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.472;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,279:554:99:10760,0,10619
contig330	44459	.	G	A	9897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.029;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.481;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,317:628:99:9926,0,9578
contig330	44549	.	T	C	11907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=0.319;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.096;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.954;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,312:633:99:11936,0,12931
contig330	44570	.	G	A	12027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.742;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.681;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,318:629:99:12056,0,12133
contig330	44618	.	A	G	11387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.398;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.604;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,290:584:99:11416,0,11414
contig330	44624	.	G	A	11233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.980;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.660;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,288:580:99:11262,0,11381
contig330	44657	.	A	G	11033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-1.017;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.180;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,293:591:99:11062,0,11135
contig330	44674	.	A	G	11055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-4.053;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.269;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,296:606:99:11084,0,11645
contig330	44782	.	T	C	11755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.227;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.202;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.760;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,294:589:99:11784,0,11600
contig330	44785	.	T	C	12096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=1.384;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.954;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,296:589:99:12125,0,11802
contig330	44788	.	C	T	12190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.104;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.519;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,304:591:99:12219,0,11949
contig330	44789	.	A	G	12316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=1.133;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.094;QD=20.84;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,302:591:99:12345,0,11940
contig330	44805	.	T	G	12235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=1.294;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.082;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.392;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,291:582:99:12264,0,11904
contig330	44812	.	C	T	12262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=-0.427;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.610;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,307:605:99:12291,0,12111
contig330	44815	.	G	T	12193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.203;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.074;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,310:608:99:12222,0,11907
contig330	44828	.	T	C	11425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.515;ClippingRankSum=0.411;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.592;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,282:548:99:11454,0,10791
contig330	44832	.	T	C	10828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.705;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.316;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,274:537:99:10857,0,10355
contig330	44833	.	C	T	10708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=-0.235;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.395;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,270:531:99:10737,0,10280
contig330	44859	.	G	A	8034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.533;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.180;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,213:439:99:8063,0,8604
contig330	44873	.	G	C	7646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=-0.005;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.356;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,200:424:99:7675,0,8510
contig330	44893	.	G	GTTTTT	4492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=1.243;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=7.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=0.279;QD=14.40;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:169,143:312:99:4530,0,6581
contig330	44917	.	T	C	8859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.361;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=8.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.250;QD=24.54;ReadPosRankSum=3.115;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,218:361:99:8888,0,5807
contig330	44924	.	A	C	8563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.946;ClippingRankSum=0.526;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=10.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=0.512;QD=22.30;ReadPosRankSum=2.911;SOR=1.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,223:384:99:8592,0,5832
contig330	44943	.	CT	C	6092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=1.964;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=1.913;QD=14.58;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,236:418:99:6130,0,4326
contig330	44970	.	T	C	7258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.289;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.014;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,249:460:99:7287,0,5994
contig330	44996	.	G	T	8101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=-1.749;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.131;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,263:511:99:8130,0,6992
contig330	45323	.	A	G	9618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.653;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.568;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,255:545:99:9647,0,10840
contig330	45341	.	T	C	9785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-0.828;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.367;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,259:531:99:9814,0,10406
contig330	45374	.	C	T	10823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.235;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.239;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,280:560:99:10852,0,11102
contig330	45377	.	A	G	10811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.335;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.006;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,277:566:99:10840,0,11132
contig330	45441	.	A	G	10762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.106;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.426;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,285:598:99:10791,0,12112
contig330	45451	.	G	T	11151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.980;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.696;QD=18.90;ReadPosRankSum=-2.219;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,282:590:99:11180,0,12429
contig330	45466	.	C	T	10266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.571;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.660;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,275:578:99:10295,0,11844
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contig330	47139	.	CT	C	8194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=1.197;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.311;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,257:487:99:8232,0,9583
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contig330	47163	.	C	T	9824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-1.958;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=4.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.406;QD=20.86;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,251:471:99:9853,0,8268
contig330	47193	.	GT	G	6043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.790;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.458;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,244:456:99:6081,0,5110
contig330	47413	.	T	C	11958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.166;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.944;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,312:623:99:11987,0,12639
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contig330	47492	.	C	T	12247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-2.084;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.548;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,308:584:99:12276,0,10899
contig330	47498	.	C	G	12750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.632;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.695;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,312:587:99:12779,0,10876
contig330	47502	.	A	C	12250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.627;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.640;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,314:590:99:12279,0,10626
contig330	47557	.	T	G	9673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.053;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=2.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.665;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,257:528:99:9702,0,10228
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contig330	47604	.	CT	C	7871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=-0.445;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.030;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,204:385:99:7909,0,6840
contig330	47614	.	AT	A	8426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=2.150;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.950;QD=20.81;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,217:405:99:8464,0,7221
contig330	47625	.	TTA	T	8556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.791;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.760;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.827;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,212:406:99:8594,0,7694
contig330	47632	.	ATTTAT	A	8073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.059;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.074;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,207:405:99:8111,0,7744
contig330	47664	.	C	A	7718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.118;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.102;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,200:404:99:7747,0,7550
contig330	47672	.	C	CT	7772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.568;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=5.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.163;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.699;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,195:394:99:7810,0,7812
contig330	47696	.	A	G	6948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=0.367;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.234;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,185:370:99:6977,0,6911
contig330	48048	.	A	G	8747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.064;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.496;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,290:609:99:8776,0,9742
contig330	48126	.	G	A	9906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=-0.244;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.157;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,261:557:99:9935,0,11671
contig330	48134	.	T	G	9820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-1.908;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.163;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,258:564:99:9849,0,12479
contig330	48155	.	A	G	9579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.140;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.116;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,299:569:99:9608,0,9912
contig330	48358	.	A	G	10024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.895;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.890;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,263:584:99:10053,0,12706
contig330	48362	.	T	C	9967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.161;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.991;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,259:579:99:9996,0,12644
contig330	48527	.	C	A	9158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.415;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.005;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,290:586:99:9187,0,9358
contig330	48686	.	A	G	9960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.964;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.547;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,264:580:99:9989,0,21149
contig330	48692	.	T	C	10705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=-0.551;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.660;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,265:596:99:10734,0,21621
contig330	48701	.	T	G	10503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-0.539;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.848;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,279:591:99:10532,0,19820
contig330	49175	.	C	T	12918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=1.019;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.426;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,348:717:99:12947,0,13912
contig330	49193	.	C	G	12832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.594;DP=742;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.882;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,344:714:99:12861,0,13937
contig330	49883	.	G	A	8848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.156;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.054;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,287:589:99:8877,0,9614
contig330	50377	.	T	TA	30086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.329;DP=801;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQRankSum=-1.491;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.335;SOR=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,754:757:99:30124,2183,0
contig330	50481	.	TAGATGTAGATGATTC	T	5244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.104;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-3.476;QD=12.61;ReadPosRankSum=4.194;SOR=1.005	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,185:416:99:5282,0,8890
contig330	50549	.	G	A	10099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.922;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=2.657;QD=15.26;ReadPosRankSum=3.208;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,331:662:99:10128,0,11989
contig330	50581	.	G	A	10399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.171;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=0.467;QD=16.59;ReadPosRankSum=1.841;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,327:627:99:10428,0,11119
contig330	50822	.	C	A	11845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.056;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.562;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,304:638:99:11874,0,14859
contig330	50824	.	G	A	11845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.193;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.586;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.899;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,305:633:99:11874,0,14859
contig330	52297	.	G	A	11101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=-0.124;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.725;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,287:636:99:11130,0,13385
contig330	52305	.	T	C	8591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.563;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.543;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,294:662:99:8620,0,15128
contig330	52316	.	T	C	12081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.478;ClippingRankSum=1.547;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.062;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,306:664:99:12110,0,14461
contig330	52326	.	G	A	11824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=-0.865;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.664;QD=18.14;ReadPosRankSum=-1.694;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,311:652:99:11853,0,13285
contig330	53059	.	A	T	10007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.969;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.068;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,265:558:99:10036,0,11483
contig330	53071	.	G	A	10848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.313;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.609;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,288:604:99:10877,0,11916
contig330	53105	.	A	G	11911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.213;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.474;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.133;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,314:622:99:11940,0,11667
contig330	53115	.	G	T	12083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=1.589;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.780;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,302:599:99:12112,0,11952
contig330	53126	.	T	C	10800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.100;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.183;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,281:572:99:10829,0,11346
contig330	53157	.	C	T	8178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.024;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.773;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,272:545:99:8207,0,8360
contig330	53246	.	T	C	8775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.440;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.408;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,230:476:99:8804,0,9375
contig330	53253	.	G	C	8567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.392;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.164;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,226:464:99:8596,0,9651
contig330	53274	.	C	T	7649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-1.323;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.254;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,242:451:99:7678,0,7893
contig330	54090	.	T	C	8891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.201;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.961;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,283:596:99:8920,0,11785
contig330	54110	.	A	G	11547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.213;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.495;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,290:598:99:11576,0,9447
contig330	54128	.	A	C	9322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.977;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.976;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,300:613:99:9351,0,11918
contig330	55218	.	C	A	9514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.189;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.475;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,254:570:99:9543,0,14231
contig330	55231	.	T	C	9871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.057;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.647;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,263:596:99:9900,0,14538
contig330	55761	.	C	T	10500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.738;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.244;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,278:587:99:10529,0,13464
contig330	55776	.	G	A	10422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.651;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.932;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,277:584:99:10451,0,13695
contig330	56046	.	T	A	11393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=-0.146;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.116;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.663;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,282:522:99:11422,0,9484
contig330	56047	.	T	C	11470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.455;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.405;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,280:520:99:11499,0,9562
contig330	56056	.	A	G	11165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=1.693;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.641;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,277:511:99:11194,0,9373
contig330	56074	.	TTCAAGTGTCA	T	10907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=1.129;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.220;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,276:527:99:10945,0,9745
contig330	56224	.	T	A	8787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.268;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.691;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,232:511:99:8816,0,11134
contig330	56229	.	T	C	8639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.444;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.877;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,227:502:99:8668,0,10963
contig330	57421	.	A	G	9814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.637;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.201;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.809;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,333:648:99:9843,0,12066
contig330	57428	.	C	T	12894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-1.114;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.322;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,332:646:99:12923,0,9194
contig330	57915	.	T	C	5510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.747;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=9.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.016;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.250;SOR=1.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,199:485:99:5539,0,10977
contig330	57988	.	C	T	12260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.166;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.631;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,318:598:99:12289,0,10678
contig330	57996	.	A	G	12397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-1.623;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.602;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.268;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,321:613:99:12426,0,10972
contig330	58078	.	T	A	9055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.368;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.802;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,238:519:99:9084,0,11011
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contig330	58635	.	G	A	12712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=-0.436;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=5.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=1.475;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,309:594:99:12741,0,16394
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contig330	58659	.	G	A	12418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=-1.032;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=2.352;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.466;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,311:592:99:12447,0,12870
contig330	58670	.	A	G	12802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-1.248;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=5.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.436;QD=21.89;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,306:585:99:12831,0,11647
contig330	58678	.	T	G	12025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.248;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=2.444;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,304:584:99:12054,0,11470
contig330	58698	.	T	A	12919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.373;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.175;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,317:609:99:12948,0,11688
contig330	58700	.	A	G	12653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.239;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.770;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,310:604:99:12682,0,11787
contig330	58702	.	A	C	12164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=1.518;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.540;QD=19.97;ReadPosRankSum=2.719;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,312:609:99:12193,0,11613
contig330	58888	.	G	A	11778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.584;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.180;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,302:609:99:11807,0,11999
contig330	58898	.	A	G	12386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.717;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.845;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,309:619:99:12415,0,12257
contig330	58903	.	T	G	12320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.615;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.834;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,318:616:99:12349,0,11845
contig330	58932	.	C	T	11751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.241;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.138;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.005;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,299:583:99:11780,0,11175
contig330	58934	.	C	T	11751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-1.237;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.433;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.428;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,301:590:99:11780,0,11175
contig330	59024	.	A	G	10091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.695;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.455;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,257:517:99:10120,0,15739
contig330	59031	.	A	G	9841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=-0.598;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.097;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,255:520:99:9870,0,15852
contig330	59169	.	C	T	10568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.382;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.811;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.795;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,279:585:99:10597,0,12728
contig330	59178	.	A	G	10576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.367;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.805;QD=18.39;ReadPosRankSum=-2.850;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,277:575:99:10605,0,12450
contig330	59524	.	A	G	10921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-1.141;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.311;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.122;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,285:574:99:10950,0,11166
contig330	59534	.	A	C	11732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-0.298;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.193;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,300:591:99:11761,0,11666
contig330	59536	.	C	T	11722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.898;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.158;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,297:591:99:11751,0,11514
contig330	59688	.	G	A	13022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.456;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.314;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,334:633:99:13051,0,11932
contig330	59691	.	G	A	13215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=1.786;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.300;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.830;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,330:634:99:13244,0,12066
contig330	59706	.	T	C	13380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.547;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.895;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.270;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,328:644:99:13409,0,12817
contig330	59721	.	A	G	12623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=1.176;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.825;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.902;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,310:621:99:12652,0,12415
contig330	59733	.	C	T	11887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.778;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.496;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,310:619:99:11916,0,12037
contig330	59762	.	G	T	11912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.190;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.506;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,305:624:99:11941,0,12553
contig330	59768	.	C	T	12098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=-0.917;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.233;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,300:625:99:12127,0,13141
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contig330	59814	.	T	C	11744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.185;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.005;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,304:620:99:11773,0,12504
contig330	59817	.	T	C	12035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-2.121;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.250;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.575;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,297:615:99:12064,0,12589
contig330	59835	.	G	A	11414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.055;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.175;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.130;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,287:594:99:11443,0,12298
contig330	59838	.	C	T	11151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=1.349;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.765;QD=18.87;ReadPosRankSum=-1.300;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,285:591:99:11180,0,12013
contig330	59955	.	A	G	11458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-1.799;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.447;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,303:582:99:11487,0,10521
contig330	59970	.	T	C	11975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-1.125;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.623;QD=20.86;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,296:574:99:12004,0,11180
contig330	59987	.	C	T	11771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.587;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.158;QD=20.58;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,293:572:99:11800,0,11310
contig330	60000	.	G	A	10696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.418;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.658;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.541;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,272:554:99:10725,0,11356
contig330	60003	.	G	A	10562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.024;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.367;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,273:549:99:10591,0,11128
contig330	60084	.	A	G	8517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=-0.631;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.367;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,221:454:99:8546,0,9116
contig330	60086	.	C	T	8517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.268;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.261;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,220:453:99:8546,0,9116
contig330	60244	.	G	GA	5792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=1.995;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=11.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-1.157;QD=13.83;ReadPosRankSum=-6.681;SOR=1.443	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,163:419:99:5830,0,10047
contig330	60259	.	C	G	5821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.204;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=18.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-0.645;QD=13.57;ReadPosRankSum=-9.243;SOR=1.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,153:429:99:5850,0,11832
contig330	60261	.	A	T	6512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.346;ClippingRankSum=0.373;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=16.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-0.544;QD=14.90;ReadPosRankSum=-9.134;SOR=1.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,152:437:99:6541,0,11896
contig330	60265	.	A	G	5585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.565;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-0.278;QD=12.96;ReadPosRankSum=-8.914;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,144:431:99:5614,0,12004
contig330	60268	.	GAA	G	5972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=-0.942;DP=464;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-0.072;QD=13.70;ReadPosRankSum=-9.125;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,141:436:99:6010,0,12310
contig330	60270	.	A	AGGGGG	5460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.791;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=15.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=0.241;QD=12.79;ReadPosRankSum=-6.365;SOR=1.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,140:427:99:5498,0,12203
contig330	60289	.	CGACGGGTCG	C	6299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.263;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=14.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-1.440;QD=13.04;ReadPosRankSum=-5.086;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,168:483:99:6337,0,12997
contig330	60300	.	C	A	6544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.899;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=12.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=0.679;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.628;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,169:455:99:6573,0,11977
contig330	60305	.	AGCG	A	6561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.787;ClippingRankSum=0.466;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=1.101;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,181:489:99:6599,0,12410
contig330	60468	.	G	A	13216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.632;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.515;QD=22.03;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,332:600:99:13245,0,10302
contig330	60471	.	G	A	13196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.776;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.390;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,335:612:99:13225,0,10441
contig330	60504	.	A	G	10745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.729;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.651;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,283:588:99:10774,0,11601
contig330	60525	.	T	C	10780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.339;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.333;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,294:615:99:10809,0,11894
contig330	60942	.	G	C	11441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.661;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.759;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,293:579:99:11470,0,10972
contig330	60945	.	G	A	11330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.614;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.735;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,291:582:99:11359,0,11245
contig330	61086	.	T	C	10067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.451;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.859;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,257:535:99:10096,0,11166
contig330	61089	.	A	G	10265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-1.515;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.465;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.386;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,257:531:99:10294,0,11154
contig330	61098	.	A	G	9485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=2.027;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.157;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,245:525:99:9514,0,11266
contig330	61418	.	G	A	11912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.575;DP=783;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.422;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,388:758:99:11941,0,11048
contig330	62081	.	GCCA	G	9651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=1.028;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.026;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,255:564:99:9689,0,11974
contig330	62163	.	A	T	8816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=1.082;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.688;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,287:551:99:8845,0,8198
contig330	62192	.	C	T	8528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=-0.847;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.366;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,296:565:99:8557,0,7855
contig330	62241	.	A	G	10270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.144;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.019;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,273:542:99:10299,0,10190
contig330	62249	.	A	G	10547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=2.336;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.414;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.165;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,279:549:99:10576,0,10225
contig330	62319	.	C	T	11945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=-1.908;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.112;QD=19.02;ReadPosRankSum=1.886;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,312:628:99:11974,0,12401
contig330	62328	.	A	G	12729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=1.503;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.015;QD=20.17;ReadPosRankSum=2.503;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,311:631:99:12758,0,12963
contig330	62368	.	T	C	13989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-0.011;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.415;QD=20.39;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,345:686:99:14018,0,13658
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contig330	62409	.	T	C	13590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-1.076;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.191;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,336:686:99:13619,0,14564
contig330	62434	.	A	G	13761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.108;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=4.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.304;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,341:693:99:13790,0,14510
contig330	62437	.	C	T	13671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-0.642;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.109;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,339:701:99:13700,0,14600
contig330	62442	.	T	C	14022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=1.811;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.951;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.905	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:371,345:716:99:14051,0,14914
contig330	62443	.	G	A	13973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=-0.864;DP=742;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.377;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,349:725:99:14002,0,15037
contig330	62484	.	CTT	C	7217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=-1.569;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-2.296;QD=11.81;ReadPosRankSum=2.853;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,235:611:99:7255,0,15680
contig330	62489	.	AACATGGCATTACTTT	A	7271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=-0.378;DP=782;ExcessHet=3.0103;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=0.525;QD=10.90;ReadPosRankSum=3.602;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:420,247:667:99:7309,0,17471
contig330	62527	.	A	T	10025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.005;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.237;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,323:687:99:10054,0,14894
contig330	62536	.	C	T	13283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.949;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.496;QD=19.53;ReadPosRankSum=-3.854;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,333:680:99:13312,0,14321
contig330	62545	.	T	G	12782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.653;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-2.025;QD=19.61;ReadPosRankSum=-4.841;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,326:652:99:12811,0,12878
contig330	62598	.	AT	A	10345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.662;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.621;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,267:520:99:10383,0,9673
contig330	62608	.	A	G	11354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.631;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.879;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,280:533:99:11383,0,10334
contig330	62615	.	T	C	11051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.857;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.388;QD=21.50;ReadPosRankSum=2.304;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,267:514:99:11080,0,10286
contig330	62625	.	C	T	10402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.304;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.518;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.587;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,265:511:99:10431,0,9692
contig330	62756	.	C	G	10915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.631;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.662;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,281:545:99:10944,0,10279
contig330	62763	.	A	G	10815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.398;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.664;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,285:563:99:10844,0,10524
contig330	62795	.	C	CT	11523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-1.220;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.358;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.629;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,304:603:99:11561,0,11500
contig330	62800	.	AACCC	A	11502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=-1.740;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.094;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,304:607:99:11540,0,11852
contig330	62830	.	T	C	11150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=-0.615;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.402;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,288:569:99:11179,0,11010
contig330	62834	.	G	A	11460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.238;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.030;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,288:566:99:11489,0,11280
contig330	62849	.	A	G	10664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.671;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.391;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,265:542:99:10693,0,11221
contig330	62855	.	G	A	11065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.815;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.064;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.428;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,279:562:99:11094,0,11319
contig330	62861	.	G	A	11008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.777;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.977;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,279:565:99:11037,0,11532
contig330	62877	.	T	C	10060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=-0.211;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.701;QD=19.05;ReadPosRankSum=2.130;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,253:528:99:10089,0,11349
contig330	62883	.	C	A	9569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=0.038;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.071;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.724;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,238:511:99:9598,0,11218
contig330	62888	.	G	A	9606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.347;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.671;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.757;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,235:499:99:9635,0,10882
contig330	62892	.	C	T	9310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.362;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.375;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,240:506:99:9339,0,10558
contig330	63800	.	G	A	9634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-1.265;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.986;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,306:574:99:9663,0,8447
contig330	67919	.	C	G	7007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.276;ClippingRankSum=-0.669;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-2.813;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.263;SOR=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,184:414:99:7036,0,8833
contig330	67937	.	GTTCTCATCAGGCCAGCCGGAGACGGGTCCGTGGCCCGAGGGAATGTT	G	8780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.811;ClippingRankSum=0.323;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-2.458;QD=14.59;ReadPosRankSum=4.250;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,224:602:99:8818,0,16699
contig330	68006	.	G	T	10181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=1.200;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-2.923;QD=19.51;ReadPosRankSum=-8.213;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,258:522:99:10210,0,13121
contig330	68016	.	A	G	10351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.516;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-1.045;QD=19.53;ReadPosRankSum=-7.757;SOR=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,270:530:99:10380,0,12649
contig330	68069	.	AAC	A	6616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.110;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-2.449;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,225:481:99:6654,0,7863
contig330	68282	.	A	G	7687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=1.529;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.144;QD=17.92;ReadPosRankSum=2.080;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,202:429:99:7716,0,9251
contig330	68293	.	T	C	8229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=-1.845;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.204;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,209:428:99:8258,0,8933
contig330	68302	.	T	G	8573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.131;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.931;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,210:414:99:8602,0,8782
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contig330	68310	.	A	G	8565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=1.332;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.451;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,211:415:99:8594,0,8324
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contig330	79390	.	A	G	10356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.368;ClippingRankSum=0.195;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=7.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.206;QD=20.15;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=1.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,261:514:99:10385,0,9973
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contig331	375	.	A	G	9548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.190;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.891;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,240:486:99:9577,0,9753
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contig331	1137	.	C	T	5343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.982;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=0.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.325;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,142:291:99:5372,0,9020
contig331	1149	.	G	A	5420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.560;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.993;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,143:278:99:5449,0,8623
contig331	1256	.	GTGGCAC	G	2212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.122;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=15.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.444;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.904;SOR=2.374	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,59:135:99:2250,0,4052
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contig331	1803	.	C	CT	9575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.116;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=5.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.030;QD=20.42;ReadPosRankSum=-2.380;SOR=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,236:469:99:9613,0,10784
contig331	1821	.	CT	C	8209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-0.626;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=4.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.626;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,210:432:99:8247,0,9027
contig331	1847	.	G	A	6981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.243;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=15.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.924;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.775;SOR=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,181:364:99:7010,0,6921
contig331	1960	.	T	TAAAAAAA	1997.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.697;ClippingRankSum=-0.374;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=42.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-3.968;QD=7.01;ReadPosRankSum=-7.715;SOR=3.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,62:285:99:2035,0,9213
contig331	1971	.	A	C	7000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.366;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=16.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=4.519;QD=18.04;ReadPosRankSum=11.868;SOR=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,256:388:99:7029,0,4354
contig331	1981	.	C	A	5548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.628;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=9.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.019;QD=16.92;ReadPosRankSum=9.976;SOR=1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,235:328:99:5577,0,3126
contig331	3850	.	C	T	6682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.876;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.158;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,180:373:99:6711,0,7265
contig331	3859	.	T	C	6622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.966;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=4.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.252;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,175:362:99:6651,0,7268
contig331	3940	.	C	T	6088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.841;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=3.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.589;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,200:389:99:6117,0,5754
contig331	4428	.	C	T	7786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=2.462;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.105;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,208:408:99:7815,0,8317
contig331	4438	.	A	G	7788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.150;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.982;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,203:388:99:7817,0,7764
contig331	5156	.	C	G	8942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.874;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.436;QD=17.03;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,240:525:99:8971,0,11101
contig331	5179	.	T	G	7954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.570;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.330;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,247:529:99:7983,0,11353
contig331	5180	.	GTTTACTTCAAAGCACCAT	G	7536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;ClippingRankSum=-1.007;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=1.730;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,244:576:99:7574,0,13210
contig331	5225	.	C	T	9387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=-0.052;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-0.807;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,281:542:99:9416,0,9678
contig331	5233	.	CAAGAAGTGCTGGATGCTATACTTTAAACAGT	C	5418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.042;ClippingRankSum=-1.143;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=9.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-0.102;QD=13.93;ReadPosRankSum=4.142;SOR=1.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,149:389:99:5456,0,9343
contig331	5349	.	A	T	10314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.026;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.256;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,272:544:99:10343,0,10661
contig331	5363	.	G	A	10732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=1.148;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.270;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,274:560:99:10761,0,11343
contig331	5377	.	C	T	11341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.002;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.134;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,282:557:99:11370,0,10881
contig331	5378	.	C	T	11250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=1.145;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.238;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,276:549:99:11279,0,10887
contig331	5388	.	G	C	10721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-0.167;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.622;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,272:542:99:10750,0,10650
contig331	5428	.	C	T	10102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-1.652;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.140;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.061;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,259:529:99:10131,0,11249
contig331	5433	.	A	G	10077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.019;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.517;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,257:536:99:10106,0,11593
contig331	5435	.	T	TC	10322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.403;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.085;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,252:528:99:10360,0,11449
contig331	5436	.	A	C	10381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.448;ClippingRankSum=-0.246;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.620;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,254:529:99:10410,0,11315
contig331	5465	.	C	T	8759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-2.410;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.436;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,247:525:99:8788,0,10449
contig331	5919	.	G	T	11537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.343;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.074;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,294:559:99:11566,0,10072
contig331	5929	.	G	A	12145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-0.130;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.326;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,304:575:99:12174,0,10790
contig331	5940	.	A	G	11978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.903;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.084;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.776;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,314:587:99:12007,0,10151
contig331	6152	.	A	G	9932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=1.486;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.357;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.153;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,265:523:99:9961,0,9896
contig331	6172	.	A	G	10085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.272;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.449;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.307;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,271:534:99:10114,0,9854
contig331	6356	.	G	A	10827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.842;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.819;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,282:552:99:10856,0,10471
contig331	6362	.	T	A	10812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.465;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.018;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,280:559:99:10841,0,10663
contig331	6406	.	GA	G	9096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=-0.108;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.921;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,236:499:99:9134,0,10266
contig331	6418	.	CTGGT	C	9556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=0.170;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.478;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.735;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,254:563:99:9594,0,12204
contig331	6553	.	C	T	7629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.449;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.929;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,244:447:99:7658,0,7423
contig331	6649	.	AG	A	6151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.497;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.377;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.576;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,161:364:99:6189,0,10187
contig331	6655	.	TGCAA	T	6478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.251;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.225;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,164:384:99:6516,0,11309
contig331	6685	.	A	T	6068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.133;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.493;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,161:383:99:6097,0,11417
contig331	6716	.	T	TC	5820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.433;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=6.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=0.652;QD=16.40;ReadPosRankSum=-2.151;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,143:355:99:5858,0,9219
contig331	6719	.	G	T	5619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.127;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=5.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-0.545;QD=15.79;ReadPosRankSum=-3.579;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,151:356:99:5648,0,8874
contig332	10244	.	CA	C	7776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=1.097;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQRankSum=0.130;QD=21.08;ReadPosRankSum=1.213;SOR=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:20,349:369:99:7814,607,0
contig332	11806	.	C	T	20499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=1.636;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=-1.559;QD=34.34;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,594:597:99:20528,1723,0
contig332	16484	.	T	G	23056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=1.577;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=-1.228;QD=32.24;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,625:626:99:23085,1836,0
contig333	18	.	T	G	26933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=1.837;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQRankSum=-0.389;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.349;SOR=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,682:684:99:26962,1975,0
contig333	1807	.	A	T	15960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.353;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.895;QD=33.57;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.407	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,426:429:99:15989,1258,0
contig335	2402	.	T	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.94;QD=26.96;SOR=1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,83:83:99:3769,262,0
contig335	2414	.	T	C	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.94;QD=26.13;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3947,268,0
contig335	2420	.	T	C	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.94;QD=28.17;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:3934,268,0
contig335	2609	.	A	G	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.357;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=54.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.70;MQRankSum=-2.676;QD=0.08;ReadPosRankSum=-3.204;SOR=5.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,16:203:45:45,0,5073
contig335	2627	.	G	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.224;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=57.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.80;MQRankSum=-1.978;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.661;SOR=5.418	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,14:174:67:67,0,4410
contig335	2717	.	A	G	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=2.188;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=118.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.37;MQRankSum=-0.384;QD=11.92;ReadPosRankSum=6.435;SOR=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,63:122:99:1483,0,1500
contig335	2738	.	G	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.222;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=77.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.48;MQRankSum=0.116;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,66:105:99:1581,0,923
contig335	2780	.	A	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-1.404;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.86;MQRankSum=-0.310;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,16:38:99:389,0,578
contig335	2816	.	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=1.857;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:138,0,583
contig335	2870	.	G	T	246.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.23;QD=26.49;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:275,21,0
contig335	2876	.	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;QD=31.51;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
contig335	2882	.	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=28.30;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:180,12,0
contig335	2894	.	G	C	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=20.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
contig335	2918	.	G	A	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;QD=20.43;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
contig336	1162	.	A	T	8058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.144;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.242;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,266:508:99:8087,0,7416
contig336	1600	.	A	G	6001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-1.564;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.173;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,193:395:99:6030,0,6251
contig336	2020	.	C	T	11914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=-0.661;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.127;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,310:638:99:11943,0,18974
contig336	2026	.	A	G	12042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-1.328;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.239;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,308:645:99:12071,0,19193
contig336	2167	.	G	A	11994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.175;ClippingRankSum=1.288;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.578;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,320:590:99:12023,0,10277
contig336	2179	.	T	C	11910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.787;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.097;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,306:574:99:11939,0,10050
contig336	2611	.	CGCACCCCCGGGCACACCACCCGGT	C	7411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=-1.972;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=6.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=0.938;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.723;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,193:395:99:7449,0,7751
contig336	2681	.	A	G	7916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.312;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=8.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=2.660;QD=19.40;ReadPosRankSum=-2.879;SOR=0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,206:408:99:7945,0,7765
contig336	2682	.	C	T	7916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.090;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.669;QD=19.36;ReadPosRankSum=-2.268;SOR=0.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,206:409:99:7945,0,7765
contig336	2942	.	C	T	8730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-1.091;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.449;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,287:533:99:8759,0,7748
contig336	3150	.	C	T	11061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=1.379;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.184;QD=18.65;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,284:593:99:11090,0,12026
contig336	3157	.	G	C	11175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.654;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.512;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,279:582:99:11204,0,12374
contig336	3168	.	C	T	9996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.385;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.059;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.974;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,262:570:99:10025,0,12186
contig336	3199	.	G	A	8455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.071;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.154;QD=14.33;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,275:590:99:8484,0,9880
contig336	3291	.	TA	T	8437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=1.842;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.908;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,269:598:99:8475,0,13287
contig336	3297	.	ATGATAATTGGG	A	10319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;ClippingRankSum=1.044;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.053;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.716;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,263:642:99:10357,0,15604
contig336	3311	.	GAAA	G	10438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;ClippingRankSum=-1.308;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.896;QD=17.17;ReadPosRankSum=2.478;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,262:608:99:10476,0,14121
contig336	3316	.	TTAGGGATG	T	10299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=2.849;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.920;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,261:633:99:10337,0,15500
contig336	3326	.	AAGT	A	10170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.791;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.665;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,272:630:99:10208,0,14439
contig336	3434	.	A	G	13811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.446;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.783;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,353:681:99:13840,0,15159
contig336	3445	.	G	A	13915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=-0.675;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.771;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,345:659:99:13944,0,15260
contig336	3446	.	T	C	13775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.666;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.122;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,342:653:99:13804,0,15129
contig337	225	.	T	A	7370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.314;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=1.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.049;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.030;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,194:389:99:7399,0,7666
contig337	234	.	T	C	7256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.304;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.181;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,190:390:99:7285,0,7679
contig337	279	.	A	G	7451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.198;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.963;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,198:437:99:7480,0,9339
contig337	280	.	A	G	7451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=1.348;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.492;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,196:436:99:7480,0,9339
contig337	440	.	A	G	7614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.004;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.083;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,249:559:99:7643,0,10023
contig337	513	.	T	C	8651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-1.551;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.273;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,276:549:99:8680,0,8634
contig337	583	.	A	G	12216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.546;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.047;QD=19.61;ReadPosRankSum=2.776;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,314:623:99:12245,0,12785
contig337	594	.	TC	T	12294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-1.743;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.934;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.444;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,316:622:99:12332,0,12773
contig337	693	.	TCCCTA	T	8972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=1.180;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.442;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,232:464:99:9010,0,9209
contig337	721	.	A	G	8550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=-0.176;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.457;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,231:473:99:8579,0,9872
contig337	752	.	G	GC	8126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-1.199;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=1.536;QD=16.06;ReadPosRankSum=1.428;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,240:506:99:8164,0,10289
contig337	803	.	T	C	5257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=-1.126;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-2.111;QD=13.95;ReadPosRankSum=3.775;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,145:377:99:5286,0,9208
contig337	808	.	T	TC	5230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=1.014;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=2.285;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.577;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,145:373:99:5268,0,9454
contig337	815	.	G	A	9487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.184;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.030;QD=20.54;ReadPosRankSum=-2.140;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,243:462:99:9525,0,8657
contig337	877	.	C	A	6723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.212;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.488;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,239:485:99:6752,0,7166
contig337	967	.	ATTTTTTTTAGTACATATTATTATTACT	A	5644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.299;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.896;QD=15.90;ReadPosRankSum=-2.159;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,156:355:99:5682,0,7678
contig337	1085	.	A	G	10650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=1.166;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.664;QD=18.05;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,280:590:99:10679,0,12192
contig337	1089	.	C	T	10499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=-0.181;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.094;QD=17.62;ReadPosRankSum=2.446;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,277:596:99:10528,0,12313
contig337	1160	.	T	TTC	12551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.558;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.894;QD=20.41;ReadPosRankSum=-2.020;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,319:615:99:12589,0,11412
contig337	1162	.	A	T	12674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.013;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.469;QD=20.51;ReadPosRankSum=-1.633;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,319:618:99:12703,0,11571
contig337	1179	.	C	T	11881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=2.035;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.307;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,292:587:99:11910,0,12217
contig337	1183	.	A	C	11822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.095;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.644;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,285:587:99:11851,0,12293
contig337	1188	.	T	A	11406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.083;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.334;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.996;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,295:598:99:11435,0,11879
contig337	1552	.	T	C	11898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=-0.040;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.018;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,308:639:99:11927,0,15758
contig337	1564	.	C	T	12342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-1.693;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.844;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,313:660:99:12371,0,16830
contig337	1567	.	C	T	11876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-0.610;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.047;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.230;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,305:664:99:11905,0,16641
contig337	1684	.	T	G	11904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.563;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.236;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.613;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,308:688:99:11933,0,15272
contig337	1686	.	C	T	12051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.526;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.540;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,308:690:99:12080,0,15554
contig337	1687	.	C	G	12054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.392;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.155;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,305:683:99:12083,0,15621
contig337	1691	.	G	A	12023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=1.019;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.775;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,307:687:99:12052,0,15438
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contig337	2033	.	A	AT	3893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.168;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.855;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,185:436:99:3931,0,5805
contig337	2065	.	T	C	6959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.958;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.521;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,240:529:99:6988,0,8829
contig337	2100	.	G	C	10701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.086;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.462;QD=20.12;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,286:532:99:10730,0,8818
contig337	2115	.	G	GT	11493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=1.100;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.636;QD=22.23;ReadPosRankSum=-2.138;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,281:517:99:11531,0,9392
contig337	2120	.	C	T	11163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=-1.618;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.540;QD=21.80;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,271:512:99:11192,0,9558
contig337	2131	.	A	ATT	11200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-1.416;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.320;QD=21.62;ReadPosRankSum=-1.168;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,274:518:99:11238,0,9845
contig337	2138	.	CCT	C	10356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.858;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.832;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,263:516:99:10394,0,9822
contig337	2237	.	T	C	8953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.196;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.570;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,228:458:99:8982,0,9085
contig337	2252	.	A	T	9626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=1.156;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.471;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,242:495:99:9655,0,10182
contig337	2268	.	C	T	9740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.205;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.068;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,247:505:99:9769,0,10579
contig337	2272	.	A	G	9710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.028;ClippingRankSum=-1.677;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.722;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,241:499:99:9739,0,10414
contig337	2284	.	CCT	C	9081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=-0.018;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.873;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,222:475:99:9119,0,10480
contig337	2287	.	T	TCC	8856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=1.884;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.155;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,221:468:99:8894,0,9956
contig337	2295	.	T	C	7991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.024;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.162;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,208:442:99:8020,0,9271
contig337	2334	.	C	T	7972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.211;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.617;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.479;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,213:438:99:8001,0,8322
contig337	2355	.	T	C	9337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.765;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.417;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,227:456:99:9366,0,9263
contig337	2365	.	C	T	9633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.121;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.154;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,242:469:99:9662,0,8906
contig337	2369	.	C	G	9407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;ClippingRankSum=0.296;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.161;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,245:466:99:9436,0,8799
contig337	2406	.	A	G	8817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.135;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.407;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.114;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,281:545:99:8846,0,8242
contig338	1590	.	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=1.583;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQRankSum=-6.195;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.833;SOR=1.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,26:52:99:607,0,574
contig338	6608	.	A	G	7336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=-1.010;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.097;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,236:466:99:7365,0,7539
contig338	8314	.	T	C	10861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.491;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.209;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.698;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,281:574:99:10890,0,11398
contig338	8316	.	A	C	10861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=1.375;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.590;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,281:575:99:10890,0,11398
contig338	8529	.	C	T	11037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.156;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.132;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.765;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,288:572:99:11066,0,11578
contig338	8536	.	G	A	10681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.868;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.395;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.072;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,276:556:99:10710,0,11571
contig338	8714	.	T	C	8675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.927;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.197;QD=16.37;ReadPosRankSum=5.515;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,272:530:99:8704,0,7847
contig338	8749	.	A	C	9239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.900;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.554;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,305:569:99:9268,0,8323
contig338	8867	.	T	C	8944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.831;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.578;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,294:613:99:8973,0,9805
contig338	9046	.	G	A	13226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.553;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.574;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,341:691:99:13255,0,17370
contig338	9052	.	A	G	13339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.552;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.028;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.397;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,334:680:99:13368,0,17866
contig338	9058	.	A	G	12711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.687;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.428;QD=19.00;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,325:669:99:12740,0,17640
contig338	9326	.	A	G	11770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.867;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.334;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,308:653:99:11799,0,18829
contig338	9332	.	C	A	11934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.888;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.406;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.687;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,312:647:99:11963,0,18522
contig338	9365	.	C	T	8353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-0.621;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.515;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.606;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,261:533:99:8382,0,8717
contig338	9406	.	C	CT	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=1.533;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=6.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.573;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.848;SOR=1.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,99:263:99:1491,0,3026
contig338	9423	.	GCCC	G	8709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.081;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.042;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,221:409:99:8747,0,7339
contig338	9438	.	A	G	9244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.787;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.088;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,240:431:99:9273,0,7093
contig338	9472	.	T	C	7453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.887;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.141;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.479;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,194:434:99:7482,0,9503
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contig338	11106	.	T	C	10418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=1.427;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.407;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.184;SOR=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,274:539:99:10447,0,10199
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contig338	14452	.	A	T	5167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.684;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.823;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.570;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,235:522:99:5196,0,11668
contig338	14465	.	C	T	10870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.939;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.298;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,285:563:99:10899,0,10763
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contig338	17301	.	A	T	10588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-0.664;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.394;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.220;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,282:574:99:10617,0,11687
contig338	17310	.	C	T	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=-0.800;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.507;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,273:561:99:10516,0,11313
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contig338	17490	.	T	TA	10529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.003;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.206;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,261:494:99:10567,0,9345
contig338	17504	.	G	A	11779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.037;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.277;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,296:563:99:11808,0,10568
contig338	17506	.	C	A	11735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=1.162;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.579;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,301:570:99:11764,0,10497
contig338	17537	.	G	A	9013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=-0.429;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.173;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,277:539:99:9042,0,8159
contig338	19758	.	C	T	12923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.370;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.496;QD=18.87;ReadPosRankSum=2.749;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,341:685:99:12952,0,13012
contig338	19770	.	T	C	13088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.027;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.072;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,331:673:99:13117,0,13612
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contig338	19857	.	A	G	9550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=1.582;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.007;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,246:531:99:9579,0,9042
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contig338	19916	.	G	A	9223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.516;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.215;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,245:515:99:9252,0,10625
contig338	19920	.	A	T	9149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.473;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.037;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,236:508:99:9178,0,10644
contig338	20888	.	C	T	8610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.276;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.589;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.557;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,268:585:99:8639,0,10178
contig338	21621	.	G	A	7032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-1.930;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.619;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.016;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,225:490:99:7061,0,8193
contig338	21639	.	G	T	6656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.378;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.232;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,221:472:99:6685,0,8041
contig338	22280	.	A	G	9102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.613;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.038;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.376;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,249:520:99:9131,0,10170
contig338	22299	.	A	G	9105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.337;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=5.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.296;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.832;SOR=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,243:504:99:9134,0,10088
contig338	25623	.	C	G	8696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.952;ClippingRankSum=-2.428;DP=819;ExcessHet=3.0103;FS=41.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-12.063;QD=11.28;ReadPosRankSum=-2.653;SOR=2.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:486,285:771:99:8725,0,14597
contig338	25634	.	G	A	7689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;ClippingRankSum=-1.773;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=31.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-7.926;QD=11.02;ReadPosRankSum=5.585;SOR=1.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:482,216:698:99:7718,0,19788
contig338	25637	.	C	A	7918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;ClippingRankSum=-1.152;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=27.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-10.142;QD=11.33;ReadPosRankSum=5.850;SOR=2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:482,217:699:99:7947,0,20398
contig338	25639	.	T	G	7929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.517;ClippingRankSum=1.130;DP=759;ExcessHet=3.0103;FS=31.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-9.016;QD=11.12;ReadPosRankSum=5.632;SOR=2.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:490,223:713:99:7958,0,20644
contig338	25643	.	C	A	8405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.264;ClippingRankSum=0.483;DP=767;ExcessHet=3.0103;FS=29.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-8.573;QD=11.67;ReadPosRankSum=4.977;SOR=2.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:489,231:720:99:8434,0,20617
contig338	25644	.	C	A	8460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.428;ClippingRankSum=-0.655;DP=772;ExcessHet=3.0103;FS=29.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-3.170;QD=11.69;ReadPosRankSum=4.395;SOR=2.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:488,236:724:99:8489,0,20395
contig338	25648	.	C	T	8606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.729;DP=783;ExcessHet=3.0103;FS=31.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-8.330;QD=11.65;ReadPosRankSum=3.145;SOR=2.266	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:493,246:739:99:8635,0,20030
contig338	25662	.	C	T	8213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.650;DP=771;ExcessHet=3.0103;FS=29.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-7.971;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=2.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:482,251:733:99:8242,0,20044
contig338	25666	.	G	A	8184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.115;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=29.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-7.366;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=2.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:508,246:754:99:8213,0,20313
contig338	25677	.	G	A	7377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.257;DP=752;ExcessHet=3.0103;FS=36.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-0.946;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.121;SOR=2.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:504,213:717:99:7406,0,20601
contig338	25680	.	A	G	7416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.199;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=42.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-1.119;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.381;SOR=2.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:500,205:705:99:7445,0,20705
contig338	25681	.	G	A	7257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.045;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=42.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-0.948;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.269;SOR=2.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:500,205:705:99:7286,0,20849
contig338	25687	.	A	T	7160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=-0.762;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=44.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-0.316;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=2.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:503,206:709:99:7189,0,20479
contig338	25700	.	A	C	2990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;ClippingRankSum=-1.299;DP=719;ExcessHet=3.0103;FS=82.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-4.325;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.845;SOR=5.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:552,136:688:99:3019,0,18341
contig338	25715	.	C	T	4048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.011;ClippingRankSum=0.710;DP=701;ExcessHet=3.0103;FS=107.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-3.050;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.080;SOR=8.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:539,138:677:99:4077,0,22548
contig338	25719	.	C	A	3923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.852;ClippingRankSum=0.341;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=101.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-3.230;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.627;SOR=8.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:542,130:672:99:3952,0,23058
contig338	25726	.	ATGC	A	3357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.440;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=95.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-5.194;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=9.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:548,117:665:99:3395,0,23644
contig338	25730	.	C	CATT	3183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.482;ClippingRankSum=0.197;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=98.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-4.476;QD=4.95;ReadPosRankSum=-2.829;SOR=9.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:527,116:643:99:3221,0,22510
contig338	25733	.	G	T	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.572;ClippingRankSum=0.992;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=91.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-4.293;QD=4.60;ReadPosRankSum=-3.402;SOR=9.364	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:531,107:638:99:2961,0,22042
contig338	25744	.	G	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.199;ClippingRankSum=-0.087;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=57.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-9.784;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.542;SOR=8.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:546,65:611:99:966,0,22462
contig338	25749	.	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.583;ClippingRankSum=0.501;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=58.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-9.472;QD=1.58;ReadPosRankSum=-5.288;SOR=8.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:522,63:585:99:951,0,22489
contig338	25751	.	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.200;ClippingRankSum=0.791;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=58.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-10.338;QD=1.58;ReadPosRankSum=-5.844;SOR=8.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:518,60:578:99:940,0,22713
contig338	25752	.	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.740;ClippingRankSum=0.122;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=55.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-11.047;QD=1.59;ReadPosRankSum=-5.866;SOR=8.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:523,58:581:99:950,0,22171
contig338	25757	.	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.418;ClippingRankSum=0.197;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=51.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-10.986;QD=1.37;ReadPosRankSum=-6.074;SOR=5.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:529,56:585:99:831,0,17028
contig338	25763	.	TCACC	T	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;ClippingRankSum=1.705;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=41.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-10.918;QD=0.16;ReadPosRankSum=-7.414;SOR=7.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:565,43:608:99:134,0,24310
contig338	27348	.	G	A	14356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.423;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.347;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,370:713:99:14385,0,13348
contig338	27356	.	A	G	14201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.821;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.099;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,369:725:99:14230,0,13695
contig338	27520	.	A	G	10544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.275;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.353;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,273:554:99:10573,0,15156
contig338	27529	.	G	C	10384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.396;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=7.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.171;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,271:548:99:10413,0,14902
contig338	28692	.	C	T	12671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.035;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.192;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,331:663:99:12700,0,16285
contig338	28698	.	A	G	12450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.750;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.520;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,320:657:99:12479,0,16351
contig338	29364	.	TAGAGAC	T	10310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=1.114;DP=925;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-2.179;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,295:656:99:10348,0,13646
contig338	29428	.	A	T	27539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0.702;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQRankSum=0.122;QD=26.31;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,759:763:99:27568,2191,0
contig338	29678	.	G	A	12724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.464;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.214;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,326:627:99:12753,0,11389
contig338	29687	.	T	C	12653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.893;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.366;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,311:598:99:12682,0,11383
contig338	29692	.	G	A	12326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.636;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.907;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.005;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,317:601:99:12355,0,11181
contig338	29728	.	G	A	10016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.511;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.824;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,262:547:99:10045,0,11008
contig338	29740	.	G	A	10387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.171;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.042;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.121;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,266:545:99:10416,0,11296
contig338	29761	.	T	C	9166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.120;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.502;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,238:499:99:9195,0,10222
contig338	30243	.	C	T	8784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.234;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=14.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.621;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,232:500:99:8813,0,10471
contig338	30250	.	G	A	8813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.421;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=9.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.769;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,226:485:99:8842,0,10233
contig338	30334	.	G	A	11154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.313;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.240;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,288:531:99:11183,0,11169
contig338	30337	.	C	T	11220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.469;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.565;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.507;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,286:533:99:11249,0,11242
contig338	30487	.	G	A	7817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.760;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.875;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,246:466:99:7846,0,6506
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contig338	31680	.	C	T	6262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.603;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.763;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,168:369:99:6291,0,10816
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contig338	32738	.	A	C	11698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.710;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.268;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,298:638:99:11727,0,13227
contig338	32745	.	T	C	11623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.422;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.219;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,310:663:99:11652,0,13416
contig338	32772	.	G	C	11794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.399;DP=730;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.998;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,373:691:99:11823,0,9880
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contig338	33152	.	CT	C	11819.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.344;DP=854;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=1.836;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:410,394:804:99:11857,0,16713
contig338	33154	.	CCTCTTTCT	C	11769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.604;DP=885;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=2.223;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:438,398:836:99:11807,0,17221
contig338	33304	.	A	C	11883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.141;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=4.673;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.801;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,371:715:99:11912,0,10434
contig338	33320	.	CTCCTTCTTCTCATCAGCA	C	9719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=1.241;DP=819;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-1.118;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.663;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,284:640:99:9757,0,13484
contig338	34299	.	TCTTTTTCCTTTCC	T	11146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=-1.197;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.080;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,295:648:99:11184,0,13575
contig338	34404	.	GA	G	7171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.032;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.820;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,245:486:99:7209,0,7095
contig338	36193	.	CT	C	1061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.365;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.850;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=1.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,99:150:99:1099,0,506
contig338	37480	.	A	G	10732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.151;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.093;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.815;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,283:626:99:10761,0,19552
contig338	37489	.	G	A	10975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.602;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.593;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,294:627:99:11004,0,19292
contig338	37887	.	G	A	10709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-0.976;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.058;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,347:671:99:10738,0,10054
contig338	38551	.	A	G	12312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.302;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.270;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,321:701:99:12341,0,14864
contig338	38557	.	T	A	12265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.112;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.801;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,325:700:99:12294,0,14851
contig338	38591	.	A	T	25303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=1.123;DP=770;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.554;QD=33.96;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,740:745:99:25332,2128,0
contig338	38924	.	T	C	11629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.624;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.288;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.514;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,313:673:99:11658,0,13768
contig338	38942	.	G	C	11527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=-1.475;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.697;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,312:651:99:11556,0,13182
contig338	39040	.	T	C	11889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.139;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.988;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.974	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,312:621:99:11918,0,12429
contig338	39052	.	A	G	11877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=2.025;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.761;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,313:631:99:11906,0,12693
contig338	39616	.	A	G	9270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.134;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.030;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,307:614:99:9299,0,9086
contig338	39630	.	T	C	9623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.350;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.571;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,309:626:99:9652,0,9524
contig338	39656	.	A	G	10056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.548;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.113;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,315:611:99:10085,0,9455
contig338	39676	.	C	T	11621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.067;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.420;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.232;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,301:600:99:11650,0,11715
contig338	39679	.	T	C	11717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=1.221;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.743;QD=19.53;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,299:600:99:11746,0,11677
contig338	40711	.	A	G	10087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.612;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.112;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,263:585:99:10116,0,12724
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contig338	40720	.	A	C	9925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.763;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.102;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,252:567:99:9954,0,12739
contig338	40856	.	A	G	9013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=1.515;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.648;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.056;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,272:520:99:9042,0,9142
contig338	40906	.	A	G	9773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-2.174;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.896;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,260:544:99:9802,0,10726
contig338	40922	.	A	G	9266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.241;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.327;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,244:525:99:9295,0,10719
contig338	40963	.	T	C	9001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.243;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.751;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,285:515:99:9030,0,7275
contig338	41611	.	A	G	10358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-2.326;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.667;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.663;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,267:508:99:10387,0,9182
contig338	41621	.	A	G	10453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=1.031;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.667;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,275:509:99:10482,0,8861
contig338	41654	.	A	AAATCTGAATGTCG	10424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=-0.373;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.410;QD=22.32;ReadPosRankSum=-3.805;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,236:467:99:10462,0,8769
contig338	41785	.	G	C	9470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=1.627;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.844;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,241:501:99:9499,0,10148
contig338	41788	.	G	A	9561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.893;ClippingRankSum=0.103;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.150;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,246:509:99:9590,0,10314
contig338	41817	.	T	TG	9437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=-1.581;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.231;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,244:523:99:9475,0,11009
contig338	41832	.	C	T	10053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-0.585;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.706;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,249:538:99:10082,0,11531
contig338	41836	.	C	A	9859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-1.907;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.805;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,247:533:99:9888,0,11613
contig338	41838	.	G	A	9622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-0.282;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.025;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,248:534:99:9651,0,11422
contig338	41865	.	C	T	8512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.231;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.623;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,276:515:99:8541,0,7613
contig338	42182	.	T	C	10013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.363;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.119;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,267:532:99:10042,0,10129
contig338	42189	.	T	C	10443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-0.853;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.405;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,258:516:99:10472,0,10463
contig338	42224	.	C	T	10293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.879;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.459;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:10322,0,10713
contig338	42242	.	T	G	8863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.700;ClippingRankSum=2.045;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=7.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=1.143;QD=17.98;ReadPosRankSum=4.102;SOR=0.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,230:493:99:8892,0,9959
contig338	42273	.	GCCTATTTTTGATAAGAT	G	6967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.350;ClippingRankSum=0.274;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=8.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.353;QD=17.51;ReadPosRankSum=-1.647;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,175:398:99:7005,0,8705
contig338	42310	.	T	G	8917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=2.064;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.302;QD=20.84;ReadPosRankSum=3.625;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,223:428:99:8946,0,8210
contig338	42324	.	TACTATTTTTGATAAGAG	T	9248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.358;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-1.844;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,241:482:99:9286,0,9300
contig338	42386	.	G	A	10162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-0.237;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.016;QD=19.25;ReadPosRankSum=2.334;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,263:528:99:10191,0,10492
contig338	42393	.	TG	T	10155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.239;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.139;QD=19.23;ReadPosRankSum=3.049;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,260:528:99:10193,0,10790
contig338	42405	.	T	C	10602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-0.063;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.049;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,278:553:99:10631,0,10769
contig338	42452	.	T	C	12380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=1.340;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.209;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,324:638:99:12409,0,12186
contig338	42458	.	C	G	12605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.042;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.761;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.522;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,328:650:99:12634,0,12266
contig338	42539	.	TC	T	6476.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.001;ClippingRankSum=-1.159;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.284;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,291:616:99:6514,0,12157
contig338	42560	.	C	T	12608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.774;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.238;QD=20.54;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,317:614:99:12637,0,11785
contig338	42580	.	G	A	11839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=-0.374;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.638;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.168;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,291:558:99:11868,0,11001
contig338	42593	.	T	C	12089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.108;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.401;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,299:573:99:12118,0,10762
contig338	42600	.	T	C	11116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=-1.583;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=5.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.273;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.261;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,279:539:99:11145,0,10290
contig338	45291	.	TG	T	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.222;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=13.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=0.325;QD=4.46;ReadPosRankSum=-2.370;SOR=3.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,61:102:99:492,0,656
contig339	316	.	GAAGTAGACCAAGTATGTAAGTAGACCAAGTATGT	G	9268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.60;QD=32.99;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,213:213:99:9306,682,0
contig339	487	.	C	A	8014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.18;QD=30.78;SOR=1.533	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,184:184:99:8043,569,0
contig339	498	.	G	A	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;QD=31.29;SOR=1.810	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:7293,503,0
contig339	546	.	AAT	A	3898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;QD=32.58;SOR=8.977	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:3936,265,0
contig339	565	.	G	A	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.11;QD=33.00;SOR=8.764	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3555,238,0
contig339	566	.	C	A	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.11;QD=27.11;SOR=8.764	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3555,238,0
contig339	693	.	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.77;MQRankSum=-1.495;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:159,0,66
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contig341	5120	.	C	T	9277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=2.312;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.252;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,233:471:99:9306,0,9184
contig341	5125	.	G	A	9501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.658;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.973;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.678;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,249:491:99:9530,0,9306
contig341	5235	.	G	A	7915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-1.843;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=6.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.243;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.563;SOR=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,254:466:99:7944,0,6577
contig341	5252	.	A	AT	8887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=-1.272;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.951;QD=21.26;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,226:418:99:8925,0,7368
contig341	5261	.	C	T	9346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=-0.383;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.478;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,251:471:99:9375,0,7998
contig341	6023	.	A	T	27261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-1.260;DP=745;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.105;QD=31.25;ReadPosRankSum=-2.288;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,713:715:99:27290,2098,0
contig341	6078	.	C	CATGTTGAAGTTAGATGAGAAGATGATAAGAACTCTTGATGAGCGT	5871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=-0.967;DP=764;ExcessHet=3.0103;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.595;QD=28.64;ReadPosRankSum=-5.441;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,53:205:99:5909,0,5314
contig341	6156	.	C	T	10430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=-0.437;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.287;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,350:677:99:10459,0,10322
contig341	6774	.	A	G	11190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.871;ClippingRankSum=-0.311;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.024;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,287:612:99:11219,0,12953
contig341	6777	.	C	T	11276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.984;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.748;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.073;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,288:615:99:11305,0,13183
contig341	6796	.	A	G	10122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-1.274;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.451;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,268:581:99:10151,0,12116
contig341	6879	.	A	G	9808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-1.458;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.506;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,314:629:99:9837,0,10192
contig341	7847	.	A	G	10399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.089;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.295;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,277:541:99:10428,0,9794
contig341	7863	.	A	G	9690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.342;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.312;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,248:486:99:9719,0,9103
contig341	7934	.	C	CTTT	4302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.381;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=7.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=0.348;QD=20.99;ReadPosRankSum=-3.479;SOR=1.172	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:108,97:205:99:4340,0,2930
contig341	7936	.	A	T	4360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.109;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=20.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-2.736;QD=18.80;ReadPosRankSum=-3.338;SOR=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:109,123:232:99:4398,0,2789
contig341	7969	.	G	A	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-1.402;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=20.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=0.549;QD=14.41;ReadPosRankSum=-3.654;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,99:195:99:2839,0,2986
contig341	8137	.	A	G	7491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-0.972;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.256;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.380;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,250:490:99:7520,0,8935
contig341	8253	.	T	C	11056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-0.745;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.266;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.031;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,282:549:99:11085,0,13494
contig341	8255	.	A	G	11300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.895;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.665;QD=20.77;ReadPosRankSum=2.056;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,278:544:99:11329,0,13542
contig341	8256	.	G	A	11126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.126;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.212;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.596;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,285:549:99:11155,0,13507
contig341	8283	.	A	G	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=1.655;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.387;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,302:580:99:11450,0,14022
contig341	8295	.	C	T	11329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.853;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.242;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,285:568:99:11358,0,14585
contig341	8307	.	G	A	10721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.988;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.673;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,283:580:99:10750,0,14843
contig341	8547	.	T	A	8065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=-0.166;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.783;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,270:568:99:8094,0,9301
contig341	9216	.	G	GGTGTA	11321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.765;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.267;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,288:616:99:11359,0,13774
contig341	9404	.	G	A	12409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=1.594;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.327;QD=19.39;ReadPosRankSum=2.821;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,319:640:99:12438,0,16360
contig341	9411	.	G	A	12806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=1.150;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.326;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.097;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,332:642:99:12835,0,16060
contig341	10055	.	TA	T	9461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.336;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.325;QD=15.07;ReadPosRankSum=2.568;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,304:628:99:9499,0,10081
contig341	11334	.	C	T	5787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-0.637;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.321;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,158:332:99:5816,0,6131
contig341	11352	.	A	G	5274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.098;DP=328;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.042;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.804;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:159,147:306:99:5303,0,6002
contig341	12101	.	T	C	11424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-0.493;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.492;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,294:623:99:11453,0,22043
contig341	12111	.	T	C	12189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.279;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.120;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.550;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,307:636:99:12218,0,22420
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contig341	13652	.	A	C	10730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=-1.723;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.393;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,291:605:99:10759,0,11577
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contig341	13830	.	G	A	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-1.008;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.110;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,236:490:99:9168,0,9864
contig341	13833	.	G	A	8994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.573;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.664;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,230:477:99:9023,0,9738
contig341	13938	.	GA	G	4860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.439;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.411;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,206:409:99:4898,0,4642
contig342	5464	.	A	C	8241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.891;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-0.314;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,257:501:99:8270,0,7451
contig342	5603	.	G	A	23492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.996;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQRankSum=2.012;QD=30.05;ReadPosRankSum=-1.925;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,627:632:99:23521,1717,0
contig342	5643	.	CAG	C	11449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-1.658;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=2.122;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.475;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,304:604:99:11487,0,11320
contig342	6070	.	T	TTATA	6329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=2.153;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.968;QD=21.17;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,161:299:99:6367,0,5264
contig342	6126	.	C	T	3853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.080;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.568;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.036;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,134:281:99:3882,0,4598
contig342	6452	.	A	G	23862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=1.517;DP=1344;ExcessHet=3.0103;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQRankSum=0.822;QD=22.58;ReadPosRankSum=1.700;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,785:1057:99:23891,0,6435
contig344	134	.	A	C	7086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=1.137;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.005;QD=16.52;ReadPosRankSum=4.128;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,237:429:99:7115,0,5788
contig344	597	.	A	G	4006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.021;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=4.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.306;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,126:268:99:4035,0,4562
contig344	606	.	ATT	A	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.416;ClippingRankSum=-0.175;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=16.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=-3.200;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.773;SOR=1.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,18:72:99:193,0,868
contig344	695	.	G	A	3694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.083;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.831;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,129:252:99:3723,0,3611
contig344	1145	.	C	T	7735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-1.583;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.665;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,257:499:99:7764,0,7254
contig344	1231	.	G	GA	6878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.066;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.243;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.506;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,233:476:99:6916,0,7138
contig344	1363	.	C	CT	3648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.281;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.332;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,168:366:99:3686,0,4584
contig344	1470	.	C	CT	7361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-0.666;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=3.719;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,223:483:99:7399,0,10325
contig344	1472	.	C	CA	8084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=-0.672;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.159;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,264:491:99:8122,0,8679
contig344	1529	.	C	CA	3321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.827;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=13.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,169:379:99:3359,0,4552
contig344	1588	.	C	T	8174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.894;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.950;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,271:534:99:8203,0,7901
contig345	1025	.	G	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.426;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=47.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.64;MQRankSum=-3.074;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.230;SOR=5.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:137,16:153:99:298,0,7916
contig345	1031	.	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.550;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=50.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.34;MQRankSum=-4.136;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.104;SOR=5.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,17:151:99:334,0,8210
contig345	1036	.	C	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-0.330;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=59.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.41;MQRankSum=-4.700;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.210;SOR=6.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,21:149:99:516,0,7879
contig345	1044	.	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.128;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=63.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.37;MQRankSum=-3.912;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.953;SOR=6.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,22:147:99:515,0,7534
contig345	1256	.	G	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.885;ClippingRankSum=0.467;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=122.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.05;MQRankSum=-1.778;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.193;SOR=6.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,66:279:99:1211,0,5511
contig345	1308	.	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.016;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=11.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.28;MQRankSum=-1.996;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=3.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:101,24:125:99:647,0,5122
contig345	1313	.	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.568;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQRankSum=-0.350;QD=5.08;ReadPosRankSum=-2.020;SOR=1.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,20:113:99:602,0,5038
contig345	1321	.	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.782;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.91;MQRankSum=-1.435;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.872;SOR=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,13:92:99:287,0,4454
contig345	1334	.	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-1.141;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.94;MQRankSum=-0.879;QD=2.17;ReadPosRankSum=-1.988;SOR=0.023	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:78,11:89:99:221,0,3900
contig345	1342	.	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=1.718;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.543;QD=2.47;ReadPosRankSum=-3.097;SOR=0.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,11:87:99:243,0,3673
contig345	1554	.	C	A	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-1.781;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=8.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.33;MQRankSum=4.230;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.606;SOR=2.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,71:84:99:3152,0,298
contig345	1555	.	A	G	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.375;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=9.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.69;MQRankSum=4.351;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.769;SOR=2.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,75:87:99:3152,0,298
contig345	1566	.	T	C	3420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.888;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=13.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.17;MQRankSum=4.129;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.121;SOR=3.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,81:90:99:3449,0,306
contig345	1574	.	C	T	3450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.049;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=63.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQRankSum=5.170;QD=29.54;ReadPosRankSum=2.931;SOR=5.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,83:98:99:3479,0,693
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contig345	1938	.	G	A	233.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.33;QD=29.18;SOR=3.912	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
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contig345	1948	.	C	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.32;QD=30.23;SOR=3.611	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
contig345	2243	.	G	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=1.244;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.53;MQRankSum=-0.512;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.756;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:678,0,453
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contig345	2377	.	A	G	4397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=-0.597;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.59;MQRankSum=0.221;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,134:285:99:4426,0,4667
contig346	1474	.	A	C	8576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=1.580;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.233;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,286:569:99:8605,0,8545
contig346	1609	.	CTTAGT	C	7340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=-0.613;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=10.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.194;QD=18.68;ReadPosRankSum=3.050;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,192:393:99:7378,0,7858
contig346	1615	.	T	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-1.863;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.608;QD=7.20;ReadPosRankSum=5.092;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,130:327:99:2382,0,7952
contig346	1629	.	G	A	8350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=2.007;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.638;QD=23.93;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,187:349:99:8379,0,7034
contig346	1643	.	C	CT	7549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.395;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=7.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.269;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,187:334:99:7587,0,5663
contig346	1773	.	G	A	6357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.313;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.146;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.486;SOR=1.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,200:450:99:6386,0,7981
contig346	2112	.	T	C	8062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-1.320;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.197;QD=14.58;ReadPosRankSum=3.299;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,269:553:99:8091,0,8913
contig346	2156	.	A	G	10107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.546;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.513;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,263:558:99:10136,0,11521
contig346	2162	.	A	C	10238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.175;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.155;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.986;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,267:568:99:10267,0,11573
contig346	2188	.	A	G	8241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=1.104;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.964;QD=15.64;ReadPosRankSum=2.527;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,224:527:99:8270,0,11467
contig346	2202	.	A	G	8575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.114;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.117;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.503;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,231:521:99:8604,0,11273
contig346	2276	.	T	C	6626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=1.651;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.080;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.542;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,215:483:99:6655,0,8637
contig346	3008	.	T	C	8470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=-1.086;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.678;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,220:434:99:8499,0,8118
contig346	3009	.	A	G	8470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.876;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.060;QD=19.93;ReadPosRankSum=1.512;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,214:425:99:8499,0,8118
contig346	3042	.	G	T	8543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.671;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=3.216;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,221:431:99:8572,0,8116
contig346	3046	.	C	T	8640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.195;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.428;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,216:421:99:8669,0,8267
contig346	3047	.	T	C	8673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.717;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.539;QD=20.80;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,215:417:99:8702,0,8231
contig346	3062	.	T	C	8845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.172;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.065;QD=20.86;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,218:424:99:8874,0,8032
contig346	3077	.	G	T	8566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.338;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.278;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,223:422:99:8595,0,7796
contig346	3182	.	C	T	6739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.652;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.504;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.476;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,234:467:99:6768,0,7083
contig346	3201	.	G	A	8870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.998;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.533;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,232:470:99:8899,0,9220
contig346	3204	.	G	A	8780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=-0.622;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.335;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.413;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,225:464:99:8809,0,9336
contig346	3231	.	C	T	7359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.133;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.070;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,235:470:99:7388,0,7484
contig346	4458	.	G	A	10531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-0.959;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.719;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,271:559:99:10560,0,11319
contig346	4460	.	T	A	10531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=-1.012;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.698;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,274:562:99:10560,0,11319
contig346	4570	.	TTGAAGTTTTTGCTTAATGGTA	T	7989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=-0.610;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=5.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-2.950;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.491;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,219:536:99:8027,0,12413
contig346	4902	.	A	G	8899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.677;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.126;QD=20.79;ReadPosRankSum=5.808;SOR=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,228:428:99:8928,0,7530
contig346	4911	.	C	T	8989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.707;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.801;QD=20.57;ReadPosRankSum=2.343;SOR=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,234:437:99:9018,0,7637
contig346	5222	.	G	C	10516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=-1.094;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.400;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,270:571:99:10545,0,11850
contig346	5224	.	C	T	10678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.987;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.818;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.317;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,269:568:99:10707,0,12128
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contig346	7403	.	C	G	10138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-1.654;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.480;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,250:461:99:10167,0,8385
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contig347	1667	.	G	A	7670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.709;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.225;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,250:517:99:7699,0,8548
contig347	1843	.	G	T	10404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.739;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=1.928;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,264:522:99:10433,0,10291
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contig347	1847	.	T	G	10480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=1.007;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=2.468;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,263:526:99:10509,0,10318
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contig347	1996	.	G	C	9458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.190;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.428;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,251:551:99:9487,0,11722
contig347	2036	.	T	C	8178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.686;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.038;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,277:572:99:8207,0,8603
contig347	2042	.	A	AT	4684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.841;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.951;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,244:502:99:4722,0,5160
contig347	2177	.	C	T	9841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.174;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.830;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,254:502:99:9870,0,9622
contig347	2178	.	T	G	9841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.459;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.169;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.036;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,256:503:99:9870,0,9622
contig347	2229	.	C	T	9436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.016;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.463;QD=19.58;ReadPosRankSum=2.385;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,240:482:99:9465,0,9662
contig347	2231	.	C	T	9507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=2.946;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.461;QD=19.56;ReadPosRankSum=2.679;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,241:486:99:9536,0,9824
contig347	2246	.	C	T	9332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.038;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.955;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,237:464:99:9361,0,9271
contig347	2249	.	C	T	9302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.361;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.071;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,229:451:99:9331,0,9106
contig347	2251	.	T	C	9163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.946;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.231;QD=20.45;ReadPosRankSum=1.776;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,225:448:99:9192,0,9156
contig347	2260	.	T	C	8748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.117;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.522;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,224:451:99:8777,0,8747
contig347	2318	.	ATTTT	A	6161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=-0.273;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=1.373;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,159:341:99:6199,0,7487
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contig347	2343	.	T	A	7002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.022;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-0.612;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.920;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,173:360:99:7031,0,7391
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contig347	2586	.	T	G	12327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.741;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.910;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,305:629:99:12356,0,13003
contig347	2588	.	C	T	11877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.011;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.732;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,305:628:99:11906,0,12868
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contig347	2668	.	G	C	8799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.653;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.046;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,278:553:99:8828,0,9010
contig347	2713	.	G	A	10208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.490;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.397;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,275:560:99:10237,0,10872
contig347	2728	.	T	C	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=1.133;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.422;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,281:574:99:10550,0,11055
contig347	2971	.	T	C	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.191;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.709;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,294:631:99:11325,0,13195
contig347	2974	.	G	C	11416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.048;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.137;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,297:638:99:11445,0,13334
contig347	3004	.	A	C	10465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.838;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.073;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,277:634:99:10494,0,14289
contig347	3007	.	G	A	10512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.406;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.244;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,275:638:99:10541,0,14388
contig347	3037	.	G	A	11136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.738;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.034;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,294:632:99:11165,0,13300
contig347	3049	.	A	G	11696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.518;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.703;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,290:628:99:11725,0,13785
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contig347	3069	.	C	T	10266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-0.059;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.089;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.232;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,270:584:99:10295,0,12240
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contig347	3295	.	A	G	11736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=-2.207;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.808;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.330;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,305:632:99:11765,0,12475
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contig347	3469	.	A	T	9436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.511;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.113;QD=15.94;ReadPosRankSum=2.957;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,304:592:99:9465,0,9064
contig347	4195	.	C	G	9985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-1.445;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.044;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,266:583:99:10014,0,12392
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contig347	4228	.	G	A	9833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.700;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.315;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.255;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,304:573:99:9862,0,8510
contig347	4751	.	A	AT	11745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-2.487;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.894;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,303:581:99:11783,0,10756
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contig347	4782	.	A	G	12876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.071;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.266;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,316:622:99:12905,0,12275
contig347	4791	.	A	G	12489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.116;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.567;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,301:590:99:12518,0,11912
contig347	4792	.	T	A	12142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.273;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.076;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,299:586:99:12171,0,11741
contig347	4797	.	G	A	11829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.009;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.076;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.667;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,303:587:99:11858,0,11200
contig347	4895	.	C	T	11312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=1.644;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.542;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.004;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,300:591:99:11341,0,11038
contig347	4908	.	T	C	11876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.477;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.127;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,293:583:99:11905,0,11764
contig347	4926	.	T	G	11068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=1.103;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.097;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.620;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,281:586:99:11097,0,12447
contig347	4938	.	A	G	11446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.042;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.879;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,291:597:99:11475,0,12420
contig347	4950	.	T	C	11983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.887;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.261;QD=20.14;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,298:595:99:12012,0,11922
contig347	4973	.	T	G	12081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=2.059;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.154;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,304:604:99:12110,0,11902
contig347	4977	.	T	C	11819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.705;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.592;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,301:605:99:11848,0,11904
contig347	5004	.	A	G	9455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.244;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.238;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,303:605:99:9484,0,9188
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contig347	5334	.	C	T	9867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=1.470;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.173;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,259:565:99:9896,0,11960
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contig347	5610	.	A	G	9893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.412;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.007;QD=19.32;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,246:512:99:9922,0,10750
contig347	5619	.	C	T	9940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.963;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.018;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,248:518:99:9969,0,11264
contig347	5626	.	C	A	10409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.399;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.089;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.684;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,261:543:99:10438,0,8724
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contig347	5639	.	A	C	10991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=1.711;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.745;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,273:568:99:11020,0,11953
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contig347	8556	.	A	G	10140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.022;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.298;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,266:533:99:10169,0,9943
contig347	8574	.	A	G	11354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.598;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.092;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.471;SOR=1.006	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,280:562:99:11383,0,11412
contig347	8591	.	G	A	11671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=-0.161;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.422;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,292:588:99:11700,0,12195
contig347	8610	.	C	G	12339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.525;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.153;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,301:618:99:12368,0,13120
contig347	8640	.	C	A	11577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=-0.122;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=2.802;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.793;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,313:627:99:11606,0,11836
contig347	8668	.	ACACTTCTGGATGATCTTCTCGATC	A	5842.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=2.498;DP=770;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-4.272;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,217:538:99:5880,0,12380
contig347	8912	.	C	T	12725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.278;DP=750;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.214;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,336:718:99:12754,0,14516
contig347	8922	.	C	CTCA	13263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.869;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.545;QD=18.92;ReadPosRankSum=-2.429;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,338:701:99:13301,0,13913
contig347	9014	.	A	G	11733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.570;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.969;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,304:656:99:11762,0,13806
contig347	9016	.	T	C	11733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.922;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.528;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,304:656:99:11762,0,13806
contig347	9623	.	C	T	10561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=-0.630;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.750;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,271:545:99:10590,0,10563
contig347	9630	.	C	T	10866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.071;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.073;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,265:535:99:10895,0,10840
contig347	9633	.	C	G	10866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.789;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.528;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,270:535:99:10895,0,10961
contig347	9643	.	T	C	10151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.172;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.740;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.592;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,265:529:99:10180,0,10214
contig347	9854	.	GATTT	G	10770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.903;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-4.678;QD=14.54;ReadPosRankSum=4.343;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:387,354:741:99:10808,0,15307
contig347	9859	.	GAATTGTGGGATGGA	G	10634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=1.382;DP=857;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-5.768;QD=13.63;ReadPosRankSum=7.900;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:426,354:780:99:10672,0,17153
contig347	9885	.	GGATGGATTCGAAGAATGA	G	14642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.528;ClippingRankSum=-1.019;DP=799;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQRankSum=-5.110;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:398,374:772:99:14680,0,15828
contig347	9930	.	TGGAGAATGGGATGGATCAGGAGAATGGGATGGATTC	T	13899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;ClippingRankSum=-1.439;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-9.576;QD=18.46;ReadPosRankSum=-4.523;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:396,357:753:99:13937,0,15695
contig347	9979	.	G	A	13345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=-2.211;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-5.850;QD=21.70;ReadPosRankSum=-5.379;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,332:615:99:13374,0,10603
contig347	10167	.	C	A	7899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.566;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.069;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,208:404:99:7928,0,11955
contig347	10182	.	A	G	8004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-0.070;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.287;QD=19.62;ReadPosRankSum=3.309;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,211:408:99:8033,0,12014
contig347	10319	.	T	C	6958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.499;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.846;QD=18.91;ReadPosRankSum=-2.541;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,179:368:99:6987,0,7341
contig347	10329	.	T	C	7199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=-0.245;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=6.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.235;QD=19.41;ReadPosRankSum=-3.432;SOR=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,189:371:99:7228,0,7061
contig347	10379	.	T	C	5742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-0.295;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=9.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.251;QD=16.94;ReadPosRankSum=-2.136;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,152:339:99:5771,0,7572
contig347	10382	.	T	C	6018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.608;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=9.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.230;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.751;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,152:340:99:6047,0,7812
contig347	10383	.	A	G	6012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.866;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.822;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,152:340:99:6041,0,7796
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contig347	10443	.	G	A	5955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.050;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.439;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.779;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,153:328:99:5984,0,6838
contig347	10498	.	CCGGGAGCA	C	7100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.960;ClippingRankSum=0.791;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.295;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,183:390:99:7138,0,8244
contig347	10507	.	TATGCGCCGCC	T	7290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.771;DP=422;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.003;QD=18.14;ReadPosRankSum=2.755;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,188:402:99:7328,0,8600
contig347	10527	.	C	T	7826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.270;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=7.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.530;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,205:394:99:7855,0,7304
contig347	10650	.	G	C	7371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-1.287;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.658;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,186:367:99:7400,0,11046
contig347	10652	.	G	T	7526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.325;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=4.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.896;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,189:377:99:7555,0,11322
contig347	10660	.	CCCATCT	C	7986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-1.467;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=3.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.077;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,199:397:99:8024,0,12962
contig347	10669	.	A	G	7833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-0.683;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.637;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,195:379:99:7862,0,12545
contig347	10675	.	A	G	7719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=-0.170;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=7.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.480;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.618;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,189:374:99:7748,0,12671
contig347	10684	.	CT	C	7302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.587;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.339;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,185:351:99:7340,0,12060
contig347	10686	.	CG	C	7554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=-0.981;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=3.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.638;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,184:349:99:7592,0,11983
contig347	10689	.	A	ATG	7509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.092;ClippingRankSum=1.143;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.528;QD=21.40;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,188:351:99:7547,0,11512
contig347	10770	.	C	T	5570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=-1.477;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=13.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.762;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.220;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,147:309:99:5599,0,6126
contig347	10776	.	A	G	5502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.279;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=10.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.003;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.983;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,146:308:99:5531,0,6205
contig347	10833	.	A	G	6469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-0.219;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.244;QD=20.67;ReadPosRankSum=2.435;SOR=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,163:313:99:6498,0,5804
contig347	10837	.	C	T	6802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.698;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=8.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.690;QD=21.94;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,168:310:99:6831,0,5754
contig347	10840	.	C	T	6822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=1.200;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.752;QD=21.66;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,174:315:99:6851,0,5545
contig347	10866	.	A	G	5826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.330;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=0.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.459;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:155,179:334:99:5855,0,4788
contig347	10909	.	C	G	7175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=-0.044;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=7.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.738;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.338;SOR=1.023	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,188:371:99:7204,0,7101
contig347	10920	.	G	A	7194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.302;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.745;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,193:389:99:7223,0,7373
contig347	10971	.	T	C	7535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.142;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.408;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,191:367:99:7564,0,6719
contig347	10974	.	A	G	7646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-0.411;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.478;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:173,193:366:99:7675,0,6676
contig347	11041	.	A	G	9053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=2.601;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.296;QD=20.16;ReadPosRankSum=1.430;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,230:449:99:9082,0,13112
contig347	11047	.	C	A	9275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=1.058;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.906;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.072;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,233:447:99:9304,0,13290
contig347	11049	.	G	A	9160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=-1.128;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.954;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,231:445:99:9189,0,13222
contig347	11275	.	C	T	11288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=-0.373;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.432;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,296:579:99:11317,0,10667
contig347	11285	.	T	C	11174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.145;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.182;QD=20.03;ReadPosRankSum=-2.414;SOR=0.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,291:558:99:11203,0,10601
contig347	11304	.	CTTTTATTTTA	C	12655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-0.468;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.100;QD=20.78;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,304:609:99:12693,0,12098
contig347	11320	.	C	T	12439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=1.072;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.477;QD=21.67;ReadPosRankSum=1.911;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,304:574:99:12468,0,10974
contig347	11329	.	C	CT	11810.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=1.028;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.554;QD=20.54;ReadPosRankSum=2.210;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,299:575:99:11848,0,10573
contig347	11364	.	T	C	12424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-1.070;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.668;QD=21.13;ReadPosRankSum=-3.207;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,326:588:99:12453,0,9759
contig347	11381	.	G	T	13068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=-0.346;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.666;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,324:625:99:13097,0,11713
contig347	11382	.	A	G	12902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;ClippingRankSum=-0.381;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.111;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,325:627:99:12931,0,11695
contig347	11548	.	C	T	10687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.696;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.085;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,279:600:99:10716,0,12571
contig347	11551	.	G	A	10636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.084;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.149;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,278:601:99:10665,0,12609
contig347	11652	.	A	G	8949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=1.833;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.524;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,234:503:99:8978,0,10528
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contig347	12390	.	G	T	9672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.534;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.293;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,260:487:99:9701,0,8573
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contig347	12433	.	A	C	7859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.351;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.796;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,250:503:99:7888,0,7949
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contig347	13287	.	A	T	12162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.351;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.850;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,306:635:99:12191,0,13496
contig347	13298	.	TC	T	11551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=1.038;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.031;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,291:611:99:11589,0,13164
contig347	13301	.	C	T	11413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=-0.741;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.934;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,291:612:99:11442,0,12882
contig347	13310	.	C	T	11728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.114;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.667;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,296:602:99:11757,0,12567
contig347	13317	.	G	A	12044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-0.414;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.780;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,295:596:99:12073,0,12008
contig347	13322	.	T	C	11360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=1.042;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.296;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,287:585:99:11389,0,11624
contig347	13446	.	T	G	11079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-2.117;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.585;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,285:608:99:11108,0,12533
contig347	13451	.	TCCA	T	10409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=-1.508;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.507;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.462;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,280:608:99:10447,0,13377
contig347	13461	.	TAAC	T	11328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.201;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.378;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,290:610:99:11366,0,12715
contig347	13519	.	GT	G	6724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.639;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.041;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,241:510:99:6762,0,7525
contig347	13576	.	A	G	9493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.112;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.220;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.864;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,249:512:99:9522,0,10094
contig347	13582	.	C	T	9482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.405;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.356;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,242:496:99:9511,0,9961
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contig347	13961	.	G	A	13722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.452;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.785;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,341:653:99:13751,0,12541
contig347	14046	.	T	G	15351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-2.216;DP=824;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.784;QD=19.24;ReadPosRankSum=-2.373;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,414:798:99:15380,0,14332
contig347	14065	.	T	C	15012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.053;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.450;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.946;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,390:759:99:15041,0,14123
contig347	14663	.	A	G	9621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=-0.831;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.287;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,253:506:99:9650,0,9688
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contig347	15427	.	T	G	9527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;ClippingRankSum=0.225;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.425;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,250:505:99:9556,0,9994
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contig347	15455	.	T	A	8979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.361;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.783;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,236:479:99:9008,0,9386
contig347	15519	.	C	A	9860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=-0.736;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.821;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,253:477:99:9889,0,8373
contig347	15536	.	A	G	10714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=-1.086;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.623;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,266:505:99:10743,0,9401
contig347	15541	.	C	G	10446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.294;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.214;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,261:497:99:10475,0,9523
contig347	15548	.	G	A	10488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.335;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.951;QD=20.61;ReadPosRankSum=2.309;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,261:509:99:10517,0,9826
contig347	15560	.	T	C	10293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-1.439;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.026;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,269:507:99:10322,0,9242
contig347	15682	.	T	A	7600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.853;ClippingRankSum=-0.452;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.910;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.067;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,233:459:99:7629,0,6676
contig347	15752	.	T	C	9007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.497;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=4.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.036;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,228:445:99:9036,0,8553
contig347	15755	.	G	T	9212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.370;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.003;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,226:444:99:9241,0,8737
contig347	15758	.	G	C	9245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.567;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.124;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,229:448:99:9274,0,8734
contig347	15762	.	G	A	9196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.069;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.065;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,226:444:99:9225,0,8945
contig347	15768	.	G	A	9256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.645;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.635;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,231:456:99:9285,0,8978
contig347	15771	.	T	A	9222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.019;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.195;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,236:459:99:9251,0,8894
contig347	15795	.	G	C	8576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.708;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.543;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,228:456:99:8605,0,9405
contig347	15812	.	C	A	9330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.515;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.040;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,245:478:99:9359,0,8896
contig347	15920	.	G	A	8663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-1.104;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.427;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,272:516:99:8692,0,7625
contig347	15948	.	CGTAATTAGCCA	C	8221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.152;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.041;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.267;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,207:473:99:8259,0,10661
contig347	15969	.	A	G	9519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.933;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.437;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,242:497:99:9548,0,10311
contig347	15979	.	G	A	9521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.439;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.616;QD=19.12;ReadPosRankSum=-1.677;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,252:498:99:9550,0,9619
contig347	16056	.	T	C	11235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=1.765;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.327;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,288:552:99:11264,0,10132
contig347	16060	.	C	A	11764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=-0.478;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.913;QD=21.31;ReadPosRankSum=-1.267;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,292:552:99:11793,0,10451
contig347	16061	.	A	T	11886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.655;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.961;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,289:550:99:11915,0,10437
contig347	16077	.	T	C	10980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.963;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.300;QD=20.56;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,267:534:99:11009,0,10860
contig347	16082	.	A	G	10646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=1.481;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.757;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.075;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,274:548:99:10675,0,10702
contig347	16109	.	A	G	9016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=1.690;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.199;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,279:524:99:9045,0,7500
contig347	16139	.	A	G	10497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=1.438;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.924;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.787;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,273:543:99:10526,0,10523
contig347	16147	.	A	G	10717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=1.639;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.200;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.243;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,270:530:99:10746,0,10590
contig347	16158	.	T	C	9708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=-0.489;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.264;QD=19.15;ReadPosRankSum=2.290;SOR=0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,248:507:99:9737,0,10098
contig347	16304	.	T	A	7330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.491;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.396;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,197:419:99:7359,0,8379
contig347	16321	.	TG	T	7578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.486;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.084;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,194:413:99:7616,0,8768
contig347	16323	.	T	A	7390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.191;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.423;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,193:413:99:7419,0,8631
contig347	16369	.	G	GT	7158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-1.474;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.520;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,248:484:99:7196,0,6913
contig347	17244	.	T	C	11073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=1.276;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.529;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.485;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,290:632:99:11102,0,18725
contig347	17253	.	C	T	11325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.487;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.281;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,298:623:99:11354,0,18443
contig347	17557	.	A	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.557;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=15.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.47;MQRankSum=3.334;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=2.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,22:205:99:360,0,7499
contig347	17560	.	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.708;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=11.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.39;MQRankSum=3.200;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=2.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,21:196:99:331,0,7521
contig347	17568	.	G	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.750;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.77;MQRankSum=3.588;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,14:174:99:205,0,7045
contig347	17574	.	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.622;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.36;MQRankSum=3.562;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,13:149:99:106,0,6091
contig347	17575	.	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.213;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=13.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.37;MQRankSum=3.512;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,13:139:99:166,0,5836
contig347	17590	.	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.135;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=75.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.70;MQRankSum=5.260;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.574;SOR=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,13:120:99:214,0,4376
contig347	17690	.	G	A	5528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.957;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=251.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.45;MQRankSum=6.701;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.507;SOR=9.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,126:147:99:5557,0,445
contig347	17699	.	G	A	6221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.311;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=206.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.20;MQRankSum=5.999;QD=32.00;ReadPosRankSum=1.364;SOR=9.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,146:161:99:6250,0,311
contig347	17703	.	AGGAAGATGAT	A	7001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-1.452;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=165.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.24;MQRankSum=5.495;QD=35.02;ReadPosRankSum=1.634;SOR=6.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,155:169:99:7039,0,184
contig347	17716	.	AGG	A	7132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=2.044;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=70.743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.70;MQRankSum=3.982;QD=32.38;ReadPosRankSum=0.284;SOR=4.835	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,169:176:77:7170,77,0
contig347	18521	.	TCTCTCTTCTTTATGCTTTCAGCTTCTTCATCAACTCTCTTCTTATGCTTTCAGCTTCTACTTCAACACTCTTCTTATGATTTCAGCTTCTACTCCAACA	T	1389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.31;QD=28.83;SOR=6.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:99:1427,100,0
contig347	18764	.	T	C	6326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.58;QD=34.57;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,183:183:99:6355,548,0
contig347	19025	.	C	T	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.67;QD=31.78;SOR=1.762	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,161:161:99:5145,483,0
contig347	20183	.	G	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=1.330;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=66.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.19;MQRankSum=0.712;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.313;SOR=5.210	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,27:256:99:269,0,6462
contig347	20425	.	C	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.357;ClippingRankSum=-1.078;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=190.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQRankSum=-7.299;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=4.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,63:273:99:1698,0,6405
contig347	21617	.	A	C	6973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.99;QD=34.70;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,201:201:99:7002,604,0
contig347	22334	.	G	A	13629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.65;QD=29.32;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,303:303:99:13658,939,0
contig347	22338	.	C	A	13504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;QD=25.53;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,301:301:99:13533,927,0
contig347	22795	.	C	T	6766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.36;QD=34.35;SOR=1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,197:197:99:6795,592,0
contig347	23189	.	C	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.95;QD=31.59;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2195,183,0
contig347	23213	.	C	T	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.89;QD=32.84;SOR=2.340	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2241,188,0
contig347	23504	.	G	A	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.28;QD=31.90;SOR=3.237	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,105:105:99:4046,316,0
contig347	23525	.	C	T	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.32;QD=31.02;SOR=7.223	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:3294,223,0
contig347	23534	.	A	C	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.33;QD=33.53;SOR=8.581	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3240,217,0
contig347	23540	.	T	C	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.30;QD=28.68;SOR=8.497	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:3195,214,0
contig347	23547	.	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.29;QD=28.69;SOR=8.468	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:3105,208,0
contig347	23548	.	C	T	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.29;QD=34.74;SOR=8.468	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:3105,208,0
contig348	3319	.	GA	G	4719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.914;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.874;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,216:418:99:4757,0,4347
contig348	3716	.	A	C	6465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.175;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.803;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,222:465:99:6494,0,7380
contig348	3921	.	GTA	G,GTATA	14714.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.573;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.099;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.065;QD=33.90;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:5,224,205:434:99:14752,7291,8009,8151,0,8504
contig348	3984	.	C	T	9289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=1.385;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.773;QD=18.58;ReadPosRankSum=-2.421;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,249:500:99:9318,0,9480
contig348	3999	.	G	A	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.637;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.204;QD=18.30;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,237:486:99:8921,0,9665
contig348	7745	.	C	T	9717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-2.671;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.844;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,249:485:99:9746,0,8895
contig348	7755	.	G	A	9646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=1.940;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.186;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,250:472:99:9675,0,8623
contig348	8447	.	T	G	8701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.476;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.401;QD=16.30;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,283:534:99:8730,0,7836
contig348	8464	.	C	T	10575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.437;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.176;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,274:520:99:10604,0,9641
contig348	8467	.	CAG	C	10470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=1.379;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.284;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,267:529:99:10508,0,10107
contig348	8984	.	C	T	7050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.141;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.194;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,248:544:99:7079,0,9603
contig348	9125	.	A	G	10591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.354;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=6.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.879;QD=18.14;ReadPosRankSum=2.121;SOR=1.100	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,277:584:99:10620,0,14596
contig348	9140	.	C	T	10566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=0.039;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=4.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.209;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.546;SOR=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,270:580:99:10595,0,17987
contig348	9153	.	C	T	10659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.460;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.509;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,275:601:99:10688,0,18718
contig348	9156	.	G	A	10367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.382;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.350;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,264:585:99:10396,0,18595
contig348	9208	.	T	C	8595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.241;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.322;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,236:535:99:8624,0,14279
contig348	9224	.	G	A	8375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.516;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.579;QD=15.71;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,233:533:99:8404,0,14318
contig348	9429	.	A	AT	4901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.287;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.233;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,223:428:99:4939,0,4385
contig348	9633	.	TGATACA	T	11357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.282;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.905;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,293:562:99:11395,0,10324
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contig348	9917	.	GT	G	5248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-1.012;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.331;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.820;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,234:510:99:5286,0,6931
contig348	10751	.	C	CT	5862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.368;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.702;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,258:500:99:5900,0,5702
contig348	10776	.	C	CT	5579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.643;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.013;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,228:470:99:5617,0,5969
contig348	10871	.	C	T	8471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-0.494;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.460;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,222:439:99:8500,0,8345
contig348	10882	.	G	A	8829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=-0.459;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.167;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,233:451:99:8858,0,8259
contig348	11070	.	TAA	T	6111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.500;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.440;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,196:408:99:6149,0,6373
contig348	11253	.	T	TCAA	12728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=-0.487;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.082;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,307:561:99:12766,0,9792
contig348	11254	.	G	GTT	12734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=-0.067;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.997;QD=22.22;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,318:573:99:12772,0,9748
contig348	11300	.	T	G	8266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-0.956;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.579;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,219:509:99:8295,0,11366
contig348	11305	.	T	C	8464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.188;DP=511;ExcessHet=3.0103;FS=3.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.911;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,216:489:99:8493,0,11079
contig348	11319	.	A	AC	7741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.050;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.589;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,208:495:99:7779,0,11414
contig348	11345	.	A	G	7995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=-1.125;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.622;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.220;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,214:504:99:8024,0,11680
contig348	11348	.	C	G	8031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=1.081;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.067;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,210:500:99:8060,0,12119
contig348	11349	.	T	C	8193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-1.363;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.181;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,208:503:99:8222,0,12223
contig348	11354	.	G	GGGAT	8645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=-2.366;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.973;QD=17.09;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,206:506:99:8683,0,12328
contig348	11356	.	GGT	G	8581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.439;ClippingRankSum=-0.969;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.311;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.495;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,211:515:99:8619,0,12624
contig348	11362	.	ACT	A	7998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=-0.058;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.334;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,210:515:99:8036,0,12319
contig348	11412	.	T	C	8870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.500;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.052;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,226:504:99:8899,0,10631
contig348	11423	.	A	T	9426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.192;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.986;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.581;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,252:534:99:9455,0,10817
contig348	11450	.	T	A	10069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-0.563;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.050;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,263:522:99:10098,0,10104
contig348	11457	.	C	T	10509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-2.577;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.250;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,262:524:99:10538,0,10306
contig348	11474	.	A	G	10404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.756;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.147;QD=19.30;ReadPosRankSum=6.066;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,260:539:99:10433,0,11150
contig348	11483	.	G	A	10066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.351;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.458;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,265:558:99:10095,0,11376
contig348	11512	.	G	T	9644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.571;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.128;QD=17.22;ReadPosRankSum=-3.408;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,269:560:99:9673,0,10717
contig348	11534	.	G	A	9751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=-0.191;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.766;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,249:541:99:9780,0,11740
contig348	11538	.	A	G	9927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;ClippingRankSum=-2.087;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.184;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,254:549:99:9956,0,11877
contig348	11539	.	C	T	9846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.051;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.144;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,253:549:99:9875,0,11841
contig348	12303	.	A	G	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.520;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.222;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,271:570:99:8304,0,10934
contig348	12332	.	C	A	11425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.447;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.338;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,304:594:99:11454,0,10657
contig348	12349	.	C	G	11598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=1.573;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.877;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,299:566:99:11627,0,9847
contig348	12524	.	G	A	9979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.064;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.914;QD=19.57;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,254:510:99:10008,0,10070
contig348	12527	.	T	A	10021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.544;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.840;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.631;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,256:520:99:10050,0,10116
contig348	12553	.	G	C	9732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.322;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.395;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,259:528:99:9761,0,10572
contig348	12568	.	A	G	9744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.637;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.533;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,263:539:99:9773,0,10450
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contig348	12683	.	A	G	8656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=1.334;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.808;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,250:564:99:8685,0,11722
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contig348	13770	.	G	A	7359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.884;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.216;QD=13.71;ReadPosRankSum=2.335;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,246:537:99:7388,0,8720
contig348	13977	.	TA	T	3669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=1.174;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=5.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.572;QD=8.25;ReadPosRankSum=3.415;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,184:445:99:3707,0,8209
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contig348	14149	.	T	C	9452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.057;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.559;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,246:516:99:9481,0,15546
contig348	14177	.	T	C	9768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.871;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.173;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,261:524:99:9797,0,9820
contig348	14194	.	T	A	10436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.587;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.548;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,261:512:99:10465,0,9996
contig348	14200	.	G	C	10258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.578;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.516;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.503;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,248:497:99:10287,0,9953
contig348	14224	.	C	A	10047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=-0.749;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.222;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,265:502:99:10076,0,9123
contig348	14244	.	G	GA	1720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.898;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.481;QD=4.02;ReadPosRankSum=5.630;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,118:428:99:1758,0,6739
contig348	14271	.	T	G	6375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.604;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.048;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.469;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,240:532:99:6404,0,9152
contig348	14307	.	T	C	9348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=-0.941;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.095;QD=15.87;ReadPosRankSum=2.090;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,264:589:99:9377,0,12876
contig348	14308	.	T	C	9360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.226;ClippingRankSum=-0.534;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.864;QD=16.00;ReadPosRankSum=2.282;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,262:585:99:9389,0,12782
contig348	14356	.	A	G	12148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.333;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=6.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.243;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.987	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,306:616:99:12177,0,12158
contig348	14357	.	G	A	12286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.234;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=6.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.232;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,311:618:99:12315,0,12218
contig348	14362	.	A	G	12137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.124;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,313:621:99:12166,0,12127
contig348	14504	.	T	A	10161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.867;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.755;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,338:612:99:10190,0,8109
contig348	14577	.	G	A	9841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.977;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.315;QD=17.12;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,262:575:99:9870,0,11927
contig348	14594	.	T	G	9889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.014;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.154;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,265:571:99:9918,0,11634
contig348	15362	.	A	G	9835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.639;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.506;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,251:514:99:9864,0,10388
contig348	15365	.	T	C	9827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.515;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.483;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,255:525:99:9856,0,10463
contig348	15661	.	C	T	10718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.009;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.455;QD=21.02;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,276:510:99:10747,0,8578
contig348	15681	.	C	T	11565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-0.545;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.233;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,286:511:99:11594,0,8916
contig348	15682	.	A	G	11459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.122;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.325;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.396;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,283:509:99:11488,0,8779
contig348	15716	.	T	TG	6690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.323;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.046;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,178:382:99:6728,0,7898
contig348	15726	.	C	T	6435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.256;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.293;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,166:357:99:6464,0,7542
contig348	15727	.	T	C	6399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=-0.455;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.149;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,164:355:99:6428,0,7545
contig348	15766	.	A	ATTTT	647.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.343;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-2.153;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,21:43:99:685,0,817
contig348	15881	.	C	T	5536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.621;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.112;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.432	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,187:390:99:5565,0,5980
contig348	16045	.	C	T	11337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.615;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.104;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,303:627:99:11366,0,12558
contig348	16058	.	C	T	11698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.270;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.314;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.634;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,292:605:99:11727,0,12445
contig348	16064	.	C	T	11557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.618;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.825;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,302:628:99:11586,0,12605
contig348	16136	.	A	G	10634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.153;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.680;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,274:574:99:10663,0,11888
contig348	16140	.	C	T	11177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=1.680;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.735;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,278:583:99:11206,0,12291
contig348	16143	.	G	C	11109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-2.170;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.403;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,274:578:99:11138,0,12352
contig348	16160	.	A	T	10912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.893;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.948;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,278:599:99:10941,0,13067
contig348	16165	.	T	C	10811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=-1.070;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.714;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,272:583:99:10840,0,12539
contig348	16677	.	G	A	12485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.241;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.057;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,320:653:99:12514,0,12913
contig348	16686	.	T	C	12962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=-0.267;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.045;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,341:688:99:12991,0,13899
contig348	16707	.	C	T	13814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.891;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.168;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,356:691:99:13843,0,13240
contig348	16713	.	A	G	13859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.339;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.249;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,362:702:99:13888,0,13165
contig348	17272	.	G	A	9432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-0.095;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.678;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,299:548:99:9461,0,7798
contig348	17325	.	G	A	10190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.513;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.329;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,265:561:99:10219,0,11258
contig348	17335	.	C	T	10286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=1.678;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.142;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,276:569:99:10315,0,11506
contig348	17419	.	A	G	11132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;ClippingRankSum=1.574;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.239;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,295:586:99:11161,0,10883
contig348	17436	.	T	C	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=1.070;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.370;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,288:577:99:11648,0,11837
contig348	17439	.	A	G	11190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=1.597;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.551;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,287:576:99:11219,0,11469
contig348	17492	.	G	GACAATTTT	10979.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.573;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.853;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,268:567:99:11017,0,11915
contig348	17499	.	G	A	11408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-1.113;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.282;QD=19.47;ReadPosRankSum=-2.743;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,280:586:99:11437,0,12691
contig348	17508	.	T	G	11119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=-0.556;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.410;QD=19.04;ReadPosRankSum=-2.800;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,278:584:99:11148,0,12682
contig348	17514	.	T	C	10751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-0.487;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.278;QD=18.38;ReadPosRankSum=-3.085;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,280:585:99:10780,0,11985
contig348	17546	.	G	A	9808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.134;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.003;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,259:559:99:9837,0,11877
contig348	17547	.	TA	T	9976.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.361;ClippingRankSum=0.553;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.465;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,256:556:99:10014,0,12043
contig348	17568	.	A	T	9894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.431;ClippingRankSum=-2.715;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.589;QD=17.80;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,264:556:99:9923,0,11177
contig348	17604	.	A	G	9656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.949;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.556;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,295:568:99:9685,0,8740
contig348	17902	.	AT	A	8322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-1.344;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.379;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,232:494:99:8360,0,9828
contig348	17909	.	AT	A	8353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=-1.208;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.457;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,240:509:99:8391,0,9952
contig348	17993	.	C	T	8032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.007;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.438;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,215:439:99:8061,0,8588
contig348	18001	.	A	G	7922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.031;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.807;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,203:417:99:7951,0,8409
contig348	18157	.	TAA	T	8797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=-2.024;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.090;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,219:468:99:8835,0,9945
contig348	18168	.	CAGA	C	10063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.506;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.423;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.923;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,260:549:99:10101,0,11485
contig348	18182	.	A	G	10678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=1.071;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.413;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,269:555:99:10707,0,11472
contig348	18196	.	T	C	10450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=1.085;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.507;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,257:527:99:10479,0,11154
contig348	18217	.	G	A	10585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.101;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.541;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,266:558:99:10614,0,11784
contig348	18236	.	T	C	10749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-0.580;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.355;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,284:579:99:10778,0,11650
contig348	18458	.	G	T	11207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.786;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.981;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,356:656:99:11236,0,9480
contig348	18720	.	C	T	10758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=1.665;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.112;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,362:694:99:10787,0,10052
contig348	19202	.	A	C	10823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=1.221;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.610;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.379;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,282:529:99:10852,0,9456
contig348	19218	.	A	AATG	11407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.638;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.373;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,271:512:99:11445,0,9429
contig348	19222	.	G	A	11075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=-1.520;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.247;QD=21.26;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,279:521:99:11104,0,9370
contig348	19255	.	G	A	10562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.941;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.701;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,274:553:99:10591,0,10664
contig348	19265	.	C	A	11366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=1.052;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.545;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,281:559:99:11395,0,11314
contig348	19277	.	C	T	11336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-0.244;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=4.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.116;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.281;SOR=0.970	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,283:561:99:11365,0,11466
contig348	19279	.	G	A	11220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.280;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.070;QD=20.00;ReadPosRankSum=1.222;SOR=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,284:561:99:11249,0,11204
contig348	19283	.	A	G	10905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-1.426;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.281;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.836;SOR=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,280:561:99:10934,0,11014
contig348	19500	.	T	C	8657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.085;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.982;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,221:429:99:8686,0,8097
contig348	19509	.	C	T	9176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-1.805;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.171;QD=20.86;ReadPosRankSum=0.746;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,227:440:99:9205,0,8480
contig348	19522	.	A	T	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-0.328;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.539;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,238:456:99:9696,0,8662
contig348	19528	.	C	T	9783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.928;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.829;QD=21.50;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,240:455:99:9812,0,8417
contig348	19546	.	C	T	8837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=-0.886;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.816;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,229:421:99:8866,0,7319
contig348	19681	.	C	G	10480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.833;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.588;QD=20.55;ReadPosRankSum=2.970;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,266:510:99:10509,0,9764
contig348	19683	.	TCTATA	T	10432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.504;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.129;QD=19.65;ReadPosRankSum=2.952;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,268:531:99:10470,0,10274
contig348	19805	.	T	C	9880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;ClippingRankSum=-0.092;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.342;QD=18.23;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,257:542:99:9909,0,11296
contig348	19810	.	T	C	10193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.876;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.040;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.843;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,256:541:99:10222,0,11475
contig348	19812	.	A	G	10087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.412;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.020;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.330;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,264:551:99:10116,0,11310
contig348	20073	.	A	G	7947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=2.216;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=6.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.070;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.649;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,260:535:99:7976,0,8600
contig348	20194	.	G	T	8450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-0.403;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.556;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,267:483:99:8479,0,7920
contig348	20281	.	G	A	6537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.567;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.011;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,211:473:99:6566,0,8320
contig348	20389	.	G	A	8119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=-0.804;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.244;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.706;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,215:452:99:8148,0,9150
contig348	20395	.	C	G	8048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=-0.333;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.373;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.504;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,205:433:99:8077,0,9053
contig348	20585	.	A	G	7637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.405;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.085;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,251:548:99:7666,0,9214
contig348	20740	.	G	A	11800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.116;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.398;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,307:667:99:11829,0,18968
contig348	20746	.	A	G	11861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.378;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.828;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.489;SOR=0.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,305:674:99:11890,0,19116
contig348	20947	.	T	G	11852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=-1.917;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.866;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,304:570:99:11881,0,9961
contig348	20963	.	A	C	12185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=2.406;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.994;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,305:578:99:12214,0,10948
contig348	20965	.	A	T	12079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.844;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.420;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,303:578:99:12108,0,10856
contig348	20966	.	C	T	11914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.429;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.663;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,300:572:99:11943,0,10826
contig348	21082	.	A	G	8721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=1.170;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.062;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.454;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,282:570:99:8750,0,8978
contig348	21113	.	A	G	11196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.777;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.581;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,288:601:99:11225,0,12251
contig348	21114	.	A	C	11196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=1.060;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.420;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,293:604:99:11225,0,12251
contig348	21142	.	C	T	8861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.808;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.378;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,289:605:99:8890,0,9597
contig348	21615	.	T	C	8762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.016;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.122;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,289:546:99:8791,0,7925
contig348	21688	.	G	A	9637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.509;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.326;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,260:532:99:9666,0,10331
contig348	21704	.	A	G	9646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.031;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.193;QD=18.52;ReadPosRankSum=2.022;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,258:521:99:9675,0,9992
contig348	22036	.	C	T	8581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.255;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.873;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,292:573:99:8610,0,8468
contig348	22062	.	T	G	9372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.147;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.416;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.965;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,301:593:99:9401,0,8920
contig348	22304	.	C	T	11013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.875;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=7.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.398;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.390	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,279:546:99:11042,0,10284
contig348	22309	.	T	A	11445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.122;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=9.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.329;QD=20.77;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.327	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,287:551:99:11474,0,10407
contig348	22321	.	C	T	11155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.742;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.246;QD=21.29;ReadPosRankSum=-1.788;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,279:524:99:11184,0,9640
contig348	22327	.	A	G	10850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.093;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.981;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,272:508:99:10879,0,9210
contig348	22399	.	C	T	8104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-1.289;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.615;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,211:462:99:8133,0,9412
contig348	22412	.	T	C	8114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.086;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.567;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,218:461:99:8143,0,9323
contig348	23034	.	G	A	8588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-0.510;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.925;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.821;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,284:577:99:8617,0,9203
contig348	23049	.	G	A	10758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=-1.209;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.219;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,280:564:99:10787,0,10921
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contig348	24525	.	A	ATT	6528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.383;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=6.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.649;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.306;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,222:455:99:6566,0,7338
contig348	24861	.	A	C	8967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=-0.247;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.169;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,225:501:99:8996,0,10824
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contig348	24909	.	C	A	9632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.139;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.021;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.212;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,255:539:99:9661,0,10699
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contig348	25635	.	C	G	10706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.053;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.592;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.176;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,281:573:99:10735,0,11353
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contig348	26586	.	C	T	7007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.686;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.338;QD=14.82;ReadPosRankSum=2.125;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,223:473:99:7036,0,7818
contig348	26922	.	A	C	11838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=1.076;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.520;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,309:617:99:11867,0,12425
contig348	26930	.	G	A	11777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.715;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.701;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.949;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,302:616:99:11806,0,12259
contig348	27363	.	G	T	10148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=-0.569;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.340;QD=20.84;ReadPosRankSum=1.450;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,261:487:99:10177,0,8660
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contig348	27382	.	A	T	10239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=1.437;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.454;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,264:513:99:10268,0,9526
contig348	27548	.	A	C	8603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=-0.015;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.865;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,231:502:99:8632,0,10409
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contig348	27573	.	T	C	9702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.138;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.376;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,238:508:99:9731,0,11146
contig348	27586	.	A	G	9164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.233;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.814;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.516;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,234:482:99:9193,0,9794
contig348	27874	.	T	C	10065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=2.133;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.105;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.469	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,324:617:99:10094,0,9366
contig348	27902	.	G	A	12370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.162;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.476;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,326:667:99:12399,0,13139
contig348	27916	.	A	G	13165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.833;DP=751;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.006;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.216;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,349:725:99:13194,0,14215
contig348	27948	.	A	G	14863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=-1.188;DP=823;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.941;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:405,390:795:99:14892,0,15636
contig348	27964	.	A	G	16026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-2.100;DP=842;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.651;QD=19.71;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:413,400:813:99:16055,0,16630
contig348	27970	.	G	A	15531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.048;DP=859;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.082;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:431,400:831:99:15560,0,16848
contig348	28202	.	C	T	11217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.488;ClippingRankSum=-0.345;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=7.427;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.117;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,371:677:99:11246,0,11110
contig348	28211	.	GTGATGATGATGATGA	G	7104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=-1.248;DP=779;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-2.914;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:431,207:638:99:7142,0,16605
contig348	28314	.	T	A	9953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.619;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.259;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,326:686:99:9982,0,11183
contig348	28415	.	T	C	12499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=1.417;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.303;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.707;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,323:619:99:12528,0,11142
contig348	28430	.	T	C	12791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=1.253;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.051;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,331:627:99:12820,0,11174
contig348	29057	.	G	GT	12176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.920;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.942;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,311:615:99:12214,0,11942
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contig348	29228	.	T	G	10412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.083;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.066;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,267:530:99:10441,0,10217
contig348	29238	.	T	C	10702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.139;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.651;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,266:526:99:10731,0,10411
contig348	29247	.	G	A	10215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-1.048;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.906;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,264:530:99:10244,0,10129
contig348	29295	.	C	T	11006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=1.034;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.628;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,285:555:99:11035,0,10409
contig348	29315	.	T	C	11536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.252;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.203;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,311:602:99:11565,0,10784
contig348	29498	.	C	G	9522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.811;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.467;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,301:575:99:9551,0,8845
contig348	29935	.	A	C	11533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.464;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.625;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,300:579:99:11562,0,10455
contig348	29957	.	C	T	13234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=1.582;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.251;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,323:618:99:13263,0,11763
contig348	29972	.	CTTACT	C	12395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-1.259;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.018;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,312:611:99:12433,0,11910
contig348	31151	.	C	T	9150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.164;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.319;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,234:498:99:9179,0,10218
contig348	31159	.	C	T	9282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=1.069;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.751;QD=18.49;ReadPosRankSum=-2.160;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,249:502:99:9311,0,9984
contig348	31537	.	G	A	10104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-2.736;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.826;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,268:542:99:10133,0,10825
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contig348	31555	.	G	A	11071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.680;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.751;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,287:578:99:11100,0,11648
contig348	31777	.	T	C	8641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.293;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.156;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,285:566:99:8670,0,8820
contig348	31810	.	T	C	10623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-1.131;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.389;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,280:569:99:10652,0,10834
contig348	31826	.	T	A	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.022;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.863;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,267:549:99:10575,0,11290
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contig348	31855	.	G	A	10952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.373;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.717;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.510;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,284:566:99:10981,0,10723
contig348	31864	.	T	G	11117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.728;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.061;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,275:540:99:11146,0,10667
contig348	31868	.	TACAG	T	10673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.176;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.612;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,271:542:99:10711,0,10668
contig348	31926	.	A	T	10670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=1.199;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.390;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,289:564:99:10699,0,10306
contig348	31936	.	AG	A	10166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.082;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.573;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,277:554:99:10204,0,10281
contig348	32162	.	A	T	10657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.612;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.131;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,277:573:99:10686,0,11620
contig348	32164	.	A	G	10792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=2.482;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.757;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,273:564:99:10821,0,12069
contig348	32170	.	A	T	11030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.261;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.464;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.726;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,279:577:99:11059,0,12169
contig348	32177	.	T	G	10829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.823;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.142;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.530;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,277:582:99:10858,0,11804
contig348	32270	.	A	G	11623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.100;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.196;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,299:535:99:11652,0,9516
contig348	32278	.	A	G	11340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.602;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.193;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,283:510:99:11369,0,9347
contig348	32313	.	CTAAGAA	C	9402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-2.475;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.340;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.727;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,247:494:99:9440,0,11066
contig348	32354	.	C	T	9344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=-0.129;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.987;QD=19.23;ReadPosRankSum=-2.061;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,247:486:99:9373,0,9618
contig348	32368	.	A	G	9105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.878;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.700;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.887;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,237:472:99:9134,0,9572
contig348	32638	.	C	T	7775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.712;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.448;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,203:430:99:7804,0,8915
contig348	32640	.	T	C	7775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.132;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.702;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.677;SOR=1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,201:430:99:7804,0,8915
contig348	32670	.	T	TA	1891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-1.604;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=7.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.012;QD=5.45;ReadPosRankSum=-2.953;SOR=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,120:347:99:1929,0,7708
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contig348	36791	.	T	A	7689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.026;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.041;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.323;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,212:468:99:7718,0,9566
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contig348	37035	.	A	T	9759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.879;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.303;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,254:500:99:9788,0,9270
contig348	37051	.	G	A	9733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.241;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.179;QD=19.43;ReadPosRankSum=2.630;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,254:501:99:9762,0,9890
contig348	37075	.	C	A	10225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.820;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.424;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,266:502:99:10254,0,7462
contig348	37240	.	G	A	11138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=2.039;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.303;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,287:622:99:11167,0,13496
contig348	37242	.	C	T	11230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.019;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=6.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.233;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,289:630:99:11259,0,13704
contig348	37253	.	C	T	10949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.017;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.022;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.310;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,288:631:99:10978,0,13479
contig348	37317	.	G	T	10694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.671;DP=669;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.473;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.426;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,285:647:99:10723,0,14387
contig348	37327	.	T	C	10984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.444;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.027;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,282:646:99:11013,0,14094
contig348	37334	.	C	A	11318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.540;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.495;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.535;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,291:677:99:11347,0,15550
contig348	37351	.	C	A	11830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=1.879;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.655;QD=18.09;ReadPosRankSum=-2.403;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,300:654:99:11859,0,14314
contig348	37359	.	C	G	11182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-1.444;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.233;QD=17.86;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,285:626:99:11211,0,13450
contig348	37501	.	C	T	12893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.066;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,332:659:99:12922,0,12572
contig348	37507	.	A	G	12884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.450;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.183;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,329:654:99:12913,0,12646
contig348	37675	.	C	T	7879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-0.810;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.502;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,255:524:99:7908,0,8757
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contig348	37816	.	G	A	9715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.878;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.107;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,244:505:99:9744,0,10581
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contig348	38862	.	C	G	9450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.149;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.592;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,245:548:99:9479,0,12060
contig348	38898	.	A	G	11166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.337;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.192;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.766;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,297:569:99:11195,0,10082
contig348	38922	.	C	T	11935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=-1.299;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.044;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,299:571:99:11964,0,10940
contig348	38925	.	G	T	11942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.455;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.191;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,296:570:99:11971,0,11046
contig348	38938	.	T	C	11593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-0.310;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.061;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,283:569:99:11622,0,11532
contig348	38943	.	T	G	11344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.466;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.218;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.138;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,281:568:99:11373,0,11508
contig348	38947	.	T	C	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.340;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.620;QD=20.14;ReadPosRankSum=-2.121;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,285:567:99:11450,0,11325
contig348	38948	.	G	A	11343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=-0.411;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.824;QD=20.04;ReadPosRankSum=-1.989;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,283:566:99:11372,0,11247
contig348	38955	.	A	T	10537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-0.540;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.052;QD=19.70;ReadPosRankSum=-2.179;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,266:535:99:10566,0,10697
contig348	39038	.	A	AATC	9161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.690;ClippingRankSum=0.984;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.310;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,241:530:99:9199,0,11614
contig348	39043	.	C	T	8872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.837;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.538;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,230:526:99:8901,0,11570
contig348	39156	.	C	T	7719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=-0.090;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.788;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.828;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,209:461:99:7748,0,9974
contig348	39169	.	C	T	7853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.531;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.228;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,203:467:99:7882,0,10737
contig348	39174	.	G	A	7382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-1.427;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.966;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.345;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,193:455:99:7411,0,10587
contig348	39211	.	C	T	8808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-1.204;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.683;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,267:504:99:8837,0,7343
contig348	39242	.	G	C	9959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.478;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.259;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,259:529:99:9988,0,10499
contig348	39243	.	T	C	9959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-1.387;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.943;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,259:528:99:9988,0,10499
contig348	39333	.	A	G	10347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.198;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.739;QD=16.48;ReadPosRankSum=2.993;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,330:628:99:10376,0,8797
contig348	39885	.	G	A	9061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=-0.469;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.345;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,241:516:99:9090,0,18784
contig348	39893	.	A	T	9210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.688;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.240;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,232:522:99:9239,0,20565
contig348	39900	.	A	G	8687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.258;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.296;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,224:520:99:8716,0,20244
contig348	39938	.	C	A	8392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=-0.879;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.735;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,222:514:99:8421,0,15791
contig348	39949	.	C	T	8652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.077;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=2.058;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.689;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,235:521:99:8681,0,15506
contig348	39988	.	C	T	6728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.236;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.509;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.520;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,230:517:99:6757,0,8954
contig348	40026	.	C	T	8852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-0.154;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.223;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,239:514:99:8881,0,10392
contig348	40039	.	ATT	A	8820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=1.308;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.518;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,232:506:99:8858,0,10596
contig348	40110	.	T	G	9155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.436;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.125;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,246:512:99:9184,0,10102
contig348	40127	.	T	C	8843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.172;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.600;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,237:493:99:8872,0,9849
contig348	40786	.	T	C	9160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.625;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.450;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,242:502:99:9189,0,9859
contig348	40803	.	A	ACACAAG	9831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.849;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.650;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.345;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,241:497:99:9869,0,10180
contig348	40804	.	T	C	9763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.295;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.764;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,230:486:99:9792,0,10147
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contig348	40840	.	G	C	8392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=-0.727;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.829;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,218:460:99:8421,0,9677
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contig348	45212	.	A	G	9802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=1.420;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=13.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.579;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.007;SOR=1.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,249:546:99:9831,0,12621
contig348	45230	.	T	C	10375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.457;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=12.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.331;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,261:559:99:10404,0,12204
contig348	45248	.	C	T	10516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.361;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.967;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=1.160	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,266:571:99:10545,0,12570
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contig348	45275	.	A	G	10787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.319;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.150;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,264:555:99:10816,0,11678
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contig348	45656	.	C	T	10564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.661;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.236;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,271:549:99:10593,0,10872
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contig348	45678	.	T	C	9929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.853;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.734;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,260:540:99:9958,0,10627
contig348	45798	.	T	C	5225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=1.803;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.107;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,175:361:99:5254,0,5644
contig351	407	.	T	C	8153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.983;ClippingRankSum=0.884;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.443;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,214:429:99:8182,0,8286
contig351	412	.	G	A	8197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-2.149;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=3.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.899;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.809;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,212:425:99:8226,0,8227
contig351	3228	.	A	AT	3863.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=1.421;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.498;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,209:461:99:3901,0,5160
contig351	7344	.	TGAACGATTTCTGATCACCTG	T	5422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.783;ClippingRankSum=1.100;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=6.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-2.995;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,147:357:99:5460,0,8240
contig351	8292	.	T	C	10332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.260;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.818;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,267:500:99:10361,0,9007
contig351	8299	.	C	T	10411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.841;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.069;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,269:507:99:10440,0,9177
contig352	598	.	C	T	8617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.746;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.966;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,280:581:99:8646,0,9556
contig352	916	.	T	C	7754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-1.292;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.696;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,261:533:99:7783,0,8112
contig352	949	.	G	C	7615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.237;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.637;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,254:525:99:7644,0,8392
contig352	967	.	C	T	8667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.105;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.638;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.702;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,285:552:99:8696,0,8399
contig352	1214	.	A	G	7361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.270;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.605;QD=14.43;ReadPosRankSum=1.975;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,243:510:99:7390,0,8220
contig352	1225	.	C	T	7744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.643;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.028;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,249:527:99:7773,0,8826
contig352	1532	.	AG	A	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.185;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=8.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.805;QD=0.23;ReadPosRankSum=2.337;SOR=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:126,20:146:71:71,0,3012
contig352	1595	.	GTATT	G	6384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=3.244;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=8.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.075;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.538;SOR=1.263	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,172:468:99:6422,0,11701
contig352	1600	.	GTTAGTATTGTTAGT	G	6650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.664;ClippingRankSum=-0.351;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=8.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.891;QD=12.91;ReadPosRankSum=2.334;SOR=1.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,176:515:99:6688,0,13852
contig352	1642	.	A	T	8155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=-0.218;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=4.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.180;QD=14.72;ReadPosRankSum=-5.506;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,214:554:99:8184,0,14034
contig352	1663	.	T	C	9103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=1.736;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=9.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.086;QD=16.46;ReadPosRankSum=-7.504;SOR=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,233:553:99:9132,0,13047
contig352	1673	.	T	TTAGTATTTTAGTAAG	10379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.549;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=8.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.210;QD=18.70;ReadPosRankSum=-6.240;SOR=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,237:555:99:10417,0,12667
contig352	1715	.	ATT	A	10981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.253;ClippingRankSum=0.084;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.246;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.947;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,284:568:99:11019,0,11127
contig352	1718	.	AG	A	10980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=-0.924;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.515;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,288:576:99:11018,0,11127
contig352	1757	.	TGTATTAGTATTA	T	11501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.554;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=3.468;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.941;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,300:643:99:11539,0,13419
contig352	1771	.	CTGT	C	11614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-1.531;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.334;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,303:630:99:11652,0,13313
contig352	1795	.	A	T	11501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.674;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=4.608;QD=18.49;ReadPosRankSum=-2.010;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,304:622:99:11530,0,12842
contig352	1828	.	G	C	8888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=-0.173;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=2.055;QD=15.43;ReadPosRankSum=2.046;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,295:576:99:8917,0,10600
contig352	1947	.	C	T	11644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.224;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.102;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,303:577:99:11673,0,10388
contig352	1959	.	A	G	11217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.110;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.822;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,284:550:99:11246,0,10306
contig352	1987	.	G	A	8451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.409;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.025;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,274:556:99:8480,0,8628
contig352	2115	.	A	G	7557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.173;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.481;QD=14.82;ReadPosRankSum=2.453;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,251:510:99:7586,0,8000
contig352	2188	.	T	G	6742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-2.167;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.065;QD=14.98;ReadPosRankSum=4.180;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,194:450:99:6771,0,13866
contig352	2211	.	T	A	5417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.048;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=3.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.654;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,143:391:99:5446,0,14629
contig352	2223	.	ATT	A	4293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.673;DP=374;ExcessHet=3.0103;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.500;QD=12.27;ReadPosRankSum=-4.105;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,112:350:99:4331,0,13993
contig352	2234	.	A	AG	2959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.416;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.174;QD=9.11;ReadPosRankSum=-5.393;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,83:325:99:2997,0,13263
contig352	2481	.	GAAAAAACGAAAAGCGAAAAACCATAAAACCATAAAATCA	G	15000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.541;DP=904;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-2.853;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:436,377:813:99:15038,0,17347
contig352	2529	.	A	T	16151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;ClippingRankSum=2.319;DP=780;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=-3.636;QD=21.89;ReadPosRankSum=-4.953;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,394:738:99:16180,0,13623
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contig352	4034	.	AGCGTATGAAAAGAATAAATAAATGATTT	A	2068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.437;ClippingRankSum=1.184;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=18.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-2.658;QD=4.53;ReadPosRankSum=6.826;SOR=1.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,83:457:99:2106,0,15476
contig352	4089	.	C	T	8325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.763;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=5.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-5.665;QD=16.39;ReadPosRankSum=-2.532;SOR=1.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,227:508:99:8354,0,10658
contig352	4171	.	C	T	8348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;ClippingRankSum=1.014;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.282;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,294:610:99:8377,0,9921
contig352	4402	.	T	C	8563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-0.239;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.709;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,270:543:99:8592,0,8614
contig352	4468	.	T	C	8307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=1.178;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.307;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,273:547:99:8336,0,7893
contig352	4811	.	G	A	5597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.349;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.546;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,157:487:99:5635,0,13060
contig352	4813	.	T	G	4195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=1.168;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.787;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,154:475:99:4224,0,13108
contig352	5329	.	C	T	4785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.488;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=7.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-0.677;QD=10.66;ReadPosRankSum=-4.958;SOR=1.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,137:449:99:4814,0,12730
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contig352	5339	.	G	C	5738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.842;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=10.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=1.743;QD=12.11;ReadPosRankSum=-4.394;SOR=1.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,160:474:99:5767,0,12908
contig352	5392	.	T	G	10862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=1.108;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.419;QD=18.83;ReadPosRankSum=4.689;SOR=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,278:577:99:10891,0,11617
contig352	5399	.	A	G	11056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=-0.926;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=6.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.320;QD=18.77;ReadPosRankSum=3.784;SOR=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,291:589:99:11085,0,11583
contig352	5449	.	C	G	10029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.381;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.265;QD=18.61;ReadPosRankSum=-2.079;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,270:539:99:10058,0,10402
contig352	5450	.	T	TA	10020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;ClippingRankSum=0.510;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.344;QD=18.59;ReadPosRankSum=-1.889;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,269:539:99:10058,0,10402
contig352	5480	.	C	T	9166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-2.986;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.092;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,287:578:99:9195,0,8998
contig352	5507	.	C	T	8443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.756;ClippingRankSum=-1.322;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.629;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,288:559:99:8472,0,8410
contig352	5544	.	T	C	8023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-0.204;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.050;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,264:565:99:8052,0,8841
contig352	5680	.	A	C	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.361;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.043;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.350;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,273:568:99:10575,0,15643
contig352	5681	.	T	C	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-2.500;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.393;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,275:570:99:10575,0,15643
contig352	5819	.	A	G	6774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.365;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.586;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,220:501:99:6803,0,8682
contig352	5846	.	G	A	8407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=1.017;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.094;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,227:489:99:8436,0,14625
contig352	5858	.	A	C	8356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=-0.749;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.183;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,220:474:99:8385,0,14469
contig352	5996	.	T	C	8610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.181;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.271;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,227:480:99:8639,0,9876
contig352	6006	.	A	T	8733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.288;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.154;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,221:477:99:8762,0,10349
contig352	6011	.	T	C	8228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.803;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.197;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,204:453:99:8257,0,10016
contig352	6027	.	G	C	7974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.489;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.557;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.475;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,215:465:99:8003,0,9681
contig352	6117	.	G	C	8650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.509;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.144;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,234:499:99:8679,0,10065
contig352	6131	.	G	A	8446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.795;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.397;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,224:479:99:8475,0,9952
contig352	6389	.	C	T	10373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.408;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.012;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,275:580:99:10402,0,15252
contig352	6393	.	A	G	10260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.808;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.662;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,259:566:99:10289,0,15464
contig352	6401	.	G	A	9739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.660;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.751;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,254:553:99:9768,0,14791
contig352	6476	.	T	G	9327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.825;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.020;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.574;SOR=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,253:512:99:9356,0,9766
contig352	6500	.	C	T	10720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.010;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.198;QD=20.86;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,264:514:99:10749,0,10109
contig352	6521	.	G	A	10338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-1.019;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=4.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.665;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.565;SOR=0.431	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,263:510:99:10367,0,9869
contig352	6526	.	C	T	10052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-1.202;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.794;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.328;SOR=0.459	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,257:508:99:10081,0,9877
contig352	6558	.	G	A	9706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.069;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=9.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.882;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,248:475:99:9735,0,8859
contig352	6562	.	G	A	9917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.181;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=9.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.078;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,246:477:99:9946,0,9418
contig352	6565	.	G	A	9855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=1.423;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.457;QD=20.49;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=1.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,248:481:99:9884,0,9276
contig352	6566	.	G	T	9867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.502;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.765;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,248:479:99:9896,0,9108
contig352	6616	.	G	A	7353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.801;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.193;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,262:509:99:7382,0,7376
contig352	6642	.	G	A	10236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.043;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=4.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.393;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.826;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,263:537:99:10265,0,11256
contig352	6643	.	T	C	10404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.718;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.583;QD=19.78;ReadPosRankSum=2.603;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,260:526:99:10433,0,11244
contig352	6644	.	G	A	10503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.666;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.514;QD=20.24;ReadPosRankSum=2.226;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,259:519:99:10532,0,11613
contig352	6653	.	G	A	11164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.935;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=8.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.101;QD=20.45;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,279:546:99:11193,0,11471
contig352	6656	.	G	A	11020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-1.724;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=9.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.579;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,280:546:99:11049,0,11040
contig352	6728	.	T	C	8250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-0.074;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.307;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,284:569:99:8279,0,8575
contig352	6810	.	G	A	10224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.546;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.002;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,274:529:99:10253,0,9503
contig352	6829	.	C	T	10579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.634;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.185;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.310;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,281:532:99:10608,0,9427
contig352	7104	.	G	A	9524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.310;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.189;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,302:587:99:9553,0,8877
contig352	7349	.	CT	C	7321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.363;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.145;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,287:563:99:7359,0,6997
contig352	7747	.	A	G	12998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-0.913;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.641;QD=20.47;ReadPosRankSum=-0.712;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,334:635:99:13027,0,11741
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contig352	7775	.	G	C	13879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.239;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.389;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,361:689:99:13908,0,12619
contig352	7854	.	G	A	13169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.404;ClippingRankSum=1.227;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.325;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,352:730:99:13198,0,14483
contig352	7871	.	T	C	13345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.468;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.023;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:383,352:735:99:13374,0,14401
contig352	8169	.	A	T	13263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.591;DP=688;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.173;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,344:666:99:13292,0,12548
contig352	8173	.	C	T	13691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.351;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.930;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,334:649:99:13720,0,12670
contig352	8181	.	A	G	13211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=-0.565;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.247;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,325:644:99:13240,0,12847
contig352	8182	.	C	G	12926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.162;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.009;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,326:643:99:12955,0,12742
contig352	8201	.	C	T	12170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.458;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.019;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,324:662:99:12199,0,12628
contig352	8232	.	T	C	13125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.153;ClippingRankSum=-0.899;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.505;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,336:700:99:13154,0,14296
contig352	8234	.	C	T	13114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=1.050;DP=730;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.229;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,340:704:99:13143,0,14342
contig352	8413	.	G	A	10961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.193;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.011;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,276:597:99:10990,0,12792
contig352	8416	.	G	A	11533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.434;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.081;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,287:606:99:11562,0,12988
contig352	8424	.	G	A	11892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-0.194;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.772;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,297:623:99:11921,0,13321
contig352	8432	.	T	C	11418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=1.086;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.243;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.801;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,296:604:99:11447,0,12373
contig352	8510	.	T	C	11587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=1.248;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.008;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.560;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,300:613:99:11616,0,12035
contig352	8515	.	C	T	11523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.306;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.108;QD=19.14;ReadPosRankSum=3.722;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,299:602:99:11552,0,11846
contig352	8550	.	C	T	10539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.940;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.611;QD=18.17;ReadPosRankSum=-1.467;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,278:580:99:10568,0,12015
contig352	8558	.	A	G	10489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.028;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.047;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,270:583:99:10518,0,12670
contig352	8566	.	T	C	10316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.797;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.078;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,267:580:99:10345,0,12357
contig352	8606	.	A	C	9535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-0.389;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.209;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,255:562:99:9564,0,11949
contig352	8613	.	G	A	9588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.012;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.171;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,248:550:99:9617,0,11790
contig352	8688	.	C	T	8965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.595;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.056;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.599;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,292:611:99:8994,0,10046
contig352	8892	.	T	C	11900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.736;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.205;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,312:646:99:11929,0,16647
contig352	8893	.	C	T	11900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.890;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.913;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,311:645:99:11929,0,16647
contig352	8985	.	C	A	9658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=-0.228;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.971;QD=15.89;ReadPosRankSum=-2.695;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,318:608:99:9687,0,9011
contig352	9011	.	A	C	8680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.073;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.510;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,282:577:99:8709,0,9283
contig352	9024	.	A	T	11390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.936;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.471;QD=19.54;ReadPosRankSum=-2.043;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,295:583:99:11419,0,11106
contig352	9025	.	C	T	11390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=2.710;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.010;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.057;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,291:576:99:11419,0,11106
contig352	9142	.	A	G	9208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.044;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.373;QD=17.81;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,248:517:99:9237,0,10164
contig352	9166	.	A	G	10059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=-0.485;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.495;QD=18.39;ReadPosRankSum=-1.348;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,257:547:99:10088,0,11535
contig352	9177	.	A	G	10642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.318;ClippingRankSum=1.423;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.639;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,265:562:99:10671,0,11334
contig352	9197	.	C	T	9991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-0.774;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.158;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,265:592:99:10020,0,13384
contig352	9215	.	C	T	10018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.104;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.318;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,274:603:99:10047,0,12616
contig352	9400	.	A	G	10273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.380;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.225;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,332:638:99:10302,0,9702
contig352	9529	.	G	T	9692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.844;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.849;QD=19.27;ReadPosRankSum=2.807;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,255:503:99:9721,0,9381
contig352	9551	.	G	T	10557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.224;ClippingRankSum=0.225;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.214;QD=20.15;ReadPosRankSum=2.096;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,258:524:99:10586,0,10648
contig352	9570	.	A	C	10451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-0.623;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.592;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.136;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,258:521:99:10480,0,10570
contig352	9587	.	C	G	10601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.017;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.091;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.378;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,262:521:99:10630,0,10436
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contig352	9636	.	G	A	10046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.785;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.137;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.730;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,258:521:99:10075,0,10194
contig352	9667	.	A	G	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.297;ClippingRankSum=-1.025;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.614;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.130;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,234:485:99:8921,0,9601
contig352	9678	.	G	T	8819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.051;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.667;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.856;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,236:501:99:8848,0,10160
contig352	10730	.	G	A	9757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=-1.208;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.654;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.245;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,321:629:99:9786,0,9438
contig352	10851	.	GT	G	11831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.112;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.261;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.994;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,310:619:99:11869,0,11987
contig352	10853	.	T	C	11870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.093;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.224;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.971;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,311:621:99:11899,0,12084
contig352	10861	.	T	A	11749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-4.621;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.003;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.412;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,300:604:99:11778,0,11753
contig352	10889	.	C	T	9991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.025;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.223;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,320:610:99:10020,0,8746
contig352	10923	.	T	G	11452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-0.347;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.286;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,289:633:99:11481,0,13589
contig352	10924	.	G	A	11737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-2.059;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.462;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,292:633:99:11766,0,13694
contig352	10941	.	C	G	11517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;ClippingRankSum=-0.352;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.970;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.731;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,288:635:99:11546,0,14334
contig352	10946	.	A	G	9887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=-0.023;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.216;QD=16.48;ReadPosRankSum=3.229;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,263:600:99:9916,0,13921
contig352	10947	.	T	C	9952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=-0.605;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.853;QD=16.78;ReadPosRankSum=2.890;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,260:593:99:9981,0,13914
contig352	10949	.	C	T	10478.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.738;ClippingRankSum=-0.825;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.630;QD=17.61;ReadPosRankSum=2.259;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,266:595:99:10516,0,13867
contig352	10952	.	GATT	G	10550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.309;ClippingRankSum=-1.677;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.101;QD=17.24;ReadPosRankSum=2.549;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,268:612:99:10588,0,14071
contig352	10958	.	A	C	10669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.762;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.811;QD=17.81;ReadPosRankSum=2.138;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,265:599:99:10698,0,13554
contig352	10966	.	A	G	10542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.720;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.680;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,282:619:99:10571,0,13277
contig352	11248	.	T	G	8631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.102;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.971;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,294:636:99:8660,0,10504
contig352	11517	.	A	G	8227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.389;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.943;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,227:539:99:8256,0,12009
contig352	11540	.	T	C	8274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-0.260;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.478;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,231:553:99:8303,0,12099
contig352	11683	.	C	T	11607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.557;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.653;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,306:642:99:11636,0,16033
contig352	11689	.	T	C	11526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.344;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.419;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,299:633:99:11555,0,16003
contig352	12062	.	C	T	10603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-1.050;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.883;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,289:599:99:10632,0,19534
contig352	12080	.	T	C	10959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.359;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.807;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,298:598:99:10988,0,19381
contig352	12351	.	T	C	11198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=1.631;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.272;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.936;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,295:633:99:11227,0,14576
contig352	12364	.	G	A	11632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.641;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.086;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,302:623:99:11661,0,14008
contig352	12418	.	C	CT	4467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.933;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.816;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,213:449:99:4505,0,8665
contig352	12438	.	G	A	9798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-1.327;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-1.928;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,251:513:99:9827,0,10085
contig352	12444	.	G	A	9474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=2.759;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-1.947;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,237:505:99:9503,0,11240
contig352	12463	.	C	A	9146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=1.207;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=6.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-1.251;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,221:498:99:9175,0,11281
contig352	12465	.	G	A	8975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.259;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-1.262;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,226:496:99:9004,0,11335
contig352	12482	.	ACG	A	8036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.396;ClippingRankSum=1.525;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-3.100;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,205:479:99:8074,0,11494
contig352	12485	.	AAATCCAGAGTTACTCTCGTTATCCGTACACCAAAAG	A	7720.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.586;ClippingRankSum=-0.774;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-3.354;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,208:590:99:7758,0,15903
contig352	12526	.	CAGAT	C	8341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.248;ClippingRankSum=0.244;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-2.612;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,209:521:99:8379,0,13059
contig352	12544	.	G	A	9436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=-0.545;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-1.566;QD=17.71;ReadPosRankSum=-5.908;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,232:533:99:9465,0,12480
contig352	12547	.	C	A	9373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=-0.613;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-0.607;QD=17.79;ReadPosRankSum=-8.057;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,236:527:99:9402,0,12192
contig352	12550	.	A	T	9271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=-0.436;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-0.760;QD=17.66;ReadPosRankSum=-7.966;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,236:525:99:9300,0,11865
contig352	12567	.	A	T	8761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=1.289;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-3.724;QD=16.53;ReadPosRankSum=-4.286;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,225:530:99:8790,0,12570
contig352	12576	.	A	G	9202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.333;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=1.259;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,237:549:99:9231,0,12831
contig352	12588	.	A	AG	9798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.421;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=1.840;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.548;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,249:561:99:9836,0,12576
contig352	12595	.	G	T	9446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=1.126;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.037;QD=16.87;ReadPosRankSum=2.459;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,250:560:99:9475,0,12364
contig352	12699	.	T	A	8057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=-0.753;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.471;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,226:503:99:8086,0,10556
contig352	12720	.	G	A	8029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-1.121;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.264;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,220:501:99:8058,0,10703
contig352	12756	.	T	C	7129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.982;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.113;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.357;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,233:518:99:7158,0,8787
contig352	12783	.	TGG	T	10416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=-2.132;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.291;QD=21.79;ReadPosRankSum=-2.181;SOR=0.842	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,257:478:99:10454,0,8560
contig352	12786	.	A	ACT	10529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=-1.232;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.676;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,257:480:99:10567,0,8593
contig352	12798	.	C	T	10201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.417;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.155;QD=21.08;ReadPosRankSum=-2.227;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,257:484:99:10230,0,9214
contig352	13151	.	A	G	10504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-1.437;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.259;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,278:561:99:10533,0,10877
contig352	13164	.	T	C	10486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.336;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.909;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,262:541:99:10515,0,11457
contig352	13171	.	C	T	8073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=1.194;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.293;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,239:521:99:8102,0,11482
contig352	13174	.	A	G	9724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.353;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.199;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.001;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,248:526:99:9753,0,11295
contig352	13254	.	A	AG	6637.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=1.313;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.091;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,201:463:99:6675,0,8800
contig352	13382	.	G	T	9297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.302;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.080;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,246:517:99:9326,0,10502
contig352	13389	.	G	A	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=1.436;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.193;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,246:516:99:9462,0,10477
contig352	13663	.	A	AT	3565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.845;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.058;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,192:425:99:3603,0,4628
contig352	13690	.	CTT	C	8455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.829;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.153;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,220:484:99:8493,0,10403
contig352	13708	.	G	A	8591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.325;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.853;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.684;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,232:478:99:8620,0,9479
contig352	13777	.	G	C	7867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.546;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.284;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,259:528:99:7896,0,8317
contig352	15099	.	A	C	12201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.351;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.038;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,319:636:99:12230,0,12518
contig352	15104	.	T	C	12098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.418;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.531;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,312:629:99:12127,0,12421
contig352	15131	.	T	C	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.441;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.168;QD=15.19;ReadPosRankSum=2.480;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,308:618:99:9414,0,9551
contig352	15278	.	C	T	11186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.458;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.688;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,296:615:99:11215,0,12447
contig352	15287	.	A	G	11204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.253;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.078;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.006;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,282:594:99:11233,0,12495
contig352	15300	.	A	G	11306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=-1.320;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.200;QD=19.33;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,279:585:99:11335,0,12349
contig352	15302	.	A	T	10947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=1.494;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.516;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.640;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,276:578:99:10976,0,12084
contig352	15342	.	A	G	7658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.001;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.246;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,259:543:99:7687,0,10398
contig352	15569	.	G	C	10511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=-0.955;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.565;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,324:607:99:10540,0,8597
contig352	15587	.	C	T	10782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-0.171;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.329;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,329:624:99:10811,0,9231
contig352	15741	.	T	C	10054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-1.500;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.215;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,323:666:99:10083,0,11084
contig352	15768	.	A	G	12427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.389;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.150;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,333:685:99:12456,0,13243
contig352	15790	.	T	C	13431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.080;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.216;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.387;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,337:677:99:13460,0,13488
contig352	15792	.	C	T	13433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.873;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.334;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,337:675:99:13462,0,13565
contig352	15797	.	C	T	13110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=1.501;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.372;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,336:664:99:13139,0,12695
contig352	15839	.	T	C	13769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=-2.099;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.310;QD=21.28;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,348:647:99:13798,0,11695
contig352	15842	.	A	G	14101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.715;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.180;QD=21.73;ReadPosRankSum=1.595;SOR=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,350:649:99:14130,0,11877
contig352	15853	.	C	T	14352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.177;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=5.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.532;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.780;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,348:648:99:14381,0,12086
contig352	15855	.	A	G	14307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=1.208;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.824;QD=21.94;ReadPosRankSum=2.115;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,347:652:99:14336,0,12131
contig352	15863	.	ATTAC	A	14195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.075;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.461;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,363:678:99:14233,0,12528
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contig352	15965	.	T	A	8687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.607;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.020;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,217:457:99:8716,0,9938
contig352	15982	.	T	A	8939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.773;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.815;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.493;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,223:457:99:8968,0,9508
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contig352	15987	.	GTCC	G	9007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.549;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.257;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,228:459:99:9045,0,9409
contig352	16002	.	GT	G	8841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.695;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.460;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,228:439:99:8879,0,8225
contig352	16039	.	G	A	8541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.889;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.141;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,221:437:99:8570,0,8419
contig352	16043	.	A	C	8444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.150;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.931;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,218:434:99:8473,0,8491
contig352	16098	.	CA	C	9576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.965;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.832;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,245:500:99:9614,0,10098
contig352	16109	.	A	C	10646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.307;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.823;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,266:531:99:10675,0,10481
contig352	16115	.	A	G	10692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.122;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.691;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,275:535:99:10721,0,10147
contig352	16149	.	C	A	11413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=2.194;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.044;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,285:553:99:11442,0,10531
contig352	16150	.	T	C	11497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-0.494;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.608;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.884;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,285:553:99:11526,0,10525
contig352	16175	.	C	A	10929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.478;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.142;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,271:527:99:10958,0,10324
contig352	16177	.	C	A	10779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.162;ClippingRankSum=0.386;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.290;QD=20.49;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,272:526:99:10808,0,10084
contig352	16733	.	C	T	9244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=1.407;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.545;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,240:518:99:9273,0,13587
contig352	16741	.	C	T	9188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=1.991;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.902;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,238:515:99:9217,0,13463
contig352	16872	.	T	C	9216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.670;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.978;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.870;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,295:587:99:9245,0,9094
contig352	16909	.	C	T	11439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.396;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.350;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,310:621:99:11468,0,11694
contig352	16931	.	C	A	12277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.859;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.076;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,311:635:99:12306,0,12828
contig352	16932	.	A	G	12235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=-0.202;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.850;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,310:636:99:12264,0,12831
contig352	16980	.	A	G	10772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.047;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.167;QD=18.23;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,289:591:99:10801,0,11367
contig352	16998	.	T	C	10712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.150;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.402;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,286:596:99:10741,0,11639
contig352	17028	.	C	T	10101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.123;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.022;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,278:574:99:10130,0,10920
contig352	17048	.	G	A	9520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.698;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.554;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,258:550:99:9549,0,11057
contig352	17094	.	G	A	11202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.187;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.078;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,283:554:99:11231,0,10337
contig352	17106	.	C	T	12076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=1.044;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.801;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,303:568:99:12105,0,10357
contig352	17117	.	C	A	11509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=-0.895;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.053;QD=21.00;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,292:548:99:11538,0,10308
contig352	17139	.	C	T	9250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=2.260;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.466;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,250:550:99:9279,0,12340
contig352	17157	.	A	G	9906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.300;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.182;QD=16.91;ReadPosRankSum=-1.609;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,268:586:99:9935,0,11050
contig352	17496	.	T	C	10725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.135;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.379;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,331:639:99:10754,0,9825
contig352	17668	.	TA	T	9087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=1.112;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.523;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,237:527:99:9125,0,11495
contig352	17672	.	A	T	9168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.009;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.086;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,247:541:99:9197,0,11576
contig352	17881	.	T	A	8507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-1.294;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.183;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,237:481:99:8536,0,9278
contig352	17901	.	GTC	G	9359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.498;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.604;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,229:482:99:9397,0,10337
contig352	17906	.	C	CTT	9081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=2.305;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.038;QD=19.24;ReadPosRankSum=-1.471;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,231:472:99:9119,0,9816
contig352	17938	.	T	C	9201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.646;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.747;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.774;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,236:477:99:9230,0,9339
contig352	17947	.	A	C	9487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=-1.181;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.077;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,236:485:99:9516,0,10315
contig352	17964	.	A	G	10325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.600;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.194;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,253:527:99:10354,0,11152
contig352	17969	.	G	C	10333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.803;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.395;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,271:551:99:10362,0,11085
contig352	18083	.	C	CTAATTA	10023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.747;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-1.176;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,260:534:99:10061,0,10533
contig352	18100	.	CTCGCTTGAACTA	C	6523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.359;ClippingRankSum=0.233;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-2.944;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,180:448:99:6561,0,10607
contig352	18142	.	A	G	8940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.140;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=0.397;QD=16.20;ReadPosRankSum=-5.690;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,248:552:99:8969,0,11438
contig352	18165	.	C	T	10170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.271;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=1.550;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,257:567:99:10199,0,13107
contig352	18172	.	C	T	9470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.039;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=1.368;QD=16.91;ReadPosRankSum=3.599;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,240:560:99:9499,0,13225
contig352	18175	.	T	G	9290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-2.184;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.218;QD=16.71;ReadPosRankSum=3.142;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,239:556:99:9319,0,12712
contig352	18217	.	A	G	11024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-0.818;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.128;QD=19.01;ReadPosRankSum=2.149;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,290:580:99:11053,0,11402
contig352	18225	.	C	T	11105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=-1.036;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.220;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.988;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,288:583:99:11134,0,11470
contig352	18508	.	G	A	9880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.081;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=4.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.683;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,260:598:99:9909,0,13563
contig352	18517	.	C	T	10041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.854;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.967;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.975;SOR=0.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,270:624:99:10070,0,13828
contig352	18671	.	A	G	11477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.480;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.966;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,301:664:99:11506,0,14268
contig352	18679	.	A	C	11104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=1.102;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.986;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,296:649:99:11133,0,14166
contig352	18895	.	C	T	8816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.186;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.454;QD=14.53;ReadPosRankSum=2.339;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,288:607:99:8845,0,9822
contig352	19114	.	G	A	10793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=1.575;DP=731;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.232;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,354:712:99:10822,0,10736
contig352	19150	.	T	C	13012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=-0.079;DP=719;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.089;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,349:696:99:13041,0,12788
contig352	19165	.	T	C	13198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=2.953;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.273;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,345:690:99:13227,0,12905
contig352	19255	.	T	G	10339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.826;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.829;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,280:587:99:10368,0,11726
contig352	19264	.	A	G	9852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.305;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.026;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,260:551:99:9881,0,11447
contig352	19341	.	T	C	8935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-2.150;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.704;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.982;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,245:471:99:8964,0,8295
contig352	19369	.	T	A	7907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.651;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.088;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,208:390:99:7936,0,7137
contig352	19409	.	T	TAC	5458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.533;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-2.060;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:107,138:245:99:5496,0,4104
contig352	19411	.	ATTTTT	A	4946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.264;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=20.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-0.261;QD=18.53;ReadPosRankSum=3.087;SOR=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,134:267:99:4984,0,4963
contig352	19530	.	G	A	7175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=1.037;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=7.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.027;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.443	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,183:335:99:7204,0,6208
contig352	19533	.	A	T	7220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=-0.235;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=5.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.142;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,176:338:99:7249,0,6331
contig352	19545	.	G	A	7237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.513;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=0.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.706;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,183:345:99:7266,0,6398
contig352	19627	.	C	A	10754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-0.458;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.319;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,286:541:99:10783,0,9709
contig352	19637	.	C	T	11363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.911;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.765;QD=20.93;ReadPosRankSum=1.785;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,285:543:99:11392,0,7761
contig352	19644	.	G	A	10349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-2.249;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.560;QD=19.53;ReadPosRankSum=1.395;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,274:530:99:10378,0,9961
contig353	204	.	G	A	4249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-1.324;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=152.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.32;MQRankSum=-6.659;QD=23.48;ReadPosRankSum=4.896;SOR=2.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,114:181:99:4278,0,2512
contig353	222	.	T	C	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.311;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=131.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.30;MQRankSum=-8.527;QD=19.97;ReadPosRankSum=3.917;SOR=2.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,95:188:99:3783,0,3694
contig353	243	.	T	C	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-0.697;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=82.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.34;MQRankSum=-9.265;QD=14.25;ReadPosRankSum=-2.970;SOR=2.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:115,67:182:99:2621,0,4964
contig353	252	.	T	C	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-0.901;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=71.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQRankSum=-8.857;QD=9.71;ReadPosRankSum=-3.643;SOR=2.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,51:186:99:1835,0,5269
contig353	313	.	C	A	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-1.243;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=12.339;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQRankSum=3.684;QD=28.72;ReadPosRankSum=2.391;SOR=0.084	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,136:141:99:5808,199,0
contig353	314	.	T	C	5779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=1.849;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=12.305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQRankSum=3.682;QD=31.83;ReadPosRankSum=2.279;SOR=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,134:139:99:5808,199,0
contig353	462	.	C	T	1151.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.147;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.89;MQRankSum=2.622;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=4.235	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,32:35:16:1180,16,0
contig353	1155	.	G	A	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=18.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
contig353	1895	.	A	C	13193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;QD=28.32;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,363:363:99:13222,1090,0
contig353	2932	.	C	T	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.15;QD=32.13;SOR=7.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1744,129,0
contig353	3012	.	T	C	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.58;QD=27.74;SOR=9.044	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,91:91:99:4237,289,0
contig353	3014	.	C	T	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.45;QD=29.60;SOR=6.890	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:4237,289,0
contig353	3379	.	G	A	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.19;QD=28.14;SOR=1.710	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:5384,435,0
contig353	3772	.	T	C	6941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.357;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=80.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.01;MQRankSum=10.357;QD=24.70;ReadPosRankSum=5.763;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,219:281:99:6970,0,1233
contig353	4043	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.383;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=18.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.72;MQRankSum=0.191;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:56:56,0,997
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contig353	4315	.	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.59;QD=28.77;SOR=5.421	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:566,42,0
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contig353	4880	.	C	T	11116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.80;QD=26.08;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,238:238:99:11145,752,0
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contig353	4994	.	T	C	9640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.62;QD=27.66;SOR=0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,264:264:99:9669,792,0
contig353	5197	.	T	C	10069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.54;QD=29.20;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,277:277:99:10098,832,0
contig353	6033	.	C	A	10669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.179;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=2.692;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,272:552:99:10698,0,10791
contig353	6039	.	A	G	10921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.234;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.415;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,283:574:99:10950,0,11066
contig353	6073	.	C	T	9701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.289;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.395;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.001;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,291:585:99:9730,0,9593
contig353	6161	.	G	A	10943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=-0.831;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.772;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,290:624:99:10972,0,13175
contig353	6172	.	A	G	10611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.221;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.446;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.250;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,272:595:99:10640,0,13711
contig353	6176	.	TA	T	10504.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.228;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.548;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,275:595:99:10542,0,13469
contig353	6212	.	AT	A	3758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=-0.807;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.499;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,165:415:99:3796,0,6168
contig353	6228	.	A	ATTTT	3286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.948;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.259;QD=10.92;ReadPosRankSum=-3.144;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,121:301:99:3324,0,6512
contig353	6316	.	G	C	5333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=0.438;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.715;QD=11.60;ReadPosRankSum=4.016;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,198:460:99:5362,0,8065
contig353	6351	.	A	G	6983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.167;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.273;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,190:435:99:7012,0,9093
contig353	6371	.	A	G	7679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.163;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.654;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,197:436:99:7708,0,9583
contig353	6372	.	T	C	7622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=-0.385;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.538;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.363;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,196:434:99:7651,0,9494
contig353	6412	.	T	C	7000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.337;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.145;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.222;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,229:449:99:7029,0,6437
contig353	6442	.	G	A	6926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=1.515;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.260;QD=15.12;ReadPosRankSum=2.197;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,234:458:99:6955,0,7136
contig353	6696	.	T	G	10282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.451;DP=715;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.771;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,336:696:99:10311,0,13631
contig353	6731	.	A	G	11035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=1.652;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.131;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,345:681:99:11064,0,10287
contig353	7293	.	T	C	9208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=1.568;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.177;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,301:606:99:9237,0,8580
contig353	7319	.	G	A	12205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.760;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.602;QD=19.47;ReadPosRankSum=-2.058;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,317:627:99:12234,0,11573
contig353	7328	.	GA	G	12332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.959;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.687;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,309:638:99:12370,0,12954
contig353	7330	.	TGGAA	T	11981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.369;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.391;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,312:650:99:12019,0,13317
contig353	7392	.	A	ATTGGTGG	11395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-1.251;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.190;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.564;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,283:606:99:11433,0,12666
contig353	7396	.	A	G	10865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=2.050;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.414;QD=17.73;ReadPosRankSum=-2.483;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,281:613:99:10894,0,12846
contig353	7424	.	C	G	10348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.347;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.172;QD=16.53;ReadPosRankSum=2.843;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,335:626:99:10377,0,8801
contig353	7973	.	A	G	4039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=-0.912;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.244;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.599;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,123:428:99:4068,0,12573
contig353	7980	.	A	G	3845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.507;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.907;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,106:420:99:3874,0,13058
contig353	7981	.	G	A	3744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.701;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.092;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,105:420:99:3773,0,13154
contig353	8016	.	G	T	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.248;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.635;QD=7.23;ReadPosRankSum=-2.125;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,96:424:99:3092,0,13807
contig353	8025	.	G	A	3794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.569;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.090;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,123:431:99:3823,0,12896
contig353	8104	.	A	T	10814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.094;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.244;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,282:544:99:10843,0,9587
contig353	8128	.	G	A	12068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.120;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.227;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,295:568:99:12097,0,10842
contig353	8133	.	C	T	11962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.869;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.092;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,298:576:99:11991,0,11046
contig353	8135	.	CACTT	C	11924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.760;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.245;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,300:591:99:11962,0,11585
contig353	8157	.	C	A	10902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=2.771;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.962;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,291:593:99:10931,0,11388
contig353	8233	.	A	G	8374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-2.203;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.727;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,272:531:99:8403,0,8214
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contig353	9028	.	C	CCCTGCGCCA	6047.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=1.585;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=5.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-3.070;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,142:307:99:6085,0,6382
contig353	9054	.	C	T	7742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=-0.342;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=2.757;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.367;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,202:377:99:7771,0,6682
contig353	9055	.	G	A	7742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.478;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=3.168;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.719;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:177,201:378:99:7771,0,6682
contig353	9188	.	G	A	4160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.893;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=0.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.606;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,140:292:99:4189,0,4706
contig353	9219	.	CAT	C	5245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.152;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.286;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,132:289:99:5283,0,6190
contig353	9222	.	G	GCT	5323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=1.575;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=1.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.422;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:152,134:286:99:5361,0,6268
contig353	9229	.	A	G	5319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.872;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.239;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.391;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,134:283:99:5348,0,6013
contig353	9232	.	A	C	5322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-1.075;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.695;QD=18.68;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,139:285:99:5351,0,5923
contig353	9259	.	T	C	5209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.552;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=5.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.035;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:134,134:268:99:5238,0,5285
contig353	9268	.	G	A	5800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.947;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=7.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.654;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.863;SOR=1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,146:285:99:5829,0,5474
contig353	9280	.	C	T	6133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.344;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=7.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.482;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.916;SOR=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,150:283:99:6162,0,5532
contig353	9286	.	A	C	6229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-1.146;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=8.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-3.110;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.524;SOR=1.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:145,156:301:99:6258,0,5908
contig353	9300	.	A	G	6910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=-0.119;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.723;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,169:322:99:6939,0,6246
contig353	9313	.	A	G	6583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=1.462;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.534;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,171:337:99:6612,0,6237
contig353	9617	.	TCG	T	6561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.559;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=6.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.124;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.128;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,171:360:99:6599,0,7529
contig353	9623	.	A	AAG	6670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.104;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=5.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.334;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.947	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,174:368:99:6708,0,7651
contig353	9730	.	T	C	6671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.356;ClippingRankSum=0.807;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=11.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.130;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,172:366:99:6700,0,7395
contig353	9739	.	T	C	7164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=1.611;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=8.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.333;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,178:372:99:7193,0,7921
contig353	9741	.	A	G	7216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.576;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=7.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.597;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,176:371:99:7245,0,7931
contig353	9760	.	T	C	6747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.212;ClippingRankSum=0.118;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.648;QD=18.59;ReadPosRankSum=1.991;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,178:363:99:6776,0,7239
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contig353	9916	.	A	G	5924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.675;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.222;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.330;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,199:414:99:5953,0,6644
contig353	9950	.	A	G	5320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=1.236;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=9.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.579;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.462;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,176:373:99:5349,0,5902
contig353	10093	.	T	C	5176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.447;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.503;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,173:339:99:5205,0,4488
contig353	10405	.	T	C	8524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-0.432;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.790;QD=19.64;ReadPosRankSum=2.551;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,218:434:99:8553,0,10197
contig353	10408	.	A	G	8576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-1.398;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.790;QD=19.63;ReadPosRankSum=2.810;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,219:437:99:8605,0,10193
contig353	10636	.	G	A	9416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.286;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.042;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,282:536:99:9445,0,8027
contig353	10698	.	G	A	9908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.245;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.118;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.531;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,259:517:99:9937,0,9994
contig353	10706	.	C	T	10240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.358;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.839;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,265:518:99:10269,0,9822
contig353	11053	.	C	T	11600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.428;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.384;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,297:590:99:11629,0,11121
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contig353	11073	.	A	G	11923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.402;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.030;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,289:574:99:11952,0,11660
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contig353	11204	.	G	A	6839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-2.308;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.692;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,215:433:99:6868,0,6854
contig353	11234	.	AGGGTGCAAG	A	8078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=1.394;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.688;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,209:449:99:8116,0,9521
contig353	11247	.	T	A	8731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-1.141;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.495;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,211:427:99:8760,0,8717
contig353	11248	.	T	TAAA	8522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.672;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.185;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,212:425:99:8560,0,8748
contig353	11253	.	T	A	8370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.542;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=5.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.249;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,212:426:99:8399,0,8714
contig353	11265	.	CT	C	8356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-0.340;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.794;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,203:419:99:8394,0,8777
contig353	11276	.	A	G	7646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.223;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.668;QD=18.93;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,197:404:99:7675,0,7999
contig353	11314	.	C	T	8337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.526;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.502;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,217:431:99:8366,0,8260
contig353	11318	.	A	G	8395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.237;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.621;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,218:435:99:8424,0,8335
contig353	12019	.	G	A	7741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.502;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.065;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.353	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,245:452:99:7770,0,6484
contig353	12179	.	G	C	9693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.595;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.567;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,256:486:99:9722,0,10474
contig353	12188	.	G	A	9991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.075;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.803;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,262:503:99:10020,0,10650
contig353	12418	.	A	C	7438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-1.431;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.236;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,196:409:99:7467,0,7979
contig353	12437	.	A	G	8367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.421;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.009;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,208:422:99:8396,0,8632
contig353	12439	.	G	A	8490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.833;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=2.684;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,208:420:99:8519,0,8768
contig353	12445	.	C	G	8100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.531;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.173;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,205:415:99:8129,0,8399
contig353	12460	.	T	C	7991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.275;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.201;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.433;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,198:423:99:8020,0,9325
contig353	12462	.	A	G	7923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.407;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.039;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,205:435:99:7952,0,9122
contig353	12473	.	C	T	7608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.799;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.209;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,197:419:99:7637,0,8722
contig353	12866	.	A	G	5175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.766;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=6.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.286;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,176:370:99:5204,0,6074
contig353	13027	.	C	T	6454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.075;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.434;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:161,176:337:99:6483,0,5918
contig353	13049	.	G	A	6768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.763;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.714;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.264;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,171:329:99:6797,0,6320
contig353	13066	.	A	G	6586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.329;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.303;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,173:331:99:6615,0,6023
contig353	13173	.	C	T	3973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=2.338;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.202;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,111:250:99:4002,0,5550
contig353	13192	.	A	G	4404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.908;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.530;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,112:258:99:4433,0,7063
contig353	13209	.	C	G	5305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.655;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=4.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.890;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.949;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:135,132:267:99:5334,0,6696
contig353	13212	.	G	C	5254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.058;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.247;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.828;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:136,134:270:99:5283,0,6824
contig353	13225	.	C	T	5952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.343;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=5.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.559;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.871;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,149:290:99:5981,0,6843
contig353	13247	.	T	C	6157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.014;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.662;QD=20.19;ReadPosRankSum=2.004;SOR=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,162:305:99:6186,0,6433
contig353	13445	.	C	T	5056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.584;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=0.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.151;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,166:377:99:5085,0,6627
contig353	13460	.	C	G	4982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.598;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.553;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,161:376:99:5011,0,6863
contig353	13495	.	T	C	4719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.621;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.408;QD=13.60;ReadPosRankSum=2.269;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,156:347:99:4748,0,5695
contig353	13507	.	T	C	5913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-0.156;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=9.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.121;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,155:323:99:5942,0,6406
contig353	13516	.	G	A	5963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.338;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=3.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.363;QD=18.64;ReadPosRankSum=2.548;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,152:320:99:5992,0,6692
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contig353	14368	.	C	CAA	7394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=-1.418;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.159;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,219:492:99:7432,0,9282
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contig353	14455	.	A	T	8464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.651;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.479;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.727;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,264:569:99:8493,0,10798
contig353	14506	.	G	C	10522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.167;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.525;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,264:581:99:10551,0,12804
contig353	14509	.	C	G	10249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-1.481;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.739;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,267:587:99:10278,0,12679
contig353	14687	.	A	G	8247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.768;ClippingRankSum=0.162;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.457;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,216:454:99:8276,0,6537
contig353	14697	.	G	A	6849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.648;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.850;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,215:447:99:6878,0,11350
contig353	15360	.	T	C	8504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=1.201;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=2.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.431;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,218:404:99:8533,0,6944
contig353	15376	.	GA	G	6149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=1.320;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=6.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.001;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.610;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,209:413:99:6187,0,8130
contig353	15386	.	T	G	6528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=-0.351;DP=460;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.035;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,224:433:99:6557,0,8423
contig353	15403	.	T	C	9070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.462;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.523;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,238:453:99:9099,0,7855
contig353	15464	.	T	G	8503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-0.229;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.101;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,226:454:99:8532,0,8541
contig353	15481	.	G	A	8405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.548;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.544;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,225:437:99:8434,0,8140
contig353	15520	.	C	T	5730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=1.451;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.341;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,186:422:99:5759,0,7169
contig353	15549	.	A	G	5136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.032;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.410;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,182:412:99:5165,0,6800
contig353	15609	.	GA	G	4667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.908;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.582;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.053;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,195:406:99:4705,0,5195
contig353	15843	.	A	G	8271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.399;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=4.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.179;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.532;SOR=0.989	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,262:531:99:8300,0,8469
contig353	15934	.	TCCCCCCC	T	10506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=0.911;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.076;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,264:565:99:10544,0,11625
contig353	15942	.	C	T	10604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-2.152;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.134;QD=19.07;ReadPosRankSum=3.884;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,270:556:99:10633,0,11787
contig353	15949	.	C	T	11089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.277;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.496;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.708;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,290:573:99:11118,0,10926
contig353	16034	.	C	T	12140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=1.118;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.033;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,332:658:99:12169,0,12340
contig353	16059	.	T	C	12486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.418;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.257;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,312:626:99:12515,0,12495
contig353	16079	.	AT	A	12081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.189;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.398;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,306:622:99:12119,0,12718
contig353	16087	.	T	C	11488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.769;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.102;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.489;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,301:625:99:11517,0,12509
contig353	16127	.	G	A	9640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=1.212;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.865;QD=15.65;ReadPosRankSum=-2.076;SOR=0.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,304:616:99:9669,0,9482
contig353	16162	.	A	T	11980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.702;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.637;QD=18.40;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,307:651:99:12009,0,13462
contig353	16172	.	T	C	12759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=-0.120;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.965;QD=19.16;ReadPosRankSum=-3.729;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,320:666:99:12788,0,13771
contig353	16179	.	T	C	11934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.943;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.281;QD=18.42;ReadPosRankSum=-3.765;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,309:648:99:11963,0,13355
contig353	16304	.	G	A	12646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.813;ClippingRankSum=1.256;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.589;QD=19.40;ReadPosRankSum=-3.003;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,339:652:99:12675,0,11742
contig353	16315	.	T	TTCTCCTC	12985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=-0.425;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.892;QD=20.58;ReadPosRankSum=-4.171;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,323:631:99:13023,0,11862
contig353	16351	.	G	A	8487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=-1.828;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=6.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.166;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,290:579:99:8516,0,8831
contig353	16541	.	G	A	9960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.217;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.856;QD=19.76;ReadPosRankSum=3.175;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,249:504:99:9989,0,25777
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contig353	16688	.	C	T	10813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=1.930;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.656;QD=19.63;ReadPosRankSum=-4.882;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,269:551:99:10842,0,11337
contig353	16708	.	T	C	9887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.538;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.278;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,252:530:99:9916,0,11110
contig353	16714	.	C	T	9449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=-0.118;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.655;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,244:512:99:9478,0,10686
contig353	17046	.	G	C	12571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.103;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.500;QD=20.02;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,328:628:99:12600,0,14479
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contig353	17316	.	T	C	11090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.163;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.882;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,299:623:99:11119,0,11953
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contig353	17341	.	T	A	11632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-1.680;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.143;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,287:606:99:11661,0,13288
contig353	17347	.	T	C	11651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.327;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.433;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,294:611:99:11680,0,12812
contig353	17363	.	T	C	10854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.507;ClippingRankSum=0.590;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.633;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,285:585:99:10883,0,11789
contig353	17507	.	G	A	10403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=2.687;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,281:555:99:10432,0,11300
contig353	17524	.	A	G	10007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=1.442;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.411;QD=18.74;ReadPosRankSum=-2.018;SOR=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,266:534:99:10036,0,10464
contig353	17623	.	C	T	4090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.240;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.719;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,198:438:99:4119,0,7742
contig353	17830	.	C	T	10366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.267;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.571;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.865;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,274:544:99:10395,0,9810
contig353	17850	.	T	C	10154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=1.611;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.875;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,269:516:99:10183,0,9310
contig353	17903	.	GTCA	G	8776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.053;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.159;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,229:508:99:8814,0,11058
contig353	17913	.	G	GA	9964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.974;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.846;QD=19.50;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,244:511:99:10002,0,10891
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contig353	18001	.	C	T	9863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.329;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.815;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,267:516:99:9892,0,9206
contig353	18027	.	G	GA	3664.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=-0.483;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=4.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.503;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,184:424:99:3702,0,5203
contig353	18176	.	C	A	8286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.193;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.143;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,219:458:99:8315,0,9447
contig353	18188	.	T	C	8301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.040;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=5.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.074;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,220:467:99:8330,0,9558
contig353	18225	.	G	C	8664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=-1.031;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.290;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,269:480:99:8693,0,6451
contig353	18321	.	C	T	11512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.617;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.722;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,301:588:99:11541,0,11317
contig353	18337	.	A	G	12592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.573;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.072;QD=20.12;ReadPosRankSum=2.101;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,317:626:99:12621,0,12408
contig353	18347	.	T	C	12261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.525;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.348;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.578;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,317:610:99:12290,0,11157
contig353	18381	.	A	G	8577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=-0.667;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.474;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,281:593:99:8606,0,9436
contig353	18537	.	C	T	9388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=1.799;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.003;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,317:596:99:9417,0,8647
contig353	18650	.	A	G	13211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=-0.644;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.776;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:396,358:754:99:13240,0,17517
contig353	18665	.	C	T	13309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.307;DP=786;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.534;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:399,355:754:99:13338,0,17745
contig353	18937	.	T	C	10469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.085;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.021;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,269:529:99:10498,0,10067
contig353	18939	.	T	C	10469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.989;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.415;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,267:525:99:10498,0,10067
contig353	19757	.	C	T	9321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-1.709;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=7.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.945;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,257:562:99:9350,0,12717
contig353	19772	.	A	G	8673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.251;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.568;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,230:531:99:8702,0,11711
contig353	19998	.	T	C	11697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.833;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=6.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.178;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,302:593:99:11726,0,11363
contig353	20001	.	T	C	11660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=-0.329;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.919;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,302:594:99:11689,0,11326
contig353	20101	.	C	T	9131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=-1.117;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.623;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.244;SOR=0.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,309:621:99:9160,0,9756
contig353	20141	.	T	C	9364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-2.507;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.749;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,312:628:99:9393,0,9395
contig353	20285	.	C	T	9452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.107;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.907;QD=15.47;ReadPosRankSum=-2.144;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,315:611:99:9481,0,8827
contig353	20303	.	C	A	10426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=1.528;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.040;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,294:598:99:10455,0,11678
contig353	20312	.	T	C	11162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.894;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.328;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,293:599:99:11191,0,9658
contig353	20721	.	T	G	10074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.710;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=6.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.090;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,264:601:99:10103,0,14743
contig353	20723	.	C	T	10074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=-1.067;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=4.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.068;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,262:589:99:10103,0,14743
contig353	20990	.	C	T	9819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.730;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.010;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,259:509:99:9848,0,10860
contig353	20992	.	A	G	9819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.944;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.330;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.570;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,246:492:99:9848,0,10860
contig353	21143	.	G	C	8370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.921;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.436;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,264:522:99:8399,0,8083
contig353	21178	.	C	T	9200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.780;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.136;QD=19.92;ReadPosRankSum=-1.167;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,238:462:99:9229,0,8585
contig353	21187	.	A	G	9390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-2.513;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.003;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,250:485:99:9419,0,8725
contig353	21220	.	A	AC	7783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.054;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.140;QD=15.66;ReadPosRankSum=-2.016;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,253:497:99:7821,0,7526
contig353	21463	.	T	A	9350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=1.355;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.671;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,253:521:99:9379,0,10148
contig353	21479	.	A	G	8928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=1.397;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.652;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,241:503:99:8957,0,9781
contig353	21888	.	G	A	8763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.805;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=6.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.429;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.934;SOR=1.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,282:558:99:8792,0,8327
contig353	22009	.	C	A	7868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.760;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.549;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.924	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,267:570:99:7897,0,9200
contig353	22025	.	T	C	8265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.375;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.472;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.289;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,275:582:99:8294,0,9378
contig353	22475	.	G	T	10157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.906;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.582;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,261:497:99:10186,0,9385
contig353	22479	.	G	C	10248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-2.011;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.049;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,258:491:99:10277,0,9371
contig353	22501	.	G	A	10114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.353;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.082;QD=19.53;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,272:518:99:10143,0,9096
contig353	22656	.	CT	C	5646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.588;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.467;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,201:454:99:5684,0,7583
contig353	22711	.	T	G	10112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.075;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.452;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,256:491:99:10141,0,8884
contig353	22728	.	T	C	10315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=-0.295;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.295;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,270:523:99:10344,0,9613
contig353	22857	.	G	T	9488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.157;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.317;QD=16.47;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,304:576:99:9517,0,9873
contig353	22897	.	A	T	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.047;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.439;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,275:527:99:8783,0,8019
contig353	22929	.	G	A	10309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-1.832;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.107;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,271:526:99:10338,0,9680
contig353	22944	.	CTTTT	C	10065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.534;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.480;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,252:527:99:10103,0,11346
contig353	22970	.	A	G	9294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=-2.041;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=6.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.085;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,257:561:99:9323,0,11433
contig353	23020	.	A	T	10158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.167;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.078;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,270:590:99:10187,0,12377
contig353	23036	.	A	G	9665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=-1.225;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.711;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,256:572:99:9694,0,12301
contig353	23264	.	A	G	8890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=-1.871;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.150;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,231:490:99:8919,0,10157
contig353	23268	.	T	C	8789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=-0.607;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.308;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,226:483:99:8818,0,10218
contig353	23520	.	T	C	6249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-0.062;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=8.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.030;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.151;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,214:485:99:6278,0,10475
contig353	23613	.	TA	T	2683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.508;ClippingRankSum=-0.607;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=57.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=-4.086;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=4.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,88:404:99:2721,0,13178
contig353	23617	.	G	A	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=-0.743;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=49.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-2.566;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.950;SOR=4.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,79:405:99:2288,0,13961
contig353	23618	.	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=-0.152;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=49.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-2.422;QD=5.59;ReadPosRankSum=-2.367;SOR=3.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,78:405:99:2291,0,13981
contig353	23631	.	C	T	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.499;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=90.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-6.794;QD=5.04;ReadPosRankSum=-5.519;SOR=4.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,60:369:99:1889,0,13207
contig353	23635	.	G	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.923;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=96.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-9.392;QD=3.98;ReadPosRankSum=-4.541;SOR=5.373	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,51:359:99:1457,0,12484
contig353	24421	.	A	T	9668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.525;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=36.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.608;QD=32.45;ReadPosRankSum=3.367;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,241:298:99:9697,0,1741
contig353	24433	.	A	G	9996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.215;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=40.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.125;QD=32.56;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:72,235:307:99:10025,0,2538
contig353	24437	.	A	G	9928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.766;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=39.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.643;QD=31.03;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,239:320:99:9957,0,2712
contig353	24444	.	T	A	9870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-2.295;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=34.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.034;QD=30.28;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,235:326:99:9899,0,3384
contig353	24458	.	C	T	9214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.062;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=31.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.213;QD=27.51;ReadPosRankSum=-1.458;SOR=0.310	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:112,223:335:99:9243,0,4261
contig353	24581	.	AT	A	6907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.841;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.741;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,192:372:99:6945,0,6819
contig353	24604	.	A	G	7599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-2.194;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=5.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.031;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,201:400:99:7628,0,7937
contig353	24816	.	CATATAGG	C	8166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.286;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.842;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,217:518:99:8204,0,12100
contig353	24835	.	T	C	9193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.022;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.347;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,230:533:99:9222,0,12373
contig353	24853	.	C	T	10405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.630;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.246;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,258:573:99:10434,0,12954
contig353	24900	.	G	A	11177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.039;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=5.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.682;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,281:606:99:11206,0,13149
contig353	24910	.	G	GAAGCA	12212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-0.515;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.627;QD=19.99;ReadPosRankSum=-2.402;SOR=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,301:611:99:12250,0,12156
contig353	24939	.	C	T	11799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=-0.544;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.429;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,313:622:99:11828,0,11693
contig353	24955	.	A	G	12638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.363;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.243;QD=20.22;ReadPosRankSum=2.004;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,314:625:99:12667,0,12443
contig353	24980	.	G	C	11579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.440;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.636;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,313:616:99:11608,0,11018
contig353	25075	.	A	G	10289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.498;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.014;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,270:562:99:10318,0,11160
contig353	25080	.	T	A	10159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.252;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.502;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,262:538:99:10188,0,10872
contig353	25140	.	G	GA	6390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=1.212;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.537;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,235:478:99:6428,0,6461
contig353	26490	.	A	C	22348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-1.015;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.929;QD=31.20;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,608:613:99:22377,1670,0
contig353	26516	.	G	A	11159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-2.306;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.354;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,295:601:99:11188,0,11539
contig353	26531	.	G	A	10887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.151;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.062;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,295:601:99:10916,0,11652
contig353	26961	.	T	C	11358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.837;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.014;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,300:606:99:11387,0,11628
contig353	26973	.	G	A	11098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.670;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.382;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,295:595:99:11127,0,11355
contig353	27208	.	A	G	8580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-0.003;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.067;QD=15.00;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,275:572:99:8609,0,9027
contig353	27223	.	T	C	8393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.923;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.426;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,275:570:99:8422,0,8766
contig353	27835	.	T	C	11530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-0.395;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.040;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.752;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,299:658:99:11559,0,14047
contig353	27840	.	A	AAGG	11768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.829;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.590;QD=17.67;ReadPosRankSum=-2.487;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,305:666:99:11806,0,14105
contig353	28349	.	A	G	9132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.044;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.177;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,244:553:99:9161,0,12324
contig353	28350	.	ATAC	A	9423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.039;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.506;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,237:553:99:9461,0,12657
contig353	28354	.	C	CGTT	9167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-0.804;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.522;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,236:546:99:9205,0,12443
contig353	28675	.	A	G	10964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=1.636;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.443;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,278:559:99:10993,0,11196
contig353	28677	.	G	A	11143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.439;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.541;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,279:565:99:11172,0,11342
contig353	28699	.	T	A	8538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.351;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.447;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,274:559:99:8567,0,10632
contig353	28740	.	C	T	10626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.585;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.490;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.633;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,266:521:99:10655,0,9824
contig353	28749	.	C	T	11350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=2.665;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.660;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,277:531:99:11379,0,10139
contig353	28756	.	T	C	11299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=1.756;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.132;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,280:524:99:11328,0,9798
contig353	28765	.	T	A	11402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.783;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.920;QD=21.89;ReadPosRankSum=-1.704;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,282:521:99:11431,0,9541
contig353	28771	.	A	G	11126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.874;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.600;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.996;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,276:517:99:11155,0,9388
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contig353	28995	.	C	T	5960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=1.640;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.041;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,194:430:99:5989,0,7439
contig353	29240	.	C	G	7386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.294;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.561;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.160;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,196:411:99:7415,0,8444
contig353	29247	.	G	A	7453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.527;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.759;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.869;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,195:424:99:7482,0,8815
contig353	29308	.	TGGGGG	T	8238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-1.540;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.013;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.949;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,214:508:99:8276,0,11958
contig353	29320	.	A	AC	8359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=-0.578;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.288;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,219:527:99:8397,0,12379
contig353	29332	.	A	C	9293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-2.255;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.359;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.987;SOR=1.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,227:526:99:9322,0,11947
contig353	29338	.	G	C	9250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-1.605;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=3.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.334;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,238:551:99:9279,0,12680
contig353	29353	.	C	A	10175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.840;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.044;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.940;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,255:549:99:10204,0,12275
contig353	29354	.	T	C	10164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.016;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.254;QD=18.45;ReadPosRankSum=-1.998;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,256:551:99:10193,0,11858
contig353	29355	.	T	G	10005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.809;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.038;QD=18.00;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,260:556:99:10034,0,11744
contig353	29422	.	G	A	12276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.332;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.331;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,316:638:99:12305,0,12763
contig353	29424	.	T	C	12452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.876;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.572;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,313:639:99:12481,0,12830
contig353	29425	.	A	T	12327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.524;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.222;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,316:640:99:12356,0,12801
contig353	29462	.	A	G	13099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=1.234;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.531;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,343:675:99:13128,0,12485
contig353	29473	.	G	A	13393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.285;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.198;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,350:675:99:13422,0,12544
contig353	29504	.	A	T	9726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=1.484;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.606;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,325:630:99:9755,0,9368
contig353	29653	.	C	T	12591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.973;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.238;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,329:683:99:12620,0,13502
contig353	29662	.	C	T	12640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.378;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.996;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,329:666:99:12669,0,13144
contig353	29791	.	G	A	12054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.851;DP=730;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.424;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.022;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,314:698:99:12083,0,15017
contig353	29797	.	G	A	11833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=1.154;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.191;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,306:682:99:11862,0,14684
contig353	29884	.	A	G	12518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=2.280;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.494;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,330:635:99:12547,0,11348
contig353	29902	.	G	A	11987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.705;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.307;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,317:609:99:12016,0,10912
contig353	29950	.	C	T	11800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.589;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.634;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,304:611:99:11829,0,12497
contig353	29956	.	C	T	11780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.186;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.118;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,306:626:99:11809,0,12699
contig353	29998	.	A	G	10766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=-1.679;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.841;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,281:588:99:10795,0,11892
contig353	30010	.	G	A	10970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=1.060;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.022;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,278:580:99:10999,0,12061
contig353	30022	.	G	A	11032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.249;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.601;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,280:569:99:11061,0,11781
contig353	30037	.	G	A	10452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.118;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.433;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,265:539:99:10481,0,11129
contig353	30046	.	A	G	10196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.256;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.282;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,266:530:99:10225,0,10428
contig353	30259	.	A	G	8178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.778;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.759;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.357;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,261:546:99:8207,0,9390
contig353	30388	.	G	A	10115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.951;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.360;QD=18.87;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,262:536:99:10144,0,10634
contig353	30391	.	T	C	10100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-1.020;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.068;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.864;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,260:533:99:10129,0,10594
contig354	32	.	G	GCTGCTGGAA	4086.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.398;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-1.169;QD=21.29;ReadPosRankSum=-1.403;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,99:192:99:4124,0,4905
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contig354	6945	.	A	AT	9315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-1.155;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.061;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,243:525:99:9353,0,11562
contig354	6969	.	T	C	8820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-0.035;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.779;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.007;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,266:503:99:8849,0,8554
contig354	6993	.	CT	C	6053.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=1.464;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.339;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,237:485:99:6091,0,6356
contig354	7052	.	G	C	10820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.628;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.455;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,277:539:99:10849,0,9974
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contig354	7719	.	A	C	9448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;ClippingRankSum=-1.663;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=6.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-0.508;QD=17.24;ReadPosRankSum=-2.200;SOR=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,237:548:99:9477,0,12897
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contig354	7746	.	A	C	9589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;ClippingRankSum=1.658;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-1.001;QD=17.47;ReadPosRankSum=-7.786;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,243:549:99:9618,0,12678
contig354	7751	.	T	TTGCTTCCTTTTTTCACTTC	11880.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-1.240;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.498;QD=21.45;ReadPosRankSum=-7.511;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,238:554:99:11918,0,13223
contig354	7753	.	A	G	12378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=-0.795;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-0.702;QD=22.43;ReadPosRankSum=-6.337;SOR=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,233:552:99:12407,0,13397
contig354	7759	.	T	A	10177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-0.496;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-0.046;QD=17.11;ReadPosRankSum=-5.073;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,262:595:99:10206,0,13806
contig354	7769	.	C	G	10651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=2.601;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-0.236;QD=18.02;ReadPosRankSum=-2.219;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,268:591:99:10680,0,13605
contig354	7782	.	C	T	11299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-1.227;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-0.038;QD=19.18;ReadPosRankSum=-2.291;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,283:589:99:11328,0,12723
contig354	7788	.	C	A	11578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.776;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.143;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,288:609:99:11607,0,12912
contig354	7811	.	C	T	12781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=-1.509;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.350;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,325:677:99:12810,0,14132
contig354	7824	.	C	T	12592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=1.903;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.840;QD=19.17;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,319:657:99:12621,0,14031
contig354	7826	.	C	A	12455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=1.199;DP=699;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.744;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,318:663:99:12484,0,13583
contig354	7863	.	C	T	12314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-0.313;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.229;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.801;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,323:678:99:12343,0,13398
contig354	7885	.	A	G	13196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.769;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.164;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,335:686:99:13225,0,14707
contig354	7894	.	C	T	12849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.101;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.607;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,323:679:99:12878,0,14408
contig354	7903	.	C	T	12711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.049;DP=709;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.665;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,319:678:99:12740,0,14585
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contig354	7917	.	C	G	12282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.028;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.154;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.377;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,301:632:99:12311,0,13571
contig354	7927	.	G	C	11697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.136;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.705;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,287:617:99:11726,0,13571
contig354	7935	.	C	T	11530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.740;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.318;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,285:605:99:11559,0,12999
contig354	7941	.	A	G	10546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=-1.105;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=8.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.008;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,265:592:99:10575,0,13316
contig354	7951	.	C	T	10371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-1.140;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.509;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,263:593:99:10400,0,13615
contig354	7956	.	C	T	9898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.122;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.291;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.933;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,264:593:99:9927,0,13123
contig354	7986	.	T	C	9346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.118;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.747;QD=15.76;ReadPosRankSum=2.513;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,242:593:99:9375,0,15847
contig354	8002	.	G	A	11050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-0.907;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.996;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.455;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,286:622:99:11079,0,16249
contig354	8007	.	T	A	11130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-0.163;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.280;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,291:638:99:11159,0,15921
contig354	8041	.	T	A	11555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.403;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.269;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,299:643:99:11584,0,15506
contig354	8048	.	C	T	12071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.286;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.385;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,303:645:99:12100,0,15833
contig354	8059	.	C	T	11516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.007;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.863;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,284:612:99:11545,0,15000
contig354	8073	.	G	A	10752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.491;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.711;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.537;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,266:583:99:10781,0,13203
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contig354	8171	.	C	CT	6693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=2.073;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=6.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.012;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,289:591:99:6731,0,11581
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contig354	8347	.	C	T	8481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=1.425;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.454;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,217:427:99:8510,0,12716
contig354	8367	.	G	C	6522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-2.080;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.088;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.783;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,211:417:99:6551,0,6393
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contig354	8539	.	A	G	6083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.199;DP=439;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.182;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,201:412:99:6112,0,6383
contig354	8574	.	G	A	8354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.415;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.293;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,265:509:99:8383,0,7443
contig354	8609	.	C	T	9797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.641;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.217;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,332:647:99:9826,0,9221
contig354	8999	.	A	G	11688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-1.409;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.315;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.002;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,306:606:99:11717,0,11335
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contig354	9974	.	G	GA	4497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.309;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.956;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.975;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,228:476:99:4535,0,5301
contig354	10296	.	A	C	10689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.924;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.495;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.176;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,274:560:99:10718,0,11245
contig354	10297	.	T	C	10809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.140;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.738;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,274:558:99:10838,0,11303
contig354	10306	.	A	G	10450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=1.571;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.952;QD=18.08;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,275:578:99:10479,0,11663
contig354	10412	.	C	T	9831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.896;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.475;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.789;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,262:565:99:9860,0,11871
contig354	10413	.	T	G	9831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.145;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.110;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.497;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,255:556:99:9860,0,11871
contig354	10510	.	G	A	8045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.339;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.083;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,262:517:99:8074,0,9594
contig354	10552	.	A	G	9735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.374;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.101;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,252:516:99:9764,0,10262
contig354	10564	.	G	A	10128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=2.019;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.446;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.630;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,255:518:99:10157,0,10363
contig354	10572	.	A	G	10499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.239;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.065;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,254:507:99:10528,0,10483
contig354	10582	.	G	A	10757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.512;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.274;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,267:534:99:10786,0,10808
contig354	10588	.	A	G	10418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=1.312;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.491;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,267:531:99:10447,0,10376
contig354	10720	.	G	C	14930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.237;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.394;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.877;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,377:736:99:14959,0,14073
contig354	10723	.	C	T	15274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=-0.158;DP=767;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.258;QD=20.53;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,377:744:99:15303,0,14765
contig354	10738	.	T	C	15343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-1.696;DP=767;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.388;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,374:742:99:15372,0,14644
contig354	10739	.	T	C	15419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=2.146;DP=766;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.473;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,375:742:99:15448,0,14683
contig354	10758	.	T	C	14662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.106;DP=759;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.415;QD=19.98;ReadPosRankSum=2.294;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:371,363:734:99:14691,0,14914
contig354	10759	.	A	C	14632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.770;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.366;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.830;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,367:735:99:14661,0,14929
contig354	10768	.	C	T	14320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=-0.906;DP=791;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.633;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.288;SOR=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,376:762:99:14349,0,14757
contig354	10807	.	G	A	11120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=2.613;DP=760;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.405;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.536;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,364:722:99:11149,0,11337
contig354	10861	.	C	T	13599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=-0.003;DP=796;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.359;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.762;SOR=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,353:739:99:13628,0,14863
contig354	10866	.	T	C	13569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=-0.730;DP=789;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.891;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:384,350:734:99:13598,0,14845
contig354	11128	.	T	C	11365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.428;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.082;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,296:625:99:11394,0,12739
contig354	11140	.	C	T	11379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.231;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.275;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,303:627:99:11408,0,12352
contig354	11177	.	C	G	11685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.528;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.663;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,300:637:99:11714,0,13449
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contig355	9680	.	A	G	22823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=-0.524;DP=1122;ExcessHet=3.0103;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQRankSum=-11.978;QD=21.70;ReadPosRankSum=3.257;SOR=1.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:486,566:1052:99:22852,0,19571
contig355	9689	.	A	G	23300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.325;DP=1135;ExcessHet=3.0103;FS=9.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-7.446;QD=21.72;ReadPosRankSum=3.252;SOR=1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:500,573:1073:99:23329,0,20134
contig355	9693	.	C	A	23615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-0.333;DP=1155;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-8.836;QD=21.45;ReadPosRankSum=2.740;SOR=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:513,588:1101:99:23644,0,20404
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contig355	9708	.	T	C	24145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.615;DP=1146;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=-11.029;QD=21.67;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:519,595:1114:99:24174,0,21159
contig355	9718	.	T	A	24514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.048;DP=1136;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-11.612;QD=22.19;ReadPosRankSum=-2.441;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:516,589:1105:99:24543,0,20673
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contig355	9750	.	G	A	22943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;ClippingRankSum=0.404;DP=1126;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-7.615;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:508,572:1080:99:22972,0,20452
contig355	9751	.	C	T	23159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;ClippingRankSum=-0.926;DP=1134;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-7.450;QD=21.29;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:513,575:1088:99:23188,0,20352
contig355	9770	.	G	C	24985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;ClippingRankSum=-0.729;DP=1189;ExcessHet=3.0103;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=1.069;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.496;SOR=1.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:502,612:1114:99:25014,0,20514
contig355	9776	.	A	G	25102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=1.040;DP=1200;ExcessHet=3.0103;FS=4.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=1.309;QD=22.57;ReadPosRankSum=1.583;SOR=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:502,610:1112:99:25131,0,20631
contig355	9784	.	T	G	24676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.455;ClippingRankSum=-0.342;DP=1228;ExcessHet=3.0103;FS=5.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.354;QD=22.11;ReadPosRankSum=2.751;SOR=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:509,607:1116:99:24705,0,20160
contig355	9801	.	C	T	23057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=2.597;DP=1197;ExcessHet=3.0103;FS=8.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.857;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.857;SOR=1.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:471,571:1042:99:23086,0,18856
contig355	9808	.	A	AG	22561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-1.652;DP=1196;ExcessHet=3.0103;FS=10.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.286;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.786;SOR=1.089	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:459,558:1017:99:22599,0,18534
contig355	9810	.	A	G	22192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.367;DP=1205;ExcessHet=3.0103;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=2.297;QD=21.78;ReadPosRankSum=1.061;SOR=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:466,553:1019:99:22221,0,17977
contig355	9840	.	C	T	20106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.218;DP=1328;ExcessHet=3.0103;FS=23.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.660;QD=19.75;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:488,530:1018:99:20135,0,18448
contig357	201	.	AT	A	25429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.316;ClippingRankSum=-0.299;DP=1122;ExcessHet=3.0103;FS=15.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=2.511;QD=31.01;ReadPosRankSum=-2.859;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,618:820:99:25467,0,6063
contig357	210	.	C	G	20528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=-0.270;DP=1053;ExcessHet=3.0103;FS=15.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=5.364;QD=24.76;ReadPosRankSum=-3.002;SOR=0.483	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,641:829:99:20557,0,6048
contig357	216	.	C	T	26902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-0.279;DP=996;ExcessHet=3.0103;FS=16.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=5.478;QD=33.76;ReadPosRankSum=-2.602;SOR=0.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:168,629:797:99:26931,0,5238
contig357	232	.	T	C	26913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.766;DP=888;ExcessHet=3.0103;FS=19.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=7.512;QD=24.24;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:123,624:747:99:26942,0,3289
contig357	235	.	T	C	26198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.117;DP=863;ExcessHet=3.0103;FS=20.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQRankSum=6.145;QD=32.24;ReadPosRankSum=2.498;SOR=0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,613:731:99:26227,0,3206
contig357	236	.	G	A	25829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.148;DP=858;ExcessHet=3.0103;FS=18.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=7.002;QD=30.21;ReadPosRankSum=2.658;SOR=0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,613:729:99:25858,0,3107
contig358	936	.	C	T	7179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=-1.015;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.307;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,229:454:99:7208,0,7181
contig358	963	.	G	A	8045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.104;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.482;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,256:494:99:8074,0,8832
contig358	984	.	C	T	8237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.935;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=9.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.820;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.578;SOR=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,224:465:99:8266,0,9687
contig358	999	.	G	A	8371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.654;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=10.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.969;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.345;SOR=1.006	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,211:462:99:8400,0,10230
contig358	1007	.	G	A	8073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.301;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=8.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.344;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.408;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,210:456:99:8102,0,9647
contig358	1201	.	CT	C	2989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=1.331;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.572;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,115:289:99:3027,0,4934
contig358	3558	.	CA	C	7042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.103;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.395;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,188:384:99:7080,0,7547
contig358	3575	.	C	T	7693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=-1.056;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.496;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,193:401:99:7722,0,8302
contig358	3578	.	T	G	7643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-0.037;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.157;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,189:389:99:7672,0,8221
contig358	3593	.	C	T	7327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=-0.479;DP=409;ExcessHet=3.0103;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.877;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.293;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,188:383:99:7356,0,7712
contig358	5697	.	T	C	9090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=1.320;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.905;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,240:470:99:9119,0,8610
contig358	5711	.	A	T	9253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.539;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.693;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.012;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,246:469:99:9282,0,8475
contig358	6398	.	A	G	10360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=-1.096;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.487;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,337:622:99:10389,0,8843
contig358	6942	.	G	A	6846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.381;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.403;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,223:525:99:6875,0,9670
contig358	7372	.	C	T	7757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.300;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.734;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,249:466:99:7786,0,6554
contig358	7676	.	G	A	7922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=1.210;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.430;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,257:526:99:7951,0,8204
contig358	7687	.	T	C	7486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.205;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.516;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,246:508:99:7515,0,8204
contig358	8047	.	A	G	7548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.093;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.307;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,241:473:99:7577,0,7356
contig358	8079	.	C	T	9721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.062;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.292;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,247:479:99:9750,0,9178
contig358	8096	.	C	G	10346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=-1.217;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.553;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,261:490:99:10375,0,9328
contig358	8107	.	T	C	10454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.117;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.381;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,253:481:99:10483,0,9060
contig358	8113	.	T	C	10018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.062;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.556;QD=20.53;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,255:488:99:10047,0,8984
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contig358	8521	.	A	G	6658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=-1.602;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=9.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.443;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,174:397:99:6687,0,11611
contig358	8523	.	A	T	6658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=1.074;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.275;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.695;SOR=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,176:401:99:6687,0,11611
contig358	9402	.	C	A	8040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.932;ClippingRankSum=-0.220;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.804;QD=18.66;ReadPosRankSum=2.519;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,208:431:99:8069,0,8825
contig358	9403	.	G	A	8040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=-0.733;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.408;QD=18.57;ReadPosRankSum=3.368;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,204:433:99:8069,0,8874
contig358	9460	.	C	T	8273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=1.020;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.145;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,218:438:99:8302,0,8476
contig358	9468	.	T	C	8535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.185;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.047;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,225:453:99:8564,0,8694
contig358	9515	.	A	G	6946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=-0.658;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.287;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.553;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,221:457:99:6975,0,7519
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contig358	9962	.	C	T	9668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=-0.809;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.012;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.251;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,257:579:99:9697,0,12235
contig358	10329	.	G	A	6901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=1.509;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.828;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.456;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,183:409:99:6930,0,15372
contig358	10331	.	A	C	6901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.695;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.432;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,181:405:99:6930,0,15372
contig358	11507	.	G	T	11610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-1.207;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=5.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.805;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,303:595:99:11639,0,11131
contig358	11525	.	A	G	11907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.763;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,314:615:99:11936,0,11375
contig358	11554	.	A	G	9290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.118;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.017;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.001;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,303:604:99:9319,0,9284
contig358	11728	.	GTTT	G	1396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-1.876;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=1.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-0.324;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:77,58:135:99:1434,0,1701
contig358	11863	.	GT	G	5141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=1.124;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.877;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:181,176:357:99:5179,0,5330
contig358	11892	.	G	A	7550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-1.658;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.357;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,201:417:99:7579,0,9555
contig358	11903	.	G	A	7519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.173;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=4.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.360;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=1.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,200:424:99:7548,0,9784
contig358	12674	.	A	T	7803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=-0.494;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.506;QD=14.81;ReadPosRankSum=2.793;SOR=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,255:527:99:7832,0,8412
contig358	13006	.	A	G	9019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.707;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.250;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,248:523:99:9048,0,11391
contig358	13030	.	G	A	8956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.458;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.489;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,226:499:99:8985,0,11953
contig358	13035	.	T	A	9036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.736;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.261;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,239:515:99:9065,0,11785
contig359	6965	.	A	G	12377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.174;ClippingRankSum=-0.505;DP=1669;ExcessHet=3.0103;FS=7.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQRankSum=-8.079;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:780,359:1139:99:12406,0,37042
contig359	6977	.	T	C	12555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.819;ClippingRankSum=-0.321;DP=1662;ExcessHet=3.0103;FS=9.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQRankSum=-8.997;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.207;SOR=1.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:802,349:1151:99:12584,0,40219
contig359	7002	.	T	C	15727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.167;DP=1443;ExcessHet=3.0103;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQRankSum=6.756;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.754;SOR=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:527,535:1062:99:15756,0,18553
contig359	7003	.	A	C	9695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.666;DP=1430;ExcessHet=3.0103;FS=16.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQRankSum=-5.943;QD=9.18;ReadPosRankSum=2.958;SOR=1.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:774,282:1056:99:9724,0,41371
contig359	7037	.	C	G	4067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-0.693;DP=1060;ExcessHet=3.0103;FS=22.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-8.479;QD=5.20;ReadPosRankSum=-7.207;SOR=2.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:647,136:783:99:4096,0,33554
contig359	7043	.	A	C	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.521;DP=997;ExcessHet=3.0103;FS=23.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQRankSum=-7.879;QD=3.66;ReadPosRankSum=-7.702;SOR=3.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:626,102:728:99:2695,0,32181
contig359	7046	.	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.671;ClippingRankSum=-1.451;DP=983;ExcessHet=3.0103;FS=25.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQRankSum=-8.463;QD=2.67;ReadPosRankSum=-7.264;SOR=3.334	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:630,88:718:99:1942,0,31974
contig359	7985	.	A	T	5435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.042;DP=758;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-1.283;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.560;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,157:498:99:5464,0,13929
contig359	7988	.	C	G	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=1.138;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=2.759;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,152:494:99:5387,0,14473
contig359	7989	.	A	G	5292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.863;DP=746;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-0.414;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.635;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,152:502:99:5321,0,14656
contig359	7998	.	T	A	5405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.607;DP=737;ExcessHet=3.0103;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-0.623;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.035;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,150:515:99:5434,0,15109
contig359	8003	.	A	G	4985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.080;DP=715;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=2.020;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.120;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:371,145:516:99:5014,0,15682
contig359	8015	.	C	A	4272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.028;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-1.412;QD=8.33;ReadPosRankSum=2.572;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:385,128:513:99:4301,0,15568
contig359	8219	.	A	T	11036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.993;DP=1051;ExcessHet=3.0103;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.861;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.362;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:691,323:1014:99:11065,0,27766
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contig359	13092	.	C	T	8399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-1.438;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.904;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,272:567:99:8428,0,9078
contig359	13212	.	G	A	10196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=2.440;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.727;QD=18.92;ReadPosRankSum=2.410;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,271:539:99:10225,0,14708
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contig359	13467	.	A	G	11158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=1.495;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.104;QD=20.18;ReadPosRankSum=-1.107;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,282:553:99:11187,0,10668
contig359	13478	.	A	G	11573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.509;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.296;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,283:567:99:11602,0,11390
contig359	13494	.	A	G	10569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.132;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.914;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,274:559:99:10598,0,10837
contig359	13521	.	A	G	8240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.020;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=9.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.981;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,271:542:99:8269,0,8549
contig359	13767	.	C	T	10802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.817;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.684;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.046;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,278:591:99:10831,0,12135
contig359	13769	.	A	G	10802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.708;ClippingRankSum=1.514;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.536;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.433;SOR=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,280:589:99:10831,0,12135
contig359	13806	.	C	T	11007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.408;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,284:559:99:11036,0,10601
contig359	13815	.	A	G	11517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-0.534;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.901;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,282:551:99:11546,0,10752
contig359	13824	.	C	T	11615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.008;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.503;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,305:581:99:11644,0,10879
contig359	13839	.	T	A	11189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.821;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.016;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,280:552:99:11218,0,8035
contig360	463	.	T	C	10879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.742;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.800;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.834;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,349:719:99:10908,0,14049
contig360	1041	.	T	C	7831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=-1.740;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.242;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,242:506:99:7860,0,8476
contig360	2054	.	T	TG	8661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=-0.701;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.205;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,254:526:99:8699,0,9291
contig360	4489	.	G	T	7779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.769;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.096;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,197:406:99:7808,0,8366
contig360	4491	.	A	G	7830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.336;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.055;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,199:411:99:7859,0,8612
contig360	4515	.	AC	A	6987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.210;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.661;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,185:418:99:7025,0,10507
contig360	4552	.	A	G	7725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.473;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.329;QD=15.30;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,226:505:99:7754,0,8736
contig360	5482	.	G	A	9968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=1.488;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.868;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,264:541:99:9997,0,10786
contig360	5494	.	T	C	9840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.337;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.006;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,255:553:99:9869,0,11504
contig360	5536	.	C	T	10406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-1.023;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.157;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,272:591:99:10435,0,12727
contig360	5541	.	C	T	10740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.801;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.882;QD=18.33;ReadPosRankSum=-1.369;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,272:586:99:10769,0,12626
contig360	5557	.	T	C	10364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=1.282;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.056;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,277:594:99:10393,0,12166
contig360	5816	.	C	CTTTTT	4950.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.050;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.166;QD=18.75;ReadPosRankSum=-2.657;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:141,123:264:99:4988,0,6156
contig360	5828	.	G	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.880;ClippingRankSum=-0.031;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-2.297;QD=5.61;ReadPosRankSum=3.629;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,126:335:99:1906,0,7155
contig360	5855	.	C	T	6137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=3.455;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.004;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,196:408:99:6166,0,7968
contig360	6429	.	A	G	9691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.462;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.162;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,264:590:99:9720,0,12146
contig360	6447	.	G	A	8993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-0.265;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.143;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,250:567:99:9022,0,12258
contig360	6480	.	T	A	7300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=1.222;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.793;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.314;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,252:599:99:7329,0,10882
contig360	6978	.	T	A	11036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-0.067;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.082;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.101;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,287:569:99:11065,0,11000
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contig360	7568	.	G	T	11285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-2.033;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.128;QD=19.06;ReadPosRankSum=1.069;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,292:592:99:11314,0,11647
contig360	7756	.	TTTTTTGA	T	4180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=1.184;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-3.874;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.965;SOR=0.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,146:350:99:4218,0,7931
contig360	7870	.	C	T	5439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.643;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=17.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.724;QD=13.77;ReadPosRankSum=3.324;SOR=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,187:395:99:5468,0,7326
contig360	7896	.	G	GAA	6412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=1.322;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=30.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.239;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.709;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,167:374:99:6450,0,8516
contig360	7937	.	A	G	10033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=-0.945;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.091;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,249:491:99:10062,0,9538
contig360	7941	.	C	T	9896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.958;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=3.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=2.345;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,259:500:99:9925,0,10006
contig360	7969	.	AG	A	10144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-1.111;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.853;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,289:608:99:10182,0,12667
contig360	8002	.	A	G	10399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=-1.052;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.153;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,289:623:99:10428,0,12510
contig360	8098	.	CT	C	10907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.721;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.634;QD=19.04;ReadPosRankSum=2.255;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,289:573:99:10945,0,10192
contig360	8123	.	C	T	11957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=1.452;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.555;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,320:593:99:11986,0,10264
contig360	8237	.	T	C	8319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-1.026;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.139;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,274:581:99:8348,0,9466
contig360	10003	.	G	A	11167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.463;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.088;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,289:607:99:11196,0,12457
contig360	10006	.	G	A	11191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-0.878;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.053;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,289:608:99:11220,0,12479
contig360	12029	.	CA	C	5788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.408;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.717;QD=11.72;ReadPosRankSum=2.929;SOR=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,243:494:99:5826,0,5770
contig360	12247	.	G	A	11311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.099;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.200;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,287:560:99:11340,0,10672
contig360	12248	.	GT	G	11653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.481;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.770;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,288:563:99:11691,0,10661
contig360	12251	.	C	T	11577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=1.368;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.062;QD=20.53;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,296:564:99:11606,0,10574
contig360	12391	.	C	T	10486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.190;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.180;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,339:693:99:10515,0,11054
contig360	12817	.	T	C	9754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.159;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.701;QD=15.31;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,310:637:99:9783,0,12529
contig360	13078	.	T	C	6590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.399;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.228;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,177:372:99:6619,0,7423
contig360	13086	.	C	T	6202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.605;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.831;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,158:329:99:6231,0,6951
contig360	13128	.	T	C	10177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=-0.070;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.016;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,267:531:99:10206,0,10179
contig360	13141	.	A	C	10425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.308;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.105;QD=19.49;ReadPosRankSum=4.788;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,267:535:99:10454,0,10695
contig360	13142	.	G	A	10392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.012;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.743;QD=19.28;ReadPosRankSum=2.346;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,267:539:99:10421,0,10654
contig360	13222	.	G	A	11781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=-0.050;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.112;QD=18.73;ReadPosRankSum=-3.058;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,300:629:99:11810,0,13146
contig360	13228	.	C	T	12175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.021;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.332;QD=19.02;ReadPosRankSum=-2.581;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,300:640:99:12204,0,13486
contig360	13234	.	T	A	11607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.566;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.616;QD=18.00;ReadPosRankSum=-2.308;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,302:645:99:11636,0,13424
contig360	13369	.	G	C	9702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=1.396;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.053;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,312:613:99:9731,0,9334
contig360	14243	.	A	G	9510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.646;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.598;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.443;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,252:561:99:9539,0,11944
contig360	14261	.	T	C	9883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=2.517;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.594;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,266:578:99:9912,0,12049
contig360	15218	.	G	A	11454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.482;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.163;QD=18.75;ReadPosRankSum=-2.036;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,303:611:99:11483,0,12190
contig360	15239	.	A	G	11356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=-0.575;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.527;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,313:648:99:11385,0,12391
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contig360	16261	.	C	T	10912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=1.499;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.303;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.970;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,290:572:99:10941,0,17446
contig360	16281	.	C	A	11109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=1.402;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.724;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,291:576:99:11138,0,17411
contig360	17331	.	T	C	8396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=1.071;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.204;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.041;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,262:535:99:8425,0,8751
contig360	17400	.	T	C	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.341;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.950;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,240:483:99:9414,0,9094
contig360	17419	.	A	G	9396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=1.082;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=2.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.186;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,261:531:99:9425,0,9894
contig360	17532	.	C	T	9758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=1.092;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.083;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,250:477:99:9787,0,8789
contig360	17533	.	A	G	9758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-2.049;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.790;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,246:474:99:9787,0,8789
contig360	17568	.	G	A	9199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=-0.547;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.498;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,303:596:99:9228,0,9245
contig360	18469	.	A	G	10516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.664;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.397;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,332:657:99:10545,0,10123
contig360	19219	.	T	C	8628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=1.300;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.824;QD=16.50;ReadPosRankSum=4.864;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,275:523:99:8657,0,7578
contig360	20781	.	C	T	9519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.815;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.166;QD=20.08;ReadPosRankSum=2.325;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,244:474:99:9548,0,8934
contig360	20784	.	G	A	9595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.414;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.058;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,248:481:99:9624,0,8997
contig360	20814	.	T	C	9452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.093;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.460;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,243:474:99:9481,0,8724
contig360	20823	.	A	G	9321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.707;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.012;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.005;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,243:462:99:9350,0,8444
contig360	20850	.	C	T	9463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=-1.873;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.280;QD=20.85;ReadPosRankSum=-2.293;SOR=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,248:454:99:9492,0,8190
contig360	20859	.	A	G	9244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.660;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=4.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.843;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,231:449:99:9273,0,8664
contig360	20871	.	C	T	8504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.013;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.293;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,221:435:99:8533,0,8227
contig360	20901	.	T	C	5925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-1.411;DP=420;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.686;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,192:402:99:5954,0,6765
contig360	21102	.	C	T	7627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.238;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.154;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,202:406:99:7656,0,7619
contig360	21121	.	A	G	7894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.424;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.058;QD=18.98;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,217:416:99:7923,0,7299
contig360	21162	.	G	A	6233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=-1.573;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.646;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.860;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,209:415:99:6262,0,6575
contig360	21207	.	C	T	8360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.188;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.416;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,212:435:99:8389,0,8997
contig360	21208	.	A	G	8410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.541;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.206;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,213:436:99:8439,0,9253
contig360	21219	.	T	C	7564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.652;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.171;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.092;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,189:418:99:7593,0,8932
contig360	21801	.	T	C	7532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-1.488;DP=470;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.321;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.296;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,202:445:99:7561,0,9265
contig360	21810	.	G	A	7544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=-0.937;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.497;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,202:430:99:7573,0,9014
contig360	22071	.	T	C	6279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.647;DP=369;ExcessHet=3.0103;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.915;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,159:353:99:6308,0,20053
contig360	22074	.	G	A	6329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.464;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=7.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.798;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,162:363:99:6358,0,20501
contig360	22077	.	T	C	6247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.451;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.001;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.618;SOR=0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,165:369:99:6276,0,20448
contig360	22231	.	A	C	5741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=-0.194;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.699;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,151:304:99:5770,0,9582
contig360	22236	.	T	C	5714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=1.512;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=3.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.687;QD=20.05;ReadPosRankSum=2.367;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,139:285:99:5743,0,9843
contig360	22254	.	C	A	5665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=1.114;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=6.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.340;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.132;SOR=1.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:153,143:296:99:5694,0,10678
contig360	22258	.	A	G	5745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.073;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=19.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.205;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.376;SOR=1.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,151:308:99:5774,0,10582
contig360	22380	.	A	G	5908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.986;DP=434;ExcessHet=3.0103;FS=5.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.136;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.886;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,162:397:99:5937,0,9037
contig360	22395	.	A	G	6320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.022;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.603;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.870;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,178:414:99:6349,0,9022
contig360	22472	.	A	G	5185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=-1.153;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.540;QD=11.89;ReadPosRankSum=-2.433;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,179:436:99:5214,0,7935
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contig360	22683	.	A	C	8301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=1.799;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.391;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.756;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,264:501:99:8330,0,7322
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contig360	28055	.	C	A	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.14;QD=33.72;SOR=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,133:133:99:4513,400,0
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contig364	851	.	G	A	8689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-1.249;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.417;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,268:589:99:8718,0,10752
contig364	1524	.	C	T	10092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.470;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.475;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.402;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,268:534:99:10121,0,10325
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contig364	1826	.	C	T	11876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.814;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.435;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,314:627:99:11905,0,11952
contig364	1889	.	GCTAA	G	10640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-1.111;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.573;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.135;SOR=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,272:578:99:10678,0,12197
contig364	1893	.	A	AGGG	10643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.386;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.379;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,272:562:99:10681,0,12175
contig364	1901	.	T	C	10322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=-0.892;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.232;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,273:559:99:10351,0,11303
contig364	2259	.	T	C	11572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.689;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.239;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.605;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,300:591:99:11601,0,9204
contig364	2263	.	A	G	9106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.399;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=4.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.080;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.757;SOR=1.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,291:585:99:9135,0,13213
contig364	2452	.	G	T	9500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-1.673;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.985;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.642;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,306:650:99:9529,0,10752
contig364	2634	.	T	A	12706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.268;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.641;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.080;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,323:688:99:12735,0,14130
contig364	2644	.	A	C	13932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.266;DP=740;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.495;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.898;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,341:715:99:13961,0,15154
contig364	2646	.	G	C	13824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=-1.936;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.743;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.675;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:379,343:722:99:13853,0,15101
contig364	2662	.	G	A	12401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.394;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.226;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,324:678:99:12430,0,13833
contig364	3478	.	T	C	7475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.521;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.217;QD=15.07;ReadPosRankSum=1.192;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,249:496:99:7504,0,7546
contig364	3518	.	C	A	6939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=-0.942;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.088;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.655;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,240:477:99:6968,0,7292
contig364	3546	.	C	G	10660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.412;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.013;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,268:527:99:10689,0,10070
contig364	3547	.	T	C	10858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.973;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.165;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,267:524:99:10887,0,10223
contig364	3569	.	CCT	C	10953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.980;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.425;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,279:544:99:10991,0,10363
contig364	3801	.	TTGA	T	9234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.880;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.164;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,255:565:99:9272,0,12436
contig364	3817	.	GAT	G	10274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-1.806;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.942;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.141;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,268:592:99:10312,0,13138
contig364	3835	.	A	AT	4932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.723;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.973;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.855;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,229:486:99:4970,0,5847
contig364	3901	.	GA	G	12032.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.388;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.590;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,292:602:99:12070,0,12528
contig364	3927	.	T	C	12667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-2.106;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.027;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,321:623:99:12696,0,12165
contig364	3941	.	G	A	13113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=-0.626;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.711;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,323:630:99:13142,0,12467
contig364	3945	.	C	A	13032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.828;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.826;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.543;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,325:640:99:13061,0,12443
contig364	3948	.	C	T	12812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.155;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.533;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,320:619:99:12841,0,12264
contig364	3982	.	T	C	11692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=1.304;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.200;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,299:625:99:11721,0,12897
contig364	3993	.	T	C	12162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.686;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.759;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,312:651:99:12191,0,13579
contig364	3994	.	G	T	12114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.013;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.446;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,310:652:99:12143,0,13520
contig364	4195	.	GT	G	8859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=1.321;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.286;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:374,295:669:99:8897,0,14857
contig364	4200	.	T	C	11425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.628;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.499;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:378,305:683:99:11454,0,11749
contig364	4272	.	G	A	9973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.605;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.165;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,266:604:99:10002,0,13743
contig364	4296	.	G	C	10510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.074;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.400;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,271:598:99:10539,0,13315
contig364	4319	.	T	G	10319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.117;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.163;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,275:584:99:10348,0,11890
contig364	4446	.	T	TGATTA	11970.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.468;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.995;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.317;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,292:600:99:12008,0,11738
contig364	4880	.	T	C	8070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.996;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.310;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,214:479:99:8099,0,10340
contig364	4893	.	A	C	8680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=-0.920;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.424;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.119;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,215:477:99:8709,0,10665
contig364	4902	.	G	A	8779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.575;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.195;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,226:502:99:8808,0,11055
contig364	4903	.	G	A	8698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.603;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.758;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,227:502:99:8727,0,11019
contig364	4926	.	AT	A	5738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.080;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.918;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.063;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,224:507:99:5776,0,7736
contig364	5088	.	C	CA	5670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.292;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.114;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.284;SOR=0.757	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,239:541:99:5708,0,7673
contig364	5329	.	TTGTAGCAGCAGTGGTCTCAGCAGC	T	13763.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.607;DP=777;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=1.741;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.961	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,356:732:99:13801,0,15089
contig364	5357	.	AGTG	A	14121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.167;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-0.244;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.780;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,355:678:99:14159,0,12741
contig364	5363	.	A	G	14122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.484;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=1.527;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,351:661:99:14151,0,12296
contig364	5384	.	G	A	14242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.001;ClippingRankSum=1.644;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-0.348;QD=21.23;ReadPosRankSum=-4.449;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,371:671:99:14271,0,11344
contig364	5492	.	G	A	13694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.369;DP=734;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.118;QD=19.45;ReadPosRankSum=2.621;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,353:704:99:13723,0,13678
contig364	5498	.	A	G	13990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-0.510;DP=759;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.169;QD=19.24;ReadPosRankSum=2.384;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,364:727:99:14019,0,13880
contig364	5531	.	G	A	13951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.143;DP=777;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.728;QD=18.83;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:366,375:741:99:13980,0,13587
contig364	5549	.	G	A	13768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.411;DP=745;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.074;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.639;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,363:713:99:13797,0,13516
contig364	5797	.	A	G	11692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.279;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.053;QD=20.48;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,300:571:99:11721,0,10372
contig364	5805	.	A	G	11716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.413;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.949;QD=20.70;ReadPosRankSum=-2.493;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,291:566:99:11745,0,11112
contig364	5808	.	AAGC	A	11290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=-0.831;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.245;QD=20.02;ReadPosRankSum=-2.025;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,280:564:99:11328,0,11548
contig364	5815	.	A	ACTAGC	11929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-0.641;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.180;QD=21.19;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,279:563:99:11967,0,11382
contig364	5828	.	A	C	11104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=-0.799;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.685;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.870;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,276:572:99:11133,0,11943
contig364	5831	.	T	G	11083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=-0.740;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.090;QD=19.62;ReadPosRankSum=-2.403;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,276:565:99:11112,0,11652
contig364	5836	.	G	T	11274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.977;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.786;QD=20.10;ReadPosRankSum=-3.592;SOR=0.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,280:561:99:11303,0,11371
contig364	5844	.	T	C	11197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.915;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=4.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.264;QD=19.04;ReadPosRankSum=-3.588;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,297:588:99:11226,0,11104
contig364	6432	.	T	A	9158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=1.762;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.301;QD=20.26;ReadPosRankSum=2.199;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,231:452:99:9187,0,8717
contig364	6435	.	A	T	9514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.381;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.059;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,236:455:99:9543,0,8809
contig364	6439	.	C	T	9827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-0.205;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.045;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,245:460:99:9856,0,9077
contig364	6440	.	C	G	9845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.464;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.178;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.320;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,245:462:99:9874,0,8854
contig364	6443	.	C	T	9732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.970;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.013;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,242:462:99:9761,0,8512
contig364	6790	.	A	G	11997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.845;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.557;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,302:579:99:12026,0,10756
contig364	6794	.	G	A	12345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.979;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.606;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,304:580:99:12374,0,10915
contig364	6797	.	T	A	12160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=1.162;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.460;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.720;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,306:585:99:12189,0,11199
contig364	6805	.	C	A	12366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.323;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.191;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,300:568:99:12395,0,10575
contig364	6810	.	TA	T	11826.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.922;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.433;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,302:577:99:11864,0,10593
contig364	6990	.	GTT	G	9078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=-0.312;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=1.387;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,240:513:99:9116,0,10265
contig364	7012	.	CTCCTACATTTTCTCCTTTT	C	8997.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=0.822;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-1.267;QD=15.65;ReadPosRankSum=4.232;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,243:575:99:9035,0,13177
contig364	7328	.	GA	G	5966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.427;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.897;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,275:531:99:6004,0,5535
contig364	7353	.	AAAAT	A	5816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-0.916;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.890;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,264:547:99:5854,0,10743
contig364	7503	.	TCC	T	7521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.564;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.528;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.890;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,223:494:99:7559,0,10225
contig364	7506	.	C	T	5124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.783;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.679;QD=10.61;ReadPosRankSum=3.565;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,211:483:99:5153,0,10308
contig364	7905	.	G	A	6133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.433;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=4.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.117;QD=13.22;ReadPosRankSum=2.171;SOR=0.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,208:464:99:6162,0,7891
contig364	8736	.	G	A	7916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.835;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.182;QD=13.24;ReadPosRankSum=3.826;SOR=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,260:598:99:7945,0,10641
contig364	10047	.	T	C	9479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.984;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.268;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,248:506:99:9508,0,10022
contig364	10065	.	G	C	9389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-1.834;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.719;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,250:522:99:9418,0,10508
contig364	10485	.	C	T	12136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.648;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=3.082;QD=19.70;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,317:616:99:12165,0,15351
contig364	10497	.	T	C	12039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.081;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.843;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,316:619:99:12068,0,15319
contig364	10632	.	C	T	8265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.663;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.242;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,261:530:99:8294,0,8545
contig364	10656	.	G	A	8076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-0.664;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.408;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,249:508:99:8105,0,8325
contig364	11301	.	T	C	12476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.737;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.056;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.255;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,322:655:99:12505,0,13019
contig364	11313	.	G	C	12550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-0.724;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.564;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,313:646:99:12579,0,13417
contig364	11329	.	G	A	11968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.336;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.068;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,318:665:99:11997,0,13169
contig364	11713	.	G	T	10414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.100;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.748;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,274:597:99:10443,0,12996
contig364	11721	.	C	A	11094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.055;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.670;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,281:616:99:11123,0,13742
contig364	11727	.	C	T	10838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-0.684;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.298;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,287:623:99:10867,0,13273
contig364	11766	.	A	G	10135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=2.393;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.305;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:363,335:698:99:10164,0,11042
contig364	12230	.	A	G	8090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=1.274;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.328;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,225:510:99:8119,0,13472
contig364	12245	.	T	C	8041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-1.323;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.342;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,214:488:99:8070,0,13217
contig364	12408	.	G	C	10599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.542;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.605;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.339;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,272:555:99:10628,0,10919
contig364	12411	.	A	T	10521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.671;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.408;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,272:550:99:10550,0,10895
contig364	12589	.	A	G	8421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-0.003;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.992;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,264:519:99:8450,0,8146
contig364	12630	.	A	T	7252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.648;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.248;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,223:483:99:7281,0,8392
contig364	12771	.	A	G	10012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=2.634;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=6.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.596;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.177;SOR=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,266:538:99:10041,0,11938
contig364	12780	.	T	A	10187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.757;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.272;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,267:539:99:10216,0,11956
contig364	12861	.	AAT	A	10895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=1.559;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.471;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,280:571:99:10933,0,11375
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contig364	12952	.	T	C	9825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.442;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.386;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,253:509:99:9854,0,9972
contig364	12953	.	A	G	9825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.431;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.007;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.243;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,249:506:99:9854,0,9972
contig364	12987	.	T	A	6686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.159;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.567;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,233:491:99:6715,0,8172
contig364	13014	.	T	C	8533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.308;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.748;QD=17.31;ReadPosRankSum=-2.083;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,231:493:99:8562,0,9963
contig364	13036	.	C	T	8325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=1.310;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.723;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,228:499:99:8354,0,10179
contig364	13066	.	C	T	8305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.907;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.306;QD=17.34;ReadPosRankSum=4.300;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,224:479:99:8334,0,13364
contig364	13079	.	G	A	8318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.057;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.239;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,218:473:99:8347,0,13564
contig364	13358	.	T	C	7335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.047;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.374;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.596;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,281:580:99:7364,0,8887
contig364	13426	.	C	G	11749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.483;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.752;QD=19.91;ReadPosRankSum=2.170;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,307:590:99:11778,0,10936
contig364	13433	.	T	C	11619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.185;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.573;QD=20.35;ReadPosRankSum=2.324;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,293:571:99:11648,0,10792
contig364	13550	.	T	G	8844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.056;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.611;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,276:574:99:8873,0,9388
contig364	13783	.	C	G	7581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-0.958;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.038;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,258:559:99:7610,0,8988
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contig364	13807	.	G	A	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.887;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.792;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,300:590:99:11325,0,11185
contig364	14253	.	A	G	10692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=1.213;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.040;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.335;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,281:586:99:10721,0,12584
contig364	14268	.	A	G	11605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=1.800;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=4.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.043;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.543;SOR=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,286:581:99:11634,0,11985
contig364	14271	.	G	A	11626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.673;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=6.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.736;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.288;SOR=1.084	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,287:575:99:11655,0,11655
contig364	14273	.	CTTACAT	C	11608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-1.092;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.275;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.859;SOR=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,293:605:99:11646,0,12357
contig364	14283	.	T	C	12097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.222;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.324;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.627;SOR=1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,294:581:99:12126,0,11487
contig364	14307	.	A	G	13102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.469;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.292;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,324:604:99:13131,0,11102
contig364	14326	.	A	G	12237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.523;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.538;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,310:572:99:12266,0,9732
contig364	14509	.	A	G	8199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=1.347;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.634;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,271:571:99:8228,0,9079
contig364	14570	.	A	G	11740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-0.316;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.579;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,300:594:99:11769,0,11197
contig364	14577	.	T	C	11981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.347;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.675;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.005;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,291:578:99:12010,0,11851
contig364	14595	.	C	T	10648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=1.040;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.634;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.266;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,277:565:99:10677,0,11788
contig364	14608	.	TTGAC	T	11752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.049;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.562;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.066;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,292:584:99:11790,0,12105
contig364	14633	.	C	T	11458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.474;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.458;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.160;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,285:575:99:11487,0,11667
contig364	14635	.	T	C	11287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=1.623;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.559;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,285:573:99:11316,0,11721
contig364	14653	.	A	G	11944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.852;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.328;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,292:591:99:11973,0,11883
contig364	14666	.	T	C	12526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-1.982;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.747;QD=20.88;ReadPosRankSum=-1.659;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,303:600:99:12555,0,11925
contig364	14681	.	ATAT	A	9049.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=-0.488;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.039;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.110;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,289:592:99:9087,0,12454
contig364	14690	.	A	G	11967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=-1.047;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.311;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,302:606:99:11996,0,12125
contig364	14697	.	G	A	11758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=1.059;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.525;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.389;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,305:607:99:11787,0,11859
contig364	15036	.	C	T	12115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=0.670;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.255;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,306:564:99:12144,0,10010
contig364	15039	.	A	G	12429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.492;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.025;QD=21.92;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,306:567:99:12458,0,10394
contig364	15049	.	A	G	12629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.129;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.360;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,308:571:99:12658,0,10330
contig364	15050	.	G	A	12629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.211;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.455;QD=22.35;ReadPosRankSum=-0.310;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,305:565:99:12658,0,10330
contig364	15063	.	C	T	11999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=1.740;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.697;QD=21.43;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,294:560:99:12028,0,10743
contig364	15067	.	C	G	11433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.458;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.944;QD=20.64;ReadPosRankSum=2.535;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,285:554:99:11462,0,10512
contig364	15230	.	C	T	11537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.231;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.760;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,293:555:99:11566,0,10064
contig364	15235	.	T	C	11772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.447;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.938;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,290:550:99:11801,0,10393
contig364	15256	.	G	T	11261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.456;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.232;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.561;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,281:523:99:11290,0,9760
contig364	15260	.	A	G	11089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.459;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.452;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,272:523:99:11118,0,9993
contig364	15272	.	T	C	10247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.151;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.531;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,260:520:99:10276,0,9846
contig364	15301	.	C	A	10701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.550;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.414;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,275:534:99:10730,0,10262
contig364	15303	.	G	A	10723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=-1.740;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.056;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.050;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,273:537:99:10752,0,10259
contig364	15425	.	ATCT	A	9323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-1.519;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.985;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,250:555:99:9361,0,11891
contig364	15502	.	A	C	10900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=2.447;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.261;QD=17.81;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,281:612:99:10929,0,13327
contig364	15507	.	G	A	11372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=2.204;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.533;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,285:628:99:11401,0,13879
contig364	15517	.	T	C	11574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.077;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.584;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,292:649:99:11603,0,14317
contig364	15533	.	T	C	10889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.286;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.040;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,291:632:99:10918,0,13443
contig364	15807	.	T	C	11730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.590;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.233;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.013;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,304:618:99:11759,0,12227
contig364	15812	.	A	G	11821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-1.218;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.658;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,305:619:99:11850,0,12043
contig364	15925	.	C	A	8104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=1.198;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.443;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,268:604:99:8133,0,10556
contig364	15940	.	C	T	8823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.352;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.004;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,283:621:99:8852,0,10347
contig364	16058	.	A	C	9679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=-0.953;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.081;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.818;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,307:630:99:9708,0,12194
contig364	16136	.	C	T	9514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.769;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.260;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,296:564:99:9543,0,8382
contig364	16176	.	C	G	12162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.201;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.286;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.671;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,305:581:99:12191,0,10712
contig364	16177	.	C	T	12324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.221;ClippingRankSum=-0.350;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.024;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.263;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,307:580:99:12353,0,10784
contig364	16183	.	C	A	12097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.319;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.389;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.068;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,301:569:99:12126,0,10911
contig364	16198	.	T	C	12815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.217;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.147;QD=21.47;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,315:597:99:12844,0,11235
contig364	16210	.	C	T	13383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.485;DP=648;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.199;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,332:626:99:13412,0,11753
contig364	16231	.	G	A	13123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=1.563;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.338;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,344:664:99:13152,0,11880
contig364	16390	.	CA	C	11060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.486;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.047;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,288:626:99:11098,0,13429
contig364	16393	.	C	G	11175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.068;ClippingRankSum=0.041;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.284;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,285:622:99:11204,0,13589
contig364	16400	.	C	T	11422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=-0.245;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.399;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,288:612:99:11451,0,13223
contig364	16404	.	C	T	10955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.490;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.026;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.822;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,283:597:99:10984,0,12576
contig364	16958	.	G	A	8805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.346;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.242;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.752;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,277:512:99:8834,0,7441
contig364	17322	.	C	A	10845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=-0.416;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-2.555;QD=18.38;ReadPosRankSum=-3.708;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,274:590:99:10874,0,12469
contig364	17325	.	G	A	11182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=-0.138;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=1.807;QD=19.08;ReadPosRankSum=-4.671;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,276:586:99:11211,0,12717
contig364	17347	.	T	C	9961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.746;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-0.330;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.284;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,251:591:99:9990,0,14196
contig364	17348	.	T	C	9991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.336;ClippingRankSum=0.185;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-3.568;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,228:568:99:10020,0,14361
contig364	17349	.	A	G	9712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.166;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-2.759;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,230:566:99:9741,0,14172
contig364	17356	.	T	C	9034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;ClippingRankSum=1.065;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-1.663;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.608;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,230:573:99:9063,0,14013
contig364	17357	.	G	T	9070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.928;ClippingRankSum=0.301;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-1.908;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,234:576:99:9099,0,14094
contig364	17364	.	T	C	7635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=-0.529;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-4.382;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,227:554:99:7664,0,13823
contig364	17366	.	T	C	7679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;ClippingRankSum=-0.244;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-1.408;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,235:573:99:7708,0,13694
contig364	17368	.	A	G	7667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.222;ClippingRankSum=0.482;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-4.903;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,234:574:99:7696,0,13862
contig364	17373	.	G	A	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-0.064;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-4.500;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,243:574:99:9414,0,13779
contig364	17379	.	C	T	9859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.809;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-4.325;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,249:591:99:9888,0,14163
contig364	17386	.	A	AAG	9832.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.069;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-4.237;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,252:595:99:9870,0,14415
contig364	17387	.	TAC	T	9808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.380;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-0.206;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,253:610:99:9846,0,14751
contig364	17391	.	A	G	10149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.634;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-5.468;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,249:603:99:10178,0,14768
contig364	17400	.	C	G	10738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.195;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-3.252;QD=17.24;ReadPosRankSum=-2.289;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,274:623:99:10767,0,14142
contig364	17402	.	A	G	10941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.584;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-4.863;QD=17.65;ReadPosRankSum=-2.757;SOR=0.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,276:620:99:10970,0,14210
contig364	17408	.	G	A	11103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.079;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-0.688;QD=17.97;ReadPosRankSum=-2.800;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,277:618:99:11132,0,14282
contig364	17415	.	C	T	10759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.264;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-5.620;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,275:628:99:10788,0,14731
contig364	17420	.	C	T	10645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.435;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=6.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-2.324;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:358,279:637:99:10674,0,14339
contig364	17476	.	AC	A	10411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=2.687;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=5.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.727;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,309:625:99:10449,0,10795
contig364	18435	.	CA	C	7259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.135;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.928;QD=12.47;ReadPosRankSum=-2.095;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,298:582:99:7297,0,6898
contig364	18586	.	T	C	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.708;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.744;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,262:516:99:9696,0,9538
contig364	18599	.	T	G	8998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=-0.715;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=13.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.861;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,225:449:99:9027,0,8812
contig364	18745	.	G	T	6984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-2.135;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.073;QD=16.21;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,191:431:99:7013,0,9205
contig364	18766	.	G	A	6996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-1.830;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.725;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,182:417:99:7025,0,9757
contig364	18772	.	C	A	7313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-1.676;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.069;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,185:422:99:7342,0,10043
contig364	18773	.	C	A	7397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.234;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.012;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,186:429:99:7426,0,10036
contig364	18778	.	T	A	7832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.091;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=4.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.010;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,193:432:99:7861,0,9796
contig364	18784	.	C	T	7611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=3.081;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.079;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,196:426:99:7640,0,9395
contig364	18787	.	A	G	7765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.046;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.126;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,189:422:99:7794,0,9434
contig364	18810	.	C	T	7383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.690;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.215;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.533;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,202:428:99:7412,0,8535
contig364	18838	.	G	A	8238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.196;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.819;QD=19.07;ReadPosRankSum=1.032;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,218:432:99:8267,0,7932
contig364	18860	.	A	G	8448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.432;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.502;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,224:449:99:8477,0,8344
contig364	18894	.	A	G	9004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.191;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.243;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,237:470:99:9033,0,8934
contig364	18898	.	C	G	8989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.850;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.324;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,232:456:99:9018,0,8951
contig364	19202	.	C	T	13407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.515;DP=791;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.612;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:409,351:760:99:13436,0,15977
contig364	19203	.	A	G	13407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.563;DP=788;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.488;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:410,347:757:99:13436,0,15977
contig364	19372	.	C	T	9548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.745;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.595;QD=15.86;ReadPosRankSum=-3.044;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,310:602:99:9577,0,9401
contig364	19420	.	G	A	10129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.727;ClippingRankSum=-0.618;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.414;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.743;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,264:564:99:10158,0,11807
contig364	19423	.	C	T	10044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=1.227;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.687;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,261:560:99:10073,0,11853
contig364	19738	.	A	G	12127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-1.565;DP=654;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.724;QD=19.59;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,322:619:99:12156,0,11065
contig364	19751	.	G	C	13147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.665;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.078;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,329:647:99:13176,0,12758
contig364	19768	.	A	T	12909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.443;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.262;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,340:651:99:12938,0,11634
contig364	19800	.	A	C	13722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.947;DP=725;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.961;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,362:694:99:13751,0,12631
contig364	19818	.	C	T	13224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=1.329;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.745;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.877;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,346:697:99:13253,0,13276
contig364	20117	.	G	A	11379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.350;ClippingRankSum=-0.194;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.628;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,296:602:99:11408,0,11958
contig364	20125	.	C	A	11484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.433;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.242;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.084;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,290:597:99:11513,0,12238
contig364	20142	.	G	A	11198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=-0.794;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.037;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,283:575:99:11227,0,11741
contig364	20143	.	T	C	11036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.364;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.438;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,283:572:99:11065,0,11659
contig364	20309	.	T	C	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=1.219;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.508;QD=20.92;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,291:546:99:11450,0,9957
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contig364	20314	.	T	C	11392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.442;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.197;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,286:544:99:11421,0,10071
contig364	20349	.	C	T	8155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.018;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=5.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.182;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.464;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,265:556:99:8184,0,9253
contig364	20383	.	A	G	11731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=-1.052;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.050;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,292:554:99:11760,0,10367
contig364	20385	.	A	G	12064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=-0.812;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.644;QD=21.58;ReadPosRankSum=-1.846;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,295:559:99:12093,0,10449
contig364	20389	.	C	T	12014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.836;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.065;QD=21.08;ReadPosRankSum=-2.628;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,305:570:99:12043,0,10255
contig364	20411	.	T	C	9236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=1.035;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.974;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,296:575:99:9265,0,8859
contig364	20426	.	T	C	9795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-3.541;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.711;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.996;SOR=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,312:597:99:9824,0,9048
contig364	21497	.	C	T	12997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.329;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.576;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,340:681:99:13026,0,12757
contig364	21514	.	T	C	12967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.269;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.376;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,326:666:99:12996,0,13536
contig364	21515	.	AC	A	10226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.640;ClippingRankSum=1.013;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.118;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,325:669:99:10264,0,13760
contig364	21518	.	C	CT	12843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.080;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.081;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,324:664:99:12881,0,13493
contig364	21617	.	C	T	10213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.296;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.273;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.381;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,268:589:99:10242,0,12929
contig364	21622	.	G	C	10532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-0.035;DP=628;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.102;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,267:594:99:10561,0,13226
contig364	21641	.	T	A	9315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=-1.878;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.860;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,255:588:99:9344,0,12982
contig364	21772	.	C	T	12536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.988;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.699;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,329:681:99:12565,0,13907
contig364	21782	.	A	G	13626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=0.866;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.653;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:361,343:704:99:13655,0,14525
contig364	21784	.	C	T	13648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.058;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.534;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,339:704:99:13677,0,14411
contig364	21787	.	C	T	13119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.216;DP=748;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.107;QD=18.58;ReadPosRankSum=-1.191;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:367,339:706:99:13148,0,14418
contig364	21870	.	C	T	14048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.054;DP=748;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.579;QD=19.79;ReadPosRankSum=-2.491;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,354:710:99:14077,0,14135
contig364	21879	.	C	A	14818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.202;DP=751;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.004;QD=20.78;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,357:713:99:14847,0,14168
contig364	21888	.	A	T	14536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=2.314;DP=762;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.994;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,361:725:99:14565,0,15036
contig364	21890	.	C	T	14188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=-0.503;DP=775;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.276;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,363:739:99:14217,0,14643
contig364	22053	.	CCAT	C	12352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.369;DP=839;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-2.004;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,330:676:99:12390,0,13189
contig364	22169	.	T	C	13053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.229;DP=728;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.427;QD=18.95;ReadPosRankSum=-1.284;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,345:689:99:13082,0,12701
contig364	22184	.	G	A	12664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.791;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.831;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,333:653:99:12693,0,12202
contig364	22265	.	G	A	11973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=1.071;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.360;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.687;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,320:635:99:12002,0,11895
contig364	22296	.	T	A	12484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=1.712;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.321;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,346:676:99:12513,0,12039
contig364	22397	.	C	G	8532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=2.143;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-2.404;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,289:603:99:8561,0,11981
contig364	22412	.	AC	A	6676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.578;ClippingRankSum=-0.511;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=2.573;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.734;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,231:584:99:6714,0,14598
contig364	22414	.	TCTCCTTTTCCATTTCCTTAC	T	6012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.757;ClippingRankSum=-1.835;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=1.571;QD=10.37;ReadPosRankSum=2.201;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,225:580:99:6050,0,14691
contig364	22456	.	C	T	10406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;ClippingRankSum=-0.122;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-0.318;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.807;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,277:556:99:10435,0,10774
contig364	22848	.	C	T	13605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.917;DP=792;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=3.950;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:413,353:766:99:13634,0,16166
contig364	22853	.	CTCTTCT	C	13740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.423;DP=817;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=1.044;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.596;SOR=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:432,354:786:99:13778,0,17508
contig364	22873	.	TCTTCTTTTCCTTCCTTTCCTTTTC	T	13405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-1.331;DP=877;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-1.965;QD=16.04;ReadPosRankSum=3.138;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:493,343:836:99:13443,0,20486
contig364	22908	.	T	C	13316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=1.553;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-1.058;QD=18.97;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,337:702:99:13345,0,14616
contig364	22913	.	C	A	13047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.154;DP=738;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-0.593;QD=18.69;ReadPosRankSum=-1.968;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:365,333:698:99:13076,0,14228
contig364	22954	.	T	C	9598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.379;DP=706;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.088;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.425;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,307:656:99:9627,0,10985
contig364	22995	.	C	T	10411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.661;DP=670;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.610;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,330:612:99:10440,0,8972
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contig364	24095	.	T	C	9274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.904;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.402;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,304:620:99:9303,0,10224
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contig364	25220	.	A	C	8977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=-1.175;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.988;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.912;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,306:631:99:9006,0,9943
contig364	25653	.	T	C	10634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.962;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.003;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.452;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,277:568:99:10663,0,11083
contig364	25670	.	G	A	11360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.980;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.221;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,285:574:99:11389,0,11482
contig364	25672	.	T	A	11232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=0.393;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.070;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,281:568:99:11261,0,11314
contig364	25787	.	T	A	10380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.875;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=0.284;QD=23.81;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:172,264:436:99:10409,0,22940
contig364	25799	.	G	GGAA	11223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.833;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.881;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,281:456:99:11261,0,23219
contig364	25801	.	ATTTTT	A	11225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-1.031;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.587;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,279:450:99:11263,0,23216
contig364	26335	.	C	T	10077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.416;DP=677;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.475;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,323:659:99:10106,0,12385
contig364	26366	.	A	G	12933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-1.225;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.141;QD=19.16;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,334:675:99:12962,0,12628
contig364	26375	.	C	A	13230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.081;ClippingRankSum=-1.679;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.211;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,328:665:99:13259,0,13861
contig364	26396	.	T	C	12858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.423;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.857;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,316:633:99:12887,0,12825
contig364	26426	.	G	A	11847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=1.384;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.667;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.283;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,326:640:99:11876,0,11873
contig364	26738	.	A	T	7106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.224;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.831;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,244:522:99:7135,0,10650
contig364	26843	.	C	T	7069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.661;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.279;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,240:521:99:7098,0,8807
contig364	26967	.	T	C	8341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.143;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.137;QD=17.34;ReadPosRankSum=3.484;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,221:481:99:8370,0,17167
contig364	26976	.	T	C	8171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.248;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.563;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,214:466:99:8200,0,16846
contig364	27197	.	T	G	8145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=1.020;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.816;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,214:469:99:8174,0,9887
contig364	27200	.	G	A	8182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-0.007;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.009;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,214:466:99:8211,0,9836
contig364	27227	.	C	G	7724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-1.213;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.415;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,244:462:99:7753,0,6621
contig364	27257	.	T	A	6646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.835;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.643;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.687;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,218:485:99:6675,0,8324
contig364	27295	.	A	T	8856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-0.748;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.003;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,282:539:99:8885,0,7675
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contig364	27454	.	T	C	10126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.915;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.619;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,265:570:99:10155,0,11878
contig364	27461	.	C	T	10079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=-0.333;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.035;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,266:571:99:10108,0,11867
contig364	27674	.	G	A	11446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.842;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.265;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.720;SOR=0.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,300:613:99:11475,0,12130
contig364	27686	.	A	G	11598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.752;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.379;QD=18.41;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,298:630:99:11627,0,13333
contig364	27710	.	T	C	9934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=1.402;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.364;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,323:632:99:9963,0,11540
contig364	28017	.	C	T	9012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.312;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.758;QD=16.27;ReadPosRankSum=-2.191;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,286:554:99:9041,0,8561
contig364	28130	.	C	T	12874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=-0.987;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.092;QD=21.90;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,326:588:99:12903,0,10235
contig364	28132	.	A	G	12911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-0.448;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.240;QD=21.66;ReadPosRankSum=-1.151;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,324:596:99:12940,0,10232
contig364	28305	.	AT	A	4960.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.024;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.687;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,228:460:99:4998,0,5008
contig364	28354	.	G	A	7115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-1.131;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.970;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,237:479:99:7144,0,7430
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contig364	28431	.	GGAAGGTGGACTT	G	7179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=1.788;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-0.921;QD=15.15;ReadPosRankSum=2.087;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,205:474:99:7217,0,10314
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contig364	29859	.	GGGCACTTCTTCC	G	8551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;ClippingRankSum=-1.547;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.477;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,221:466:99:8589,0,9638
contig364	29891	.	T	C	10175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.010;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.324;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.688;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,254:506:99:10204,0,9812
contig364	29896	.	C	T	9908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.463;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.370;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,259:503:99:9937,0,9477
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contig364	31869	.	GCATTCTACATATACATAA	G	6354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=-0.265;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-2.198;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,179:407:99:6392,0,8766
contig364	31957	.	T	G	10153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.784;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-2.376;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,273:561:99:10182,0,11070
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contig364	32016	.	A	G	10093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.193;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.695;QD=17.68;ReadPosRankSum=-4.279;SOR=1.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,251:571:99:10122,0,13227
contig364	32019	.	T	C	9988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.501;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.625;QD=17.81;ReadPosRankSum=-4.280;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,246:561:99:10017,0,12942
contig364	32036	.	A	AAGAGAC	10223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=1.266;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.535;QD=17.84;ReadPosRankSum=-3.207;SOR=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,248:573:99:10261,0,13380
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contig364	32069	.	G	A	10867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=-0.420;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.495;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,275:618:99:10896,0,13718
contig364	32072	.	C	T	10629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.126;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.197;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,268:606:99:10658,0,13510
contig364	32125	.	G	A	11268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.806;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.783;QD=18.44;ReadPosRankSum=-1.586;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,299:611:99:11297,0,11921
contig364	32143	.	T	A	12037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.702;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-2.099;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,301:604:99:12066,0,12163
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contig364	32163	.	C	T	11566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.239;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.553;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,285:558:99:11595,0,11325
contig364	32166	.	A	G	11598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.786;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.662;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.661;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,288:570:99:11627,0,11256
contig364	32178	.	G	A	11489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.362;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.634;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.940;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,298:572:99:11518,0,10616
contig364	32211	.	C	T	11316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.159;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.489;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,285:572:99:11345,0,11359
contig364	32213	.	G	A	11556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-0.500;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.579;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,285:568:99:11585,0,11509
contig364	32214	.	G	A	11663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.875;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.760;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,286:569:99:11692,0,11405
contig364	32227	.	G	A	12249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.244;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.879;QD=20.55;ReadPosRankSum=-2.199;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,304:596:99:12278,0,11609
contig364	32235	.	G	C	11472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=-1.818;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.895;QD=19.45;ReadPosRankSum=-2.415;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,300:590:99:11501,0,11307
contig364	32267	.	A	G	11777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=1.607;DP=686;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.536;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,316:643:99:11806,0,12658
contig364	32282	.	A	G	11890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-0.816;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.407;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,320:658:99:11919,0,12679
contig364	32315	.	C	T	10275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-1.546;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.167;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,332:668:99:10304,0,10473
contig364	32406	.	C	T	12958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.683;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-0.609;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,338:679:99:12987,0,13208
contig364	32417	.	T	C	12523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.003;ClippingRankSum=-1.495;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.022;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.118;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,306:646:99:12552,0,13929
contig364	32424	.	C	T	12865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.239;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=3.916;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,313:658:99:12894,0,13996
contig364	32445	.	C	T	12651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-0.309;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-2.326;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,317:648:99:12680,0,13533
contig364	32456	.	CAGATGGGGGAGAGAGAAATATTGGATTGTT	C	11492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.991;ClippingRankSum=0.951;DP=762;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-2.074;QD=15.83;ReadPosRankSum=-2.735;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:413,313:726:99:11530,0,16324
contig364	32573	.	A	T	10142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.164;DP=716;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.173;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,328:681:99:10171,0,11033
contig364	32664	.	A	G	9947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.462;DP=672;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.215;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,316:648:99:9976,0,10420
contig364	32934	.	G	A	9538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=1.349;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.882;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.117;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,306:634:99:9567,0,12162
contig364	33019	.	TATCATCGTTACCGTCTTCTTC	T	3273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;QD=30.28;SOR=1.310	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3311,309,0
contig364	33407	.	C	T	11512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.730;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.375;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,307:641:99:11541,0,13808
contig364	33419	.	T	C	10950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.362;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.178;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.761;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,289:623:99:10979,0,13893
contig364	33893	.	C	T	11530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-0.938;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.454;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.346;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,297:615:99:11559,0,12588
contig364	33895	.	A	G	11530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.559;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.583;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,296:619:99:11559,0,12588
contig364	33930	.	T	C	9082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=1.965;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.033;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.376;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,302:587:99:9111,0,8742
contig364	34052	.	A	C	10749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=-1.057;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.076;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,280:564:99:10778,0,11030
contig364	34056	.	G	C	10595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=-0.147;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.858;QD=19.02;ReadPosRankSum=1.014;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,268:557:99:10624,0,11270
contig364	34204	.	C	T	9352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.675;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.176;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.388;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,239:489:99:9381,0,9801
contig364	34210	.	GCA	G	10133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-1.159;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.779;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,249:501:99:10171,0,10292
contig364	34213	.	A	AGT	10100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.029;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.059;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,252:503:99:10138,0,10072
contig364	34224	.	T	A	10223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.248;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.068;QD=20.33;ReadPosRankSum=-1.399;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,261:503:99:10252,0,9667
contig364	34227	.	T	C	10314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.042;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.270;QD=21.01;ReadPosRankSum=-1.758;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,255:491:99:10343,0,9660
contig364	34231	.	T	A	9867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.143;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.921;QD=20.26;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,251:487:99:9896,0,9322
contig364	34355	.	TATTTACAGGTGTATTTAAGC	T	9101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=-0.112;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.174;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,247:539:99:9139,0,11117
contig364	34581	.	A	G	10123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.657;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.464;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,271:572:99:10152,0,12133
contig364	34590	.	G	T	9912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=2.814;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.794;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,263:562:99:9941,0,11932
contig364	34637	.	G	GCA	10141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.472;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.598;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,261:534:99:10179,0,10562
contig364	34687	.	G	A	9906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.923;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.423;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.784;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,264:509:99:9935,0,9096
contig364	34705	.	C	T	9597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.104;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.422;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.333;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,255:503:99:9626,0,9137
contig364	34857	.	G	A	7693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.161;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.867;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,258:535:99:7722,0,8969
contig364	34877	.	T	C	8165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.004;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.432;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,268:547:99:8194,0,8902
contig364	34934	.	C	T	7666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=-0.417;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.636;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.105;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,240:501:99:7695,0,8709
contig364	34951	.	A	G	9016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.135;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.454;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,229:484:99:9045,0,10345
contig364	34953	.	A	G	9099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.250;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.689;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,233:492:99:9128,0,10379
contig364	34957	.	G	A	8863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.817;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.214;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,227:486:99:8892,0,10238
contig364	35864	.	C	T	7654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.378;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.260;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.378;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,251:500:99:7683,0,7360
contig364	36102	.	A	G	12697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.385;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.108;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.959;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,338:678:99:12726,0,12726
contig364	36110	.	CTCACCA	C	9777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=1.874;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.733;QD=14.46;ReadPosRankSum=2.236;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,324:676:99:9815,0,13995
contig364	36132	.	T	C	12472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-1.448;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.302;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,317:642:99:12501,0,12979
contig364	36133	.	T	C	12436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.044;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.945;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,319:647:99:12465,0,12898
contig364	36194	.	T	TA	11663.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.071;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.668;QD=20.11;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,294:580:99:11701,0,11236
contig364	36197	.	A	T	12207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.270;ClippingRankSum=-1.501;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.567;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,292:580:99:12236,0,11664
contig364	36200	.	A	G	12049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.479;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.076;QD=20.42;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,300:590:99:12078,0,11563
contig364	36212	.	G	T	12588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=-0.428;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.503;QD=21.02;ReadPosRankSum=-2.375;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,311:599:99:12617,0,11469
contig364	36225	.	T	C	12219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.032;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.742;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.298;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,326:628:99:12248,0,11260
contig364	37339	.	T	C	8806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.333;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.413;QD=17.83;ReadPosRankSum=2.709;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,233:494:99:8835,0,17034
contig364	37350	.	A	G	8751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=-0.044;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.101;QD=17.82;ReadPosRankSum=2.298;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,232:491:99:8780,0,17039
contig364	37709	.	C	T	14806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.726;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.808;QD=22.10;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,378:670:99:14835,0,11206
contig364	37715	.	A	G	14784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.228;DP=685;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.359;QD=22.13;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,371:668:99:14813,0,11230
contig364	37800	.	C	T	9680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.899;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.358;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.989;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,302:544:99:9709,0,8806
contig364	37804	.	GT	G	11606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.391;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.991;QD=23.17;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,300:501:99:11644,0,4600
contig364	37856	.	A	C	18052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-0.194;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=0.873;QD=31.50;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,449:453:99:18081,1254,0
contig364	37876	.	A	C	7968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.017;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.236;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.581;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,254:484:99:7997,0,6726
contig364	38082	.	C	A	8892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.213;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.042;QD=18.60;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,231:478:99:8921,0,9446
contig364	38092	.	C	T	9066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-1.167;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.819;QD=18.77;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,234:483:99:9095,0,9439
contig364	38148	.	G	A	7941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=1.310;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.714;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,202:409:99:7970,0,7820
contig364	38158	.	A	G	8277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-1.070;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=4.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.525;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.856;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,221:436:99:8306,0,7989
contig364	38521	.	T	C	12162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.670;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.456;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,310:619:99:12191,0,11790
contig364	38530	.	C	T	12286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.239;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.467;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,320:619:99:12315,0,11526
contig364	39307	.	C	T	10275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-2.012;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.865;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.625;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,273:603:99:10304,0,12984
contig364	39310	.	G	A	10350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.178;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.463;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,267:593:99:10379,0,12974
contig364	40020	.	G	A	11110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.401;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.293;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,286:616:99:11139,0,17814
contig364	40026	.	T	C	11428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.300;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.311;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,288:624:99:11457,0,18258
contig364	40035	.	G	A	11574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.203;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.651;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,285:610:99:11603,0,17567
contig364	40054	.	T	C	10991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=1.388;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.519;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,268:582:99:11020,0,14755
contig364	40056	.	G	A	10514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.445;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.259;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.368;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,273:584:99:10543,0,14093
contig364	40572	.	C	T	11456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.273;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.262;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,300:638:99:11485,0,13822
contig364	40581	.	G	A	12066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=2.288;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.184;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,306:661:99:12095,0,14287
contig364	40590	.	T	C	11283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.576;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.884;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,300:649:99:11312,0,13488
contig364	40605	.	G	A	9121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.324;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=8.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.216;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.267;SOR=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:348,300:648:99:9150,0,10822
contig364	40617	.	T	C	9390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.005;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.110;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,311:664:99:9419,0,10949
contig364	41060	.	G	A	14317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.093;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.712;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.965;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,364:685:99:14346,0,13452
contig364	41064	.	C	T	14333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=-0.153;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.752;QD=20.89;ReadPosRankSum=1.403;SOR=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,367:686:99:14362,0,13437
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contig364	41933	.	C	T	13208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=2.307;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.545;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.113;SOR=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,349:699:99:13237,0,13253
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contig364	42020	.	T	C	11258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.176;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.045;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,296:635:99:11287,0,13230
contig364	42102	.	G	GTTTTTT	5043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.100;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=23.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-0.348;QD=13.34;ReadPosRankSum=-3.045;SOR=1.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,166:378:99:5081,0,7081
contig364	42104	.	T	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.578;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=38.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=3.017;QD=3.93;ReadPosRankSum=9.875;SOR=1.319	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,107:358:99:1435,0,8865
contig364	42221	.	C	T	7041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=-0.945;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.875;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,253:554:99:7070,0,9194
contig364	42345	.	A	C	12287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.487;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.270;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.870;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,318:650:99:12316,0,13212
contig364	42347	.	A	T	12287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-1.054;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.774;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.520;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,316:654:99:12316,0,13213
contig364	42543	.	C	CAT	12297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.026;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.310;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:375,324:699:99:12335,0,15034
contig364	42567	.	G	A	12063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.297;DP=749;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.567;QD=16.71;ReadPosRankSum=2.760;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,386:722:99:12092,0,12320
contig364	42858	.	G	A	13104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.331;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.412;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,348:672:99:13133,0,12240
contig364	42873	.	G	A	13383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.175;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.077;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,334:661:99:13412,0,13069
contig364	42876	.	C	T	13017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.610;DP=668;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.310;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,325:645:99:13046,0,12706
contig364	43188	.	A	G	9696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.442;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.627;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,312:598:99:9725,0,8705
contig364	43248	.	A	C	8790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.094;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.866;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,284:602:99:8819,0,9837
contig364	43751	.	G	A	8252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=1.539;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.248;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,209:435:99:8281,0,8959
contig364	43754	.	A	G	8569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.424;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.735;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,215:449:99:8598,0,9313
contig364	43756	.	G	A	8719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.016;DP=485;ExcessHet=3.0103;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.673;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,214:448:99:8748,0,9471
contig364	43764	.	G	A	8390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=1.443;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.134;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.184;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,222:462:99:8419,0,9271
contig364	43779	.	A	G	8249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.552;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.634;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,249:506:99:8278,0,8258
contig364	44090	.	G	T	9146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.867;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.300;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,235:493:99:9175,0,15780
contig364	44092	.	T	C	9262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=1.089;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.834;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,232:484:99:9291,0,15897
contig364	44097	.	G	A	9223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.262;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.696;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,237:478:99:9252,0,15600
contig364	44099	.	CACA	C	9356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=1.661;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.067;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,238:490:99:9394,0,15479
contig364	44124	.	C	T	8020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=1.237;DP=440;ExcessHet=3.0103;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.979;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,215:409:99:8049,0,9799
contig364	44285	.	CG	C	6477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.485;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=7.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.205;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,211:480:99:6515,0,10859
contig364	44290	.	A	C	6808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.151;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=5.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.070;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.913;SOR=1.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,222:497:99:6837,0,11157
contig364	44293	.	A	ACACGT	9385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=-1.626;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.355;QD=18.22;ReadPosRankSum=-2.333;SOR=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,238:515:99:9423,0,11120
contig364	44305	.	G	A	9214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.269;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.595;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.588;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,243:518:99:9243,0,10812
contig364	44306	.	T	C	9220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=-1.070;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.767;QD=17.77;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,244:519:99:9249,0,10730
contig364	44332	.	A	C	7237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.832;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.830;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,237:514:99:7266,0,10785
contig364	44333	.	T	G	9166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-0.852;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.227;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,240:513:99:9195,0,8317
contig364	44347	.	C	T	7728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.062;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=3.694;QD=14.72;ReadPosRankSum=-2.129;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,252:525:99:7757,0,8501
contig364	44368	.	G	A	7640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-1.285;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.264;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.859;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,263:546:99:7669,0,8610
contig364	44472	.	A	AG	5275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=-0.412;DP=453;ExcessHet=3.0103;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.032;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.200;SOR=1.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,207:401:99:5313,0,4864
contig364	44505	.	A	G	5541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-2.197;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=4.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-3.069;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.506;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,196:400:99:5570,0,5968
contig364	44558	.	CACAGAA	C	9104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.823;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=17.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.645;QD=25.01;ReadPosRankSum=1.959;SOR=0.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,225:364:99:9142,0,5205
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contig364	44589	.	A	C	9647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=-0.090;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=3.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.698;QD=23.36;ReadPosRankSum=8.502;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,233:413:99:9676,0,7160
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contig364	44984	.	TGA	T	10875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-1.124;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.650;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,280:608:99:10913,0,12999
contig364	44990	.	T	TC	10876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.074;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.407;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,267:589:99:10914,0,13254
contig364	44999	.	G	A	11461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.794;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.063;QD=19.10;ReadPosRankSum=-2.284;SOR=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,286:600:99:11490,0,12795
contig364	45005	.	C	T	11541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-1.870;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.867;QD=18.50;ReadPosRankSum=-1.366;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,291:624:99:11570,0,13415
contig364	45016	.	T	C	11229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.067;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.042;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,287:623:99:11258,0,13688
contig364	45024	.	A	T	10604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.208;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.413;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:347,272:619:99:10633,0,14148
contig364	45026	.	T	C	10654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=-1.184;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.654;QD=17.30;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,270:616:99:10683,0,14148
contig364	45071	.	A	AC	9811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=1.082;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.226;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,248:561:99:9849,0,12954
contig364	45091	.	C	G	10330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.670;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-0.419;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,263:574:99:10359,0,12834
contig364	45093	.	G	A	10324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=1.168;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-2.183;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.565;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,252:563:99:10353,0,12918
contig364	45097	.	G	A	7094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.918;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-4.281;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,231:548:99:7123,0,13031
contig364	45098	.	C	G	7222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.760;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-2.269;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.637;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,233:549:99:7251,0,12932
contig364	45099	.	C	T	7289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.238;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-2.732;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.554;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,234:556:99:7318,0,13010
contig364	45110	.	G	A	9703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=-0.317;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-3.027;QD=17.68;ReadPosRankSum=-4.924;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,245:549:99:9732,0,12252
contig364	45132	.	A	ACTTCACTGATCCCATTACGAT	12401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=-1.335;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=0.583;QD=23.36;ReadPosRankSum=-8.427;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,248:531:99:12439,0,11262
contig364	45141	.	C	A	9781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.510;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-1.707;QD=18.18;ReadPosRankSum=-5.941;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,254:538:99:9810,0,11469
contig364	45146	.	C	T	9751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=1.473;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=1.214;QD=17.96;ReadPosRankSum=-4.322;SOR=0.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,259:543:99:9780,0,11291
contig364	45310	.	C	T	9187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.187;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.184;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,294:576:99:9216,0,8764
contig364	45665	.	T	C	9677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=1.414;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=7.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.769;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.987	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,266:603:99:9706,0,13120
contig364	45684	.	A	G	10336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.070;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.254;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.653;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,272:616:99:10365,0,13371
contig364	45941	.	T	C	10340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.835;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.040;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.644;SOR=1.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,328:645:99:10369,0,9736
contig364	46136	.	G	A	11114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.077;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.205;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,293:585:99:11143,0,11470
contig364	46151	.	A	G	11067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.525;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.354;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,294:606:99:11096,0,12089
contig364	46464	.	C	T	3645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.310;ClippingRankSum=1.296;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=5.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.758;QD=10.27;ReadPosRankSum=-4.453;SOR=0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,101:355:99:3674,0,10269
contig364	46468	.	G	A	3878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.684;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=8.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.255;QD=10.43;ReadPosRankSum=-3.912;SOR=0.413	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,117:372:99:3907,0,10763
contig364	46476	.	C	A	4747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.374;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.714;QD=12.46;ReadPosRankSum=-2.415;SOR=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,137:381:99:4776,0,8050
contig364	46571	.	C	CA	5229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.155;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.310;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,239:486:99:5267,0,9372
contig364	46572	.	A	G	4981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.660;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.842;QD=10.00;ReadPosRankSum=3.180;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,229:498:99:5010,0,10157
contig364	46656	.	A	G	11321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.142;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.340;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.862;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,298:588:99:11350,0,11257
contig364	46664	.	C	T	11173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.705;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.910;QD=18.72;ReadPosRankSum=2.063;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,295:597:99:11202,0,11512
contig364	46697	.	C	T	9670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.666;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.163;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,308:594:99:9699,0,8572
contig364	46746	.	G	T	11931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-0.008;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.182;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,307:599:99:11960,0,11293
contig364	46755	.	T	C	12490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=-0.235;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.053;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,309:593:99:12519,0,11322
contig364	46756	.	T	C	12490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.083;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=3.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.055;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,311:594:99:12519,0,11214
contig364	46767	.	C	T	12289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.241;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.331;QD=21.23;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,305:579:99:12318,0,11148
contig364	46772	.	C	T	12199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=1.811;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.871;QD=20.82;ReadPosRankSum=0.557;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,301:586:99:12228,0,11823
contig364	46784	.	C	T	11652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-1.013;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.266;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,295:591:99:11681,0,11793
contig364	46800	.	A	C	10926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.225;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.232;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,275:552:99:10955,0,10980
contig364	46859	.	A	C	10037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.253;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.304;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,259:576:99:10066,0,12903
contig364	46863	.	T	C	9830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.379;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.380;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,260:590:99:9859,0,12869
contig364	46890	.	A	G	8645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.561;ClippingRankSum=0.039;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.090;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,284:624:99:8674,0,10298
contig364	47068	.	A	G	8162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=1.117;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.066;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,274:541:99:8191,0,7284
contig364	47106	.	A	G	7817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=-1.591;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.861;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.462;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,261:530:99:7846,0,7500
contig364	47245	.	T	C	7434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.866;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.029;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.008;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,193:389:99:7463,0,7652
contig364	47246	.	G	A	7434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.646;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.678;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.378;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,193:389:99:7463,0,7652
contig364	47336	.	T	A	7220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-1.179;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.547;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.688;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,190:389:99:7249,0,8661
contig364	47345	.	A	G	6973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.235;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.460;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,182:380:99:7002,0,8659
contig364	47450	.	C	T	8219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.858;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.092;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:208,223:431:99:8248,0,7885
contig364	47469	.	C	T	7874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.707;DP=447;ExcessHet=3.0103;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.210;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.291;SOR=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:210,215:425:99:7903,0,7943
contig364	47509	.	A	G	6202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.187;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.548;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,203:418:99:6231,0,6654
contig364	48203	.	C	T	7844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-1.143;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.325;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,259:497:99:7873,0,7101
contig364	48590	.	G	A	10168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.944;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.354;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,267:563:99:10197,0,11404
contig364	48598	.	C	T	10002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.463;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.011;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.391;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,252:540:99:10031,0,11754
contig364	48608	.	G	T	9635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-0.220;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.047;QD=18.53;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,252:520:99:9664,0,10785
contig364	49088	.	G	A	11216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=1.692;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.100;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,288:551:99:11245,0,10066
contig364	49096	.	G	T	11442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.107;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.865;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,283:547:99:11471,0,10533
contig364	49110	.	A	G	11566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.848;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.915;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.969;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,278:548:99:11595,0,10740
contig364	49129	.	G	A	11257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=1.153;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.149;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,277:533:99:11286,0,10386
contig364	49137	.	C	T	11572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=-0.539;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.382;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,282:535:99:11601,0,10071
contig364	49158	.	T	G	11854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.594;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.300;QD=22.49;ReadPosRankSum=-1.354;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,290:527:99:11883,0,11139
contig364	49160	.	C	T	12034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=-0.647;DP=553;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.408;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,288:529:99:12063,0,11041
contig364	49162	.	A	G	11854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-0.317;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.425;QD=22.24;ReadPosRankSum=-1.296;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,294:533:99:11883,0,11417
contig364	49164	.	T	C	11933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=-0.107;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.248;QD=22.43;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,293:532:99:11962,0,11355
contig364	49178	.	A	G	10979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.238;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.287;QD=20.60;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,281:533:99:11008,0,11289
contig364	49207	.	A	G	9103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-1.816;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.191;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,279:521:99:9132,0,7699
contig364	49244	.	C	T	11154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-0.749;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.267;QD=19.50;ReadPosRankSum=-2.145;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,301:572:99:11183,0,11152
contig364	49263	.	T	A	10319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.022;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.566;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,267:530:99:10348,0,9936
contig364	49293	.	A	G	7814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=-0.287;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.478;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,263:542:99:7843,0,8618
contig364	49311	.	TAAAA	T	10554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=-0.491;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.036;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,276:558:99:10592,0,10676
contig364	49326	.	T	G	11527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.905;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.906;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,311:596:99:11556,0,11332
contig364	49652	.	T	C	9289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.457;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.716;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,305:611:99:9318,0,9705
contig364	49730	.	G	A	12344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.632;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.242;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,326:657:99:12373,0,12713
contig364	49749	.	A	G	12950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=-0.148;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.404;QD=19.47;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,323:665:99:12979,0,13676
contig364	49752	.	G	T	13045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.316;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=3.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.109;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,325:659:99:13074,0,13459
contig364	49763	.	A	T	12985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-0.406;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.098;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,338:667:99:13014,0,12857
contig364	49849	.	T	A	14430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=1.593;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.964;QD=20.21;ReadPosRankSum=2.929;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,369:714:99:14459,0,13319
contig364	49855	.	C	T	14502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.345;DP=731;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.463;QD=20.72;ReadPosRankSum=2.130;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,365:700:99:14531,0,13477
contig364	49874	.	C	T	14258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=-1.887;DP=757;ExcessHet=3.0103;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.510;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,375:727:99:14287,0,13086
contig364	50011	.	TGAGGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAG	T	13608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.258;ClippingRankSum=0.834;DP=924;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=1.748;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.181;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:449,370:819:99:13646,0,17255
contig364	50817	.	C	A	9809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=-0.659;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.106;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,309:570:99:9838,0,7680
contig364	50849	.	A	G	9503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-1.155;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.861;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.697;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,296:555:99:9532,0,8227
contig364	50892	.	T	C	11968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.275;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.491;QD=20.32;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,317:589:99:11997,0,10310
contig364	50900	.	TAAAACAGAATGATAAATGAACAAAACAAAATGATAAATGAAC	T	12331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.302;ClippingRankSum=0.174;DP=785;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-1.818;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:424,317:741:99:12369,0,17083
contig364	50959	.	A	T	13911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.872;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=5.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=0.470;QD=20.89;ReadPosRankSum=-5.981;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,338:666:99:13940,0,12992
contig364	50969	.	A	G	13656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=-0.087;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=5.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=0.838;QD=20.82;ReadPosRankSum=-8.559;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,332:656:99:13685,0,13055
contig364	50974	.	T	C	13647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.494;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-1.126;QD=20.55;ReadPosRankSum=-8.299;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,338:664:99:13676,0,13074
contig364	50978	.	G	A	13201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.990;ClippingRankSum=-0.460;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-0.720;QD=19.85;ReadPosRankSum=-7.363;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,334:665:99:13230,0,12887
contig364	51425	.	TGAAGGA	T	8808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.562;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.113;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.775;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,236:542:99:8846,0,13114
contig364	51538	.	G	A	7404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=1.220;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.551;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.297;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,238:515:99:7433,0,9064
contig364	51551	.	C	G	7154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.615;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.213;QD=13.84;ReadPosRankSum=-3.287;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,240:517:99:7183,0,8903
contig364	51555	.	C	CT	6497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.622;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.312;QD=14.41;ReadPosRankSum=-2.166;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,197:451:99:6535,0,10069
contig364	51562	.	A	T	8354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.907;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.582;QD=16.68;ReadPosRankSum=-2.453;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,229:501:99:8383,0,10281
contig364	51655	.	C	T	9343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.728;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.119;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,242:525:99:9372,0,11141
contig364	51661	.	A	G	9440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.595;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.379;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.285;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,244:531:99:9469,0,11190
contig364	51760	.	T	G	11894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.329;ClippingRankSum=-0.315;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.004;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,308:612:99:11923,0,11981
contig364	51761	.	GAA	G	12023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=-1.048;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.233;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.389;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,310:623:99:12061,0,12245
contig364	51777	.	T	C	12827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.966;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.992;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.840;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,337:665:99:12856,0,12631
contig364	51987	.	C	T	10575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=1.424;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.838;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,282:546:99:10604,0,13226
contig364	52005	.	A	G	10227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.580;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.906;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,275:532:99:10256,0,12866
contig364	52422	.	T	C	12971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.746;ClippingRankSum=-0.425;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.837;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:353,342:695:99:13000,0,12935
contig364	52440	.	G	A	12717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.260;DP=753;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.650;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:376,346:722:99:12746,0,13963
contig364	53253	.	T	C	7203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.466;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.518;QD=14.52;ReadPosRankSum=2.013;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,241:496:99:7232,0,8090
contig364	53305	.	CT	C	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.633;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=8.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=0.613;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.837;SOR=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:75,52:127:99:477,0,1269
contig364	53425	.	T	C	6162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.406;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=4.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.613;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.992;SOR=0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,174:375:99:6191,0,7723
contig364	53444	.	C	T	6572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.240;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.482;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,167:365:99:6601,0,8028
contig364	53455	.	A	G	6636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.524;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.397;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,172:374:99:6665,0,8420
contig364	53478	.	G	A	7802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.576;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.234;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,193:427:99:7831,0,9631
contig364	53497	.	T	G	7636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.852;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.349;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.389;SOR=0.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,188:420:99:7665,0,9601
contig364	53508	.	T	C	7575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.476;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.818;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.284;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,194:428:99:7604,0,9397
contig364	53511	.	C	T	7455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=1.948;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.792;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.223;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,194:431:99:7484,0,9302
contig364	53551	.	G	C	6677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.419;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.340;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,179:414:99:6706,0,8952
contig364	53568	.	C	G	7871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.471;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.402;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,198:438:99:7900,0,9961
contig364	53569	.	AT	A	8355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-2.387;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=7.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.706;QD=20.89;ReadPosRankSum=-3.166;SOR=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,209:400:99:8393,0,3861
contig364	53571	.	T	A	7613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.471;ClippingRankSum=0.642;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.413;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.896;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,194:448:99:7642,0,10307
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contig364	55196	.	C	T	7078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=-0.356;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.982;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.980;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,286:612:99:7107,0,10229
contig364	55628	.	G	A	10609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.042;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.578;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,280:539:99:10638,0,10392
contig364	55640	.	G	A	10466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.640;ClippingRankSum=-0.459;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.666;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,273:539:99:10495,0,10128
contig364	55817	.	T	A	11158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.933;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.698;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,288:509:99:11187,0,8430
contig364	55827	.	T	A	11511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.388;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.079;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,280:501:99:11540,0,8683
contig364	55829	.	A	G	11339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.136;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=4.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.289;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,278:495:99:11368,0,8498
contig364	55838	.	T	G	11068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.493;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.197;QD=22.50;ReadPosRankSum=0.399;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,279:492:99:11097,0,7928
contig364	55963	.	T	TA	8616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=0.750;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.848;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.705;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,219:456:99:8654,0,9224
contig364	55967	.	G	A	8851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.824;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.152;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,232:478:99:8880,0,9364
contig364	56260	.	C	G	9774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.372;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.443;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,257:526:99:9803,0,10358
contig364	56266	.	G	A	9863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.682;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.492;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.419;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,259:531:99:9892,0,10513
contig364	56413	.	A	G	13086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.330;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.151;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,351:687:99:13115,0,14068
contig364	56430	.	G	C	13663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.206;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.883;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,343:683:99:13692,0,15065
contig364	56434	.	G	A	13237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.560;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.756;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,336:672:99:13266,0,14665
contig364	56502	.	T	C	12361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.785;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.179;QD=18.42;ReadPosRankSum=2.238;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:345,326:671:99:12390,0,18721
contig364	56514	.	C	T	12720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.237;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.468;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,338:678:99:12749,0,18701
contig364	56562	.	G	A	11704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.049;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.515;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.689;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,302:615:99:11733,0,12244
contig364	56574	.	G	A	12220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.717;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.079;QD=20.33;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,298:601:99:12249,0,12155
contig364	56575	.	A	C	12283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.897;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.812;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.464;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,297:601:99:12312,0,12134
contig364	56582	.	A	G	12131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.010;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.127;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.665;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,304:607:99:12160,0,12366
contig364	56587	.	T	A	12142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.432;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.525;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,316:618:99:12171,0,12226
contig364	56610	.	A	T	11294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.157;ClippingRankSum=1.091;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.709;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,288:618:99:11323,0,13202
contig364	56617	.	A	G	11354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.389;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.498;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,293:614:99:11383,0,13011
contig364	56619	.	T	C	11561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-1.038;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.551;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,290:613:99:11590,0,13038
contig364	56620	.	T	C	11606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.301;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.091;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,291:611:99:11635,0,12993
contig364	56622	.	C	A	11730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=-1.231;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.115;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,296:616:99:11759,0,12737
contig364	56624	.	A	G	11610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.765;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.085;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,301:623:99:11639,0,12662
contig364	56655	.	C	T	11786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-2.003;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.414;QD=18.74;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,305:629:99:11815,0,12500
contig364	56665	.	C	A	12265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.718;ClippingRankSum=-0.260;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.841;QD=19.47;ReadPosRankSum=-1.679;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,303:630:99:12294,0,13648
contig364	56679	.	C	G	11877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;ClippingRankSum=-0.217;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.437;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,297:637:99:11906,0,13976
contig364	56687	.	A	T	11724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.530;ClippingRankSum=-0.098;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.590;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,289:627:99:11753,0,13778
contig364	56688	.	G	A	11763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.335;ClippingRankSum=0.649;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.314;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,286:623:99:11792,0,13817
contig364	56693	.	AAG	A	11044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.090;ClippingRankSum=-1.247;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.998;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,277:616:99:11082,0,13827
contig364	56699	.	A	G	10765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=-0.841;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.716;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,279:620:99:10794,0,13764
contig364	56701	.	G	A	10890.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=1.284;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.326;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,276:611:99:10928,0,14090
contig364	56702	.	C	CCCA	10856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.400;ClippingRankSum=1.459;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.604;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,273:604:99:10894,0,14007
contig364	56705	.	GAT	G	10400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;ClippingRankSum=-0.896;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.292;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,272:610:99:10438,0,13679
contig364	56733	.	T	A	13142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.242;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.111;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,339:641:99:13171,0,11771
contig364	56744	.	T	C	13862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.330;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.642;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.164;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,339:643:99:13891,0,12044
contig364	56766	.	T	A	12157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=2.234;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.534;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,324:628:99:12186,0,11333
contig364	56812	.	A	G	12759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.026;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.866;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,323:621:99:12788,0,20025
contig364	56815	.	T	C	12747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-0.383;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.643;QD=20.04;ReadPosRankSum=4.118;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,326:636:99:12776,0,20162
contig364	57191	.	T	A	6294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=1.245;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.987;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.001;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,223:422:99:6323,0,5945
contig364	57261	.	C	CA	4256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.249;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.625;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,205:420:99:4294,0,4702
contig364	57390	.	A	G	7686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=-0.119;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.321;QD=14.56;ReadPosRankSum=4.281;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,259:528:99:7715,0,7687
contig364	57422	.	T	C	10910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=1.434;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.700;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.724;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,279:560:99:10939,0,10840
contig364	57426	.	A	C	11109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.190;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.692;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,288:566:99:11138,0,10718
contig364	57561	.	A	T	8496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=2.114;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.958;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,286:642:99:8525,0,10924
contig364	58273	.	C	T	8776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.789;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.216;QD=17.08;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,229:514:99:8805,0,11667
contig364	58281	.	A	T	9303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.934;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.684;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.863;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,239:528:99:9332,0,11744
contig364	58294	.	A	G	8566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.397;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.084;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,225:505:99:8595,0,11278
contig364	58495	.	A	T	12015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=1.127;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.036;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,311:596:99:12044,0,10979
contig364	58504	.	A	G	11584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.437;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.595;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,299:592:99:11613,0,11216
contig364	58831	.	A	T	5720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=1.418;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=46.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.905;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.695;SOR=1.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,150:378:99:5749,0,9141
contig364	58837	.	T	C	7354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=-1.665;DP=463;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.065;QD=16.87;ReadPosRankSum=-5.974;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,206:436:99:7383,0,8907
contig364	58930	.	T	C	5739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-0.416;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.253;QD=14.17;ReadPosRankSum=3.435;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,186:405:99:5768,0,6623
contig364	59171	.	G	C	9142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=1.576;DP=663;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.184;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,306:627:99:9171,0,9080
contig364	59187	.	C	T	10141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.513;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.600;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.616;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,310:624:99:10170,0,9682
contig364	59343	.	A	G	10506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-3.015;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.034;QD=17.48;ReadPosRankSum=3.191;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,277:601:99:10535,0,12686
contig364	59353	.	A	G	11209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.577;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.739;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,277:594:99:11238,0,12788
contig364	59356	.	T	A	11239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.824;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.872;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.071;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,271:575:99:11268,0,12608
contig364	59365	.	T	C	10295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-2.094;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.918;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.281;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,267:568:99:10324,0,11906
contig364	59461	.	T	A	10707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.187;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-1.627;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,348:672:99:10736,0,9454
contig364	59487	.	G	A	10235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.340;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-3.390;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,318:597:99:10264,0,8662
contig364	59504	.	TATATTAATTACTTATATTAATTACTG	T	9248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.448;ClippingRankSum=0.966;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-1.924;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,249:537:99:9286,0,10998
contig364	59557	.	C	T	11384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.786;ClippingRankSum=0.989;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQRankSum=-4.994;QD=20.59;ReadPosRankSum=-3.045;SOR=0.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,288:553:99:11413,0,10503
contig364	59564	.	C	T	11855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=1.113;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=4.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQRankSum=-6.484;QD=20.76;ReadPosRankSum=-4.692;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,294:571:99:11884,0,11067
contig364	59571	.	C	A	12214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=-0.376;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQRankSum=-7.056;QD=21.06;ReadPosRankSum=-5.412;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,298:580:99:12243,0,11613
contig364	59583	.	C	T	12082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.146;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQRankSum=-2.786;QD=20.31;ReadPosRankSum=-3.904;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,292:595:99:12111,0,12291
contig364	59584	.	C	T	11941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=1.619;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=3.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-5.047;QD=19.87;ReadPosRankSum=-3.581;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,294:601:99:11970,0,12510
contig364	59602	.	C	T	12328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.604;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=0.176;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.214;SOR=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,305:620:99:12357,0,12941
contig364	59604	.	T	C	12310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.951;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=1.653;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.946;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,305:620:99:12339,0,12608
contig364	59607	.	T	C	12115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.646;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-3.096;QD=19.64;ReadPosRankSum=2.720;SOR=0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,302:617:99:12144,0,12998
contig364	59615	.	G	A	12199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=1.408;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=2.270;QD=19.52;ReadPosRankSum=3.768;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,302:625:99:12228,0,12992
contig364	59616	.	C	T	12136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.920;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-2.080;QD=19.42;ReadPosRankSum=3.853;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,302:625:99:12165,0,13289
contig364	59627	.	G	A	12312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.827;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-2.823;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.156;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,298:609:99:12341,0,12483
contig364	59628	.	C	T	12306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.056;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-2.105;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,302:612:99:12335,0,12567
contig364	59651	.	G	A	11993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=-0.580;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-1.351;QD=20.79;ReadPosRankSum=-1.678;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,293:577:99:12022,0,11667
contig364	59655	.	C	T	12206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.235;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=0.561;QD=21.16;ReadPosRankSum=-2.099;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,296:577:99:12235,0,11464
contig364	59671	.	T	C	10221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.444;ClippingRankSum=0.062;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-0.113;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,267:543:99:10250,0,10429
contig364	59725	.	C	G	8698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.898;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.749;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,279:517:99:8727,0,7102
contig364	59783	.	G	T	8476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.183;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.460;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.182;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,219:464:99:8505,0,9296
contig364	59796	.	ATC	A	9974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.601;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.347;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,247:487:99:10012,0,9559
contig364	59823	.	A	G	10310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.724;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.395;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,250:465:99:10339,0,8908
contig364	59848	.	G	T	10657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.954;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.403;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,261:495:99:10686,0,9324
contig364	59850	.	A	G	10495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.729;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.658;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.240;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,263:503:99:10524,0,9249
contig364	60095	.	A	G	8962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=-0.235;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-0.416;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,289:572:99:8991,0,10443
contig364	60137	.	TGAAGAAAAGAACGAAGAAAAGAAC	T	7643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;ClippingRankSum=-0.006;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-2.684;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.638;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,213:550:99:7681,0,13377
contig364	60207	.	A	G	13879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=-1.157;DP=731;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=2.371;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,373:699:99:13908,0,11908
contig364	60231	.	G	A	14763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.143;DP=733;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=1.678;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,366:701:99:14792,0,13610
contig364	60233	.	A	T	14808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.429;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=3.481;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,364:700:99:14837,0,13307
contig364	60245	.	G	A	14640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.826;ClippingRankSum=0.165;DP=732;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.045;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,363:698:99:14669,0,13319
contig364	60256	.	A	G	15217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.703;DP=747;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.334;QD=21.28;ReadPosRankSum=-1.126;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,380:715:99:15246,0,13270
contig364	60273	.	A	G	14531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.251;DP=741;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.213;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,379:708:99:14560,0,12530
contig364	60344	.	G	A	16194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.119;DP=866;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-2.309;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.356;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:409,431:840:99:16223,0,18152
contig364	60359	.	C	A	15518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.973;DP=833;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=0.252;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:397,410:807:99:15547,0,17907
contig364	60518	.	C	T	4820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.446;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=181.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.54;MQRankSum=1.298;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.308;SOR=1.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,138:192:99:4849,0,1615
contig364	60741	.	A	AG	8203.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.63;QD=29.54;SOR=1.880	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:8241,560,0
contig364	60745	.	GA	G	8299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.39;QD=27.92;SOR=1.948	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,181:181:99:8337,566,0
contig364	60748	.	GCA	G	8003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.40;QD=30.62;SOR=2.049	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,178:178:99:8041,542,0
contig364	60993	.	C	CAG	3455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;QD=31.86;SOR=8.789	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3493,250,0
contig364	61059	.	G	A	8882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.60;QD=24.89;SOR=2.571	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,186:186:99:8911,599,0
contig364	61066	.	A	G	9581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.48;QD=32.21;SOR=2.246	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,209:209:99:9610,644,0
contig364	61070	.	A	G	10214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.46;QD=28.94;SOR=2.292	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,221:221:99:10243,692,0
contig364	61072	.	C	T	10124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.96;QD=33.42;SOR=2.169	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,225:225:99:10153,686,0
contig364	61334	.	A	G	14861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.49;QD=32.05;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,336:336:99:14890,1044,0
contig364	61349	.	G	T	14859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;QD=27.63;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,333:333:99:14888,1035,0
contig364	61868	.	C	T	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.087;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.84;MQRankSum=-0.739;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.849;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:71,61:132:99:1470,0,1810
contig364	61902	.	T	C	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-1.410;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.83;MQRankSum=-1.180;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,46:93:99:1538,0,1628
contig364	61920	.	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-0.428;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.91;MQRankSum=-0.630;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,28:58:99:1140,0,1194
contig364	61941	.	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=1.262;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.465;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:537,0,658
contig365	485	.	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.830;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.42;MQRankSum=2.489;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.256;SOR=1.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,44:62:99:1247,0,303
contig365	596	.	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-0.821;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.68;MQRankSum=-0.849;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.379	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,12:42:99:408,0,1267
contig365	597	.	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-0.646;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.55;MQRankSum=-1.331;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.540;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,12:44:99:408,0,1267
contig365	954	.	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.475;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.30;MQRankSum=2.375;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.070	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,6:31:76:76,0,677
contig365	1905	.	C	A	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;QD=28.21;SOR=5.283	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:395,39,0
contig365	2096	.	A	G	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.23;QD=26.83;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:216,21,0
contig365	2623	.	A	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;QD=34.51;SOR=5.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:684,57,0
contig365	3561	.	T	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.624;ClippingRankSum=-2.303;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=142.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQRankSum=-9.421;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.083;SOR=7.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,66:387:99:921,0,9330
contig365	4154	.	A	G	9152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;QD=30.81;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,210:210:99:9181,643,0
contig365	4167	.	G	T	8477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;QD=30.68;SOR=1.060	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,195:195:99:8506,589,0
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contig365	4199	.	G	A	6405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;QD=28.64;SOR=1.904	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,137:137:99:6434,439,0
contig365	4218	.	C	T	5027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.06;QD=28.14;SOR=3.696	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,107:107:99:5056,340,0
contig365	4240	.	T	C	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.70;QD=29.37;SOR=8.714	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:3462,237,0
contig365	5387	.	G	A	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=-0.640;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=308.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.10;MQRankSum=-7.973;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.056;SOR=4.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,77:163:99:1929,0,2870
contig365	5407	.	A	G	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=-1.021;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=246.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.11;MQRankSum=-8.010;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=2.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:86,73:159:99:2781,0,5027
contig365	5409	.	G	A	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.168;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=233.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.09;MQRankSum=-7.943;QD=17.20;ReadPosRankSum=-2.043;SOR=2.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:87,72:159:99:2763,0,5279
contig365	5417	.	C	A	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=0.547;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=135.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.30;MQRankSum=-7.480;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.312;SOR=2.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,65:162:99:2497,0,5716
contig365	5418	.	G	A	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=1.349;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=134.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.91;MQRankSum=-8.195;QD=14.47;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=2.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,65:165:99:2416,0,5680
contig365	5440	.	A	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=-0.322;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=19.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.22;MQRankSum=-6.435;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,32:160:99:504,0,3913
contig365	5581	.	AT	A	3706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-1.294;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=174.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.74;MQRankSum=-3.180;QD=19.61;ReadPosRankSum=2.564;SOR=2.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,108:189:99:3744,0,2650
contig365	5612	.	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-1.342;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=234.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.29;MQRankSum=-1.023;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.514;SOR=7.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:185,53:238:99:1144,0,4648
contig365	5673	.	A	AAG	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;ClippingRankSum=0.200;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=78.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.32;MQRankSum=2.822;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=6.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,29:171:99:791,0,5741
contig365	5677	.	AGC	A	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.375;ClippingRankSum=1.205;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=65.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.03;MQRankSum=3.903;QD=4.14;ReadPosRankSum=-2.393;SOR=6.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,29:173:99:754,0,6245
contig365	5695	.	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.066;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=11.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.28;MQRankSum=3.936;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.309;SOR=3.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,11:132:99:287,0,5327
contig365	5771	.	T	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.434;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=-1.732;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.538;SOR=6.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:2562,133,0
contig365	5776	.	G	A	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.404;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQRankSum=-1.732;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.520;SOR=6.804	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,59:60:99:2606,136,0
contig365	5797	.	GTGAAAATACATGCCT	G	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=31.74;SOR=6.666	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:87:1305,87,0
contig365	5844	.	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.03;SOR=5.784	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:54:810,54,0
contig365	5854	.	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=34.82;SOR=5.421	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:45:675,45,0
contig365	6318	.	CT	C	3048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.706;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=5.143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQRankSum=0.863;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,133:137:99:3086,305,0
contig365	6359	.	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;ClippingRankSum=0.195;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=75.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQRankSum=-6.764;QD=0.42;ReadPosRankSum=-3.784;SOR=6.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:198,20:218:99:119,0,6413
contig365	6669	.	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=-0.883;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=160.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQRankSum=-9.555;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.445;SOR=7.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,50:257:99:941,0,6400
contig365	6687	.	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.226;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=106.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.07;MQRankSum=-8.213;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.111;SOR=7.111	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,34:245:99:348,0,6847
contig365	8064	.	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.719;ClippingRankSum=0.410;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=31.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.84;MQRankSum=0.399;QD=7.19;ReadPosRankSum=2.230;SOR=3.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:146,56:202:99:1481,0,3598
contig365	8166	.	A	G	4774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.428;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=18.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.79;MQRankSum=3.655;QD=11.08;ReadPosRankSum=-2.223;SOR=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,181:431:99:4803,0,6910
contig365	8358	.	T	A	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=1.557;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=141.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.44;MQRankSum=1.718;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.302;SOR=8.142	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:160,67:227:99:1883,0,4739
contig365	8995	.	C	T	6237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=2.033;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=58.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.25;MQRankSum=5.644;QD=24.75;ReadPosRankSum=4.244;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,212:252:99:6266,0,535
contig365	9082	.	C	T	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.504;ClippingRankSum=-2.420;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=36.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.61;MQRankSum=-3.525;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,157:361:99:4414,0,4787
contig365	9240	.	A	G	3704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.241;ClippingRankSum=-0.515;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=59.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.55;MQRankSum=-5.505;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,103:267:99:3733,0,6108
contig365	9250	.	A	G	3764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=1.073;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=56.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.99;MQRankSum=-7.017;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:138,106:244:99:3793,0,5550
contig365	9337	.	C	T	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.476;ClippingRankSum=-0.662;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=197.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.61;MQRankSum=-5.676;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.716;SOR=6.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,71:234:99:1559,0,4238
contig365	10173	.	T	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.750;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=18.261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.80;MQRankSum=0.491;QD=30.28;ReadPosRankSum=1.319;SOR=8.409	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,66:67:99:2474,170,0
contig365	10521	.	T	C	8135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.744;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.91;MQRankSum=-0.744;QD=34.62;ReadPosRankSum=-1.496;SOR=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,234:235:99:8164,662,0
contig365	11365	.	TTTGTATCGTTTTCAGAACTTGCATCCTTTTCAACAC	T	12924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;QD=25.66;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,292:292:99:12962,895,0
contig365	11547	.	T	C	9828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;QD=33.61;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,269:269:99:9857,807,0
contig365	12399	.	T	C	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.393;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=203.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.29;MQRankSum=3.839;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.181;SOR=2.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,107:299:99:3254,0,4626
contig365	12867	.	A	C	6539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.59;QD=27.01;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,145:145:99:6568,448,0
contig365	12873	.	T	G	6960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.98;QD=29.37;SOR=2.026	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,162:162:99:6989,487,0
contig365	12906	.	A	G	9401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;QD=31.32;SOR=1.478	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,211:211:99:9430,648,0
contig365	12912	.	T	C	9754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.15;QD=33.97;SOR=1.257	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,223:223:99:9783,678,0
contig365	13291	.	C	T	11397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.021;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=157.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.39;MQRankSum=3.688;QD=34.02;ReadPosRankSum=3.585;SOR=0.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,276:335:99:11426,0,3765
contig365	13293	.	A	G	11397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.272;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=164.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.10;MQRankSum=3.603;QD=33.92;ReadPosRankSum=2.870;SOR=0.130	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,275:336:99:11426,0,3765
contig365	13598	.	T	A	10617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.183;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.034;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,283:586:99:10646,0,11605
contig365	13617	.	T	G	10820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=-0.155;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.114;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,269:568:99:10849,0,12079
contig365	13624	.	T	C	10850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.557;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.055;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,268:563:99:10879,0,12052
contig365	13640	.	C	T	10422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;ClippingRankSum=0.894;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.657;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,277:584:99:10451,0,11726
contig365	13680	.	C	T	11231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=1.134;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.591;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.236;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,289:603:99:11260,0,12466
contig365	13683	.	G	A	11570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.293;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.215;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,286:598:99:11599,0,12666
contig365	13692	.	A	C	10796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.409;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.314;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,283:616:99:10825,0,12730
contig365	13788	.	G	A	9443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-2.232;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.727;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.545;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,245:577:99:9472,0,12719
contig365	13800	.	G	A	10435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=-0.504;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.655;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,263:576:99:10464,0,12716
contig365	13809	.	A	G	10299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=1.022;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=5.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.545;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,273:585:99:10328,0,12249
contig365	14452	.	A	T	12037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=1.393;DP=690;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.177;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.236;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,316:662:99:12066,0,13593
contig365	14465	.	C	T	12103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.334;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.546;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:346,301:647:99:12132,0,13961
contig365	14472	.	T	C	11555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.751;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.259;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,289:624:99:11584,0,13642
contig365	14487	.	T	C	10487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.589;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.737;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,278:600:99:10516,0,12603
contig365	14613	.	C	T	7892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-1.115;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.718;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,266:591:99:7921,0,10139
contig365	14790	.	A	G	10056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.395;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.360;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,262:563:99:10085,0,11877
contig365	14792	.	T	A	10278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.351;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.435;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,262:558:99:10307,0,12279
contig365	14797	.	A	G	10471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.530;ClippingRankSum=-1.269;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.323;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,255:554:99:10500,0,11943
contig365	14813	.	C	T	10273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=-1.036;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.770;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.313;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,262:547:99:10302,0,11877
contig365	14832	.	G	C	10612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=-0.805;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.696;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.659;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,260:552:99:10641,0,12020
contig365	14844	.	C	T	10139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=1.068;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.117;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,270:548:99:10168,0,10792
contig365	15966	.	T	C	10490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=-0.053;DP=723;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.718;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,342:693:99:10519,0,11315
contig365	16071	.	C	T	8877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=-2.170;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.830;QD=14.60;ReadPosRankSum=-2.123;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,302:608:99:8906,0,11467
contig365	16164	.	T	C	8802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=-0.428;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.161;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,283:561:99:8831,0,8446
contig365	16284	.	C	T	8643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.390;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=5.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.000;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,281:573:99:8672,0,8928
contig365	16611	.	G	GC	9092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.101;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.875;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,287:586:99:9130,0,9395
contig365	16620	.	CCACCTGCGACTTTCT	C	4906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;ClippingRankSum=-1.371;DP=674;ExcessHet=3.0103;FS=24.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.443;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.569;SOR=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,217:587:99:4944,0,12991
contig365	16979	.	C	T	13073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.795;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.725;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,339:601:99:13102,0,11674
contig365	16992	.	A	C	12930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.193;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.090;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,334:589:99:12959,0,11478
contig365	17019	.	A	G	10194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=2.038;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.092;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,330:574:99:10223,0,7412
contig365	17173	.	AAAC	A	2377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.170;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=4.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.916;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,149:468:99:2415,0,12233
contig365	17646	.	A	C	9796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=-0.654;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.473;QD=14.96;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,333:655:99:9825,0,9752
contig365	17874	.	T	C	13356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.982;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.713;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,339:639:99:13385,0,11707
contig365	17877	.	C	T	13659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=1.016;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.369;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,337:641:99:13688,0,12185
contig365	17883	.	T	G	13495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=2.243;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.505;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,346:648:99:13524,0,11846
contig365	18168	.	C	G	9648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.169;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.317;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,248:528:99:9677,0,11174
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contig365	18171	.	T	C	9534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=-0.469;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.666;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,250:528:99:9563,0,11008
contig365	18420	.	A	G	10246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=2.301;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.613;QD=18.30;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,268:560:99:10275,0,11187
contig365	18432	.	T	C	10427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.416;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.591;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,276:587:99:10456,0,11801
contig365	18518	.	T	C	9338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.645;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.361;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,307:609:99:9367,0,9483
contig365	18600	.	A	T	8164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.443;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.238;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,260:529:99:8193,0,8531
contig365	18612	.	T	G	7750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-0.501;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.589;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.060;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,249:507:99:7779,0,7924
contig365	18930	.	C	A	12367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.566;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.131;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,319:648:99:12396,0,12443
contig365	18946	.	G	A	13606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.454;DP=689;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.022;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,335:666:99:13635,0,13214
contig365	18950	.	C	G	13590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.110;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.330;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:333,340:673:99:13619,0,13353
contig365	18957	.	G	A	13260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.429;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.115;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.594;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,345:672:99:13289,0,12675
contig365	18988	.	G	A	9844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=-1.857;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.834;QD=16.66;ReadPosRankSum=3.532;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,308:591:99:9873,0,8697
contig365	19212	.	T	C	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.649;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.110;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.193;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,295:578:99:8783,0,10478
contig365	19341	.	GAA	G	7231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=-0.145;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=6.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.602;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,247:501:99:7269,0,8220
contig365	19630	.	A	G	6957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.716;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.824;QD=15.53;ReadPosRankSum=2.133;SOR=0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,227:448:99:6986,0,6796
contig365	20249	.	G	T	10321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.981;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.471;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,268:553:99:10350,0,15919
contig365	20254	.	G	T	10519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.037;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.304;QD=18.82;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,274:559:99:10548,0,15875
contig365	20360	.	C	T	11149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=-0.239;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.096;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,293:589:99:11178,0,21134
contig365	20372	.	G	A	11555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=1.670;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.241;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.146;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,290:605:99:11584,0,22858
contig365	20379	.	G	A	11100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=1.483;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.475;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,293:620:99:11129,0,23182
contig365	20611	.	C	A	8931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.127;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.448;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,236:507:99:8960,0,10277
contig365	20617	.	A	G	8971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.184;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.071;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.340;SOR=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,237:502:99:9000,0,10264
contig365	20684	.	TC	T	8760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.193;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.076;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.758;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,232:441:99:8798,0,8214
contig365	20686	.	TTC	T	3622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-2.233;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=3.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.015;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,187:398:99:3660,0,8521
contig365	20705	.	G	A	8810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=-2.422;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.997;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,218:433:99:8839,0,8974
contig365	20711	.	A	C	9020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=-0.300;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.041;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,225:450:99:9049,0,8959
contig365	20729	.	G	A	9005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.498;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.858;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,224:463:99:9034,0,9754
contig365	20754	.	G	A	10342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.007;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.385;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,257:530:99:10371,0,10945
contig365	20765	.	T	A	9880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.695;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.852;QD=18.61;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,259:531:99:9909,0,10422
contig365	20886	.	T	C	10902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.605;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.088;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,284:612:99:10931,0,13060
contig365	20894	.	T	G	11235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.338;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.193;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,299:628:99:11264,0,13043
contig365	21095	.	C	T	8697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.062;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.185;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,279:584:99:8726,0,9495
contig365	21243	.	A	C	11567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.720;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.292;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.219;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,300:626:99:11596,0,12584
contig365	21251	.	G	A	11397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=-0.056;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.011;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,290:605:99:11426,0,12976
contig365	21262	.	A	G	11567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.886;ClippingRankSum=-0.379;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.336;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,287:597:99:11596,0,12817
contig365	21268	.	G	A	11397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;ClippingRankSum=-0.988;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.632;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,281:591:99:11426,0,12719
contig365	21270	.	C	T	10882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.574;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.132;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.926;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,273:583:99:10911,0,12339
contig365	21310	.	A	T	10919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.409;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.645;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,286:581:99:10948,0,11712
contig365	21317	.	C	T	11139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.114;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.304;QD=19.01;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,283:586:99:11168,0,12130
contig365	21318	.	A	G	11182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.272;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.641;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,281:580:99:11211,0,12014
contig365	21335	.	G	A	10714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.203;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.480;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,270:553:99:10743,0,11553
contig365	21338	.	A	G	10798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.428;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.721;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.038;SOR=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,262:546:99:10827,0,11547
contig365	21341	.	GC	G	10411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-1.551;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.728;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,263:546:99:10449,0,11574
contig365	21367	.	G	T	11200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.763;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.243;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,281:571:99:11229,0,11574
contig365	21371	.	T	G	10816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-1.258;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.018;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,279:571:99:10845,0,11332
contig365	21414	.	T	C	10871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.707;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.098;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,283:569:99:10900,0,11055
contig365	21418	.	T	G	11005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=2.791;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.865;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,276:555:99:11034,0,11216
contig365	21427	.	G	A	11390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.650;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.564;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,287:576:99:11419,0,11683
contig365	21444	.	T	G	11167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.229;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.845;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,299:609:99:11196,0,11646
contig365	21496	.	C	T	11178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=1.427;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.473;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,296:578:99:11207,0,10655
contig365	21514	.	T	G	11582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.130;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.615;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.254;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,290:574:99:11611,0,11369
contig365	21522	.	C	A	11687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.683;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.932;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.299;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,301:588:99:11716,0,11203
contig365	21551	.	G	A	8972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.953;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.194;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,300:569:99:9001,0,7844
contig365	21575	.	C	CT	9962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-0.888;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.462;QD=17.92;ReadPosRankSum=-2.155;SOR=0.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,266:556:99:10000,0,11175
contig365	21589	.	A	G	10273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=-0.039;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.001;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.070;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,256:571:99:10302,0,12729
contig365	21598	.	G	C	9693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=1.328;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.429;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,249:552:99:9722,0,12298
contig365	21606	.	C	T	8570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.679;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.405;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,233:529:99:8599,0,12032
contig365	21819	.	C	T	9524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;ClippingRankSum=0.066;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.805;QD=15.82;ReadPosRankSum=2.347;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,298:602:99:9553,0,11076
contig365	21858	.	AG	A	12064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.506;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.819;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,306:612:99:12102,0,12197
contig365	21860	.	G	A	12168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=-0.349;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.375;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,310:615:99:12197,0,12221
contig365	21863	.	G	A	12227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.033;DP=657;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.067;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.276;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,311:622:99:12256,0,12101
contig365	21944	.	T	C	11533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.584;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.330;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,309:631:99:11562,0,12260
contig365	21962	.	A	G	11966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.588;DP=647;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.610;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,295:606:99:11995,0,12726
contig365	21976	.	G	A	11875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.525;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.035;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,292:610:99:11904,0,12849
contig365	21980	.	C	T	11191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.540;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-2.213;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,278:590:99:11220,0,12703
contig365	21983	.	A	G	10801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.128;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=4.671;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.644;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,278:593:99:10830,0,12453
contig365	22010	.	CGTCTA	C	9987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.411;DP=633;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-1.212;QD=17.01;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,261:587:99:10025,0,12978
contig365	22018	.	AT	A	10319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.119;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-2.686;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,261:577:99:10357,0,12949
contig365	22025	.	C	T	10846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.411;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-1.795;QD=18.45;ReadPosRankSum=-2.416;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,274:588:99:10875,0,12630
contig365	22042	.	TG	T	11174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.104;ClippingRankSum=-0.488;DP=787;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.696;QD=15.02;ReadPosRankSum=-3.692;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:449,295:744:99:11212,0,18359
contig365	22044	.	TATATGTAAGGATGACATATGTATGTAAGGATGCTA	T	4738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.333;ClippingRankSum=-0.013;DP=782;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-1.369;QD=6.80;ReadPosRankSum=-3.095;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:452,245:697:99:4776,0,18480
contig365	22081	.	TCC	T	11539.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=2.166;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.236;QD=18.64;ReadPosRankSum=-13.196;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,293:619:99:11577,0,13332
contig365	22089	.	C	T	11536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-1.382;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-1.864;QD=19.29;ReadPosRankSum=-4.597;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:315,283:598:99:11565,0,12915
contig365	22092	.	T	G	11263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=-0.953;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=1.039;QD=19.19;ReadPosRankSum=-6.349;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,278:587:99:11292,0,12642
contig365	22099	.	G	A	10798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.515;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=4.836;QD=19.32;ReadPosRankSum=-7.601;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,263:559:99:10827,0,11895
contig365	22101	.	G	A	10261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.120;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=0.342;QD=18.36;ReadPosRankSum=-7.487;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,263:559:99:10290,0,11847
contig365	22147	.	G	C	3933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.037;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=10.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.420;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.854;SOR=1.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,110:397:99:3962,0,13361
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contig365	24500	.	A	C	5208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-1.543;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.512;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=0.948	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,174:433:99:5237,0,8471
contig365	24534	.	G	A,GA	11569.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.083;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=11.204;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.021;QD=29.74;ReadPosRankSum=1.102;SOR=0.183	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:36,268,85:389:99:11607,907,7457,10439,0,10667
contig365	24537	.	A	AT	10710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.956;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=1.691;QD=22.18;ReadPosRankSum=8.746;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,260:483:99:10748,0,8568
contig365	24546	.	A	T	10277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=2.043;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.829;QD=20.72;ReadPosRankSum=7.733;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,273:496:99:10306,0,8336
contig365	24603	.	A	T	10507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.661;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=8.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.759;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,272:501:99:10536,0,8775
contig365	24627	.	G	A	10808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.610;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.602;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,293:572:99:10837,0,10167
contig365	24674	.	G	A	10114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-0.822;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.029;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,266:507:99:10143,0,9399
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contig365	26102	.	T	TGCCAA	11971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-0.400;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.113;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,293:553:99:12009,0,9933
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contig365	26471	.	CA	C	10240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.577;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.662;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.740;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,262:562:99:10278,0,11812
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contig365	26664	.	G	A	13077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=-0.755;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.030;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,323:577:99:13106,0,10129
contig365	26673	.	G	T	12750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.013;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.493;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,325:590:99:12779,0,10413
contig365	26680	.	CA	C	12671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.607;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.202;QD=22.96;ReadPosRankSum=-1.219;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,319:552:99:12709,0,5084
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contig365	26799	.	T	A,TAAAAAAAA	15186.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.331;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.93;MQRankSum=1.531;QD=33.90;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:2,267,179:448:99:15224,8562,8572,7276,0,11017
contig365	26989	.	A	G	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.186;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.506;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,263:561:99:8304,0,9515
contig365	27393	.	ACGAAGC	A	7129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.230;ClippingRankSum=2.226;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.152;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.772;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,241:538:99:7167,0,11627
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contig365	27451	.	A	G	12025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.651;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.203;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.901;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,302:619:99:12054,0,12601
contig365	27457	.	C	T	11764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.975;DP=639;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.438;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,304:608:99:11793,0,11968
contig365	28020	.	A	T	10524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=1.052;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.394;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,276:566:99:10553,0,10946
contig365	28028	.	G	A	10547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.777;ClippingRankSum=-0.889;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.471;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,278:552:99:10576,0,10671
contig365	28093	.	A	T	9957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.729;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.545;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,258:546:99:9986,0,11204
contig365	28097	.	G	A	9853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.495;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.043;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,254:539:99:9882,0,11318
contig365	28197	.	G	T	8633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.904;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.764;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,230:510:99:8662,0,15495
contig365	28203	.	T	C	8658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=-0.465;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.281;QD=16.91;ReadPosRankSum=-2.136;SOR=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,231:512:99:8687,0,15433
contig365	28383	.	GA	G	4601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-2.006;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=1.494;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:229,213:442:99:4639,0,5069
contig365	28406	.	GTAAATA	G	6150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.157;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-2.796;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,163:311:99:6188,0,5492
contig365	28450	.	G	A	7722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=-1.181;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=2.897;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,199:453:99:7751,0,10100
contig365	28454	.	C	A	7889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.885;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=2.643;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,202:455:99:7918,0,10334
contig365	28471	.	T	TCG	8745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.380;DP=487;ExcessHet=3.0103;FS=6.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=2.135;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.189;SOR=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,215:457:99:8783,0,9866
contig365	28475	.	A	G	8449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.812;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=1.804;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:247,220:467:99:8478,0,9692
contig365	28835	.	A	C	10535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.698;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.297;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,268:531:99:10564,0,10482
contig365	28837	.	G	A	10635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.681;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.766;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.011;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,266:533:99:10664,0,10681
contig365	28840	.	T	C	10403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.678;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.795;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,265:534:99:10432,0,10455
contig365	29062	.	C	G	9490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.473;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.184;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,250:548:99:9519,0,11755
contig365	29065	.	C	A	9433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.261;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.825;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,249:545:99:9462,0,11593
contig365	29159	.	C	T	9831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=1.934;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.260;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,263:590:99:9860,0,13432
contig365	29173	.	A	G	10000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.999;DP=629;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.031;QD=16.56;ReadPosRankSum=-1.538;SOR=0.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,273:604:99:10029,0,12709
contig365	29699	.	T	C	13409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=1.600;DP=739;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.407;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,352:704:99:13438,0,20153
contig365	29715	.	T	C	14262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.345;DP=783;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.961;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,378:748:99:14291,0,20598
contig365	29906	.	G	C	13670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-1.880;DP=748;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.379;QD=18.88;ReadPosRankSum=2.040;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:362,362:724:99:13699,0,13943
contig365	29913	.	T	C	13643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.172;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.660;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.349;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:349,353:702:99:13672,0,13673
contig365	29950	.	T	C	10407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=1.098;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.556;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.622;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,349:700:99:10436,0,11139
contig365	30157	.	G	C	11292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.962;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.610;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,302:632:99:11321,0,12624
contig365	30171	.	G	A	11147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.426;DP=653;ExcessHet=3.0103;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.973;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.401;SOR=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,302:628:99:11176,0,12639
contig365	31001	.	G	A	8747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=1.700;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=6.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.412;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,300:585:99:8776,0,8728
contig365	31372	.	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.595;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-0.112;QD=0.28;ReadPosRankSum=-4.812;SOR=1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,25:266:99:102,0,9705
contig365	31413	.	T	C	7522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-1.204;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.753;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,240:403:99:7551,0,5141
contig365	31689	.	A	G	9125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.341;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.292;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.336;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,237:489:99:9154,0,9796
contig365	31694	.	T	C	8983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.295;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.166;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,232:480:99:9012,0,9771
contig365	31782	.	G	T	10548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=1.695;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.805;QD=20.02;ReadPosRankSum=1.513;SOR=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,268:527:99:10577,0,9816
contig365	31788	.	A	C	10552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=-0.493;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=4.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.267;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.421;SOR=1.023	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,267:517:99:10581,0,9549
contig365	32100	.	A	G	10963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.609;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.540;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,288:562:99:10992,0,15033
contig365	32112	.	T	C	10931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=1.737;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.084;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,286:558:99:10960,0,14854
contig365	32480	.	C	CT	2140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=-1.038;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=11.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.536;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.106;SOR=1.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,130:313:99:2178,0,3627
contig365	32612	.	A	T	10368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.249;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.356;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,266:552:99:10397,0,11160
contig365	32620	.	C	T	10836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.507;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.163;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,273:553:99:10865,0,11071
contig365	32639	.	C	T	10531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.012;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.235;QD=18.84;ReadPosRankSum=-1.552;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,280:559:99:10560,0,10350
contig365	32778	.	G	A	8271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.941;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.813;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,276:577:99:8300,0,9486
contig365	33015	.	G	T	10838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.251;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.905;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,279:573:99:10867,0,11262
contig365	33023	.	G	A	11241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.149;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.148;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.717;SOR=0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,284:560:99:11270,0,11080
contig365	33024	.	A	G	11178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.719;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.106;QD=19.86;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,283:563:99:11207,0,10977
contig365	33926	.	T	C	10815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.473;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=8.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.488;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,274:526:99:10844,0,9761
contig365	33929	.	G	A	10813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.283;DP=564;ExcessHet=3.0103;FS=8.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.127;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.933;SOR=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,275:534:99:10842,0,10002
contig365	34196	.	A	G	11296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=1.475;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.601;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.436;SOR=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,293:561:99:11325,0,10231
contig365	34202	.	T	G	11225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.085;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.614;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.162;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,284:540:99:11254,0,10017
contig365	34850	.	C	T	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.588;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.925;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,259:513:99:10209,0,10763
contig365	34851	.	A	G	10180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.530;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.616;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,260:518:99:10209,0,10763
contig365	35819	.	C	T	12008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.075;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.351;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.077;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,314:625:99:12037,0,12044
contig365	35832	.	C	T	11816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.168;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.094;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,303:610:99:11845,0,11719
contig365	36294	.	G	A	8600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.417;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.001;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,278:561:99:8629,0,8615
contig365	36465	.	C	T	10071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=1.316;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.196;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,258:520:99:10100,0,10307
contig365	36466	.	C	T	10130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=-0.177;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.298;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,257:520:99:10159,0,10456
contig365	36483	.	G	A	9650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=-0.571;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.161;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,252:501:99:9679,0,9888
contig365	36990	.	A	G	14147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=-0.639;DP=761;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.068;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,368:736:99:14176,0,20256
contig365	36999	.	C	T	14315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.481;DP=754;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.462;QD=19.64;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:357,372:729:99:14344,0,20050
contig365	37284	.	C	A	10415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-0.174;DP=593;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.059;QD=18.24;ReadPosRankSum=-2.971;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,274:571:99:10444,0,11619
contig365	37300	.	TC	T	11560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.199;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.752;QD=19.05;ReadPosRankSum=-3.552;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:317,290:607:99:11598,0,12811
contig365	37303	.	TTC	T	2598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-0.015;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.627;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.898;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,162:505:99:2636,0,13805
contig365	37319	.	C	T	10039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.697;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.610;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.317;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,263:548:99:10068,0,11136
contig365	38087	.	T	A	9516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-1.211;DP=495;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.142;QD=20.04;ReadPosRankSum=1.484;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,243:475:99:9545,0,8954
contig365	38089	.	A	G	9516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=1.426;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.356;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.908;SOR=0.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,250:480:99:9545,0,8954
contig365	38141	.	G	A	8154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.331;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.703;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,272:536:99:8183,0,8310
contig365	38260	.	C	T	9388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.524;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.304;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,260:578:99:9417,0,12200
contig365	38279	.	G	A	9605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=1.076;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.893;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.287;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,240:542:99:9634,0,12251
contig365	38300	.	G	A	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=-0.124;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.888;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,235:556:99:8884,0,12351
contig365	38444	.	A	G	12610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.445;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.261;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,328:668:99:12639,0,12660
contig365	38459	.	C	T	12687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=1.184;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.413;QD=19.76;ReadPosRankSum=-1.563;SOR=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,338:642:99:12716,0,11815
contig365	38707	.	C	T	9951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=1.512;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.160;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,254:510:99:9980,0,10021
contig365	38709	.	C	T	9951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.105;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.579;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,258:516:99:9980,0,10021
contig365	38810	.	C	G	9402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.419;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.358;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.220;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,240:480:99:9431,0,9321
contig365	38811	.	T	A	9402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=-1.373;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.719;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,245:486:99:9431,0,9321
contig365	38979	.	A	G	11385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.960;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.526;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,290:567:99:11414,0,10710
contig365	38984	.	T	C	11324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.272;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.146;QD=20.01;ReadPosRankSum=0.568;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,292:566:99:11353,0,10511
contig365	39021	.	G	A	9056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=1.468;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.475;QD=15.83;ReadPosRankSum=4.896;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,280:572:99:9085,0,9121
contig365	39303	.	T	C	11750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.994;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.065;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,308:585:99:11779,0,10358
contig365	39315	.	A	G	11421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.325;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.119;QD=21.00;ReadPosRankSum=-0.822;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,283:544:99:11450,0,10461
contig365	39318	.	GA	G	11270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.681;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.301;QD=20.68;ReadPosRankSum=-1.190;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,283:545:99:11308,0,10510
contig365	39323	.	T	TCC	11158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=-0.748;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.313;QD=20.74;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,279:538:99:11196,0,10354
contig365	39748	.	A	ATT	804.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=1.244;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=0.404;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.798;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,72:269:99:842,0,5937
contig365	39750	.	T	TC	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.128;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=13.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=1.440;QD=2.10;ReadPosRankSum=4.912;SOR=1.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,76:283:99:631,0,7017
contig365	39775	.	G	A	6340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-2.163;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.983;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:121,155:276:99:6369,0,4529
contig365	39776	.	C	T	6406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.712;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=0.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.328;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.728	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:117,156:273:99:6435,0,4565
contig365	39791	.	T	C	6389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.290;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=1.651;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:125,167:292:99:6418,0,4650
contig365	40286	.	T	C	8773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=2.267;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.213;QD=15.37;ReadPosRankSum=2.055;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,275:571:99:8802,0,9341
contig365	40301	.	C	T	9013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.320;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.620;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,285:563:99:9042,0,8709
contig365	40936	.	G	T	11729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.723;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.287;QD=21.06;ReadPosRankSum=2.771;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,309:557:99:11758,0,9069
contig365	40950	.	G	A	11915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.251;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.409;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.728;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,311:545:99:11944,0,8886
contig365	41961	.	A	C	9886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.392;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.147;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,310:585:99:9915,0,8774
contig365	42001	.	T	G	12706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=-1.573;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=3.415;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,331:656:99:12735,0,12636
contig365	42011	.	A	T	12476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.988;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-2.186;QD=18.93;ReadPosRankSum=2.084;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,325:659:99:12505,0,12781
contig365	42045	.	TTTCAATTTGGATAA	T	11679.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.914;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=5.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=2.755;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,308:636:99:11717,0,12967
contig365	42064	.	T	G	11656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.694;ClippingRankSum=-0.008;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-1.977;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,296:601:99:11685,0,12192
contig365	42066	.	TAGAAAA	T	11710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.834;ClippingRankSum=0.012;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-2.197;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,291:612:99:11748,0,13110
contig365	42075	.	AAATGTAAC	A	11524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.595;ClippingRankSum=1.292;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-2.890;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,296:619:99:11562,0,12958
contig365	42152	.	A	G	11924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=1.434;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.270;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,310:595:99:11953,0,11282
contig365	42160	.	T	C	11777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=1.091;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.236;QD=19.53;ReadPosRankSum=2.638;SOR=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,305:603:99:11806,0,12088
contig365	42184	.	G	A	10159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-0.283;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.239;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:309,273:582:99:10188,0,12826
contig365	42199	.	T	A	10971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.513;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-1.696;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,273:576:99:11000,0,12559
contig365	42219	.	T	C	9667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-1.044;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-1.372;QD=18.34;ReadPosRankSum=2.011;SOR=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,245:527:99:9696,0,11815
contig365	42232	.	ATTTC	A	9311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.426;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-0.649;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.050;SOR=1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,231:504:99:9349,0,11456
contig365	42247	.	G	A	8108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=-0.272;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=9.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-2.417;QD=18.02;ReadPosRankSum=-2.596;SOR=1.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,206:450:99:8137,0,10297
contig365	42248	.	T	A	8036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.002;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=9.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-2.501;QD=17.86;ReadPosRankSum=-2.877;SOR=1.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,207:450:99:8065,0,10135
contig365	42259	.	A	G	7416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=1.067;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=17.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-0.038;QD=17.13;ReadPosRankSum=-6.340;SOR=1.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,189:433:99:7445,0,10072
contig365	42265	.	C	T	6789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-1.497;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=21.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-2.108;QD=16.52;ReadPosRankSum=-6.991;SOR=1.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,170:411:99:6818,0,10074
contig365	42283	.	T	TTTTCAA	5115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.755;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=35.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-1.187;QD=15.05;ReadPosRankSum=-11.771;SOR=1.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,137:340:99:5153,0,8751
contig365	42285	.	C	CGTAT	5104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.709;ClippingRankSum=-1.031;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=174.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=1.215;QD=17.48;ReadPosRankSum=-12.026;SOR=8.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,93:292:99:5142,0,8319
contig365	42288	.	A	ATTTTACATTATTTATACATTTTAAAC	2978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;ClippingRankSum=-0.752;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=77.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-1.796;QD=10.87;ReadPosRankSum=-6.033;SOR=6.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,81:274:99:3016,0,8213
contig365	42291	.	C	CATT	896.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;QD=4.23;SOR=0.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:180,32:212:99:934,0,8108
contig365	42292	.	G	GTTTTAATTTTTACATTATTTATACATTTTAAATATCATTGAGCACACTGTCAATTTTGTATTCATTCTTTCAACATATTACAGAATATTTAAGAAGCATCTTATATTATTATCACAGTCTTTTTCATT	4695.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;QD=27.63;SOR=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,0:16:99:4733,0,4628
contig365	42293	.	T	TTTTAATTTTTACATTATTTATACATTTTAAATATCATTGAGCACACTGTCAATTTTGTATTCATTCTTTCAACATATTACAGAATATTTAAGAAGCATCTTATATTATTATCACAGTCTTTTCCATTC	2657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=429;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;QD=18.59;SOR=0.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,0:143:99:2695,0,6628
contig365	42427	.	G	GT	8674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.087;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.819;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,298:585:99:8712,0,8359
contig365	42562	.	C	T	8579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.586;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.611;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,281:533:99:8608,0,7751
contig365	42614	.	G	T	7100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.429;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.430;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,246:502:99:7129,0,8036
contig365	42753	.	T	A	9385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.007;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.752;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:289,250:539:99:9414,0,11118
contig365	42759	.	A	G	9557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.349;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.281;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,248:527:99:9586,0,11000
contig365	42815	.	A	G	10122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.546;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.613;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,268:566:99:10151,0,11391
contig365	42831	.	T	C	11314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=1.392;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.428;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,283:588:99:11343,0,12542
contig365	42835	.	A	T	11400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.772;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.666;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,284:586:99:11429,0,12334
contig365	42836	.	G	C	11406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.007;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.939;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,288:590:99:11435,0,12190
contig365	42841	.	G	A	11423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=1.359;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.396;QD=19.17;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,296:596:99:11452,0,11737
contig365	42900	.	A	G	11765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-1.125;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.307;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,309:614:99:11794,0,11585
contig365	42915	.	T	C	12360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=1.265;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.258;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,313:607:99:12389,0,11610
contig365	42921	.	T	C	11999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=1.086;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.822;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,307:602:99:12028,0,11456
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contig365	43443	.	T	C	10198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=1.475;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.922;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,272:571:99:10227,0,11406
contig365	43686	.	T	C	9801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=1.916;DP=505;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.093;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,250:477:99:9830,0,8768
contig365	43695	.	G	A	9608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=1.772;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.711;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.604;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,252:475:99:9637,0,8637
contig365	43726	.	T	C	11215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=-0.719;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=4.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.700;QD=21.74;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,286:516:99:11244,0,8663
contig365	43731	.	T	C	11215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.742;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.081;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,282:512:99:11244,0,8701
contig365	43761	.	C	T	10783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.640;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.206;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.815;SOR=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,283:504:99:10812,0,8118
contig365	43776	.	T	C	11459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.459;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=5.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.522;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.199;SOR=1.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,300:523:99:11488,0,8239
contig365	43924	.	G	A	10152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=1.510;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=4.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.516;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.746;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,321:620:99:10181,0,9626
contig365	44398	.	G	A	13970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=-0.403;DP=773;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.431;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:369,371:740:99:13999,0,13897
contig365	44418	.	T	G	14194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=2.778;DP=799;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.056;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:380,384:764:99:14223,0,14133
contig365	44524	.	G	T	12698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.620;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.282;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,324:650:99:12727,0,12805
contig365	44529	.	T	C	13266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-0.342;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.001;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,324:650:99:13295,0,12830
contig365	44539	.	G	A	12750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=-1.382;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.062;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,317:638:99:12779,0,12733
contig365	44552	.	A	C	12148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=-0.224;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.899;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,302:587:99:12177,0,11378
contig365	44553	.	C	T	11989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-0.735;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.565;QD=20.39;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,303:588:99:12018,0,11264
contig365	44606	.	CCCTTTAG	C	11090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-0.088;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.980;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,284:551:99:11128,0,10571
contig365	44615	.	GATATA	G	11090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=-0.143;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.128;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.295;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,284:547:99:11128,0,10543
contig365	44829	.	T	C	11505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.760;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.364;QD=19.80;ReadPosRankSum=2.700;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,293:581:99:11534,0,20911
contig365	44830	.	A	T	11579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.174;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.013;QD=19.90;ReadPosRankSum=4.701;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,295:582:99:11608,0,20944
contig365	44841	.	C	A	11324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=1.698;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.585;QD=19.97;ReadPosRankSum=4.590;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,294:567:99:11353,0,19283
contig365	49914	.	A	G	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.19;QD=29.19;SOR=6.091	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:612,60,0
contig365	49998	.	A	G	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.968;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQRankSum=-0.611;QD=31.71;ReadPosRankSum=1.477;SOR=0.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,67:68:99:2984,163,0
contig365	50016	.	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.251;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQRankSum=-1.347;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,71:72:99:3058,172,0
contig365	50106	.	A	G	420.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=1.470;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.82;MQRankSum=1.203;QD=32.36;ReadPosRankSum=-1.737;SOR=3.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:6:448,0,6
contig365	50127	.	G	A	428.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.935;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQRankSum=0.668;QD=32.96;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=3.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:455,0,3
contig366	40780	.	GAAAAAAGAAGAA	G	4492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.659;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.21;MQRankSum=-1.732;QD=23.48;SOR=0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,112:113:99:4530,285,0
contig367	969	.	A	G	23472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;QD=29.65;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,635:635:99:23501,1906,0
contig367	3064	.	A	G	13701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-1.907;DP=982;ExcessHet=3.0103;FS=1.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-0.648;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,431:726:99:13730,0,9328
contig367	3378	.	G	A	37344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.803;DP=1755;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.878;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:730,943:1673:99:37373,0,27993
contig367	3384	.	T	C	38374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.081;DP=1750;ExcessHet=3.0103;FS=4.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.512;QD=22.95;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:729,943:1672:99:38403,0,28345
contig367	3385	.	G	A	38043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=-0.103;DP=1741;ExcessHet=3.0103;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.764;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:726,938:1664:99:38072,0,28198
contig367	3415	.	ACGG	A	33562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.036;DP=1679;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.008;QD=21.77;ReadPosRankSum=5.825;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:688,854:1542:99:33600,0,27344
contig367	3453	.	T	C	28820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.219;ClippingRankSum=-0.419;DP=1595;ExcessHet=3.0103;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.079;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:633,900:1533:99:28849,0,17489
contig367	3497	.	T	G	31462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.504;DP=1526;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.361;QD=21.59;ReadPosRankSum=1.562;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:670,787:1457:99:31491,0,29671
contig367	3499	.	G	A	31960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.335;DP=1539;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.159;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:675,791:1466:99:31989,0,30304
contig367	3507	.	GTA	G	30888.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.643;DP=1548;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.072;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:702,771:1473:99:30926,0,30740
contig367	3518	.	G	A	30042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.805;DP=1504;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.153;QD=21.01;ReadPosRankSum=-5.254;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:670,760:1430:99:30071,0,25988
contig367	3550	.	A	AGG	35036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.897;DP=1360;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-1.194;QD=27.54;ReadPosRankSum=-24.037;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:636,636:1272:99:35074,0,23953
contig367	3551	.	A	AATTGCCAAAGGAATACCTTGGAGTGGCATATAACGGGTGAATTGGAGGCG	35227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.475;DP=1286;ExcessHet=3.0103;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.250;QD=29.02;ReadPosRankSum=-24.007;SOR=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:637,577:1214:99:35265,0,24276
contig367	3570	.	G	A	20585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;ClippingRankSum=-0.991;DP=1367;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-1.591;QD=15.92;ReadPosRankSum=-11.152;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:682,611:1293:99:20614,0,25653
contig367	3631	.	T	G	17632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.432;DP=1442;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.908;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.509;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:791,580:1371:99:17661,0,25827
contig367	3660	.	A	G	33536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.542;DP=1492;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.335;QD=23.72;ReadPosRankSum=-0.882;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:579,835:1414:99:33565,0,21820
contig367	3663	.	G	T	33457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.244;DP=1508;ExcessHet=3.0103;FS=0.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.990;QD=23.41;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:588,841:1429:99:33486,0,21985
contig367	3694	.	G	A	34355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.274;DP=1594;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.062;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:652,869:1521:99:34384,0,24544
contig367	3695	.	A	G	34355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=-1.290;DP=1587;ExcessHet=3.0103;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.769;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:647,866:1513:99:34384,0,24544
contig367	5604	.	A	G	18031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=-0.324;DP=1070;ExcessHet=3.0103;FS=45.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQRankSum=-24.683;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.981;SOR=2.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:567,462:1029:99:18060,0,22757
contig367	5607	.	A	G	19179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=1.790;DP=1111;ExcessHet=3.0103;FS=43.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQRankSum=-24.360;QD=18.03;ReadPosRankSum=3.469;SOR=2.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:584,480:1064:99:19208,0,23667
contig367	5625	.	C	A	24166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.161;ClippingRankSum=0.455;DP=1218;ExcessHet=3.0103;FS=22.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-16.381;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.068;SOR=1.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:568,581:1149:99:24195,0,23205
contig367	5626	.	T	C	24349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=0.084;DP=1215;ExcessHet=3.0103;FS=21.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-15.861;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.118;SOR=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:566,580:1146:99:24378,0,22983
contig367	5627	.	T	A	24460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;ClippingRankSum=0.094;DP=1230;ExcessHet=3.0103;FS=21.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQRankSum=-17.815;QD=21.14;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=1.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:566,591:1157:99:24489,0,23184
contig367	5639	.	A	G	25458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.032;DP=1286;ExcessHet=3.0103;FS=11.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=-15.783;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.789;SOR=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:579,616:1195:99:25487,0,23822
contig367	5650	.	A	G	26454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;ClippingRankSum=-0.066;DP=1351;ExcessHet=3.0103;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-11.766;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.508;SOR=1.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:596,652:1248:99:26483,0,23918
contig367	5653	.	A	C	27100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;ClippingRankSum=0.243;DP=1379;ExcessHet=3.0103;FS=5.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-8.121;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.604;SOR=1.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:606,663:1269:99:27129,0,24026
contig367	5674	.	A	G	15909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.268;ClippingRankSum=-0.800;DP=1471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=18.473;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:725,597:1322:99:15938,0,28879
contig367	5691	.	C	T	23908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.822;DP=1526;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=3.022;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.318;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:753,643:1396:99:23937,0,28944
contig367	5720	.	G	C	26983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=1.030;DP=1668;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-0.864;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:678,839:1517:99:27012,0,20997
contig367	5755	.	G	C	34890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.417;DP=1915;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=2.310;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:861,903:1764:99:34919,0,33941
contig367	6951	.	A	C	21697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=1.453;DP=1440;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-8.091;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:808,576:1384:99:21726,0,31881
contig367	6958	.	G	A	22272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-1.616;DP=1416;ExcessHet=3.0103;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=-11.232;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:801,566:1367:99:22301,0,32528
contig367	6970	.	T	TA	23132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=1.254;DP=1472;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-8.041;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.656;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:837,587:1424:99:23170,0,34323
contig367	6972	.	G	A	22627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.340;DP=1473;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-5.455;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.009;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:832,592:1424:99:22656,0,34553
contig367	6997	.	A	T	26491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;ClippingRankSum=1.046;DP=1537;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=15.537;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:634,848:1482:99:26520,0,22560
contig367	7035	.	G	A	28216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;ClippingRankSum=0.794;DP=1583;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=1.183;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.443;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:651,866:1517:99:28245,0,18782
contig367	7113	.	T	A	33910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.155;DP=1549;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.787;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:594,862:1456:99:33939,0,22786
contig367	7123	.	T	A	33967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=-0.716;DP=1466;ExcessHet=3.0103;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.028;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:553,826:1379:99:33996,0,21429
contig367	7143	.	A	G	31352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.681;DP=1467;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.618;QD=22.90;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:561,808:1369:99:31381,0,20416
contig367	25036	.	T	G	18196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.986;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=-0.784;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.407	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,493:496:99:18225,1398,0
contig367	35657	.	T	TA	20150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.510;DP=753;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQRankSum=-0.420;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=0.379	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,510:513:99:20188,1469,0
contig367	35718	.	G	T	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;ClippingRankSum=-0.397;DP=1451;ExcessHet=3.0103;FS=19.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQRankSum=-5.698;QD=3.65;ReadPosRankSum=-10.876;SOR=2.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:439,130:569:99:2103,0,15893
contig368	2929	.	T	C	5872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.59;QD=28.62;SOR=3.494	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,131:131:99:5901,405,0
contig368	2935	.	T	C	6074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;QD=27.72;SOR=3.131	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,140:140:99:6103,423,0
contig368	4170	.	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=-1.192;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=24.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.60;MQRankSum=0.920;QD=15.64;ReadPosRankSum=2.662;SOR=4.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,30:68:99:1092,0,1306
contig368	4180	.	T	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.911;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.46;MQRankSum=3.927;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.568;SOR=2.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,27:45:99:1060,0,853
contig368	4362	.	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.215;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.43;MQRankSum=-0.917;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,17:52:99:384,0,1033
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contig368	6514	.	T	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=-0.389;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.93;MQRankSum=-10.071;QD=0.66;ReadPosRankSum=-4.912;SOR=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,45:349:99:257,0,10427
contig368	6733	.	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.589;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=159.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.02;MQRankSum=-9.432;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=7.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,40:268:99:511,0,7372
contig368	6751	.	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;ClippingRankSum=-2.136;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=226.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.78;MQRankSum=-10.393;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=8.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,58:270:99:1263,0,6592
contig368	7699	.	GGTGT	G	1144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.242;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.21;MQRankSum=-4.029;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.697;SOR=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,29:40:99:1182,0,417
contig368	7719	.	G	A	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-1.234;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.67;MQRankSum=-5.195;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.075;SOR=1.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,31:49:99:1241,0,746
contig368	7734	.	TGC	T	1176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-1.266;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.23;MQRankSum=-5.708;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,30:59:99:1214,0,1124
contig368	7739	.	T	TTC	1132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.599;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.35;MQRankSum=-5.788;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.630;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,30:60:99:1170,0,1156
contig368	7831	.	TA	T	4576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-1.508;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=88.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.31;MQRankSum=7.902;QD=24.34;ReadPosRankSum=-5.730;SOR=2.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,114:188:99:4614,0,2684
contig368	7855	.	C	T	5888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=-1.611;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=100.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQRankSum=8.827;QD=27.39;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=1.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:62,153:215:99:5917,0,2143
contig368	7937	.	G	C	6553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=1.589;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=13.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQRankSum=8.558;QD=27.89;ReadPosRankSum=6.035;SOR=0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,201:235:99:6582,0,424
contig368	7974	.	T	G	5623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-0.670;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=17.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=8.117;QD=29.60;ReadPosRankSum=-5.474;SOR=1.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,145:190:99:5652,0,1441
contig368	7996	.	C	T	4957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.349;ClippingRankSum=0.903;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=35.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.31;MQRankSum=6.921;QD=29.87;ReadPosRankSum=-4.436;SOR=2.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,117:166:99:4986,0,1687
contig368	7997	.	G	T	4897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=-0.874;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=40.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.68;MQRankSum=6.982;QD=30.61;ReadPosRankSum=-3.905;SOR=3.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,111:160:99:4926,0,1693
contig368	8005	.	C	T	3897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.216;ClippingRankSum=-1.350;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=86.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.10;MQRankSum=5.802;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=5.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,91:140:99:3926,0,1766
contig368	8007	.	T	C	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;ClippingRankSum=0.351;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=85.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.03;MQRankSum=5.700;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.476;SOR=5.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,89:138:99:3757,0,1778
contig368	8027	.	C	T	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.863;ClippingRankSum=0.759;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=70.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.43;MQRankSum=6.403;QD=28.26;ReadPosRankSum=3.843;SOR=7.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,72:103:99:2939,0,1153
contig368	8342	.	T	C	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-0.526;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=23.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.39;MQRankSum=-4.234;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.582;SOR=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:96,94:190:99:2631,0,2780
contig368	8523	.	A	C	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.682;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=74.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQRankSum=-1.276;QD=7.07;ReadPosRankSum=-3.209;SOR=2.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,76:302:99:2162,0,7415
contig368	8539	.	G	T	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=-2.024;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=84.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQRankSum=-6.900;QD=3.92;ReadPosRankSum=-2.122;SOR=4.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,44:287:99:1152,0,10311
contig368	8557	.	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.988;ClippingRankSum=-0.104;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=83.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQRankSum=-8.363;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=6.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,28:294:99:363,0,11246
contig368	8570	.	C	T	17.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.322;ClippingRankSum=-0.397;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=61.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQRankSum=-7.538;QD=0.06;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=6.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,21:296:46:46,0,11255
contig368	8899	.	T	C	5257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.44;QD=31.30;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,168:168:99:5286,505,0
contig368	10340	.	C	T	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=24.76;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
contig368	10359	.	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;QD=29.25;SOR=4.977	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:350,33,0
contig368	10371	.	C	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.49;QD=33.49;SOR=5.670	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:564,48,0
contig368	10468	.	C	A	4754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.90;QD=32.80;SOR=9.704	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,127:127:99:4783,382,0
contig368	11319	.	T	C	2600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.441;ClippingRankSum=0.534;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=438.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.24;MQRankSum=-4.078;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.483;SOR=3.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:105,104:209:99:2629,0,3168
contig368	11430	.	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.255;DP=338;ExcessHet=3.0103;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.84;MQRankSum=-7.793;QD=0.19;ReadPosRankSum=-2.186;SOR=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,35:335:91:91,0,9503
contig368	11628	.	C	T	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=1.086;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=138.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQRankSum=-1.255;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.068;SOR=7.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,51:256:99:994,0,5339
contig368	11655	.	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=1.633;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=76.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.77;MQRankSum=-2.902;QD=0.54;ReadPosRankSum=-2.122;SOR=6.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,29:271:99:175,0,6397
contig368	12048	.	T	C	11353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.37;QD=30.12;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,256:256:99:11382,782,0
contig368	12057	.	A	G	11695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.66;QD=30.67;SOR=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,256:256:99:11724,792,0
contig368	12060	.	T	C	11666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.71;QD=29.17;SOR=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,259:259:99:11695,792,0
contig368	12461	.	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.390;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.846;QD=21.26;ReadPosRankSum=2.667;SOR=1.402	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,21:26:81:581,0,81
contig368	12678	.	G	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=-1.396;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=6.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.96;MQRankSum=1.321;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.366;SOR=0.284	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,51:94:99:1249,0,1076
contig368	12750	.	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.111;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=7.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.68;MQRankSum=0.470;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,38:119:99:906,0,2152
contig368	12818	.	T	C	6893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-1.093;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.14;MQRankSum=-6.638;QD=22.46;ReadPosRankSum=3.153;SOR=0.481	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:131,176:307:99:6922,0,5161
contig368	12819	.	G	A	6893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.584;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.47;MQRankSum=-7.756;QD=21.95;ReadPosRankSum=3.993;SOR=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,175:314:99:6922,0,5161
contig368	12893	.	C	T	3658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.046;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=15.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.91;MQRankSum=-7.649;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.646;SOR=1.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,159:363:99:3687,0,5476
contig368	14106	.	A	G	9203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-1.550;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.417;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,303:609:99:9232,0,9042
contig368	14340	.	C	T	9288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=-1.165;DP=493;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.355;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.128;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,238:469:99:9317,0,9136
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contig368	15279	.	C	T	8247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=1.020;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.777;QD=19.64;ReadPosRankSum=-1.066;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,204:420:99:8276,0,8814
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contig368	15555	.	G	T	7629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=1.686;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.388;QD=18.98;ReadPosRankSum=2.020;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:200,202:402:99:7658,0,14290
contig368	15573	.	A	G	7151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.193;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=4.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.524;QD=18.87;ReadPosRankSum=4.780;SOR=0.649	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,180:379:99:7180,0,15566
contig368	15576	.	A	G	7046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.072;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=5.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.535;QD=18.12;ReadPosRankSum=2.303;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:206,183:389:99:7075,0,15371
contig368	15777	.	G	C	6854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.027;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=3.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.673;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.070;SOR=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,181:396:99:6883,0,8550
contig368	15783	.	G	A	7444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.332;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.251;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:218,188:406:99:7473,0,8798
contig368	15795	.	C	T	7289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.486;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.862;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,190:415:99:7318,0,8848
contig368	15850	.	A	G	9266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-0.274;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.465;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,246:503:99:9295,0,9762
contig368	15864	.	G	C	9359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-0.266;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.173;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,247:491:99:9388,0,9398
contig368	16193	.	C	G	11907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-1.143;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.008;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.300;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:383,306:689:99:11936,0,15272
contig368	16197	.	T	C	12101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-1.334;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.266;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:382,307:689:99:12130,0,15605
contig368	16212	.	C	T	11769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.515;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.357;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:372,303:675:99:11798,0,15119
contig368	16228	.	A	G	11686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.551;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.531;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.696;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,302:661:99:11715,0,13838
contig368	17024	.	AT	A	6730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.516;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.798;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.701;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,270:555:99:6768,0,7130
contig368	17154	.	T	C	8004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.140;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.791;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:220,255:475:99:8033,0,8409
contig368	17183	.	T	C	6690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.721;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.211;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,229:501:99:6719,0,8531
contig368	17305	.	A	T	6015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=-0.178;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.592;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.474;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,185:389:99:6044,0,6494
contig368	17322	.	TA	T	4068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.526;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.357;QD=10.74;ReadPosRankSum=3.209;SOR=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:204,175:379:99:4106,0,4777
contig368	17802	.	T	G	9754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.507;DP=537;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.798;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,253:506:99:9783,0,9891
contig368	17806	.	A	G	9881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.374;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.636;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,256:517:99:9910,0,10109
contig368	17967	.	T	C	7313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.452;DP=498;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.931;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,240:470:99:7342,0,6993
contig368	18083	.	A	T	10746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.424;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.504;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,287:544:99:10775,0,9612
contig368	18097	.	T	A	10269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-0.104;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.617;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.619;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,266:520:99:10298,0,9538
contig368	18304	.	C	G	8611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-2.121;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.236;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,279:599:99:8640,0,9847
contig368	18359	.	G	A	10829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.794;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.488;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,277:546:99:10858,0,10484
contig368	18371	.	A	T	11720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.290;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.018;QD=21.27;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,287:551:99:11749,0,10699
contig368	18372	.	T	C	11846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.283;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.031;QD=21.50;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,287:551:99:11875,0,10808
contig368	18380	.	T	C	11234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=-0.097;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.087;QD=20.21;ReadPosRankSum=2.783;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,291:556:99:11263,0,10085
contig368	18662	.	G	T	10658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=1.224;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.600;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,275:536:99:10687,0,13775
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contig368	18936	.	A	G	9282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=-1.407;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=28.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.049;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.131;SOR=0.284	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:167,223:390:99:9311,0,6476
contig368	18948	.	G	C	9105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=1.285;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=4.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.510;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,223:416:99:9134,0,7784
contig368	18952	.	A	G	9152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=-1.006;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.610;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,223:426:99:9181,0,8144
contig368	18953	.	C	T	9236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;ClippingRankSum=0.131;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.714;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.499	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,224:429:99:9265,0,8364
contig368	18969	.	C	T	6839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=-0.019;DP=492;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.083;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,229:471:99:6868,0,9200
contig368	19158	.	A	G	8132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.287;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.267;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:303,262:565:99:8161,0,9587
contig368	19198	.	C	T	9372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.416;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.797;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,305:607:99:9401,0,9164
contig368	19319	.	T	C	9451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.563;DP=578;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.007;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.018;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,248:547:99:9480,0,11708
contig368	19333	.	C	A	9705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.089;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.233;QD=17.33;ReadPosRankSum=-1.921;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,259:560:99:9734,0,11565
contig368	19368	.	C	T	8014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.838;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=2.127;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,255:534:99:8043,0,8828
contig368	19450	.	T	C	9164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-1.409;DP=597;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.158;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,306:568:99:9193,0,8184
contig368	19485	.	C	T	8414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.356;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.341;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.949	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,275:574:99:8443,0,8788
contig368	19878	.	A	G	6475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=-0.925;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.718;QD=13.44;ReadPosRankSum=-3.722;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,214:482:99:6504,0,10081
contig368	19917	.	T	C	7247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.720;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.058;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,218:376:99:7276,0,5144
contig368	20043	.	G	A	10110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-1.669;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.862;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,264:534:99:10139,0,10293
contig368	20052	.	G	A	10312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.352;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.388;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,259:522:99:10341,0,10540
contig368	20055	.	A	G	10292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=-1.367;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.817;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,262:525:99:10321,0,10327
contig368	20850	.	A	G	10718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.197;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-2.105;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,277:582:99:10747,0,16464
contig368	20858	.	C	T	10577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=1.787;DP=603;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.151;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.674;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,277:574:99:10606,0,16380
contig368	20968	.	C	T	10690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=-0.044;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.543;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,284:594:99:10719,0,12052
contig368	20979	.	C	T	10867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=-0.613;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.694;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,286:590:99:10896,0,12261
contig368	21000	.	C	T	10934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-0.928;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.492;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,281:568:99:10963,0,11443
contig368	21008	.	C	T	10607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=1.426;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.587;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.325;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,276:566:99:10636,0,11234
contig368	21299	.	CT	C	5869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.695;DP=571;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.291;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,231:467:99:5907,0,6060
contig368	21350	.	T	A	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=2.031;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.414;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,235:498:99:9040,0,10606
contig368	21351	.	T	A	9095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=-0.601;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.715;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,234:499:99:9124,0,10624
contig368	21357	.	C	G	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=-2.023;DP=528;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.842;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,226:492:99:9040,0,10630
contig368	21361	.	A	G	8930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=1.217;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.097;QD=17.65;ReadPosRankSum=-1.831;SOR=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,235:506:99:8959,0,10675
contig368	21453	.	G	A	9956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=-0.302;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.167;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.850;SOR=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,257:518:99:9985,0,10078
contig368	21461	.	A	T	9805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.601;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.283;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.939;SOR=0.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,250:519:99:9834,0,10319
contig368	21566	.	TA	T	8346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.896;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.024;QD=20.41;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,214:409:99:8384,0,7541
contig368	21573	.	G	C	8568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.058;DP=442;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.688;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,223:422:99:8597,0,7635
contig368	22052	.	T	C	11385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-1.216;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.216;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:312,294:606:99:11414,0,12147
contig368	22061	.	G	C	11841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.706;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.254;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,296:596:99:11870,0,12135
contig368	22067	.	T	C	11405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.776;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.298;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,296:607:99:11434,0,11977
contig368	22209	.	C	T	12486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=-0.686;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.130;QD=20.01;ReadPosRankSum=1.910;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,324:624:99:12515,0,14452
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contig368	22975	.	G	C	11496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.745;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.483;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,305:625:99:11525,0,12261
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contig368	23029	.	G	A	11929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.142;DP=696;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.273;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.183;SOR=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,306:670:99:11958,0,14580
contig368	23185	.	C	CA	4074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.124;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.001;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.164;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,209:454:99:4112,0,9386
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contig368	23395	.	T	C	9110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.145;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.846;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.266;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,282:554:99:9139,0,8639
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contig368	23608	.	C	T	10575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.363;DP=704;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.040;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,335:671:99:10604,0,10734
contig368	23656	.	T	C	13158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.172;DP=724;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.318;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:351,345:696:99:13187,0,13539
contig368	23660	.	T	C	12853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.062;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.499;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.207;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,331:685:99:12882,0,13764
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contig368	23998	.	A	G	14627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=-0.425;DP=700;ExcessHet=3.0103;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.141;QD=21.74;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,372:673:99:14656,0,11618
contig368	24153	.	A	G	13609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.668;DP=726;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.646;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,353:690:99:13638,0,13645
contig368	24159	.	C	T	13873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=1.752;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.750;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.679;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,350:685:99:13902,0,13460
contig368	24173	.	T	C	12602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.127;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.848;QD=19.51;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,325:646:99:12631,0,12389
contig368	24718	.	CAAAATTAATAATGCT	C	10059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.009;DP=676;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.370;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.989;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,271:631:99:10097,0,14196
contig368	25400	.	G	A	10192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.222;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.722;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:191,263:454:99:10221,0,8261
contig368	25412	.	G	A	10346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=-1.559;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.500;QD=24.12;ReadPosRankSum=-2.333;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:183,246:429:99:10375,0,8260
contig368	25415	.	G	A	10121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.345;DP=454;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.147;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=0.874	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,244:433:99:10150,0,8668
contig368	25417	.	G	A	10034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.375;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.616;QD=22.86;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,244:439:99:10063,0,8716
contig368	25418	.	T	C	10115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.683;DP=461;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.818;QD=23.04;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,242:439:99:10144,0,8752
contig368	25421	.	G	A	9838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.548;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.079;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,238:437:99:9867,0,9016
contig368	25422	.	C	T	9850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.890;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.107;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,235:437:99:9879,0,9012
contig368	25436	.	C	A	9357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=-0.413;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.373;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,244:447:99:9386,0,8776
contig368	25480	.	T	A	8519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-1.191;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.398;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,267:497:99:8548,0,6868
contig368	25529	.	A	G	11211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-1.649;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=3.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.963;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,290:573:99:11240,0,10915
contig368	25535	.	AG	A	11715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=3.505;DP=608;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.634;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,291:577:99:11753,0,11537
contig368	25539	.	A	G	11642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.057;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=4.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.766;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,297:591:99:11671,0,11701
contig368	25542	.	A	G	11666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=1.555;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.155;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,295:581:99:11695,0,11414
contig368	25585	.	C	A	11529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.146;ClippingRankSum=-1.238;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.605;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,304:569:99:11558,0,9821
contig368	25608	.	A	G	12403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.167;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.485;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.564;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,313:593:99:12432,0,11268
contig368	25625	.	A	G	12278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=-0.585;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.750;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,306:581:99:12307,0,10912
contig368	25650	.	A	G	12883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.640;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.235;QD=21.91;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,311:588:99:12912,0,11022
contig368	25654	.	G	A	12433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.137;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.606;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,309:582:99:12462,0,10887
contig368	25660	.	G	A	12673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.324;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.034;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.989;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,306:580:99:12702,0,11037
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contig368	25882	.	GT	G	8363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.970;DP=466;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.362;QD=19.18;ReadPosRankSum=4.875;SOR=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,211:436:99:8401,0,9339
contig368	25884	.	ATGT	A	8245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-1.057;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.079;QD=18.32;ReadPosRankSum=4.516;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,218:450:99:8283,0,9195
contig368	26068	.	T	TG	7697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.799;DP=658;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.535;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,290:612:99:7735,0,10122
contig368	26155	.	G	A	9557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.210;DP=683;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.012;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,314:652:99:9586,0,10342
contig368	26185	.	A	G	12546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-1.302;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.354;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:352,331:683:99:12575,0,13311
contig368	26199	.	AAT	A	13128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=2.629;DP=720;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.704;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,337:696:99:13166,0,14342
contig368	26202	.	GA	G	13087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.093;DP=714;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.228;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:354,335:689:99:13125,0,14273
contig368	26211	.	GTAT	G	12714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=1.304;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.090;QD=19.32;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,320:658:99:12752,0,13739
contig368	26216	.	G	GTA	12528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=-0.812;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-2.222;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,317:652:99:12566,0,13202
contig368	26245	.	G	A	12694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=1.364;DP=649;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.829;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:290,330:620:99:12723,0,11074
contig368	26252	.	T	C	12705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=1.850;DP=627;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.233;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.239;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,315:600:99:12734,0,11357
contig368	26258	.	G	A	11844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.076;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.288;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:270,298:568:99:11873,0,10604
contig368	26293	.	A	G	7830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.275;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.849;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,264:541:99:7859,0,8697
contig368	26485	.	T	C	10075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.458;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.152;QD=19.08;ReadPosRankSum=2.629;SOR=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,262:528:99:10104,0,15571
contig368	26494	.	T	C	10579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.151;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.157;QD=19.92;ReadPosRankSum=2.496;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,267:531:99:10608,0,15611
contig368	26509	.	G	A	10964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.520;DP=575;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.308;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,281:537:99:10993,0,15091
contig368	26638	.	A	G	12654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.680;DP=675;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.004;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,320:642:99:12683,0,12449
contig368	26640	.	C	T	12654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=1.446;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.918;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,328:649:99:12683,0,12449
contig368	26666	.	T	C	9875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=-0.253;DP=667;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.983;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.486;SOR=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:316,312:628:99:9904,0,10390
contig368	26699	.	G	A	10364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.337;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.304;QD=17.81;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,274:582:99:10393,0,11942
contig368	26716	.	T	G	10624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.926;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.337;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.806;SOR=1.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,264:588:99:10653,0,13268
contig368	26718	.	ATATT	A	10609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.099;DP=637;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.881;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,270:604:99:10647,0,13564
contig368	26725	.	TTCTTCATCTTCTTCGC	T	10499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.264;ClippingRankSum=1.103;DP=671;ExcessHet=3.0103;FS=4.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.040;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:368,268:636:99:10537,0,15029
contig368	26766	.	C	T	9886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.838;DP=609;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.904;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,272:577:99:9915,0,11479
contig368	27391	.	G	A	9036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=1.947;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.474;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,235:495:99:9065,0,11507
contig368	27394	.	C	T	9012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=1.661;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.725;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,235:496:99:9041,0,11464
contig368	27598	.	C	T	10645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-1.156;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.870;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,282:588:99:10674,0,11713
contig368	27608	.	T	C	10307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=1.492;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.151;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.463;SOR=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,277:588:99:10336,0,11827
contig368	27775	.	T	C	8722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.464;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.956;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,226:513:99:8751,0,11603
contig368	27779	.	C	T	8846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-0.791;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.443;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.754;SOR=0.760	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:297,231:528:99:8875,0,11950
contig368	27800	.	T	C	8615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-0.827;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.136;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.400;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,223:510:99:8644,0,11704
contig368	27801	.	CAA	C	8756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.358;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.374;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.622;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,221:513:99:8794,0,11944
contig368	27806	.	CT	C	8862.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=-0.859;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.591;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.424;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:296,223:519:99:8900,0,12005
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contig368	28195	.	T	C	12226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.918;DP=665;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.312;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.861;SOR=0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,316:643:99:12255,0,12751
contig368	28202	.	C	T	12111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.471;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.435;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.769;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,313:639:99:12140,0,13321
contig368	28224	.	G	A	10878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=-1.496;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.547;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,322:653:99:10907,0,12304
contig368	28259	.	C	T	13837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.160;DP=755;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=0.554;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,364:724:99:13866,0,13676
contig368	28274	.	CTCTCTTTGCTTT	C	11057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.028;DP=817;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=1.155;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:419,347:766:99:11095,0,16800
contig368	28287	.	ATTTCTT	A	13502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.043;DP=774;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=0.488;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.201;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:377,348:725:99:13540,0,15272
contig368	28295	.	A	C	14662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;ClippingRankSum=0.332;DP=746;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-1.297;QD=21.04;ReadPosRankSum=2.657;SOR=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:355,342:697:99:14700,0,14648
contig368	28303	.	T	C	14402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-0.095;DP=783;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=0.071;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:370,359:729:99:14431,0,14882
contig368	28326	.	T	C	13272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;ClippingRankSum=-1.237;DP=752;ExcessHet=3.0103;FS=4.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=-1.297;QD=19.21;ReadPosRankSum=-3.019;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:360,331:691:99:13301,0,14921
contig368	28334	.	C	T	12570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-1.292;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=0.634;QD=18.88;ReadPosRankSum=-3.468;SOR=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:350,316:666:99:12599,0,14219
contig368	28339	.	TC	T	12366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.300;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-1.582;QD=19.00;ReadPosRankSum=-3.408;SOR=0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,309:651:99:12404,0,14024
contig368	28344	.	T	C	12048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;ClippingRankSum=-0.657;DP=710;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=3.006;QD=18.74;ReadPosRankSum=-2.287;SOR=0.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:338,305:643:99:12077,0,13668
contig368	28347	.	C	T	11809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.812;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=1.149;QD=18.37;ReadPosRankSum=-1.997;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:341,302:643:99:11838,0,13365
contig368	28472	.	G	C	10348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.488;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.006;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,263:494:99:10377,0,8966
contig368	28474	.	A	G	10348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.208;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.978;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,267:499:99:10377,0,8966
contig368	28503	.	C	A	8795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=-1.285;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.517;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,234:509:99:8824,0,10762
contig368	28513	.	C	T	8729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=1.185;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.257;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:256,222:478:99:8758,0,10378
contig368	28517	.	C	T	8561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=-1.687;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-2.078;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,225:476:99:8590,0,9943
contig368	28720	.	TA	T	9791.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=-0.356;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.451;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=0.605	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,257:495:99:9829,0,9219
contig368	28734	.	G	A	10214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-0.038;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.369;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.450;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,264:525:99:10243,0,9820
contig368	28864	.	CATTGGAAAGGTTGAGTG	C	9009.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.416;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.716;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,244:576:99:9047,0,13058
contig368	28898	.	CAA	C	5150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.116;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=8.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=2.465;QD=12.12;ReadPosRankSum=-3.189;SOR=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,213:425:99:5188,0,6296
contig368	29036	.	CT	C	6878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-1.538;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.945;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.824;SOR=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,222:419:99:6916,0,7342
contig368	29039	.	T	C	6887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.449;DP=458;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.741;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.874;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,222:419:99:6916,0,7342
contig368	29088	.	A	T	7879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-0.727;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.612;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.988;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,210:407:99:7908,0,7157
contig368	29108	.	G	A	8091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=1.867;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=4.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.755;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,208:407:99:8120,0,7462
contig368	29155	.	C	CAA	5503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=-2.121;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.959;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:195,190:385:99:5541,0,6159
contig368	29265	.	C	T	7441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.370;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.684;QD=17.85;ReadPosRankSum=2.198;SOR=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:214,203:417:99:7470,0,8128
contig368	29276	.	C	T	6867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=-1.497;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.091;QD=18.22;ReadPosRankSum=2.196;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:203,174:377:99:6896,0,8129
contig368	29290	.	G	A	5790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=-0.918;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=4.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.690;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.646;SOR=0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,151:347:99:5819,0,7826
contig368	29291	.	C	T	5754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=-0.528;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=4.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.447;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.496;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,149:341:99:5783,0,7745
contig368	29323	.	A	ACCCTACGCTTG	5601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;ClippingRankSum=1.334;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.458;QD=23.54;ReadPosRankSum=-4.075;SOR=1.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:97,141:238:99:5639,0,3463
contig368	29329	.	C	CGCTTATCCTAT	4826.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.324;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=1.005;QD=23.78;ReadPosRankSum=-3.801;SOR=0.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:89,114:203:99:4864,0,3360
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contig368	29414	.	C	G	4058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.213;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.250;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,103:182:99:4087,0,3038
contig368	29436	.	C	T	3576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.326;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=1.222;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,108:236:99:3605,0,4749
contig368	29461	.	A	AT	5197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.559;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.572;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,156:357:99:5235,0,7092
contig368	29468	.	G	T	6386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.079;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.107;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,211:375:99:6415,0,5370
contig368	29492	.	A	AGCCG	8055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.387;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.886;QD=18.14;ReadPosRankSum=-2.246;SOR=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,206:444:99:8093,0,9252
contig368	29553	.	C	A	7264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=-0.336;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.796;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,240:491:99:7293,0,8131
contig368	29693	.	A	G	10331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.031;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=5.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.423;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,326:632:99:10360,0,9322
contig368	29805	.	C	G	10962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.976;DP=636;ExcessHet=3.0103;FS=3.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.235;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,300:607:99:10991,0,11665
contig368	29825	.	T	C	10517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=1.971;DP=617;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.927;QD=17.80;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,287:591:99:10546,0,11579
contig368	30365	.	ATC	A	12360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=-0.108;DP=712;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=0.653;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,316:655:99:12398,0,13446
contig368	30369	.	C	G	12505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=1.023;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=0.226;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,325:664:99:12534,0,13856
contig368	30371	.	ATCAT	A	12571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=-0.457;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=0.136;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:364,321:685:99:12609,0,14622
contig368	30378	.	CTTT	C	12579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.489;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=0.046;QD=18.72;ReadPosRankSum=2.473;SOR=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:356,316:672:99:12617,0,14625
contig368	30405	.	C	A	12377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-0.859;DP=694;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-6.700;QD=18.93;ReadPosRankSum=-2.745;SOR=0.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,310:654:99:12406,0,14142
contig368	30417	.	TCATCC	T	12911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=1.603;DP=718;ExcessHet=3.0103;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQRankSum=-8.842;QD=19.16;ReadPosRankSum=-6.215;SOR=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:359,315:674:99:12949,0,14352
contig368	30426	.	CCT	C	12793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.671;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-10.971;QD=19.41;ReadPosRankSum=-6.820;SOR=1.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,320:659:99:12831,0,13532
contig368	30434	.	T	TATCTCTA	14330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.394;DP=698;ExcessHet=3.0103;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=-9.905;QD=21.81;ReadPosRankSum=-6.404;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:331,326:657:99:14368,0,13379
contig368	30439	.	C	T	13410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.088;ClippingRankSum=0.326;DP=717;ExcessHet=3.0103;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQRankSum=-9.420;QD=19.84;ReadPosRankSum=-6.690;SOR=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,334:676:99:13439,0,13529
contig368	30440	.	C	T	13532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.673;ClippingRankSum=-0.945;DP=721;ExcessHet=3.0103;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-8.482;QD=19.90;ReadPosRankSum=-6.824;SOR=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:340,340:680:99:13561,0,13562
contig368	30444	.	C	T	9799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.228;ClippingRankSum=1.092;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=-10.299;QD=14.63;ReadPosRankSum=-5.185;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:339,331:670:99:9828,0,13791
contig368	30450	.	C	T	13356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;ClippingRankSum=0.426;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=4.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQRankSum=-8.174;QD=20.30;ReadPosRankSum=-4.308;SOR=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,339:658:99:13385,0,13115
contig368	30455	.	T	A	13167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=0.852;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-3.857;QD=20.97;ReadPosRankSum=-3.037;SOR=1.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,317:628:99:13196,0,12461
contig368	30458	.	T	C	12921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.128;ClippingRankSum=0.744;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=5.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-5.963;QD=20.91;ReadPosRankSum=-2.373;SOR=1.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,310:618:99:12950,0,12372
contig368	30468	.	G	T	12073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=1.071;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-4.911;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.553;SOR=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,319:610:99:12102,0,11709
contig368	30668	.	T	C	9722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.587;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.905;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,251:527:99:9751,0,10840
contig368	30669	.	G	A	9722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=1.336;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.086;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,254:532:99:9751,0,10840
contig368	30716	.	A	C	9352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-1.236;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.680;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,239:523:99:9381,0,11139
contig368	30722	.	A	G	9995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.276;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.131;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.848	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,256:540:99:10024,0,11389
contig368	30740	.	A	T	9543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.704;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.002;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,255:550:99:9572,0,12111
contig368	30762	.	A	G	11596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.009;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.215;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:262,295:557:99:11625,0,10476
contig368	30764	.	G	A	11959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=2.327;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.230;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,295:556:99:11988,0,10659
contig368	30774	.	G	A	11718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.920;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.780;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,290:547:99:11747,0,10353
contig368	30794	.	T	C	11621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.487;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.356;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:259,288:547:99:11650,0,10274
contig368	30810	.	A	G	10569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=1.337;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.030;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.092;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,280:552:99:10598,0,10243
contig368	31000	.	G	A	10149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=1.366;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.640;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,266:467:99:10178,0,7532
contig368	31016	.	T	C	10571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=1.727;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.228;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,261:482:99:10600,0,8717
contig368	31032	.	T	C	11059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.139;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.491;QD=21.64;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,272:511:99:11088,0,9517
contig368	31052	.	G	A	10604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.290;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.699;QD=20.08;ReadPosRankSum=-2.724;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,285:528:99:10633,0,9089
contig368	31262	.	C	T	4917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=1.786;DP=309;ExcessHet=3.0103;FS=124.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.19;MQRankSum=4.704;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.792;SOR=7.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,130:309:99:4946,0,7087
contig368	31265	.	T	C	4852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.566;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=123.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.97;MQRankSum=6.154;QD=16.28;ReadPosRankSum=2.270;SOR=7.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,127:298:99:4881,0,7160
contig368	31286	.	C	T	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.132;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=157.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.75;MQRankSum=3.548;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.691;SOR=8.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:157,103:260:99:3922,0,6513
contig368	31304	.	C	A	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=-1.659;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=160.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.47;MQRankSum=2.410;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=8.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:165,89:254:99:3147,0,6291
contig368	31574	.	A	G	5265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.871;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.70;MQRankSum=-0.258;QD=29.09;ReadPosRankSum=-1.675;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,180:181:99:5294,510,0
contig368	31613	.	A	G	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-1.312;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.65;MQRankSum=0.997;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,131:132:99:5697,355,0
contig368	31619	.	A	C	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=1.197;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=4.367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.26;MQRankSum=-0.972;QD=30.40;ReadPosRankSum=1.084;SOR=1.204	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,122:123:99:5470,328,0
contig368	31620	.	G	A	5441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.881;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.63;MQRankSum=-0.294;QD=31.59;ReadPosRankSum=1.204;SOR=1.284	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,117:118:99:5470,328,0
contig368	31626	.	A	G	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=1.250;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=4.925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.29;MQRankSum=-0.166;QD=36.97;ReadPosRankSum=1.612;SOR=1.570	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,114:115:99:5175,307,0
contig368	31633	.	CAGT	C	4957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.47;QD=30.36;SOR=2.393	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,106:106:99:4995,334,0
contig368	31642	.	C	CGA	4237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;QD=27.91;SOR=3.987	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:4275,286,0
contig368	31643	.	AGC	A	4057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.06;QD=30.17;SOR=6.568	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,81:81:99:4095,274,0
contig368	31648	.	C	T	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.52;QD=30.70;SOR=8.764	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3735,250,0
contig368	31658	.	A	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;QD=31.72;SOR=8.789	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3600,241,0
contig368	31670	.	T	C	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;QD=32.63;SOR=8.581	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3285,220,0
contig368	31671	.	G	A	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;QD=25.93;SOR=8.581	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3240,217,0
contig368	31675	.	T	C	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;QD=28.25;SOR=8.526	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3195,214,0
contig368	31676	.	C	T	3166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;QD=29.60;SOR=8.526	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3195,214,0
contig368	31677	.	A	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.84;QD=25.70;SOR=8.468	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:3150,211,0
contig368	31754	.	A	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.72;QD=28.23;SOR=5.994	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:772,57,0
contig368	31764	.	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;QD=28.43;SOR=5.283	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
contig368	33057	.	C	T	6912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=-0.718;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=22.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.39;MQRankSum=4.123;QD=31.00;ReadPosRankSum=1.863;SOR=2.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,165:223:99:6941,0,4357
contig368	33060	.	T	C	7124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.117;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=21.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.50;MQRankSum=4.965;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.889;SOR=1.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,169:228:99:7153,0,4536
contig368	33081	.	C	T	8026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-1.207;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=8.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.31;MQRankSum=6.112;QD=33.03;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=1.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,193:243:99:8055,0,3931
contig368	33099	.	C	A	8538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.677;ClippingRankSum=0.084;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=11.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.36;MQRankSum=7.408;QD=34.02;ReadPosRankSum=-2.022;SOR=1.245	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,216:251:99:8567,0,2787
contig368	33270	.	T	C	6264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.027;ClippingRankSum=-0.107;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.52;MQRankSum=-1.768;QD=20.27;ReadPosRankSum=-2.384;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,215:309:99:6293,0,1614
contig368	33408	.	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=-0.455;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=28.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.95;MQRankSum=-2.641;QD=0.78;ReadPosRankSum=4.637;SOR=4.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:164,16:180:99:169,0,6702
contig368	33414	.	A	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=0.202;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=24.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.27;MQRankSum=-2.918;QD=1.00;ReadPosRankSum=3.744;SOR=4.234	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:148,16:164:99:193,0,6501
contig368	33415	.	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.085;ClippingRankSum=-0.547;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=21.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.12;MQRankSum=-2.774;QD=1.06;ReadPosRankSum=3.421;SOR=4.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:143,16:159:99:196,0,6466
contig368	33421	.	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;ClippingRankSum=0.077;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=16.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.70;MQRankSum=-2.499;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.075;SOR=3.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:133,16:149:99:256,0,5746
contig368	33428	.	CAGT	C	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.240;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=11.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.20;MQRankSum=-2.725;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.503;SOR=2.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:120,16:136:99:281,0,5411
contig368	33437	.	C	CGA	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.414;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQRankSum=-2.248;QD=3.25;ReadPosRankSum=-3.124;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,17:111:99:398,0,4358
contig368	33438	.	AGC	A	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.463;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQRankSum=-1.968;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.382;SOR=0.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,17:110:99:461,0,4061
contig368	33443	.	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.132;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.89;MQRankSum=-2.508;QD=3.95;ReadPosRankSum=-3.196;SOR=0.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:93,18:111:99:467,0,3943
contig368	33453	.	A	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.856;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQRankSum=-0.281;QD=1.54;ReadPosRankSum=-3.499;SOR=0.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:90,10:100:99:182,0,3785
contig368	33505	.	A	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.959;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;MQRankSum=0.831;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=5.892	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,56:58:85:2417,85,0
contig368	33507	.	C	T	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.976;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.81;MQRankSum=1.019;QD=30.78;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=5.856	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,55:57:85:2417,85,0
contig368	33514	.	G	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=1.043;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;MQRankSum=0.218;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.170;SOR=5.630	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,49:51:67:2160,67,0
contig368	33520	.	C	T	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-1.522;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.89;MQRankSum=1.728;QD=35.69;ReadPosRankSum=0.748;SOR=5.507	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,46:48:61:2070,61,0
contig368	33597	.	G	A	246.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=32.60;SOR=4.174	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:275,21,0
contig368	33600	.	G	A	214.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=34.30;SOR=3.258	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:243,18,0
contig368	33613	.	C	T	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=18.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
contig368	33624	.	C	T	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=17.37;SOR=2.303	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
contig368	33918	.	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=29.40;SOR=5.136	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:381,36,0
contig368	33951	.	T	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;QD=32.93;SOR=6.518	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:87:1305,87,0
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contig368	41968	.	T	A	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.027;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=18.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.08;MQRankSum=-1.732;QD=33.25;ReadPosRankSum=0.773;SOR=8.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,64:65:64:2685,0,64
contig370	57	.	A	T	5737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-2.363;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.001;QD=19.19;ReadPosRankSum=2.326;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:150,149:299:99:5766,0,8245
contig370	61	.	A	C	5644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-2.074;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.530;QD=18.45;ReadPosRankSum=2.885;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:158,148:306:99:5673,0,8329
contig370	573	.	A	G	11024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.945;DP=596;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.002;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.810;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,287:574:99:11053,0,10965
contig370	580	.	A	G	10970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.697;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.490;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,281:556:99:10999,0,10750
contig370	618	.	C	T	10222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.524;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.943;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,263:524:99:10251,0,10201
contig370	619	.	T	C	10219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=-1.236;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.258;QD=19.73;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,260:518:99:10248,0,10222
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contig370	652	.	G	A	9422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.553;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.172;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,249:491:99:9451,0,9121
contig370	670	.	G	A	10317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=-0.281;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.782;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,261:492:99:10346,0,9018
contig370	678	.	C	T	9849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-2.186;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.333;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,253:476:99:9878,0,8617
contig370	859	.	C	T	6575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.092;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.411;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.921;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,212:428:99:6604,0,6745
contig370	889	.	A	G	6392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-1.184;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.622;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,212:444:99:6421,0,6936
contig370	996	.	T	C	7865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.184;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.063;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,260:491:99:7894,0,7056
contig370	1009	.	A	G	10265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-1.137;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.411;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,262:488:99:10294,0,8670
contig370	1013	.	G	T	10222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.428;DP=518;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.222;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,263:486:99:10251,0,8604
contig370	1198	.	T	C	8253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=1.090;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.392;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,259:523:99:8282,0,9662
contig370	1235	.	A	C	9126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=-1.906;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.310;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,292:578:99:9155,0,8498
contig370	1850	.	GAAGAAATGAGGA	G	7757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=-1.179;DP=630;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.162;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,255:530:99:7795,0,10638
contig370	2040	.	T	C	7242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.355;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.047;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.195;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,193:412:99:7271,0,8286
contig370	2057	.	A	AG	7363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.005;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=2.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.619;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.679;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:213,182:395:99:7401,0,8664
contig370	2058	.	A	AGTC	7489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=2.441;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.420;QD=19.06;ReadPosRankSum=1.197;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:215,178:393:99:7527,0,8697
contig370	2064	.	CT	C	7162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.030;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.333;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.197;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:219,177:396:99:7200,0,9212
contig370	2066	.	CCCCAGA	C	6894.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=-0.307;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.068;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.280;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,184:416:99:6932,0,9374
contig370	2106	.	A	G	8170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.147;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=0.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.896;QD=21.00;ReadPosRankSum=2.893;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,210:389:99:8199,0,6796
contig370	2116	.	T	C	8797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-1.037;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.891;QD=22.50;ReadPosRankSum=2.022;SOR=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,215:391:99:8826,0,7055
contig370	2119	.	C	T	8683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-1.807;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.524;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.863;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:176,218:394:99:8712,0,6905
contig370	2122	.	T	C	8546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.825;DP=414;ExcessHet=3.0103;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.278;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:175,216:391:99:8575,0,6711
contig370	2466	.	G	A	7165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.676;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.066;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,187:384:99:7194,0,10517
contig370	2472	.	G	A	7182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.054;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.581;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,190:395:99:7211,0,10765
contig370	2498	.	T	C	5755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=0.141;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.482;QD=14.72;ReadPosRankSum=2.108;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,190:391:99:5784,0,5434
contig370	2967	.	T	C	3522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=1.490;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=11.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.376;QD=12.02;ReadPosRankSum=2.858;SOR=1.257	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:171,122:293:99:3551,0,4995
contig370	3006	.	A	G	5847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.862;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=7.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.950;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,181:344:99:5876,0,4656
contig370	5072	.	T	C	9876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-0.078;DP=616;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.043;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:335,260:595:99:9905,0,14494
contig370	5078	.	C	G	10211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=2.368;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.490;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:329,253:582:99:10240,0,14604
contig370	5080	.	G	A	9724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.753;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.008;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:326,257:583:99:9753,0,14513
contig370	5202	.	A	T	12058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.829;DP=655;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.026;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:322,309:631:99:12087,0,12193
contig370	5211	.	C	T	12079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.975;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-2.008;QD=19.14;ReadPosRankSum=-1.495;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,307:631:99:12108,0,13299
contig370	5214	.	TAAG	T	11926.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=-1.212;DP=661;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.400;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.037;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:342,298:640:99:11964,0,13834
contig370	5222	.	T	C	11860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.299;ClippingRankSum=0.596;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.017;QD=19.90;ReadPosRankSum=1.132;SOR=0.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:328,268:596:99:11889,0,13140
contig370	5226	.	T	C	10681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.658;ClippingRankSum=-0.004;DP=612;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.961;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,265:590:99:10710,0,13266
contig370	5228	.	T	C	10645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.938;DP=606;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-2.212;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,265:585:99:10674,0,13104
contig370	5229	.	G	A	10644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-2.003;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.266;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:319,268:587:99:10673,0,12978
contig370	5238	.	A	G	10807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.388;ClippingRankSum=0.158;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.925;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.449;SOR=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:314,269:583:99:10836,0,12591
contig370	5246	.	C	CGTT	11428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.056;ClippingRankSum=0.348;DP=599;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.674;QD=19.77;ReadPosRankSum=-2.195;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,272:578:99:11466,0,12546
contig370	5249	.	T	A	10903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.145;ClippingRankSum=0.513;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.461;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.532;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,270:578:99:10932,0,12417
contig370	5250	.	G	A	10846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=-0.056;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.152;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.753;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,270:575:99:10875,0,12630
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contig370	5417	.	A	G	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.353;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.090;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.833;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,238:505:99:9168,0,15855
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contig370	5498	.	A	G	10677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.481;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.590;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,280:556:99:10706,0,10785
contig370	5508	.	C	T	10879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.354;DP=618;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.254;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,292:586:99:10908,0,11090
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contig370	6098	.	C	G	10810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=-0.931;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.041;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.635;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:332,268:600:99:10839,0,13719
contig370	6109	.	GAATGAATAGTCAATTAATAGTGAATGAATAGTC	G	9933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.508;ClippingRankSum=1.946;DP=729;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=0.029;QD=13.93;ReadPosRankSum=-1.418;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:445,268:713:99:9971,0,18450
contig370	6191	.	A	G	11821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.434;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.875;QD=19.97;ReadPosRankSum=2.339;SOR=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,313:592:99:11850,0,11139
contig370	6212	.	C	A	13166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.891;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.250;QD=21.76;ReadPosRankSum=-2.908;SOR=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,320:605:99:13195,0,11454
contig370	6233	.	C	T	12565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.499;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.093;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:295,328:623:99:12594,0,11780
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contig370	6855	.	A	T	6313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.456;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.025;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,171:361:99:6342,0,7752
contig370	6872	.	C	T	7034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.606;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.201;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:189,175:364:99:7063,0,9147
contig370	6882	.	G	A	6858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.068;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.092;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:190,183:373:99:6887,0,8858
contig370	6908	.	C	T	5068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=1.033;DP=384;ExcessHet=3.0103;FS=2.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.543;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:186,181:367:99:5097,0,5770
contig370	7148	.	T	G	15493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=-1.466;DP=449;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.000;QD=30.79;ReadPosRankSum=-1.901;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,407:411:99:15522,1137,0
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contig370	7927	.	A	G	9042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.304;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.742;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.798;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,236:466:99:9071,0,8425
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contig370	8310	.	T	C	7229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.259;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=1.537;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,236:472:99:7258,0,7484
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contig370	9697	.	AGGG	A	10222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.748;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.972;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.625;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:294,269:563:99:10260,0,11440
contig370	9713	.	A	G	8320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.153;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.043;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.929;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,282:584:99:8349,0,9337
contig370	10359	.	A	C	12091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.398;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.792;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:334,318:652:99:12120,0,13558
contig370	10370	.	C	T	12526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=-1.718;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.311;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:325,313:638:99:12555,0,13130
contig370	10378	.	A	T	12399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=1.557;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.628;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.665;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:320,302:622:99:12428,0,13688
contig370	10391	.	GCA	G	11650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.080;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.809;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.897	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:321,296:617:99:11688,0,13527
contig370	10419	.	C	G	11253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-1.036;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.562;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,300:574:99:11282,0,10762
contig370	10437	.	A	C	11968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=1.096;DP=586;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.094;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,294:554:99:11997,0,10522
contig370	10453	.	T	C	11183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=1.210;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.894;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,293:544:99:11212,0,9500
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contig370	10593	.	G	A	9343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.938;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.816;QD=18.36;ReadPosRankSum=1.439;SOR=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,248:509:99:9372,0,10064
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contig370	11577	.	T	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-1.209;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.59;MQRankSum=-0.277;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:66,40:106:99:1291,0,2258
contig372	45	.	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.083;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=11.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=1.965;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=2.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,65:133:99:2588,0,2924
contig372	69	.	G	A	3353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-0.521;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=14.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=1.198;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=2.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:95,85:180:99:3382,0,3866
contig372	86	.	C	CTG	4378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=2.743;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=11.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.012;QD=18.17;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=1.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,112:241:99:4416,0,5322
contig372	87	.	A	T	4519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=1.452;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=15.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-0.711;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=1.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:132,112:244:99:4548,0,5271
contig372	88	.	GC	G	4146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.632;DP=391;ExcessHet=3.0103;FS=11.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-2.147;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:116,134:250:99:4184,0,4676
contig372	91	.	A	AGCG	5099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=-0.641;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=13.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-0.096;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:142,117:259:99:5137,0,5546
contig372	103	.	C	G	5517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.458;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=2.238;QD=19.71;ReadPosRankSum=-2.788;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,141:280:99:5546,0,5471
contig372	116	.	T	C	5621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=-0.307;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=6.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=1.551;QD=19.19;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:144,149:293:99:5650,0,5471
contig372	163	.	G	GC	11194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=33.62;SOR=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,333:333:99:11232,1007,0
contig372	342	.	G	GC	10853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.276;DP=331;ExcessHet=3.0103;FS=7.350;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQRankSum=-1.626;QD=32.30;ReadPosRankSum=0.412;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,305:307:99:10891,918,0
contig372	387	.	A	G	6164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-0.324;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=11.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.654;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:91,154:245:99:6193,0,3436
contig372	392	.	A	G	6338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-0.682;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.006;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:94,155:249:99:6367,0,3542
contig372	400	.	G	A	6506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=-0.235;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.396;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.037;SOR=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,153:235:99:6535,0,3226
contig372	404	.	G	A	6328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=-0.030;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=3.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.591;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:82,158:240:99:6357,0,2957
contig372	459	.	C	CG	7630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=33.18;SOR=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,230:230:99:7668,705,0
contig372	542	.	G	A	6188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.034;DP=378;ExcessHet=3.0103;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.797;QD=17.73;ReadPosRankSum=-1.370;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:151,198:349:99:6217,0,4318
contig372	554	.	AG	A	15837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;QD=27.74;SOR=1.185	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,384:384:99:15875,1158,0
contig372	557	.	C	T	6125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=-1.224;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.258;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.900;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:174,215:389:99:6154,0,4947
contig372	803	.	G	A	9543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.540;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.276;QD=20.01;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:228,249:477:99:9572,0,8757
contig372	811	.	G	A	9388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-0.541;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.242;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,239:456:99:9417,0,8530
contig372	868	.	C	A	8275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=1.774;DP=372;ExcessHet=3.0103;FS=49.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.269;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.094	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:139,210:349:99:8304,0,5083
contig372	882	.	C	T	8731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-2.098;DP=436;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=1.419;QD=21.04;ReadPosRankSum=6.461;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:199,216:415:99:8760,0,7989
contig372	891	.	T	TCGC	8368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.641;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.098;QD=19.64;ReadPosRankSum=-5.099;SOR=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:223,203:426:99:8406,0,9270
contig372	893	.	GC	G	8603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-0.703;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=1.705;QD=19.64;ReadPosRankSum=4.908;SOR=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:211,227:438:99:8641,0,9248
contig372	894	.	C	CCCTGCGCA	8775.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-1.218;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.332;QD=20.13;ReadPosRankSum=-5.371;SOR=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:226,210:436:99:8813,0,8789
contig372	1113	.	T	A	9670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=-0.674;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.529;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,259:523:99:9699,0,9848
contig372	1128	.	C	T	9256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.451;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.413;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,243:494:99:9285,0,9504
contig372	1141	.	T	TG	18791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;QD=27.68;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,466:466:99:18829,1444,0
contig372	1176	.	C	T	9165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.779;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-3.275;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.580;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,236:507:99:9194,0,8840
contig372	1178	.	T	G	7549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.020;DP=540;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=2.375;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.318;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,238:516:99:7578,0,10963
contig372	1246	.	TATTTTCTCCATCTACAGTATTCACATTTTCTCTCACAGCATTCAC	T	8617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.925;ClippingRankSum=0.163;DP=862;ExcessHet=3.0103;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-6.054;QD=11.01;ReadPosRankSum=-5.040;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:530,253:783:99:8655,0,21099
contig372	1382	.	T	C	10569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.602;DP=815;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.391;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:386,350:736:99:10598,0,12126
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contig373	2303	.	A	G	8731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-1.348;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.455;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,241:526:99:8760,0,11262
contig373	2400	.	G	C	9869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.072;DP=513;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.044;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.671	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,254:491:99:9898,0,9104
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contig373	2684	.	T	C	7605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.591;DP=451;ExcessHet=3.0103;FS=4.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.314;QD=17.77;ReadPosRankSum=-1.710;SOR=0.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:225,203:428:99:7634,0,8541
contig373	2735	.	A	G	7606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.674;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=8.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.440;QD=16.46;ReadPosRankSum=2.243;SOR=1.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,240:462:99:7635,0,7149
contig373	2790	.	T	C	9812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.913;ClippingRankSum=-0.972;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.573;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.458	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,265:500:99:9841,0,8836
contig373	2809	.	CG	C	9026.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-0.170;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.261;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.454;SOR=1.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,235:498:99:9064,0,10476
contig373	2810	.	GA	G	10291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.839;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=8.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.401;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,257:495:99:10329,0,9558
contig373	2822	.	CA	C	9347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=1.169;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=9.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.255;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,243:510:99:9385,0,10078
contig373	2823	.	AG	A	9999.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.310;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=8.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.398;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,266:508:99:10037,0,9416
contig373	2928	.	G	A	6801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.076;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.876;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.273;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,216:421:99:6830,0,9588
contig373	2938	.	T	G	8232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.057;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.137;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:205,214:419:99:8261,0,6281
contig373	3032	.	T	C	5701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-1.132;DP=444;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.496;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.865;SOR=0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,187:423:99:5730,0,7411
contig373	3283	.	A	G	7601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.856;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.541;QD=15.94;ReadPosRankSum=3.585;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,247:477:99:7630,0,6995
contig373	3526	.	C	T	8698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-1.337;DP=595;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.343;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,283:563:99:8727,0,8533
contig373	3590	.	C	CA	6780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.869;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.402;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,276:545:99:6818,0,8715
contig373	3593	.	A	AG	8275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.666;DP=601;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.675;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,282:573:99:8313,0,9356
contig373	3632	.	T	C	8492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-0.713;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.737;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,271:558:99:8521,0,9087
contig373	3813	.	T	A	7803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=1.640;DP=560;ExcessHet=3.0103;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.718;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,248:540:99:7832,0,9217
contig373	4126	.	A	G	9272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-0.034;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.311;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,241:515:99:9301,0,10808
contig373	4127	.	T	C	9272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.893;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.397;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:275,241:516:99:9301,0,10808
contig373	4226	.	G	A	8429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.106;DP=640;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.259;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:330,286:616:99:8458,0,10710
contig373	4254	.	T	C	8475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.716;DP=642;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.780;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:344,277:621:99:8504,0,10949
contig373	4299	.	C	CA	8323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=1.926;DP=651;ExcessHet=3.0103;FS=5.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.075;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:337,274:611:99:8361,0,10341
contig373	4301	.	A	AT	7808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.015;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=6.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.246;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,323:606:99:7846,0,8421
contig373	4334	.	T	G	8473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.369;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=8.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.861;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=0.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,274:562:99:8502,0,9311
contig373	4435	.	A	AG	7899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=1.038;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.029;QD=17.44;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,231:453:99:7937,0,7309
contig375	37	.	G	T	4789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.719;DP=503;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=1.038;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:122,125:247:99:4818,0,4644
contig375	55	.	A	G	4740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-1.252;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.015;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,125:253:99:4769,0,4795
contig375	135	.	G	A	5218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.980;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=9.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.173;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.181;SOR=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:166,169:335:99:5247,0,4926
contig375	219	.	A	C	6963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.004;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.790;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,218:427:99:6992,0,6659
contig375	334	.	G	A	7766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.596;DP=515;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.097;QD=15.95;ReadPosRankSum=2.131;SOR=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,247:487:99:7795,0,7271
contig375	508	.	A	C	6791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-0.933;DP=462;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.978;QD=15.33;ReadPosRankSum=3.352;SOR=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,209:443:99:6820,0,7349
contig375	748	.	A	T	8380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.014;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.033;QD=16.09;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,268:521:99:8409,0,7837
contig375	786	.	C	T	7453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-1.103;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.943;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,245:499:99:7482,0,7636
contig375	1513	.	T	C	7031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.167;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.066;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.410;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,235:504:99:7060,0,8309
contig375	1604	.	TA	T	7002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=-1.209;DP=508;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.498;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,236:477:99:7040,0,7577
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contig375	4280	.	C	T	9115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=-0.692;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.449;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,238:489:99:9144,0,11974
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contig375	5495	.	A	T	7315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-1.633;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.572;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,236:517:99:7344,0,9057
contig375	5680	.	C	CT	5267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.681;DP=590;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.532;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:291,231:522:99:5305,0,9549
contig375	5684	.	T	TC	8361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=1.334;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.365;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.014;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,297:534:99:8399,0,6933
contig375	5900	.	G	A	8623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-1.061;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.877;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:253,269:522:99:8652,0,7886
contig375	5959	.	C	T	8823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.433;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.343;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:267,283:550:99:8852,0,8269
contig375	6396	.	A	C	8026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.622;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.590;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,258:499:99:8055,0,7476
contig375	6765	.	G	A	8202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.539;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.246;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,251:495:99:8231,0,7691
contig375	6795	.	C	T	7462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.809;DP=524;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.071;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:246,250:496:99:7491,0,7530
contig375	6869	.	C	T	10585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.016;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.155;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:224,279:503:99:10614,0,8247
contig375	6892	.	C	A	10355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.366;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.016;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.432;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,272:499:99:10384,0,8374
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contig375	7392	.	G	C	8302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.757;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.990;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.286;SOR=0.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:188,222:410:99:8331,0,5745
contig375	7406	.	C	CA	3962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.130;DP=400;ExcessHet=3.0103;FS=9.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.529;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.612;SOR=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:187,178:365:99:4000,0,6759
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contig375	7965	.	C	T	10121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.202;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.709;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,260:503:99:10150,0,9455
contig375	8151	.	G	T	8150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.883;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.063;QD=16.50;ReadPosRankSum=2.453;SOR=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,264:494:99:8179,0,6941
contig375	8300	.	T	C	9313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=-0.487;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.412;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,296:547:99:9342,0,7642
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contig375	8804	.	A	AT	3980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.244;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.063;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:232,211:443:99:4018,0,4686
contig375	8942	.	A	G	10026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.760;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.418;QD=19.97;ReadPosRankSum=4.586;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,259:502:99:10055,0,10222
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contig375	9150	.	T	TGTA	4967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.112;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.229;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:149,127:276:99:5005,0,5890
contig375	9157	.	C	T	5303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.022;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.134;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:128,149:277:99:5332,0,4979
contig375	9242	.	G	A	7016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=1.927;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.135;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.548;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,232:466:99:7045,0,6729
contig375	9347	.	G	A	6974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.547;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.285;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,216:423:99:7003,0,6454
contig375	9695	.	C	T	6243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.259;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.588;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.352;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,206:454:99:6272,0,7675
contig375	9985	.	A	G	8239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=2.466;DP=605;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.760;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:308,270:578:99:8268,0,9236
contig375	10204	.	G	A	9495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.436;DP=638;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.360;QD=15.54;ReadPosRankSum=2.356;SOR=0.941	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:311,300:611:99:9524,0,9444
contig375	10865	.	C	T	8893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.013;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.663;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:221,276:497:99:8922,0,7153
contig375	10906	.	T	A	8525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.848;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.333;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,276:539:99:8554,0,8083
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contig375	11552	.	G	A	8046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.444;DP=530;ExcessHet=3.0103;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.929;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,270:507:99:8075,0,7060
contig375	11672	.	T	C	7498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.925;DP=522;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.255;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.237;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,238:499:99:7527,0,8048
contig375	11807	.	C	T	8669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.275;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.128;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,283:534:99:8698,0,7672
contig375	12222	.	T	C	5664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.318;DP=382;ExcessHet=3.0103;FS=3.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.200;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.028;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:179,180:359:99:5693,0,5798
contig375	12820	.	T	A	8941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=1.444;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.995;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:260,292:552:99:8970,0,8125
contig375	13088	.	T	C	11493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.559;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.078;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:201,298:499:99:11522,0,7432
contig375	13102	.	T	TC	11881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-1.632;DP=554;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.892;QD=22.63;ReadPosRankSum=4.216;SOR=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,288:525:99:11919,0,9331
contig375	13116	.	C	CCT	11278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.639;DP=514;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.659;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.945;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,272:484:99:11316,0,8194
contig375	13302	.	A	T	7824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.530;DP=450;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.386;QD=18.50;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:216,207:423:99:7853,0,8326
contig375	13305	.	AT	A	7724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.645;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.484;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:222,205:427:99:7762,0,8414
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contig375	22159	.	T	TC	7022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.105;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.374;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:242,269:511:99:7060,0,7599
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contig375	22246	.	TG	T	6900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.799;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.584;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,235:486:99:6938,0,8183
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contig375	23637	.	GGGAAT	G	6494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=1.344;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.122;QD=14.59;ReadPosRankSum=2.062;SOR=0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:264,181:445:99:6532,0,10608
contig375	23681	.	C	CT	4383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.494;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.284;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.436;SOR=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:239,193:432:99:4421,0,7444
contig375	23684	.	T	TC	7203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.789;DP=478;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.103;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,248:457:99:7241,0,6315
contig375	23993	.	T	C	8039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=2.430;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.665;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,268:512:99:8068,0,7244
contig376	75	.	T	C	18167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.015;DP=1032;ExcessHet=3.0103;FS=3.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.107;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:507,471:978:99:18196,0,19958
contig376	86	.	C	A	19084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.541;DP=1071;ExcessHet=3.0103;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.263;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:531,485:1016:99:19113,0,21294
contig376	91	.	T	C	18914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.332;ClippingRankSum=-1.410;DP=1085;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.752;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:541,488:1029:99:18943,0,21195
contig376	129	.	C	T	15762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=-0.018;DP=1134;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.274;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:580,500:1080:99:15791,0,18450
contig376	197	.	C	T	6517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=-0.751;DP=854;ExcessHet=3.0103;FS=2.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.752;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:557,245:802:99:6546,0,18501
contig377	116	.	T	C	19844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.560;DP=1188;ExcessHet=3.0103;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.045;QD=17.50;ReadPosRankSum=-0.858;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:615,519:1134:99:19873,0,23725
contig377	136	.	A	G	20678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.789;DP=1208;ExcessHet=3.0103;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.948;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:627,524:1151:99:20707,0,25172
contig377	141	.	G	C	20804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.106;DP=1214;ExcessHet=3.0103;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.477;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.254;SOR=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:632,527:1159:99:20833,0,25696
contig377	144	.	T	C	20173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-1.188;DP=1219;ExcessHet=3.0103;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.777;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:646,521:1167:99:20202,0,25447
contig377	210	.	T	G	20384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.404;DP=1213;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.551;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.610;SOR=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:604,545:1149:99:20413,0,36565
contig377	231	.	G	T	20548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.904;DP=1187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.040;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:572,550:1122:99:20577,0,35592
contig377	301	.	A	ATGGATGCTTTTCTAGACT	22847.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=1.258;DP=1135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.039;QD=21.53;ReadPosRankSum=-10.219;SOR=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:535,526:1061:99:22885,0,20406
contig377	332	.	C	T	21309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.299;DP=1202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-1.617;QD=18.69;ReadPosRankSum=-2.281;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:594,546:1140:99:21338,0,23390
contig377	335	.	T	G	21605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-0.038;DP=1183;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.943;QD=19.22;ReadPosRankSum=-1.600;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:586,538:1124:99:21634,0,24271
contig377	336	.	C	T	21595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.409;DP=1189;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.424;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=0.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:589,540:1129:99:21624,0,24309
contig377	347	.	A	G	20122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.740;DP=1120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.040;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:551,522:1073:99:20151,0,21779
contig377	391	.	A	G	20289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=0.675;DP=1138;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.368;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:549,541:1090:99:20318,0,20686
contig377	415	.	T	A	21064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=1.137;DP=1137;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.097;QD=19.36;ReadPosRankSum=2.002;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:561,527:1088:99:21093,0,22660
contig377	422	.	T	C	20883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=1.046;DP=1133;ExcessHet=3.0103;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.876;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.995;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:563,522:1085:99:20912,0,22813
contig377	425	.	T	C	20737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.509;DP=1111;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.091;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.768;SOR=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:551,513:1064:99:20766,0,22361
contig377	426	.	A	G	20425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.843;DP=1107;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.279;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.566;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:547,511:1058:99:20454,0,22049
contig377	454	.	T	C	20332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.769;DP=1148;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.425;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:556,535:1091:99:20361,0,21571
contig377	464	.	T	G	19776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=-1.060;DP=1134;ExcessHet=3.0103;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.378;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.916	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:562,516:1078:99:19805,0,21525
contig377	492	.	A	T	15989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-1.022;DP=1155;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.758;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.864;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:586,509:1095:99:16018,0,18555
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contig377	663	.	C	T	24164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.096;DP=1341;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.162;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.665;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:693,597:1290:99:24193,0,28458
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contig377	897	.	A	G	21436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.338;DP=1143;ExcessHet=3.0103;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.521;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:545,543:1088:99:21465,0,21189
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contig377	907	.	T	C	22097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=-0.668;DP=1116;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.044;QD=20.73;ReadPosRankSum=-1.510;SOR=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:521,545:1066:99:22126,0,21073
contig377	922	.	A	G	20312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.778;DP=1105;ExcessHet=3.0103;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=2.163;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.082;SOR=0.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:534,527:1061:99:20341,0,19930
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contig377	1078	.	C	T	16427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=-0.473;DP=1187;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.810;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:607,528:1135:99:16456,0,18958
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contig377	1149	.	T	C	19601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.869;DP=1105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.602;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:556,500:1056:99:19630,0,22227
contig377	1164	.	A	G	19416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.306;DP=1080;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-1.545;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:545,485:1030:99:19445,0,22264
contig377	1169	.	G	A	19598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.919;DP=1074;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-1.122;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:534,489:1023:99:19627,0,21652
contig377	1181	.	C	T	18351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.709;DP=1014;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-3.270;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:513,457:970:99:18380,0,21575
contig377	1191	.	G	A	18096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.268;DP=1001;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-2.343;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:507,453:960:99:18125,0,20465
contig377	1199	.	T	C	18294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-1.475;DP=1000;ExcessHet=3.0103;FS=2.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=3.192;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:505,456:961:99:18323,0,21203
contig377	1211	.	A	T	18345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-0.866;DP=988;ExcessHet=3.0103;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=1.190;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:500,458:958:99:18374,0,20489
contig377	1215	.	T	C	18255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.416;DP=984;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=0.801;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.270;SOR=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:500,454:954:99:18284,0,20579
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contig377	1306	.	A	G	20875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.869;DP=1064;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.545;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:514,517:1031:99:20904,0,20972
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contig377	1419	.	C	T	26547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.989;DP=1315;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.004;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:592,664:1256:99:26576,0,24101
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contig377	1562	.	G	A	22851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.114;DP=1230;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.041;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:606,574:1180:99:22880,0,24408
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contig377	1593	.	C	T	21637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=-0.746;DP=1185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.411;QD=19.08;ReadPosRankSum=-1.975;SOR=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:576,558:1134:99:21666,0,22470
contig377	1629	.	T	TTA	21247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=-1.611;DP=1159;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.159;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.959;SOR=0.575	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:570,530:1100:99:21285,0,22539
contig377	1632	.	A	T	21329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=1.647;DP=1136;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.442;QD=19.43;ReadPosRankSum=1.330;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:572,526:1098:99:21358,0,23466
contig377	1635	.	T	G	21457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;ClippingRankSum=0.130;DP=1129;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.364;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.852;SOR=0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:564,528:1092:99:21486,0,23691
contig377	1650	.	T	A	22330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.079;DP=1184;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.551;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:586,562:1148:99:22359,0,23754
contig377	1652	.	C	T	22195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.812;ClippingRankSum=0.705;DP=1183;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.296;QD=19.33;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:589,559:1148:99:22224,0,23889
contig377	1655	.	G	A	22201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=-0.388;DP=1181;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.353;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:586,558:1144:99:22230,0,23805
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contig377	1803	.	T	C	18371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=-0.496;DP=1254;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.215;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:542,472:1014:99:18400,0,21304
contig377	1838	.	T	C	10555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.024;DP=1153;ExcessHet=3.0103;FS=3.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.427;QD=13.08;ReadPosRankSum=4.385;SOR=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:513,294:807:99:10584,0,20430
contig377	1844	.	C	A	10168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.131;DP=1145;ExcessHet=3.0103;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.182;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.181;SOR=0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:501,276:777:99:10197,0,20079
contig378	61	.	A	AG	19075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-0.107;DP=816;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.756;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.023;SOR=1.128	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,580:582:99:19113,1702,0
contig378	187	.	TC	T	25502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=835;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=34.28;SOR=0.886	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,744:744:99:25540,2237,0
contig378	250	.	AT	A	33072.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=830;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=32.88;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,755:755:99:33110,2288,0
contig378	265	.	GC	G	34637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=799;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=28.24;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,762:762:99:34675,2381,0
contig378	578	.	A	T	8446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.689;DP=928;ExcessHet=3.0103;FS=4.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.508;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:580,297:877:99:8475,0,19352
contig378	618	.	T	C	36435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=863;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=29.76;SOR=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,814:814:99:36464,2486,0
contig378	619	.	C	T	36401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=866;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=31.06;SOR=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,816:816:99:36430,2458,0
contig378	835	.	G	A	8973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.288;DP=876;ExcessHet=3.0103;FS=1.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.800;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:585,260:845:99:9002,0,23441
contig378	837	.	A	AT	8998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.815;DP=872;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.462;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:580,259:839:99:9036,0,23957
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contig379	262	.	G	A	15919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.529;DP=1252;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.494;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.477;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:526,509:1035:99:15948,0,18792
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contig379	302	.	T	A	9692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.023;DP=1138;ExcessHet=3.0103;FS=3.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.642;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.989	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:693,299:992:99:9721,0,26961
contig379	419	.	A	G	11960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=-1.312;DP=1301;ExcessHet=3.0103;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.388;QD=14.07;ReadPosRankSum=-5.235;SOR=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:457,393:850:99:11989,0,14398
contig379	573	.	CG	C	11607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.743;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.096;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:277,293:570:99:11645,0,10522
contig379	574	.	GA	G	10326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.335;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.314;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,272:570:99:10364,0,11743
contig379	576	.	AC	A	11595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=-0.071;DP=682;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.106;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,301:580:99:11633,0,10622
contig379	577	.	CT	C	10311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-0.512;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.613;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,277:578:99:10349,0,11880
contig379	687	.	A	G	7230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=1.274;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.376;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.463;SOR=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:257,235:492:99:7259,0,7924
contig379	783	.	C	T	9693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=-0.237;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.456;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.788;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,319:555:99:9722,0,7251
contig379	804	.	C	T	9669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.658;DP=588;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.081;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.828	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,318:561:99:9698,0,7312
contig379	903	.	G	A	12025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=-1.202;DP=923;ExcessHet=3.0103;FS=12.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.249;QD=18.30;ReadPosRankSum=-5.314;SOR=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,378:657:99:12054,0,8148
contig379	970	.	T	A	15925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=1.689;DP=1213;ExcessHet=3.0103;FS=31.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=0.136;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.419;SOR=0.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,524:726:99:15954,0,4669
contig379	996	.	A	AAACATTATT	4360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.505;ClippingRankSum=0.059;DP=1045;ExcessHet=3.0103;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-3.199;QD=9.61;ReadPosRankSum=-16.145;SOR=0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:313,141:454:99:4398,0,12517
contig379	998	.	A	ATTCGATGTGCT	4362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.475;DP=834;ExcessHet=3.0103;FS=28.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=0.334;QD=10.77;ReadPosRankSum=-14.521;SOR=5.862	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,100:405:99:4400,0,12515
contig379	999	.	T	C	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-0.148;DP=808;ExcessHet=3.0103;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=2.298;QD=10.14;ReadPosRankSum=4.969;SOR=0.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:245,136:381:99:3891,0,9547
contig381	71	.	G	A	34630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.252;DP=1579;ExcessHet=3.0103;FS=5.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQRankSum=0.364;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.982;SOR=1.095	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,1069:1348:99:34659,0,6243
contig381	162	.	C	CACTTTCTA	55206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-1.275;DP=1620;ExcessHet=3.0103;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.244;QD=31.53;ReadPosRankSum=-5.001;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:248,1245:1493:99:55244,0,7637
contig381	164	.	C	T	55258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=1.040;DP=1626;ExcessHet=3.0103;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.203;QD=28.87;ReadPosRankSum=-4.888;SOR=0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,1267:1517:99:55287,0,7640
contig381	254	.	C	A	57249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.865;DP=1923;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.930;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:288,1494:1782:99:57278,0,5331
contig381	264	.	T	C	35866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.082;DP=1976;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.160;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:903,922:1825:99:35895,0,35427
contig381	275	.	C	T	35601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.432;DP=2048;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.791;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:956,929:1885:99:35630,0,36541
contig381	338	.	T	C	30652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.202;DP=2207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.210;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.725;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:994,969:1963:99:30681,0,31888
contig381	365	.	A	G	29196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.620;DP=2152;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.250;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.189;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:975,951:1926:99:29225,0,30789
contig381	432	.	A	G	18699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=1.397;DP=1886;ExcessHet=3.0103;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.933;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.826;SOR=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1095,531:1626:99:18728,0,44263
contig381	440	.	A	T	18590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.306;DP=1859;ExcessHet=3.0103;FS=3.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.671;QD=11.92;ReadPosRankSum=2.953;SOR=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1052,508:1560:99:18619,0,44103
contig381	445	.	C	G	17992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.142;DP=1862;ExcessHet=3.0103;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.304;QD=11.72;ReadPosRankSum=3.631;SOR=1.006	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1035,500:1535:99:18021,0,42641
contig381	539	.	C	T	4525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.810;DP=1159;ExcessHet=3.0103;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=0.900;QD=6.29;ReadPosRankSum=-2.471;SOR=0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:534,186:720:99:4554,0,17058
contig382	76	.	C	T	9011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=-0.146;DP=620;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.406;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.554;SOR=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:305,284:589:99:9040,0,9693
contig382	460	.	A	G	8422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=2.087;DP=610;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.527;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,283:585:99:8451,0,8915
contig382	539	.	T	C	8502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=1.381;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.725;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.159;SOR=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,276:569:99:8531,0,8919
contig382	867	.	T	C	8649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.399;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.543;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.154;SOR=0.646	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,276:544:99:8678,0,8026
contig382	914	.	C	A	10927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.857;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.262;QD=20.12;ReadPosRankSum=2.786;SOR=0.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:263,280:543:99:10956,0,10411
contig382	915	.	G	A	10927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.486;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.681;QD=19.90;ReadPosRankSum=2.747;SOR=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,284:549:99:10956,0,10411
contig382	966	.	T	G	9966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.880;DP=624;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.357;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.411;SOR=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:284,320:604:99:9995,0,8993
contig382	1035	.	C	T	10212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-2.711;DP=662;ExcessHet=3.0103;FS=5.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.707;QD=15.91;ReadPosRankSum=3.881;SOR=0.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:310,332:642:99:10241,0,9510
contig382	1064	.	C	T	10686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.824;DP=693;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.448;QD=16.00;ReadPosRankSum=-1.599;SOR=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:323,345:668:99:10715,0,10099
contig382	1095	.	C	T	9519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.497;DP=666;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.745;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:318,319:637:99:9548,0,9707
contig382	1185	.	C	T	10377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=1.585;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.121;QD=16.06;ReadPosRankSum=1.516;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:307,339:646:99:10406,0,9497
contig382	1220	.	C	T	11242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.046;DP=634;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.918;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:304,301:605:99:11271,0,11975
contig382	1236	.	A	G	10909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.459;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.254;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:306,292:598:99:10938,0,11946
contig382	1280	.	A	G	9717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=-0.689;DP=557;ExcessHet=3.0103;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.955;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:276,255:531:99:9746,0,10642
contig382	1286	.	C	T	9625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=2.217;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.052;QD=18.33;ReadPosRankSum=1.033;SOR=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,252:525:99:9654,0,10572
contig382	1796	.	A	G	8713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.149;DP=581;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.295;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,285:551:99:8742,0,7963
contig382	2549	.	C	A	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.381;DP=579;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.463;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:282,274:556:99:8192,0,8665
contig382	2861	.	A	G	7269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.348;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.962;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.411	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,238:476:99:7298,0,7301
contig382	3369	.	CAT	C,CAAT	17247.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.554;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.287;QD=31.07;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.321	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:2,223,198:423:99:17285,8716,8080,8589,0,9017
contig382	3373	.	A	AAT	8135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.106;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.946;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:234,210:444:99:8173,0,9078
contig382	4033	.	G	A	8022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.064;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.773;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.114;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,255:485:99:8051,0,7168
contig382	4177	.	C	G	7390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.846;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.518;QD=15.46;ReadPosRankSum=2.671;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,243:478:99:7419,0,7431
contig382	4620	.	G	GT	4438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.187;DP=643;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-3.241;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,239:508:99:4476,0,5207
contig382	4984	.	C	T	12234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.850;DP=635;ExcessHet=3.0103;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.445;QD=20.02;ReadPosRankSum=1.161;SOR=0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:293,318:611:99:12263,0,16136
contig382	4992	.	G	A	12139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.656;ClippingRankSum=-0.378;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.543;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:298,310:608:99:12168,0,16416
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contig382	8522	.	T	C	6484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.755;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.196;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,220:488:99:6513,0,9966
contig382	8539	.	A	G	7140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=-0.172;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.101;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:196,235:431:99:7169,0,7336
contig382	8608	.	C	T	4594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.657;DP=631;ExcessHet=3.0103;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=2.306;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.384;SOR=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,156:338:99:4623,0,5464
contig383	60	.	T	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.574;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQRankSum=-3.743;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:129,38:167:99:693,0,6225
contig383	1335	.	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=1.194;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=7.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.86;MQRankSum=2.383;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=2.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,20:80:99:450,0,2052
contig385	413	.	T	C	6539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.591;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.060;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,213:471:99:6568,0,7930
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contig387	944	.	G	A	8416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.034;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.601;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.542	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:285,273:558:99:8445,0,8966
contig387	980	.	C	T	8495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=-1.855;DP=574;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.487;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.511;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:292,270:562:99:8524,0,9102
contig387	1392	.	G	C	6596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.638;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.402;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=0.677	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:266,215:481:99:6625,0,8547
contig387	1463	.	C	T	6726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.940;ClippingRankSum=-0.932;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.042;QD=13.96;ReadPosRankSum=-2.056;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,239:482:99:6755,0,7566
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contig387	6800	.	AG	A	6814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=-0.499;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.217;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:233,238:471:99:6852,0,7205
contig387	7092	.	G	A	9681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=1.853;DP=621;ExcessHet=3.0103;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.482;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.061;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:287,308:595:99:9710,0,8751
contig388	23	.	A	G	5403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.802;DP=873;ExcessHet=3.0103;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.632;QD=9.92;ReadPosRankSum=5.367;SOR=1.229	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:343,202:545:99:5432,0,9222
contig388	55	.	T	C	4770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.851;DP=916;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.600;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:336,189:525:99:4799,0,9647
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contig389	2999	.	A	G	28016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.026;DP=1854;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.371;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:947,830:1777:99:28045,0,33728
contig389	3016	.	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-0.583;DP=1919;ExcessHet=3.0103;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.501;QD=0.19;ReadPosRankSum=1.451;SOR=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1687,155:1842:99:380,0,66506
contig389	3380	.	A	G	66738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=-0.220;DP=2067;ExcessHet=3.0103;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.964;QD=33.98;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:163,1801:1964:99:66767,0,374
contig389	3614	.	T	C	4494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.281;DP=1784;ExcessHet=3.0103;FS=0.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.549;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.794;SOR=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1437,238:1675:99:4523,0,52959
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contig389	4772	.	G	A	8136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.624;DP=2066;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.005;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1570,293:1863:99:8165,0,54801
contig389	4790	.	G	T	6905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=2.179;DP=2081;ExcessHet=3.0103;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.065;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1522,283:1805:99:6934,0,62316
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contig390	298	.	GTCTGAAGATTTTTGGAATTTGACCTTTGATGCAGTCTGAAGATATTCAGAATTTGATCTTTGATGCAA	G	3483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.797;DP=568;ExcessHet=3.0103;FS=12.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=1.891;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.870;SOR=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:428,113:541:99:3521,0,17854
contig390	421	.	T	TAA	10217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-1.947;DP=545;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.128;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.126;SOR=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,244:515:99:10255,0,11181
contig390	445	.	C	T	10523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.743;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-0.785;QD=20.20;ReadPosRankSum=2.223;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,267:521:99:10552,0,10180
contig390	514	.	C	G	9150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=2.214;DP=592;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.573;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.301;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:300,263:563:99:9179,0,10042
contig390	598	.	CT	C	8512.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.695;DP=556;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.445;QD=16.89;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,233:504:99:8550,0,10410
contig390	617	.	G	A	9240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.299;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.675;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:283,231:514:99:9269,0,11563
contig390	631	.	A	T	8754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=2.039;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.155;QD=17.00;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,235:515:99:8783,0,10983
contig390	1371	.	A	G	8586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.212;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.294;QD=18.47;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,228:465:99:8615,0,13210
contig390	1389	.	T	C	8922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.450;DP=697;ExcessHet=3.0103;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.082;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.505;SOR=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:227,221:448:99:8951,0,13433
contig390	1408	.	A	C	8335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.448;DP=711;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.905;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:217,208:425:99:8364,0,11713
contig390	1409	.	C	T	8257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.230;DP=713;ExcessHet=3.0103;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.719;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.169;SOR=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:212,208:420:99:8286,0,11626
contig391	46	.	G	A	5134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.607;DP=2049;ExcessHet=3.0103;FS=10.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.701;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.404;SOR=1.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1012,243:1255:99:5163,0,39443
contig391	53	.	C	A	23793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.755;ClippingRankSum=-0.336;DP=2216;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.138;QD=17.07;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:706,688:1394:99:23822,0,22749
contig391	116	.	C	CTAT	13567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-0.968;DP=3322;ExcessHet=3.0103;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.040;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.806;SOR=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2004,465:2469:99:13605,0,81214
contig391	211	.	A	G	17075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=-0.382;DP=2098;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.094;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.422;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1359,606:1965:99:17104,0,49099
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contig391	326	.	A	T	7042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.736;DP=1137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.518;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:828,263:1091:99:7071,0,29885
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contig391	1531	.	C	T	6298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-1.443;DP=1519;ExcessHet=3.0103;FS=3.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.599;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.980	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1187,280:1467:99:6327,0,42377
contig391	1556	.	A	AT	61587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.238;DP=1678;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.514;QD=31.64;ReadPosRankSum=1.624;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,1570:1574:99:61625,4681,0
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contig391	1614	.	T	G	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=-0.072;DP=1699;ExcessHet=3.0103;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.005;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1421,196:1617:99:3151,0,54738
contig391	1662	.	T	C	22724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=1.214;DP=1809;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.677;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:968,707:1675:99:22753,0,33273
contig391	1680	.	CA	C	66759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1836;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;QD=31.78;SOR=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1623:1623:99:66797,5106,0
contig391	1710	.	T	C	4138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=-0.706;DP=1868;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.622;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1386,226:1612:99:4167,0,51079
contig391	1771	.	A	AT	48741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.578;DP=1602;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQRankSum=0.777;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=1.320	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,1134:1135:99:48779,3650,0
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contig391	1812	.	C	T	21339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=1.225;DP=1371;ExcessHet=3.0103;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.303;QD=25.77;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=0.882	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,526:828:99:21368,0,10802
contig391	1816	.	C	T	14230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=2.458;DP=1365;ExcessHet=3.0103;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.523;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.116;SOR=1.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:425,379:804:99:14259,0,17242
contig391	1827	.	A	ATCT	993.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.104;DP=1295;ExcessHet=3.0103;FS=2.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=2.413;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.327;SOR=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:512,72:584:99:1031,0,21344
contig391	1828	.	T	TC	1374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.365;DP=1293;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.621;QD=2.04;ReadPosRankSum=2.339;SOR=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:557,118:675:99:1412,0,22824
contig391	1831	.	T	C	3262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.485;DP=1276;ExcessHet=3.0103;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.822;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:582,119:701:99:3291,0,24948
contig391	1832	.	G	T	12402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.397;DP=1275;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-3.082;QD=21.35;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:271,310:581:99:12431,0,10648
contig391	1841	.	G	A	8131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.410;DP=1148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-1.878;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.400;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:392,218:610:99:8160,0,15869
contig391	1843	.	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.465;DP=1131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=0.574;QD=2.46;ReadPosRankSum=2.258;SOR=0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:516,85:601:99:1504,0,20536
contig392	27	.	C	T	8109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.428;DP=2104;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=0.309;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:916,302:1218:99:8138,0,31310
contig392	72	.	C	T	15969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.324;DP=2032;ExcessHet=3.0103;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.995;QD=11.08;ReadPosRankSum=4.877;SOR=0.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:902,539:1441:99:15998,0,30467
contig392	96	.	A	AC	73027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.392;DP=2285;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQRankSum=-0.481;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.200	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,1733:1736:99:73065,5334,0
contig392	121	.	T	TC	88501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2387;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;QD=35.07;SOR=1.195	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2022:2022:99:88539,6257,0
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contig392	199	.	C	T	9061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.616;DP=2754;ExcessHet=3.0103;FS=4.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.379;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2085,439:2524:99:9090,0,74040
contig392	275	.	A	AG	52115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.466;DP=1592;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQRankSum=-0.031;QD=30.06;ReadPosRankSum=1.679;SOR=0.300	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,1317:1318:99:52153,4020,0
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contig392	329	.	G	A	36778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.247;DP=1594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.733;QD=25.05;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:480,988:1468:99:36807,0,14755
contig392	330	.	T	G	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.641;DP=1587;ExcessHet=3.0103;FS=2.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.594;QD=0.94;ReadPosRankSum=2.524;SOR=0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1327,141:1468:99:1405,0,51813
contig392	361	.	C	CCA	5177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-1.269;DP=1523;ExcessHet=3.0103;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.048;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1196,209:1405:99:5215,0,49495
contig392	378	.	G	A	31092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.252;DP=1507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.153;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:569,854:1423:99:31121,0,18833
contig392	486	.	T	A	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-0.976;DP=1304;ExcessHet=3.0103;FS=1.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.248;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1045,185:1230:99:3856,0,39455
contig392	506	.	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=-0.856;DP=1349;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.320;QD=0.08;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1163,106:1269:99:132,0,43325
contig392	551	.	G	A	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=1.698;DP=1361;ExcessHet=3.0103;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.161;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1124,158:1282:99:2523,0,44669
contig392	555	.	T	C	21202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;ClippingRankSum=-0.083;DP=1376;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.584;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.351;SOR=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:683,611:1294:99:21231,0,23491
contig392	558	.	G	A	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.167;DP=1403;ExcessHet=3.0103;FS=0.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.803;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1120,200:1320:99:3883,0,43661
contig392	686	.	G	GA	73187.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.495;DP=1816;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQRankSum=1.330;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.299	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,1724:1725:99:73225,5245,0
contig392	706	.	G	A	5224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.288;DP=1825;ExcessHet=3.0103;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.016;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1533,236:1769:99:5253,0,63580
contig392	710	.	A	C	5478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-1.470;DP=1834;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.921;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1525,252:1777:99:5507,0,62743
contig392	722	.	G	A	5174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=1.061;DP=1744;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.262;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.920;SOR=0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1463,231:1694:99:5203,0,62308
contig392	731	.	G	A	16541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.993;DP=1755;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.793;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1215,487:1702:99:16570,0,49435
contig392	912	.	A	G	4762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.895;ClippingRankSum=-0.029;DP=1528;ExcessHet=3.0103;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.254;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1212,204:1416:99:4791,0,49416
contig392	935	.	T	C	4881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=-0.034;DP=1557;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.015;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.793;SOR=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1227,201:1428:99:4910,0,52789
contig392	938	.	C	CT	1102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.542;DP=1534;ExcessHet=3.0103;FS=3.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.591;QD=0.85;ReadPosRankSum=-1.852;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1131,163:1294:99:1140,0,32854
contig392	943	.	TTA	T	4549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.316;DP=1538;ExcessHet=3.0103;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.426;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1200,191:1391:99:4587,0,52046
contig392	960	.	C	T	4522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=-0.034;DP=1626;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.124;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.388;SOR=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1232,190:1422:99:4551,0,52919
contig392	977	.	A	G	4061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=-0.926;DP=1735;ExcessHet=3.0103;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.323;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1260,190:1450:99:4090,0,51300
contig392	978	.	C	CT	60847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1744;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;QD=28.95;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1445:1445:99:60885,4469,0
contig392	1017	.	G	A	3474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.270;DP=1876;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.271;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1185,196:1381:99:3503,0,45187
contig392	1030	.	A	G	17883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-2.000;DP=1877;ExcessHet=3.0103;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.610;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.809;SOR=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:796,531:1327:99:17912,0,28361
contig392	1032	.	T	C	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.274;ClippingRankSum=1.408;DP=1873;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.285;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.883;SOR=0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1139,179:1318:99:3188,0,45610
contig393	118	.	T	A	5708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=-0.148;DP=2018;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.771;QD=2.98;ReadPosRankSum=-3.262;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1607,307:1914:99:5737,0,55356
contig393	327	.	G	T	4745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.227;DP=2119;ExcessHet=3.0103;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.329;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1717,302:2019:99:4774,0,56340
contig393	486	.	T	C	13560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.075;DP=1870;ExcessHet=3.0103;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.576;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.005;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1281,504:1785:99:13589,0,42171
contig393	557	.	A	AG	64329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.781;DP=1958;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQRankSum=-0.630;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.321	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,1819:1825:99:64367,5427,0
contig393	622	.	A	G	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;ClippingRankSum=0.842;DP=1652;ExcessHet=3.0103;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.170;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1367,205:1572:99:3205,0,46619
contig393	648	.	T	C	30955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=-0.555;DP=1689;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.570;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:645,950:1595:99:30984,0,20061
contig393	883	.	G	A	5411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=2.292;DP=1964;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.427;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1560,302:1862:99:5440,0,52697
contig393	1040	.	G	A	54783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.408;DP=1985;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.119;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:273,1601:1874:99:54812,0,4441
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contig393	3574	.	G	GT	13106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-1.199;DP=2166;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.619;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.291;SOR=0.587	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1548,513:2061:99:13144,0,58522
contig393	3576	.	T	TC	56394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=2.420;DP=2148;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.447;QD=27.35;ReadPosRankSum=-2.302;SOR=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:515,1547:2062:99:56432,0,14600
contig393	3672	.	C	T	3519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-1.614;DP=2485;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.298;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.647;SOR=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2043,287:2330:99:3548,0,81398
contig393	3683	.	C	CG	15011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;ClippingRankSum=0.112;DP=2408;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.332;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.131;SOR=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1702,522:2224:99:15049,0,54643
contig393	3684	.	A	AC,C	80389.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-1.425;DP=2395;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.733;QD=31.69;ReadPosRankSum=1.529;SOR=0.282	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:1,1675,523:2199:99:80427,20499,14994,53462,0,54636
contig393	3708	.	A	C	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.152;DP=2446;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.015;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1951,274:2225:99:3239,0,76538
contig393	3755	.	C	T	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.835;DP=2595;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.235;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1816,268:2084:99:3390,0,62325
contig393	3767	.	C	T	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.305;DP=2498;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.391;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1685,238:1923:99:2740,0,57817
contig394	104	.	C	T	4836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.656;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=4.050;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.669;SOR=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:192,169:361:99:4865,0,5773
contig394	559	.	T	A	18236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-1.741;DP=533;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQRankSum=0.116;QD=31.66;ReadPosRankSum=0.968;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,493:495:99:18265,1414,0
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contig394	3102	.	G	A	11461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.322;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.403;QD=21.75;ReadPosRankSum=-1.650;SOR=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,284:527:99:11490,0,9616
contig394	3126	.	G	A	10121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.293;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.756;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:252,273:525:99:10150,0,9383
contig394	3210	.	T	C	7101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=1.590;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.148;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.747;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:202,221:423:99:7130,0,6423
contig394	3239	.	T	G	6058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.815;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=3.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.495;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:197,202:399:99:6087,0,5915
contig394	3291	.	G	A	4743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.995;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=41.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.555;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.338;SOR=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:182,137:319:99:4772,0,6928
contig394	3316	.	G	A	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.363;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=79.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.489;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:162,98:260:99:3589,0,6476
contig394	3590	.	T	TTTGTTGTTG	6439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=1.492;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=0.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-1.257;QD=17.50;ReadPosRankSum=-2.604;SOR=0.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:184,184:368:99:6477,0,6757
contig394	3838	.	T	C	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.673;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.154;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.990;SOR=0.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:272,241:513:99:8884,0,10039
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contig394	4072	.	T	C	6515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=1.371;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.146;QD=15.85;ReadPosRankSum=4.025;SOR=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:207,204:411:99:6544,0,6735
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contig394	5824	.	T	C	10474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.657;DP=602;ExcessHet=3.0103;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.993;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:301,279:580:99:10503,0,11613
contig394	5888	.	T	C	10211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=-0.892;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.261;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:279,265:544:99:10240,0,10690
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contig394	6383	.	A	G	6652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.344;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.288;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,220:475:99:6681,0,8212
contig394	6407	.	CTT	C	8106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=1.582;DP=481;ExcessHet=3.0103;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.457;QD=17.86;ReadPosRankSum=-1.715;SOR=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:238,216:454:99:8144,0,9078
contig394	6511	.	C	G	9033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.250;DP=494;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.381;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:241,232:473:99:9062,0,9397
contig394	6518	.	TAC	T	8884.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-1.273;DP=500;ExcessHet=3.0103;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.054;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:255,225:480:99:8922,0,10223
contig394	6521	.	TTCTCTCAATGTTA	T	8435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-0.246;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.208;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,224:510:99:8473,0,11259
contig394	6611	.	G	C	7712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.672;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.269;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,254:505:99:7741,0,7869
contig394	6667	.	T	A	4623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=1.461;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.009;QD=9.92;ReadPosRankSum=3.153;SOR=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:250,216:466:99:4652,0,9266
contig394	6680	.	T	TA	5238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.149;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.088;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.812;SOR=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,230:484:99:5276,0,9174
contig394	6761	.	T	C	10903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.124;ClippingRankSum=1.905;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.016;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:243,283:526:99:10932,0,9135
contig394	6771	.	G	A	10678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=-0.028;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.134;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,274:518:99:10707,0,9340
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contig394	8111	.	TC	T	3912.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.318;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.856;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.444;SOR=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:286,196:482:99:3950,0,11233
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contig395	195	.	T	C	6862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-0.770;DP=1584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.566;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1188,301:1489:99:6891,0,42613
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contig395	258	.	T	C	38656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=1.530;DP=1662;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.167;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.385;SOR=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:579,988:1567:99:38685,0,20655
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contig395	317	.	C	CG	32994.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.463;DP=1607;ExcessHet=3.0103;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.865;QD=21.97;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:564,938:1502:99:33032,0,16089
contig395	325	.	C	T	7335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.032;DP=1606;ExcessHet=3.0103;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.391;QD=4.78;ReadPosRankSum=1.027;SOR=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1202,333:1535:99:7364,0,44455
contig395	351	.	G	GC	16238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.016;DP=1659;ExcessHet=3.0103;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.312;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.848;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:936,591:1527:99:16276,0,36551
contig395	352	.	C	CG	29324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.998;DP=1598;ExcessHet=3.0103;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.182;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.641;SOR=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:609,916:1525:99:29362,0,22740
contig395	353	.	C	T	36435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.976;DP=1606;ExcessHet=3.0103;FS=1.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.962;QD=23.69;ReadPosRankSum=2.223;SOR=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:612,926:1538:99:36473,0,22518
contig395	468	.	AAAT	A	39565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.220;DP=1746;ExcessHet=3.0103;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.076;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.939;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:649,1003:1652:99:39603,0,25540
contig395	541	.	T	C	18875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=-0.497;DP=1765;ExcessHet=3.0103;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.538;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1018,651:1669:99:18904,0,33021
contig395	615	.	G	T	32191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=-0.980;DP=1669;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.459;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:616,977:1593:99:32220,0,17500
contig395	641	.	G	T	30520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-1.101;DP=1617;ExcessHet=3.0103;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.468;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.312;SOR=0.657	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:605,944:1549:99:30549,0,17600
contig395	699	.	T	G	29355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.125;DP=1585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=2.893;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:601,916:1517:99:29384,0,17647
contig395	767	.	T	C	31208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.065;DP=1699;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.642;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.275;SOR=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:652,974:1626:99:31237,0,19219
contig395	816	.	A	AT	18704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-1.455;DP=1676;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.913;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.857;SOR=0.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:930,638:1568:99:18742,0,34701
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contig395	822	.	C	A	24834.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=1.030;DP=1646;ExcessHet=3.0103;FS=0.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.297;QD=17.16;ReadPosRankSum=2.819;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:784,663:1447:99:24872,0,26432
contig395	931	.	T	C	30262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-0.113;DP=1676;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.185;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.398;SOR=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:680,916:1596:99:30291,0,20745
contig395	1136	.	A	G	33939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.565;DP=1887;ExcessHet=3.0103;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.319;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.942;SOR=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:745,1072:1817:99:33968,0,22223
contig395	1174	.	C	A	20307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.815;DP=1950;ExcessHet=3.0103;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.338;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1161,714:1875:99:20336,0,36696
contig395	1239	.	C	T	34562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.689;DP=1927;ExcessHet=3.0103;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.633;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.915;SOR=0.802	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:758,1075:1833:99:34591,0,22122
contig395	1275	.	A	G	38033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.205;DP=1857;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.400;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.730	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:701,1059:1760:99:38062,0,20591
contig395	1296	.	C	T	19062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-0.279;DP=1834;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.165;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.679	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1083,656:1739:99:19091,0,39160
contig395	1962	.	T	TC	6032.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.480;DP=1644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=1.852;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.809;SOR=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1242,290:1532:99:6070,0,41951
contig395	2027	.	C	T	31990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.027;DP=1695;ExcessHet=3.0103;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.509;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:641,989:1630:99:32019,0,19297
contig395	2178	.	G	A	33284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=2.353;DP=1558;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.023;QD=22.50;ReadPosRankSum=1.900;SOR=0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:620,859:1479:99:33313,0,22524
contig395	2202	.	T	A	34400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.194;DP=1601;ExcessHet=3.0103;FS=0.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.616;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:641,885:1526:99:34429,0,22846
contig395	2221	.	C	T	5278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.072;DP=1609;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.190;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1261,262:1523:99:5307,0,47787
contig395	2379	.	T	C	4613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=1.521;DP=2054;ExcessHet=3.0103;FS=0.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=0.216;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1223,284:1507:99:4642,0,39125
contig395	2405	.	C	T	30680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-2.048;DP=2113;ExcessHet=3.0103;FS=0.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.798;QD=22.86;ReadPosRankSum=4.894;SOR=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:565,777:1342:99:30709,0,22225
contig395	2409	.	G	A	30646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.144;DP=2145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.900;QD=23.06;ReadPosRankSum=5.446;SOR=0.629	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:573,756:1329:99:30675,0,22529
contig395	2411	.	T	A	30124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.945;DP=2150;ExcessHet=3.0103;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-1.720;QD=22.94;ReadPosRankSum=4.931;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:564,749:1313:99:30153,0,22152
contig395	2440	.	T	C	30081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=-0.460;DP=2378;ExcessHet=3.0103;FS=6.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-0.374;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.512;SOR=1.266	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:390,898:1288:99:30110,0,10653
contig395	2444	.	G	A	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;ClippingRankSum=-0.459;DP=2392;ExcessHet=3.0103;FS=9.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-0.456;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=2.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1089,205:1294:99:2942,0,39328
contig396	92	.	A	T	7529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.745;DP=566;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.076;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.658;SOR=0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:302,244:546:99:7558,0,9608
contig396	572	.	T	TC	20902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=29.23;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,564:564:99:20940,1703,0
contig396	657	.	C	CA	17275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=-1.330;DP=583;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQRankSum=0.787;QD=33.42;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,516:517:99:17313,1523,0
contig396	699	.	G	A	8144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.798;DP=573;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.080;QD=14.70;ReadPosRankSum=2.408;SOR=0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,255:554:99:8173,0,9412
contig396	709	.	T	TA	21437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=33.71;SOR=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,556:556:99:21475,1692,0
contig396	741	.	GT	G	20399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=611;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=30.48;SOR=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,582:582:99:20437,1748,0
contig396	856	.	G	GT	21166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.194;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-1.620;QD=34.62;ReadPosRankSum=1.632;SOR=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,589:590:99:21204,1759,0
contig396	919	.	T	TA	22282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=30.25;SOR=0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,548:548:99:22320,1681,0
contig396	924	.	A	G	8848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.522;DP=587;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.963;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:281,281:562:99:8877,0,8703
contig396	946	.	TC	T	21542.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=29.35;SOR=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,532:532:99:21580,1617,0
contig396	1012	.	T	TA	17319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=-1.041;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.322;QD=33.89;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.350	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,510:511:99:17357,1552,0
contig396	1089	.	CA	C	16092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=32.51;SOR=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,495:495:99:16130,1489,0
contig396	1247	.	AT	A	18036.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=25.58;SOR=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,485:485:99:18074,1458,0
contig396	1310	.	C	T	7039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-0.688;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.859;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,229:494:99:7068,0,8284
contig396	1761	.	G	GA	17930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=30.70;SOR=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,448:448:99:17968,1381,0
contig396	1826	.	T	TC	16906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=1.280;DP=509;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.382;QD=25.36;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.233	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,474:475:99:16944,1426,0
contig396	1881	.	A	G	7942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-2.607;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.059;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.120;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:237,258:495:99:7971,0,7356
contig396	1936	.	G	A	8717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=2.997;DP=551;ExcessHet=3.0103;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.593;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.724;SOR=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:251,280:531:99:8746,0,7534
contig396	1959	.	A	AG	15730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=1.163;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.419;QD=30.91;ReadPosRankSum=1.530;SOR=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,506:509:99:15768,1464,0
contig396	2079	.	C	T	9139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.270;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.144;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:268,288:556:99:9168,0,8359
contig396	2091	.	TA	T	21730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=27.68;SOR=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,533:533:99:21768,1618,0
contig396	2138	.	G	A	10495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=1.575;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.158;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.648;SOR=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:278,271:549:99:10524,0,10675
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contig396	2873	.	A	AT	18037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=619;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=32.80;SOR=0.726	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,549:550:99:18075,1670,0
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contig396	2979	.	A	AT	23676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;QD=32.66;SOR=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,511:511:99:23714,1607,0
contig396	2985	.	G	GT	20449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=1.246;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=-0.607;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.808	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,493:495:99:20487,1478,0
contig396	3005	.	T	C	8103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=1.535;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.498;QD=15.29;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=0.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,265:530:99:8132,0,8101
contig396	3021	.	G	GT	23499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;QD=28.79;SOR=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,566:566:99:23537,1733,0
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contig396	3093	.	G	C	7872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=-1.094;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.557;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,264:513:99:7901,0,7692
contig396	3100	.	A	AT	22101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=36.20;SOR=0.975	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,487:487:99:22139,1571,0
contig396	3160	.	A	AT	18836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.441;DP=538;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=-0.688;QD=28.54;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,508:511:99:18874,1457,0
contig396	3198	.	G	A	7059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.505;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=5.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.721;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.768;SOR=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:280,242:522:99:7088,0,8601
contig396	3227	.	G	GT	17065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=547;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=33.66;SOR=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,507:507:99:17103,1534,0
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contig396	3349	.	GA	G	15107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;QD=32.70;SOR=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,462:462:99:15145,1389,0
contig396	3372	.	A	AG	15799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.408;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQRankSum=-0.200;QD=32.64;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,483:484:99:15837,1453,0
contig396	3456	.	C	CT	18690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=525;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;QD=32.41;SOR=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,497:497:99:18728,1502,0
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contig396	3664	.	C	CT	15285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.209;DP=570;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.584;QD=30.09;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,505:508:99:15323,1441,0
contig396	3803	.	A	AT	18798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=536;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=32.72;SOR=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,504:504:99:18836,1527,0
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contig396	4011	.	G	A	6713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.476;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.646;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,218:454:99:6742,0,7477
contig396	4040	.	T	C	8471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.366;DP=483;ExcessHet=3.0103;FS=6.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.164;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.392	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:235,224:459:99:8500,0,8883
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contig396	4206	.	C	T	10085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-1.109;DP=468;ExcessHet=3.0103;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.289;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:194,254:448:99:10114,0,7333
contig396	4208	.	A	T	10085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.445;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.879;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.688;SOR=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:193,254:447:99:10114,0,7333
contig396	4249	.	T	C	7454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-1.093;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.409;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.391;SOR=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:209,237:446:99:7483,0,6356
contig396	4288	.	C	T	7198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.195;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=6.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.825;QD=15.45;ReadPosRankSum=-2.702;SOR=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:230,236:466:99:7227,0,7396
contig396	4291	.	C	CT	17154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-0.519;DP=488;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=1.312;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.485	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,457:460:99:17192,1335,0
contig396	4461	.	C	T	8048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.179;DP=552;ExcessHet=3.0103;FS=4.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.717;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:269,259:528:99:8077,0,8459
contig396	4886	.	T	C	6984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-0.031;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.241;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:249,232:481:99:7013,0,7465
contig396	5109	.	G	A	6357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=1.920;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.210;QD=14.58;ReadPosRankSum=3.306;SOR=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:231,205:436:99:6386,0,7342
contig396	5739	.	T	A	8968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=-0.654;DP=577;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.351;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:274,279:553:99:8997,0,8613
contig396	6248	.	AAG	A	2461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=1.007;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=4.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-0.852;QD=13.83;ReadPosRankSum=-6.633;SOR=0.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:100,78:178:99:2499,0,3554
contig397	41	.	G	A	4020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.956;DP=477;ExcessHet=3.0103;FS=0.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.991;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:118,139:257:99:4049,0,3245
contig397	62	.	CT	C	3821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.171;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=0.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.253;QD=12.57;ReadPosRankSum=3.143;SOR=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:147,157:304:99:3859,0,3513
contig397	144	.	C	A	7850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=-0.171;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.437;QD=16.22;ReadPosRankSum=2.052;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:236,248:484:99:7879,0,6975
contig397	305	.	C	T	7627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.166;DP=526;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.990;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:261,243:504:99:7656,0,8111
contig397	796	.	G	A	9586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=1.248;DP=594;ExcessHet=3.0103;FS=0.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.071;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.599;SOR=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:265,305:570:99:9615,0,8118
contig397	962	.	A	G	8319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.119;DP=534;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.213;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.412;SOR=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:254,259:513:99:8348,0,7976
contig397	1447	.	T	G	12830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-1.383;DP=687;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.264;QD=19.41;ReadPosRankSum=2.107;SOR=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:327,334:661:99:12859,0,14406
contig397	1457	.	T	A	12497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=-0.032;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.618;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.822;SOR=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:324,324:648:99:12526,0,14147
contig397	1835	.	T	TG	18136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=549;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=26.91;SOR=0.980	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,511:511:99:18174,1550,0
contig397	2168	.	G	C	8943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=-0.759;DP=625;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=1.881;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.804;SOR=0.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:299,301:600:99:8972,0,9446
contig397	2378	.	A	G	7698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.041;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.976;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:258,241:499:99:7727,0,8550
contig397	2661	.	A	AT	21435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=516;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=26.74;SOR=0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,477:477:99:21473,1475,0
contig397	2670	.	CT	C	22138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=29.07;SOR=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,492:492:99:22176,1520,0
contig397	2683	.	T	A	8651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.495;DP=548;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-1.153;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:244,281:525:99:8680,0,7282
contig397	2769	.	A	AG	19377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=1.067;DP=546;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQRankSum=0.490;QD=30.87;ReadPosRankSum=1.598;SOR=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,515:516:99:19415,1563,0
contig397	2940	.	C	T	8555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-1.397;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=4.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.822;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:240,274:514:99:8584,0,7426
contig397	3251	.	T	TA	16483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;QD=33.64;SOR=0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,490:490:99:16521,1487,0
contig397	3646	.	C	CA	21944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=576;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;QD=34.25;SOR=0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,547:547:99:21982,1669,0