## HLA genotyping results from Tokyo team ## 2016_0523 ## Class I (A, B, C), Class II (DPA1, DPB1, DQA1, DQB1, DRB1), MIC (MICA, MICB) ## March 2016 Dataset (2834 samples) ## For each sample, HLA genotypes were determined by Tokyo team's computational method (ALPHLARD ver 1.1). ## The genotypes listed in this file were determined by using tumor and matched normal merged WGS data. ## Note that we did not report the genotypes that could not be uniquely determined. ## The genotypes in this file are at 4-digit resolution, and 6-digit information is in another file. ## icgc_donor_id is used instead of submitter_donor_id, which is used in the previous version (v1). #icgc_donor_id HLA-A type 1 HLA-A type 2 HLA-B type 1 HLA-B type 2 HLA-C type 1 HLA-C type 2 HLA-DPA1 type 1 HLA-DPA1 type 2 HLA-DPB1 type 1 HLA-DPB1 type 2 HLA-DQA1 type 1 HLA-DQA1 type 2 HLA-DQB1 type 1 HLA-DQB1 type 2 HLA-DRB1 type 1 HLA-DRB1 type 2 HLA-MICA type 1 HLA-MICA type 2 HLA-MICB type 1 HLA-MICB type 2 DO804 A*02:01 A*32:01 B*15:17 B*51:01 C*07:01 C*15:02 DPA1*01:03 DPA1*02:01 DPB1*02:01 DPB1*09:01 DQA1*01:02 DQA1*05:05 DQB1*03:01 DQB1*06:04 DRB1*11:04 DRB1*13:02 MICA*004 MICA*008:01 MICB*005:02 MICB*005:02 DO555 A*24:02 A*24:02 B*08:01 B*44:05 C*02:02 C*07:01 DPA1*01:03 DPA1*02:01 DPB1*04:01 DPB1*14:01 DQA1*05:01 DQA1*05:05 DQB1*02:01 DQB1*03:01 DRB1*03:01 DRB1*11:04 MICA*008:01 MICA*008:01 MICB*005:02 MICB*008 DO479 A*02:03 A*33:03 B*08:01 B*15:12 C*03:03 C*07:02 DPA1*02:01 DPA1*02:01 DPB1*14:01 DPB1*17:01 DQA1*05:01 DQA1*06:01 DQB1*02:01 DQB1*03:01 DRB1*03:01 DRB1*12:02 MICB*002:01 MICB*005:02 DO689 A*01:02 A*03:01 B*07:02 B*49:01 C*07:01 C*07:02 DPA1*01:03 DPA1*01:03 DPB1*18:01 DPB1*104:01 DQA1*01:05 DQA1*03:03 DQB1*02:02 DQB1*05:01 DRB1*09:01 DRB1*12:01 MICA*004 MICA*008:04 MICB*004:01 MICB*005:02 DO483 A*01:01 A*24:02 B*35:08 B*57:01 C*04:01 C*06:02 DPA1*01:03 DPA1*02:02 DPB1*04:01 DPB1*04:01 DQA1*02:01 DQA1*05:01 DQB1*03:01 DQB1*03:03 DRB1*07:01 DRB1*11:01 MICA*017 MICA*019:01 MICB*002:01 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