Huberarchaeacell legend (click on numbers for pathway map):reliable+questionable |unique | CG02_land_8_20_14_3_00_150_Huberarchaea_01_31_209 | CG03_land_8_20_14_0_80_cor_Huberarchaea_31_114 | CG17_big_fil_post_rev_8_21_14_2_50_Huberarchaea_31_73 | CG18_big_fil_WC_8_21_14_2_50_Huberarchaea_31_19 | CG1_02_FULL_Huberarchaea_31_31_curated | CG2_30_FULL_Huberarchaea_31_98_curated | CG_4_10_14_0_8_um_filter_cor_Huberarchaea_31_133 | CG_4_8_14_3_um_filter_Huberarchaea_31_151 | CG_4_9_14_0_8_um_filter_Huberarchaea_31_21 | CG_4_9_14_3_um_filter_150_Huberarchaea_31_125 | CG_SAG_2014_w16S_CG_CPArch01_01_32_1 |
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METABOLISM | |||||||||||
Carbohydrate metabolism | |||||||||||
Pentose phosphate pathway | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
Galactose metabolism | - | 1+0=1(u:0) | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Starch and sucrose metabolism | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism | 1+0=1(u:1) | 4+1=5(u:2) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:2) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
Pyruvate metabolism | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Energy metabolism | |||||||||||
Oxidative phosphorylation | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
Sulfur metabolism | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | - | - |
Lipid metabolism | |||||||||||
Glycerolipid metabolism | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:1) |
Glycerophospholipid metabolism | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:1) |
Nucleotide metabolism | |||||||||||
Purine metabolism | 10+1=11(u:0) | 12+1=13(u:0) | 12+1=13(u:0) | 12+1=13(u:0) | 11+1=12(u:0) | 12+1=13(u:0) | 12+1=13(u:0) | 12+1=13(u:0) | 12+2=14(u:0) | 12+1=13(u:0) | 4+1=5(u:0) |
Pyrimidine metabolism | 15+1=16(u:3) | 17+1=18(u:3) | 17+1=18(u:3) | 17+1=18(u:3) | 16+1=17(u:3) | 15+1=16(u:2) | 17+1=18(u:3) | 17+1=18(u:3) | 15+2=17(u:2) | 17+1=18(u:3) | 5+1=6(u:0) |
Amino acid metabolism | |||||||||||
Alanine, aspartate and glutamate metabolism | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | - |
Glycine, serine and threonine metabolism | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) |
Cysteine and methionine metabolism | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 2+0=2(u:1) | - |
Arginine and proline metabolism | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | - |
Tyrosine metabolism | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Phenylalanine metabolism | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | - |
Metabolism of other amino acids | |||||||||||
Selenocompound metabolism | 2+0=2(u:0) | 2+1=3(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+1=3(u:0) | 2+1=3(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+1=3(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+1=3(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) |
Glycan biosynthesis and metabolism | |||||||||||
N-Glycan biosynthesis | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+1=4(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+1=4(u:2) | 2+1=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 1+0=1(u:1) |
Various types of N-glycan biosynthesis | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Metabolism of cofactors and vitamins | |||||||||||
One carbon pool by folate | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | - |
Thiamine metabolism | 1+0=1(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Riboflavin metabolism | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | - | - |
Porphyrin and chlorophyll metabolism | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+1=2(u:0) | 1+0=1(u:0) |
Metabolism of terpenoids and polyketides | |||||||||||
Polyketide sugar unit biosynthesis | - | 6+0=6(u:2) | - | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 5+0=5(u:1) | 4+0=4(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | - |
Terpenoid backbone biosynthesis | 2+0=2(u:2) | 2+0=2(u:2) | 2+0=2(u:2) | 2+0=2(u:2) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:2) | 2+0=2(u:2) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:2) | - |
Biosynthesis of vancomycin group antibiotics | - | 1+0=1(u:0) | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | - | - |
Biosynthesis of other secondary metabolites | |||||||||||
Penicillin and cephalosporin biosynthesis | - | 1+0=1(u:1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Novobiocin biosynthesis | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | - |
Streptomycin biosynthesis | - | 4+0=4(u:0) | - | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 4+0=4(u:0) | 4+0=4(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | - |
Isoquinoline alkaloid biosynthesis | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
GENETIC INFORMATION PROCESSING | |||||||||||
Transcription | |||||||||||
RNA polymerase | 6+1=7(u:0) | 7+1=8(u:0) | 7+1=8(u:0) | 7+1=8(u:0) | 6+1=7(u:0) | 7+1=8(u:0) | 7+1=8(u:0) | 7+1=8(u:0) | 7+2=9(u:0) | 7+1=8(u:0) | 2+1=3(u:0) |
Basal transcription factors | 3+0=3(u:2) | 3+1=4(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 2+0=2(u:1) | 3+0=3(u:2) | 3+1=4(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+0=3(u:2) | 3+1=4(u:2) | - |
Spliceosome | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Translation | |||||||||||
Aminoacyl-tRNA biosynthesis | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 22+0=22(u:20) | 20+0=20(u:18) | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 23+0=23(u:21) | 10+0=10(u:8) |
Ribosome biogenesis in eukaryotes | 8+0=8(u:4) | 8+0=8(u:4) | 8+0=8(u:4) | 8+0=8(u:4) | 6+0=6(u:2) | 7+0=7(u:3) | 7+0=7(u:4) | 8+0=8(u:4) | 8+0=8(u:4) | 8+0=8(u:4) | 4+0=4(u:2) |
Ribosome | 33+12=45(u:32) | 36+11=47(u:35) | 33+10=43(u:32) | 35+11=46(u:34) | 34+10=44(u:33) | 32+10=42(u:31) | 36+11=47(u:35) | 33+11=44(u:32) | 36+11=47(u:35) | 34+11=45(u:33) | 11+3=14(u:11) |
RNA transport | 9+0=9(u:6) | 10+0=10(u:7) | 10+0=10(u:7) | 9+0=9(u:6) | 9+0=9(u:6) | 9+0=9(u:6) | 9+0=9(u:7) | 10+0=10(u:7) | 10+0=10(u:7) | 10+0=10(u:7) | 3+0=3(u:1) |
mRNA surveillance pathway | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 2+0=2(u:2) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 1+0=1(u:1) |
Folding, sorting and degradation | |||||||||||
RNA degradation | 3+0=3(u:3) | 4+0=4(u:4) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 4+0=4(u:4) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 3+0=3(u:3) | 1+0=1(u:1) |
Proteasome | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 2+1=3(u:2) | 1+1=2(u:1) | 1+0=1(u:1) |
Protein export | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 5+2=7(u:1) | 1+0=1(u:0) |
Ubiquitin mediated proteolysis | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | - | - | - | - |
Sulfur relay system | 1+0=1(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | 2+0=2(u:0) | 2+0=2(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Protein processing in endoplasmic reticulum | 5+1=6(u:3) | 4+1=5(u:2) | 4+1=5(u:2) | 4+1=5(u:2) | 4+1=5(u:2) | 4+1=5(u:2) | 4+2=6(u:3) | 4+1=5(u:2) | 4+1=5(u:2) | 4+0=4(u:2) | 3+0=3(u:2) |
Replication and repair | |||||||||||
DNA replication | 11+0=11(u:5) | 13+0=13(u:6) | 12+0=12(u:5) | 12+0=12(u:5) | 12+0=12(u:5) | 12+0=12(u:5) | 13+0=13(u:6) | 12+0=12(u:5) | 12+0=12(u:5) | 10+1=11(u:4) | 6+0=6(u:3) |
Base excision repair | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 4+0=4(u:1) | 5+0=5(u:2) | 5+0=5(u:2) | 2+0=2(u:0) |
Nucleotide excision repair | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 5+0=5(u:0) | 4+0=4(u:0) | 2+0=2(u:0) |
Mismatch repair | 5+0=5(u:1) | 5+0=5(u:1) | 5+0=5(u:1) | 5+0=5(u:1) | 5+0=5(u:1) | 5+0=5(u:1) | 4+0=4(u:0) | 4+0=4(u:0) | 5+0=5(u:1) | 4+0=4(u:1) | 2+0=2(u:0) |
Homologous recombination | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - | - |
Non-homologous end-joining | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
Fanconi anemia pathway | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) |
ENVIRONMENTAL INFORMATION PROCESSING | |||||||||||
Membrane transport | |||||||||||
Bacterial secretion system | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 4+2=6(u:1) | 1+0=1(u:1) |
Signal transduction | |||||||||||
Two-component system | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | 2+0=2(u:1) | - |
HIF-1 signaling pathway | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
mTOR signaling pathway | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
PI3K-Akt signaling pathway | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | - |
AMPK signaling pathway | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
CELLULAR PROCESSES | |||||||||||
Transport and catabolism | |||||||||||
Phagosome | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) |
Cell growth and death | |||||||||||
Cell cycle | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 2+0=2(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) | 1+0=1(u:0) |
Cell cycle - yeast | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | - | - | - | - |
Cell cycle - Caulobacter | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+1=2(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:2) |
Meiosis - yeast | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 2+0=2(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | 1+0=1(u:1) | - |
Oocyte meiosis | - | - | - | - | - | - | 1+0=1(u:0) | - | - | - | - |