PHYLA CD HFD name Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) p-values Actinobacteria 8.01 8.64 0.45 41.30 5.60 0.23 0.22 0.02 1.15 0.18 0.0001 Bacteroidetes 9.86 7.11 1.27 26.71 8.03 3.88 4.28 0.35 17.92 2.26 0.0002 Candidatus Saccharibacteria 5.15 4.89 0.20 20.33 3.79 0.47 0.69 0.00 3.00 0.28 0.0001 Deferribacteres 0.04 0.06 0.00 0.22 0.01 0.09 0.13 0.00 0.52 0.04 0.0426 Firmicutes 70.58 13.42 24.69 92.44 72.02 84.12 7.14 68.06 93.62 84.38 0.0001 3.61 8.41 GENERA CD HFD name Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) p-values Barnesiella 0.39 0.46 0.00 2.29 0.21 0.05 0.06 0.00 0.31 0.03 0.0002 Bifidobacterium 6.70 8.35 0.01 40.09 4.43 0.08 0.15 0.00 0.69 0.02 0.0001 Bilophila 0.08 0.13 0.00 0.70 0.05 0.30 0.48 0.00 1.87 0.07 0.0192 Butyricicoccus 0.08 0.12 0.00 0.45 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0031 Butyricimonas 0.10 0.14 0.00 0.43 0.04 0.02 0.03 0.00 0.11 0.00 0.0022 Clostridium sensu stricto 0.06 0.18 0.00 0.71 0.00 0.28 0.52 0.00 2.45 0.09 0.0318 Clostridium XI 0.14 0.42 0.00 2.10 0.00 3.32 3.17 0.00 12.43 2.79 0.0001 Enterorhabdus 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 0.0289 Escherichia/Shigella 0.00 0.01 0.00 0.03 0.00 0.02 0.03 0.00 0.13 0.00 0.0188 Lactococcus 0.19 0.94 0.00 5.25 0.01 12.07 14.92 0.24 48.41 6.97 0.0001 Mucispirillum 0.04 0.06 0.00 0.22 0.01 0.09 0.13 0.00 0.52 0.04 0.0428 Oscillibacter 0.66 0.49 0.03 1.80 0.57 0.29 0.27 0.01 1.13 0.23 0.0007 Prevotella 0.10 0.09 0.00 0.32 0.06 0.01 0.01 0.00 0.07 0.00 0.0001 Pseudoflavonifractor 0.02 0.02 0.00 0.06 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0002 Ruminococcus 0.01 0.02 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0109 Ruminococcus2 0.43 0.45 0.01 1.46 0.26 0.10 0.19 0.00 0.93 0.04 0.0005 Saccharibacteria_genera_incertae_sedis 5.14 4.89 0.20 20.30 3.79 0.47 0.69 0.00 2.99 0.28 0.0001 Sporobacter 0.03 0.03 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0010 Streptococcus 0.14 0.21 0.00 1.10 0.06 0.41 0.51 0.00 1.83 0.19 0.0080 Turicibacter 1.38 2.20 0.00 6.92 0.01 0.13 0.68 0.00 3.66 0.00 0.0049 unclassified_Clostridiales_Incertae Sedis XIII 0.01 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0011 unclassified_Coriobacteriaceae 1.30 0.84 0.30 4.12 1.16 0.14 0.11 0.02 0.44 0.13 0.0001 unclassified_Desulfovibrionaceae 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.03 0.05 0.00 0.22 0.01 0.0274 unclassified_Porphyromonadaceae 3.45 3.53 0.01 13.28 2.25 0.83 1.45 0.02 7.54 0.31 0.0005 unclassified_Prevotellaceae 0.01 0.01 0.00 0.04 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0001 OTUs CD HFD name (Phylum;Family;Genus;Species) Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) Mean (%) SD (%) Min (%) Max (%) Median (%) p-values OTU_1_Firmicutes;Lactobacillales;Lactobacillaceae;Lactobacillus 4.8959 5.8392 0.0053 29.0644 4.7090 8.5003 7.5945 0.0617 23.3030 6.5391 0.0430 OTU_10_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1648 0.1935 0.0010 0.7042 0.0647 3.2271 4.0698 0.0007 17.8136 2.1566 0.0001 OTU_100_Firmicutes;Clostridiales 0.5775 0.7884 0.0008 3.1852 0.2859 0.0238 0.1077 0.0007 0.5834 0.0024 0.0004 OTU_101_Firmicutes;Clostridiales 0.2903 0.3283 0.0008 1.1379 0.1688 0.1453 0.1821 0.0016 0.8312 0.0827 0.0405 OTU_102_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1252 0.1223 0.0027 0.4399 0.0802 0.0659 0.0859 0.0015 0.3716 0.0259 0.0349 OTU_104_Firmicutes;Clostridiales;[Mogibacteriaceae] 0.1641 0.1383 0.0024 0.6578 0.1365 0.0263 0.0475 0.0010 0.2124 0.0062 0.0000 OTU_107_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1050 0.2380 0.0008 1.1111 0.0194 0.0044 0.0048 0.0007 0.0185 0.0021 0.0267 OTU_108_Firmicutes;Clostridiales 0.2359 0.5212 0.0023 2.9018 0.1022 0.0277 0.0635 0.0007 0.3306 0.0074 0.0370 OTU_11_Firmicutes;Clostridiales;Peptostreptococcaceae 0.1047 0.2846 0.0008 1.1340 0.0036 3.2674 3.1045 0.0021 12.0140 2.7686 <0.0001 OTU_110_Firmicutes;Clostridiales 0.2194 0.4208 0.0009 1.9522 0.0132 0.0130 0.0526 0.0007 0.2853 0.0016 0.0112 OTU_111_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.2179 0.3244 0.0016 1.6279 0.1314 0.0087 0.0331 0.0007 0.1803 0.0016 0.0010 OTU_113_Firmicutes;Clostridiales 0.5535 0.5002 0.0008 1.7539 0.5498 0.0735 0.1646 0.0009 0.6067 0.0055 <0.0001 OTU_119_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1994 0.2501 0.0015 0.9545 0.0918 0.0420 0.1221 0.0009 0.6296 0.0031 0.0033 OTU_12_TM7 4.5326 4.3214 0.0095 18.2196 3.3690 0.3410 0.6071 0.0010 2.5750 0.0461 <0.0001 OTU_122_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1541 0.3498 0.0008 1.3640 0.0027 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0230 OTU_123_Bacteroidetes;Bacteroidales;Rikenellaceae 0.3179 0.4442 0.0008 2.2809 0.2230 0.0122 0.0189 0.0007 0.0796 0.0031 0.0005 OTU_124_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0940 0.1488 0.0008 0.5805 0.0213 0.0300 0.0437 0.0011 0.1885 0.0118 0.0299 OTU_126_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0794 0.1347 0.0012 0.5759 0.0162 0.0032 0.0048 0.0007 0.0236 0.0017 0.0035 OTU_127_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.1662 0.1799 0.0015 0.7343 0.1011 0.0107 0.0216 0.0009 0.1124 0.0036 <0.0001 OTU_128_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.1414 0.1911 0.0009 0.9444 0.0733 0.0461 0.0640 0.0007 0.2175 0.0136 0.0132 OTU_129_Firmicutes;Clostridiales 0.1428 0.2022 0.0012 0.7040 0.0531 0.0109 0.0228 0.0007 0.1209 0.0036 0.0009 OTU_13_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 1.1316 0.7313 0.0672 2.7418 0.8888 0.6159 0.4944 0.0130 2.1032 0.5914 0.0024 OTU_132_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 0.1284 0.2045 0.0009 0.9774 0.0621 0.3127 0.4356 0.0015 1.4024 0.0964 0.0383 OTU_133_Firmicutes;Clostridiales 0.1483 0.3595 0.0009 1.9102 0.0186 0.0053 0.0155 0.0009 0.0848 0.0015 0.0366 OTU_135_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1461 0.1739 0.0010 0.6371 0.0893 0.0333 0.0536 0.0010 0.2400 0.0135 0.0014 OTU_138_Firmicutes;Clostridiales 0.1548 0.2307 0.0008 0.7677 0.0290 0.0125 0.0368 0.0007 0.1821 0.0018 0.0018 OTU_14_Firmicutes;Clostridiales 1.9333 2.4792 0.0047 12.9901 1.3703 4.5841 4.5880 0.8953 19.4975 3.3525 0.0068 OTU_141_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1341 0.1799 0.0015 0.9294 0.0747 0.0199 0.0242 0.0015 0.1111 0.0106 0.0013 OTU_142_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1683 0.2370 0.0008 0.8283 0.0493 0.0045 0.0104 0.0007 0.0563 0.0017 0.0005 OTU_143_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.1108 0.1260 0.0023 0.6000 0.0706 0.0452 0.0533 0.0014 0.2245 0.0212 0.0121 OTU_145_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.2097 0.3999 0.0008 1.8542 0.0344 0.0061 0.0109 0.0007 0.0404 0.0018 0.0082 OTU_148_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1160 0.1319 0.0008 0.5005 0.0818 0.0064 0.0084 0.0007 0.0317 0.0025 <0.0001 OTU_149_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 0.0207 0.0278 0.0008 0.1239 0.0132 0.1199 0.2642 0.0007 1.0915 0.0093 0.0420 OTU_15_Firmicutes;Clostridiales 0.0637 0.1768 0.0010 0.9345 0.0044 2.1280 3.8443 0.0010 18.3739 0.0196 0.0041 OTU_150_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0204 0.0327 0.0008 0.1157 0.0032 0.2956 0.5292 0.0007 1.8988 0.0159 0.0054 OTU_151_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1219 0.1069 0.0032 0.4760 0.1005 0.0305 0.0656 0.0007 0.3579 0.0121 0.0002 OTU_153_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1133 0.1004 0.0017 0.4703 0.0757 0.3514 0.4772 0.0011 1.6411 0.1430 0.0087 OTU_154_Bacteroidetes;Bacteroidales;Rikenellaceae 0.1856 0.2453 0.0008 0.8200 0.0636 0.0035 0.0043 0.0007 0.0159 0.0018 0.0002 OTU_155_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1258 0.2656 0.0008 0.9738 0.0023 0.0067 0.0232 0.0007 0.1262 0.0016 0.0193 OTU_156_Firmicutes;Clostridiales;Clostridiaceae;Clostridium perfringens 0.0636 0.1827 0.0008 0.7145 0.0018 0.1802 0.2374 0.0012 0.8386 0.0883 0.0366 OTU_158_Firmicutes;Clostridiales 0.0784 0.0631 0.0012 0.2132 0.0708 0.0265 0.0325 0.0010 0.1482 0.0159 0.0002 OTU_159_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1662 0.1936 0.0012 0.6452 0.0939 0.0366 0.0289 0.0010 0.1128 0.0396 0.0007 OTU_16_Firmicutes;Clostridiales 2.2020 3.5189 0.0015 15.1349 0.3395 0.3362 1.7804 0.0007 9.5933 0.0027 0.0130 OTU_164_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.2156 0.3509 0.0009 1.8983 0.1214 0.0140 0.0230 0.0007 0.0808 0.0022 0.0031 OTU_165_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1138 0.2211 0.0008 0.8751 0.0053 0.0024 0.0028 0.0007 0.0159 0.0016 0.0088 OTU_17_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.5561 0.6523 0.0069 2.4891 0.3408 0.2763 0.3833 0.0039 1.4182 0.1322 0.0493 OTU_174_Firmicutes;Clostridiales;[Mogibacteriaceae] 0.0852 0.0881 0.0009 0.2971 0.0701 0.0192 0.0241 0.0007 0.0685 0.0073 0.0003 OTU_175_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.2048 0.1996 0.0015 0.9148 0.1583 0.0033 0.0038 0.0007 0.0159 0.0019 <0.0001 OTU_176_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0754 0.0549 0.0009 0.1800 0.0849 0.0320 0.0377 0.0010 0.1447 0.0159 0.0008 OTU_178_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0465 0.1161 0.0008 0.5029 0.0073 0.0024 0.0029 0.0007 0.0159 0.0015 0.0453 OTU_179_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Butyricicoccus pullicaecorum 0.1846 0.1785 0.0017 0.6249 0.1704 0.0156 0.0152 0.0010 0.0550 0.0091 <0.0001 OTU_182_Bacteroidetes;Bacteroidales;Prevotellaceae;Prevotella 0.0857 0.0955 0.0009 0.3300 0.0429 0.0047 0.0119 0.0007 0.0635 0.0016 <0.0001 OTU_183_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Anaerostipes 0.1371 0.2177 0.0010 0.7785 0.0292 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0015 OTU_185_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0658 0.0898 0.0010 0.3492 0.0250 0.0274 0.0507 0.0007 0.2225 0.0095 0.0481 OTU_186_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0667 0.1300 0.0008 0.4583 0.0023 0.0029 0.0040 0.0007 0.0171 0.0015 0.0106 OTU_187_Firmicutes;Clostridiales 0.1013 0.0920 0.0008 0.2959 0.0695 0.0068 0.0230 0.0007 0.1252 0.0016 <0.0001 OTU_19_Firmicutes;Clostridiales 2.9483 2.5653 0.0092 10.7192 2.0252 0.0751 0.1352 0.0010 0.4441 0.0178 0.0000 OTU_193_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1976 0.3878 0.0012 2.0908 0.0805 0.0484 0.0809 0.0010 0.3777 0.0123 0.0469 OTU_195_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1078 0.1108 0.0029 0.4420 0.0642 0.0073 0.0064 0.0012 0.0287 0.0062 <0.0001 OTU_196_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0824 0.0813 0.0010 0.2782 0.0685 0.0361 0.0495 0.0007 0.2130 0.0142 0.0106 OTU_2_Firmicutes;Lactobacillales;Streptococcaceae;Lactococcus 0.0110 0.0065 0.0021 0.0296 0.0081 11.9258 14.7232 0.2358 48.1674 6.9220 <0.0001 OTU_20_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 1.1337 1.8408 0.0054 9.4540 0.6820 0.3967 0.6484 0.0007 2.1457 0.0159 0.0459 OTU_200_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 0.0488 0.0595 0.0009 0.2072 0.0166 0.1512 0.1576 0.0010 0.4865 0.0865 0.0013 OTU_206_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.2174 0.5379 0.0008 2.1527 0.0024 0.0026 0.0030 0.0007 0.0159 0.0016 0.0358 OTU_208_Bacteroidetes;Bacteroidales;[Odoribacteraceae];Odoribacter 0.1049 0.1440 0.0008 0.4478 0.0427 0.0173 0.0337 0.0007 0.1126 0.0025 0.0023 OTU_215_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0552 0.0665 0.0010 0.2533 0.0323 0.0142 0.0449 0.0007 0.2404 0.0018 0.0073 OTU_218_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0698 0.0668 0.0009 0.3338 0.0577 0.0027 0.0031 0.0009 0.0159 0.0015 <0.0001 OTU_219_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.0839 0.1342 0.0008 0.5589 0.0191 0.0035 0.0044 0.0009 0.0170 0.0016 0.0021 OTU_222_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae 0.1424 0.1433 0.0015 0.6343 0.1325 0.0029 0.0033 0.0007 0.0159 0.0017 0.0000 OTU_223_Firmicutes;Clostridiales 0.0741 0.1814 0.0009 0.8415 0.0039 0.0024 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0375 OTU_228_Firmicutes;Clostridiales 0.0466 0.0793 0.0008 0.3988 0.0107 0.0118 0.0255 0.0007 0.0970 0.0018 0.0279 OTU_23_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 1.2104 1.0018 0.1467 3.5466 0.9095 0.7109 0.6353 0.0137 2.6079 0.4666 0.0258 OTU_230_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0528 0.0447 0.0008 0.1813 0.0420 0.0121 0.0199 0.0010 0.0952 0.0045 <0.0001 OTU_232_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1075 0.2126 0.0010 1.0485 0.0346 0.0038 0.0042 0.0007 0.0179 0.0018 0.0110 OTU_237_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0280 0.0359 0.0009 0.1292 0.0112 0.0037 0.0061 0.0007 0.0317 0.0016 0.0007 OTU_238_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.1133 0.2308 0.0008 1.2010 0.0119 0.0030 0.0042 0.0007 0.0191 0.0016 0.0127 OTU_24_Firmicutes;Turicibacterales;Turicibacteraceae;Turicibacter 1.3847 2.2053 0.0008 6.9509 0.0131 0.1315 0.6804 0.0007 3.6691 0.0027 0.0048 OTU_240_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0434 0.0395 0.0018 0.1894 0.0255 0.0056 0.0159 0.0007 0.0863 0.0017 <0.0001 OTU_241_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.2626 0.5884 0.0008 2.7119 0.0635 0.0062 0.0109 0.0007 0.0594 0.0027 0.0224 OTU_244_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.3613 0.4212 0.0008 1.6728 0.2377 0.0072 0.0108 0.0007 0.0455 0.0026 <0.0001 OTU_246_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 0.0185 0.0181 0.0014 0.0745 0.0126 0.0519 0.0435 0.0010 0.1812 0.0477 0.0002 OTU_247_Bacteroidetes;Bacteroidales;Rikenellaceae 0.0355 0.0516 0.0008 0.1937 0.0044 0.0130 0.0246 0.0007 0.1111 0.0031 0.0374 OTU_25_Bacteroidetes;Bacteroidales 1.0452 1.5781 0.0008 5.3755 0.1762 0.2054 0.4353 0.0009 1.7070 0.0032 0.0076 OTU_250_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0087 0.0106 0.0008 0.0395 0.0031 0.0359 0.0537 0.0007 0.2000 0.0064 0.0076 OTU_251_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0186 0.0232 0.0008 0.0920 0.0090 0.0028 0.0032 0.0007 0.0159 0.0016 0.0006 OTU_252_Firmicutes;Clostridiales 0.0389 0.0957 0.0008 0.5130 0.0055 0.0029 0.0042 0.0007 0.0188 0.0015 0.0474 OTU_253_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0418 0.0611 0.0008 0.1890 0.0027 0.0120 0.0281 0.0007 0.1067 0.0018 0.0195 OTU_256_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0322 0.0373 0.0008 0.1355 0.0179 0.0074 0.0136 0.0007 0.0541 0.0018 0.0013 OTU_258_Firmicutes;Clostridiales 0.0433 0.0648 0.0008 0.2360 0.0107 0.0028 0.0041 0.0007 0.0180 0.0015 0.0014 OTU_26_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.2797 0.1999 0.0319 0.8462 0.2478 1.1922 0.6907 0.1750 2.6333 1.1487 <0.0001 OTU_267_Firmicutes;Clostridiales;Clostridiaceae;Candidatus Arthromitus 0.0330 0.0511 0.0008 0.1727 0.0023 0.0027 0.0032 0.0007 0.0159 0.0015 0.0023 OTU_269_Firmicutes;Clostridiales 0.0451 0.0796 0.0008 0.3758 0.0024 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0054 OTU_27_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.8445 0.6858 0.0015 2.8416 0.6299 0.4109 0.5062 0.0010 1.6515 0.1457 0.0075 OTU_273_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0412 0.0549 0.0008 0.1985 0.0055 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0003 OTU_278_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0998 0.0988 0.0009 0.4418 0.0776 0.0240 0.0318 0.0007 0.1420 0.0092 0.0002 OTU_279_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0679 0.1616 0.0009 0.8684 0.0242 0.0062 0.0087 0.0007 0.0432 0.0022 0.0444 OTU_28_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.6849 0.7397 0.0469 3.0770 0.3798 0.2631 0.3118 0.0015 1.5773 0.1336 0.0062 OTU_280_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Coprococcus 0.0273 0.0450 0.0008 0.2272 0.0078 0.0078 0.0108 0.0007 0.0476 0.0019 0.0269 OTU_281_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0238 0.0281 0.0012 0.1418 0.0148 0.0077 0.0073 0.0009 0.0304 0.0063 0.0042 OTU_283_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0109 0.0080 0.0008 0.0355 0.0097 0.0176 0.0145 0.0010 0.0476 0.0123 0.0285 OTU_289_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0307 0.0621 0.0009 0.2610 0.0064 0.0026 0.0031 0.0007 0.0159 0.0015 0.0178 OTU_291_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0344 0.0524 0.0009 0.2699 0.0178 0.0038 0.0065 0.0007 0.0317 0.0016 0.0028 OTU_296_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.7654 1.1569 0.0008 3.8838 0.1258 0.1452 0.3046 0.0009 1.2057 0.0051 0.0070 OTU_299_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0276 0.0278 0.0014 0.1012 0.0176 0.0048 0.0058 0.0007 0.0269 0.0030 0.0001 OTU_3_Firmicutes;Clostridiales 0.5508 0.6608 0.0045 2.3524 0.3078 9.3944 9.5845 0.0076 32.5231 6.4012 <0.0001 OTU_30_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1375 0.2803 0.0010 1.4655 0.0055 1.1130 1.6183 0.0010 6.4846 0.2245 0.0016 OTU_300_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0197 0.0282 0.0008 0.0960 0.0026 0.0025 0.0029 0.0007 0.0159 0.0015 0.0018 OTU_302_Firmicutes;Clostridiales 0.3297 0.6273 0.0010 3.0776 0.0597 0.0732 0.1074 0.0013 0.4443 0.0300 0.0340 OTU_306_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;[Ruminococcus] 0.0089 0.0082 0.0008 0.0291 0.0055 0.0202 0.0279 0.0009 0.1151 0.0053 0.0345 OTU_307_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0218 0.0516 0.0008 0.2768 0.0023 0.0024 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0474 OTU_31_Firmicutes;Clostridiales 0.1984 0.3035 0.0012 1.2442 0.0653 0.7183 1.1147 0.0015 5.2085 0.0910 0.0152 OTU_312_Proteobacteria;Enterobacteriales;Enterobacteriaceae 0.0033 0.0053 0.0008 0.0290 0.0017 0.0175 0.0324 0.0007 0.1328 0.0031 0.0194 OTU_315_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0222 0.0332 0.0009 0.1384 0.0053 0.0049 0.0057 0.0007 0.0248 0.0027 0.0076 OTU_32_Firmicutes;Clostridiales 0.9521 2.1121 0.0010 8.9305 0.1370 0.0485 0.0721 0.0010 0.3650 0.0266 0.0250 OTU_320_Firmicutes;Clostridiales 0.0146 0.0201 0.0008 0.0740 0.0031 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0018 OTU_322_TM7 0.5113 0.6783 0.0009 2.6286 0.2232 0.1176 0.2043 0.0007 0.8100 0.0077 0.0040 OTU_326_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0135 0.0165 0.0009 0.0597 0.0027 0.0051 0.0064 0.0007 0.0228 0.0022 0.0137 OTU_333_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Ruminococcus 0.0090 0.0143 0.0009 0.0701 0.0042 0.0024 0.0029 0.0007 0.0159 0.0016 0.0175 OTU_336_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0494 0.0702 0.0014 0.2607 0.0239 0.0047 0.0045 0.0009 0.0159 0.0031 0.0011 OTU_338_Cyanobacteria 0.0067 0.0073 0.0008 0.0275 0.0036 0.0024 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0040 OTU_340_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae; Ruminococcus gnavus 0.0180 0.0235 0.0008 0.1019 0.0073 0.0672 0.0985 0.0014 0.3379 0.0202 0.0090 OTU_352_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0310 0.0640 0.0008 0.3424 0.0104 0.0036 0.0044 0.0010 0.0171 0.0018 0.0247 OTU_354_Firmicutes;Clostridiales 0.0128 0.0186 0.0009 0.0711 0.0023 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0037 OTU_357_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae 0.0105 0.0192 0.0008 0.1030 0.0032 0.0024 0.0029 0.0007 0.0159 0.0015 0.0270 OTU_359_Firmicutes;Lactobacillales;Streptococcaceae;Streptococcus 0.0018 0.0009 0.0008 0.0053 0.0016 0.0084 0.0181 0.0007 0.0859 0.0019 0.0470 OTU_36_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.8200 0.9409 0.0252 4.4324 0.4996 0.0519 0.0524 0.0010 0.1878 0.0372 <0.0001 OTU_363_Firmicutes;Clostridiales 0.0107 0.0223 0.0008 0.0868 0.0018 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0479 OTU_368_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0135 0.0277 0.0008 0.1253 0.0026 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0342 OTU_369_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Clostridium piliforme 0.0060 0.0073 0.0010 0.0277 0.0025 0.0025 0.0029 0.0007 0.0159 0.0015 0.0182 OTU_37_Firmicutes;Clostridiales 0.1378 0.2713 0.0029 1.2818 0.0607 0.8342 1.0352 0.0159 4.5782 0.5330 0.0006 OTU_371_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0467 0.0554 0.0009 0.2103 0.0331 0.2701 0.2703 0.0013 0.8631 0.2210 <0.0001 OTU_379_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Coprococcus 0.0138 0.0146 0.0008 0.0450 0.0083 0.0034 0.0048 0.0007 0.0176 0.0015 0.0005 OTU_382_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0123 0.0208 0.0009 0.1091 0.0036 0.0037 0.0061 0.0009 0.0317 0.0018 0.0358 OTU_385_Firmicutes;Clostridiales 0.0071 0.0123 0.0009 0.0584 0.0026 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0414 OTU_39_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1899 0.1465 0.0018 0.7148 0.1805 0.7616 0.5932 0.0015 2.4585 0.6668 <0.0001 OTU_395_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0048 0.0038 0.0008 0.0150 0.0046 0.0029 0.0032 0.0007 0.0159 0.0018 0.0376 OTU_4_Actinobacteria;Bifidobacteriales;Bifidobacteriaceae;Bifidobacterium pseudolongum 6.7785 8.8619 0.0050 44.0082 4.3979 0.0774 0.1468 0.0010 0.6884 0.0159 0.0001 OTU_400_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0068 0.0076 0.0008 0.0261 0.0026 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0047 OTU_402_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0068 0.0107 0.0008 0.0444 0.0018 0.0025 0.0029 0.0009 0.0159 0.0015 0.0395 OTU_411_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0290 0.0521 0.0009 0.2053 0.0042 0.0072 0.0123 0.0007 0.0500 0.0026 0.0316 OTU_412_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0667 0.0527 0.0015 0.1816 0.0455 0.0155 0.0388 0.0007 0.1835 0.0031 0.0001 OTU_413_Firmicutes;Lactobacillales;Lactobacillaceae;Lactobacillus 2.8686 3.3544 0.0017 13.8547 2.2742 0.9883 2.3737 0.0022 12.2671 0.1303 0.0156 OTU_416_Firmicutes;Clostridiales 0.0105 0.0145 0.0008 0.0472 0.0029 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0039 OTU_434_Firmicutes;Clostridiales;Christensenellaceae 0.0025 0.0019 0.0008 0.0079 0.0018 0.0047 0.0049 0.0007 0.0171 0.0022 0.0280 OTU_436_Firmicutes;Clostridiales 0.0057 0.0078 0.0008 0.0291 0.0023 0.0024 0.0029 0.0007 0.0159 0.0015 0.0408 OTU_438_Firmicutes;Clostridiales 0.0020 0.0011 0.0008 0.0053 0.0017 0.0082 0.0116 0.0007 0.0498 0.0025 0.0043 OTU_479_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.0036 0.0029 0.0008 0.0153 0.0026 0.0053 0.0035 0.0010 0.0159 0.0039 0.0464 OTU_492_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.0332 0.0293 0.0008 0.1155 0.0268 0.0075 0.0173 0.0007 0.0952 0.0030 0.0001 OTU_496_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0084 0.0133 0.0008 0.0613 0.0024 0.0023 0.0028 0.0007 0.0159 0.0015 0.0180 OTU_50_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Blautia producta 0.1920 0.2586 0.0023 1.1345 0.0947 0.7418 0.6336 0.1303 2.9591 0.5661 <0.0001 OTU_504_Firmicutes;Clostridiales 0.1556 0.3484 0.0024 1.8909 0.0566 0.4538 0.6433 0.0031 2.7948 0.2096 0.0281 OTU_53_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.7564 0.9191 0.0010 3.6807 0.4121 0.0085 0.0161 0.0007 0.0594 0.0025 0.0001 OTU_537_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.6133 0.8429 0.0008 3.3539 0.1854 0.1531 0.4015 0.0007 1.8724 0.0130 0.0098 OTU_538_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0146 0.0181 0.0010 0.0756 0.0073 0.0028 0.0031 0.0007 0.0159 0.0018 0.0010 OTU_550_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1531 0.3838 0.0008 1.6745 0.0023 0.0025 0.0029 0.0007 0.0159 0.0016 0.0390 OTU_552_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1275 0.1414 0.0010 0.7455 0.0876 0.0386 0.0882 0.0007 0.4341 0.0118 0.0053 OTU_553_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.0354 0.0620 0.0008 0.2722 0.0032 0.0028 0.0032 0.0007 0.0159 0.0017 0.0064 OTU_56_Firmicutes;Clostridiales 0.4663 0.7959 0.0009 3.1255 0.1633 0.0650 0.0724 0.0010 0.2494 0.0310 0.0090 OTU_565_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.0633 0.0897 0.0015 0.3652 0.0321 0.0227 0.0486 0.0010 0.2535 0.0049 0.0349 OTU_579_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Dorea 0.0171 0.0275 0.0009 0.1051 0.0053 0.3190 0.4382 0.0014 1.4764 0.1175 0.0003 OTU_58_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.4843 0.3992 0.0010 1.5730 0.4014 0.0203 0.0309 0.0007 0.1177 0.0077 <0.0001 OTU_591_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae 0.0391 0.0525 0.0008 0.2171 0.0180 0.0029 0.0035 0.0007 0.0159 0.0016 0.0005 OTU_594_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.4107 0.4855 0.0020 1.9270 0.2124 0.0862 0.1730 0.0012 0.7536 0.0101 0.0012 OTU_6_Firmicutes;Clostridiales 1.5024 2.5297 0.0221 12.0387 0.4552 4.9881 4.8436 0.1905 17.6001 4.4468 0.0008 OTU_62_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.3593 0.5398 0.0085 2.8831 0.2045 0.0833 0.1359 0.0007 0.6665 0.0380 0.0097 OTU_63_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.4472 0.3360 0.0573 1.2127 0.3715 0.0584 0.0515 0.0065 0.2153 0.0453 <0.0001 OTU_64_Firmicutes;Clostridiales 0.7211 0.9093 0.0009 3.1117 0.3535 0.0455 0.1016 0.0007 0.4760 0.0092 0.0002 OTU_65_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.3354 0.3417 0.0029 1.4753 0.2159 0.0643 0.0515 0.0007 0.1739 0.0562 0.0001 OTU_66_Firmicutes;Clostridiales;Ruminococcaceae;Oscillospira 0.3883 0.3443 0.0523 1.8655 0.3878 1.0427 1.1859 0.0168 4.8984 0.5777 0.0046 OTU_70_Proteobacteria;Desulfovibrionales;Desulfovibrionaceae;Bilophila 0.0847 0.1305 0.0015 0.6907 0.0527 0.3004 0.4804 0.0007 1.8762 0.0635 0.0192 OTU_71_Firmicutes;Clostridiales 0.3509 0.7092 0.0008 3.3481 0.0023 0.0024 0.0028 0.0007 0.0159 0.0016 0.0105 OTU_72_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.4479 0.8971 0.0023 4.8517 0.1879 0.0494 0.0628 0.0013 0.2864 0.0294 0.0204 OTU_73_Firmicutes;Clostridiales 0.6605 0.7892 0.0036 3.6576 0.3068 0.1056 0.1333 0.0015 0.6641 0.0601 0.0004 OTU_75_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1028 0.1483 0.0008 0.6722 0.0446 0.3482 0.5163 0.0007 2.5027 0.2208 0.0138 OTU_76_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.4241 0.6940 0.0012 3.6173 0.1856 0.0438 0.0477 0.0010 0.2063 0.0302 0.0047 OTU_79_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Ruminococcus gnavus 0.3301 0.3857 0.0010 1.1939 0.1712 0.0221 0.0966 0.0007 0.5236 0.0029 0.0001 OTU_80_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.2835 0.3116 0.0010 1.2673 0.1619 0.0457 0.0344 0.0007 0.1168 0.0405 0.0001 OTU_82_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.2620 0.3947 0.0014 1.9245 0.0889 0.0075 0.0123 0.0009 0.0584 0.0031 0.0010 OTU_84_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;Coprococcus 0.6885 0.8510 0.0012 3.8600 0.3380 0.0852 0.2138 0.0017 1.0851 0.0109 0.0005 OTU_87_Actinobacteria;Coriobacteriales;Coriobacteriaceae;Adlercreutzia 0.2473 0.3408 0.0015 1.6135 0.1529 0.0047 0.0115 0.0007 0.0626 0.0017 0.0003 OTU_88_Deferribacteres;Deferribacterales;Deferribacteraceae;Mucispirillum schaedleri 0.0361 0.0542 0.0008 0.2171 0.0077 0.0885 0.1280 0.0007 0.5132 0.0359 0.0412 OTU_89_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae;[Ruminococcus]gnavus 0.2260 0.2866 0.0009 1.1304 0.1059 0.0186 0.0762 0.0007 0.4137 0.0020 0.0004 OTU_9_Proteobacteria;Desulfovibrionales;Desulfovibrionaceae;Desulfovibrio 2.2276 1.8538 0.0017 8.3513 1.9059 0.9285 1.6909 0.0009 7.6373 0.0888 0.0064 OTU_96_Firmicutes;Clostridiales;Lachnospiraceae 0.1718 0.3109 0.0008 1.0829 0.0258 0.0326 0.0642 0.0010 0.2483 0.0049 0.0215 OTU_99_Bacteroidetes;Bacteroidales 0.4544 0.5789 0.0058 2.6037 0.2328 0.0312 0.0734 0.0013 0.4029 0.0127 0.0002