Sanderson et al.—American Journal of Botany 2019– Appendix S6.,,,,,,
"Appendix S6. List of genes with significant gene by environment interactions in our study for the pairwise comparison of IT to SW (PFDR <= 0.05). F, PValue, and FDR refer to the significance test of the interaction term.",,,,,,
Gene,Alias,logFC,logCPM,F,PValue,FDR
AT1G01470,LEA14,-0.914377776,6.577855502,20.84677954,5.75E-04,0.049782337
AT1G02270,NA,-0.82737883,5.128473426,20.28572518,6.43E-04,0.052230954
AT1G02330,NA,-0.622116502,4.921718153,20.44825388,6.22E-04,0.051617631
AT1G03687,NA,1.07958926,4.231399269,49.08704049,1.11E-05,0.007649197
AT1G04530,NA,0.768759911,6.023460817,23.46445463,3.52E-04,0.038389404
AT1G08630,THA1,-3.486283616,1.371886651,25.36129211,2.52E-04,0.032442142
AT1G09350,GolS3,-2.525208891,6.647404102,28.69291261,1.46E-04,0.023653544
AT1G09415,NIMIN-3,1.349576159,4.530005327,28.47788935,1.51E-04,0.024078363
AT1G09890,NA,1.209559749,3.024766605,20.87684249,5.72E-04,0.049705006
AT1G10070,BCAT-2,-3.524871489,4.175548109,97.64147985,2.74E-07,6.34E-04
AT1G10410,NA,-0.7612765,6.365445715,25.71783687,2.37E-04,0.030927391
AT1G10960,FD1,1.139327093,7.743053088,25.12977319,2.62E-04,0.033107664
AT1G11210,NA,-1.752735967,5.815733768,45.76412059,1.58E-05,0.008697945
AT1G11280,NA,-1.748363219,4.252494172,26.78000661,1.99E-04,0.02782132
AT1G11450,NA,0.965349077,3.909751161,21.56371544,5.01E-04,0.046550078
AT1G13270,MAP1C,1.482441771,6.318467615,45.12823818,1.69E-05,0.008697945
AT1G13930,NA,-0.829393193,8.34778378,22.95537643,3.86E-04,0.040178442
AT1G14200,NA,-2.188280894,3.175902592,121.295058,7.98E-08,4.01E-04
AT1G15860,NA,0.788519316,5.566493051,25.73012881,2.37E-04,0.030927391
AT1G15960,NRAMP6,1.250183846,3.789080799,46.91028317,1.39E-05,0.008211342
AT1G16260,NA,1.677171338,4.062806432,88.47116721,4.75E-07,9.54E-04
AT1G16850,NA,-3.82254707,5.449170572,154.7716339,1.94E-08,1.95E-04
AT1G19350,BES1,0.86304706,6.933530197,21.69291745,4.89E-04,0.046307187
AT1G19370,NA,-0.993945625,4.611268473,39.76353779,3.16E-05,0.012685141
AT1G20440,COR47,-1.792220846,8.737840543,71.99439752,1.47E-06,0.001524743
AT1G20450,ERD10,-1.533993226,8.327434778,106.8915501,1.64E-07,4.71E-04
AT1G21350,NA,1.054585874,4.684675645,35.89777506,5.17E-05,0.015822876
AT1G21390,emb2170,-1.302822037,3.646694651,48.56332069,1.17E-05,0.007808911
AT1G21440,NA,0.792571798,6.768059641,24.98968151,2.69E-04,0.033257151
AT1G22070,TGA3,-1.308459849,5.770841776,29.39080199,1.31E-04,0.022738319
AT1G22360,UGT85A2,-1.048254198,4.792454836,25.16222061,2.61E-04,0.033107664
AT1G22370,UGT85A5,-2.676578705,3.303931664,79.58771834,8.53E-07,0.0013166
AT1G23890,NA,1.741154961,3.411693718,76.2685051,1.08E-06,0.001440727
AT1G24100,UGT74B1,1.30655454,6.529090645,39.41335437,3.30E-05,0.012984265
AT1G25550,NA,0.849490427,5.308185409,31.83374472,9.10E-05,0.019475407
AT1G26560,BGLU40,1.244494488,3.857954095,34.38398641,6.35E-05,0.017216155
AT1G26665,NA,-0.816876512,4.067184394,25.05954518,2.66E-04,0.033107664
AT1G28260,NA,-1.077295245,3.700664469,21.87317059,4.72E-04,0.04586337
AT1G29720,NA,1.389409129,5.547038243,32.43206215,8.34E-05,0.019475407
AT1G31690,NA,2.395158625,6.209616194,84.23236702,6.24E-07,0.001138458
AT1G31870,NA,-0.566551911,5.101131552,23.49236067,3.50E-04,0.038389404
AT1G32080,NA,0.982987156,7.433705964,37.55935079,4.17E-05,0.015128385
AT1G32090,NA,-0.994714361,4.328300505,31.93777732,8.96E-05,0.019475407
AT1G32860,NA,-0.795941839,5.239173026,20.48824178,6.17E-04,0.051617631
AT1G33320,NA,2.734951877,1.796192581,31.58961228,9.43E-05,0.01970959
AT1G33720,CYP76C6,-2.40959025,2.801582185,71.58698477,1.52E-06,0.001524743
AT1G33960,AIG1,-3.473320844,2.24617577,40.56910216,2.86E-05,0.011892711
AT1G35560,NA,1.04778355,4.088720671,27.62498892,1.73E-04,0.026530848
AT1G47710,NA,-1.170818539,5.62140699,33.62854279,7.05E-05,0.018054085
AT1G48360,NA,-1.111569092,4.756741109,24.38013859,2.99E-04,0.034682731
AT1G49630,PREP2,0.950286366,4.418564349,21.63195022,4.94E-04,0.046376876
AT1G49720,ABF1,-0.887757176,6.005473333,27.4298094,1.79E-04,0.027173086
AT1G51820,NA,-3.525438115,0.793216927,23.67698229,3.39E-04,0.037712369
AT1G52290,NA,1.299108102,4.015757658,45.43440885,1.63E-05,0.008697945
AT1G52342,NA,2.431247942,2.646733571,23.21533016,3.68E-04,0.039518059
AT1G56500,NA,0.807060818,6.681929388,29.43173565,1.30E-04,0.022738319
AT1G58080,ATP-PRT1,0.774104288,7.28821581,30.30157899,1.14E-04,0.021609463
AT1G58848,NA,1.598922607,3.372153267,21.66977508,4.91E-04,0.046307187
AT1G60470,GolS4,-2.134429128,4.175700647,25.91467942,2.29E-04,0.030308993
AT1G60890,NA,-0.646106017,5.504940831,20.97312722,5.61E-04,0.049639998
AT1G62430,CDS1,-1.724035649,5.022163315,111.4848467,1.29E-07,4.33E-04
AT1G63800,UBC5,1.496119905,4.623220225,34.8615031,5.95E-05,0.017051924
AT1G64170,CHX16,-1.161792715,4.070758175,26.75286623,2.00E-04,0.02782132
AT1G64740,TUA1,0.86196903,4.625913017,25.98122933,2.27E-04,0.030275335
AT1G64760,NA,-0.899738865,4.230980813,30.59540057,1.09E-04,0.021074509
AT1G65310,XTH17,1.990023936,2.3662122,20.36186406,6.33E-04,0.052204275
AT1G65490,NA,2.063168931,3.245798421,26.15051168,2.21E-04,0.030122294
AT1G65860,FMO GS-OX1,1.218236331,5.811554723,26.99261345,1.92E-04,0.027708832
AT1G66330,NA,1.348402135,6.246630791,73.47531747,1.32E-06,0.001524743
AT1G66350,RGL1,0.995923736,3.560375231,22.62830494,4.10E-04,0.041151257
AT1G67850,NA,-1.097501232,4.879589917,28.8556517,1.42E-04,0.023630618
AT1G68080,NA,1.102200173,3.758088216,42.44769112,2.29E-05,0.010457676
AT1G70280,NA,0.740095968,5.147485956,24.53099619,2.91E-04,0.034445404
AT1G71360,NA,-1.058739675,4.290456778,22.15217069,4.48E-04,0.044306051
AT1G72130,NA,1.032319205,5.265303834,45.14847406,1.69E-05,0.008697945
AT1G72420,NA,1.257163094,3.907246867,28.9542904,1.40E-04,0.023463837
AT1G76590,NA,-1.901184924,4.906689263,24.85768946,2.75E-04,0.03337924
AT1G78230,NA,1.435797441,4.746953629,35.74366554,5.28E-05,0.015822876
AT1G79460,GA2,-0.956776142,4.136451692,33.3150607,7.36E-05,0.018302755
AT1G80530,NA,-0.71247035,5.484285556,21.41939765,5.15E-04,0.047634595
AT2G02820,MYB88,1.001356669,4.34667092,29.42471453,1.30E-04,0.022738319
AT2G03550,NA,1.293722937,4.264256219,30.67750621,1.08E-04,0.021019574
AT2G11000,MAK10,-1.024521836,5.733589373,42.86248093,2.18E-05,0.010197751
AT2G13550,NA,-1.606201014,3.546905115,27.13380664,1.87E-04,0.027668511
AT2G13790,SERK4,0.796796366,4.179548965,20.31663243,6.39E-04,0.052204275
AT2G15970,COR413-PM1,-0.979599363,7.983602531,26.5469574,2.06E-04,0.028390103
AT2G16490,NA,5.320406345,-0.047750565,22.96097838,3.86E-04,0.040178442
AT2G17840,ERD7,-1.514536201,6.23703967,35.36533265,5.56E-05,0.016399224
AT2G19310,NA,1.096854263,4.295062457,29.10534354,1.37E-04,0.023307744
AT2G19830,SNF7.2,-1.059815159,5.643539125,37.45778526,4.22E-05,0.015128385
AT2G20610,SUR1,0.733225176,7.545942844,22.76193667,4.00E-04,0.040553476
AT2G20680,NA,1.150253511,3.734210349,34.68836035,6.09E-05,0.017160836
AT2G20870,NA,-2.271948556,1.043591548,21.33687148,5.23E-04,0.047659534
AT2G21210,NA,1.564608041,4.146207316,20.32206058,6.38E-04,0.052204275
AT2G22450,NA,-0.858030976,4.048864186,27.21697637,1.85E-04,0.027503458
AT2G22500,UCP5,0.97424857,4.895816035,40.45869978,2.90E-05,0.011892711
AT2G22590,NA,-1.935987089,4.092632861,29.91771454,1.21E-04,0.022478246
AT2G23170,GH3.3,1.200695052,3.874329302,29.28689378,1.33E-04,0.022855465
AT2G23340,DEAR3,-0.862292624,4.427874658,24.83567888,2.76E-04,0.03337924
AT2G23600,ACL,2.318387274,5.435677821,71.98920977,1.47E-06,0.001524743
AT2G24390,NA,0.72973591,4.264134912,21.32169642,5.25E-04,0.047659534
AT2G26470,NA,-0.927688103,3.962026611,20.90511464,5.69E-04,0.049646346
AT2G26695,NA,1.380317598,2.942280582,21.01737914,5.57E-04,0.049432172
AT2G27420,NA,2.956400031,4.040300237,32.42413273,8.35E-05,0.019475407
AT2G28900,OEP16-1,-1.30597307,7.578581199,25.06176589,2.65E-04,0.033107664
AT2G32560,NA,0.808806526,5.386826265,28.71965022,1.46E-04,0.023653544
AT2G32870,NA,2.444100935,5.090707117,81.33996048,7.56E-07,0.001265408
AT2G32880,NA,2.925742405,3.865134152,31.78103329,9.17E-05,0.019475407
AT2G32960,NA,1.177283672,4.61142248,28.76737335,1.44E-04,0.023653544
AT2G35830,NA,1.157612819,4.736314057,23.62307021,3.42E-04,0.037717897
AT2G36270,ABI5,-2.048705777,3.16775092,30.30452199,1.14E-04,0.021609463
AT2G39470,PPL2,0.880028862,7.283258223,31.04160319,1.02E-04,0.020716534
AT2G39890,PROT1,0.909453752,5.095563634,26.8766853,1.96E-04,0.02782132
AT2G40435,NA,1.570149349,2.770609182,22.83989324,3.94E-04,0.040178442
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