MetaCyc Pathway ID MetaCyc Pathway Name Moranella Tremblaya Composite VALSYN-PWY L-valine biosynthesis 0 0.5 0.5 PWY-5971 palmitate biosynthesis II (bacteria and plants) 0.007604832977967 0 0.007604832977967 PWY-7227 adenosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis 1 0 1 GLYOXYLATE-BYPASS glyoxylate cycle 0 0.2 0.2 PWY-6823 molybdenum cofactor biosynthesis 0.25 0 0.25 PWY-5723 Rubisco shunt 0.25 0 0.25 PWY0-1264 biotin-carboxyl carrier protein assembly 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5097 L-lysine biosynthesis VI 0.428571428571429 0 0.428571428571429 TRPSYN-PWY L-tryptophan biosynthesis 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-6545 pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis III 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-4984 urea cycle 0.4 0.6 1 PWY-6936 seleno-amino acid biosynthesis 0.2 0.2 0.2 ILEUSYN-PWY L-isoleucine biosynthesis I (from threonine) 0 0.4 0.4 PWY-5659 GDP-mannose biosynthesis 0.25 0 0.25 THIOREDOX-PWY thioredoxin pathway 1 0 1 PWY-621 sucrose degradation III (sucrose invertase) 0.166666666666667 0 0.166666666666667 ARGSYNBSUB-PWY L-arginine biosynthesis II (acetyl cycle) 0.444444444444444 0.333333333333333 0.777777777777778 PWY-702 L-methionine biosynthesis II 0 0.2 0 PWY-6908 thiamine diphosphate biosynthesis IV (eukaryotes) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-2161 folate polyglutamylation 0.2 0 0.2 PWY-7184 pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis I 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-3801 sucrose degradation II (sucrose synthase) 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-2301 myo-inositol biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY-5041 S-adenosyl-L-methionine cycle II 0 0.25 0 PWY-5973 cis-vaccenate biosynthesis 0.2 0 0.2 PWY-5686 UMP biosynthesis I 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5046 2-oxoisovalerate decarboxylation to isobutanoyl-CoA 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7250 [2Fe-2S] iron-sulfur cluster biosynthesis 0.1 0 0.1 PWY0-1021 L-alanine biosynthesis III 2 0 2 PWY-7356 thiamine salvage IV (yeast) 0.142857142857143 0 0.142857142857143 PWY0-501 lipoate biosynthesis and incorporation I 1 0 1 CALVIN-PWY Calvin-Benson-Bassham cycle 0.269230769230769 0 0.269230769230769 PWY-5084 2-oxoglutarate decarboxylation to succinyl-CoA 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5690 TCA cycle II (plants and fungi) 0.25 0.125 0.375 GLUCONEO-PWY gluconeogenesis I 0.428571428571429 0.071428571428572 0.5 PWY-7219 adenosine ribonucleotides de novo biosynthesis 0.25 0 0.25 SERSYN-PWY L-serine biosynthesis 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-1269 CMP-3-deoxy-D-manno-octulosonate biosynthesis 0.25 0 0.25 PWY490-4 L-asparagine biosynthesis III (tRNA-dependent) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5484 glycolysis II (from fructose 6-phosphate) 0.727272727272727 0 0.727272727272727 PWY-7388 octanoyl-[acyl-carrier protein] biosynthesis (mitochondria, yeast) 0.155 0 0.155 PYRUVDEHYD-PWY pyruvate decarboxylation to acetyl CoA 1 0 1 PWY-5989 stearate biosynthesis II (bacteria and plants) 0.25 0 0.25 GLYCOLYSIS glycolysis I (from glucose 6-phosphate) 0.75 0 0.75 CITRULBIO-PWY L-citrulline biosynthesis 0.125 0 0.125 TRNA-CHARGING-PWY tRNA charging 1.02380952380952 0 1.02380952380952 PWY-4702 phytate degradation I 0.071428571428572 0 0.071428571428572 LEUSYN-PWY L-leucine biosynthesis 0 0.333333333333333 0.333333333333333 PWY-7206 pyrimidine deoxyribonucleotides dephosphorylation 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY66-399 gluconeogenesis III 0.615384615384615 0.076923076923077 0.692307692307692 NONOXIPENT-PWY pentose phosphate pathway (non-oxidative branch) 0.1 0 0.1 DETOX1-PWY superoxide radicals degradation 0.333333333333333 0 0.333333333333333 NAGLIPASYN-PWY lipid IVA biosynthesis 1 0 1 PWY-4381 fatty acid biosynthesis initiation I 0.6 0 0.6 GLYSYN-PWY glycine biosynthesis I 1 0 1 PWY-6363 D-myo-inositol (1,4,5)-trisphosphate degradation 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-4983 nitric oxide biosynthesis II (mammals) 0.333333333333333 1 1.33333333333333 PWY-6012 acyl carrier protein metabolism 1 0 1 HOMOSERSYN-PWY L-homoserine biosynthesis 0.333333333333333 0 0.333333333333333 OXIDATIVEPENT-PWY pentose phosphate pathway (oxidative branch) I 0.666666666666667 0 0.666666666666667 PANTO-PWY phosphopantothenate biosynthesis I 0.5 0 0.5 PWY-7187 pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 0.1 0 0.1 PWY-6890 4-amino-2-methyl-5-diphosphomethylpyrimidine biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY-1042 glycolysis IV (plant cytosol) 0.7 0 0.7 PWY-5188 tetrapyrrole biosynthesis I (from glutamate) 0.5 0 0.5 MALATE-ASPARTATE-SHUTTLE-PWY L-aspartate degradation II 0 0.5 0.5 FASYN-ELONG-PWY fatty acid elongation -- saturated 0.171875 0 0.171875 PWY0-662 PRPP biosynthesis I 1 0 1 CYSTSYN-PWY L-cysteine biosynthesis I 0.5 0 0.5 PWY-181 photorespiration 0.125 0 0.125 PWY-7238 sucrose biosynthesis II 0.1 0 0.1 PWY-6799 fatty acid biosynthesis (plant mitochondria) 0.5 0 0.5 GLYCLEAV-PWY glycine cleavage 0.333333333333333 0 0.333333333333333 RIBOSYN2-PWY flavin biosynthesis I (bacteria and plants) 0.222222222222222 0 0.222222222222222 PWY-7226 guanosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis I 1 0 1 CITRULLINE-DEG-PWY L-citrulline degradation 0.5 0 0.5 PWY-622 starch biosynthesis 0.125 0 0.125 PWY-3841 folate transformations II 0.111111111111111 0 0.111111111111111 PWY-6163 chorismate biosynthesis from 3-dehydroquinate 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 PWY-2781 cis-zeatin biosynthesis 1 0 1 PWY-6707 gallate biosynthesis 1 0 1 PWY0-1544 proline to cytochrome bo oxidase electron transfer 1 0 1 PWY0-1567 NADH to cytochrome bo oxidase electron transfer II 1 0 1 PWY0-1329 succinate to cytochrome bo oxidase electron transfer 1 0 1 PWY-6282 palmitoleate biosynthesis I (from (5Z)-dodec-5-enoate) 0.090909090909091 0 0.090909090909091 PWY0-1565 D-lactate to cytochrome bo oxidase electron transfer 1 0 1 PWY0-1335 NADH to cytochrome bo oxidase electron transfer I 1 0 1 PWY0-1275 lipoate biosynthesis and incorporation II 0.5 0 0.5 UDPNAGSYN-PWY UDP-N-acetyl-D-glucosamine biosynthesis I 0.2 0 0.2 PPGPPMET-PWY ppGpp biosynthesis 0.083333333333333 0 0.083333333333333 PWY0-1586 peptidoglycan maturation (meso-diaminopimelate containing) 0.5 0 0.5 FERMENTATION-PWY mixed acid fermentation 0.214285714285714 0.071428571428572 0.285714285714286 PWY-7805 aminomethylphosphonate degradation 0.125 0 0.125 PWY0-1312 acetate formation from acetyl-CoA I 1 0 1 PWY0-901 L-selenocysteine biosynthesis I (bacteria) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-6892 thiazole biosynthesis I (facultative anaerobic bacteria) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 TCA TCA cycle I (prokaryotic) 0.25 0.125 0.375 PWY-5965 fatty acid biosynthesis initiation III 0.8 0 0.8 1CMET2-PWY N10-formyl-tetrahydrofolate biosynthesis 0.125 0 0.125 PWY-5966 fatty acid biosynthesis initiation II 0.357142857142857 0 0.357142857142857 PYRIDOXSYN-PWY pyridoxal 5'-phosphate biosynthesis I 0.666666666666667 0 0.666666666666667 PWY-7222 guanosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 0.25 0 0.25 PWY0-862 (5Z)-dodec-5-enoate biosynthesis I 0.555555555555556 0 0.555555555555556 PWY-6519 8-amino-7-oxononanoate biosynthesis I 0.076923076923077 0 0.076923076923077 DAPLYSINESYN-PWY L-lysine biosynthesis I 0.333333333333333 0.111111111111111 0.444444444444444 PWY-5785 di-trans,poly-cis-undecaprenyl phosphate biosynthesis 1 0 1 PWY-6700 queuosine biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY0-1587 N6-L-threonylcarbamoyladenosine37-modified tRNA biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY0-1479 tRNA processing 0.15 0 0.15 PWY-7220 adenosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 0.25 0 0.25 PWY-6894 thiamine diphosphate biosynthesis I (E. coli) 0.5 0 0.5 HOMOSER-METSYN-PWY L-methionine biosynthesis I 0 0.25 0 PWY0-1561 glycerol-3-phosphate to cytochrome bo oxidase electron transfer 1 0 1 PWY-7544 pyruvate to cytochrome bo oxidase electron transfer 1 0 1 PWY-5189 tetrapyrrole biosynthesis II (from glycine) 0.5 0 0.5 PWY66-398 TCA cycle III (animals) 0.181818181818182 0.090909090909091 0.272727272727273 PWY-7286 7-(3-amino-3-carboxypropyl)-wyosine biosynthesis 0.25 0 0.25 PWY-2201 folate transformations I 0.090909090909091 0 0.090909090909091 PWY-7210 pyrimidine deoxyribonucleotides biosynthesis from CTP 0.2 0 0.2 PWY-5994 palmitate biosynthesis I (animals and fungi) 0.003019323671498 0 0.003019323671498 PWY-6012-1 acyl carrier protein activation 2 0 2 PWY-3661-1 glycine betaine degradation II (mammalian) 0.25 0 0.25 PWY-6281 L-selenocysteine biosynthesis II (archaea and eukaryotes) 0.25 0 0.25 PWY66-373 sucrose degradation V (sucrose α-glucosidase) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5514 UDP-N-acetyl-D-galactosamine biosynthesis II 0.125 0 0.125 PWY-6728 methylaspartate cycle 0.125 0.0625 0.1875 PWY-6871 3-methylbutanol biosynthesis (engineered) 0 0.333333333333333 0.333333333333333 PWY-6876 isopropanol biosynthesis (engineered) 0.2 0 0.2 PWY-6992 1,5-anhydrofructose degradation 0.2 0 0.2 RUMP-PWY formaldehyde oxidation I 0.5 0 0.5 P122-PWY heterolactic fermentation 0.473684210526316 0 0.473684210526316 PWY-6891 thiazole biosynthesis II (aerobic bacteria) 0.4 0 0.4 PWY-6167 flavin biosynthesis II (archaea) 0.2 0 0.2 PWY-6168 flavin biosynthesis III (fungi) 0.222222222222222 0 0.222222222222222 PWY-6893 thiamine diphosphate biosynthesis II (Bacillus) 0.5 0 0.5 PWY-7674 CMP-8-amino-3,8-dideoxy-D-manno-octulosonate biosynthesis 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-6829 tRNA methylation (yeast) 0.0625 0 0.0625 PWY-6907 thiamine diphosphate biosynthesis III (Staphylococcus) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7800 Ac/N-end rule pathway 0.006944444444444 0 0.006944444444444 PWY-7198 pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis IV 0.222222222222222 0 0.222222222222222 PWY-7799 Arg/N-end rule pathway (eukaryotic) 0.090909090909091 0 0.090909090909091 PWY-5103 L-isoleucine biosynthesis III 0 0.4 0.4 PWY-5101 L-isoleucine biosynthesis II 0 0.142857142857143 0.142857142857143 PWY-5104 L-isoleucine biosynthesis IV 0 0.166666666666667 0.166666666666667 QUINATEDEG-PWY quinate degradation I 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-6416 quinate degradation II 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7115 C4 photosynthetic carbon assimilation cycle, NAD-ME type 0 0.1 0.1 PWY-1622 formaldehyde assimilation I (serine pathway) 0.25 0.083333333333333 0.333333333333333 P185-PWY formaldehyde assimilation III (dihydroxyacetone cycle) 0.375 0 0.375 PWY-1861 formaldehyde assimilation II (RuMP Cycle) 0.277777777777778 0 0.277777777777778 PWY-6308 L-cysteine biosynthesis II (tRNA-dependent) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 P108-PWY pyruvate fermentation to propanoate I 0 0.142857142857143 0.142857142857143 PWY-5 canavanine biosynthesis 0.333333333333333 1 1.33333333333333 PWY-5392 reductive TCA cycle II 0.3 0.1 0.4 P3-PWY gallate degradation III (anaerobic) 0.166666666666667 0 0.166666666666667 P42-PWY incomplete reductive TCA cycle 0.571428571428571 0.142857142857143 0.714285714285714 PWY-6637 sulfolactate degradation II 0.25 0 0.25 P23-PWY reductive TCA cycle I 0.3 0.1 0.4 PWY-6587 pyruvate fermentation to ethanol III 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-1281 sulfoacetaldehyde degradation I 0.5 0 0.5 P21-PWY pentose phosphate pathway (partial) 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-5958 acridone alkaloid biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY-4981 L-proline biosynthesis II (from arginine) 0.2 0 0.2 PWY-2942 L-lysine biosynthesis III 0.428571428571429 0 0.428571428571429 PWY-2941 L-lysine biosynthesis II 0.375 0 0.375 PWY-6654 phosphopantothenate biosynthesis III (archaebacteria) 0.25 0 0.25 PWY-7357 thiamine formation from pyrithiamine and oxythiamine (yeast) 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-7268 NAD/NADP-NADH/NADPH cytosolic interconversion (yeast) 0.2 0 0.2 PWY-7382 lipoate biosynthesis and incorporation (yeast) 0.190476190476191 0 0.190476190476191 PWY-6987 lipoate biosynthesis and incorporation III (Bacillus) 0.666666666666667 0 0.666666666666667 PWY-7153 grixazone biosynthesis 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY-6683 sulfate reduction III (assimilatory) 0.666666666666667 0 0.666666666666667 PWY-6661 4-hydroxy-2(1H)-quinolone biosynthesis 1 0 1 PWY-6660 2-heptyl-3-hydroxy-4(1H)-quinolone biosynthesis 0.5 0 0.5 PWY-7347 sucrose biosynthesis III 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7400 L-arginine biosynthesis IV (archaebacteria) 0.444444444444444 0.333333333333333 0.777777777777778 PWY-5154 L-arginine biosynthesis III (via N-acetyl-L-citrulline) 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 P341-PWY glycolysis V (Pyrococcus) 0.555555555555556 0 0.555555555555556 ANAGLYCOLYSIS-PWY glycolysis III (from glucose) 0.818181818181818 0 0.818181818181818 PWY-7790 UMP biosynthesis II 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7791 UMP biosynthesis III 0.333333333333333 0 0.333333333333333 P105-PWY TCA cycle IV (2-oxoglutarate decarboxylase) 0 0.1 0.1 PWY-6969 TCA cycle V (2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase) 0.181818181818182 0.090909090909091 0.272727272727273 PWY-5913 partial TCA cycle (obligate autotrophs) 0.2 0.1 0.3 PWY-5509 adenosylcobalamin biosynthesis from cobyrinate a,c-diamide I 0.125 0 0.125 PWY-5508 adenosylcobalamin biosynthesis from cobyrinate a,c-diamide II 0.111111111111111 0 0.111111111111111 PWY-5482 pyruvate fermentation to acetate II 0.666666666666667 0 0.666666666666667 P101-PWY ectoine biosynthesis 0.2 0 0.2 PWY-6562 norspermidine biosynthesis 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWY3O-355 stearate biosynthesis III (fungi) 0.083333333333333 0 0.083333333333333 PWY-5493 reductive monocarboxylic acid cycle 0.5 0 0.5 PWY-6679 jadomycin biosynthesis 0.4 0 0.4 PWY-7274 D-cycloserine biosynthesis 0.166666666666667 0 0.166666666666667 PWYG-321 mycolate biosynthesis 0.002923976608187 0 0.002923976608187 PWY-3661 glycine betaine degradation I 0.2 0 0.2 PWY-7663 gondoate biosynthesis (anaerobic) 0.4 0 0.4 PWY-7858 (5Z)-dodec-5-enoate biosynthesis II 0.285714285714286 0 0.285714285714286 PWY-5384 sucrose degradation IV (sucrose phosphorylase) 0.25 0 0.25 PWY-6583 pyruvate fermentation to butanol I 0.125 0 0.125 PWY-7385 1,3-propanediol biosynthesis (engineered) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7807 glyphosate degradation III 0.142857142857143 0 0.142857142857143 P164-PWY purine nucleobases degradation I (anaerobic) 0.076923076923077 0 0.076923076923077 PWY-5497 purine nucleobases degradation II (anaerobic) 0.25 0 0.25 PWY-7383 anaerobic energy metabolism (invertebrates, cytosol) 0.142857142857143 0.142857142857143 0.285714285714286 P161-PWY acetylene degradation 0.4 0 0.4 P124-PWY Bifidobacterium shunt 0.4375 0 0.4375 PWY-7285 methylwyosine biosynthesis 0.25 0 0.25 P163-PWY L-lysine fermentation to acetate and butanoate 0.2 0 0.2 PWY-6559 spermidine biosynthesis II 0.25 0 0.25 PWY-6588 pyruvate fermentation to acetone 0.2 0 0.2 CENTFERM-PWY pyruvate fermentation to butanoate 0.142857142857143 0 0.142857142857143 PWY-7111 pyruvate fermentation to isobutanol (engineered) 0 0.4 0.4 PWY-6863 pyruvate fermentation to hexanol (engineered) 0.090909090909091 0 0.090909090909091 PWY-6854 ethylene biosynthesis III (microbes) 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-5054 sorbitol biosynthesis I 0.333333333333333 0 0.333333333333333 METH-ACETATE-PWY methanogenesis from acetate 0.333333333333333 0 0.333333333333333 PWY-7664 oleate biosynthesis IV (anaerobic) 0.192982456140351 0 0.192982456140351 PWY-2221 Entner-Doudoroff pathway III (semi-phosphorylative) 0.153846153846154 0 0.153846153846154 NPGLUCAT-PWY Entner-Doudoroff pathway II (non-phosphorylative) 0.272727272727273 0 0.272727272727273 PWY-5750 itaconate biosynthesis 0.25 0 0.25