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geneontology_Biological_Process GO:1902850 microtubule cytoskeleton organization involved in mitosis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902850 112 60 22.1240019714145 2.71198674080411 1.33226762955019e-15 2.15484772882389e-13 891;991;1058;1062;1104;1213;1778;2316;3192;3796;3832;3833;3837;3925;4605;4751;5116;5347;5901;6491;6790;6867;6993;7175;7272;7283;7756;8243;8480;8481;8556;9055;9126;9181;9212;9493;9700;10274;10403;10426;10460;10735;11200;22974;23636;24137;25978;27175;29072;29127;29899;51203;54820;55125;57405;79598;83540;114327;128866;284403 MYBL2;CDC20;TPX2;KIFC1;NUSAP1;KIF4A;PLK1;CCNB1;NUF2;NEK2;PRC1;AURKB;CENPA;NDC80;KIF23;TTK;KIF11;SPC25;STMN1;TACC3;RACGAP1;AURKA;ESPL1;WDR62;CENPE;STIL;ARHGEF2;TUBG1;GPSM2;RCC1;NDE1;SMC1A;SMC3;KIF2A;CHEK2;KPNB1;NUP62;RAN;FLNA;TPR;TUBG2;CEP192;STAG1;ZNF207;OFD1;RAE1;HNRNPU;EFHC1;TUBGCP3;PCNT;CEP97;SETD2;CHMP4B;CLTC;DYNLT1;CDC14A;CHMP2B;STAG2;DYNC1H1;TACC1 geneontology_Biological_Process GO:0090068 positive regulation of cell cycle process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090068 228 97 45.0381468703795 2.15372982105964 1.55431223447522e-15 2.44415598871228e-13 351;581;672;835;891;898;983;990;993;994;995;1017;1019;1663;1778;1820;1869;1874;1894;2033;2146;2237;2260;2810;3192;3276;4085;4582;4849;5111;5469;5586;5885;5889;6421;6604;6659;6790;7015;7027;7029;7039;7040;7161;7175;7517;7832;8317;8318;8450;8851;9212;9401;9493;9555;9585;9700;9787;9928;10403;10498;10615;10733;11065;11113;11200;23236;23476;23636;25836;25904;25942;25946;26271;27085;29127;29883;29899;51143;51203;51433;51512;51514;55023;55795;55835;55920;57472;57504;79915;80174;81620;84440;113130;115426;144455;252983 UBE2C;CDK1;NUSAP1;E2F1;CDC6;CCNB1;AURKB;ECT2;CDT1;DTL;CDCA5;CDC45;CCNE1;GTSE1;DLGAP5;NDC80;KIF23;SPAG5;RACGAP1;SFN;CDC25C;AURKA;EZH2;MAD2L1;FEN1;ESPL1;RECQL4;CDC25A;CDC7;CDC25B;CDK2;PCNA;KIF14;BRCA1;PLK4;FBXO5;SOX4;RCC2;TFDP1;DDX11;ARID3A;GPSM2;CDK4;KIF20B;CIT;CASP2;ATAD5;XRCC3;PLCB1;CENPJ;E2F7;DBF4B;MUC1;SFPQ;CHEK2;NUP62;RAD21;H2AFY;PHIP;RAB11FIP4;CNOT6;TPR;RAD51C;TP73;TGFA;TGFB1;TERT;PRMT1;CNOT3;HNRNPU;MTA3;ZNF385A;BTG2;EP300;MTBP;UHRF2;APP;CNOT10;PCID2;BAX;CDK5R1;MED1;STXBP4;SIN3A;BRD4;NIPBL;CUL4B;ANAPC5;E2F4;FGFR1;DYNC1H1;SMARCD3;CARM1;PKN2;CNOT7;DYNC1LI1;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0007052 mitotic spindle organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007052 93 53 18.3708230655495 2.88500955079089 1.99840144432528e-15 3.05755420981768e-13 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25;302;402;578;581;672;822;841;891;908;961;1663;1736;1778;1786;1789;1869;2150;2237;2242;2316;2648;2810;2885;3055;3091;3099;3178;3181;3184;3192;3383;3720;3799;3936;3976;3984;4088;4216;4318;4582;4751;5027;5058;5217;5305;5329;5341;5366;5562;5570;5594;5595;5829;5880;5885;6281;6421;6598;6624;6714;6721;6790;6857;6871;6950;7016;7027;7029;7039;7040;7046;7161;7175;7248;7334;7408;7422;7429;7456;7520;7533;7534;7855;8396;8440;8473;8726;8743;8851;8936;9037;9212;9270;9520;9530;9555;9696;9700;9733;9787;9810;9869;10018;10055;10059;10075;10094;10096;10097;10109;10152;10155;10270;10576;10615;10694;10733;10787;10971;11065;11135;11151;22823;22919;22948;22976;23028;23075;23221;23236;23476;23580;23636;25836;25942;26147;26354;29108;29899;50807;51199;51203;51433;55023;55183;55329;55558;55704;55737;55835;55971;57472;57602;59341;65057;79734;81620;90427;113130;147179;255967;285590 UBE2C;NUSAP1;E2F1;CCNB1;NEK2;AURKB;CDT1;CDCA5;DLGAP5;SPAG5;SFN;AURKA;FEN1;DNMT1;ESPL1;VIL1;KCTD17;PHF19;BRCA1;MMP9;NCK2;PLK4;CAPG;TFDP1;DDX11;WASF1;MNS1;GPSM2;PFN2;BMF;SRC;MAPRE1;BAK1;PYCARD;DNMT3B;PLCB1;CENPJ;PKIB;YWHAQ;LIMK1;MTF2;SAE1;MUC1;HK2;SFPQ;LIF;HIF1A;NUP62;F2RL1;RAD21;CCDC88A;PLAUR;SYT1;PLEK;ASAP1;H2AFY;FLNA;PHIP;CNOT6;TPR;TP73;HNRNPA1;ICAM1;VASP;DKC1;NPEPPS;KAT2A;PAK1;BCL2L11;TRIM28;CCT5;DNM1L;VEGFA;SART3;YWHAZ;RIF1;TGFA;TGFB1;PLXNA3;ABL1;FZD5;S100A10;YWHAH;ABI2;CCT2;SETDB1;KDM1A;PMAIP1;RAC2;HNRNPA2B1;HNRNPU;CCT6A;WIPF2;HNRNPD;NCKAP1;MAP3K4;SMARCB1;ACTR2;SH3PXD2B;PIP4K2A;SWAP70;CASP8;NIN;FSCN1;ACTR3;ACD;MAPK1;FES;PAN3;BAX;CDK5R1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;ANXA2;TCP1;KIF5B;CDC42EP4;LCP1;GRB2;MAPK3;HUWE1;SIN3A;HCK;PIP4K2B;BAIAP2L1;ITGB1BP1;TRPV4;OGT;CCT8;BRD4;GNL3;EED;NIPBL;RNF40;VPS35;UBE2N;TESK1;USP36;XRCC5;ANAPC5;TNFSF10;TGFBR1;JARID2;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;PRKAA1;BAG4;PAXIP1;DYNC1H1;ARPC2;CROCC;PXN;AKAP8;SREBF2;P2RX7;RHOBTB2;ARL2;SEMA5A;TADA2A;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0000077 DNA damage checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000077 121 59 23.9018235584032 2.46843090678148 5.55777646127353e-13 5.42458147366715e-11 581;641;672;835;891;983;995;1017;1111;1386;1407;1820;1869;1874;2033;2810;2956;3014;3276;4436;4582;4849;5111;5347;5591;5810;5883;6118;6659;6790;7027;7029;7158;7832;8563;8682;9656;9984;10116;10498;11200;25896;25904;25946;29883;51322;51512;51514;54962;55159;57472;57551;57646;63967;79968;83990;84444;144455;146956 CDK1;E2F1;PLK1;CCNB1;DTL;GTSE1;SFN;CDC25C;WDR76;AURKA;H2AFX;EME1;CDK2;PCNA;CHEK1;BRCA1;SOX4;MSH2;TFDP1;BLM;CLSPN;ARID3A;CASP2;BRIP1;MDC1;RFWD3;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;MSH6;TIPIN;DOT1L;CNOT6;RAD1;RAD9A;PRMT1;THOC1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;PEA15;EP300;CRY1;TP53BP1;CNOT10;INTS7;BAX;TAOK1;THOC5;ATF2;WAC;E2F4;RPA2;USP28;CARM1;CNOT7;FEM1B;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0032200 telomere organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032200 128 61 25.2845736816166 2.41253820484032 8.11573031000989e-13 7.78697445507898e-11 142;641;675;898;908;1736;1763;2237;2547;3178;3181;3184;3192;4216;4751;5111;5394;5422;5424;5557;5558;5570;5591;5594;5595;5888;5889;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;6714;6950;7015;7486;7515;7517;7520;9134;9156;9212;9401;9937;10576;10694;10714;22948;23049;23381;23649;26354;55183;55226;64421;64858;65057;84444;167227 NEK2;AURKB;CCNE1;EXO1;RFC4;RAD51;FEN1;RECQL4;PCNA;PRIM1;POLD1;BLM;RFC3;POLA1;RFC5;SRC;POLA2;DNA2;POLD3;XRCC3;CCNE2;PKIB;PRIM2;PRKDC;DCLRE1B;RFC2;DOT1L;RAD51C;RPA1;HNRNPA1;DKC1;CCT5;RIF1;TERT;XRCC1;CCT2;HNRNPA2B1;PARP1;BRCA2;HNRNPU;CCT6A;HNRNPD;DCLRE1C;MAP3K4;ACD;MAPK1;WRN;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;GNL3;XRCC5;DCP2;RPA2;EXOSC10;RPA3;SMG1;DCLRE1A;XRCC6;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0000723 telomere maintenance http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000723 125 60 24.6919664859537 2.42994011976048 8.43769498715119e-13 7.96096522037715e-11 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nuclear division http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007088 150 67 29.6303597831444 2.26119427811045 2.73758793412071e-12 2.31305750672498e-10 699;701;858;890;891;898;899;990;991;995;996;1062;1063;1104;1111;3192;3832;4085;4288;4751;5347;5885;6790;7039;7040;7175;7272;7517;7756;8243;8556;8697;9088;9126;9133;9134;9184;9212;9232;9319;9555;9585;9700;9735;9787;10274;10403;10460;10735;11065;23636;25836;25978;26271;27085;51143;51203;51433;51451;54443;55023;55795;79598;81620;84687;113130;128866 CDC20;UBE2C;NUSAP1;CDC6;CCNB2;PLK1;CCNB1;ANLN;CCNA2;MKI67;PTTG1;NEK2;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;CDCA5;CCNE1;DLGAP5;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;KIF11;TACC3;CDC25C;AURKA;KNTC1;MAD2L1;PKMYT1;ESPL1;CCNF;CENPE;CHEK1;FBXO5;KIF20B;XRCC3;CCNE2;RCC1;SMC1A;SMC3;NUP62;RAD21;H2AFY;PHIP;TPR;STAG1;ZNF207;TGFA;TGFB1;PPP1R9B;CDC27;HNRNPU;MTBP;CAV2;PCID2;BUB3;CEP97;NIPBL;CHMP4B;ANAPC5;CDC14A;CHMP2B;STAG2;CDC23;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0006405 RNA export from nucleus 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MCM2;ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CHAF1B;HMGB2;CDKN2A;HELLS;H2AFX;CENPH;CENPK;HMGA1;CHAF1A;CENPO;CENPQ;NASP;HIST3H2A;NAP1L1;SMARCD1;SUV39H2;RBBP4;SOX9;CHD3;SMARCC2;H2AFY;SMARCC1;TPR;SET;H1FX;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SUPT16H;SART3;CENPN;HP1BP3;HAT1;SMARCB1;ANP32B;SMARCA4;ARID1A;BAZ1B;CABIN1;PBRM1;SMARCE1;MTA2;HIST1H2BO;SMARCA5;RUVBL1;NAP1L4;MAP1S;TLK2;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0051783 regulation of nuclear division http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051783 166 70 32.7909314933465 2.1347365509944 2.41975328663102e-11 1.90253102161364e-09 699;701;858;890;891;898;899;990;991;995;996;1062;1063;1104;1111;3192;3832;3976;4085;4288;4751;5347;5810;5885;6790;7039;7040;7175;7272;7517;7756;8243;8556;8697;9088;9126;9133;9134;9184;9212;9232;9319;9555;9585;9700;9735;9787;10274;10403;10460;10735;11065;23236;23636;25836;25978;26271;27085;51143;51203;51433;51451;54443;55023;55795;79598;81620;84687;113130;128866 CDC20;UBE2C;NUSAP1;CDC6;CCNB2;PLK1;CCNB1;ANLN;CCNA2;MKI67;PTTG1;NEK2;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;CDCA5;CCNE1;DLGAP5;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;KIF11;TACC3;CDC25C;AURKA;KNTC1;MAD2L1;PKMYT1;ESPL1;CCNF;CENPE;CHEK1;FBXO5;KIF20B;XRCC3;CCNE2;RCC1;PLCB1;SMC1A;SMC3;LIF;NUP62;RAD21;H2AFY;PHIP;TPR;RAD1;STAG1;ZNF207;TGFA;TGFB1;PPP1R9B;CDC27;HNRNPU;MTBP;CAV2;PCID2;BUB3;CEP97;NIPBL;CHMP4B;ANAPC5;CDC14A;CHMP2B;STAG2;CDC23;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0034728 nucleosome organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0034728 105 51 20.7412518482011 2.45886797832906 2.51154652630703e-11 1.9476527240307e-09 1058;3014;3148;3159;4171;4673;4676;4678;5757;5928;5931;6418;6597;6598;6599;6601;6602;6604;6605;6662;6944;8208;8289;8348;8467;8520;8607;8971;9025;9555;9733;10036;10541;10847;11198;11339;23421;23523;29072;50809;54107;55166;55193;55355;55723;55839;64105;64946;79172;81611;92815 MCM2;ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CHAF1B;HMGB2;H2AFX;CENPH;CENPK;HMGA1;CHAF1A;CENPO;CENPQ;NASP;HIST3H2A;NAP1L1;SMARCD1;ANP32E;RBBP4;SOX9;SMARCC2;H2AFY;SMARCC1;SET;H1FX;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SUPT16H;PTMA;SART3;CENPN;HP1BP3;HAT1;SRCAP;VPS72;SMARCB1;ANP32B;SMARCA4;ARID1A;RNF8;CABIN1;PBRM1;SETD2;SMARCE1;HIST1H2BO;SMARCA5;RUVBL1;NAP1L4;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0051304 chromosome separation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051304 73 40 14.4201084277969 2.77390424630192 3.01387803602893e-11 2.30561669756213e-09 641;699;701;891;990;991;996;1062;1063;1457;4085;5347;5885;7153;7155;7175;7272;7517;7756;8697;9184;9212;9232;9319;9700;9787;9918;10403;10460;23310;23397;26271;29781;51143;51433;51451;55795;80010;81620;146956 TOP2A;CDC20;CDC6;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NCAPH;DLGAP5;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;TACC3;NCAPD2;MAD2L1;ESPL1;EME1;CENPE;FBXO5;BLM;XRCC3;NCAPD3;RAD21;RMI1;NCAPH2;TPR;ZNF207;CDC27;TOP2B;CSNK2A1;PCID2;BUB3;ANAPC5;CDC23;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0051168 nuclear export http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051168 157 67 31.0131099063578 2.16037669883164 3.42017525412075e-11 2.58154828181034e-09 580;1434;1660;2810;3178;3181;3267;3921;4116;4686;4928;5036;5433;5901;5905;6741;7040;7175;7248;7514;7884;8480;8563;9631;9688;9775;9877;9883;9972;9984;10541;10657;10762;10892;10921;11052;11260;11338;22794;22916;23039;23049;23165;23214;23225;23279;23381;23511;23636;29072;29107;29890;51512;51692;54535;55795;57122;57187;57510;64328;65109;79023;79902;81608;84321;84445;348995 GTSE1;SFN;NUP210;BARD1;NUP205;NUP107;NUP188;NUP85;SLBP;NUP62;CPSF6;NUP43;RAN;NUP155;UPF3B;CCHCR1;CSE1L;TPR;DHX9;NUP37;HNRNPA1;XPO1;TGFB1;NUP160;THOC2;XPO7;NCBP2;XPOT;NUP153;KHDRBS1;XPO5;LZTS2;U2AF2;THOC1;RNPS1;RAE1;HNRNPA2B1;AGFG1;EIF4A3;ANP32B;NUP50;PA2G4;SSB;NUP93;PCID2;NCBP1;RANGAP1;TSC1;CASC3;SMG5;NXT1;POLR2D;THOC5;SETD2;RPSA;RBM15B;POM121;MALT1;CPSF3;MAGOH;ZC3H11A;NUP98;THOC3;SMG1;XPO6;FIP1L1;XPO4 geneontology_Biological_Process GO:0045931 positive regulation of mitotic cell cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045931 131 59 25.8771808772795 2.28000106656915 3.64523966567276e-11 2.71522391412809e-09 25;351;440;675;891;898;983;990;993;994;995;1019;1978;2260;3169;3192;4085;4212;5578;5586;5889;6198;6604;6790;7015;7039;7040;7175;7517;8317;8318;8450;8877;9401;9555;9585;9700;9787;10403;11065;23236;23326;23476;23636;25836;25942;26271;27085;51143;51203;51433;51514;55023;55795;55920;57504;80174;81620;113130 UBE2C;CDK1;NUSAP1;CDC6;CCNB1;CDT1;DTL;CDCA5;CDC45;CCNE1;DLGAP5;NDC80;CDC25C;SPHK1;AURKA;MAD2L1;ESPL1;RECQL4;CDC25A;CDC7;CDC25B;FBXO5;RCC2;CDK4;KIF20B;XRCC3;ASNS;PLCB1;DBF4B;NUP62;H2AFY;PHIP;TPR;RAD51C;EIF4EBP1;TGFA;TGFB1;ABL1;TERT;BRCA2;HNRNPU;MTA3;MTBP;APP;PCID2;RPS6KB1;FOXA1;SIN3A;PRKCA;BRD4;NIPBL;CUL4B;ANAPC5;USP22;FGFR1;SMARCD3;PKN2;DYNC1LI1;MEIS2 geneontology_Biological_Process GO:0044774 mitotic DNA integrity checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0044774 88 45 17.3831444061114 2.5887146162221 4.10560474506383e-11 3.01841928075407e-09 581;641;835;891;983;990;995;1017;1386;1820;1869;1874;2033;2810;2956;3276;4436;4582;4849;5111;5591;5883;6118;6659;6790;7027;7029;7153;7155;7832;9656;10498;11073;11200;25904;25946;29883;51512;54962;55159;57472;57551;63967;144455;146956 TOP2A;CDK1;E2F1;CDC6;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;EME1;CDK2;PCNA;SOX4;TOPBP1;MSH2;TFDP1;BLM;CLSPN;ARID3A;CASP2;MDC1;RFWD3;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;MSH6;TIPIN;CNOT6;RAD9A;PRMT1;TOP2B;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;TAOK1;ATF2;E2F4;RPA2;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0006323 DNA packaging http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006323 122 56 24.0993592902908 2.32371322927915 4.58031390593305e-11 3.32425090019064e-09 891;983;1029;1058;3014;3070;3148;3159;4171;4673;4676;4678;5928;5931;6418;6662;6732;7153;7175;8208;8348;8467;8520;8607;8971;9025;9555;9733;9918;10036;10051;10270;10541;10592;11339;22985;23310;23397;23421;23523;25836;29781;50809;51203;54107;54892;55166;55355;55723;55839;55870;64105;64151;64946;79172;113130 TOP2A;MCM2;CDK1;NUSAP1;ASF1B;CCNB1;HJURP;NCAPG;CDCA5;CENPA;NCAPH;OIP5;CHAF1B;HMGB2;SMC4;NCAPD2;CDKN2A;HELLS;H2AFX;CENPH;NCAPG2;CENPK;HMGA1;CHAF1A;SMC2;CENPO;CENPQ;NASP;NAP1L1;NCAPD3;RBBP4;SOX9;H2AFY;NCAPH2;TPR;SET;H1FX;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SART3;CENPN;HP1BP3;HAT1;SRPK1;ACIN1;ASH1L;ANP32B;RNF8;CABIN1;NIPBL;HIST1H2BO;SMARCA5;RUVBL1;NAP1L4;AKAP8 geneontology_Biological_Process GO:0051225 spindle assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051225 83 43 16.3954657466732 2.62267633407883 6.40876240964872e-11 4.59240556974954e-09 991;1104;1453;1778;2316;3192;3796;3832;3833;3837;4605;4751;5347;6790;7175;7756;8243;8481;8556;9126;9212;9493;10274;10426;10615;10735;11200;22919;22974;24137;25978;26054;26271;29127;29899;55125;55142;79598;84445;115106;128866;203068;259266 MYBL2;CDC20;TPX2;KIFC1;KIF4A;PLK1;NEK2;AURKB;KIF23;ASPM;KIF11;SPAG5;RACGAP1;AURKA;FBXO5;GPSM2;MAPRE1;HAUS1;RCC1;TUBB;SMC1A;SMC3;KIF2A;CHEK2;KPNB1;FLNA;TPR;CEP192;STAG1;ZNF207;OFD1;LZTS2;HNRNPU;CSNK1D;HAUS2;TUBGCP3;CEP97;CHMP4B;CDC14A;CHMP2B;SENP6;STAG2;DYNC1H1 geneontology_Biological_Process GO:2001251 negative regulation of chromosome organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2001251 117 54 23.1116806308526 2.33648088438508 7.84607934178894e-11 5.5520818942334e-09 142;672;699;701;891;991;1063;1786;1789;3159;3178;3192;3720;4085;4171;4302;5347;5394;5885;6418;6598;6688;6714;7153;7175;7272;7515;7517;7520;7756;8971;9184;9212;9232;9319;9555;9682;9700;10403;22823;25942;26271;29028;51143;51366;51451;54880;55170;55226;55795;55818;65057;81620;167227 TOP2A;CDC20;MCM2;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;DNMT1;ESPL1;BRCA1;HMGA1;ATAD2;FBXO5;SRC;XRCC3;DNMT3B;MTF2;RAD21;BCOR;PRMT6;H2AFY;TPR;SET;H1FX;HNRNPA1;ZNF207;XRCC1;PARP1;HNRNPU;SMARCB1;MLLT6;SPI1;ACD;PCID2;BUB3;SIN3A;XRCC5;DCP2;JARID2;UBR5;EXOSC10;KDM3A;KDM4A;NAT10;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0033045 regulation of sister chromatid segregation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033045 67 37 13.2348940364712 2.79564006315727 1.22613252884207e-10 8.56930400712959e-09 699;701;891;990;991;996;1062;1063;1663;2237;3192;4085;5347;5885;6421;7175;7272;7517;7756;8697;9184;9212;9232;9319;9555;9700;9787;10403;10460;25836;26271;51143;51433;51451;55795;81620;113130 CDC20;CDC6;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;CDCA5;DLGAP5;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;TACC3;MAD2L1;FEN1;ESPL1;CENPE;FBXO5;DDX11;XRCC3;SFPQ;RAD21;H2AFY;TPR;ZNF207;CDC27;HNRNPU;PCID2;BUB3;NIPBL;ANAPC5;CDC23;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0051054 positive regulation of DNA metabolic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051054 178 72 35.161360275998 2.04770234811276 1.28061561355253e-10 8.84093291258641e-09 142;581;641;672;908;983;1017;1660;1663;1736;1763;1786;2140;2187;2260;2305;2956;3014;3178;3181;3184;4216;4436;4751;4862;4931;5111;5570;5580;5594;5595;5888;5982;5983;5984;5985;6714;6950;7037;7040;7158;7292;7334;7374;7486;7515;7520;8317;8914;9025;9212;9401;9869;10097;10155;10576;10694;10926;22948;22976;23529;26354;51010;55183;63922;65057;79075;79915;80174;81620;144455;165918 FOXM1;CDK1;NEK2;AURKB;CDT1;RFC4;RAD51;DNMT1;RECQL4;CDC7;H2AFX;CDK2;PCNA;BRCA1;TIMELESS;MSH2;BLM;CHTF18;RFC3;DDX11;PRKCD;RFC5;SRC;DSCC1;DNA2;ATAD5;DBF4;PKIB;E2F7;TFRC;DBF4B;MSH6;NPAS2;RFC2;UNG;DHX9;HNRNPA1;DKC1;TRIM28;CCT5;RIF1;TGFB1;TNFSF4;XRCC1;CLCF1;CCT2;SETDB1;HNRNPA2B1;PARP1;CCT6A;HNRNPD;MAP3K4;ACTR2;EXOSC3;RNF8;ACD;MAPK1;WRN;TP53BP1;RNF168;BAX;NVL;TCP1;MAPK3;CCT8;GNL3;FANCB;UBE2N;XRCC5;EYA3;FGFR1;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:1903046 meiotic cell cycle process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1903046 109 51 21.5313947757516 2.36863429105093 1.42057254848282e-10 9.68898939392923e-09 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CDK1;PLK1;AURKB;BUB1B;CDT1;CDCA5;CENPA;NDC80;TTK;EZH2;MCM8;RCC2;MSH2;CENPQ;RAD21;H2AFY;RPA1;DKC1;CCT5;TERT;CCT2;BRCA2;CCT6A;MTBP;ACD;BUB3;TCP1;SETD2;CCT8;GNL3;NIPBL;XRCC5;RPA2;CARM1 geneontology_Biological_Process GO:0051493 regulation of cytoskeleton organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051493 408 133 80.5945786101528 1.65023506907753 2.71464850598591e-10 1.72669945981868e-08 25;120;402;672;822;827;829;899;961;1111;1213;1778;1894;1946;2011;2150;2242;2316;2648;2885;3055;3192;3383;3832;3925;3984;4088;4591;4703;4751;5027;5058;5217;5341;5347;5562;5580;5594;5595;5756;5829;6093;6279;6280;6281;6491;6624;6790;6993;7016;7040;7046;7114;7175;7226;7248;7408;7429;7430;7456;7514;7517;8045;8195;8243;8440;8480;8851;8936;9037;9113;9126;9168;9181;9270;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10163;10274;10460;10615;10733;10735;10787;11113;11135;11151;11190;22919;22974;23075;23221;23299;23433;23580;23607;23616;23636;25978;26054;26586;26973;29108;29899;51199;51474;55114;55558;55607;55704;55835;55971;57216;57551;58526;59341;64857;79598;81930;85464;93663;128272;128866;136319;147179;220134;221150;285590;348235 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CCNB1;NEK2;AURKB;CDT1;DLGAP5;FEN1;DNMT1;ESPL1;PHF19;BRCA1;DDX11;DNMT3B;PKIB;MTF2;MUC1;SFPQ;LIF;RAD21;H2AFY;TPR;HNRNPA1;DKC1;KAT2A;TRIM28;CCT5;VEGFA;SART3;RIF1;TGFB1;CCT2;SETDB1;KDM1A;HNRNPA2B1;HNRNPU;CCT6A;HNRNPD;MAP3K4;SMARCB1;ACD;MAPK1;TCP1;MAPK3;SIN3A;OGT;CCT8;BRD4;GNL3;EED;NIPBL;RNF40;UBE2N;XRCC5;ANAPC5;JARID2;PAXIP1;AKAP8;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0040029 regulation of gene expression, epigenetic http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0040029 211 78 41.6800394282898 1.87139938133212 3.29470750681793e-09 1.74311581271928e-07 672;1111;1660;1786;1788;1789;2033;2146;2648;3065;3066;3070;3159;3181;3192;3428;3720;4088;4686;5394;5431;5433;5460;5901;5928;5931;5936;6602;6688;6839;6908;6996;7015;7040;7703;7913;8289;8318;8467;8493;8520;8575;8726;8971;9014;9031;9555;9612;9869;9931;10155;10336;10849;10933;11146;11176;22823;23369;23451;23512;25942;26147;29028;29883;29890;51593;54107;54487;55183;56339;57472;57492;57510;57673;58487;63925;84444;121536 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geneontology_Biological_Process GO:1902400 intracellular signal transduction involved in G1 DNA damage checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902400 51 29 10.0743223262691 2.87860553402998 5.03720820610454e-09 2.43139702100695e-07 581;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;5591;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0051169 nuclear transport http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051169 299 101 59.0631838344012 1.71003311103545 5.06809483269421e-09 2.43139702100695e-07 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regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010971 24 18 4.7408575653031 3.79678143712575 7.74836195205353e-09 3.509078160846e-07 351;891;983;993;994;995;1019;5889;6604;8317;9401;23476;25942;26271;51514;55920;57504;80174 CDK1;CCNB1;DTL;CDC25C;RECQL4;CDC25A;CDC7;CDC25B;FBXO5;RCC2;CDK4;DBF4B;RAD51C;MTA3;APP;SIN3A;BRD4;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0072413 signal transduction involved in mitotic cell cycle checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0072413 52 29 10.2718580581567 2.82324773529863 9.2490388681199e-09 4.05895020005617e-07 581;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;5591;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:1902402 signal transduction involved in mitotic DNA damage checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902402 52 29 10.2718580581567 2.82324773529863 9.2490388681199e-09 4.05895020005617e-07 581;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;5591;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:1902403 signal transduction involved in mitotic DNA integrity checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902403 52 29 10.2718580581567 2.82324773529863 9.2490388681199e-09 4.05895020005617e-07 581;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;5591;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0140013 meiotic nuclear division http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0140013 94 43 18.5683587974372 2.31576740136748 9.24933007961926e-09 4.05895020005617e-07 641;675;699;701;898;991;994;1164;2175;2177;3976;4439;4603;5347;5810;5885;5888;5889;6118;6790;7153;7155;7272;9134;9232;9319;9700;10051;10096;10097;10592;11040;23236;23353;23397;26271;29781;80010;81930;83540;83990;146956;259266 TOP2A;CDC20;PLK1;NUF2;PTTG1;BUB1B;CCNE1;NCAPH;ASPM;TRIP13;TTK;BUB1;SMC4;RAD51;AURKA;CKS2;ESPL1;FANCD2;EME1;KIF18A;CDC25B;FBXO5;SMC2;BLM;BRIP1;CCNE2;PLCB1;LIF;FANCA;RAD21;RMI1;NCAPH2;RAD51C;MYBL1;RAD1;SUN1;TOP2B;BRCA2;ACTR2;ACTR3;MSH5;PIM2;RPA2 geneontology_Biological_Process GO:1902807 negative regulation of cell cycle G1/S phase transition http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902807 85 40 16.7905372104485 2.38229423505929 1.11549731673932e-08 4.85756177697023e-07 581;835;891;983;995;1017;1030;1032;1820;1869;1874;2033;2146;2810;3275;3276;4582;4849;5111;5591;5933;6118;6659;6790;7027;7029;7465;7832;10106;10217;10457;10498;11200;25904;25946;29883;51512;55159;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;EZH2;CDK2;PCNA;RBL1;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;RFWD3;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;WEE1;CDKN2D;GPNMB;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;CTDSPL;BAX;CDKN2B;CTDSP2;E2F4;RPA2;CARM1;PRMT2;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:2000134 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2000134 82 39 16.1979300147856 2.4077150576895 1.17023457590903e-08 5.05477025755005e-07 581;835;891;983;995;1017;1030;1820;1869;1874;2033;2146;2810;3275;3276;4582;4849;5111;5591;5933;6118;6659;6790;7027;7029;7465;7832;10106;10217;10457;10498;11200;25904;25946;29883;51512;55159;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;EZH2;CDK2;PCNA;RBL1;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;RFWD3;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;WEE1;GPNMB;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;CTDSPL;BAX;CDKN2B;CTDSP2;E2F4;RPA2;CARM1;PRMT2;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0034508 centromere complex assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0034508 29 20 5.72853622474125 3.49129327551793 1.18757188527496e-08 5.05477025755005e-07 1058;1062;1063;3070;4678;5928;5931;8467;8607;11339;23126;23421;26054;54107;55166;55355;55839;64105;64946;79172 HJURP;CENPF;CENPA;OIP5;HELLS;CENPH;CENPK;CENPE;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;POGZ;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;CENPN;SMARCA5;RUVBL1;SENP6 geneontology_Biological_Process GO:0043486 histone exchange http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043486 29 20 5.72853622474125 3.49129327551793 1.18757188527496e-08 5.05477025755005e-07 1058;4678;5757;5928;5931;6944;8467;8607;9025;10847;11339;23421;54107;55166;55355;55839;64105;64946;79172;81611 HJURP;CENPA;OIP5;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;ANP32E;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;PTMA;CENPN;SRCAP;VPS72;RNF8;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:0032392 DNA geometric change http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032392 64 33 12.6422868408083 2.61028723802395 1.2490406930965e-08 5.23764397305134e-07 641;1107;1108;1660;1663;1763;2071;2547;3148;3159;3181;4171;4173;4175;4176;5888;5965;6117;6118;6594;7153;7486;7520;8318;8438;8607;9401;9557;10973;51659;57680;83990;84296 TOP2A;MCM2;CDC45;MCM6;RAD54L;MCM4;HMGB2;RAD51;GINS2;MCM7;RECQL4;HMGA1;BLM;GINS4;DDX11;DNA2;BRIP1;RECQL;CHD3;DHX9;RPA1;HNRNPA2B1;CHD4;WRN;ASCC3;CHD8;SMARCA1;XRCC5;CHD1L;RUVBL1;RPA2;ERCC3;XRCC6 geneontology_Biological_Process GO:0072395 signal transduction involved in cell cycle checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0072395 64 33 12.6422868408083 2.61028723802395 1.2490406930965e-08 5.23764397305134e-07 581;672;835;891;983;995;1017;1111;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;5347;5591;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;51514;57472;144455 CDK1;E2F1;PLK1;CCNB1;DTL;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;CHEK1;BRCA1;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:1902099 regulation of metaphase/anaphase transition of cell cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902099 47 27 9.28417939871858 2.90817301567079 1.26396948463281e-08 5.26127297978407e-07 699;701;891;990;991;1062;1063;4085;5347;5885;7175;7272;7517;7756;8697;9184;9212;9319;9700;9787;10403;26271;51143;51433;51451;55795;81620 CDC20;CDC6;PLK1;CCNB1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;DLGAP5;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;ESPL1;CENPE;FBXO5;XRCC3;RAD21;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;ANAPC5;CDC23;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0006913 nucleocytoplasmic transport http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006913 296 99 58.4705766387383 1.69315928952905 1.28615248451425e-08 5.3145322736023e-07 473;580;983;999;1434;1660;1894;2316;2810;3178;3181;3267;3837;3838;3843;3921;4088;4116;4321;4659;4686;4928;5036;5433;5469;5501;5580;5594;5901;5905;5936;6628;6632;6633;6636;6637;6741;6850;7040;7175;7248;7514;7884;8480;8563;9631;9688;9775;9877;9883;9972;9984;10155;10527;10541;10657;10736;10762;10892;10921;11052;11260;11338;22794;22916;23039;23049;23165;23214;23225;23279;23381;23511;23636;29072;29107;29890;51319;51366;51512;51692;54535;54830;55705;55795;55916;57122;57187;57506;57510;64328;65109;65110;79023;79902;81608;84321;84445;348995 CDK1;ECT2;GTSE1;SFN;KPNA2;NUP210;BARD1;PRKCD;NUP205;MMP12;NUP107;SNRPB;NUP188;NUP85;SLBP;KPNB1;NUP62;CPSF6;NUP43;SNRPD1;RAN;FLNA;NUP155;UPF3B;CCHCR1;CSE1L;TPR;DHX9;NUP37;PPP1CC;IPO9;HNRNPA1;XPO1;TRIM28;TGFB1;SNRPF;NUP160;THOC2;XPO7;NCBP2;XPOT;NUP153;KHDRBS1;XPO5;LZTS2;RERE;IPO5;U2AF2;THOC1;SYK;RNPS1;SNRPG;RAE1;HNRNPA2B1;AGFG1;PPP1R12A;RSRC1;EIF4A3;ANP32B;NUP50;SNRPD2;PA2G4;SSB;MAPK1;NUP93;IPO7;PCID2;NCBP1;RANGAP1;SIX2;TSC1;CDH1;CASC3;SMG5;MED1;NXT1;POLR2D;THOC5;SETD2;RPSA;RBM15B;POM121;MALT1;NUP62CL;NXT2;CPSF3;MAGOH;UBR5;ZC3H11A;MAVS;SMAD3;NUP98;THOC3;UPF3A;SMG1;RBM4;XPO6;FIP1L1;XPO4 geneontology_Biological_Process GO:1905819 negative regulation of chromosome separation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1905819 34 22 6.7162148841794 3.27565457320653 1.3324882752741e-08 5.46609864226572e-07 699;701;891;991;1063;4085;5347;5885;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9232;9319;10403;26271;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;FBXO5;XRCC3;RAD21;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0006977 DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006977 50 28 9.87678659438147 2.83493013972056 1.4740183629236e-08 6.00317838310109e-07 581;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2810;3276;4582;4849;5111;6659;6790;7027;7029;7832;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;144455 CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;E2F7;MUC1;CHEK2;CNOT6;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0033046 negative regulation of sister chromatid segregation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033046 37 23 7.30882207984229 3.14688191185197 1.91276263716844e-08 7.73439234929325e-07 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CDC20;PLK1;CCNB1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;FBXO5;XRCC3;RAD21;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0034080 CENP-A containing nucleosome assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0034080 19 15 3.75317890586496 3.99661203907974 4.48569301703117e-08 1.69290054462756e-06 1058;4678;5928;5931;8467;8607;11339;23421;54107;55166;55355;55839;64105;64946;79172 HJURP;CENPA;OIP5;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;CENPN;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:0061641 CENP-A containing chromatin organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0061641 19 15 3.75317890586496 3.99661203907974 4.48569301703117e-08 1.69290054462756e-06 1058;4678;5928;5931;8467;8607;11339;23421;54107;55166;55355;55839;64105;64946;79172 HJURP;CENPA;OIP5;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;CENPN;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:0042770 signal transduction in response to DNA damage http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0042770 115 48 22.7166091670774 2.11299140848737 4.85285607254582e-08 1.8193389554094e-06 25;581;672;675;835;891;983;995;1017;1111;1820;1869;1874;2033;2305;2810;2885;3276;4582;4646;4849;5111;5347;5366;5591;5716;6659;6790;7027;7029;7832;8493;9521;10397;10498;11200;22976;23028;25904;25946;29883;51512;51514;57472;79915;144455;161742;200734 FOXM1;CDK1;E2F1;PLK1;CCNB1;DTL;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;CHEK1;BRCA1;SOX4;TFDP1;NDRG1;ARID3A;CASP2;ATAD5;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;MYO6;CNOT6;SPRED1;ABL1;PPM1D;PRMT1;KDM1A;PMAIP1;CNOT3;BRCA2;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;EEF1E1;GRB2;PSMD10;E2F4;PAXIP1;CARM1;CNOT7;SPRED2;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0006275 regulation of DNA replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006275 89 40 17.580680137999 2.2752248312364 5.56537890217257e-08 2.07273749771045e-06 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http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033048 36 22 7.11128634795466 3.09367376358394 6.10696773151176e-08 2.23042221471536e-06 699;701;891;991;1063;4085;5347;5885;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9232;9319;10403;26271;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;FBXO5;XRCC3;RAD21;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0007062 sister chromatid cohesion http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007062 36 22 7.11128634795466 3.09367376358394 6.10696773151176e-08 2.23042221471536e-06 699;701;991;1663;2237;3835;5347;5885;5889;6421;8243;9126;9555;9700;10735;23126;23244;25836;27127;79075;80218;113130 CDC20;PLK1;BUB1B;CDCA5;BUB1;FEN1;ESPL1;DDX11;DSCC1;SMC1A;SMC3;SFPQ;RAD21;H2AFY;POGZ;RAD51C;SMC1B;KIF22;NAA50;PDS5A;NIPBL;STAG2 geneontology_Biological_Process GO:0051784 negative regulation of nuclear division http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051784 47 26 9.28417939871858 2.80046290397927 6.79535526737496e-08 2.46592988260318e-06 699;701;891;991;1063;1111;3976;4085;5347;5810;5885;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9232;9319;10403;26271;27085;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;CHEK1;FBXO5;XRCC3;LIF;RAD21;TPR;RAD1;ZNF207;MTBP;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0010212 response to ionizing radiation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010212 123 50 24.2968950221784 2.05787611768333 7.10645851054181e-08 2.5623988298202e-06 142;578;581;641;672;675;836;867;1196;1535;1788;1789;1894;2140;2177;2547;2885;3014;3383;3428;4436;5562;5591;5810;5883;5888;6240;7040;7158;7412;7486;7516;7520;8438;9025;10276;10635;11011;11073;11200;22976;23028;25836;25896;54107;55159;57646;64421;65123;165918 ECT2;RAD51AP1;RAD54L;RAD51;FANCD2;H2AFX;XRCC2;BRCA1;TOPBP1;MSH2;BLM;RRM1;BAK1;DNMT3B;RFWD3;PRKDC;CYBA;VCAM1;CHEK2;DNMT3A;CLK2;ICAM1;POLE3;RAD1;TGFB1;RAD9A;INTS3;KDM1A;PARP1;BRCA2;DCLRE1C;RNF8;CASP3;WRN;TP53BP1;RNF168;CBL;NET1;INTS7;BAX;IFI16;GRB2;NIPBL;XRCC5;EYA3;PRKAA1;PAXIP1;USP28;TLK2;XRCC6 geneontology_Biological_Process GO:0070507 regulation of microtubule cytoskeleton organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070507 144 56 28.4451453918186 1.96870148591705 7.4072872058295e-08 2.65396537165828e-06 25;402;672;899;1111;1213;1778;1946;2011;2242;2648;3192;3832;3925;4591;4751;5058;5347;5562;6491;6790;7175;7514;7517;8045;8243;8480;8851;9126;9181;10274;10460;10615;10733;10735;11190;22919;22974;23299;23636;25978;26054;26586;26973;29899;51199;55835;57551;58526;59341;79598;81930;128866;220134;221150;348235 TPX2;PLK1;NEK2;SKA1;KIF11;SKA3;SPAG5;STMN1;TACC3;AURKA;CCNF;KIF18A;CHEK1;BRCA1;PLK4;STIL;CKAP2;ARHGEF2;GPSM2;MAPRE1;XRCC3;CENPJ;SMC1A;SMC3;SKA2;NUP62;MID1IP1;TRIM37;TPR;XPO1;KAT2A;CEP250;PAK1;STAG1;ABL1;CHORDC1;RAE1;MARK2;HNRNPU;NIN;FES;CDK5R1;CEP97;RASSF7;TAOK1;TRPV4;CHMP4B;CLTC;EFNA5;CHMP2B;BICD2;SENP6;PRKAA1;STAG2;DYNC1H1;ARL2 geneontology_Biological_Process GO:0034724 DNA replication-independent nucleosome organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0034724 29 19 5.72853622474125 3.31672861174203 9.91785513715371e-08 3.53113068751114e-06 1058;4678;5928;5931;8467;8520;8607;11198;11339;23421;23523;54107;55166;55355;55723;55839;64105;64946;79172 ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SUPT16H;CENPN;HAT1;CABIN1;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:0030330 DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030330 94 41 18.5683587974372 2.20805728967597 1.06566057533897e-07 3.77044032312118e-06 581;672;675;835;891;983;995;1017;1820;1869;1874;2033;2305;2810;3276;4582;4646;4849;5111;5366;5716;6659;6790;7027;7029;7832;8493;9521;10397;10498;11200;22976;23028;25904;25946;29883;51512;57472;144455;161742;200734 FOXM1;CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;BRCA1;SOX4;TFDP1;NDRG1;ARID3A;CASP2;E2F7;MUC1;CHEK2;MYO6;CNOT6;SPRED1;PPM1D;PRMT1;KDM1A;PMAIP1;CNOT3;BRCA2;ZNF385A;BTG2;EP300;CNOT10;BAX;EEF1E1;PSMD10;E2F4;PAXIP1;CARM1;CNOT7;SPRED2;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0006270 DNA replication initiation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006270 22 16 4.34578610152785 3.68172745418254 1.12487451242593e-07 3.93081149064395e-06 898;990;1017;4171;4172;4173;4174;4175;4176;5422;8317;8318;9134;23649;55388;81620 MCM2;CDC6;CDT1;CDC45;CCNE1;MCM6;MCM4;MCM3;MCM10;MCM5;MCM7;CDC7;CDK2;POLA1;POLA2;CCNE2 geneontology_Biological_Process GO:0031055 chromatin remodeling at centromere http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031055 22 16 4.34578610152785 3.68172745418254 1.12487451242593e-07 3.93081149064395e-06 1058;3070;4678;5928;5931;8467;8607;11339;23421;54107;55166;55355;55839;64105;64946;79172 HJURP;CENPA;OIP5;HELLS;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;CENPN;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:0070317 negative regulation of G0 to G1 transition http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070317 37 22 7.30882207984229 3.01006095916276 1.22584685291471e-07 4.25737364070564e-06 317;672;1111;1869;1876;2146;5888;5928;5931;5932;6045;6241;7027;7029;7703;8317;8726;10919;11335;23269;23468;23512 E2F1;RRM2;RAD51;EZH2;CDC7;CHEK1;BRCA1;RBBP8;TFDP1;SUZ12;RBBP4;CBX5;E2F6;RBBP7;EHMT2;APAF1;CBX3;PCGF2;RNF2;EED;MGA;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0032508 DNA duplex unwinding http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032508 57 29 11.2595367175949 2.57559442518472 1.3935319009839e-07 4.81023420211577e-06 641;1107;1108;1660;1663;1763;2071;2547;3159;4171;4173;4175;4176;5888;5965;6117;6118;7153;7486;7520;8318;8607;9401;9557;10973;51659;57680;83990;84296 TOP2A;MCM2;CDC45;MCM6;MCM4;RAD51;GINS2;MCM7;RECQL4;HMGA1;BLM;GINS4;DDX11;DNA2;BRIP1;RECQL;CHD3;DHX9;RPA1;CHD4;WRN;ASCC3;CHD8;XRCC5;CHD1L;RUVBL1;RPA2;ERCC3;XRCC6 geneontology_Biological_Process GO:0045023 G0 to G1 transition http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045023 40 23 7.90142927550518 2.91086576846307 1.49595660525748e-07 5.13249111658338e-06 317;672;1111;1869;1876;2146;5469;5888;5928;5931;5932;6045;6241;7027;7029;7703;8317;8726;10919;11335;23269;23468;23512 E2F1;RRM2;RAD51;EZH2;CDC7;CHEK1;BRCA1;RBBP8;TFDP1;SUZ12;RBBP4;CBX5;E2F6;RBBP7;EHMT2;APAF1;CBX3;PCGF2;RNF2;MED1;EED;MGA;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0045839 negative regulation of mitotic nuclear division http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045839 43 24 8.49403647116806 2.82551176716335 1.73600119612871e-07 5.92018239234014e-06 699;701;891;991;1063;1111;4085;5347;5885;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9232;9319;10403;26271;27085;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;PTTG1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;CHEK1;FBXO5;XRCC3;RAD21;TPR;ZNF207;MTBP;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:1901989 positive regulation of cell cycle phase transition http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1901989 76 35 15.0127156234598 2.33135702279651 1.78781317305976e-07 6.06036549262952e-06 351;891;898;983;990;993;994;995;1019;2146;5889;6604;7015;7040;8317;8318;8450;9401;9700;9787;11065;23236;23476;25942;26271;27085;51433;51514;55920;57504;79915;80174;81620;113130;252983 UBE2C;CDK1;CDC6;CCNB1;CDT1;DTL;CDCA5;CDC45;CCNE1;DLGAP5;CDC25C;EZH2;ESPL1;RECQL4;CDC25A;CDC7;CDC25B;FBXO5;RCC2;CDK4;ATAD5;PLCB1;DBF4B;RAD51C;TGFB1;TERT;MTA3;MTBP;APP;STXBP4;SIN3A;BRD4;CUL4B;ANAPC5;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0016571 histone methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016571 99 42 19.5560374568753 2.14767434827315 1.922957170164e-07 6.47967889303475e-06 672;1786;1789;2091;2146;3275;3276;3720;4302;6018;6598;6839;7403;8473;8726;9555;9682;9739;9869;10196;10498;10919;11108;22823;22976;23476;23512;26147;29072;30827;54880;55170;55183;55818;55870;57673;63925;64324;79723;80335;84444;90780 EZH2;DNMT1;PHF19;BRCA1;SUZ12;DNMT3B;MTF2;SUV39H2;BCOR;PRMT6;H2AFY;DOT1L;PYGO2;EHMT2;BEND3;RIF1;PRMT1;SETDB1;PRDM4;KDM6A;PRMT3;FBL;SMARCB1;MLLT6;ASH1L;WDR82;CXXC1;RLF;SUV39H1;SETD2;OGT;BRD4;EED;JARID2;SETD1A;PAXIP1;NSD1;ZNF335;KDM3A;CARM1;PRMT2;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0051383 kinetochore organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051383 16 13 3.16057171020207 4.11317989021956 2.06920571566016e-07 6.9312269564214e-06 1058;1062;1063;10051;10403;10592;23126;26054;55839;64105;64946;81620;83540 NUF2;CENPF;CDT1;CENPA;NDC80;SMC4;CENPH;CENPK;CENPE;SMC2;POGZ;CENPN;SENP6 geneontology_Biological_Process GO:1901992 positive regulation of mitotic cell cycle phase transition http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1901992 67 32 13.2348940364712 2.41785086543331 2.11291750207288e-07 7.03601528190267e-06 351;891;898;983;990;993;994;995;1019;5889;6604;7015;7040;8317;8318;8450;9401;9700;9787;11065;23236;23476;25942;26271;27085;51433;51514;55920;57504;80174;81620;113130 UBE2C;CDK1;CDC6;CCNB1;CDT1;DTL;CDCA5;CDC45;CCNE1;DLGAP5;CDC25C;ESPL1;RECQL4;CDC25A;CDC7;CDC25B;FBXO5;RCC2;CDK4;PLCB1;DBF4B;RAD51C;TGFB1;TERT;MTA3;MTBP;APP;SIN3A;BRD4;CUL4B;ANAPC5;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0007094 mitotic spindle assembly checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007094 30 19 5.92607195662888 3.20617099135063 2.20384627103165e-07 7.17009985075297e-06 699;701;891;991;1063;4085;5347;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9319;10403;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;XRCC3;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0031577 spindle checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031577 30 19 5.92607195662888 3.20617099135063 2.20384627103165e-07 7.17009985075297e-06 699;701;891;991;1063;4085;5347;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9319;10403;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;XRCC3;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0071173 spindle assembly checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071173 30 19 5.92607195662888 3.20617099135063 2.20384627103165e-07 7.17009985075297e-06 699;701;891;991;1063;4085;5347;7175;7272;7517;7756;9184;9212;9319;10403;51143;51451;55795;81620 CDC20;PLK1;CCNB1;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;MAD2L1;XRCC3;TPR;ZNF207;PCID2;BUB3;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0071174 mitotic spindle checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071174 30 19 5.92607195662888 3.20617099135063 2.20384627103165e-07 7.17009985075297e-06 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geneontology_Biological_Process GO:0006336 DNA replication-independent nucleosome assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006336 28 18 5.53100049285362 3.25438408896493 3.33357932591483e-07 1.06019059348336e-05 1058;4678;5928;5931;8467;8520;8607;11339;23421;23523;54107;55166;55355;55723;55839;64105;64946;79172 ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CENPH;CENPK;CENPO;CENPQ;NASP;RBBP4;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;CENPN;HAT1;CABIN1;SMARCA5;RUVBL1 geneontology_Biological_Process GO:1903827 regulation of cellular protein localization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1903827 412 123 81.3847215377033 1.51134018371025 3.72031399464845e-07 1.1765752806539e-05 102;142;312;580;665;841;898;908;983;999;1000;1213;1399;1601;1736;1857;1869;1894;2037;2207;2239;2316;2810;3675;3684;3688;3689;3767;3799;3843;3936;3958;3976;4088;4323;4931;5058;5116;5347;5366;5469;5562;5580;5584;5594;5770;5880;5905;6714;6721;6809;6950;7015;7027;7029;7040;7161;7175;7429;7430;7514;7533;7534;7855;8417;8826;8851;9134;9270;9520;9530;9555;9585;9648;9696;10055;10075;10155;10228;10403;10445;10541;10551;10576;10694;10971;11006;11190;11235;22948;23028;23433;23607;23613;23636;25836;25942;26056;26060;26354;29072;29775;29899;51366;51465;51512;54209;55166;55432;55704;55722;55737;57506;57510;57602;64328;80184;81620;84445;84662;113130;245812;258010 CDK1;E2F1;PLK1;ECT2;CDT1;CDCA5;CCNE1;GTSE1;NDC80;SFN;VIL1;AGR2;ANXA13;GLIS2;TFDP1;CENPQ;BARD1;EPB41L2;PRKCD;MMP14;TREM2;GPSM2;KIF20B;SRC;EZR;PRKCI;CCNE2;ITGA3;YWHAQ;SAE1;LIF;NUP62;CCDC88A;STX3;IQGAP1;DVL3;H2AFY;FLNA;DAB2;TPR;FCER1G;CNPY4;CEP72;TP73;DKC1;NPEPPS;XPO1;CEP250;PAK1;TRIM28;CCT5;YWHAZ;TGFB1;ITGAM;STX6;ITGB1;TERT;CD2AP;FZD5;XPO5;YWHAH;LZTS2;IPO5;CCT2;KDM1A;PMAIP1;RAC2;PARP1;KCNJ11;MCRS1;CCT6A;LGALS3;ANP32B;CRKL;ZMYND8;CARD10;CASP8;PCNT;ADAM10;ITGB2;MAPK1;RANGAP1;CDK5R1;NVL;CDH1;MED1;PDCD10;TCP1;UBE2J1;KIF5B;LCP1;GPC4;APPL1;HUWE1;SETD2;SIN3A;ITGB1BP1;CCT8;GNL3;NIPBL;VPS35;USP36;CLTC;GCC2;BNIP3L;LILRB4;UBR5;MAVS;SMAD3;YOD1;RHOQ;SVIP;PRKAA1;BAG4;CEP290;CDH2;STX7;PTPN1;CROCC;SREBF2;RAB11FIP5;XPO4;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0032886 regulation of microtubule-based process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032886 158 58 31.2106456382454 1.85834028146239 4.44289254275532e-07 1.39728970469655e-05 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102;332;1627;1741;1759;2239;3181;3192;3267;3797;3921;4116;4686;4928;5036;5433;5901;6421;6616;6741;6809;7175;7248;7430;7514;7884;8417;8480;8563;9631;9688;9775;9877;9883;9972;9984;10762;10921;11260;11338;22794;22883;22916;23049;23165;23225;23279;23381;23511;23636;26160;27092;29072;29107;29890;51668;51692;55081;55722;55737;55795;55920;57122;57187;57560;65109;79023;79902;81608;84321;117178;348995 BIRC5;RCC2;NUP210;CLSTN1;DLG3;SNAP25;DBN1;NUP205;EZR;NUP107;NUP188;IFT80;NUP85;SFPQ;SLBP;NUP62;STX3;NUP43;RAN;NUP155;IFT57;UPF3B;TPR;NUP37;CEP72;XPO1;KIF3C;DNM1;NUP160;THOC2;NCBP2;XPOT;NUP153;SSX2IP;U2AF2;THOC1;RNPS1;RAE1;HNRNPA2B1;HNRNPU;AGFG1;EIF4A3;NUP50;HSPB11;PA2G4;IFT172;ADAM10;SSB;NUP93;PCID2;NCBP1;TSC1;CASC3;SMG5;NXT1;POLR2D;GPC4;THOC5;SETD2;RPSA;RBM15B;POM121;VPS35;CACNG4;CPSF3;MAGOH;ZC3H11A;STX7;NUP98;THOC3;SMG1;FIP1L1 geneontology_Biological_Process GO:0018394 peptidyl-lysine acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018394 131 50 25.8771808772795 1.93220429370267 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http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902806 132 50 26.0747166091671 1.91756638238674 9.31684791760645e-07 2.79061778103546e-05 581;835;891;898;983;990;995;1017;1030;1032;1820;1869;1874;2033;2146;2810;3275;3276;4582;4849;5111;5591;5933;6118;6659;6790;7015;7027;7029;7465;7832;8318;8450;9928;10106;10197;10217;10457;10498;11200;23236;25904;25946;27085;29883;51512;55159;57472;144455;252983 CDK1;E2F1;CDC6;CCNB1;CDC45;CCNE1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;EZH2;CDK2;PCNA;KIF14;RBL1;SOX4;TFDP1;ARID3A;CASP2;PLCB1;RFWD3;E2F7;PRKDC;MUC1;CHEK2;CNOT6;WEE1;CDKN2D;TERT;GPNMB;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;MTBP;CNOT10;CTDSPL;BAX;PSME3;STXBP4;CDKN2B;CUL4B;CTDSP2;E2F4;RPA2;CARM1;PRMT2;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:1903829 positive regulation of cellular protein localization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1903829 265 85 52.3469689502218 1.62378074040598 1.03383944127788e-06 3.08029740898637e-05 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peptidyl-lysine methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018022 84 36 16.5930014785609 2.16958939264328 1.05729798982601e-06 3.13369838764662e-05 672;1786;1789;2146;3720;4302;6018;6598;6839;7403;8473;8726;9555;9682;9739;9869;10919;22823;22976;23476;23512;26147;29072;30827;54880;55170;55183;55818;55870;57673;63925;64324;79723;80335;84444;90780 EZH2;DNMT1;PHF19;BRCA1;SUZ12;DNMT3B;MTF2;SUV39H2;BCOR;PRMT6;H2AFY;DOT1L;PYGO2;EHMT2;BEND3;RIF1;SETDB1;KDM6A;SMARCB1;MLLT6;ASH1L;WDR82;CXXC1;RLF;SUV39H1;SETD2;OGT;BRD4;EED;JARID2;SETD1A;PAXIP1;NSD1;ZNF335;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0006334 nucleosome assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006334 75 33 14.8151798915722 2.22744510978044 1.44499873289128e-06 4.26048845150913e-05 1058;3014;3148;4171;4673;4676;4678;5928;5931;6418;6662;8208;8348;8467;8520;8607;8971;9555;9733;10036;10541;11339;23421;23523;50809;54107;55166;55355;55723;55839;64105;64946;79172 MCM2;ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CHAF1B;HMGB2;H2AFX;CENPH;CENPK;CHAF1A;CENPO;CENPQ;NASP;NAP1L1;RBBP4;SOX9;H2AFY;SET;H1FX;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SART3;CENPN;HP1BP3;HAT1;ANP32B;CABIN1;HIST1H2BO;SMARCA5;RUVBL1;NAP1L4 geneontology_Biological_Process GO:0016573 histone acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016573 123 47 24.2968950221784 1.93440355062233 1.46966941494409e-06 4.31077645492149e-05 86;672;675;1111;1386;1810;2033;2648;3054;3976;4582;5595;6418;6598;6688;6871;6885;7040;7703;7862;8089;8202;8295;8473;8520;8607;8861;9329;9913;10445;10847;10902;10933;11177;22976;23326;23774;25942;51230;51616;54107;55209;55274;57634;57673;80218;90780 CHEK1;BRCA1;ACTL6A;MUC1;LIF;PYGO2;SET;HCFC1;BEND3;POLE3;KAT2A;SETD5;MAP3K7;TGFB1;DR1;TRRAP;BRPF1;HAT1;YEATS4;PCGF2;SRCAP;BRCA2;MCRS1;TAF9B;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;PHF10;EP400;GTF3C4;BRD1;BRD8;SUPT7L;MAPK3;SIN3A;BAZ1A;ATF2;LDB1;OGT;NCOA3;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PAXIP1;PHF20;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0010639 negative regulation of organelle organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010639 291 91 57.4828979793001 1.5830795453766 1.48574761649201e-06 4.33547281286662e-05 120;142;672;699;701;822;829;891;899;991;1063;1111;1786;1789;2648;3159;3178;3192;3720;3925;3976;4085;4171;4302;4591;4751;5217;5347;5394;5580;5716;5756;5810;5885;6418;6598;6688;6714;7114;7153;7175;7272;7429;7515;7517;7520;7756;8195;8971;9168;9181;9184;9212;9232;9319;9530;9555;9682;9700;10059;10163;10403;10493;11151;22823;22919;23075;25942;26271;26586;27085;29028;51143;51366;51451;51474;54880;55170;55226;55607;55795;55818;57551;58526;65057;79598;81620;84079;128866;136319;167227 TOP2A;CDC20;MCM2;PLK1;CCNB1;PTTG1;NEK2;AURKB;CENPF;BUB1B;CDT1;NDC80;TRIP13;TTK;BUB1;STMN1;MAD2L1;DNMT1;ESPL1;VIL1;CCNF;CHEK1;BRCA1;HMGA1;ATAD2;FBXO5;CAPG;CKAP2;ARHGEF2;PRKCD;PFN2;SRC;MAPRE1;XRCC3;DNMT3B;MTF2;ADD3;TMSB10;LIF;RAD21;BCOR;PRMT6;H2AFY;MID1IP1;TRIM37;TPR;SET;H1FX;HNRNPA1;RAD1;KAT2A;ZNF207;DNM1L;XRCC1;ANKRD27;PARP1;HNRNPU;CAPZA1;TMSB4X;WASF2;SMARCB1;MLLT6;SPI1;MKKS;MTBP;SWAP70;ACD;PCID2;BUB3;VAT1;CEP97;TAOK1;LIMA1;SIN3A;TWF1;MTPN;PSMD10;XRCC5;CHMP4B;DCP2;PPP1R9A;JARID2;UBR5;CORO1A;EXOSC10;BAG4;KDM3A;KDM4A;NAT10;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0006337 nucleosome disassembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006337 18 13 3.55564317397733 3.65615990241739 2.11954990336771e-06 6.15321641177673e-05 3159;6418;6597;6598;6599;6601;6602;6604;6605;8289;11198;55193;92815 HMGA1;HIST3H2A;SMARCD1;SMARCC2;SMARCC1;SET;SUPT16H;SMARCB1;SMARCA4;ARID1A;PBRM1;SMARCE1;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0045005 DNA-dependent DNA replication maintenance of fidelity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045005 23 15 4.54332183341548 3.30154907576152 2.5254497366678e-06 7.24864751374273e-05 641;675;1663;1763;2956;5111;5424;5426;5888;7486;8914;9984;54962;55159;146956 RAD51;EME1;PCNA;POLD1;TIMELESS;BLM;DDX11;DNA2;RFWD3;MSH6;TIPIN;POLE;THOC1;BRCA2;WRN geneontology_Biological_Process GO:0051984 positive regulation of chromosome segregation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051984 23 15 4.54332183341548 3.30154907576152 2.5254497366678e-06 7.24864751374273e-05 891;990;1663;2237;3192;5885;6421;9555;9700;9787;25836;51433;55920;56852;81620 CDC6;CCNB1;CDT1;DLGAP5;FEN1;ESPL1;RCC2;DDX11;SFPQ;RAD21;H2AFY;RAD18;HNRNPU;NIPBL;ANAPC5 geneontology_Biological_Process GO:0031497 chromatin assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031497 90 37 17.7782158698866 2.08119871368374 2.53529801752528e-06 7.24864751374273e-05 1029;1058;3014;3070;3148;3159;4171;4673;4676;4678;5928;5931;6418;6662;7175;8208;8348;8467;8520;8607;8971;9555;9733;10036;10541;11339;23421;23523;50809;54107;55166;55355;55723;55839;64105;64946;79172 MCM2;ASF1B;HJURP;CENPA;OIP5;CHAF1B;HMGB2;CDKN2A;HELLS;H2AFX;CENPH;CENPK;HMGA1;CHAF1A;CENPO;CENPQ;NASP;NAP1L1;RBBP4;SOX9;H2AFY;TPR;SET;H1FX;ITGB3BP;RBBP7;POLE3;SART3;CENPN;HP1BP3;HAT1;ANP32B;CABIN1;HIST1H2BO;SMARCA5;RUVBL1;NAP1L4 geneontology_Biological_Process GO:0006473 protein acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006473 151 54 29.827895515032 1.81038585081493 2.78245459117699e-06 7.91531429178539e-05 86;672;675;1111;1386;1810;2033;2648;3054;3066;3976;4582;5562;5595;6418;6598;6659;6688;6871;6885;7040;7703;7862;8089;8202;8295;8473;8520;8607;8861;9329;9913;10445;10847;10902;10933;11177;22976;23326;23774;25942;51230;51616;54107;55209;55274;57551;57634;57673;79075;80018;80218;84140;90780 CHEK1;BRCA1;SOX4;ACTL6A;DSCC1;MUC1;LIF;HDAC2;PYGO2;SET;HCFC1;BEND3;POLE3;KAT2A;SETD5;MAP3K7;TGFB1;DR1;TRRAP;BRPF1;HAT1;YEATS4;PCGF2;SRCAP;BRCA2;MCRS1;TAF9B;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;PHF10;EP400;GTF3C4;BRD1;NAA25;BRD8;TAOK1;SUPT7L;MAPK3;SIN3A;BAZ1A;ATF2;LDB1;OGT;NCOA3;FAM161A;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PRKAA1;PAXIP1;PHF20;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0071897 DNA biosynthetic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071897 159 56 31.4081813701331 1.78297493064186 3.15929980221341e-06 8.94239809016506e-05 641;908;1032;1063;1736;3178;3181;3184;3192;3978;4216;4751;4931;5111;5394;5422;5424;5426;5427;5570;5594;5595;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;6714;6950;7015;7027;7083;7298;7486;7520;9212;10576;10694;10714;10721;11232;22948;23381;23649;51455;51514;54107;55226;55666;63922;65057;79075;167227;286826 NEK2;TYMS;AURKB;CENPF;DTL;TK1;RFC4;PCNA;POLD1;LIG1;TFDP1;BLM;POLE2;CHTF18;RFC3;POLA1;POLQ;RFC5;SRC;POLA2;DSCC1;POLD3;LIN9;PKIB;RFC2;RPA1;HNRNPA1;DKC1;POLE3;CDKN2D;CCT5;POLG2;TERT;POLE;CCT2;HNRNPA2B1;HNRNPU;CCT6A;HNRNPD;MAP3K4;ACD;MAPK1;WRN;NVL;SMG5;TCP1;MAPK3;REV1;CCT8;XRCC5;DCP2;RPA2;EXOSC10;RPA3;NAT10;NPLOC4 geneontology_Biological_Process GO:0018393 internal peptidyl-lysine acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018393 126 47 24.8895022178413 1.88834632322656 3.22824076415262e-06 9.09207510739702e-05 86;672;675;1111;1386;1810;2033;2648;3054;3976;4582;5595;6418;6598;6688;6871;6885;7040;7703;7862;8089;8202;8295;8473;8520;8607;8861;9329;9913;10445;10847;10902;10933;11177;22976;23326;23774;25942;51230;51616;54107;55209;55274;57634;57673;80218;90780 CHEK1;BRCA1;ACTL6A;MUC1;LIF;PYGO2;SET;HCFC1;BEND3;POLE3;KAT2A;SETD5;MAP3K7;TGFB1;DR1;TRRAP;BRPF1;HAT1;YEATS4;PCGF2;SRCAP;BRCA2;MCRS1;TAF9B;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;PHF10;EP400;GTF3C4;BRD1;BRD8;SUPT7L;MAPK3;SIN3A;BAZ1A;ATF2;LDB1;OGT;NCOA3;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PAXIP1;PHF20;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0061982 meiosis I cell cycle process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0061982 61 28 12.0496796451454 2.32371322927915 3.25182697435977e-06 9.11316460487657e-05 641;675;898;993;994;995;1164;2177;2956;4439;4603;5347;5885;5888;5889;6118;6790;7153;7155;9134;9232;9319;9700;23353;26271;80010;83990;146956 TOP2A;PLK1;PTTG1;CCNE1;TRIP13;CDC25C;RAD51;AURKA;CKS2;ESPL1;FANCD2;CDC25A;EME1;CDC25B;FBXO5;BLM;BRIP1;CCNE2;MSH6;RAD21;RMI1;RAD51C;MYBL1;SUN1;TOP2B;BRCA2;MSH5;RPA2 geneontology_Biological_Process GO:0022406 membrane docking http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0022406 141 51 27.8525381961557 1.83107189875568 3.57705669440378e-06 9.9752305157733e-05 858;983;1453;1778;1781;2054;3383;4751;4957;5116;5341;5347;6093;6616;6804;6809;6813;6857;7277;7283;7412;7430;8417;8481;8675;9545;9657;9793;9814;10228;10652;10733;10890;11190;11311;22919;22981;22995;51762;54820;55125;55142;55722;55835;79598;80184;84131;115106;117177;121441;203068 CDK1;PLK1;NEK2;PLK4;TUBG1;SNAP25;MAPRE1;HAUS1;EZR;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;TUBB;NEDD1;VCAM1;STX3;SYT1;PLEK;RAB3D;CEP78;CEP72;STX2;SFI1;ICAM1;CEP192;CEP250;OFD1;STX6;NINL;ODF2;RAB8B;CSNK1D;STX16;CEP152;HAUS2;RAB3IP;PCNT;CAV2;CEP97;RAB10;STX1A;STXBP2;TUBA4A;YKT6;CEP290;DYNC1H1;STX7;VPS45;DYNC1I2;ROCK1 geneontology_Biological_Process GO:0000079 regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000079 81 34 16.000394282898 2.12494763559301 3.68672796702274e-06 0.000102306701084881 641;836;890;891;898;899;904;990;993;995;1019;1029;1030;1031;1032;1033;1050;1163;1164;2810;3843;5347;5716;6714;7128;8851;9088;9113;9133;9134;10527;10614;23560;57018 CDC6;CCNB2;PLK1;CCNB1;CCNA2;CCNE1;CDKN3;SFN;CDC25C;CKS2;PKMYT1;CDC25A;CDKN2A;CCNF;CDKN2C;BLM;CDK4;SRC;CCNE2;CKS1B;CDKN2D;TNFAIP3;IPO5;GTPBP4;LATS1;CASP3;IPO7;CDK5R1;CCNL1;HEXIM1;CDKN2B;PSMD10;CEBPA;CCNT1 geneontology_Biological_Process GO:0051298 centrosome duplication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051298 49 24 9.67925086249384 2.47953073444947 3.97615256875206e-06 0.000109799998496124 672;675;899;1017;2648;4591;6491;7514;7517;8481;9793;10733;22995;23032;23636;25978;26973;54820;55125;55722;55835;128866;163786;284403 CCNF;CDK2;WDR62;BRCA1;PLK4;STIL;SASS6;XRCC3;CENPJ;NDE1;CKAP5;NUP62;TRIM37;CEP72;XPO1;KAT2A;CEP192;OFD1;CHORDC1;BRCA2;CEP152;USP33;CHMP4B;CHMP2B geneontology_Biological_Process GO:0044089 positive regulation of cellular component biogenesis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0044089 401 116 79.2118284869394 1.46442775297286 4.41491672997785e-06 0.000121324483535945 25;142;402;581;822;961;1385;1778;1946;2049;2071;2150;2242;2316;2885;2967;3055;3383;3556;3936;3984;3987;4088;4312;5027;5058;5217;5305;5341;5366;5578;5829;5880;6093;6117;6118;6119;6281;6624;6662;6714;6928;7016;7040;7046;7162;7175;7248;7408;7422;7429;7456;8027;8396;8440;8450;8826;8851;8936;9076;9146;9231;9270;9448;9530;9557;9696;9774;10018;10094;10096;10097;10109;10152;10163;10563;10615;10733;10787;10923;11135;11151;22883;22919;22976;23075;23221;23394;23433;23580;23613;23636;29108;29899;29904;50807;51199;54443;54874;55127;55329;55704;55832;55835;55971;57472;79574;79734;81620;83732;84128;90427;147179;255967;285590;375790 ANLN;CDT1;SPAG5;VIL1;KCTD17;NCK2;PLK4;CAPG;WASF1;MNS1;GPSM2;MMP1;PFN2;BMF;CLSTN1;SRC;EPS8L3;MAPRE1;PYCARD;CENPJ;LIMK1;SOX9;NUP62;F2RL1;CCDC88A;IQGAP1;PLEK;ASAP1;FLNA;CNOT6;TPR;HGS;RPA1;ADNP;FNBP1L;HNF1B;ICAM1;VASP;PAK1;BCL2L11;VEGFA;AGRN;TGFB1;IL1RAP;ABL1;CAND1;HEATR1;GTF2H3;S100A10;ABI2;CXCL13;PMAIP1;RAC2;PARP1;LIMS1;WIPF2;NCKAP1;WASF2;TPBG;MAP4K4;ACTR2;DLG5;CLDN1;ZMYND8;SH3PXD2B;PIP4K2A;SWAP70;NIN;FSCN1;ACTR3;FES;PAN3;EPHB3;BAX;CDK5R1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;STAM;WDR75;CDC42EP4;LCP1;GRB2;HCK;PIP4K2B;BAIAP2L1;ITGB1BP1;PRKCA;SUB1;TESK1;CUL4B;CREB1;EFNA5;TGFBR1;CHD1L;CORO1A;BCLAF1;SMAD3;RPA2;CD47;WIPF1;RHOQ;BAG4;RPA3;PAXIP1;ERCC3;DYNC1H1;ROCK1;ARPC2;CROCC;PXN;P2RX7;EEF2K;RHOBTB2;ARL2;RIOK1 geneontology_Biological_Process GO:0097711 ciliary basal body-plasma membrane docking http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0097711 72 31 14.2225726959093 2.1796337879796 5.20694493610918e-06 0.000142398624557073 983;1453;1778;1781;4751;4957;5116;5347;7277;7283;8481;9657;9793;9814;10733;11190;22919;22981;22995;54820;55125;55142;55722;55835;79598;80184;84131;115106;117177;121441;203068 CDK1;PLK1;NEK2;PLK4;TUBG1;MAPRE1;HAUS1;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;TUBB;NEDD1;CEP78;CEP72;SFI1;CEP192;CEP250;OFD1;NINL;ODF2;CSNK1D;CEP152;HAUS2;RAB3IP;PCNT;CEP97;TUBA4A;CEP290;DYNC1H1;DYNC1I2 geneontology_Biological_Process GO:0009303 rRNA transcription http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0009303 24 15 4.7408575653031 3.16398453093812 5.50350344286077e-06 0.000149068578899688 1663;2975;2976;4141;4691;6597;6598;9014;9329;9330;9555;10360;10849;10927;25926 DDX11;SPIN1;H2AFY;NPM3;TAF1B;GTF3C2;SMARCB1;SMARCA4;GTF3C4;CD3EAP;NOL11;NCL;GTF3C3;MARS;GTF3C1 geneontology_Biological_Process GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008608 24 15 4.7408575653031 3.16398453093812 5.50350344286077e-06 0.000149068578899688 891;1062;1894;3192;4751;7756;9184;9212;10403;10615;11004;29127;55920;81620;83540 KIF2C;CCNB1;NUF2;NEK2;AURKB;ECT2;CDT1;NDC80;SPAG5;RACGAP1;CENPE;RCC2;ZNF207;HNRNPU;BUB3 geneontology_Biological_Process GO:0016458 gene silencing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016458 158 55 31.2106456382454 1.76221923242123 5.7781037534621e-06 0.000155761168325471 1017;1660;1786;1788;3065;3066;3070;3159;3181;4088;4686;4849;5431;5433;5460;5901;5936;6839;7015;7040;7703;8289;8318;8467;8493;8520;8575;8726;8971;9555;9612;9869;9931;10155;10521;10847;10933;11176;22916;22955;23369;25904;25942;29028;29883;51593;54107;54487;55183;56339;57472;57510;57673;84444;90459 CDC45;DNMT1;HELLS;CDK2;HMGA1;ATAD2;BAZ2A;RAN;H2AFY;HDAC2;SCMH1;DOT1L;DNMT3A;CNOT6;DHX9;H1FX;BEND3;POLE3;HDAC1;SRRT;TRIM28;NCOR2;RIF1;TGFB1;PPM1D;TERT;NCBP2;HELZ;XPO5;HAT1;PCGF2;SETDB1;SRCAP;HNRNPA2B1;ERI1;CNOT3;POU5F1;ARID1A;POLR2B;CNOT10;NCBP1;SUV39H1;POLR2D;DDX17;PRKRA;SIN3A;EED;DGCR8;SMARCA5;MORF4L1;SMAD3;RBM4;METTL3;CNOT7;PUM2 geneontology_Biological_Process GO:0090224 regulation of spindle organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090224 35 19 6.91375061606703 2.74814656401483 5.89390728422678e-06 0.000158129901118521 1213;1778;3192;5347;7175;8243;8480;9126;10274;10460;10615;10735;22974;23636;25978;26054;29899;79598;128866 TPX2;PLK1;SPAG5;TACC3;GPSM2;SMC1A;SMC3;NUP62;TPR;STAG1;RAE1;HNRNPU;CEP97;CHMP4B;CLTC;CHMP2B;SENP6;STAG2;DYNC1H1 geneontology_Biological_Process GO:0050684 regulation of mRNA processing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0050684 100 39 19.7535731887629 1.97432634730539 6.36492502992247e-06 0.000169961512237694 580;891;904;1660;3178;3181;3190;3191;3192;4116;4686;4928;5725;5935;5936;6434;6626;6651;6732;7072;9589;9733;9810;10181;10262;10521;10657;10921;11051;11052;11338;22916;26528;27316;29890;57703;58517;79869;84991 CCNB1;BARD1;CPSF6;TIA1;SF3B4;DHX9;RBMX;HNRNPA1;RBM17;SNRPA;SART3;NCBP2;KHDRBS1;U2AF2;WTAP;RNPS1;HNRNPA2B1;HNRNPU;HNRNPL;SRPK1;CWC22;TRA2B;PTBP1;NCBP1;RBM25;DDX17;DAZAP1;CPSF7;RBM15B;RNF40;MAGOH;RBM5;RBM3;HNRNPK;NUDT21;NUP98;CCNT1;SON;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:0051310 metaphase plate congression http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051310 47 23 9.28417939871858 2.47733256890474 6.43067851202606e-06 0.00017073908725589 891;1062;1063;1778;3192;3833;3835;3837;8697;9928;10403;10615;11004;23636;25978;55143;55165;55166;81620;81930;83540;113130;128866 KIFC1;KIF2C;CCNB1;NUF2;CDCA8;CENPF;CDT1;CDCA5;NDC80;CEP55;SPAG5;KIF18A;KIF14;CENPE;CENPQ;KPNB1;NUP62;HNRNPU;KIF22;CHMP4B;CHMP2B;DYNC1H1;CDC23 geneontology_Biological_Process GO:1902275 regulation of chromatin organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902275 151 53 29.827895515032 1.77686018691095 6.45436577861869e-06 0.00017073908725589 672;891;1111;1786;1789;2648;3159;3192;3720;3976;4288;4302;4582;5595;6418;6598;6688;6871;7040;7175;7334;7422;8318;8473;8726;8971;9555;9682;9733;9739;9810;9869;10155;10270;11011;22823;22976;23028;23476;25836;25942;26147;29028;51366;54880;55170;55183;55201;55209;55818;63925;64324;90780 CCNB1;MKI67;CDC45;DNMT1;PHF19;CHEK1;BRCA1;HMGA1;ATAD2;DNMT3B;MTF2;MUC1;LIF;BCOR;PRMT6;H2AFY;PYGO2;TPR;SET;H1FX;KAT2A;TRIM28;SETD5;VEGFA;SART3;RIF1;TGFB1;SETDB1;KDM1A;HNRNPU;SMARCB1;MLLT6;SPI1;MAPK3;SIN3A;OGT;BRD4;EED;NIPBL;RNF40;UBE2N;JARID2;SETD1A;UBR5;MAP1S;PAXIP1;TLK2;NSD1;ZNF335;KDM3A;AKAP8;KDM4A;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0043543 protein acylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043543 171 58 33.7786101527846 1.71706295012315 8.12638082781092e-06 0.000213969497052268 86;672;675;1111;1386;1810;2033;2648;3054;3066;3976;4582;5562;5595;6418;6598;6659;6688;6871;6885;7040;7703;7862;8089;8202;8295;8473;8520;8607;8861;9329;9913;10445;10847;10902;10933;11177;22976;23326;23390;23774;25942;51230;51616;54107;55209;55274;55625;57551;57634;57673;79075;80018;80218;84140;90780;254887;340481 CHEK1;BRCA1;SOX4;ACTL6A;DSCC1;MUC1;LIF;HDAC2;PYGO2;SET;HCFC1;BEND3;POLE3;KAT2A;SETD5;MAP3K7;TGFB1;DR1;TRRAP;ZDHHC23;BRPF1;HAT1;YEATS4;PCGF2;SRCAP;BRCA2;MCRS1;TAF9B;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;PHF10;EP400;GTF3C4;BRD1;ZDHHC21;NAA25;BRD8;TAOK1;SUPT7L;MAPK3;SIN3A;BAZ1A;ATF2;LDB1;OGT;NCOA3;FAM161A;ZDHHC17;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PRKAA1;PAXIP1;PHF20;TADA2A;ZDHHC7 geneontology_Biological_Process GO:0006475 internal protein amino acid acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006475 130 47 25.6796451453918 1.83024335943498 8.64171245629208e-06 0.000226484880625322 86;672;675;1111;1386;1810;2033;2648;3054;3976;4582;5595;6418;6598;6688;6871;6885;7040;7703;7862;8089;8202;8295;8473;8520;8607;8861;9329;9913;10445;10847;10902;10933;11177;22976;23326;23774;25942;51230;51616;54107;55209;55274;57634;57673;80218;90780 CHEK1;BRCA1;ACTL6A;MUC1;LIF;PYGO2;SET;HCFC1;BEND3;POLE3;KAT2A;SETD5;MAP3K7;TGFB1;DR1;TRRAP;BRPF1;HAT1;YEATS4;PCGF2;SRCAP;BRCA2;MCRS1;TAF9B;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;PHF10;EP400;GTF3C4;BRD1;BRD8;SUPT7L;MAPK3;SIN3A;BAZ1A;ATF2;LDB1;OGT;NCOA3;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PAXIP1;PHF20;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:2001022 positive regulation of response to DNA damage stimulus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2001022 67 29 13.2348940364712 2.19117734679894 9.19225723294836e-06 0.000238703523833581 142;641;672;1660;1663;2140;2187;2305;3014;4862;5111;5366;5580;5883;6498;7334;7515;8914;9025;9521;9774;10097;10155;22976;25946;55183;161742;165918;200734 FOXM1;H2AFX;PCNA;BRCA1;TIMELESS;BLM;DDX11;PRKCD;NPAS2;SKIL;DHX9;TRIM28;SPRED1;RIF1;RAD9A;XRCC1;PMAIP1;PARP1;ZNF385A;ACTR2;RNF8;RNF168;EEF1E1;FANCB;UBE2N;BCLAF1;EYA3;PAXIP1;SPRED2 geneontology_Biological_Process GO:0048024 regulation of mRNA splicing, via spliceosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0048024 67 29 13.2348940364712 2.19117734679894 9.19225723294836e-06 0.000238703523833581 3178;3181;3190;3191;3192;4116;4686;4928;5725;5935;5936;6434;6651;6732;7072;9589;9733;10181;10262;10521;10657;10921;11338;26528;27316;29890;57703;58517;84991 TIA1;SF3B4;RBMX;HNRNPA1;RBM17;SART3;KHDRBS1;U2AF2;WTAP;RNPS1;HNRNPA2B1;HNRNPU;HNRNPL;SRPK1;CWC22;TRA2B;PTBP1;NCBP1;RBM25;DDX17;DAZAP1;RBM15B;MAGOH;RBM5;RBM3;HNRNPK;NUP98;SON;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:1904029 regulation of cyclin-dependent protein kinase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1904029 84 34 16.5930014785609 2.04905664860755 9.60606725530777e-06 0.000248310259051586 641;836;890;891;898;899;904;990;993;995;1019;1029;1030;1031;1032;1033;1050;1163;1164;2810;3843;5347;5716;6714;7128;8851;9088;9113;9133;9134;10527;10614;23560;57018 CDC6;CCNB2;PLK1;CCNB1;CCNA2;CCNE1;CDKN3;SFN;CDC25C;CKS2;PKMYT1;CDC25A;CDKN2A;CCNF;CDKN2C;BLM;CDK4;SRC;CCNE2;CKS1B;CDKN2D;TNFAIP3;IPO5;GTPBP4;LATS1;CASP3;IPO7;CDK5R1;CCNL1;HEXIM1;CDKN2B;PSMD10;CEBPA;CCNT1 geneontology_Biological_Process GO:0090305 nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090305 199 65 39.3096106456382 1.65353965435962 9.7896155920596e-06 0.00025190460848477 142;317;581;836;1478;1676;1763;2071;2237;2967;3148;3837;3921;4686;5111;5169;5394;5424;5426;5810;5883;5932;5982;5983;5984;5985;6036;6117;6118;6119;7247;7486;8450;9156;9557;9937;10714;10940;11051;11052;22916;23381;23404;23644;27340;29883;51010;51692;54487;54913;55775;57472;64421;64858;79869;79915;80153;81608;81875;90459;114034;146956;167227;255967;283989 HMGB2;EXO1;RFC4;FEN1;EME1;PCNA;POLD1;RBBP8;RFC3;RFC5;DNA2;ATAD5;POLD3;DCLRE1B;CSTF2;KPNB1;CPSF6;RFC2;TSEN54;CNOT6;RPA1;RNASE2;RAD1;APAF1;NCBP2;RAD9A;POLE;UTP20;GTF2H3;RPP25;ISG20L2;ERI1;PARP1;DCLRE1C;EXOSC2;EXOSC3;CASP3;WRN;EDC3;PAN3;EDC4;BAX;NCBP1;SMG5;TDP1;TSN;POP1;CPSF7;RPSA;DGCR8;CUL4B;CPSF3;DCP2;CHD1L;RPA2;EXOSC10;RPA3;NUDT21;ERCC3;TOE1;ENPP3;CNOT7;DCLRE1A;FIP1L1;DFFA geneontology_Biological_Process GO:1903311 regulation of mRNA metabolic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1903311 207 67 40.8898965007393 1.6385465783409 1.01028545882453e-05 0.000258788505991207 580;891;904;1660;1869;3178;3181;3184;3190;3191;3192;4116;4670;4686;4928;5578;5580;5725;5935;5936;6418;6434;6626;6651;6732;7072;7514;7534;7832;8570;9589;9704;9733;9810;10181;10236;10262;10492;10521;10642;10643;10644;10657;10921;10949;11051;11052;11187;11338;22916;23369;23404;23589;26528;27316;29883;29890;51010;55095;55795;56339;57703;58517;79869;84991;167227;399664 E2F1;CCNB1;IGF2BP2;BARD1;PRKCD;IGF2BP1;IGF2BP3;CPSF6;TIA1;SF3B4;SET;DHX9;RBMX;HNRNPA1;HNRNPR;RBM17;XPO1;SNRPA;SART3;YWHAZ;KHSRP;NCBP2;KHDRBS1;MEX3D;U2AF2;WTAP;RNPS1;HNRNPA2B1;HNRNPU;HNRNPD;HNRNPA0;HNRNPL;SRPK1;BTG2;EXOSC2;DHX34;EXOSC3;CWC22;TRA2B;PTBP1;HNRNPM;PCID2;SYNCRIP;NCBP1;SAMD4B;RBM25;DDX17;DAZAP1;PRKCA;CPSF7;RBM15B;RNF40;DCP2;PKP3;MAGOH;RBM5;RBM3;HNRNPK;NUDT21;NUP98;CCNT1;CARHSP1;SON;RBM4;METTL3;CNOT7;PUM2 geneontology_Biological_Process GO:0071156 regulation of cell cycle arrest http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071156 88 35 17.3831444061114 2.01344470150608 1.13076831809167e-05 0.000288345921113375 581;672;835;891;983;995;1017;1019;1820;1869;1874;2033;2305;2810;3276;4582;4849;5111;6659;6790;7027;7029;7040;7161;7832;8851;10498;11200;25904;25946;29883;51512;57472;115426;144455 FOXM1;CDK1;E2F1;CCNB1;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDK2;PCNA;BRCA1;SOX4;TFDP1;ARID3A;CDK4;CASP2;E2F7;MUC1;CHEK2;CNOT6;TP73;TGFB1;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;BTG2;EP300;UHRF2;CNOT10;BAX;CDK5R1;E2F4;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0032986 protein-DNA complex disassembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032986 20 13 3.95071463775259 3.29054391217565 1.28523580553708e-05 0.000326265466150018 3159;6418;6597;6598;6599;6601;6602;6604;6605;8289;11198;55193;92815 HMGA1;HIST3H2A;SMARCD1;SMARCC2;SMARCC1;SET;SUPT16H;SMARCB1;SMARCA4;ARID1A;PBRM1;SMARCE1;SMARCD3 geneontology_Biological_Process GO:0006298 mismatch repair http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006298 28 16 5.53100049285362 2.89278585685771 1.35882636893569e-05 0.000343406967613615 25;2956;3978;4436;4439;4595;5111;5378;6117;6118;6119;6996;7161;9156;10714;29072 EXO1;PCNA;LIG1;MSH2;POLD3;MSH6;TDG;RPA1;TP73;ABL1;PMS1;MSH5;MUTYH;SETD2;RPA2;RPA3 geneontology_Biological_Process GO:0031123 RNA 3'-end processing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031123 96 37 18.9634302612124 1.95112379407851 1.4950613979714e-05 0.000376157447729604 351;580;891;904;1478;1736;2091;3921;4116;4686;5433;6626;6741;7884;8563;9775;9810;9877;9984;10921;11051;11052;11338;22794;22916;23404;25896;51010;51692;55656;57187;65109;79869;81608;84321;90459;114034 CCNB1;BARD1;SLBP;CSTF2;CPSF6;UPF3B;DKC1;INTS8;SNRPA;THOC2;NCBP2;U2AF2;THOC1;RNPS1;ERI1;FBL;EIF4A3;EXOSC2;EXOSC3;APP;SSB;INTS7;NCBP1;CASC3;POLR2D;THOC5;CPSF7;RPSA;RNF40;CPSF3;MAGOH;ZC3H11A;NUDT21;TOE1;CCNT1;THOC3;FIP1L1 geneontology_Biological_Process GO:0070192 chromosome organization involved in meiotic cell cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070192 31 17 6.12360768851651 2.77614126585539 1.53435956563586e-05 0.000382643590355268 699;701;898;2177;4439;5888;5889;9134;9319;9918;10051;10592;23310;23353;23397;29781;83990 BUB1B;CCNE1;NCAPH;TRIP13;BUB1;SMC4;NCAPD2;RAD51;FANCD2;SMC2;BRIP1;CCNE2;NCAPD3;NCAPH2;RAD51C;SUN1;MSH5 geneontology_Biological_Process GO:0060236 regulation of mitotic spindle organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0060236 31 17 6.12360768851651 2.77614126585539 1.53435956563586e-05 0.000382643590355268 1213;1778;3192;5347;7175;8243;8480;9126;10274;10460;10735;22974;23636;25978;29899;79598;128866 TPX2;PLK1;TACC3;GPSM2;SMC1A;SMC3;NUP62;TPR;STAG1;RAE1;HNRNPU;CEP97;CHMP4B;CLTC;CHMP2B;STAG2;DYNC1H1 geneontology_Biological_Process GO:1900182 positive regulation of protein localization to nucleus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1900182 72 30 14.2225726959093 2.10932302062542 1.61676375998177e-05 0.000401425423037578 142;908;983;999;1736;1894;2316;3843;3976;4088;5347;5469;5580;5594;6714;6950;7015;7040;7175;10155;10445;10576;10694;22948;23607;29775;51366;51512;57506;84662 CDK1;PLK1;ECT2;GTSE1;GLIS2;PRKCD;SRC;LIF;FLNA;TPR;DKC1;TRIM28;CCT5;TGFB1;TERT;CD2AP;IPO5;CCT2;PARP1;MCRS1;CCT6A;CARD10;MAPK1;CDH1;MED1;TCP1;CCT8;UBR5;MAVS;SMAD3 geneontology_Biological_Process GO:0043967 histone H4 acetylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043967 46 22 9.08664366683095 2.42113598889178 1.62488546915363e-05 0.000401680202658457 86;672;675;2033;2648;3054;4582;6598;6688;8089;8295;8473;8520;8607;10445;10902;10933;23326;51230;57634;57673;80218 BRCA1;ACTL6A;MUC1;HCFC1;BEND3;KAT2A;TRRAP;HAT1;YEATS4;BRCA2;MCRS1;SMARCB1;SPI1;NAA50;EP300;EP400;BRD8;OGT;RUVBL1;USP22;MORF4L1;PHF20 geneontology_Biological_Process GO:0030866 cortical actin cytoskeleton organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030866 37 19 7.30882207984229 2.59959810109511 1.706469612206e-05 0.000420014107595572 752;1894;2036;2037;3993;3996;5341;6093;6242;7429;7430;7456;9493;10787;23433;29127;54443;114793;147179 ANLN;ECT2;KIF23;RACGAP1;VIL1;EPB41L2;EZR;PLEK;EPB41L1;RTKN;LLGL1;WIPF2;NCKAP1;FMNL1;FMNL2;WIPF1;RHOQ;LLGL2;ROCK1 geneontology_Biological_Process GO:0140056 organelle localization by membrane tethering http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0140056 133 47 26.2722523410547 1.78895967463569 1.7285685066204e-05 0.00042361152883022 858;983;1453;1778;1781;2054;4751;4957;5116;5341;5347;6616;6804;6809;6813;6857;7277;7283;8417;8481;8675;9545;9657;9793;9814;10228;10652;10733;10890;11190;11311;22919;22981;22995;51762;54820;55125;55142;55722;55835;79598;80184;84131;115106;117177;121441;203068 CDK1;PLK1;NEK2;PLK4;TUBG1;SNAP25;MAPRE1;HAUS1;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;TUBB;NEDD1;STX3;SYT1;PLEK;RAB3D;CEP78;CEP72;STX2;SFI1;CEP192;CEP250;OFD1;STX6;NINL;ODF2;RAB8B;CSNK1D;STX16;CEP152;HAUS2;RAB3IP;PCNT;CAV2;CEP97;RAB10;STX1A;STXBP2;TUBA4A;YKT6;CEP290;DYNC1H1;STX7;VPS45;DYNC1I2 geneontology_Biological_Process GO:0006342 chromatin silencing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006342 59 26 11.6546081813701 2.23087722859366 1.79515188567514e-05 0.000438032535552024 1786;1788;3065;3066;3070;3159;6839;7703;8289;8318;8467;8493;8520;8726;8971;9555;9869;10155;10933;11176;25942;29028;54107;55183;57673;84444 CDC45;DNMT1;HELLS;HMGA1;ATAD2;BAZ2A;H2AFY;HDAC2;DOT1L;DNMT3A;H1FX;BEND3;POLE3;HDAC1;TRIM28;RIF1;PPM1D;HAT1;PCGF2;SETDB1;ARID1A;SUV39H1;SIN3A;EED;SMARCA5;MORF4L1 geneontology_Biological_Process GO:0031061 negative regulation of histone methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031061 18 12 3.55564317397733 3.37491683300067 1.92747719963693e-05 0.000468302507602775 672;1786;1789;3720;4302;6598;9555;9682;22823;54880;55170;55818 DNMT1;BRCA1;DNMT3B;MTF2;BCOR;PRMT6;H2AFY;SMARCB1;MLLT6;JARID2;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0007127 meiosis I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007127 56 25 11.0620009857072 2.25998895067009 1.97343070706957e-05 0.000477418428748753 641;675;898;994;1164;2177;4439;4603;5347;5885;5888;5889;6118;6790;7153;7155;9134;9232;9319;9700;23353;26271;80010;83990;146956 TOP2A;PLK1;PTTG1;CCNE1;TRIP13;RAD51;AURKA;CKS2;ESPL1;FANCD2;EME1;CDC25B;FBXO5;BLM;BRIP1;CCNE2;RAD21;RMI1;RAD51C;MYBL1;SUN1;TOP2B;BRCA2;MSH5;RPA2 geneontology_Biological_Process GO:0000380 alternative mRNA splicing, via spliceosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000380 47 22 9.28417939871858 2.36962245721323 2.48888497296207e-05 0.000599556503486735 1660;3178;3191;3192;4116;4670;5725;5936;6421;6434;9589;9733;10181;10521;10657;10921;23028;27316;29890;51319;58517;84991 SFPQ;DHX9;RBMX;HNRNPA1;RBM17;SART3;KHDRBS1;WTAP;RNPS1;KDM1A;HNRNPU;HNRNPL;RSRC1;TRA2B;PTBP1;HNRNPM;RBM25;DDX17;RBM15B;MAGOH;RBM5;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:0030865 cortical cytoskeleton organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030865 41 20 8.0989650073928 2.46945134122 2.73101830632339e-05 0.000655097230173588 752;1894;2036;2037;3993;3996;5341;6093;6242;7429;7430;7456;9493;10787;23433;29127;54443;59341;114793;147179 ANLN;ECT2;KIF23;RACGAP1;VIL1;EPB41L2;EZR;PLEK;EPB41L1;RTKN;LLGL1;WIPF2;NCKAP1;FMNL1;FMNL2;TRPV4;WIPF1;RHOQ;LLGL2;ROCK1 geneontology_Biological_Process GO:0071459 protein localization to chromosome, centromeric region http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071459 16 11 3.16057171020207 3.48038298403194 2.83507035689912e-05 0.000677187058666916 701;983;1058;7272;9184;9212;10403;27085;55166;55920;81620 CDK1;AURKB;BUB1B;CDT1;CENPA;NDC80;TTK;RCC2;CENPQ;MTBP;BUB3 geneontology_Biological_Process GO:1904356 regulation of telomere maintenance via telomere lengthening http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1904356 51 23 10.0743223262691 2.28303197526516 3.45281861735547e-05 0.000821277571128122 142;908;1736;3178;3181;3192;4216;4751;5394;5570;5594;5595;6714;6950;7520;9212;10576;10694;22948;23381;55226;65057;167227 NEK2;AURKB;SRC;PKIB;HNRNPA1;DKC1;CCT5;CCT2;HNRNPA2B1;PARP1;HNRNPU;CCT6A;MAP3K4;ACD;MAPK1;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5;DCP2;EXOSC10;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0006271 DNA strand elongation involved in DNA replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006271 14 10 2.76550024642681 3.61598232107214 4.05250170817384e-05 0.000955883840415504 1763;2237;3978;5111;5422;5426;5983;5984;51659;84296 RFC4;FEN1;GINS2;PCNA;LIG1;GINS4;RFC3;POLA1;DNA2;POLE geneontology_Biological_Process GO:0007076 mitotic chromosome condensation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007076 14 10 2.76550024642681 3.61598232107214 4.05250170817384e-05 0.000955883840415504 9918;10051;10270;10592;23310;23397;25836;51203;64151;113130 NUSAP1;NCAPG;CDCA5;NCAPH;SMC4;NCAPD2;SMC2;NCAPD3;NIPBL;AKAP8 geneontology_Biological_Process GO:0008156 negative regulation of DNA replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008156 30 16 5.92607195662888 2.69993346640053 4.33718908607883e-05 0.00101457964530133 641;675;990;2956;6282;7270;8243;8914;9126;10735;11200;23244;23560;26271;51053;54962 CDC6;FBXO5;TIMELESS;BLM;S100A11;GMNN;SMC1A;SMC3;CHEK2;MSH6;TIPIN;GTPBP4;BRCA2;PDS5A;TTF1;STAG2 geneontology_Biological_Process GO:0045911 positive regulation of DNA recombination http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045911 30 16 5.92607195662888 2.69993346640053 4.33718908607883e-05 0.00101457964530133 641;2187;2956;4436;7037;7040;7158;7292;7374;7486;10097;22976;23529;51010;55183;79915 MSH2;BLM;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;ACTR2;EXOSC3;WRN;TP53BP1;FANCB;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0007080 mitotic metaphase plate congression http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007080 39 19 7.70389354361755 2.46628537796202 4.42958058829435e-05 0.00103192821853228 891;1062;3192;3833;3835;3837;8697;9928;10403;11004;23636;25978;55143;55165;81620;81930;83540;113130;128866 KIFC1;KIF2C;CCNB1;NUF2;CDCA8;CDT1;CDCA5;NDC80;CEP55;KIF18A;KIF14;CENPE;KPNB1;NUP62;HNRNPU;KIF22;CHMP4B;CHMP2B;CDC23 geneontology_Biological_Process GO:0001701 in utero embryonic development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001701 269 80 53.1371118777723 1.50553910765829 4.73797338429449e-05 0.00109924866100373 86;90;91;100;102;675;841;891;1050;1999;2186;2260;2263;2648;2885;3054;3091;3276;3688;3880;3976;4071;4088;4097;4188;4436;4678;4751;4849;4851;4952;5335;5460;5469;5594;5930;5932;6491;6498;6670;6692;6789;6928;7046;7403;7422;7516;7703;7855;9113;9133;9915;10018;10155;10653;10672;10733;11232;23462;25942;27173;29072;54880;54892;55723;57178;57498;57534;57679;57680;63925;79718;79728;84295;84296;90780;113026;123920;144455;149473 CCNB2;ASF1B;CCNB1;NEK2;SPINT1;KRT19;NCAPG2;XRCC2;PLK4;STIL;FGFR2;RBBP8;MSH2;GINS4;NASP;SPINT2;ACTL6A;ARNT2;E2F7;LIF;HIF1A;SKIL;BCOR;PYGO2;HCFC1;SP3;HNF1B;KAT2A;BCL2L11;TRIM28;ADA;VEGFA;CMTM3;ZMIZ1;NOTCH1;PALB2;POLG2;STK4;MIB1;ITGB1;FZD5;SLC39A1;BPTF;PRMT1;PCGF2;PLCG1;CNOT3;BRCA2;KDM6A;GNA13;ACVR1;PLCD3;PHF6;TBL1XR1;POU5F1;CASP8;LATS1;ADAM10;ACVR1B;MAPK1;MAFG;MED1;GRB2;CHD8;CCDC24;SETD2;SIN3A;OCRL;RBBP6;HEY1;CEBPA;TGFBR1;ALS2;SMAD3;TM4SF1;MDFI;FGFR1;ZNF335;KIDINS220;ELF3 geneontology_Biological_Process GO:0000018 regulation of DNA recombination http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000018 69 28 13.6299655002464 2.05429720269606 5.44886708777614e-05 0.0012590219013837 641;1111;2071;2187;2956;3838;4436;5888;6118;7037;7040;7158;7292;7374;7486;8971;9466;9984;10097;10635;10721;22976;23028;23529;29072;51010;55183;79915 RAD51AP1;RAD51;KPNA2;CHEK1;MSH2;BLM;POLQ;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;H1FX;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;KDM1A;ACTR2;EXOSC3;WRN;TP53BP1;SETD2;FANCB;RPA2;PAXIP1;ERCC3 geneontology_Biological_Process GO:0090231 regulation of spindle checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090231 12 9 2.37042878265155 3.79678143712575 5.54026374615102e-05 0.00125957562517915 891;4085;7175;7517;10403;51143;51451;55795;81620 CCNB1;CDT1;NDC80;MAD2L1;XRCC3;TPR;PCID2;DYNC1LI1;LCMT1 geneontology_Biological_Process GO:0090266 regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090266 12 9 2.37042878265155 3.79678143712575 5.54026374615102e-05 0.00125957562517915 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1778;3192;5347;7175;8243;9126;10274;10615;10735;25978;26054;29899;79598;128866 PLK1;SPAG5;GPSM2;SMC1A;SMC3;TPR;STAG1;HNRNPU;CEP97;CHMP4B;CHMP2B;SENP6;STAG2;DYNC1H1 geneontology_Biological_Process GO:0007050 cell cycle arrest http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007050 198 62 39.1120749137506 1.58518820943971 6.49791428488644e-05 0.00145394042556293 25;580;581;672;835;891;983;995;1017;1019;1029;1030;1031;1032;1033;1820;1869;1874;1982;2033;2305;2810;3276;4088;4291;4436;4582;4849;4851;4853;5036;5111;5496;5562;5608;6498;6659;6790;7027;7029;7040;7046;7161;7832;8556;8851;9585;10498;10657;11180;11200;25904;25946;27085;29883;51512;57472;58528;64121;84687;115426;144455 FOXM1;CDK1;E2F1;CCNB1;CDKN3;GTSE1;SFN;CDC25C;AURKA;CDKN2A;CDKN2C;CDK2;PCNA;BRCA1;SOX4;MSH2;TFDP1;BARD1;ARID3A;CDK4;KIF20B;CASP2;E2F7;MUC1;CHEK2;SKIL;CNOT6;NOTCH2;TP73;WDR6;CDKN2D;TGFB1;PPP1R9B;NOTCH1;ABL1;KHDRBS1;PRMT1;CNOT3;ZNF385A;PPM1G;BTG2;EP300;RRAGD;MTBP;PA2G4;UHRF2;EIF4G2;CNOT10;BAX;CDK5R1;CDKN2B;MLF1;CDC14A;TGFBR1;E2F4;RRAGC;SMAD3;PRKAA1;MAP2K6;CARM1;CNOT7;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0007015 actin filament organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007015 313 90 61.828684080828 1.45563505576706 6.58693306148095e-05 0.00146805622287573 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STMN1;VIL1;NCK2;CAPG;ARHGEF2;MARCKS;WASF1;PRKCD;SH3BP1;PFN2;CIT;SRC;TPM4;DBN1;EZR;PRKCI;NEB;PYCARD;LIMK1;ADD3;DIAPH3;TMSB10;PLEKHG2;F2RL1;MICAL1;PLEK;FLNA;ALDOA;TPM3;USH1C;ICAM1;VASP;RHOV;ARHGAP18;PACSIN1;PAK1;PPP1R9B;ABL1;ITGB1;CD2AP;S100A10;ABI2;RAC2;CAPZA1;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;WASF2;ACTR2;MKKS;ZYX;SH3PXD2B;SWAP70;FSCN1;ACTR3;LATS1;ACTN4;INPPL1;NEBL;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;PDCD10;CDC42EP4;LIMA1;LCP1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;SSH2;ITGB1BP1;TRPV4;MTPN;TESK1;TPM2;PPP1R9A;TGFBR1;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;RHOQ;BAG4;ROCK1;ARPC2;PXN;ARHGAP17;RHOBTB2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0043484 regulation of RNA splicing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043484 91 34 17.9757516017743 1.89143690640697 6.87878432135136e-05 0.00152709011934 1196;3178;3181;3187;3190;3191;3192;4116;4686;4928;5725;5935;5936;6434;6651;6732;7072;9589;9733;10181;10262;10521;10657;10921;11338;23076;26528;27316;29890;51755;57703;58155;58517;84991 HNRNPH1;TIA1;SF3B4;CLK2;RBMX;HNRNPA1;RBM17;SART3;KHDRBS1;U2AF2;WTAP;RNPS1;HNRNPA2B1;HNRNPU;HNRNPL;SRPK1;CWC22;RRP1B;TRA2B;CDK12;PTBP1;NCBP1;RBM25;DDX17;DAZAP1;PTBP2;RBM15B;MAGOH;RBM5;RBM3;HNRNPK;NUP98;SON;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:0006268 DNA unwinding involved in DNA replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006268 10 8 1.97535731887629 4.0499001996008 7.02457007240032e-05 0.00155336293671321 3159;4171;4173;4175;4176;5888;6117;6118 MCM2;MCM6;MCM4;RAD51;MCM7;HMGA1;RPA1;RPA2 geneontology_Biological_Process GO:0030261 chromosome condensation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030261 34 17 6.7162148841794 2.5311876247505 7.35656269771345e-05 0.00162044752652747 891;983;7153;8971;9918;10051;10270;10592;22985;23310;23397;25836;29781;51203;54892;64151;113130 TOP2A;CDK1;NUSAP1;CCNB1;NCAPG;CDCA5;NCAPH;SMC4;NCAPD2;NCAPG2;SMC2;NCAPD3;NCAPH2;H1FX;ACIN1;NIPBL;AKAP8 geneontology_Biological_Process GO:0010833 telomere maintenance via telomere lengthening http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010833 70 28 13.8275012321341 2.0249500998004 7.38939261550886e-05 0.0016213477100419 142;908;1736;3178;3181;3192;4216;4751;5394;5570;5594;5595;5888;6117;6118;6714;6950;7015;7520;9212;10576;10694;22948;23381;55226;64858;65057;167227 NEK2;AURKB;RAD51;SRC;PKIB;DCLRE1B;RPA1;HNRNPA1;DKC1;CCT5;TERT;CCT2;HNRNPA2B1;PARP1;HNRNPU;CCT6A;MAP3K4;ACD;MAPK1;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5;DCP2;RPA2;EXOSC10;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0060271 cilium assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0060271 223 68 44.0504682109414 1.54368393258326 7.41793069953811e-05 0.0016213477100419 983;1453;1778;1781;1874;1951;2302;2316;3175;3797;3911;4751;4851;4952;4957;5116;5347;6674;7277;7283;8195;8481;9657;9696;9793;9814;10096;10097;10733;11138;11190;22919;22981;22995;23216;25930;26160;27148;50807;51668;51762;54820;54874;55081;55125;55142;55212;55329;55704;55722;55835;57216;57560;65999;79582;79598;79734;80184;84131;84140;90355;92344;115106;117177;117178;121441;203068;219844 CDK1;PLK1;NEK2;KCTD17;FOXJ1;PLK4;TUBG1;MNS1;C5orf30;MAPRE1;HAUS1;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;IFT80;TUBB;NEDD1;CCDC88A;ASAP1;FLNA;CEP78;IFT57;CEP72;GORAB;SFI1;FNBP1L;CEP192;CEP250;KIF3C;OFD1;LAMA5;NOTCH1;SSX2IP;NINL;SPAG1;ODF2;RAB8B;CSNK1D;CEP152;HAUS2;RAB3IP;ACTR2;MKKS;TBC1D8;ONECUT1;HSPB11;PCNT;IFT172;ACTR3;PTPN23;CEP97;STK36;SPAG16;OCRL;CELSR3;BBS7;TBC1D1;VANGL2;LRRC61;FAM161A;TUBA4A;E2F4;CEP290;DYNC1H1;DYNC1I2;CROCC;HYLS1 geneontology_Biological_Process GO:0032204 regulation of telomere maintenance http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032204 67 27 13.2348940364712 2.04006166770936 8.4951961196067e-05 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47;102;226;230;240;302;317;427;823;961;963;965;1075;1265;1315;1520;1535;1536;1650;1778;2150;2171;2207;2212;2547;2896;2919;2950;2992;3310;3482;3606;3608;3684;3685;3687;3689;3837;3903;3958;4318;4332;4758;4860;4893;5036;5328;5329;5337;5580;5594;5646;5708;5717;5724;5768;5834;5912;6036;6093;6279;6280;6282;6286;6372;6590;6616;6813;6850;6993;7077;7097;7130;7226;7305;7414;7520;8560;8826;8904;9545;10075;10097;10213;10493;10576;10694;10890;10970;11031;23406;25801;25852;29108;51143;54918;55832;79980;80184;80331;83858;114790;201294;203068;258010 DSN1;MMP9;PRSS3;S100A11;CKAP4;PRKCD;SNAP25;CXCL1;S100P;PYCARD;FABP5;TUBB;CYBA;S100A9;KPNB1;F2RL1;PLAUR;ITGAV;IQGAP1;NRAS;RAB3D;CTSC;ALDOA;PNP;ALOX5;QSOX1;TIMP2;GCA;FCER1G;RNASE2;ACLY;RAP2B;ILF2;APAF1;ITGAM;CYBB;SLPI;DEGS1;CXCL6;FCGR2A;CAND1;CPNE1;CCT2;SYK;HSPA6;LGALS3;PLD1;VCL;ACTR2;TLR2;DDOST;PA2G4;COPB1;ADAM10;TNFAIP6;GRN;ITGB2;MAPK1;CD53;CTSS;PLAU;PTAFR;LAIR1;DNAJC5;ANXA2;PYGB;VAT1;RAB10;IGF2R;COTL1;MNDA;HUWE1;ASAH1;CCT8;UNC13D;STXBP2;XRCC5;IL18;GYG1;DYNLT1;TRPM2;CNN2;S100A8;ATAD3B;RAB31;PSMD11;CD58;NEU1;CD47;ITGAX;PSMD2;SVIP;CEP290;DYNC1H1;ARMC8;ALDOC;GSTP1;ROCK1;PSMD14;STK11IP;TYROBP;XRCC6;CMTM6;CAPN1;DYNC1LI1 geneontology_Biological_Process GO:0032210 regulation of telomere maintenance via telomerase http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032210 47 21 9.28417939871858 2.26191234552172 8.88118759765355e-05 0.00191165030381433 908;1736;3178;3192;4216;4751;5394;5570;5594;5595;6714;6950;7520;9212;10576;10694;22948;23381;55226;65057;167227 NEK2;AURKB;SRC;PKIB;HNRNPA1;DKC1;CCT5;CCT2;HNRNPU;CCT6A;MAP3K4;ACD;MAPK1;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5;DCP2;EXOSC10;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0001841 neural tube formation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001841 85 32 16.7905372104485 1.90583538804743 9.40935917974617e-05 0.00201766599683875 25;317;1856;1857;2348;2648;3091;6491;6659;6692;6789;7040;7248;7403;7408;8289;8321;8323;8463;8915;9585;9968;10653;11146;25902;26160;29072;54910;55081;57216;57534;65979 SPINT1;STIL;SOX4;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;HIF1A;DVL3;IFT57;FOLR1;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;STK4;ABL1;MIB1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4 geneontology_Biological_Process GO:1990823 response to leukemia inhibitory factor http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1990823 78 30 15.4077870872351 1.94706740365423 9.78830672317965e-05 0.00207534098726292 688;1385;1974;2731;3099;3192;3383;3720;4144;4605;4691;5214;5277;7037;7520;7805;8467;8726;8731;9242;9774;10678;11156;11235;22823;51444;54836;55183;55818;84159 MYBL2;KLF5;MTF2;MAT2A;TFRC;HK2;BSPRY;GLDC;RNF138;PIGA;ICAM1;RIF1;PFKP;HNRNPU;LAPTM5;ARID5B;RNMT;NCL;PDCD10;MSC;EIF4A2;EED;XRCC5;CREB1;SMARCA5;JARID2;BCLAF1;PTP4A3;KDM3A;B3GNT2 geneontology_Biological_Process GO:1990830 cellular response to leukemia inhibitory factor http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1990830 78 30 15.4077870872351 1.94706740365423 9.78830672317965e-05 0.00207534098726292 688;1385;1974;2731;3099;3192;3383;3720;4144;4605;4691;5214;5277;7037;7520;7805;8467;8726;8731;9242;9774;10678;11156;11235;22823;51444;54836;55183;55818;84159 MYBL2;KLF5;MTF2;MAT2A;TFRC;HK2;BSPRY;GLDC;RNF138;PIGA;ICAM1;RIF1;PFKP;HNRNPU;LAPTM5;ARID5B;RNMT;NCL;PDCD10;MSC;EIF4A2;EED;XRCC5;CREB1;SMARCA5;JARID2;BCLAF1;PTP4A3;KDM3A;B3GNT2 geneontology_Biological_Process GO:1905269 positive regulation of chromatin organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1905269 78 30 15.4077870872351 1.94706740365423 9.78830672317965e-05 0.00207534098726292 672;891;1786;1789;2648;3720;3976;4582;5595;6598;6871;7040;7175;7334;7422;8473;8726;9733;9810;9869;10155;10270;22823;22976;23028;23476;25836;25942;26147;55183 CCNB1;DNMT1;PHF19;BRCA1;DNMT3B;MTF2;MUC1;LIF;TPR;KAT2A;TRIM28;VEGFA;SART3;RIF1;TGFB1;SETDB1;KDM1A;SMARCB1;MAPK3;SIN3A;OGT;BRD4;EED;NIPBL;RNF40;UBE2N;JARID2;PAXIP1;AKAP8;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0006284 base-excision repair http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006284 41 19 8.0989650073928 2.345978774159 0.000104728592818182 0.00220397235666813 1763;2237;3159;3978;4595;5424;5426;6117;6118;6119;6996;7374;7486;7515;9401;10038;10075;10721;55170 FEN1;RECQL4;HMGA1;POLD1;LIG1;POLQ;DNA2;PRMT6;UNG;TDG;RPA1;POLE;XRCC1;PARP2;WRN;MUTYH;HUWE1;RPA2;RPA3 geneontology_Biological_Process GO:0000731 DNA synthesis involved in DNA repair http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000731 41 19 8.0989650073928 2.345978774159 0.000104728592818182 0.00220397235666813 641;1032;5111;5422;5424;5426;5427;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;7486;10714;51455;51514;55666 DTL;RFC4;PCNA;POLD1;BLM;POLE2;RFC3;POLA1;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;CDKN2D;POLE;WRN;REV1;RPA2;RPA3;NPLOC4 geneontology_Biological_Process GO:0036230 granulocyte activation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0036230 385 106 76.0512567767373 1.39379682194053 0.000106782932545846 0.0022388821523779 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geneontology_Biological_Process GO:0043299 leukocyte degranulation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043299 412 112 81.3847215377033 1.376179679476 0.000120805586546258 0.00251426626999399 47;102;136;226;230;240;302;317;427;823;867;961;963;965;1075;1265;1315;1520;1535;1536;1650;1778;2150;2171;2207;2212;2242;2547;2896;2919;2950;2992;3055;3310;3482;3566;3608;3684;3685;3687;3689;3837;3903;3958;3965;4318;4332;4758;4860;4893;5036;5328;5329;5337;5580;5594;5646;5708;5717;5724;5768;5834;5880;5912;6036;6093;6279;6280;6282;6284;6286;6590;6616;6813;6850;6993;7077;7097;7130;7226;7305;7414;7520;8560;8826;8904;9545;10075;10097;10213;10493;10576;10694;10890;10970;11031;11151;23406;25801;25852;29108;51143;54918;55832;79980;80184;80331;83858;114790;201294;203068;258010 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FOXM1;RAD51AP1;RAD51;H2AFX;PCNA;CHEK1;BRCA1;TIMELESS;BLM;USP1;DDX11;POLQ;DEK;NPAS2;DHX9;TRIM28;RIF1;XRCC1;KDM1A;PARP1;ACTR2;RNF8;TP53BP1;RNF168;SETD2;FANCB;UBE2N;UBR5;EYA3;RPA2 geneontology_Biological_Process GO:0038094 Fc-gamma receptor signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0038094 72 28 14.2225726959093 1.96870148591705 0.000132227653845574 0.00271210416094127 25;71;961;2207;2212;2214;2885;2889;3055;3984;5058;5335;5580;5594;5595;6714;6850;7456;7525;10094;10096;10097;10109;10163;10451;10787;63916;147179 PRKCD;SRC;LIMK1;FCGR3A;FCER1G;PAK1;ABL1;FCGR2A;SYK;PLCG1;WIPF2;NCKAP1;WASF2;ACTR2;ACTR3;ACTG1;MAPK1;YES1;ARPC3;GRB2;MAPK3;HCK;ELMO2;RAPGEF1;CD47;WIPF1;ARPC2;VAV3 geneontology_Biological_Process GO:0044782 cilium organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0044782 227 68 44.8406111384919 1.51648245359501 0.00013468249707449 0.0027524823680097 983;1453;1778;1781;1874;1951;2302;2316;3175;3797;3911;4751;4851;4952;4957;5116;5347;6674;7277;7283;8195;8481;9657;9696;9793;9814;10096;10097;10733;11138;11190;22919;22981;22995;23216;25930;26160;27148;50807;51668;51762;54820;54874;55081;55125;55142;55212;55329;55704;55722;55835;57216;57560;65999;79582;79598;79734;80184;84131;84140;90355;92344;115106;117177;117178;121441;203068;219844 CDK1;PLK1;NEK2;KCTD17;FOXJ1;PLK4;TUBG1;MNS1;C5orf30;MAPRE1;HAUS1;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;IFT80;TUBB;NEDD1;CCDC88A;ASAP1;FLNA;CEP78;IFT57;CEP72;GORAB;SFI1;FNBP1L;CEP192;CEP250;KIF3C;OFD1;LAMA5;NOTCH1;SSX2IP;NINL;SPAG1;ODF2;RAB8B;CSNK1D;CEP152;HAUS2;RAB3IP;ACTR2;MKKS;TBC1D8;ONECUT1;HSPB11;PCNT;IFT172;ACTR3;PTPN23;CEP97;STK36;SPAG16;OCRL;CELSR3;BBS7;TBC1D1;VANGL2;LRRC61;FAM161A;TUBA4A;E2F4;CEP290;DYNC1H1;DYNC1I2;CROCC;HYLS1 geneontology_Biological_Process GO:0035148 tube formation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0035148 120 41 23.7042878265155 1.72964487691284 0.000137924791020705 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cytoskeleton-dependent cytokinesis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0061640 83 31 16.3954657466732 1.89076665945218 0.000142738688697852 0.00288587041685193 675;1058;1894;3619;3925;5347;6242;6651;9094;9212;9493;9585;9700;10096;10097;10112;11021;11113;23636;24137;25978;26586;29127;51203;54443;55165;81620;84445;114327;128866;129531 NUSAP1;KIF4A;PLK1;ANLN;KIF20A;AURKB;ECT2;CDT1;CENPA;KIF23;CEP55;STMN1;RACGAP1;ESPL1;INCENP;CKAP2;KIF20B;CIT;NUP62;UNC119;RTKN;LZTS2;BRCA2;EFHC1;ACTR2;MITD1;ACTR3;RAB35;CHMP4B;CHMP2B;SON geneontology_Biological_Process GO:0006303 double-strand break repair via nonhomologous end joining http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006303 55 23 10.8644652538196 2.11699328615496 0.000144365321299356 0.00288781655079736 580;641;672;2547;3014;5422;5591;7158;7334;7515;7520;7913;9025;9656;9937;10097;10213;10721;22976;55183;64421;64858;165918 H2AFX;BRCA1;BLM;POLA1;BARD1;POLQ;DEK;MDC1;PRKDC;DCLRE1B;RIF1;XRCC1;DCLRE1C;ACTR2;RNF8;TP53BP1;RNF168;UBE2N;XRCC5;PAXIP1;PSMD14;DCLRE1A;XRCC6 geneontology_Biological_Process GO:0002562 somatic diversification of immune receptors via germline recombination within a single locus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002562 55 23 10.8644652538196 2.11699328615496 0.000144365321299356 0.00288781655079736 2956;3148;3978;4436;5591;6929;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;64421;79915;165918 HMGB2;EXO1;LIG1;MSH2;ATAD5;PRKDC;TFRC;MSH6;TCF3;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;DCLRE1C;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0016444 somatic cell DNA recombination http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016444 55 23 10.8644652538196 2.11699328615496 0.000144365321299356 0.00288781655079736 2956;3148;3978;4436;5591;6929;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;64421;79915;165918 HMGB2;EXO1;LIG1;MSH2;ATAD5;PRKDC;TFRC;MSH6;TCF3;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;DCLRE1C;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0000076 DNA replication checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000076 13 9 2.56796451453918 3.50472132657761 0.000148369158889494 0.00295745707208953 990;1763;5883;8318;8914;11073;54962;63967;81620 CDC6;CDT1;CDC45;TIMELESS;TOPBP1;CLSPN;DNA2;TIPIN;RAD9A geneontology_Biological_Process GO:0002431 Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002431 76 29 15.0127156234598 1.93169581888854 0.000149780349995243 0.00297511074148446 25;71;961;2207;2212;2214;2885;2889;3055;3984;5058;5335;5359;5580;5594;5595;6714;6850;7456;7525;10094;10096;10097;10109;10163;10451;10787;63916;147179 PRKCD;SRC;LIMK1;FCGR3A;PLSCR1;FCER1G;PAK1;ABL1;FCGR2A;SYK;PLCG1;WIPF2;NCKAP1;WASF2;ACTR2;ACTR3;ACTG1;MAPK1;YES1;ARPC3;GRB2;MAPK3;HCK;ELMO2;RAPGEF1;CD47;WIPF1;ARPC2;VAV3 geneontology_Biological_Process GO:0043312 neutrophil degranulation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043312 371 102 73.2857565303105 1.39181206320513 0.000151973076645828 0.00300811044367844 47;102;226;230;240;302;317;427;823;961;963;965;1075;1265;1315;1520;1535;1536;1650;1778;2171;2207;2212;2547;2896;2919;2950;2992;3310;3482;3608;3684;3685;3687;3689;3837;3903;3958;4318;4332;4758;4860;4893;5036;5328;5329;5337;5580;5594;5646;5708;5717;5724;5768;5834;5912;6036;6093;6279;6280;6282;6286;6590;6616;6813;6850;6993;7077;7097;7130;7226;7305;7414;7520;8560;8826;8904;9545;10075;10097;10213;10493;10576;10694;10890;10970;11031;23406;25801;25852;29108;51143;54918;55832;79980;80184;80331;83858;114790;201294;203068;258010 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ECT2;STMN1;VIL1;NCK2;CAPG;WASF1;PRKCD;SH3BP1;PFN2;CIT;EZR;NEB;PYCARD;LIMK1;ADD3;TMSB10;PLEKHG2;F2RL1;CCDC88A;PLEK;FLNA;ICAM1;VASP;ARHGAP18;PAK1;TGFB1;ABL1;CD2AP;S100A10;ABI2;ARHGEF19;CAPZA1;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;WASF2;ACTR2;MKKS;SH3PXD2B;SWAP70;FSCN1;ACTR3;LATS1;FES;CDK5R1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;TAOK1;CDC42EP4;LIMA1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;SSH2;ITGB1BP1;MTPN;TESK1;TRPM2;VANGL2;EFNA5;PPP1R9A;TGFBR1;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;RHOQ;BAG4;ROCK1;ARPC2;PXN;ARHGAP17;RHOBTB2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0016574 histone ubiquitination http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016574 42 19 8.29650073928043 2.29012213667902 0.000156118663505511 0.00305808911454913 4591;6045;7324;7334;7703;8450;9025;9810;10075;10336;23028;23326;23512;29128;51322;51366;54880;56970;165918 UHRF1;SUZ12;BCOR;ATXN7L3;TRIM37;PCGF2;KDM1A;UBE2E1;RNF8;RNF168;RNF2;HUWE1;PCGF3;RNF40;UBE2N;CUL4B;WAC;UBR5;USP22 geneontology_Biological_Process GO:0002283 neutrophil activation involved in immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002283 372 102 73.4832922621981 1.38807063292769 0.000169647457458288 0.00331163536783231 47;102;226;230;240;302;317;427;823;961;963;965;1075;1265;1315;1520;1535;1536;1650;1778;2171;2207;2212;2547;2896;2919;2950;2992;3310;3482;3608;3684;3685;3687;3689;3837;3903;3958;4318;4332;4758;4860;4893;5036;5328;5329;5337;5580;5594;5646;5708;5717;5724;5768;5834;5912;6036;6093;6279;6280;6282;6286;6590;6616;6813;6850;6993;7077;7097;7130;7226;7305;7414;7520;8560;8826;8904;9545;10075;10097;10213;10493;10576;10694;10890;10970;11031;23406;25801;25852;29108;51143;54918;55832;79980;80184;80331;83858;114790;201294;203068;258010 DSN1;MMP9;PRSS3;S100A11;CKAP4;PRKCD;SNAP25;CXCL1;S100P;PYCARD;FABP5;TUBB;CYBA;S100A9;KPNB1;PLAUR;ITGAV;IQGAP1;NRAS;RAB3D;CTSC;ALDOA;PNP;ALOX5;QSOX1;TIMP2;GCA;FCER1G;RNASE2;ACLY;RAP2B;ILF2;APAF1;ITGAM;CYBB;SLPI;DEGS1;FCGR2A;CAND1;CPNE1;CCT2;SYK;HSPA6;LGALS3;PLD1;VCL;ACTR2;TLR2;DDOST;PA2G4;COPB1;ADAM10;TNFAIP6;GRN;ITGB2;MAPK1;CD53;CTSS;PLAU;PTAFR;LAIR1;DNAJC5;ANXA2;PYGB;VAT1;RAB10;IGF2R;COTL1;MNDA;HUWE1;ASAH1;CCT8;UNC13D;STXBP2;XRCC5;GYG1;DYNLT1;TRPM2;CNN2;S100A8;ATAD3B;RAB31;PSMD11;CD58;NEU1;CD47;ITGAX;PSMD2;SVIP;CEP290;DYNC1H1;ARMC8;ALDOC;GSTP1;ROCK1;PSMD14;STK11IP;TYROBP;XRCC6;CMTM6;CAPN1;DYNC1LI1 geneontology_Biological_Process GO:0034504 protein localization to nucleus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0034504 229 68 45.2356826022671 1.50323806535401 0.000179461094911515 0.00349116583606215 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3978;5111;5424;5426;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;7515;10714 RFC4;PCNA;POLD1;LIG1;RFC3;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;POLE;XRCC1;RPA2;RPA3 geneontology_Biological_Process GO:0007265 Ras protein signal transduction http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007265 356 98 70.3227205519961 1.3935752091323 0.000193557548513024 0.00373969038270385 25;393;867;890;1017;1029;1278;1399;1435;1786;1796;1894;2056;2057;2150;2245;2305;2885;2889;3675;3688;3837;3845;3925;3984;4254;4851;4853;4893;5337;5874;5880;5900;5911;5912;5922;6016;6091;6093;6242;6993;7077;7204;8473;8625;8727;8936;9138;9181;9448;9545;9826;9869;9928;10152;10155;10163;10256;10276;10451;10564;10672;10787;10890;10981;11021;11031;11135;11235;22800;22821;23221;23433;23580;23636;23682;25894;29899;51762;55288;55738;55785;56882;56990;57111;57216;57531;57646;57679;64857;65979;79574;81848;83871;117178;128239;128272;171177 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I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0042790 11 8 2.17289305076392 3.68172745418254 0.000212722236931917 0.00408110014503632 1663;4141;4691;6597;6598;9014;9555;25926 DDX11;H2AFY;TAF1B;SMARCB1;SMARCA4;NOL11;NCL;MARS geneontology_Biological_Process GO:0009792 embryo development ending in birth or egg hatching http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0009792 470 124 92.8417939871858 1.33560538497473 0.000213390857256801 0.00408110014503632 25;86;90;91;100;102;317;672;675;841;891;1050;1277;1856;1857;1999;2033;2182;2186;2260;2263;2348;2648;2778;2885;3054;3091;3169;3276;3688;3880;3976;4071;4088;4097;4188;4323;4436;4678;4751;4849;4851;4952;5335;5460;5469;5591;5594;5930;5932;6297;6491;6498;6659;6662;6670;6692;6789;6928;6949;7040;7046;7248;7403;7408;7422;7516;7703;7855;8289;8321;8323;8463;8851;8915;9113;9133;9585;9775;9915;9968;10018;10155;10653;10672;10733;10736;11146;11232;22943;23326;23462;25836;25902;25942;26160;26227;27173;29072;54880;54892;54910;55081;55502;55723;57178;57216;57498;57534;57679;57680;63925;65979;79365;79718;79728;84295;84296;90780;92344;113026;123920;144455;149473 CCNB2;ASF1B;CCNB1;NEK2;SPINT1;KRT19;NCAPG2;DKK1;XRCC2;BRCA1;PLK4;STIL;SALL2;FGFR2;RBBP8;SOX4;MSH2;GINS4;NASP;MMP14;SPINT2;PHGDH;KIF20B;ACTL6A;ARNT2;FZD1;E2F7;PRKDC;TEAD2;LIF;HIF1A;SOX9;SKIL;BCOR;DVL3;IFT57;FOLR1;PYGO2;HCFC1;GORAB;SP3;HNF1B;MED12;VASP;KAT2A;BCL2L11;TRIM28;ADA;VEGFA;TCOF1;TGFB1;CMTM3;ZMIZ1;APAF1;MTHFD1L;NOTCH1;PALB2;POLG2;STK4;ABL1;MIB1;ITGB1;COL1A1;DVL2;FZD5;SLC39A1;BPTF;PRMT1;PCGF2;PLCG1;CNOT3;BRCA2;KDM6A;GNA13;SEMA4C;ACVR1;PLCD3;PHF6;EIF4A3;TBL1XR1;FZD6;POU5F1;EP300;ARID1A;CASP8;IFT172;LATS1;ADAM10;ACVR1B;MAPK1;BCL10;MAFG;SIX2;CDK5R1;TSC1;MED1;GRB2;HES6;CHD8;GLMN;CCDC24;SETD2;FOXA1;SIN3A;NIPBL;OCRL;GNAS;RBBP6;HEY1;CEBPA;VANGL2;TGFBR1;ACSL4;PHACTR4;ALS2;USP22;SMAD3;TM4SF1;MDFI;FGFR1;BHLHE41;ZNF335;KIDINS220;ELF3 geneontology_Biological_Process GO:0008630 intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008630 92 33 18.1732873336619 1.81585199166884 0.00021594246959078 0.00411599434462426 25;578;581;597;672;675;835;1032;1869;2033;2810;2956;3190;3428;4436;4582;5591;5883;6498;7161;8445;9641;10018;11200;22954;23028;25946;29108;51616;57646;79915;83596;204851 E2F1;SFN;BRCA1;MSH2;IKBKE;CASP2;BAK1;ATAD5;PYCARD;DYRK2;PRKDC;MUC1;CHEK2;MSH6;SKIL;TP73;CDKN2D;BCL2L11;BCL2A1;ABL1;RAD9A;BCL2L12;KDM1A;TRIM32;BRCA2;ZNF385A;TAF9B;EP300;HIPK1;BAX;IFI16;HNRNPK;USP28 geneontology_Biological_Process GO:0031297 replication fork processing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031297 16 10 3.16057171020207 3.16398453093812 0.00021938294029078 0.00416753968116143 641;675;1663;1763;5111;5888;7486;9984;55159;146956 RAD51;EME1;PCNA;BLM;DDX11;DNA2;RFWD3;THOC1;BRCA2;WRN geneontology_Biological_Process GO:0030832 regulation of actin filament length http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030832 138 45 27.2599310004929 1.65077453788076 0.000228358855595578 0.00429997085738031 120;822;829;2150;2885;3055;3383;4703;5217;5341;5580;5756;7114;7408;7429;7456;8195;8440;8936;9037;9113;9168;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10787;11113;11135;11151;23075;23221;23580;23616;29108;51474;55607;55971;64857;85464;93663;136319;147179 VIL1;NCK2;CAPG;WASF1;PRKCD;SH3BP1;PFN2;CIT;NEB;PYCARD;ADD3;TMSB10;PLEKHG2;F2RL1;PLEK;ICAM1;VASP;ARHGAP18;ABI2;CAPZA1;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;ACTR2;MKKS;SWAP70;ACTR3;LATS1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;LIMA1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;SSH2;MTPN;PPP1R9A;CORO1A;WIPF1;BAG4;ARPC2;RHOBTB2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0045739 positive regulation of DNA repair http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045739 43 19 8.49403647116806 2.23686348233765 0.000228381658578414 0.00429997085738031 142;641;672;1660;1663;2140;2187;2305;3014;4862;5111;7334;7515;8914;9025;10097;10155;55183;165918 FOXM1;H2AFX;PCNA;BRCA1;TIMELESS;BLM;DDX11;NPAS2;DHX9;TRIM28;RIF1;XRCC1;PARP1;ACTR2;RNF8;RNF168;FANCB;UBE2N;EYA3 geneontology_Biological_Process GO:0001843 neural tube closure http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001843 74 28 14.6176441596846 1.91549333764903 0.000228632967332887 0.00429997085738031 25;317;1856;1857;2348;2648;6491;6692;7040;7248;7403;7408;8289;8321;8323;8463;8915;9585;9968;10653;11146;25902;26160;29072;54910;55081;57216;65979 SPINT1;STIL;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;DVL3;IFT57;FOLR1;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;ABL1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4 geneontology_Biological_Process GO:0043009 chordate embryonic development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043009 458 121 90.4713652045343 1.33743974932232 0.000238943897903909 0.00447901127825838 25;86;90;91;100;102;317;672;675;841;891;1050;1277;1856;1857;1999;2033;2186;2260;2263;2348;2648;2778;2885;3054;3091;3169;3276;3688;3880;3976;4071;4088;4097;4188;4323;4436;4678;4751;4849;4851;4952;5335;5460;5469;5591;5594;5930;5932;6297;6491;6498;6659;6662;6670;6692;6789;6928;6949;7040;7046;7248;7403;7408;7422;7516;7703;7855;8289;8321;8323;8463;8915;9113;9133;9585;9775;9915;9968;10018;10155;10653;10672;10733;10736;11146;11232;22943;23462;25836;25902;25942;26160;26227;27173;29072;54880;54892;54910;55081;55502;55723;57178;57216;57498;57534;57679;57680;63925;65979;79365;79718;79728;84295;84296;90780;92344;113026;123920;144455;149473 CCNB2;ASF1B;CCNB1;NEK2;SPINT1;KRT19;NCAPG2;DKK1;XRCC2;BRCA1;PLK4;STIL;SALL2;FGFR2;RBBP8;SOX4;MSH2;GINS4;NASP;MMP14;SPINT2;PHGDH;KIF20B;ACTL6A;ARNT2;FZD1;E2F7;PRKDC;TEAD2;LIF;HIF1A;SOX9;SKIL;BCOR;DVL3;IFT57;FOLR1;PYGO2;HCFC1;GORAB;SP3;HNF1B;MED12;VASP;KAT2A;BCL2L11;TRIM28;ADA;VEGFA;TCOF1;TGFB1;CMTM3;ZMIZ1;APAF1;MTHFD1L;NOTCH1;PALB2;POLG2;STK4;ABL1;MIB1;ITGB1;COL1A1;DVL2;FZD5;SLC39A1;BPTF;PRMT1;PCGF2;PLCG1;CNOT3;BRCA2;KDM6A;GNA13;SEMA4C;ACVR1;PLCD3;PHF6;EIF4A3;TBL1XR1;FZD6;POU5F1;EP300;ARID1A;CASP8;IFT172;LATS1;ADAM10;ACVR1B;MAPK1;BCL10;MAFG;SIX2;TSC1;MED1;GRB2;HES6;CHD8;GLMN;CCDC24;SETD2;FOXA1;SIN3A;NIPBL;OCRL;GNAS;RBBP6;HEY1;CEBPA;VANGL2;TGFBR1;PHACTR4;ALS2;SMAD3;TM4SF1;MDFI;FGFR1;BHLHE41;ZNF335;KIDINS220;ELF3 geneontology_Biological_Process GO:0007264 small GTPase mediated signal transduction http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007264 454 120 89.6812222769837 1.33807275317207 0.000248096743881598 0.00463523322479778 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FOXM1;CCNA2;ECT2;DEPDC1B;STMN1;RACGAP1;ARHGAP11A;DNMT1;IQGAP3;CDKN2A;CDK2;KIF14;CHML;ARHGEF2;WASF1;SH3BP1;GPSM2;EPO;ARHGAP33;SRC;EPS8L3;ITGA3;LIMK1;SIPA1L3;RAB34;PLEKHG2;KPNB1;NUP62;F2RL1;FGD6;RGS19;CTNNAL1;NRAS;RAB3D;RAP2A;RIT1;FGD1;TIMP2;KITLG;GMIP;ARHGAP4;NOTCH2;RAB25;CDC42SE1;RAP1GAP;RHOV;ARHGAP18;RAP2B;TRIM28;NOTCH1;ABL1;RTKN;ITGB1;CD2AP;RAB27B;SSX2IP;ABI2;ARHGEF19;SETDB1;RAC2;RAB8B;ARHGEF11;GNA13;ROBO1;RALGAPB;PLD1;NCKAP1;WASF2;RASA3;MAP4K4;CRKL;RAB32;COL1A2;CSF1;CBL;NET1;TRIO;TRIP10;RHOT1;CDC42EP1;ARFGAP1;ARHGEF1;DOK1;RAB10;PDCD10;RAB35;CDC42EP4;GRB2;SRGAP2;CDC42SE2;PLEKHG4;KRAS;OGT;OCRL;RAPGEF1;DYNLT1;RAB38;VANGL2;RASA2;RFXANK;EPOR;RAB31;PHACTR4;ALS2;RRAGC;RHOQ;USP28;ROCK1;SPRY4;RALGDS;ARFIP2;HACE1;VAV3;ARFGEF2;ARHGAP19;RRAS2;ARHGAP17;RHOBTB2;CNKSR1;ARHGAP21 geneontology_Biological_Process GO:0031056 regulation of histone modification http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031056 123 41 24.2968950221784 1.68745841650033 0.000252598658145198 0.00470381909131567 672;891;1111;1786;1789;2648;3720;3976;4302;4582;5595;6418;6598;6688;6871;7040;7334;7422;8473;8726;9555;9682;9733;9810;10270;22823;22976;23028;23476;25836;25942;26147;51366;54880;55170;55183;55209;55818;63925;64324;90780 CCNB1;DNMT1;PHF19;CHEK1;BRCA1;DNMT3B;MTF2;MUC1;LIF;BCOR;PRMT6;H2AFY;PYGO2;SET;KAT2A;SETD5;VEGFA;SART3;RIF1;TGFB1;KDM1A;SMARCB1;MLLT6;SPI1;MAPK3;SIN3A;OGT;BRD4;EED;NIPBL;RNF40;UBE2N;JARID2;UBR5;PAXIP1;NSD1;ZNF335;KDM3A;AKAP8;KDM4A;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:0031060 regulation of histone methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031060 50 21 9.87678659438147 2.12619760479042 0.000258542772525683 0.00479872339432095 672;1786;1789;3720;4302;6598;8473;8726;9555;9682;22823;22976;23476;26147;54880;55170;55183;55818;63925;64324;90780 DNMT1;PHF19;BRCA1;DNMT3B;MTF2;BCOR;PRMT6;H2AFY;PYGO2;RIF1;SMARCB1;MLLT6;OGT;BRD4;EED;JARID2;PAXIP1;NSD1;ZNF335;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0002433 immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway involved in phagocytosis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002433 71 27 14.0250369640217 1.92512861600742 0.000267134583090245 0.00492589210056637 25;71;961;2212;2214;2885;2889;3055;3984;5058;5335;5580;5594;5595;6714;6850;7456;7525;10094;10096;10097;10109;10163;10451;10787;63916;147179 PRKCD;SRC;LIMK1;FCGR3A;PAK1;ABL1;FCGR2A;SYK;PLCG1;WIPF2;NCKAP1;WASF2;ACTR2;ACTR3;ACTG1;MAPK1;YES1;ARPC3;GRB2;MAPK3;HCK;ELMO2;RAPGEF1;CD47;WIPF1;ARPC2;VAV3 geneontology_Biological_Process GO:0038096 Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0038096 71 27 14.0250369640217 1.92512861600742 0.000267134583090245 0.00492589210056637 25;71;961;2212;2214;2885;2889;3055;3984;5058;5335;5580;5594;5595;6714;6850;7456;7525;10094;10096;10097;10109;10163;10451;10787;63916;147179 PRKCD;SRC;LIMK1;FCGR3A;PAK1;ABL1;FCGR2A;SYK;PLCG1;WIPF2;NCKAP1;WASF2;ACTR2;ACTR3;ACTG1;MAPK1;YES1;ARPC3;GRB2;MAPK3;HCK;ELMO2;RAPGEF1;CD47;WIPF1;ARPC2;VAV3 geneontology_Biological_Process GO:2000104 negative regulation of DNA-dependent DNA replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2000104 19 11 3.75317890586496 2.93084882865847 0.000271889067208431 0.00498111329924571 641;675;2956;8243;8914;9126;10735;11200;26271;51053;54962 FBXO5;TIMELESS;BLM;GMNN;SMC1A;SMC3;CHEK2;MSH6;TIPIN;BRCA2;STAG2 geneontology_Biological_Process GO:0070199 establishment of protein localization to chromosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070199 19 11 3.75317890586496 2.93084882865847 0.000271889067208431 0.00498111329924571 675;908;1736;6950;7015;9555;10576;10694;22948;25836;65057 H2AFY;DKC1;CCT5;TERT;CCT2;BRCA2;CCT6A;ACD;TCP1;CCT8;NIPBL geneontology_Biological_Process GO:0097193 intrinsic apoptotic signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0097193 249 72 49.1863972400197 1.4638193492533 0.000285409209153653 0.005211940429093 25;142;317;578;581;597;672;675;835;836;1032;1869;1870;2023;2033;2056;2810;2956;3065;3091;3190;3428;3651;4318;4436;4582;4841;5326;5329;5366;5580;5591;5598;5770;5771;5883;6279;6280;6421;6498;6714;7161;7186;8428;8440;8445;8575;9181;9641;9774;9833;10018;10059;10488;10625;11200;11235;22954;23028;25946;29108;51616;54431;57646;57761;64714;79915;83596;90427;90993;204851;100133941 E2F1;MELK;CD24;SFN;BRCA1;MMP9;NCK2;E2F2;MSH2;ARHGEF2;IKBKE;PRKCD;BMF;EPO;PLAGL2;SRC;CASP2;BAK1;ATAD5;PYCARD;DYRK2;PRKDC;MUC1;SFPQ;S100A9;CHEK2;MSH6;HIF1A;PLAUR;SKIL;TRAF2;NONO;TP73;STK24;HDAC1;CDKN2D;ENO1;BCL2L11;DNM1L;APAF1;BCL2A1;ABL1;RAD9A;BCL2L12;PDX1;CREB3L1;DNAJC10;KDM1A;PMAIP1;PARP1;TRIM32;BRCA2;ZNF385A;TAF9B;EP300;PDIA2;IVNS1ABP;CASP3;TRIB3;MAPK7;HIPK1;BAX;IFI16;PDCD10;PRKRA;CREB3;S100A8;BCLAF1;HNRNPK;PTPN2;USP28;PTPN1 geneontology_Biological_Process GO:1901796 regulation of signal transduction by p53 class mediator http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1901796 116 39 22.914144898965 1.70200547181499 0.0002900045799894 0.0052788293482958 1017;1111;1457;2033;3190;4582;5366;5716;6749;6790;6873;6874;6878;6882;6908;7161;7862;8148;8445;8805;9212;9521;9891;10614;11198;11200;22974;23028;25946;51230;51616;55170;79915;80196;83596;83860;161742;200734;204851 TPX2;AURKB;AURKA;CDK2;CHEK1;ATAD5;DYRK2;MUC1;CHEK2;RNF34;TAF6;PRMT6;SSRP1;TP73;NUAK1;SUPT16H;SPRED1;BCL2L12;BRPF1;TAF4;KDM1A;PMAIP1;ZNF385A;TAF9B;TBP;EP300;CSNK2A1;TAF3;TRIM24;HIPK1;EEF1E1;HEXIM1;TAF2;TAF15;PSMD10;HNRNPK;TAF11;PHF20;SPRED2 geneontology_Biological_Process GO:0060606 tube closure http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0060606 75 28 14.8151798915722 1.88995342648037 0.000297024132808632 0.00538927440971047 25;317;1856;1857;2348;2648;6491;6692;7040;7248;7403;7408;8289;8321;8323;8463;8915;9585;9968;10653;11146;25902;26160;29072;54910;55081;57216;65979 SPINT1;STIL;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;DVL3;IFT57;FOLR1;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;ABL1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4 geneontology_Biological_Process GO:0045830 positive regulation of isotype switching http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045830 22 12 4.34578610152785 2.76129559063691 0.000304123794894862 0.00550046262907288 2956;4436;7037;7040;7158;7292;7374;22976;23529;51010;55183;79915 MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;EXOSC3;TP53BP1;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0110053 regulation of actin filament organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0110053 200 60 39.5071463775259 1.5187125748503 0.000311988574313915 0.00562473668532189 25;120;822;829;961;2150;2316;2885;3055;3383;3925;3984;4088;5058;5217;5341;5580;5756;5829;6093;6281;7016;7046;7114;7248;7408;7429;7456;8195;8440;8936;9037;9113;9168;9270;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10163;10787;11113;11135;11151;23075;23221;23580;23616;29108;51474;55607;55971;64857;85464;93663;136319;147179;285590 STMN1;VIL1;NCK2;CAPG;WASF1;PRKCD;SH3BP1;PFN2;CIT;PYCARD;LIMK1;ADD3;TMSB10;PLEKHG2;F2RL1;PLEK;FLNA;ICAM1;VASP;ARHGAP18;PAK1;ABL1;S100A10;ABI2;CAPZA1;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;WASF2;ACTR2;MKKS;SH3PXD2B;SWAP70;ACTR3;LATS1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;LIMA1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;SSH2;ITGB1BP1;MTPN;TESK1;PPP1R9A;TGFBR1;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;BAG4;ROCK1;ARPC2;PXN;RHOBTB2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0002200 somatic diversification of immune receptors http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002200 61 24 12.0496796451454 1.99175419652498 0.000318543471190424 0.0057016180964266 2956;3148;3978;4436;5591;6929;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;10721;22976;23075;23529;51010;55183;64421;79915;165918 HMGB2;EXO1;LIG1;MSH2;POLQ;ATAD5;PRKDC;TFRC;MSH6;TCF3;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;DCLRE1C;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0007099 centriole replication http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007099 25 13 4.93839329719073 2.63243512974052 0.000318625936895689 0.0057016180964266 672;1017;2648;4591;6491;8481;10733;22995;23636;55722;55835;163786;284403 CDK2;WDR62;BRCA1;PLK4;STIL;SASS6;CENPJ;NUP62;TRIM37;CEP72;KAT2A;OFD1;CEP152 geneontology_Biological_Process GO:0042554 superoxide anion generation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0042554 28 14 5.53100049285362 2.5311876247505 0.000319274498598698 0.0057016180964266 54;1535;1536;2150;2950;3684;3689;4688;5580;6850;7040;26574;50506;53905 PRKCD;CYBA;DUOX2;F2RL1;NCF2;TGFB1;ITGAM;CYBB;SYK;ACP5;ITGB2;DUOX1;AATF;GSTP1 geneontology_Biological_Process GO:0014020 primary neural tube formation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0014020 79 29 15.6053228191227 1.85834028146239 0.000325793594229906 0.0057997406821871 25;317;1856;1857;2348;2648;3091;6491;6692;7040;7248;7403;7408;8289;8321;8323;8463;8915;9585;9968;10653;11146;25902;26160;29072;54910;55081;57216;65979 SPINT1;STIL;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;HIF1A;DVL3;IFT57;FOLR1;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;ABL1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4 geneontology_Biological_Process GO:0051495 positive regulation of cytoskeleton organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051495 176 54 34.7662888122228 1.55322876973326 0.000331879400823354 0.00588955889674297 25;402;961;1778;2150;2242;2316;2885;3055;3383;3984;4088;5027;5058;5217;5341;5829;6281;7016;7046;7248;7408;7429;7456;8440;8851;8936;9037;9270;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10615;10733;10787;11135;11151;22919;23075;23221;23580;23636;29108;29899;51199;55558;55835;55971;59341;147179;285590 SPAG5;VIL1;NCK2;PLK4;WASF1;GPSM2;PFN2;MAPRE1;PYCARD;CENPJ;LIMK1;NUP62;F2RL1;PLEK;FLNA;ICAM1;VASP;PAK1;PLXNA3;ABL1;S100A10;ABI2;WIPF2;NCKAP1;ACTR2;SH3PXD2B;SWAP70;NIN;ACTR3;FES;CDK5R1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;GRB2;HCK;BAIAP2L1;ITGB1BP1;TRPV4;TESK1;TGFBR1;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;BAG4;DYNC1H1;ARPC2;PXN;P2RX7;RHOBTB2;ARL2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0071900 regulation of protein serine/threonine kinase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071900 444 117 87.7058649581074 1.33400428871986 0.000336191444547995 0.00594743677370688 25;136;641;836;890;891;898;899;904;983;990;993;995;1019;1029;1030;1031;1032;1033;1050;1163;1164;1399;1844;1846;1849;1852;1856;1857;2146;2260;2810;2889;2950;3843;3845;4214;4215;4216;4254;4486;5027;5058;5347;5562;5570;5580;5585;5594;5595;5608;5716;5770;5997;6091;6714;6789;6850;6885;7016;7039;7040;7046;7128;7161;7186;7334;7345;7422;7852;7855;8491;8682;8754;8767;8792;8826;8851;9020;9043;9088;9113;9133;9134;9146;9294;9500;9555;10527;10614;10818;10926;11183;11235;22943;23043;23162;23560;23636;26973;27347;29108;51755;57018;57216;57498;57551;57679;57761;65125;80174;81848;84062;128239;161742;200734;100133941 CDK1;CDC6;CCNB2;PLK1;CCNB1;CCNA2;CD24;CCNE1;CDKN3;SFN;DUSP9;CDC25C;EZH2;CKS2;PKMYT1;IQGAP3;CDC25A;CDKN2A;CCNF;DKK1;CDKN2C;RGS2;BLM;PRKCD;CDK4;SRC;DBF4;PYCARD;CCNE2;PKIB;UCHL1;DBF4B;ADAM9;NUP62;S1PR2;CKS1B;IQGAP1;TRAF2;DVL3;H2AFY;MAGED1;KITLG;HGS;TP73;STK39;TNIK;CDKN2D;PAK1;SPRED1;VEGFA;MAP3K7;TGFA;TGFB1;STK4;ABL1;CHORDC1;DVL2;TNFAIP3;FZD5;WNK1;CXCR4;IPO5;SYK;GTPBP4;MAPK8IP3;ROBO1;MAP3K14;MAP3K1;MAP3K4;MAP4K3;PEA15;CRKL;PKN1;TNFRSF11A;LATS1;CDK12;CASP3;FRS2;MAPK1;ADORA2B;TRIB3;IPO7;RIPK2;CDK5R1;CCNL1;PDCD10;HEXIM1;TAOK1;MAPK3;CDKN2B;KRAS;PSMD10;RAPGEF1;MST1R;UBE2N;TESK1;DTNBP1;CEBPA;DUSP7;VANGL2;TGFBR1;ALS2;DUSP4;MAP3K3;PRKAA1;FGFR1;SPAG9;DUSP2;MAP4K5;CCNT1;MAP2K6;GSTP1;KIDINS220;PTPN1;SPRY4;SPRED2;P2RX7 geneontology_Biological_Process GO:0033631 cell-cell adhesion mediated by integrin http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033631 14 9 2.76550024642681 3.25438408896493 0.00034248861414321 0.00602120510765439 100;3678;3688;8754;10563;23075;65125;83706;255743 ITGA5;ADAM9;ADA;NPNT;ITGB1;WNK1;CXCL13;SWAP70;FERMT3 geneontology_Biological_Process GO:0070200 establishment of protein localization to telomere http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070200 14 9 2.76550024642681 3.25438408896493 0.00034248861414321 0.00602120510765439 675;908;1736;6950;7015;10576;10694;22948;65057 DKC1;CCT5;TERT;CCT2;BRCA2;CCT6A;ACD;TCP1;CCT8 geneontology_Biological_Process GO:0002275 myeloid cell activation involved in immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002275 418 111 82.5699359290291 1.34431495859955 0.000347048238981573 0.00608247703057178 47;102;136;226;230;240;302;317;427;823;867;961;963;965;1075;1265;1315;1520;1535;1536;1650;1778;2150;2171;2207;2212;2242;2547;2896;2919;2950;2992;3310;3482;3566;3608;3684;3685;3687;3689;3837;3903;3958;3965;4318;4332;4758;4860;4893;5036;5169;5328;5329;5337;5580;5594;5646;5708;5717;5724;5768;5834;5880;5912;6036;6093;6279;6280;6282;6284;6286;6590;6616;6813;6850;6993;7077;7097;7130;7226;7305;7414;7520;8560;8826;8904;9545;10075;10097;10213;10493;10576;10694;10890;10970;11031;23406;25801;25852;29108;51143;54918;55832;79980;80184;80331;83858;114790;201294;203068;258010 DSN1;MMP9;PRSS3;S100A11;CKAP4;PRKCD;SNAP25;CXCL1;S100P;PYCARD;FABP5;TUBB;CYBA;S100A9;KPNB1;F2RL1;PLAUR;ITGAV;IQGAP1;NRAS;RAB3D;CTSC;ALDOA;PNP;ALOX5;QSOX1;TIMP2;GCA;FCER1G;RNASE2;ACLY;RAP2B;ILF2;APAF1;ITGAM;CYBB;SLPI;DEGS1;FCGR2A;CAND1;CPNE1;IL4R;CCT2;SYK;HSPA6;RAC2;LGALS9;LGALS3;S100A13;PLD1;VCL;ACTR2;TLR2;DDOST;PA2G4;COPB1;ADAM10;TNFAIP6;GRN;ITGB2;MAPK1;ADORA2B;FES;CD53;CTSS;PLAU;CBL;PTAFR;LAIR1;DNAJC5;ANXA2;PYGB;VAT1;RAB10;IGF2R;COTL1;MNDA;HUWE1;ASAH1;CCT8;UNC13D;STXBP2;XRCC5;GYG1;DYNLT1;TRPM2;CNN2;S100A8;ATAD3B;RAB31;PSMD11;CD58;NEU1;CD47;ITGAX;PSMD2;SVIP;CEP290;DYNC1H1;ARMC8;ALDOC;GSTP1;ROCK1;PSMD14;ENPP3;STK11IP;TYROBP;XRCC6;CMTM6;CAPN1;DYNC1LI1 geneontology_Biological_Process GO:0016445 somatic diversification of immunoglobulins http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0016445 51 21 10.0743223262691 2.08450745567688 0.000358633179064816 0.00626611860088247 2956;4436;5591;6929;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;10721;22976;23075;23529;51010;55183;79915;165918 EXO1;MSH2;POLQ;ATAD5;PRKDC;TFRC;MSH6;TCF3;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0051962 positive regulation of nervous system development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051962 397 106 78.4216855593889 1.3516669431917 0.000377817071200992 0.00658099212328866 351;991;1399;1435;1453;1627;1789;1856;1857;1869;1894;1946;2011;2033;2049;2056;2119;2146;2242;2260;2316;2889;3065;3066;3091;3169;3556;3675;3706;3976;3984;4076;4673;4851;5025;5058;5270;5274;5361;5501;5584;5597;5756;5997;6091;6280;6498;6604;6692;6857;6929;6938;6993;7040;7077;7097;7161;7162;7422;7516;7520;7852;8175;8321;8826;8904;9037;9043;9139;9181;9231;9253;9585;9682;9896;10059;10097;10154;10507;22883;22906;22943;22954;23013;23028;23060;23394;23529;23613;25836;29904;29993;51199;51393;51593;55558;55607;57498;57556;60436;63925;64764;84079;92344;259266;375790 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VIL1;NCK2;CAPG;WASF1;PRKCD;SH3BP1;PFN2;CIT;PYCARD;ADD3;TMSB10;PLEKHG2;F2RL1;PLEK;ICAM1;VASP;ARHGAP18;ABI2;CAPZA1;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;ACTR2;MKKS;SWAP70;ACTR3;LATS1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;LIMA1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;SSH2;MTPN;PPP1R9A;CORO1A;WIPF1;BAG4;ARPC2;RHOBTB2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0032970 regulation of actin filament-based process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032970 298 83 58.8656481025136 1.40999042184088 0.000390554804951204 0.00672462599669313 25;120;476;488;822;829;961;1265;1824;1829;1894;1946;2150;2242;2316;2626;2885;3055;3383;3925;3984;4088;4703;5058;5217;5341;5580;5756;5829;6093;6281;6624;6717;7016;7040;7046;7114;7226;7248;7408;7429;7430;7456;8195;8440;8851;8936;9037;9113;9168;9270;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10163;10787;11113;11135;11151;23075;23221;23433;23580;23607;23616;29108;51474;55114;55607;55704;55971;57216;57551;64857;85464;93663;128272;136319;147179;285590 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intracellular transport http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032388 174 53 34.3712173484475 1.54198786335375 0.000455872849732919 0.00765785223245713 136;302;983;999;1601;1660;1778;1894;2207;2316;2810;3566;3684;3689;3799;3843;4088;5058;5116;5469;5562;5580;5594;5880;6721;6850;6857;7040;7175;7430;7855;8851;8898;9270;9520;9585;10055;10059;10075;10155;10541;10615;10657;11052;11235;22916;25930;51366;51512;57506;57602;64328;80184 CDK1;ECT2;GTSE1;SPAG5;SFN;PRKCD;KIF20B;EZR;SAE1;MTMR2;CPSF6;SYT1;FLNA;DAB2;TPR;DHX9;FCER1G;NPEPPS;PAK1;TRIM28;DNM1L;TGFB1;ITGAM;NCBP2;KHDRBS1;FZD5;IL4R;IPO5;SYK;RAC2;ANP32B;PCNT;ITGB2;MAPK1;ADORA2B;PTPN23;CDK5R1;ANXA2;CDH1;MED1;PDCD10;KIF5B;HUWE1;ITGB1BP1;USP36;UBR5;MAVS;SMAD3;PRKAA1;CEP290;DYNC1H1;SREBF2;XPO4 geneontology_Biological_Process GO:0008334 histone mRNA metabolic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008334 23 12 4.54332183341548 2.64123926060922 0.00052212486823433 0.00865331329992543 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geneontology_Biological_Process GO:0002208 somatic diversification of immunoglobulins involved in immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002208 42 18 8.29650073928043 2.16958939264328 0.000523728451632954 0.00865331329992543 2956;4436;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;79915;165918 EXO1;MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0045190 isotype switching http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045190 42 18 8.29650073928043 2.16958939264328 0.000523728451632954 0.00865331329992543 2956;4436;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;79915;165918 EXO1;MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0046931 pore complex assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0046931 12 8 2.37042878265155 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SPINT1;STIL;FGFR2;SOX4;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;HIF1A;SOX9;DVL3;IFT57;FOLR1;HNF1B;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;STK4;ABL1;MIB1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4;CEP290 geneontology_Biological_Process GO:0000245 spliceosomal complex assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000245 39 17 7.70389354361755 2.20667639080813 0.000587048477669327 0.00949508980596018 4686;6632;6633;6637;6732;8175;9416;10181;10713;10946;11168;23020;23451;27316;51747;55692;58155 PSIP1;SNRPD1;RBMX;LUC7L3;SF3A2;SNRNP200;SF3B1;SNRPG;SRPK1;SNRPD2;DDX23;USP39;NCBP1;PTBP2;SF3A3;RBM5;LUC7L geneontology_Biological_Process GO:0000381 regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000381 39 17 7.70389354361755 2.20667639080813 0.000587048477669327 0.00949508980596018 3178;3191;3192;4116;5725;5936;6434;9589;9733;10181;10521;10657;10921;27316;29890;58517;84991 RBMX;HNRNPA1;RBM17;SART3;KHDRBS1;WTAP;RNPS1;HNRNPU;HNRNPL;TRA2B;PTBP1;RBM25;DDX17;RBM15B;MAGOH;RBM5;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:0001824 blastocyst development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001824 67 25 13.2348940364712 1.88894598861978 0.000620360983203616 0.0100053091906429 86;100;675;1999;3054;4071;4678;4751;4849;5460;5932;6498;6670;6928;7046;9113;54880;54892;55723;79718;79728;84295;84296;123920;149473 ASF1B;NEK2;NCAPG2;RBBP8;GINS4;NASP;ACTL6A;SKIL;BCOR;HCFC1;SP3;HNF1B;ADA;CMTM3;PALB2;CNOT3;BRCA2;PHF6;TBL1XR1;POU5F1;LATS1;CCDC24;TGFBR1;TM4SF1;ELF3 geneontology_Biological_Process GO:0001838 embryonic epithelial tube formation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001838 101 34 19.9511089206506 1.70416592557459 0.000673312425965689 0.0108284705778175 25;317;1856;1857;2348;2648;3091;6491;6659;6662;6692;6789;6928;7040;7248;7403;7408;8289;8321;8323;8463;8915;9585;9968;10653;11146;25902;26160;29072;54910;55081;57216;57534;65979 SPINT1;STIL;SOX4;SPINT2;KIF20B;FZD1;TEAD2;HIF1A;SOX9;DVL3;IFT57;FOLR1;HNF1B;MED12;VASP;KAT2A;TGFB1;APAF1;MTHFD1L;STK4;ABL1;MIB1;DVL2;KDM6A;SEMA4C;FZD6;ARID1A;IFT172;BCL10;TSC1;GLMN;SETD2;VANGL2;PHACTR4 geneontology_Biological_Process GO:0031058 positive regulation of histone modification http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031058 71 26 14.0250369640217 1.8538275561553 0.000679385059898507 0.0108951808047746 672;891;1786;1789;2648;3720;3976;4582;5595;6598;6871;7040;7334;7422;8473;8726;9733;9810;10270;22823;22976;23028;23476;25836;26147;55183 CCNB1;DNMT1;PHF19;BRCA1;DNMT3B;MTF2;MUC1;LIF;KAT2A;VEGFA;SART3;RIF1;TGFB1;KDM1A;SMARCB1;MAPK3;OGT;BRD4;EED;NIPBL;RNF40;UBE2N;JARID2;PAXIP1;AKAP8;TADA2A geneontology_Biological_Process GO:1900180 regulation of protein localization to nucleus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1900180 105 35 20.7412518482011 1.68745841650033 0.000693800554921298 0.0110949292130211 142;908;983;999;1736;1894;2316;3843;3976;4088;4931;5347;5469;5580;5594;6714;6950;7015;7040;7175;10155;10445;10576;10694;11006;22948;23607;23636;25942;29775;51366;51512;57506;84445;84662 CDK1;PLK1;ECT2;GTSE1;GLIS2;PRKCD;SRC;LIF;NUP62;FLNA;TPR;DKC1;TRIM28;CCT5;TGFB1;TERT;CD2AP;LZTS2;IPO5;CCT2;PARP1;MCRS1;CCT6A;CARD10;MAPK1;NVL;CDH1;MED1;TCP1;SIN3A;CCT8;LILRB4;UBR5;MAVS;SMAD3 geneontology_Biological_Process GO:0007064 mitotic sister chromatid cohesion http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007064 15 9 2.96303597831444 3.0374251497006 0.0007062398468487 0.0112620387972126 991;8243;9555;23126;23244;25836;79075;80218;113130 CDC20;CDCA5;DSCC1;SMC1A;H2AFY;POGZ;NAA50;PDS5A;NIPBL geneontology_Biological_Process GO:0051053 negative regulation of DNA metabolic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051053 109 36 21.5313947757516 1.67197714662418 0.000711531923258235 0.0113145567909126 142;641;675;990;1676;2187;2956;3178;3192;4436;5394;6282;6714;7158;7270;7515;7520;8243;8914;8971;9126;9984;10155;10721;10735;11200;23244;23560;26271;51053;51366;54962;55183;55226;65057;167227 CDC6;FBXO5;TIMELESS;MSH2;BLM;S100A11;POLQ;SRC;GMNN;SMC1A;SMC3;CHEK2;MSH6;TIPIN;H1FX;HNRNPA1;TRIM28;RIF1;XRCC1;THOC1;GTPBP4;PARP1;BRCA2;HNRNPU;PDS5A;ACD;TP53BP1;TTF1;FANCB;XRCC5;DCP2;UBR5;EXOSC10;STAG2;DFFA;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0032212 positive regulation of telomere maintenance via telomerase http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032212 33 15 6.51867915229177 2.30107965886409 0.000717228829281824 0.0113732000071832 908;1736;3178;4216;4751;5570;5594;5595;6950;7520;9212;10576;10694;22948;65057 NEK2;AURKB;PKIB;HNRNPA1;DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;MAP3K4;ACD;MAPK1;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5 geneontology_Biological_Process GO:0043087 regulation of GTPase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0043087 373 99 73.6808279940858 1.34363310911689 0.000724841000707244 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ECT2;DEPDC1B;RACGAP1;ARHGAP11A;DEPDC1;EZH2;IQGAP3;FOXJ1;CHML;CCL20;RCC2;RGS2;RGS1;SH3BP1;ARHGAP33;PLXNA1;PYCARD;PLCB1;SIPA1L3;PLXNC1;F2RL1;FGD6;IQGAP1;ASAP1;PIP5K1A;DVL3;GIT1;CORO1C;FGD1;GMIP;ARHGAP4;CDC42SE1;RAP1GAP;ICAM1;ARHGAP18;DNM1L;AGRN;PLXNA3;RTKN;RANBP1;ITGB1;LLGL1;DVL2;ANKRD27;WNK1;S100A10;ARHGEF19;IPO5;CXCL13;SBF1;LIMS1;AGFG1;ARHGEF11;RGS10;STXBP5;RALGAPB;XCL1;RASA3;MAP4K4;MKKS;TBC1D8;NUP50;CRKL;RRP1B;RIC8B;RP2;CAV2;NET1;EPHB3;RANGAP1;TRIP10;ADAP1;TSC1;ARFGAP1;ARHGEF1;GPSM1;SRGAP2;PLEKHG4;ALS2CL;SEMA4D;ITGB1BP1;OCRL;RAPGEF1;DYNLT1;TBC1D1;EFNA5;RASA2;ALS2;SEC23B;SMAP1;AGAP1;LLGL2;ARHGAP27;VAV3;ARHGAP19;ARHGAP17;ADAP2;ARL2;ARHGAP21 geneontology_Biological_Process GO:0006278 RNA-dependent DNA biosynthetic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006278 64 24 12.6422868408083 1.89839071856287 0.000727924770434152 0.0114785017421385 908;1736;3178;3192;4216;4751;5394;5570;5594;5595;6117;6118;6714;6950;7015;7520;9212;10576;10694;22948;23381;55226;65057;167227 NEK2;AURKB;SRC;PKIB;RPA1;HNRNPA1;DKC1;CCT5;TERT;CCT2;HNRNPU;CCT6A;MAP3K4;ACD;MAPK1;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5;DCP2;RPA2;EXOSC10;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:0006301 postreplication repair http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006301 43 18 8.49403647116806 2.11913382537251 0.000736378142632166 0.0115474699873703 672;4436;5111;5424;5427;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;7334;10714;51455;51514;55666;56852 DTL;RFC4;PCNA;BRCA1;POLD1;MSH2;POLE2;RFC3;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;RAD18;REV1;UBE2N;RPA2;RPA3;NPLOC4 geneontology_Biological_Process GO:0046605 regulation of centrosome cycle http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0046605 43 18 8.49403647116806 2.11913382537251 0.000736378142632166 0.0115474699873703 672;899;1111;2648;3832;4591;4751;6491;6790;7514;7517;10733;11190;23636;25978;26973;55835;128866 NEK2;KIF11;AURKA;CCNF;CHEK1;BRCA1;PLK4;STIL;XRCC3;CENPJ;NUP62;TRIM37;XPO1;KAT2A;CEP250;CHORDC1;CHMP4B;CHMP2B geneontology_Biological_Process GO:0018107 peptidyl-threonine phosphorylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018107 94 32 18.5683587974372 1.72336178706417 0.000769590960938427 0.0120349569885979 90;91;351;790;983;1111;1453;1457;2011;5347;5528;5578;5580;5585;5594;7040;7046;7272;7443;7444;8312;8317;8767;8851;8877;9294;9943;22853;27347;65125;161742;200734 CDK1;PLK1;TTK;SPHK1;CDC7;CHEK1;PRKCD;VRK1;CAD;S1PR2;STK39;SPRED1;TGFB1;VRK2;WNK1;MARK2;CSNK1D;ACVR1;PKN1;CSNK2A1;APP;ACVR1B;MAPK1;RIPK2;CDK5R1;AXIN1;PRKCA;PPP2R5D;OXSR1;TGFBR1;LMTK2;SPRED2 geneontology_Biological_Process GO:0045191 regulation of isotype switching http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045191 30 14 5.92607195662888 2.36244178310047 0.000777449671201635 0.012124359748409 2956;4436;7037;7040;7158;7292;7374;9466;9984;22976;23529;51010;55183;79915 MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;EXOSC3;TP53BP1;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:1901836 regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1901836 10 7 1.97535731887629 3.5436626746507 0.000793330174668316 0.0123042249830064 1663;4141;4691;6597;6598;9555;25926 DDX11;H2AFY;SMARCB1;SMARCA4;NOL11;NCL;MARS geneontology_Biological_Process GO:0035246 peptidyl-arginine N-methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0035246 10 7 1.97535731887629 3.5436626746507 0.000793330174668316 0.0123042249830064 3275;3276;10196;10498;55170;79084;80204 PRMT6;PRMT1;PRMT3;FBXO11;CARM1;PRMT2;WDR77 geneontology_Biological_Process GO:0030033 microvillus assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030033 18 10 3.55564317397733 2.81243069416722 0.000812620335802539 0.0125347240353629 688;4640;5337;5909;5911;5912;6624;7430;9448;23043 KLF5;EZR;RAP2A;RAP1GAP;RAP2B;TNIK;PLD1;MAP4K4;FSCN1;MYO1A geneontology_Biological_Process GO:1901673 regulation of mitotic spindle assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1901673 18 10 3.55564317397733 2.81243069416722 0.000812620335802539 0.0125347240353629 3192;5347;7175;8243;9126;10274;10735;25978;79598;128866 PLK1;SMC1A;SMC3;TPR;STAG1;HNRNPU;CEP97;CHMP4B;CHMP2B;STAG2 geneontology_Biological_Process GO:0032528 microvillus organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032528 24 12 4.7408575653031 2.5311876247505 0.000857730650225208 0.0131946011166438 688;4640;5337;5909;5911;5912;6624;7429;7430;9448;10083;23043 VIL1;KLF5;EZR;RAP2A;USH1C;RAP1GAP;RAP2B;TNIK;PLD1;MAP4K4;FSCN1;MYO1A geneontology_Biological_Process GO:0002381 immunoglobulin production involved in immunoglobulin mediated immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002381 47 19 9.28417939871858 2.0464921221387 0.000885922634791481 0.0135913496898498 2956;4436;6375;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;79915;165918 EXO1;MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;IL27RA;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;XCL1;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:2001242 regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2001242 138 43 27.2599310004929 1.57740678064162 0.000907291516943798 0.0138815602092401 142;581;597;1032;2023;2056;3065;3091;3190;3651;4318;4582;4841;5326;5329;5366;5598;5770;5771;5883;6279;6280;6421;6498;6714;8440;8575;9181;9774;10018;10059;10488;10625;22954;23028;25946;29108;51616;64714;79915;83596;90427;90993 MMP9;NCK2;ARHGEF2;BMF;EPO;PLAGL2;SRC;ATAD5;PYCARD;MUC1;SFPQ;S100A9;HIF1A;PLAUR;SKIL;NONO;HDAC1;CDKN2D;ENO1;BCL2L11;DNM1L;BCL2A1;RAD9A;BCL2L12;PDX1;CREB3L1;KDM1A;PMAIP1;PARP1;TRIM32;ZNF385A;TAF9B;PDIA2;IVNS1ABP;MAPK7;BAX;PRKRA;CREB3;S100A8;BCLAF1;HNRNPK;PTPN2;PTPN1 geneontology_Biological_Process GO:0031057 negative regulation of histone modification http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031057 37 16 7.30882207984229 2.18913524302746 0.000940968376463625 0.0143580107255002 672;1786;1789;3720;4302;6418;6598;6688;9555;9682;22823;25942;51366;54880;55170;55818 DNMT1;BRCA1;DNMT3B;MTF2;BCOR;PRMT6;H2AFY;SET;SMARCB1;MLLT6;SPI1;SIN3A;JARID2;UBR5;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0007018 microtubule-based movement http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007018 171 51 33.7786101527846 1.50983121476346 0.000983939069244322 0.0149733308360003 351;1062;1778;1781;3091;3192;3796;3797;3799;3832;3833;3835;3837;5874;6421;7345;8195;8481;8936;9493;9585;9787;9928;10096;10097;10112;11004;22906;23162;23299;23353;24137;26160;27148;29127;51143;51668;54820;55081;55201;55288;56992;57560;57584;64837;66008;81930;84062;90990;117178;388552 KIFC1;KIF2C;KIF4A;KIF20A;DLGAP5;KIF23;KIF11;RACGAP1;KIF15;KIF18A;KIF14;CENPE;WASF1;KIF20B;NDE1;IFT80;UCHL1;KIF2A;SFPQ;HIF1A;KPNB1;IFT57;KIF3C;OFD1;SUN1;RAB27B;SSX2IP;MAPK8IP3;HNRNPU;KIFC2;KIF22;KLC2;ACTR2;MKKS;HSPB11;IFT172;ACTR3;APP;TRAK2;RHOT1;STK36;KIF5B;TRAK1;DTNBP1;BICD2;MAP1S;DYNC1H1;BLOC1S3;DYNC1I2;DYNC1LI1;ARHGAP21 geneontology_Biological_Process GO:0032206 positive regulation of telomere maintenance http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032206 44 18 8.69157220305569 2.07097169297768 0.00101892763916167 0.0154642074136574 908;1736;3178;3181;3184;4216;4751;5570;5594;5595;6950;7520;9212;10576;10694;22948;26354;65057 NEK2;AURKB;PKIB;HNRNPA1;DKC1;CCT5;CCT2;HNRNPA2B1;CCT6A;HNRNPD;MAP3K4;ACD;MAPK1;TCP1;MAPK3;CCT8;GNL3;XRCC5 geneontology_Biological_Process GO:2000278 regulation of DNA biosynthetic process http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2000278 92 31 18.1732873336619 1.70580035581012 0.00111910858867015 0.0169392345466891 908;1736;3178;3181;3184;3192;4216;4751;4931;5394;5570;5594;5595;5982;5983;5984;5985;6714;6950;7027;7520;9212;10576;10694;22948;23381;55226;63922;65057;79075;167227 NEK2;AURKB;RFC4;TFDP1;CHTF18;RFC3;RFC5;SRC;DSCC1;PKIB;RFC2;HNRNPA1;DKC1;CCT5;CCT2;HNRNPA2B1;HNRNPU;CCT6A;HNRNPD;MAP3K4;ACD;MAPK1;NVL;SMG5;TCP1;MAPK3;CCT8;XRCC5;DCP2;EXOSC10;NAT10 geneontology_Biological_Process GO:1904814 regulation of protein localization to chromosome, telomeric region http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1904814 13 8 2.56796451453918 3.11530784584677 0.00113374907904551 0.0170242799376038 908;1736;6950;9555;10576;10694;22948;26354 H2AFY;DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;GNL3 geneontology_Biological_Process GO:2000001 regulation of DNA damage checkpoint http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:2000001 13 8 2.56796451453918 3.11530784584677 0.00113374907904551 0.0170242799376038 1407;6118;8563;9984;10116;11200;55159;79968 WDR76;RFWD3;CHEK2;THOC1;CRY1;THOC5;RPA2;FEM1B geneontology_Biological_Process GO:0098787 mRNA cleavage involved in mRNA processing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0098787 13 8 2.56796451453918 3.11530784584677 0.00113374907904551 0.0170242799376038 1478;4686;11051;11052;22916;51692;79869;81608 CSTF2;CPSF6;NCBP2;NCBP1;CPSF7;CPSF3;NUDT21;FIP1L1 geneontology_Biological_Process GO:0042771 intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator 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672;1786;1789;6018;7403;8473;9555;9739;22976;30827;54880;55170;55870;57673;63925;80335;90780 DNMT1;BRCA1;DNMT3B;BCOR;PRMT6;H2AFY;PYGO2;BEND3;KDM6A;ASH1L;WDR82;CXXC1;RLF;OGT;SETD1A;PAXIP1;ZNF335 geneontology_Biological_Process GO:0051258 protein polymerization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051258 210 60 41.4825036964022 1.44639292842886 0.00121963836085959 0.0181217132830082 25;120;402;822;829;1453;2242;2885;3055;3383;3925;5058;5217;5580;5756;7114;7283;7408;7429;7456;7756;8195;8440;8851;8936;9113;9168;9530;9793;10059;10094;10096;10097;10109;10152;10426;10787;11065;11135;11151;22919;23221;23580;26271;27175;27338;29108;51199;54820;55125;55607;55835;55971;58526;59341;64857;81624;93663;136319;147179 UBE2C;STMN1;VIL1;UBE2S;NCK2;FBXO5;CAPG;TUBG1;WASF1;PRKCD;PFN2;MAPRE1;PYCARD;CENPJ;NDE1;CKAP5;ADD3;DIAPH3;TMSB10;PLEKHG2;MID1IP1;TUBG2;ICAM1;VASP;ARHGAP18;CEP192;PAK1;ZNF207;DNM1L;ABL1;ABI2;CAPZA1;CSNK1D;WIPF2;NCKAP1;TMSB4X;ACTR2;MKKS;TUBGCP3;NIN;ACTR3;LATS1;FES;CDK5R1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;GRB2;HCK;BAIAP2L1;TWF1;TRPV4;MTPN;PPP1R9A;CORO1A;WIPF1;BAG4;ARPC2;RHOBTB2;ARL2 geneontology_Biological_Process GO:0001844 protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001844 28 13 5.53100049285362 2.35038850869689 0.00126724055497207 0.0187797088526097 581;841;1869;2810;5366;7027;7029;7161;7533;7534;10018;10971;90427 E2F1;SFN;TFDP1;BMF;YWHAQ;TP73;BCL2L11;YWHAZ;YWHAH;PMAIP1;CASP8;BAX;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0042769 DNA damage response, detection of DNA damage http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0042769 38 16 7.50635781172992 2.13152642084253 0.00133081303741189 0.0196703201169418 142;5111;5424;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;6659;7398;8450;10714;51514;56852 DTL;RFC4;PCNA;POLD1;SOX4;RFC3;USP1;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;RAD18;PARP1;CUL4B;RPA2;RPA3 geneontology_Biological_Process GO:0032928 regulation of superoxide anion generation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032928 19 10 3.75317890586496 2.66440802605316 0.00141343285646256 0.0208370921886316 54;1535;2150;2950;3684;3689;5580;6850;7040;26574 PRKCD;CYBA;F2RL1;TGFB1;ITGAM;SYK;ACP5;ITGB2;AATF;GSTP1 geneontology_Biological_Process GO:0002312 B cell activation involved in immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002312 63 23 12.4447511089207 1.84816874188132 0.00142300146250096 0.0209236656603063 25;100;1880;2956;3956;4436;4853;7037;7040;7158;7292;7374;9025;9156;9466;9984;22976;23075;23529;51010;55183;79915;165918 EXO1;MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;NOTCH2;IL27RA;ADA;RIF1;TGFB1;ABL1;TNFSF4;CLCF1;THOC1;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;LGALS1;GPR183;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0098727 maintenance of cell number http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0098727 125 39 24.6919664859537 1.57946107784431 0.00149429403525336 0.0219150221076925 182;607;1000;2146;2176;2177;3976;4017;4849;4851;4853;5460;6659;6662;6688;6928;6944;8202;8243;8289;8324;8861;9126;9282;9968;10642;10736;22823;25836;26354;27257;51586;51593;55183;55818;56339;57216;259266;283149 ASPM;EZH2;FANCD2;SOX4;IGF2BP1;BCL9;MTF2;SMC1A;SMC3;LIF;SOX9;NOTCH2;FANCC;HNF1B;MED12;MED14;BCL9L;SRRT;RIF1;NOTCH1;FZD7;CNOT3;VPS72;SPI1;POU5F1;JAG1;ARID1A;SIX2;MED15;LDB1;GNL3;NIPBL;VANGL2;NCOA3;LOXL2;CDH2;KDM3A;LSM1;METTL3 geneontology_Biological_Process GO:0033627 cell adhesion mediated by integrin http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033627 56 21 11.0620009857072 1.89839071856287 0.00153042604900533 0.0223869298796361 100;1399;3383;3678;3685;3688;3689;3691;4582;5054;5328;6850;6868;8754;9270;10563;23075;54997;65125;83706;255743 ITGA5;ITGB4;MUC1;ADAM9;ADAM17;ITGAV;SERPINE1;ICAM1;ADA;NPNT;TESC;ITGB1;WNK1;SYK;CXCL13;CRKL;SWAP70;ITGB2;PLAU;FERMT3;ITGB1BP1 geneontology_Biological_Process GO:0046824 positive regulation of nucleocytoplasmic transport http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0046824 60 22 11.8521439132578 1.85620425815037 0.00167843967372416 0.0244795259516259 983;999;1660;1894;2316;2810;3843;4088;5469;5580;5594;7040;7175;10155;10541;10657;11052;22916;51366;51512;57506;64328 CDK1;ECT2;GTSE1;SFN;PRKCD;CPSF6;FLNA;TPR;DHX9;TRIM28;TGFB1;NCBP2;KHDRBS1;IPO5;ANP32B;MAPK1;CDH1;MED1;UBR5;MAVS;SMAD3;XPO4 geneontology_Biological_Process GO:0018210 peptidyl-threonine modification http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018210 98 32 19.3585017249877 1.65302048963298 0.00169357365580169 0.0244795259516259 90;91;351;790;983;1111;1453;1457;2011;5347;5528;5578;5580;5585;5594;7040;7046;7272;7443;7444;8312;8317;8767;8851;8877;9294;9943;22853;27347;65125;161742;200734 CDK1;PLK1;TTK;SPHK1;CDC7;CHEK1;PRKCD;VRK1;CAD;S1PR2;STK39;SPRED1;TGFB1;VRK2;WNK1;MARK2;CSNK1D;ACVR1;PKN1;CSNK2A1;APP;ACVR1B;MAPK1;RIPK2;CDK5R1;AXIN1;PRKCA;PPP2R5D;OXSR1;TGFBR1;LMTK2;SPRED2 geneontology_Biological_Process GO:0002714 positive regulation of B cell mediated immunity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002714 32 14 6.32114342040414 2.21478917165669 0.00169510230931591 0.0244795259516259 2207;2956;4436;6375;7037;7040;7158;7292;7374;22976;23529;51010;55183;79915 MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;FCER1G;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;XCL1;EXOSC3;TP53BP1;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0002891 positive regulation of immunoglobulin mediated immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002891 32 14 6.32114342040414 2.21478917165669 0.00169510230931591 0.0244795259516259 2207;2956;4436;6375;7037;7040;7158;7292;7374;22976;23529;51010;55183;79915 MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;UNG;FCER1G;RIF1;TGFB1;TNFSF4;CLCF1;XCL1;EXOSC3;TP53BP1;PAXIP1 geneontology_Biological_Process GO:0051973 positive regulation of telomerase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051973 32 14 6.32114342040414 2.21478917165669 0.00169510230931591 0.0244795259516259 1736;3181;3184;4216;4751;4931;5570;5594;5595;6950;7520;9212;10576;65057 NEK2;AURKB;PKIB;DKC1;CCT2;HNRNPA2B1;HNRNPD;MAP3K4;ACD;MAPK1;NVL;TCP1;MAPK3;XRCC5 geneontology_Biological_Process GO:0051988 regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051988 11 7 2.17289305076392 3.22151152240973 0.00180939406570735 0.0258661106211346 891;1894;3192;4751;10615;29127;55920 CCNB1;NEK2;ECT2;SPAG5;RACGAP1;RCC2;HNRNPU geneontology_Biological_Process GO:0032530 regulation of microvillus organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032530 11 7 2.17289305076392 3.22151152240973 0.00180939406570735 0.0258661106211346 688;5337;5909;6624;7429;7430;10083 VIL1;KLF5;EZR;USH1C;RAP1GAP;PLD1;FSCN1 geneontology_Biological_Process GO:1904816 positive regulation of protein localization to chromosome, telomeric region http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1904816 11 7 2.17289305076392 3.22151152240973 0.00180939406570735 0.0258661106211346 908;1736;6950;10576;10694;22948;26354 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;GNL3 geneontology_Biological_Process GO:0046831 regulation of RNA export from nucleus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0046831 11 7 2.17289305076392 3.22151152240973 0.00180939406570735 0.0258661106211346 1660;7175;9972;10657;11052;22916;29072 CPSF6;TPR;DHX9;NCBP2;NUP153;KHDRBS1;SETD2 geneontology_Biological_Process GO:0051204 protein insertion into mitochondrial membrane http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051204 29 13 5.72853622474125 2.26934062908665 0.00188588515232779 0.0268916771972988 581;841;1869;2810;5366;7027;7029;7161;7533;7534;10018;10971;90427 E2F1;SFN;TFDP1;BMF;YWHAQ;TP73;BCL2L11;YWHAZ;YWHAH;PMAIP1;CASP8;BAX;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0031334 positive regulation of protein complex assembly http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0031334 214 60 42.2726466239527 1.41935754658906 0.00199525977123183 0.0283798129772447 142;402;581;822;1385;2071;2242;2885;2967;3055;3383;3936;4312;5058;5217;5341;5366;6117;6118;6119;6624;6714;6928;7040;7408;7422;7429;7456;8440;8450;8851;8936;9530;9557;9774;10018;10094;10096;10097;10109;10152;10563;10787;10923;11135;11151;22919;22976;23221;23580;29108;50807;51199;55832;55971;57472;81620;90427;147179;255967 CDT1;VIL1;NCK2;CAPG;WASF1;MMP1;PFN2;BMF;SRC;MAPRE1;PYCARD;PLEK;ASAP1;CNOT6;RPA1;HNF1B;ICAM1;VASP;PAK1;BCL2L11;VEGFA;TGFB1;CAND1;GTF2H3;ABI2;CXCL13;PMAIP1;PARP1;WIPF2;NCKAP1;ACTR2;NIN;FSCN1;ACTR3;FES;PAN3;BAX;CDK5R1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;LCP1;GRB2;HCK;BAIAP2L1;SUB1;CUL4B;CREB1;CHD1L;CORO1A;BCLAF1;RPA2;WIPF1;BAG4;RPA3;PAXIP1;ERCC3;ARPC2;RHOBTB2;ARL2 geneontology_Biological_Process GO:0002285 lymphocyte activation involved in immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002285 139 42 27.4574667323805 1.52963856459742 0.0020088993535452 0.0285022036100736 25;100;942;1880;2150;2207;2956;3383;3566;3606;3936;3956;3958;3965;4436;4853;5971;7037;7040;7158;7248;7292;7374;8767;9025;9156;9466;9655;9984;10892;11151;22976;23075;23529;51010;54518;55183;64218;64332;79915;165918;201294 EXO1;MSH2;ATAD5;TFRC;MSH6;F2RL1;UNG;FCER1G;NOTCH2;IL27RA;ICAM1;NFKBIZ;ADA;RIF1;TGFB1;ABL1;TNFSF4;CLCF1;IL4R;THOC1;LGALS9;LGALS3;APBB1IP;EXOSC3;RNF8;SWAP70;TP53BP1;RNF168;RIPK2;TSC1;RELB;LCP1;SEMA4A;SOCS5;UNC13D;MALT1;IL18;LGALS1;CORO1A;GPR183;PAXIP1;CD86 geneontology_Biological_Process GO:0046822 regulation of nucleocytoplasmic transport http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0046822 99 32 19.5560374568753 1.63632331297002 0.00203760034737166 0.0288371389161774 580;983;999;1660;1894;2316;2810;3843;4088;4659;5469;5501;5580;5594;5905;5936;7040;7175;7514;9972;10155;10541;10657;11052;22916;23636;29072;51366;51512;57506;57510;64328 CDK1;ECT2;GTSE1;SFN;BARD1;PRKCD;NUP62;CPSF6;FLNA;TPR;DHX9;PPP1CC;XPO1;TRIM28;TGFB1;NCBP2;NUP153;KHDRBS1;XPO5;IPO5;PPP1R12A;ANP32B;MAPK1;RANGAP1;CDH1;MED1;SETD2;UBR5;MAVS;SMAD3;RBM4;XPO4 geneontology_Biological_Process GO:0006356 regulation of transcription by RNA polymerase I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006356 26 12 5.13592902907836 2.33648088438508 0.00206908299483555 0.028992769390505 1663;2316;4141;4691;5469;6597;6598;7343;9555;25926;55127;84128 DDX11;H2AFY;FLNA;HEATR1;SMARCB1;SMARCA4;NOL11;NCL;MED1;WDR75;UBTF;MARS geneontology_Biological_Process GO:0070198 protein localization to chromosome, telomeric region http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070198 26 12 5.13592902907836 2.33648088438508 0.00206908299483555 0.028992769390505 675;908;1736;6950;7015;7520;9555;10576;10694;22948;26354;65057 H2AFY;DKC1;CCT5;TERT;CCT2;BRCA2;CCT6A;ACD;TCP1;CCT8;GNL3;XRCC5 geneontology_Biological_Process GO:0051567 histone H3-K9 methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051567 26 12 5.13592902907836 2.33648088438508 0.00206908299483555 0.028992769390505 672;1786;1789;3720;6598;6839;9682;10919;55183;55818;57673;79723 DNMT1;BRCA1;DNMT3B;SUV39H2;EHMT2;BEND3;RIF1;SMARCB1;SUV39H1;JARID2;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0010390 histone monoubiquitination http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010390 26 12 5.13592902907836 2.33648088438508 0.00206908299483555 0.028992769390505 4591;6045;7324;7703;8450;9810;10336;29128;51322;54880;56970;165918 UHRF1;BCOR;ATXN7L3;TRIM37;PCGF2;UBE2E1;RNF168;RNF2;PCGF3;RNF40;CUL4B;WAC geneontology_Biological_Process GO:0019827 stem cell population maintenance http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0019827 123 38 24.2968950221784 1.56398584943933 0.00207730420584806 0.0290360965661874 182;607;1000;2176;2177;3976;4017;4849;4851;4853;5460;6659;6662;6688;6928;6944;8202;8243;8289;8324;8861;9126;9282;9968;10642;10736;22823;25836;26354;27257;51586;51593;55183;55818;56339;57216;259266;283149 ASPM;FANCD2;SOX4;IGF2BP1;BCL9;MTF2;SMC1A;SMC3;LIF;SOX9;NOTCH2;FANCC;HNF1B;MED12;MED14;BCL9L;SRRT;RIF1;NOTCH1;FZD7;CNOT3;VPS72;SPI1;POU5F1;JAG1;ARID1A;SIX2;MED15;LDB1;GNL3;NIPBL;VANGL2;NCOA3;LOXL2;CDH2;KDM3A;LSM1;METTL3 geneontology_Biological_Process GO:1902905 positive regulation of supramolecular fiber organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1902905 160 47 31.6057171020207 1.48707272954092 0.00214406549810353 0.0298954551348869 25;351;402;961;2150;2242;2316;2885;3055;3383;3984;4088;5058;5217;5341;5829;6281;7016;7046;7248;7408;7429;7456;8440;8851;8936;9037;9270;9530;10094;10096;10097;10109;10152;10787;11135;11151;22919;23075;23221;23580;29108;51199;55971;59341;147179;285590 VIL1;NCK2;WASF1;PFN2;MAPRE1;PYCARD;LIMK1;F2RL1;PLEK;FLNA;ICAM1;VASP;PAK1;ABL1;S100A10;ABI2;WIPF2;NCKAP1;ACTR2;SH3PXD2B;SWAP70;NIN;ACTR3;APP;FES;CDK5R1;TSC1;ARPC3;CDC42EP1;CDC42EP4;GRB2;HCK;BAIAP2L1;ITGB1BP1;TRPV4;TESK1;TGFBR1;CORO1A;SMAD3;CD47;WIPF1;BAG4;ARPC2;PXN;RHOBTB2;ARL2;SEMA5A geneontology_Biological_Process GO:0070849 response to epidermal growth factor http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070849 43 17 8.49403647116806 2.00140416840737 0.00217287286529966 0.0302226862173498 790;867;1277;2950;4141;4176;4691;5335;5469;5594;5595;5782;6662;7175;7429;8826;9530 MCM7;VIL1;CAD;SOX9;IQGAP1;TPR;COL1A1;PLCG1;MAPK1;CBL;NCL;MED1;MAPK3;BAG4;PTPN12;GSTP1;MARS geneontology_Biological_Process GO:0006972 hyperosmotic response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006972 20 10 3.95071463775259 2.5311876247505 0.00233018518652506 0.0318096452673495 231;2056;2547;5585;6513;6558;7520;9076;9181;59341 ARHGEF2;EPO;AKR1B1;SLC2A1;SLC12A2;CLDN1;PKN1;TRPV4;XRCC5;XRCC6 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DNA double-strand break processing http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0000729 17 9 3.3581074420897 2.6800810144417 0.00233753973347772 0.0318096452673495 580;641;672;1763;5932;7334;9156;51444;83990 EXO1;BRCA1;RBBP8;BLM;BARD1;DNA2;BRIP1;RNF138;UBE2N geneontology_Biological_Process GO:0007063 regulation of sister chromatid cohesion http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007063 17 9 3.3581074420897 2.6800810144417 0.00233753973347772 0.0318096452673495 699;1663;2237;5885;6421;9555;9700;25836;113130 CDCA5;BUB1;FEN1;ESPL1;DDX11;SFPQ;RAD21;H2AFY;NIPBL geneontology_Biological_Process GO:0051307 meiotic chromosome separation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051307 17 9 3.3581074420897 2.6800810144417 0.00233753973347772 0.0318096452673495 641;7153;7155;7272;9700;23397;29781;80010;146956 TOP2A;NCAPH;TTK;ESPL1;EME1;BLM;RMI1;NCAPH2;TOP2B geneontology_Biological_Process GO:0070734 histone H3-K27 methylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0070734 17 9 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E2F1;TYMS;IGF2BP2;NCK2;SOX4;RGS2;PRKCD;IGF2BP1;CDK4;IGF2BP3;GRB7;DHFR;ILF3;TIA1;RAN;LSM14B;CNOT6;UPF3B;TPR;SET;DHX9;HNRNPR;DKC1;XPO1;SRRT;EIF4EBP1;NCOR2;TCOF1;YWHAZ;KHSRP;TGFB1;TERT;EIF5A2;NCBP2;HELZ;KHDRBS1;PASK;XPO5;MEX3D;HNRNPA2B1;CNOT3;HNRNPU;ZNF385A;PUS7;LARP4B;HNRNPD;HNRNPA0;DAPK1;HNRNPL;BTG2;EIF4A3;EXOSC2;POU5F1;RPS6KA1;EXOSC3;PA2G4;APP;HNRNPM;POLR2B;CAPRIN1;EIF4G2;MAPK1;CNOT10;PTAFR;PCID2;SYNCRIP;NCBP1;RPS6KB1;TSC1;SAMD4B;CASC3;SMG5;NCL;POLR2D;MAPK3;PRKRA;RPS6KA3;PRKCA;MTPN;EIF4A2;DGCR8;DCP2;TDRD7;PKP3;MAGOH;RBM3;SMAD3;NUDT21;YTHDF1;CARHSP1;UPF3A;RBM4;METTL3;CNOT7;QKI;PUM2 geneontology_Biological_Process GO:0061351 neural precursor cell proliferation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0061351 112 35 22.1240019714145 1.58199226546906 0.00246724805411014 0.0332549791293274 473;1000;1627;2260;2263;2316;2787;2889;3091;4673;4851;6240;6259;6604;6692;7005;7040;7422;7832;8323;9181;9253;9833;9928;10642;10653;10818;10890;23028;29127;54820;58155;63925;79801;259266 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regulation of chromatin organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1905268 51 19 10.0743223262691 1.88598293608861 0.00275080968770469 0.0365547738077377 672;1786;1789;3159;3720;4302;6418;6598;6688;8971;9555;9682;22823;25942;29028;51366;54880;55170;55818 DNMT1;BRCA1;HMGA1;ATAD2;DNMT3B;MTF2;BCOR;PRMT6;H2AFY;SET;H1FX;SMARCB1;MLLT6;SPI1;SIN3A;JARID2;UBR5;KDM3A;KDM4A geneontology_Biological_Process GO:0007229 integrin-mediated signaling pathway http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007229 89 29 17.580680137999 1.64953800264639 0.00282370449316249 0.0372610515985848 25;102;961;1601;2192;2207;2316;3055;3675;3678;3684;3685;3687;3688;3689;3691;3911;5341;6714;6850;7305;7791;8751;8754;9270;10451;55920;65979;83706 FBLN1;RCC2;SRC;ITGA5;ITGB4;ITGA3;ADAM9;ITGAV;PLEK;FLNA;DAB2;FCER1G;LAMA5;ITGAM;ABL1;ITGB1;SYK;ZYX;ADAM10;ITGB2;ADAM15;FERMT3;HCK;ITGB1BP1;PHACTR4;CD47;ITGAX;TYROBP;VAV3 geneontology_Biological_Process GO:0035601 protein deacylation 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PPT1;SFPQ;BAZ2A;RBBP4;CHD3;HDAC2;SAP30;RBBP7;HDAC1;SPRED1;VEGFA;TGFB1;HDAC7;SUDS3;KDM1A;MTA3;PHF21A;CHD4;TBL1XR1;HDAC11;EP300;SIN3A;MTA2;NIPBL;SIN3B;MORF4L1;PRKAA1;AKAP8;SPRED2 geneontology_Biological_Process GO:0007276 gamete generation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0007276 424 107 83.7551503203549 1.27753337664294 0.00286378744947302 0.037702094770853 90;102;174;330;581;675;694;891;994;995;1399;1788;1869;2119;2175;2176;2177;2188;2189;2302;2649;2678;3014;3148;3267;3298;3482;3566;3688;3833;3985;4090;4436;4603;4851;4957;5050;5127;5347;5889;5901;5997;6045;6198;6305;6498;6627;6662;6690;6714;6732;6752;6790;6908;7016;7040;7046;7130;7153;7182;7272;7301;8195;8607;9025;9232;9319;9514;10018;10406;10657;10927;11040;22955;23139;23353;23397;23424;23636;23762;26064;26271;26292;26528;29127;29781;51361;51465;51668;55120;55329;55342;55723;55818;56339;56648;57178;64395;65010;79582;81624;81930;83990;84515;90780;147912;259266 TOP2A;KIFC1;AFP;E2F1;ASF1B;PLK1;CCNB1;PTTG1;NCAPH;ASPM;TRIP13;TTK;GAL3ST1;RACGAP1;HMGB2;CDC25C;AURKA;FANCD2;PAFAH1B3;H2AFX;KIF18A;CDC25B;FANCG;FOXJ1;FBXO5;MCM8;MSH2;RGS2;TYRO3;MNS1;WFDC2;SRC;BRIP1;SPIN1;SPINK1;HSF2;CDK16;DIAPH3;FANCA;SOX9;NUP62;SKIL;RAN;SCMH1;DNMT3A;NCAPH2;PYGO2;RAD51C;SNRPA1;MAST2;FANCL;FANCC;MYBL1;GMCL1;BCL2L11;ETV5;TGFB1;ZMIZ1;NOTCH1;RAI14;ITGB1;EIF5A2;SMAD5;SUN1;KHDRBS1;NR6A1;SLC26A6;IL4R;SIX5;ODF2;SBF1;BRCA2;AGFG1;TBP;ACVR1;GGT1;OSBP2;SRPK1;MKKS;CRKL;HSPB11;RNF8;NR2C2;ADAM10;TNFAIP6;BAX;RNF2;RPS6KB1;HOOK1;BIRC3;UBE2J1;IGF2R;DAZAP1;BTG1;MYCBP;STRBP;SPAG16;FANCF;PIM2;TESK1;TDRD7;TGFBR1;RUVBL1;KDM3A;LIMK2;METTL3;SSTR2 geneontology_Biological_Process GO:0021987 cerebral cortex development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0021987 97 31 19.1609659931 1.61787250241784 0.00289127953932966 0.0379341352411612 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DNA incision, 5'-to lesion http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006296 37 15 7.30882207984229 2.05231429033824 0.00292213973537025 0.0381157443362466 142;2071;2967;5111;5424;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;8450;9557;10714 RFC4;PCNA;POLD1;RFC3;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;GTF2H3;PARP1;CUL4B;CHD1L;RPA2;RPA3;ERCC3 geneontology_Biological_Process GO:0051653 spindle localization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0051653 37 15 7.30882207984229 2.05231429033824 0.00292213973537025 0.0381157443362466 1058;1778;3837;3993;3996;6993;9181;9700;10096;10097;10403;29899;51203;54820;259266 NUSAP1;CENPA;NDC80;ASPM;ESPL1;ARHGEF2;GPSM2;NDE1;KPNB1;LLGL1;ACTR2;ACTR3;DYNLT1;DYNC1H1;LLGL2 geneontology_Biological_Process GO:0006360 transcription by RNA polymerase I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0006360 55 20 10.8644652538196 1.84086372709127 0.00299813834024354 0.0390171520554452 1663;2071;2316;2967;4141;4691;5469;5595;6597;6598;6908;7270;7343;9014;9555;10849;11176;25926;55127;84128 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AURKB;ECT2;DTL;PBK;RAD51AP1;RAD54L;RAD51;FEN1;MAPK13;FANCD2;CDC25A;H2AFX;PCNA;FANCG;CHEK1;XRCC2;BRCA1;POLD1;TOPBP1;MSH2;BLM;PLEKHB1;USP1;POLA1;RRM1;BMF;HIST3H2A;BAK1;DNMT3B;ASNS;RFWD3;SMC1A;PRKDC;HMGN1;CYBA;VCAM1;CHEK2;MSH6;HIF1A;TIPIN;DNMT3A;CLK2;UNC119;PPP1CC;RAD18;ICAM1;POLE3;RAD1;CDKN2D;OPN1SW;TGFB1;PPM1D;ITGB1;RAD9A;INTS3;KDM1A;PARP1;TRIM32;BRCA2;DCLRE1C;MAP3K4;MAP4K3;EP300;RNF8;CRY1;TNFRSF11A;APP;CASP3;WRN;TP53BP1;RNF168;CBL;NET1;INTS7;BAX;IFI16;GRB2;KRAS;REV1;NIPBL;XRCC5;CUL4B;CREB1;EYA3;PRKAA1;PAXIP1;ERCC3;USP28;TLK2;RBM4;METTL3;XRCC6;MEIS2 geneontology_Biological_Process GO:0045736 negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045736 27 12 5.33346476096599 2.24994455533378 0.00306265862480792 0.03967439467972 836;1029;1030;1031;1032;1050;3843;5347;7128;9113;10527;10614 PLK1;CDKN2A;CDKN2C;CDKN2D;TNFAIP3;IPO5;LATS1;CASP3;IPO7;HEXIM1;CDKN2B;CEBPA geneontology_Biological_Process GO:0010720 positive regulation of cell development http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010720 425 107 83.9526860522425 1.27452741575672 0.00310195290239612 0.0400916789508321 25;351;1399;1435;1453;1627;1789;1856;1857;1869;1894;1946;2011;2033;2056;2119;2146;2242;2260;2316;2889;3065;3066;3091;3169;3675;3706;3976;3984;3987;4076;4673;4851;5025;5058;5270;5274;5361;5501;5584;5597;5756;5997;6091;6280;6281;6498;6604;6692;6790;6857;6929;6938;6993;7040;7077;7097;7161;7422;7516;7520;7852;8175;8321;8826;8904;9037;9043;9139;9181;9231;9253;9294;9585;9682;9896;10038;10059;10097;10109;10154;10507;22906;22943;22954;23013;23028;23060;23394;23529;23613;25836;29904;29993;51199;51393;51593;55558;55607;57498;57556;60436;63925;64764;84079;201294;259266 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CA9;SPINT1;DDR1;GPC3;DKK1;STIL;FGFR2;SOX4;TIMELESS;MMP14;SH3BP1;SPINT2;KIF20B;DLG3;SRC;PLXNA1;EZR;MMP12;ITGA5;FZD1;TEAD2;LIF;HIF1A;SOX9;ADAM17;DVL3;FLNA;MAGED1;DAB2;RAP2A;IFT57;FOLR1;KRT17;GORAB;HNF1B;MED12;VASP;KAT2A;PAK1;TRIM28;NPNT;ETV5;VEGFA;TGFB1;APAF1;LAMA5;MTHFD1L;NOTCH1;STK4;ABL1;MIB1;GATA4;DVL2;FZD5;PDX1;FZD7;ARHGEF19;VANGL1;SMURF2;KDM6A;STAT1;GNA13;SEMA4C;ACVR1;VCL;FZD6;MKKS;DLG5;JAG1;ARID1A;IFT172;FRS2;CSF1;BCL10;SIX2;TSC1;MED1;RAB10;PDCD10;RYK;PRKX;LCP1;GPC4;GRB2;GLMN;SETD2;FOXA1;KRAS;TNC;CELSR3;CLTC;BBS7;VANGL2;PHACTR4;SMAD3;FGFR1;CEP290;FEM1B geneontology_Biological_Process GO:0002824 positive regulation of adaptive immune response based on somatic recombination of immune receptors built from immunoglobulin superfamily domains http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002824 82 27 16.1979300147856 1.6668796553235 0.00329056899444691 0.0423361615399181 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regulation of regulatory T cell differentiation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045589 24 11 4.7408575653031 2.32025532268796 0.00338485812111566 0.0431569410442247 861;865;2175;2177;2648;3965;4773;7040;7292;8784;11006 FANCD2;NFATC2;FANCA;KAT2A;TGFB1;TNFSF4;CBFB;LGALS9;RUNX1;TNFRSF18;LILRB4 geneontology_Biological_Process GO:0032465 regulation of cytokinesis http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0032465 63 22 12.4447511089207 1.76781357919082 0.00340644457018469 0.0432374051834428 675;990;994;1894;3619;5347;5586;6790;9055;9212;9493;9585;9928;10112;11113;23636;28964;29072;29127;55660;84440;144455 CDC6;PLK1;KIF20A;PRC1;AURKB;ECT2;KIF23;RACGAP1;AURKA;CDC25B;KIF14;INCENP;KIF20B;CIT;E2F7;NUP62;GIT1;RAB11FIP4;BRCA2;PRPF40A;SETD2;PKN2 geneontology_Biological_Process GO:0071479 cellular response to ionizing radiation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0071479 63 22 12.4447511089207 1.76781357919082 0.00340644457018469 0.0432374051834428 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ANLN;EZH2;VIL1;KCTD17;RGS2;ITPKA;MNS1;EPO;SRC;EPS8L3;PLXNA1;DBN1;PRKCI;ITGA3;CENPJ;FZD1;LIMK1;PLXNC1;S100A9;F2RL1;CBFA2T2;CCDC88A;SKIL;SYT1;IQGAP1;SERPINI1;DVL3;CORO1C;ADNP;FNBP1L;PACSIN1;KAT2A;PAK1;SF3A2;DNM1L;VEGFA;AGRN;PLXNA3;DVL2;ANKRD27;KDM1A;RAC2;MARK2;RAB8B;ROBO1;NCKAP1;WASF2;ACTR2;DLG5;EP300;ZMYND8;NIN;FSCN1;CAPRIN1;FES;CDC42EP1;MAPK6;CDC42EP4;FIG4;TWF1;SEMA4D;TRAK1;RAPGEF1;DYNLT1;EFNA5;PPP1R9A;TGFBR1;CREB3L2;RHOQ;FGFR1;KIDINS220;ARPC2;CROCC;P2RX7;EEF2K;SEMA5A;TRPV2 geneontology_Biological_Process GO:0008298 intracellular mRNA localization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008298 12 7 2.37042878265155 2.95305222887558 0.00360423974747592 0.0453413360232471 5394;22794;23404;25946;51010;55795;399664 MEX3D;ZNF385A;EXOSC2;EXOSC3;PCID2;CASC3;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:0048025 negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0048025 12 7 2.37042878265155 2.95305222887558 0.00360423974747592 0.0453413360232471 3181;3190;3191;5725;10921;11338;27316 RBMX;U2AF2;RNPS1;HNRNPA2B1;HNRNPL;PTBP1;HNRNPK geneontology_Biological_Process GO:0018027 peptidyl-lysine dimethylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0018027 12 7 2.37042878265155 2.95305222887558 0.00360423974747592 0.0453413360232471 6598;6839;10919;29072;55818;55870;79723 SUV39H2;EHMT2;SMARCB1;ASH1L;SUV39H1;SETD2;KDM3A geneontology_Biological_Process GO:0045143 homologous chromosome segregation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045143 21 10 4.14825036964022 2.41065488071476 0.0036687464786892 0.046050496265764 898;2177;4439;5347;9134;9232;9319;9700;23353;83990 PLK1;PTTG1;CCNE1;TRIP13;ESPL1;FANCD2;BRIP1;CCNE2;SUN1;MSH5 geneontology_Biological_Process GO:0045943 positive regulation of transcription by RNA polymerase I http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045943 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 1663;4141;4691;6597;6598;7343;25926;55127;84128 DDX11;HEATR1;SMARCB1;SMARCA4;NOL11;NCL;WDR75;UBTF;MARS geneontology_Biological_Process GO:0090670 RNA localization to Cajal body http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090670 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 908;1736;5394;6950;8607;10576;10694;22948;167227 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;DCP2;RUVBL1;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:0090671 telomerase RNA localization to Cajal body http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090671 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 908;1736;5394;6950;8607;10576;10694;22948;167227 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;DCP2;RUVBL1;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:0090672 telomerase RNA localization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090672 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 908;1736;5394;6950;8607;10576;10694;22948;167227 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;DCP2;RUVBL1;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:0090685 RNA localization to nucleus http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0090685 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 908;1736;5394;6950;8607;10576;10694;22948;167227 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;DCP2;RUVBL1;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:1904872 regulation of telomerase RNA localization to Cajal body http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1904872 18 9 3.55564317397733 2.5311876247505 0.00386245913115291 0.0478454729572355 908;1736;5394;6950;8607;10576;10694;22948;167227 DKC1;CCT5;CCT2;CCT6A;TCP1;CCT8;DCP2;RUVBL1;EXOSC10 geneontology_Biological_Process GO:1900363 regulation of mRNA polyadenylation http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:1900363 15 8 2.96303597831444 2.69993346640053 0.00388307524413434 0.0478912613443235 904;4686;6626;9810;11051;11052;22916;79869 CPSF6;SNRPA;NCBP2;NCBP1;CPSF7;RNF40;NUDT21;CCNT1 geneontology_Biological_Process GO:0045292 mRNA cis splicing, via spliceosome http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0045292 15 8 2.96303597831444 2.69993346640053 0.00388307524413434 0.0478912613443235 4686;5936;9416;11168;22916;23020;51729;55660 PSIP1;SNRNP200;NCBP2;DDX23;WBP11;NCBP1;PRPF40A;RBM4 geneontology_Biological_Process GO:0001738 morphogenesis of a polarized epithelium http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0001738 79 26 15.6053228191227 1.66609818338008 0.00390820190305907 0.0480963716809074 25;1213;1601;1741;1856;1857;1951;2239;2719;3911;5911;6259;7430;7855;8321;8323;8324;9231;9968;10890;22943;23616;57216;64750;81839;128272 GPC3;DKK1;SH3BP1;DLG3;EZR;FZD1;DVL3;DAB2;RAP2A;MED12;LAMA5;ABL1;DVL2;FZD5;FZD7;ARHGEF19;VANGL1;SMURF2;FZD6;DLG5;RAB10;RYK;GPC4;CELSR3;CLTC;VANGL2 geneontology_Biological_Process GO:0033683 nucleotide-excision repair, DNA incision http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0033683 38 15 7.50635781172992 1.99830601953987 0.00395996149490829 0.0486276399624205 142;2071;2967;5111;5424;5982;5983;5984;5985;6117;6118;6119;8450;9557;10714 RFC4;PCNA;POLD1;RFC3;RFC5;POLD3;RFC2;RPA1;GTF2H3;PARP1;CUL4B;CHD1L;RPA2;RPA3;ERCC3 geneontology_Biological_Process GO:0002821 positive regulation of adaptive immune response http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0002821 87 28 17.1856086742238 1.6292701952417 0.00402887463704926 0.0493667950656621 100;2207;2956;3606;4436;5027;6375;6885;7037;7040;7158;7186;7292;7374;7855;8417;8767;9466;9655;10892;22976;23529;29108;51010;51571;55183;64332;79915 MSH2;ATAD5;PYCARD;TFRC;MSH6;TRAF2;UNG;FAM49B;FCER1G;IL27RA;NFKBIZ;ADA;MAP3K7;RIF1;TGFB1;TNFSF4;FZD5;CLCF1;XCL1;EXOSC3;TP53BP1;RIPK2;SOCS5;MALT1;IL18;PAXIP1;STX7;P2RX7 geneontology_Biological_Process GO:0010822 positive regulation of mitochondrion organization http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0010822 95 30 18.7658945293248 1.59864481563189 0.0040819449703644 0.0499090507067665 578;581;841;1869;2810;3091;3099;4318;5329;5366;5562;5880;6721;7027;7029;7161;7533;7534;7855;8743;9520;10018;10055;10059;10075;10971;29108;55737;57602;90427 E2F1;SFN;MMP9;TFDP1;BMF;BAK1;PYCARD;YWHAQ;SAE1;HK2;HIF1A;PLAUR;TP73;NPEPPS;BCL2L11;DNM1L;YWHAZ;FZD5;YWHAH;PMAIP1;RAC2;CASP8;BAX;HUWE1;VPS35;USP36;TNFSF10;PRKAA1;SREBF2;TFDP2 geneontology_Biological_Process GO:0005815 microtubule organizing center http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0005815 492 173 77.9079611650485 2.2205689561494 0 0 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TOP2A;CDC20;TPX2;KIFC1;KIF2C;CDK1;E2F1;CCNB2;PLK1;CCNB1;NEK2;AURKB;CENPF;BUB1B;DTL;CDC45;CCNE1;DLGAP5;NDC80;KIF23;ASPM;CEP55;SPAG5;TACC3;HMMR;MCM3;RAD51;KIF15;AURKA;ESPL1;CCNF;H2AFX;KIF18A;CDC25B;CDK2;WDR62;PCNA;CHEK1;XRCC2;BRCA1;PLK4;STIL;CAPG;TOPBP1;CKAP2;MARCKS;TUBG1;DDX11;NDRG1;GPSM2;KIF20B;MAPRE1;HAUS1;CCDC14;EZR;SASS6;CCNE2;IQCB1;CENPJ;NDE1;CKAP5;IFT80;NEDD1;DCLRE1B;KIF2A;NUP62;CHD3;CCDC88A;RAN;FAM110A;CTSC;RAB11FIP4;CEP78;IFT57;UPF3B;CCHCR1;TRAF5;DHX9;TUBG2;UNC119;CEP72;SFI1;RAD18;DDAH2;KAT2A;CEP192;CEP250;CDC42BPG;CCT5;OFD1;SLC1A4;RANBP1;MIB1;SSX2IP;CRMP1;CDC27;LZTS2;LRRCC1;NINL;RPP25;HSPA6;ODF2;BRCA2;HNRNPU;OLA1;CSNK1D;PPP1R12A;TAP1;DCAF12;CHD4;CEP152;EFHC1;HAUS2;MKKS;NUP50;DLG5;RRAGD;HSPB11;TUBGCP3;RBM39;KATNA1;NIN;PCNT;IFT172;LATS1;RIC8B;USP33;RP2;MAPK1;WRN;YES1;HIPK1;PTPN23;HOOK1;CEP97;CCDC120;RELB;CEP170;RASSF7;TCP1;KIF5B;FBXL7;MLF1;ITGB1BP1;CCT8;RBBP6;BBS7;FAM161A;CDC14A;RUVBL1;MPHOSPH9;ALS2;BICD2;EYA3;AKNA;NUDT21;CEP290;HOOK2;SPAG9;DYNC1H1;DYNC1I2;ROCK1;CROCC;PKN2;RNF19A;RAB11FIP5;TACC1;CCDC88C;ARFGEF2;HYLS1;DCTN5;DYNC1LI1;ARL2 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granule membrane http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0030667 205 48 32.4616504854369 1.47866788293879 0.00274365253800402 0.0127667551349961 102;858;961;963;965;1315;1535;1536;1650;2171;2207;2212;3482;3684;3685;3687;3689;3710;3903;3958;4893;5328;5329;5337;5724;5874;5912;6616;6717;6809;6813;6857;7097;7226;7305;8560;8826;8904;9545;10890;10970;11031;51143;54495;54918;80331;83858;258010 ITPR3;CKAP4;SNAP25;FABP5;CYBA;PLAUR;STX3;ITGAV;SYT1;IQGAP1;NRAS;RAB3D;FCER1G;RAP2B;ITGAM;CYBB;DEGS1;FCGR2A;RAB27B;CPNE1;LGALS3;PLD1;TLR2;DDOST;COPB1;ADAM10;ITGB2;CD53;PLAU;CAV2;PTAFR;LAIR1;DNAJC5;TMX3;RAB10;IGF2R;STXBP2;TRPM2;ATAD3B;RAB31;CD58;CD47;ITGAX;SVIP;TYROBP;CMTM6;DYNC1LI1;SRI geneontology_Cellular_Component GO:0005741 mitochondrial outer membrane http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0005741 119 31 18.8435922330097 1.64512156794048 0.00274476206579832 0.0127667551349961 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