Raw data for Table two ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, Cheese,,,,Fresh milk,,,,Fresh milk,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 1,1.322,1.224 ± 09,M,1,1.823,1.7 ± 28,S,1,1.521,1.39 ± 19,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.145,,,,1.888,,,,1.483,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.204,,,,1.377,,,,1.171,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 2,0.825,1.023 ± 18,W,2,1.161,1.094 ± 10,W,2,0.45,0.428 ± 02,N,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.172,,,,0.982,,,,0.413,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.072,,,,1.139,,,,0.421,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 3,1.414,1.241 ± 31,M,3,1.366,1.24 ±17,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,0.885,,,,1.288,,,,1.206,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.424,,,,1.606,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 4,1.348,1.38 ± 23,M,4,0.875,0.89 ± 08,W,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.176,,,,0.816,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.627,,,,0.968,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 5,1.001,0.956 ± 12,W,5,1.424,1.49 ± 14,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,0.818,,,,1.388,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.049,,,,1.649,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 6,1.005,1.4 ± 44,M,6,1.101,1.01 ± 0.9,W,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.316,,,,0.998,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.881,,,,0.922,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 7,0.795,1.78 ± 94,S,7,1.081,0.97 ± 13,W,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.889,,,,0.822,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,2.66,,,,0.993,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 8,1.259,1.34 ± 16,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.236,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.524,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 9,1.331,1.32 ± 02,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.289,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.328,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 10,1.163,1.228 ± 09,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.196,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.326,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 11,1.274,1.221 ± 05,M,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.181,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.208,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 12,1.73,1.634 ± 28,S,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.316,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,1.856,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, Raw data for Fig 2.,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,Antibiotics,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,Antibiotic resistance genes,,,,,,,,,, Cheese,Strain's number,Penicillin,Ampicillin,Ampicillin-sulbactam,Amoxicillin,Gentamycin,Amikacin,Streptomycin,Doripenem,Imipenem,Ertapenem,Ceftriaxone,Cefotetan,Vancomycin,Erythromycin,Clarithromycin,Ciprofloxacin,Trimethoprim,Sulfamethoxazole,Trimethoprim-sulfame,Oxytetracycline,Chloramphenicol,Fosfomycin,sul1,sul2,blaTEM,blaTEM variants,blaSHV,blaz,tetA,tetD,tetG,tetK,tetM ,Ch1,83,83,83,82,83,83,82,83,83,82,82,73,83,83,83,83,83,82,83,83,83,83,,,80,80,,,,,,, ,Ch2,83,83,83,82,82,83,82,83,83,83,82,82,83,83,83,83,83,82,83,82,83,83,80,80,80,,80,,80,,,80, ,Ch3,83,83,83,82,83,83,83,83,82,83,82,82,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,,,80,,,,,,,, ,Ch4,83,83,83,83,73,73,83,83,83,83,83,83,83,83,73,83,83,83,83,83,83,83,,,,,,,,,,, ,Ch5,83,83,83,82,83,73,83,83,83,83,83,83,83,82,83,83,82,82,83,82,83,83,80,80,,,,,,,,, ,Ch6,82,83,83,83,73,83,83,82,83,83,83,83,83,83,73,83,82,82,83,82,83,83,,80,,,,,80,,,80, ,Ch7,83,83,83,83,83,83,82,83,83,83,73,83,83,82,83,83,82,82,83,83,83,82,,,,,,,,,,, ,Ch8,82,83,83,82,73,73,82,83,82,83,82,83,83,82,83,82,82,82,83,82,82,83,,80,,,,,,,,,80 ,Ch9,83,83,83,83,73,73,83,83,83,83,83,83,83,82,83,83,82,82,83,83,83,83,,80,,,,,,,,, ,Ch10,82,82,82,83,82,83,82,82,83,83,83,83,83,82,82,83,82,82,82,83,83,83,,,,,80,,,,,, ,Ch11,83,83,83,83,83,82,83,82,83,83,82,82,83,82,83,83,82,82,83,83,83,83,,80,80,,,,,,,, ,Ch12,83,83,83,83,83,82,73,83,83,83,82,82,83,82,83,83,82,82,83,83,83,83,,,,,,,,,,, Freshmilk,Fm1,83,83,83,83,83,82,73,83,83,83,82,82,83,83,83,83,82,82,83,83,83,83,,,,,,,,,,, ,Fm2,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,73,83,83,83,83,83,83,83,,,,,,,,,,, ,Fm3,83,83,83,83,73,82,82,83,83,82,82,82,83,73,73,73,83,82,83,82,83,83,,,,,,,,80,,, ,Fm4,83,83,83,82,82,83,82,83,83,83,83,83,82,82,73,83,82,82,83,82,83,83,,80,,,,,,,,, ,Fm5,83,83,83,83,83,83,83,82,83,83,83,82,83,83,83,83,83,83,83,82,83,83,80,,,,,,,,80,80, ,Fm6,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,73,82,83,83,83,83,83,83,83,82,83,82,,,,,,,,,,80, ,Fm7,83,83,83,83,82,83,83,82,83,83,83,82,82,83,83,83,83,82,83,82,83,83,,,,,,80,80,,,, Rawmilk,Rm1,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,83,73,83,83,83,83,83,83,83,,,,,,,,,,, ,Rm2,82,82,82,82,82,73,82,82,83,83,83,83,83,82,82,83,82,82,82,83,83,83,80,80,,,,,,,,,