Abstract
目的
严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)又称新型冠状病毒,其新变异株不断产生,中国疫情防控压力持续增加。具有更强传染性、免疫逃逸能力和重复感染能力的Omicron变异株在短时间内传播至全球多个国家和地区,中国也陆续报道境外输入的Omicron变异株感染病例。本研究旨在通过分析湖南省Omicron变异株境外输入感染者的流行病学特征,更好地了解Omicron变异株的流行特点,为有效预防、控制境外输入疫情提供科学依据。
方法
回顾性收集2021年12月16日至31日湖南省长沙市收治的新型冠状病毒肺炎境外输入病例的临床资料,分析病例的流行病学史、一般情况、临床分型、临床症状、SARS-CoV-2疫苗接种情况及肺部CT影像等资料。采集鼻咽拭子及血液标本,利用SARS-CoV-2检测试剂盒通过磁珠法进行病毒核酸检测,比较无症状感染者和确诊患者ORF1ab基因和N基因的Ct值差异;特异性IgM、IgG抗体分别采用SARS-CoV-2 IgM检测试剂盒和SARS-CoV-2 IgG检测试剂盒通过化学发光法检测,比较无症状感染者和确诊患者特异性抗体IgM抗体和IgG抗体的差异。
结果
共收治17例Omicron变异株境外输入感染者,其中确诊15例(普通型5例、轻型10例)、无症状感染者2例。17例Omicron变异株感染者均为中国籍,年龄总体偏年轻,男性16例。9例患者有基础疾病,其中3例患者为呼吸系统疾病。17例感染者均已完成SARS-CoV-2疫苗全流程接种,但仅有1人接种了SARS-CoV-2疫苗加强针。患者临床表现较轻,主要表现为咽喉干/痛/痒、咳嗽、乏力。Omicron变异株感染的无症状感染者和确诊患者的总蛋白质和肌酸均在正常参考值范围内,但其他生化指标均出现异常,无症状感染者与确诊患者间仅C反应蛋白和纤维蛋白原差异具有统计学意义(均P<0.05),确诊患者中C反应蛋白升高者较多。入院时特异性IgM、IgG抗体检出率为100%,无症状感染者与确诊患者间特异性抗体水平差异无统计学意义(P>0.05)。无症状感染者和确诊患者ORF1ab基因的Ct值分别为21.35和18.39,N基因的Ct值分别为19.22和15.67,核酸Ct值差异无统计学意义(P>0.05)。仅3例患者肺部CT存在异常,表现为少量斑片状、条索状影,其中1例入院时未见异常,入院后出现肺部病变并呈现游走性现象。
结论
Omicron变异株感染者有年轻化趋势且临床症状较轻,但病毒载量高、传染性强,因此对无症状感染者和表现轻微症状感染者的及时识别和有效隔离、管控极其重要;在疫情防控上,政府仍需加强境外输入的风险管控,坚持常态化疫情防控措施,以有效控制传染源、切断传播途径、保护易感人群。
Keywords: 新型冠状病毒肺炎, Omicron变异株, 严重急性呼吸综合征冠状病毒2, 境外输入, 流行病学特征
Abstract
Objective
With the continuous generation of new variants of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the pressure of epidemic prevention and control continues to increase in China. Omicron with stronger infectiousness, immune escape ability and repeated infection ability spread to many countries and regions around the world in a short period of time. China has also successively reported cases of imported Omicron infections. This study aims to understand the epidemiological characteristics of Omicron variant via analyzing the epidemiological characteristics of imported patients with Omicron in Hunan Province, and to provide reference for preventing and controlling the imported epidemics.
Methods
The clinical data of imported patients with coronavirus disease 2019 admitted to Hunan Province from December 16 to December 31, 2021 were retrospectively collected. The epidemiological information, general information, clinical classification, clinical symptoms, vaccination status, and lung CT were analyzed. Nasopharyngeal swabs and blood samples were collected. Virus nucleic acid was detected by magnetic beads method using SARS-CoV-2 detection kit. Ct values of ORF1ab gene and N gene were compared between asymptomatic infected patients and confirmed patients. The specific IgM and IgG antibodies were detected by chemiluminescence assay using SARS-CoV-2 IgM test kit and SARS-CoV-2 IgG test kit, respectively. Ct values of IgM and IgG antibodies were compared between asymptomatic infected patients and confirmed patients.
Results
Seventeen patients with Omicron variant infection were treated in Hunan, including 15 confirmed patients (5 common type and 10 mild type) and 2 asymptomatic infection patients. The 17 patients were all Chinese, they were generally young, and 16 were male. There were 9 patients with diseases. Of them 3 patients had respiratory diseases. All 17 patients had completed the whole process of vaccination, but only one person received a booster shot of SARS-CoV-2 vaccine. The clinical manifestations of the patients were mild, mainly including dry/painful/itchy throat, cough, and fatigue. The total protein and creatine in the asymptomatic infection and confirmed cases infected with Omicron variant were all within the normal range, but other biochemical indicators were abnormal. There were the significant differences in C-reactive protein and fibrinogen between asymptomatic infection and confirmed patients (both P<0.05). There were more patients with elevated C-reactive protein in confirmed patients than without confirmed ones. The detection rate of specific IgM and IgG antibodies on admission was 100%, and there was no significant difference in the specific antibody levels between asymptomatic infection and confirmed patients (P>0.05). There were no significant differences in Ct values of ORF1ab gene and N gene (21.35 and 18.39 vs 19.22 and 15.67) between the asymptomatic infection and the confirmed patients (both P>0.05). Only 3 patients had abnormal lung CT, showing a small amount of patchy and cord-like shadows. One of them had no abnormality on admission but had pulmonary lesions and migratory phenomenon after admission.
Conclusion
The patients with Omicron variant tend to be young people and have milder clinical symptoms, but the viral load is high and the infectiveness is strong. Therefore, the timely identification and effective isolation and control for asymptomatic infections and confirmed patients with mild symptoms are extremely important. In terms of epidemic prevention and control, the government still needs to strengthen the risk control of overseas input, adhere to normalized epidemic prevention and control measures, to effectively control the source of infection, cut off the route of transmission, and protect vulnerable people.
Keywords: coronavirus disease 2019, Omicron variant, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, imported case, epidemiological characteristics
严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)自被发现以来,通过不断进化和变异,已产生多种变异株,如Alpha(B.1.1.7)、Beta(B1.351)、Gamma(P.1)和Delta(B.1617.2)[1]。2021年11月,南非首次报道了最新变异株Omicron变异株感染病例,并在短时间内传播至全球多个国家和地区[2]。截至2022年1月20日,已经有171个国家报道了新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)病例存在Omicron变异株感染,在短期内成为南非、美国、英国等国家的主要流行株[3]。2021年12月9日起,中国内地也陆续多次报道从境外输入的Omicron变异株感染病例[4-5]。
相比之前发现的Delta等变异株,Omicron变异株有更多突变,因此具有更强的传染性和免疫逃逸能力[6],以及更强的重复感染能力[7]。境外COVID-19疫情形势严峻,中国也一直持续面临较大的境外病例输入风险,已有多地出现由于境外输入病例造成的本土疫情。2022年1月8日,天津报告了中国内地首例Omicron变异株感染的本土确诊患者,并在短时间内造成社区传播[8-9]。因此,本研究通过对湖南省长沙市某定点医院收治的Omicron变异株境外输入感染病例进行分析,旨在了解Omicron变异株感染病例的流行病学特征,为更好地预防及有效控制境外输入疫情提供科学依据。
1. 资料与方法
1.1. 资料来源
收集长沙市某定点医院从2021年12月16日至31日收治的SARS-CoV-2 Omicron变异株境外输入感染病例的临床资料。
1.2. 方法
1.2.1. 病例诊断
确诊患者和无症状感染者的诊断标准参照《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第八版 修订版)》[10]。境外输入病例:发病前14 d有境外疫情国家或地区旅居史的病例。Omicron变异株感染病例:通过SARS-CoV-2全基因组测序和序列分析判定。
1.2.2. 资料收集
收集Omicron变异株感染病例的流行病学史,人口学特征,临床分型,临床症状,疫苗接种情况,核酸阈值循环数(threshold cycle,Ct)值,特异性IgM、IgG抗体,肺部CT结果等资料。
1.2.3. 实验室检测
采集病例的呼吸道(鼻咽拭子)及血液标本,采用SARS-CoV-2检测试剂盒(圣湘生物科技股份有限公司)通过磁珠法检测SARS-CoV-2核酸。分别采用SARS-CoV-2 IgM检测试剂盒和SARS-CoV-2 IgG检测试剂盒(郑州安图生物工程股份有限公司)通过化学发光法检测SARS-CoV-2特异性IgM、IgG抗体。
1.3. 统计学处理
采用Excel和SPSS 23.0软件进行数据整理和分析,不符合正态分布的资料用中位数(第1四分位数,第3四分位数)[M(P 25,P 75)]表示,2组间比较采用秩和检验;计数资料采用例数描述,2组间比较采用Fisher确切概率法。P<0.05为差异有统计学意义。
2. 结 果
2.1. 基本情况
2021年12月16日至12月31日,湖南省长沙市定点医院共收治境外输入Omicron变异株感染病例17例,含确诊患者15例、无症状感染者2例。确诊患者中普通型5例、轻型10例。
17例Omicron变异株感染者均为中国籍,男性16例;患者整体年龄偏轻,年龄中位数35(30,49)岁;9例患者有基础疾病,其中3例为呼吸系统疾病(陈旧性肺结核、肺大泡、肺气肿);11例患者吸烟,3例有饮酒史(表1)。
表1.
Omicron变异株感染病例流行病学和人口学特征
Table 1 Epidemiological and demographic characteristics of Omicron variant infection cases
| 特征 |
确诊患者/例 (n=15) |
无症状感染者/例 (n=2) |
合计/例 (n=17) |
特征 |
确诊患者/例 (n=15) |
无症状感染者/例 (n=2) |
合计/例 (n=17) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 性别 | 疫苗接种史 | ||||||
| 男 | 14 | 2 | 16 | 是 | 15 | 2 | 17 |
| 女 | 1 | 0 | 1 | 否 | 0 | 0 | 0 |
| 年龄/岁 | 疫苗厂家* | ||||||
| 20~ | 4 | 0 | 4 | 北京生物 | 7 | 0 | 7 |
| 30~ | 5 | 2 | 7 | 北京科兴 | 4 | 0 | 4 |
| 40~ | 2 | 0 | 2 | 武汉生物 | 2 | 0 | 2 |
| 50~ | 4 | 0 | 4 | 阿斯利康 | 2 | 0 | 2 |
| 婚姻状况 | 智飞生物 | 0 | 1 | 1 | |||
| 已婚 | 11 | 1 | 12 | 疫苗接种地 | |||
| 未婚 | 4 | 1 | 5 | 中国 | 8 | 1 | 9 |
| 基础疾病 | 国外 | 7 | 1 | 8 | |||
| 有 | 7 | 1 | 8 | 疫苗全流程接种 | |||
| 无 | 8 | 1 | 9 | 完成 | 15 | 2 | 17 |
| 吸烟史 | 未完成 | 0 | 0 | 0 | |||
| 是 | 10 | 1 | 11 | 疫苗加强针 | |||
| 否 | 5 | 1 | 6 | 是 | 1 | 0 | 1 |
| 饮酒史 | 否 | 14 | 2 | 16 | |||
| 是 | 3 | 0 | 3 | ||||
| 否 | 12 | 2 | 14 | ||||
*1例疫苗厂家不详;北京生物:北京生物制品研究所;北京科兴:北京科兴生物技术有限公司;武汉生物:武汉生物制品研究所有限责任公司;阿斯利康:阿斯利康制药有限公司;智飞生物:重庆智飞生物制品股份有限公司。
2.2. 疫苗接种情况
在疫苗接种方面,17例感染者均已接种疫苗,其接种疫苗多数产自中国,以北京生物制品研究所疫苗为主(7例)。17例感染者中多数在国内接受疫苗接种,并且所有患者已完成疫苗全流程接种,仅1人接种了新冠疫苗加强针(表1)。
2.3. 临床特点
Omicron变异株感染者在入院时临床症状较轻,主要表现为咽喉干/痛/痒(10例)、咳嗽(8例)、乏力(6例),少数患者伴有口干、口苦、发热、头晕等症状,且所有患者入院后均未吸氧,血氧饱和度情况良好,维持在97%~99%。
对患者入院后的血常规及血生化指标进行分析,Omicron变异株无症状感染者和确诊患者的总蛋白质和肌酸均在正常参考值范围内,但其他生化指标均有异常。在确诊患者中C反应蛋白升高的患者较多(9例),无症状感染者的C反应蛋白均在正常参考值范围内,无症状感染者与确诊患者间C反应蛋白差异具有统计学意义(P<0.05)。无症状感染者和确诊患者均有纤维蛋白原异常的情况,但无症状感染者纤维蛋白原减少更为明显,无症状感染者与确诊患者间纤维蛋白原差异具有统计学意义(P<0.05,表2)。
表2.
境外输入Omicron变异株感染者临床指标比较
Table 2 Comparison of clinical indicators of patients infected with Omicron variant strains imported from abroad
| 指标 | n | 谷丙转氨酶/(U·L-1) | 谷草转氨酶/(U·L-1) | 总蛋白质/(U·L-1) | 白蛋白/(U·L-1) |
|---|---|---|---|---|---|
| P | 0.456 | 0.766 | 0.062 | 0.232 | |
| 无症状感染者 | 2 | 46.85* | 32.50* | 76.50 | 54.95* |
| 确诊患者 | 15 | 14.30(13.30, 54.00)§ | 27.40(21.80, 42.00)§ | 73.00(71.10, 74.90) | 51.20(48.70, 52.50)† |
| 指标 | 球蛋白/(g·L-1) | 尿素氮/(mmol·L-1) | 血肌酐/(μmol·L-1) | 乳酸脱氢酶/(U·L-1) | C反应蛋白/(mg·L-1) |
|---|---|---|---|---|---|
| 无症状感染者 | 21.55* | 3.83 | 79.65 | 112.5 | 0.45 |
| 确诊患者 | 23.00(21.00, 24.20)‡ | 4.95(77.10, 89.90)* | 81.10(77.10, 89.90) | 143.90(125.90, 168.70)* | 5.90(2.50, 20.90)‖ |
| P | 0.881 | 0.101 | 0.655 | 0.074 | 0.031 |
| 指标 | 肌酸激酶/(U·L-1) | 肌酸激酶同工酶/(U·L-1) | 白细胞/(×109·L-1) |
淋巴细胞/ (×109·L-1) |
中性粒细胞/ (×109·L-1) |
|---|---|---|---|---|---|
| 无症状感染者 | 99.50 | 11.90 | 6.06 | 1.44* | 4.04 |
| 确诊患者 | 131.10(96.00, 151.50)‡ | 13.30(11.00, 16.00)* | 7.03(5.55, 7.47)* | 1.37(3.18, 6.10)¶ | 4.70(3.18, 6.10)* |
| P | 0.233 | 0.156 | 0.371 | 1.000 | 0.655 |
| 指标 | 嗜酸性粒细胞/ (×109·L-1) | 血红蛋白/(g·L-1) | 血小板/(×109·L-1) |
D-二聚体/ (μg·mL-1) |
纤维蛋白原/ (g·L-1) |
|---|---|---|---|---|---|
| 无症状感染者 | 0.03 | 163.00* | 194.00 | 0.07 | 1.51† |
| 确诊患者 | 0.04(0.03, 0.07)* | 162.00(155.00, 169.00)‖ | 213.00(162.00, 273.00)† | 0.06(0.02, 0.25)† | 2.40(2.05, 2.60)† |
| P | 0.821 | 1.000 | 0.655 | 0.708 | 0.037 |
*异常例数为1;†异常例数为2;‡异常例数为3;§异常例数为4;¶异常例数为5;‖异常例数为9。无症状感染者以M表示;确诊者以M(P 25, P 75)表示。
2.4. 抗体水平及核酸Ct值
17例患者在入院时均能检出SARS-CoV-2特异性IgM抗体和IgG抗体,阳性率均为100%。无症状感染者和确诊患者特异性IgM抗体和IgG抗体水平差异均无统计学意义(均P>0.05,表3)。
表3.
境外输入Omicron变异株感染病例特异性抗体水平和核酸Ct值水平
Table 3 Specific antibody levels and Ct values of imported cases of Omicron variant infection from abroad
| 组别 | n | 特异性抗体/COI | 核酸Ct值 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| IgG | IgM | ORF1ab基因 | N基因 | |||
| P | 0.941 | 0.618 | 0.721 | 0.721 | ||
| 无症状感染者 | 2 | 10.35 | 0.043 | 21.35 | 19.22 | |
| 确诊患者 | 15 | 6.21(1.36, 11.63) | 0.025(0.016, 0.076) | 18.39(16.28, 21.56) | 15.67(12.82, 18.23) | |
Ct:阈值循环数。
无症状感染者和确诊患者入院时的咽拭子病毒核酸Ct值结果显示:2组患者ORF1ab基因和N基因的Ct值均差异无统计学意义(均P>0.05,表3)。
2.5. 影像学结果
在17例Omicron变异株感染者中,仅有2例普通型病例在入院时出现肺部影像学改变,表现为左肺舌叶及两下肺胸膜下可见斑片状及条索状影(图1)。另有1例普通型病例在入院时肺部CT未见异常,入院后复查,肺部CT影像出现新发斑片状及索条状影,第2次复查,肺部病变出现游走性现象。
图1.

境外输入Omicron变异株感染病例肺部CT影像
Figure 1 CT images of lung of imported Omicron variant infection cases
3. 讨 论
SARS-CoV-2新变异株不断产生,中国疫情防控压力持续增加,疫情防控措施也随之不断更新和严格。目前关于Omicron变异株感染者的临床症状特征、实验室指标、病毒载量、特异性抗体的特点鲜有报道。本研究对Omicron变异株感染患者的流行病学特征进行了初步的分析。
本研究中收治的17例Omicron变异株感染者均为从肯尼亚返回中国的输入性病例。从临床分型看,确诊患者占多数,并且未出现重型和危重型患者,由于感染者均已完成疫苗接种,所以疫苗接种状态与其临床分型的相关性有待进一步研究和分析。从发病人群年龄和性别分布来看,患者以男性居多,且年龄整体偏年轻,这可能与感染病例前往境外事由为务工有关,同时也提示Omicron感染有年轻化的趋势。
境外输入Omicron变异株感染者的临床表现主要为轻度上呼吸道症状,包括咽喉干/痛/痒、咳嗽、乏力等,并未出现如呼吸困难、嗅觉或味觉丧失等明显临床症状,Omicron变异株造成的临床症状比早期变异株要轻,这与目前国外如欧洲疾病与预防控制中心的报告以及南非相关研究[11]相一致。鉴于人体感染Omicron变异株后的主要临床表现在早期很难与急性上呼吸道感染、流行性感冒等多种常见呼吸道疾病鉴别,容易造成漏诊和过度防控,增加了疫情防控的难度。
本研究分析了17例Omicron感染者的实验室检查资料,C反应蛋白作为临床常用的炎症指标之一,可准确且快速地反映机体感染状态,在《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第八版修订版)》中也指出,C反应蛋白水平进行性升高是重型及危重型COVID-19患者临床预警指标之一[10]。在严重COVID-19患者和因多器官系统衰竭死亡的COVID-19患者中C反应蛋白升高,C反应蛋白激活补体,诱导促炎细胞因子的产生,并诱导细胞凋亡,可导致严重的后果[12]。在重型、危重型患者中可见D-二聚体水平升高,纤维蛋白原可作为预测COVID-19患者是否发展为重症的预测因子[13]。
既往研究[14-19]发现Delta等变异株感染者在发病后(或首次核酸检测阳性后)1周内特异性IgM、IgG抗体阳性率分别为11.11%~50.00%、3.7%~42.9%。本研究中17例Omicron变异株感染者在首次核酸检测阳性1周内均检测到特异性IgM、IgG抗体,阳性率达100%,提示Omicron变异株感染者可能较早出现特异性抗体。本研究还发现无症状感染者与有症状的确诊患者间特异性IgM、IgG抗体水平并未出现差异;而在SARS-CoV-2其他变异株的抗体研究[20]中发现无症状感染者的特异性IgG抗体水平比确诊患者的特异性IgG抗体水平低,可能的原因有:一是本研究纳入的17例Omicron感染者均已完成SARS-CoV-2疫苗接种,疫苗接种对特异性抗体的影响尚不明确;二是本研究样本数较少,并且缺乏重型、危重型患者的数据,可能对结果的判断产生选择性偏倚。
本研究发现Omicron感染者主要表现为无症状或轻微症状,入院时无症状感染者核酸N基因和ORF1ab基因的Ct值中位数分别为19.22和21.35,确诊患者的核酸N基因和ORF1ab基因的Ct值中位数分别为15.67和18.39,表明Omicron感染者体内病毒载量较高。核酸Ct值分析显示无症状感染者与确诊患者间病毒载量差异无统计学意义,表明Omicron感染者发病早期无论是否出现症状,均可能在鼻咽部检测到一定载量的病毒,Omicron变异株感染的无症状感染者在潜伏期内可能具有与确诊患者相同的传染性。因此,对无症状感染者和表现轻微症状感染者的及时识别和有效隔离、管控对COVID-19疫情的防控极其重要。
本组17例中有3例肺部CT出现异常,Omicron变异株感染病例的影像学表现及变化与既往变异株并不完全一致。由于病例数较少,需要后期有更多资料验证Omicron变异株对患者肺部的损伤及其与其他变异株之间的差异。
本研究具有一定的局限性,病例来源均为境外输入病例,病例数较少,尤其缺乏重症和危重症患者的相关数据,不能全面反映Omicron变异株感染者的临床特征。
综上所述,Omicron变异株感染者有年轻化趋势,且临床症状较轻,但由于感染者体内病毒载量高,使得Omicron变异株感染者的传染性强,因此对无症状感染者和表现轻微症状的感染者的及时识别和有效隔离、管控极其重要;在COVID-19疫情防控上仍需加强境外输入风险的管控,坚持常态化疫情防控措施,有效控制传染源、切断传播途径、保护易感人群。
基金资助
湖南省创新型省份建设专项(2020SK3014)。
This work was supported by the Special Project for the Construction of Innovative Provinces in Hunan Province, China (2020SK3014).
利益冲突声明
作者声称无任何利益冲突。
作者贡献
刘晓芳 论文构思、撰写和修改,数据分析;陈美平 数据采集,论文撰写;周志国 研究设计和实施,论文修改;陈东 论文构思,技术指导;莫娟 论文构思,技术指导;刘激扬 论文指导和修改。
原文网址
http://xbyxb.csu.edu.cn/xbwk/fileup/PDF/202203344.pdf
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