Table 1.
Primers used for generating Pfnek3 site-directed mutants
| Mutation | Sequence of mutagenic primers (5′-3′) |
|---|---|
| Y99F |
F: gtgatgagatatttatatctaaggtatatg R: taccttagatataaatatctcatcactttc |
| Y117F |
F: gatttgaataaatttatgaatgaattatata R: taattcattcataaatttattcaaatcatc |
| Y117D |
F: gatttgaataaagatatgaatgaattatata R: taattcattcatatctttattcaaatcatc |
| Y117E |
F: gatttgaataaagaaatgaatgaattatata R: taattcattcatttctttattcaaatcatc |
| Y122F |
F: tgaatgaattatttataatgaataagttaag R: cttattcattataaataattcattcatatattta |
| Y122D |
F: tgaatgaattagatataatgaataagttaag R: cttattcattatatctaattcattcatatattta |
| Y122E |
F: tgaatgaattagaaataatgaataagttaag R: cttattcattatttctaattcattcatatattta |
| Y172F |
F: aataatgaaatatttacagaaagtgaaata R: ttcactttctgtaaatatttcattatttaatttc |
| Y172D |
F: aataatgaaatagatacagaaagtgaaata R: ttcactttctgtatctatttcattatttaatttc |
| Y172E |
F: aataatgaaatagaaacagaaagtgaaata R: ttcactttctgtttctatttcattatttaatttc |
| Y238F |
F: aattgtttaagttttgaatcaattaaatttaag R: atttaattgattcaaaacttaaacaatttaatg |
| Y238D |
F: aattgtttaagtgatgaatcaattaaatttaag R: atttaattgattcatcacttaaacaatttaatg |
| Y238E |
F: aattgtttaagtgaagaatcaattaaatttaag R: atttaattgattcttcacttaaacaatttaatg |
| Y286F |
F: gaggataaaaattttaaaagctatattatc R: aatatagcttttaaaatttttatcctcaaaaag |
The designations F and R denote the forward and reverse primers, respectively, with the sites of mutagenesis underlined