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. 2025 Mar 15;27(3):340–346. [Article in Chinese] doi: 10.7499/j.issn.1008-8830.2411062

GAMT基因变异所致肌酸缺乏综合征2例并文献复习

Two cases of creatine deficiency syndrome caused by GAMT gene mutations and literature review

赵 婷婷 1,2,3, 潘 邹 1,2, 钟 建民 3, 唐 海云 4, 尹 飞 1,2, 彭 镜 1,2, 陈 晨 1,2,✉,
Editor: 王 颖
PMCID: PMC11928038  PMID: 40105081

Abstract

目的

总结GAMT基因变异所致肌酸缺乏综合征(creatine deficiency syndrome, CDS)的临床表现及遗传学特点。

方法

回顾性分析2020年12月—2024年12月中南大学湘雅医院儿童医学中心诊治的2例GAMT缺乏型CDS患儿的临床和遗传学资料。

结果

2例患儿均为婴幼儿期起病,GAMT基因均存在复合杂合变异,病例1表现为癫痫发作和智力障碍,病例2存在智力障碍及注意力缺陷多动障碍;2例患儿头颅磁共振波谱提示肌酸峰减低。肌酸治疗后病例1癫痫发作控制,2例患儿仍存在智力障碍及行为问题。截至2024年12月,国内共报道21例患者(包括本研究),国外报道115例。所有患者均有发育迟缓或智力障碍,66.9%(91/136)患者有癫痫发作,33.8%(46/136)患者存在运动障碍,36.8%(50/136)患者有行为问题,75.0%(102/136)患者接受肌酸治疗,癫痫发作及运动障碍可明显改善,认知改善不明显。

结论

GAMT缺乏型CDS罕见且临床表现不特异,及时诊断有助于针对性治疗,可部分改善预后。

Keywords: 肌酸缺乏综合征, GAMT基因, 智力障碍, 癫痫, 基因变异, 儿童


肌酸缺乏综合征(creatine deficiency syndrome, CDS)是一组因肌酸合成和转运障碍导致的先天性代谢性疾病,包括胍乙酸甲基转移酶(guanidinoacetate methyltransferase, GAMT)缺乏型、精氨酸甘氨酸脒基转移酶(L-arginine∶glycine amidinotransferase, AGAT)缺乏型和肌酸转运蛋白(creatine transporter, CRTR)缺乏型3种类型。GAMT缺乏型CDS是一种罕见的常染色体隐性遗传病,于1994年首次被报道1。截至2024年12月全世界已报道130余例,发病率为1/55万~1/264万2,发病年龄多在3个月至2岁。GAMT缺乏型CDS的临床主要表现为发育迟缓/智力障碍、癫痫、行为异常及运动障碍等3。该病目前在国内报道较少,不足20例,且患儿临床表现不特异,易漏诊或延迟诊断,早期针对性治疗可改善部分症状,提高患儿生活质量。因此,本文报道2例在中南大学湘雅医院儿童医学中心就诊的GAMT缺乏型CDS患儿并进行文献复习,探讨其临床及遗传学特点,以提高对该病的认识。

1. 资料与方法

1.1. 研究对象

回顾性分析2020年12月—2024年12月在中南大学湘雅医院儿童医学中心诊治的,经全外显子组测序(whole exome sequencing, WES)的2例GAMT基因变异所致CDS患儿的临床资料。本研究经我院医学伦理委员会批准(批号:202310892),并获得患儿监护人知情同意。

1.2. 资料收集

通过查阅病历记录、门诊复诊、电话随访收集患儿临床资料,包括:性别、起病年龄、发育情况、癫痫发作情况、行为异常、既往史、家族史、体格检查等一般资料,脑电图(electroencephalogram, EEG)、头颅磁共振成像(magnetic resonance imaging, MRI)、头颅磁共振波谱(magnetic resonance spectroscopy, MRS)、尿有机酸检测及基因检测等辅助检查,治疗经过及预后转归。

1.3. 基因变异分析

征得父母知情同意后行基因检测。采集患儿及父母外周静脉血2 mL,乙二胺四乙酸抗凝,提取基因组DNA,进行WES检测。检测变异形式包括单核苷酸变异、小片段插入缺失变异、拷贝数变异。并对受检者表型相关的变异按照美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)指南4进行详细的变异致病性评级解读分析。

1.4. 文献复习

以“GAMT”“肌酸缺乏综合征”为关键词在万方数据知识服务平台、中国期刊全文数据库、中国生物医学文献服务系统进行中文文献检索;以“GAMT”“creatine deficiency syndrome”为关键词在在线人类孟德尔遗传数据库(https://www.omim.org/)、PubMed数据库、人类基因突变数据库(http://www.hgmd.cf.ac.uk)进行英文文献检索。检索时间均为建库至2024年12月。筛选出具有完整临床资料并经基因诊断为GAMT基因变异所致CDS的病例,系统性总结并分析所有病例的临床和遗传学特征。

2. 结果

2.1. 病例介绍

病例1,女性,6岁11个月,因发作性愣神3年余就诊。首次发作年龄为3岁余,表现为愣神,伴双眼向一侧斜视,持续数秒,具体发作频率不详,考虑诊断“癫痫”,给予左乙拉西坦治疗后,未见明显好转,予加用丙戊酸钠、吡仑帕奈,仍频繁发作,1个月发作数次。患儿系第1胎第1产,足月顺产,出生体重3.2 kg,出生史无异常。患儿3个月抬头,6个月独坐,12个月独走,15个月会发“baba”“mama”。就诊时就读小学一年级,会数数,可以唱简单儿歌,不会10以内加减法。体格检查:神志清楚,吐字不清,定位、定向可。无特殊面容,四肢自主活动,肌力、肌张力正常,腱反射正常引出,病理征阴性。辅助检查:4岁7个月格塞尔发育量表评估示发育水平中度缺陷,粗大运动发育商69.6,精细运动发育商60,应物能发育商44,言语能发育商34.7,应人能发育商47.1。头颅MRS示肌酸峰明显减低(图1A)。头颅MRI示右侧海马体积较对侧略小。EEG示枕区节律减慢(6~8 Hz混合节律),醒睡期广泛性或弥漫性2.5~3.5 Hz棘慢波、慢波;过度换气诱发4次不典型失神发作。

图1. 2例GAMT缺乏型CDS患儿的头颅MRS结果 A为病例1右侧基底节区MRS图像,肌酸峰(Cr)明显减低。B为病例2右侧顶叶MRS图像,红色曲线为拟合曲线,白色曲线为真正的波谱曲线,肌酸主峰(Cr)存在但减低。.

图1

病例2,男性,7岁6个月,因发现智力发育落后6年余就诊。患儿9月龄定期体检提示智力发育稍落后,此后家长发现患儿行为幼稚、反应稍慢。4岁龄时表现多动且伴有注意力不集中,予补充赖氨酸、营养神经等治疗,未见明显好转。患儿系第1胎第1产,足月剖宫产,出生体重3 kg,出生史无异常。患儿6个月独坐,1岁4个月独走,1岁能会发“baba”“mama”,2岁半说短句,能听懂指令。体格检查:神志清楚,行为幼稚,吐词清楚,无特殊面容,四肢自主活动,肌力、肌张力正常,腱反射正常引出,病理征阴性。辅助检查:1岁9个月完善0~3岁婴幼儿发育量表结果示智力发育指数69,运动发育指数96,提示智力发育落后,运动发育中等水平。4岁1个月注意力缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder, ADHD)评定量表示ADHD多动型。7岁5个月ADHD评定量表示ADHD混合型。6岁6个月韦氏学龄前儿童智力测试示语言智商63,操作智商70,总智商63。头颅MRI示右额叶异常信号,非特异性脑白质病变可能。头颅MRS示肌酸峰减低(图1B)。尿有机酸检测示胍乙酸/肌酐比值升高,为1 004.93 mmo1/mol肌酐(参考值:10~280 mmo1/mol肌酐),提示GAMT缺乏。EEG示枕区节律略减慢(7~8 Hz混合节律夹杂3.5~5 Hz慢波),醒睡期广泛性2~2.5 Hz棘慢波、慢波,前头部著。

2.2. 遗传学结果及分析

病例1 WES结果显示患儿GAMT基因存在复合杂合变异,分别为c.352G>T(p.Glu118*)变异和c.327+43G>A变异(NM_000156.6),前者来自父亲,后者来自母亲(图2)。c.352G>T(p.Glu118*)变异位于第3外显子,为无义变异,该变异导致CDS的致病机制为功能缺失,在线工具NMD Prediction Tool(https://nmdpredictions.shinyapps.io/shiny/)预测该变异可导致无义介导的信使RNA降解,且在人群数据库gnomAD中没有收录,依据ACMG指南评级为可疑致病性变异(PVS1+PM2)。c.327+43G>A变异位于第2外显子,为内含子区域变异,在人群数据库gnomAD中频率小于万分之一,预测软件SpliceAI预测供体位点丢失(donor loss)评分为0.7,高度提示该变异可能使剪切供体位点丢失,导致信使RNA异常剪切。且与c.352G>T构成复合杂合,依据ACMG指南评级为意义不明变异(PM2+PM3+PP3)。结合临床表现及相关辅助检查,本例患儿诊断为GAMT缺乏型CDS。

图2. 病例1及其家系成员WES结果 病例1 GAMT基因存在c.352G>T(p.Glu118*)和c.327+43G>A变异,前者来自患儿父亲,后者来自患儿母亲。灰色框内为变异位点。.

图2

病例2 WES结果显示患儿GAMT基因存在复合杂合变异,分别为c.59G>C(p.Trp20Ser)变异和c.384C>G(p.His128Gln)变异(NM_138924),前者来自父亲,后者来自母亲(图3)。其中c.59G>C变异位于第1外显子,导致该基因编码的蛋白第20位色氨酸变为丝氨酸,为错义变异,体外功能实验显示该变异导致GAMT活性降低5,在人群数据库gnomAD中频率小于千分之一,综合注释依赖耗竭评分(combined annotation-dependent depletion, CADD)预测评分为31,罕见外显子组变体集成学习器(rare exome variant ensemble learner, REVEL)预测评分为0.94,对于编码区CADD>20或REVEL>0.8,依据ACMG指南评级为致病性变异(PS3+PM3+PM2+PP3)。c.384C>G变异位于第3个外显子,导致该基因编码的蛋白第128位组氨酸变为谷氨酰胺,为错义变异,在人群数据库gnomAD中没有收录,CADD预测评分为31,REVEL预测评分为0.587,根据ACMG指南该变异为意义不明的变异(PM2+PP3)。结合临床表现及相关辅助检查,本例患儿诊断为GAMT缺乏型CDS。

图3. 病例2及其家系成员WES结果 病例2 GAMT基因存在c.59G>C(p.Trp20Ser)和c.384C>G(p.His128Gln)变异,前者来自患儿父亲,后者来自患儿母亲。箭头所示为变异位点。.

图3

2.3. 治疗及随访

病例1予左乙拉西坦[23.8 mg/(kg·d)]、丙戊酸钠[22.8 mg/(kg·d)]、吡仑帕奈[0.14 mg/(kg·d)]抗癫痫发作治疗,明确诊断后补充肌酸并逐渐加量至9 000 mg/d[428 mg/(kg·d)],补充肌酸3个月后有2年余未再出现明显临床发作,末次复查4 h EEG示广泛性棘慢波,过度换气诱发1次失神发作。门诊规律复诊,末次随访时患儿就读小学三年级,生活可自理,交流合作,学习成绩差,注意力不集中。

病例2予补充肌酸并逐渐加量至10 000 mg/d[363 mg/(kg·d)]治疗,补充肌酸4个月后复查尿有机酸检验示胍乙酸/肌酐比值下降至399.35 mmo1/mol肌酐,定期于当地医院随诊,无癫痫发作,末次随访时患儿就读小学五年级,生活可自理,学习成绩较差,注意力不集中,情绪易激动。

2.4. 文献复习结果

共检索到国外病例报道文献33篇5-12,国内病例报道文献8篇13-20。国外已报道115例CDS患者,所有患者均有不同程度的发育迟缓,其中77例(67.0%)伴癫痫发作,44例(38.3%)有运动障碍,47例(40.9%)有行为问题,47例(40.9%)头颅MRI或MRS提示异常,25例(21.7%)EEG提示异常,81例(70.4%)接受肌酸治疗。国内已报道21例(包括本研究2例),所有患者均有不同程度的发育迟缓或智力障碍,其中14例(66.7%)伴癫痫发作,2例(9.5%)有运动障碍,3例(14.3%)有行为问题,13例(61.9%)头颅MRI或MRS提示异常,9例(42.9%)EEG提示异常,所有患者(100%)均接受肌酸治疗,见表1

表1.

中国21例GAMT基因变异所致CDS患者的临床资料及基因变异信息

病例 文献 GDD/ID 癫痫发作 运动障碍 行为问题 头颅MRS/MRI异常 EEG异常 肌酸治疗及剂量 变异位点
1 本研究 - - 有,428 mg/(kg·d) c.352G>T(p.E118*)和c.327+43G>A
2 本研究 - - 有,363 mg/(kg·d) c.59G>C(p.W20S)和c.384C>G (p.H128Q)
3 唐海2016[13] - - 有,- c.242C>T(p.A81V)
4 杨蕾2024[14] - - - - 有,- c.467C>A(p.A156D)和c.194T>C(p.L65P)
5 宋冬梅2017[15] - - - 有,300 mg/(kg·d) c.403G>A(p.D135N)和c.491dupG(p.V165Rfs*26)
6 孙卫华2020[16] - - - - 有,400 mg/(kg·d) c.289delC(p.Q97Sfs*17)和c.392-1G>C
7 闫丽红2021[17] - - - 有,- c.327G>A(p.K109K)
8 闫丽红2021[17] - - - 有,- -
9 闫丽红2021[17] - - - - 有,- -
10 张勇刚2021[18] - - 有,400 mg/(kg·d) c.412C>T(p.P138S)和IVS4-1G>A
11 Sun 2023[19] - - 有,400 mg/(kg·d) c.564G>T(p.M188I)和c.491dupG(p.G164Afs*14)
12 Sun 2023[19] - - - 有,400 mg/(kg·d) c.328-1G>A和c.403G>A(p.D135N)
13 Sun 2023[19] - - - 有,400 mg/(kg·d) c.328-1G>A和c.114C>T(p.G38G)
14 Sun 2023[19] - - - - 有,400 mg/(kg·d) c.328-2A>G和c.115A>G(p.K39E)
15 Sun 2023[19] - - - 有,400 mg/(kg·d) c.289delC(p.Q97Sfs*17)和c.392-1G>C
16 Sun 2023[19] - - - - 有,400 mg/(kg·d) -
17 Shen 2022[20] - - 有,4 g/d c.403G>A(p.D135N)和c.520T>C(p.W174R)
18 Shen 2022[20] - - - - 有,2 g/d c.134G>A(p.W45*)和c.316C>T(p.Q106*)
19 Shen 2022[20] - - 有,3 g/d c.491dup(p.V165Rfs*26)和c.403G>A(p.D135N)
20 Shen 2022[20] - - - - 有,2 g/d c.158_181+7del和c.181G>A(p.G61R)
21 Shen 2022[20] - - - - 有,1.5 g/d c.444_448del(p.F149Lfs*40)和c.520T>C(p.W174R)

注:[GDD]全面发育迟缓;[ID]智力障碍;[MRS]磁共振波谱;[MRI]磁共振成像;[EEG]脑电图。-为文献中未提及或未描述。

截至2024年12月31日,人类基因突变数据库收录国内外已经报道的84种GAMT基因变异,包含41种错义变异,23种移码变异,9种无义变异,6种内含子区域变异,4种框内变异,1种同义变异。国内已报道病例中完成基因检测18例,其中错义变异12种,内含子区域变异6种,移码变异5种,无义变异3种,同义变异1种。GAMT基因最常见变异是c.327G>A(p.Lys109=),该变异影响GAMT基因第2外显子的剪接,导致44个核苷酸插入21;其次为c.59G>C(p.Trp20Ser)变异,Almeida等5研究发现该变异在葡萄牙人群中存在高携带率。

3. 讨论

CDS是由基因变异导致肌酸合成和/或转运障碍的一组遗传代谢性疾病。GAMT缺乏型CDS相对少见,GAMT基因位于染色体19p13.3上,包含6个外显子,编码含有236个氨基酸的GAMT,参与肌酸合成。GAMT基因变异导致GAMT缺乏,引起胍乙酸积累及肌酸合成障碍,肌酸对于高能量需求器官至关重要,大脑是CDS患者的主要受累器官。肌酸与神经递质类似,以兴奋毒性和动作电位依赖的方式释放,可以与N-甲基-D-天冬氨酸、γ-氨基丁酸A型等多种受体相互作用,并在中枢传递过程中发挥重要作用,因此被认为是一种神经调节因子22。中枢神经系统中肌酸的完全缺失或明显下降,会引起发育迟缓/智力障碍、癫痫发作、运动障碍、行为问题等神经系统症状6

GAMT缺乏型CDS患儿同时具备临床表现及至少2种辅助检查,包括尿有机酸检测、头颅MRS以及基因检测结果即可诊断7。GAMT缺乏型CDS临床表现缺乏特异性及基因型-表型关联。本研究回顾136例GAMT缺乏型CDS患者,所有患者表现为不同程度的发育迟缓或智力障碍;66.9%患者出现癫痫发作。全面性强直或强直-阵挛发作和跌倒发作是最常见的发作类型,其次是肌阵挛发作和失神发作8。最常见的EEG改变包括背景减慢、多灶性尖波和广泛性慢棘慢波9。本研究中病例1主要表现为不典型失神发作,过度换气可诱发,癫痫发作控制后EEG异常仍存在;2例患儿EEG均表现为背景减慢及广泛性的慢棘慢波、慢波,与既往报道8相符,提示脑功能障碍。本研究中,33.8%患者有运动障碍,包括肌张力障碍、舞蹈症、共济失调等;36.8%患者有不同类型的行为异常,如ADHD、孤独症谱系障碍等。本研究2例患儿暂无明显运动障碍的表现,但均存在行为问题,需长期随访。头颅MRS显示肌酸峰明显降低或缺失为本病特征性改变10,患儿同时可存在MRI非特异性改变如苍白球T2高信号等8,本研究中2例患儿头颅MRS均提示肌酸峰减低,同时病例2尿有机酸检测示胍乙酸/肌酐比值显著升高,提示GAMT缺乏,对诊断具有重要提示意义。

本研究中病例1 GAMT基因存在复合杂合变异,其中c.352G>T变异可导致无义介导的信使RNA降解,c.327+43G>A变异SpliceAI剪接变异预测为中等可能,提示原有的供体剪接位点可能丢失,导致信使RNA序列的改变,进而影响蛋白质的功能,但需要进一步功能试验证实,且不能排除其GAMT基因存在其他变异类型。病例2 GAMT基因存在复合杂合变异,其中c.59G>C变异为已报道变异5,CADD评分及REVEL评分均提示可能具有强致病性,c.384C>G变异对RNA的编辑具有一定影响,可能会改变所编码的蛋白质功能。目前病例1的c.352G>T变异、c.327+43G>A变异及病例2的c.384C>G变异在人类基因突变数据库中暂未见收录,致病性有待进一步验证。

GAMT缺乏型CDS的治疗包括补充肌酸、鸟氨酸、苯甲酸钠以及限制精氨酸或蛋白质饮食11。补充肌酸治疗推荐剂量为400~800 mg/(kg·d)18。研究发现,大多数GAMT缺乏型CDS患儿在经治疗后行为、语言和日常生活技能方面都有所改善,有75%的患者补充肌酸治疗,可有效改善癫痫发作及运动障碍,但认知改善并不明显12。本研究中病例1癫痫发作好转,2例患儿仍存在学习困难及行为异常,需长期随访管理。

综上所述,GAMT缺乏型CDS是一种罕见但可治疗的神经系统疾病,早期诊治意义重大,因其非特异性的临床表现可能导致诊断及针对性治疗的延迟。因此,对于原因不明的发育落后/智力障碍、伴或不伴癫痫发作、运动障碍的患儿,怀疑本病时应进行肌酸代谢筛查、头颅MRS检测,并结合GAMT基因检测,以便早期确诊、分型和及时干预。

基金资助

中国抗癫痫协会“新锐酮学”研究项目基金(CX-A-2021-17)。

利益冲突声明

所有作者均声明不存在利益冲突。

作者贡献

赵婷婷负责资料收集、查阅资料、论文撰写;潘邹负责遗传学数据分析;钟建民负责部分病例资料收集;唐海云负责影像数据分析;尹飞、彭镜、陈晨负责论文设计、指导及修改。

参 考 文 献

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Articles from Chinese Journal of Contemporary Pediatrics are provided here courtesy of Xiangya Hospital, Central South University

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