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. 2026 Jul 6;19(31):1301–1323. doi: 10.56786/PHWR.2026.19.31.2

Five-year Incidence Trends and the Status of Major Rare Diseases in 2023 in the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in Korea」

Il-Su Park 1, Kyounga Lee 2,*, Jeongwook Lee 3, Jae-Hoon Ji 4, Eun-Ji Choi 5, Jee-Young Kim 6, Do-Hyeon Park 6, Kyoung-Hwa Choi 6
PMCID: PMC13470548  PMID: 42597817

Abstract

Objectives

This study analyzed 5-year trends in rare disease incidence, deaths, and medical expenditures in the Republic of Korea using the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in Korea」 (the Annual Report), with particular attention to the 2023 incidence figures by age, province, and frequently occurring diseases.

Methods

This retrospective descriptive study used data from the Annual Report from 2019 to 2023. The annual numbers of newly registered rare disease cases and of deaths and the figures for healthcare utilization were analyzed, with particular attention to the incidence status in 2023.

Results

Newly registered rare disease cases remained at around 50,000 annually before rising to 62,420 in 2023, with deaths and medical expenditures also increasing. In 2023, the incidence was highest among individuals in their 60s and those in the Gyeonggi-do region. Idiopathic pulmonary fibrosis and systemic lupus erythematosus with organ or system involvement were the most common rare diseases among males and females, respectively. Crohn’s disease of the small and large intestine was the most frequent among those in their 10s and 20s, autosomal dominant polycystic kidney disease among those in their 30s to 50s, and idiopathic pulmonary fibrosis among those aged 60 and older, which last also incurred the highest total annual medical expenditure.

Conclusions

The Annual Report has enhanced analytical accuracy and comprehensiveness through data refinement and statistical expansion. Future efforts should be directed to a transition from incidence-centered statistics to the establishment of a longitudinal data infrastructure that records incidence rates, survival rates, and the overall prevalence of rare diseases.

Keywords: Rare diseases, Rare disease statistics, Public health surveillance, Incidence


Key messages

① What is known previously?

Five editions of the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in Korea」 have been published. Until 2022, the number of new rare disease cases remained around 50,000.

② What new information is presented?

In 2023, the number of new rare disease cases was found to be 62,420, of which idiopathic pulmonary fibrosis accounted for the largest share of both the number of cases and total annual medical expenditures, followed by the newly designated polycystic kidney disease, autosomal dominant.

③ What are implications?

Expansions of the rare disease list and advances in statistics successfully steered potential patients into the healthcare system, indicating that future policies should tailor the statistical framework to disease characteristics.

Introduction

Globally, an estimated 300 to 400 million people are affected by rare diseases, and this number is increasing as new rare diseases are being continuously identified [1]. However, for each individual rare disease, the number of patients is small; therefore, the pathophysiology of such diseases has not been clearly elucidated, and the patterns of manifestation of such diseases are diverse, often making them highly unpredictable [2,3]. Previous studies have reported that it takes an average of more than 5 years to receive a definitive diagnosis for a rare disease, and even after diagnosis, patients face challenges because 95% of these diseases have no approved treatments [4,5]. Although diagnosis rates are gradually improving with advancements in medical technology, patients also face economic difficulties and multidimensional unmet needs due to the burden of medical expenses from high treatment costs and the accumulation of caregiving costs [6]. For these reasons, although rare diseases are a public health area requiring systematic management at the national level, most research on rare diseases is primarily based on small target populations focused on specific diseases, which limits the ability to identify longitudinal changes and trends in healthcare utilization patterns for all rare diseases nationwide [7,8].

To overcome these limitations and establish a foundation for evidence-based policy-making, the Korean government has been publishing the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in the Korea」 (the Annual Report) since 2020, which systematically links data dispersed across various administrative and public institutions [9-13]. The Annual Report has policy and academic value in that it annually presents the number of incident cases of rare diseases by sex, region, and age, the number of deaths occurring in the same year among the incident cases for that year, and healthcare utilization status during the one-year period following registration for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases. Due to the low prevalence and clinical diversity of rare diseases, it is difficult to bridge the gap between patients’ actual healthcare and welfare needs and support policies [14-16]. This phenomenon might be attributed to the small number of patients, which makes it difficult to provide sufficient quantitative evidence for policy-making, and the different clinical characteristics of each disease, which may create constraints within a generalized support system. Therefore, to incorporate patients’ multidimensional needs into policy, it is necessary to refine the national statistical system and provide empirical data.

Over the past 5 years, the compilation method for the Annual Report has been continuously refined to enhance the precision and inclusivity of the data. The 2019 Annual Report presented only the number of incident cases for that year on a limited basis, while the mortality status of the 2019 incident cases and their healthcare utilization during the first 3 months after registration were linked and published in the following year’s 2020 Annual Report due to the data follow-up period. Consequently, concerns were raised that this transitional approach, which resulted in the inclusion of statistics from different years (2020 incidence statistics and 2019 mortality and healthcare utilization statistics) within a single annual report, could undermine the timeliness and utility of the data and lead to confusion in interpretation. To address this structural limitation, the generation of 2021 incidence statistics was temporarily suspended. Instead, the number of 2020 incident cases was recalculated, and their mortality and 3-month healthcare utilization were analyzed, leading to the publication of the 2020 Annual Report (2) in 2022. Subsequently, starting with the 2021 Annual Report published in 2023, the collection and follow-up period for administrative data was extended from the previous 1 to 2 years and established as standard practice. This approach established a stable system for integrating statistics on incident cases, mortality, and healthcare utilization for a given year within a single annual report. As the data follow-up period was extended to 2 years, healthcare utilization status for the first 3 months after registration was expanded to healthcare utilization statistics for the first 12 months after registration, thereby improving the accuracy of disease burden measurement. Furthermore, the geographic unit of analysis was disaggregated from the previous seven metropolitan regions to the 17 province-level administrative districts. In the 2022 Annual Report, published in 2024, the approaches for statistics analyses were enhanced. To diversify the analysis of mortality, an item for the number of deaths by disease and sex was newly added. Additionally, the decedent age group and incident case age group, which were previously managed differently, were standardized to 10-year intervals, ensuring linkage between result tables. Moreover, the status of healthcare utilization by type of health security (national health insurance or medical aid) was introduced as a new item, establishing a foundation for understanding healthcare utilization among the vulnerable population. In the 2023 Annual Report, published in 2025, the comprehensiveness of the data was expanded. Previously, the status by age and region was disclosed only for diseases with more than 200 incident cases; however, this list was expanded to apply to all rare diseases. However, to minimize the risk of personal identification, a balance was struck between the openness and information security of national health and medical data through limited disclosure, whereby detailed items are not revealed in cases where the count is three or fewer.

As such, longitudinally examining the dynamic changes and data of the Annual Report accumulated over the past 5 years goes beyond a simple confirmation of statistical figures and becomes core foundational data for tracking the development process of the national rare disease healthcare data system and identifying rare disease occurrence trends. Previous studies have also achieved the accomplishment of presenting the compilation method for the Annual Report and the demographic distribution and scale of medical expenses of newly incident cases for the corresponding year [17-19]. However, the list of rare diseases is continuously expanding every year, and accordingly, the influx of new patients, the patterns of high-frequency diseases, and medical expenses are also newly changing every year. Therefore, it is necessary to analyze and share the most recently published statistical results to secure the timeliness of healthcare policy and to establish the direction of rare disease management. To this end, this study, by utilizing the Annual Report from 2019–2023, intends to longitudinally analyze the national rare disease occurrence patterns and, at the same time, to analyze, in detail, the rare disease occurrence status for the year 2023.

Methods

1. Study Design

This study is a descriptive statistics-based retrospective analysis conducted to identify the status and characteristics of the incidence, mortality, and healthcare utilization of rare diseases in the Republic of Korea (ROK) using data from the Annual Report published over the past 5 years.

2. Study Population and Data Collection Methods for the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in Korea」

1) Definition and criteria of the study population

The newly incident patients with rare diseases in the ROK covered by the Annual Report are individuals who were first registered as beneficiaries of the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases for diseases classified as nationally managed rare diseases announced by the Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA). Among these patients, new registrants for a given year are finalized by restricting the cohort to individuals whose “Effective Start Date of the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases” falls between January 1 and December 31 of that year, based on the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases data finally collected by December 31 of the following year, taking into consideration potential administrative delays in registration.

2) Data collection methods

The Annual Report collects data individually from five related institutions (National Health Insurance Service, Korea Social Security Information Service, Health Insurance Review and Assessment Service, Ministry of the Interior and Safety, and Ministry of Data and Statistics), and the collected data are used after undergoing processes such as data cleaning and transformation according to the characteristics of each dataset. Information on beneficiaries of the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases is collected from the National Health Insurance Service and the Korea Social Security Information Service. Healthcare utilization information for the 12 months following the Effective Start Date of the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases for newly incident patients is collected from the Health Insurance Review and Assessment Service. Mortality information for newly incident patients during the corresponding year is collected from the Ministry of Data and Statistics. Address and residency status information for newly incident patients are collected from the Ministry of the Interior and Safety.

3) Analytical methods for the 「Annual Report on the Rare Disease Patients in Korea」

The raw data on beneficiaries of the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases, collected from the National Health Insurance Service and the Korea Social Security Information Service, contain multiple duplicate cases for the same patient, as update histories resulting from modifications to patient demographic information, disease changes, eligibility changes, and other revisions are cumulatively recorded in the form of log data. Therefore, a connected-component analysis was conducted to identify duplicate patients by recognizing eligibility information for the same individual entered at different time points as a single entity when the records could be linked together through identifier variables. During the construction of the final analysis dataset, a single value was finalized for each patient by selecting only the most recent data record without logical errors from among the multiple log records sorted by patient. Among these, only patients with no registration history for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases in previous years were filtered to identify the final cohort of newly incident patients with rare diseases. The disease information (disease classification code and disease classification code serial number) recorded in the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases data for the finally selected newly incident patients was converted into disease codes and Korean and English disease names in accordance with the annually announced list of rare diseases eligible for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases. Additionally, for these finally selected newly incident patients, the result tables for the Annual Report were generated by linking healthcare utilization data (Health Insurance Review and Assessment Service) for the 12 months following registration for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases, mortality data for the corresponding year (Ministry of Data and Statistics), and address data (Ministry of the Interior and Safety).

3. Data Analysis Methods

In this study, the following analyses were conducted to identify the incidence patterns of rare diseases in the ROK and the detailed occurrence status in 2023. First, annual trends in the number of nationally managed rare diseases announced by the KDCA, the number of incident cases, and the number of deaths in the corresponding year were comparatively analyzed for 2019–2023. At this stage, the occurrence status of incident cases was analyzed by sex (male and female) and disease group (rare diseases, extremely rare diseases, and other chromosomal abnormality disorders), while mortality status was analyzed by disease group. To examine medical expenditure patterns during the 12 months following registration for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases, healthcare utilization status for the 3-year period from 2021 to 2023, when these statistics began to be reported consecutively, was analyzed. Second, using the 2023 Annual Report, the occurrence status of rare diseases by age and region, as well as the status of frequently occurring rare diseases, was examined from multiple perspectives. Occurrence status by age was presented in 10-year age groups, and occurrence status by region was presented for the 17 provincial-level administrative districts. For frequently occurring rare diseases, the top five high-frequency diseases were identified by sex and age group to determine the incidence distribution according to demographic characteristics. To analyze the financial burden of disease, the top five diseases were identified based on total annual medical expenses and average medical expenditure per capita.

Results

1. Annual Trends in the Status of Incidence, Mortality, and Healthcare Utilization of Rare Diseases

An analysis of 5-year data from 2019 to 2023 (Table 1) showed that the designated rare disease list expanded from 926 in 2019 to 1,165 in 2023. Accordingly, the number of rare diseases with registered incident patients in the ROK also increased from 636 in 2019 to 784 in 2023. The number of incident cases remained at approximately the mid-50,000 level annually from 2019 (55,549) through 2022 (54,952), but reached 62,420 in 2023. Regarding the trend in occurrence by sex, there were more female incident cases in 2019, 2020, and 2022 and more male incident cases in 2021 and 2023; however, the overall distribution of incident cases by sex remained similar, with no marked disparity between males and females.

Table 1. Annual trends in rare disease incidence and deaths.

Category 2019 2020 2021 2022 2023
No. of rare diseases 926 1,014 1,086 1,123 1,165
No. of occurring rare diseases 636 694 753 770 784
No. of incident cases Total 55,549 52,310 55,874 54,952 62,420
Sex Male 26,171 25,353 27,976 27,357 31,614
Female 29,378 26,957 27,898 27,595 30,806
Group Rare diseases 54,728 50,455 53,967 52,790 59,797
Ultra-rare diseases 775 1,767 1,820 2,074 2,510
Other chromosomal abnormalities 46 88 87 88 113
No. of deaths Total 1,596 1,662 1,845 1,902 2,093
Group Rare diseases 1,595 1,643 1,826 1,871 2,044
Ultra-rare diseases 1 18 19 31 49
Other chromosomal abnormalities 0 1 0 0 0
Healthcare utilizationa) Patients - - 49,772 52,818 60,050
Total medical expenses (billion KRW) - - 307.2 337.4 391.5
Medical expenses per capita (KRW 10,000) Total - - 617 639 652
Insurance benefit - - 553 572 584
Co-payment - - 64 66 68

-=not available. a)Healthcare utilization data within 12 months of registration have been provided since the 2021 annual report.

In the distribution of incident cases by disease group, rare diseases accounted for more than 95% of all incident cases each year. Extremely rare diseases and other chromosomal abnormality disorders increased substantially over the past 5 years. The number of incident cases of extremely rare diseases increased by more than 3.2-fold, from 775 in 2019 to 2,510 in 2023, while the number of incident cases of other chromosomal abnormality disorders also increased by approximately 2.5-fold, from 46 in 2019 to 113 in 2023.

Meanwhile, the number of deaths occurring in the corresponding year among incident cases in the corresponding year also showed an increasing trend. The number of deaths increased annually from 1,596 in 2019 to 2,093 in 2023. In the distribution of deaths by disease group, most deaths were concentrated in the rare disease group, while the number of deaths in the extremely rare disease group increased from one in 2019 to 49 in 2023.

The annual number of unique patients receiving medical care during the 12 months following registration for the Special Copayment Reduction Program for Rare Diseases increased from 49,772 in 2021 and 52,818 in 2022 to 60,050 in 2023. The annual total medical expenses for patients with rare diseases increased from KRW 307.2 billion in 2021 to KRW 337.4 billion in 2022 and KRW 391.5 billion in 2023, while the average total medical expenses per patient increased from KRW 6.17 million in 2021 to KRW 6.39 million in 2022 and reached KRW 6.52 million in 2023.

2. Occurrence Status of Rare Diseases by Age Group and Region as of 2023

Regarding the distribution of cases by age group in 2023, the 60–69-year age group accounted for the highest proportion, with 12,078 cases (19.3%), followed by the 50–59-year age group with 10,123 cases (16.2%) and the 70–79-year age group with 8,509 cases (13.6%) (Figure 1). The number of incident cases by region was the highest in Gyeonggi-do, with 16,631 cases (26.6%), followed by Seoul Metropolitan City, with 12,375 cases (19.8%) (Figure 2).

Figure 1. Number of new rare disease patients by age group in 2023.

Figure 1

Figure 2. Number of new rare disease patients by province in 2023.

Figure 2

a)When the registered residential address was unidentifiable or the address on the application was invalid.

3. Occurrence Status of the Top Five Rare Diseases as of 2023

The status of the top five rare diseases in 2023 based on the number of incident cases and total medical expenses is shown in Table 2. In 2023, idiopathic pulmonary fibrosis had the highest number of incident cases (5,543), followed by polycystic kidney, autosomal dominant (autosomal dominant polycystic kidney disease, ADPKD) (4,830) and irreversible dilated cardiomyopathy (3,367). Among males, idiopathic pulmonary fibrosis ranked first (4,308), followed by ADPKD (2,562) and irreversible dilated cardiomyopathy (2,266). Among females, systemic lupus erythematosus with organ or system involvement was the most common (2,346), followed by ADPKD (2,268) and sicca syndrome (Sjögren, 2,093), demonstrating differences in the distribution of the top diseases by sex.

Table 2. Incidence status of the top 5 rare diseases in 2023.

Category Rank 1 Rank 2 Rank 3 Rank 4 Rank 5
Total (case) Idiopathic pulmonary fibrosis (5,543) Polycystic kidney, autosomal dominant (4,830) Irreversible dilated cardiomyopathy (3,367) Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (2,718) Moyamoya disease (2,372)
Sex (case) Male Idiopathic pulmonary fibrosis (4,308) Polycystic kidney, autosomal dominant (2,562) Irreversible dilated cardiomyopathy (2,266) Crohn’s disease of both small and large intestine (1,686) Nonobstructive hypertrophic cardiomyopathy (831)
Female Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (2,346) Polycystic kidney, autosomal dominant (2,268) Sicca syndrome (Sjögren) (2,093) Moyamoya disease (1,559) Idiopathic pulmonary fibrosis (1,235)
Age (case) <1 yr Tetralogy of Fallot (96) Coarctation of aorta (75) Spina bifida, unspecified (69) Craniosynostosis (62) West’s syndrome (60)
1−9 yrs Neurofibromatosis (nonmalignant) type 1, type 2 (106) Moyamoya disease (84) Juvenile rheumatoid arthritis (74) Status epilepticus, unspecified (73) Microtia (70)
10−19 yrs Crohn’s disease of both small and large intestine (656) Narcolepsy and cataplexy (269) Juvenile rheumatoid arthritis (223) Crohn’s disease of small intestine (176) Crohn’s disease of large intestine (143)
20−29 yrs Crohn’s disease of both small and large intestine (739) Narcolepsy and cataplexy (475) Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (404) Crohn’s disease of small intestine (295) Crohn’s disease of large intestine (219)
30−39 yrs Polycystic kidney, autosomal dominant (605) Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (479) Crohn’s disease of both small and large intestine (376) Moyamoya disease (344) Keratoconus (283)
40−49 yrs Polycystic kidney, autosomal dominant (1,273) Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (595) Moyamoya disease (499) Irreversible dilated cardiomyopathy (449) Sicca syndrome (Sjögren) (405)
50−59 yrs Polycystic kidney, autosomal dominant (1,376) Irreversible dilated cardiomyopathy (639) Sicca syndrome (Sjögren) (615) Moyamoya disease (577) Systemic lupus erythematosus with organ or system involvement (481)
60−69 yrs Idiopathic pulmonary fibrosis (1,499) Polycystic kidney, autosomal dominant (921) Irreversible dilated cardiomyopathy (807) Sicca syndrome (Sjögren) (630) Moyamoya disease (432)
70−79 yrs Idiopathic pulmonary fibrosis (2,251) Irreversible dilated cardiomyopathy (673) Polymyalgia rheumatica (319) Polycystic kidney, autosomal dominant (309) Nonobstructive hypertrophic cardiomyopathy (275)
≥80 yrs Idiopathic pulmonary fibrosis (1,464) Irreversible dilated cardiomyopathy (455) Bullous pemphigoid (437) Status epilepticus, unspecified (310) Polymyalgia rheumatica (158)
Annual medical expenses (KRW 1,000) Total Idiopathic pulmonary fibrosis (40,453,095) Status epilepticus, unspecified (36,732,908) Polycystic kidney, autosomal dominant (26,302,326) Guillain–Barré syndrome (23,575,310) Moyamoya disease (19,704,339)
Per capita average Gaucher’s disease (318,423) Morquio(-like)(classic) syndrome (245,701) Mucopolysaccharidosis, type II (213,268) Pompe’s disease (166,219) Hurler-Scheie syndrome (162,846)

According to the age-group analysis, the most frequently occurring diseases were Tetralogy of Fallot among those aged under 1 year, neurofibromatosis (non-malignant) types 1 and 2 among those aged 1–9 years, Crohn’s disease involving both small intestine and colon among those in their teens and twenties, ADPKD among those in their thirties to fifties, and idiopathic pulmonary fibrosis among those aged 60 years or older.

The disease with the highest annual total medical expenses was idiopathic pulmonary fibrosis, totaling KRW 40.45 billion, followed by status epilepticus, unspecified (KRW 36.73 billion) and ADPKD (KRW 26.30 billion). The highest average medical expenditure per capita was observed for Gaucher disease KRW 318.42 million, followed by Morquio(-like)(classic) syndrome (KRW 245.70 million) and mucopolysaccharidosis type II (KRW 213.27 million).

Discussion

This study was conducted to provide empirical evidence on the occurrence status of rare diseases in the ROK by longitudinally reviewing the Annual Report from 2019 to 2023 and analyzing the characteristics of incident cases reported in the latest 2023 data. Changes in the compilation framework of the Annual Report over the past 5 years demonstrate that the report has matured into foundational data supporting health policy and clinical practice in the ROK. In particular, the structural issue whereby statistics from different years were mixed within the same annual report was addressed by extending the data follow-up period, and the timeliness and precision of the data were improved by integrating incidence, mortality, and healthcare utilization into a single annual report. Furthermore, extending the follow-up period for healthcare utilization to 12 months established a foundation for empirically assessing patients’ annual burden of healthcare costs. Subdividing the geographic unit of analysis into the 17 metropolitan cities and provinces and newly introducing benefit status by type of medical security represented a turning point in improving public health equity by enabling the monitoring of disparities according to place of residence and income level [6]. The decision to disclose age- and region-specific occurrence status even for rare diseases with 200 or fewer incident cases was also consistent with the United Nations General Assembly resolution and the global research governance framework, which call for the collection and dissemination of disaggregated data by sex, age, income, and race at the national level to strengthen international cooperation [15,16]. In this process, to protect personal information and prevent personal identification, a balance between data utility and security was achieved by disclosing only categories with more than three incident cases.

An examination of the annual number of incident cases of rare diseases showed that the rare disease list, the number of diseases with incident cases, and the annual number of incident cases all exhibited a continuous increasing trend. This finding suggests that the scope of rare disease designation has gradually expanded and that new diagnoses are being made across a broader range of diseases as a result of advances in diagnostic technology and improved disease awareness [1,20,21]. In particular, the number of incident cases reached 62,420 in 2023, exceeding 60,000 for the first time since the publication of the Annual Report. This increase was confirmed to reflect the impact of rare diseases newly designated and officially announced in 2023. Compared with 2022, a total of 42 diseases were newly added to the rare disease list in 2023 (1 rare disease, 20 extremely rare diseases, and 21 other chromosomal abnormality disorders), and no diseases were removed. Within these newly designated diseases, a total of 5,250 incident cases were identified. In particular, ADPKD, one of the newly designated diseases, accounted for 4,830 incident cases and was identified as the primary contributor to the increase in incident cases [13]. However, this increase is subject to administrative limitations in the statistical derivation: because ADPKD was newly designated as a rare disease in 2023, patients who had developed the condition prior to that year were officially registered and thus counted as ‘incident cases’ only upon their registration in 2023. Consequently, these figures encompass both true epidemiological occurrence and individuals whose disease onset occurred before 2023 but who were incorporated into the current year’s counts due to administrative timing, necessitating cautious interpretation when evaluating the 2023 incidence scale. Furthermore, over the past 5 years, the number of incident cases of extremely rare diseases increased by approximately 3.2-fold, while the number of incident cases of other chromosomal abnormality disorders increased by approximately 2.5-fold. The increase in incident cases among these smaller disease groups may be interpreted as reflecting the policy achievement of progressively expanding the designation of nationally managed rare diseases and incorporating potential patient populations that had previously remained in the blind spot of public health and medical care into the healthcare system [16]. However, the increase in the number of deaths in the extremely rare disease group, together with the increase in incident cases, suggests that clinical vulnerabilities inherent to these smaller disease groups, including prolonged time to definitive diagnosis and the lack of standard treatments, still exist [2,3,22]. Nevertheless, the annual number of deaths has the interpretational limitation that deaths directly due to a rare disease cannot be clearly distinguished from deaths due to other diseases or external causes.

From the perspective of healthcare utilization, total medical expenses also continued to increase. In particular, the five diseases with the highest total medical expenses, including idiopathic pulmonary fibrosis and status epilepticus, unspecified, accounted for 35.9% of the total medical expenses for all rare diseases. These findings suggest that, in addition to expanding inclusiveness, future rare disease support policies will also require efficient financial management and monitoring strategies for disease groups with the greatest financial burden. Meanwhile, the five diseases with the highest average total annual medical expenses per patient included Gaucher disease and Morquio(-like)(classic) syndrome, indicating a pattern different from that of diseases with the highest total medical expenses. Therefore, a multifaceted system for strengthening coverage is required to comprehensively cover patients with rare diseases who have relatively small patient populations but a high per-capita medical expense burden without leaving any blind spots. However, because diseases with the highest average total annual medical expenses per patient have extremely small annual numbers of incident cases, the possibility that individual observations acted as outliers cannot be excluded. Therefore, long-term follow-up analyses should be conducted to derive average medical expenses that are clinically relevant and policy-relevant. Furthermore, to take into account the impact of the expansion of nationally managed rare diseases, newly designated and previously designated diseases should be analyzed separately, and disease-specific mortality and medical expenses should be analyzed as a time series to identify the cumulative effects of disease expansion and changes in actual healthcare utilization.

Finally, analyses of the occurrence status of rare diseases by age group and region and of frequently occurring rare diseases showed that rare diseases differed according to sex, region, and age. This finding indicates that rare diseases constitute a multi-layered, heterogeneous group that cannot simply be classified as a single disease category and suggests that the clinical problems and socioeconomic needs faced by patients may vary according to demographic characteristics [6]. According to the existing literature, during infancy, childhood, and adolescence, lifelong treatment and the caregiving burden on the entire family become the primary concerns, whereas women of childbearing age experience difficulties related to pregnancy and childbirth because of their disease. In contrast, older patients with rare diseases may experience compounded difficulties as the pathophysiology of rare diseases combines with declining physical function, making independent daily living more difficult [23-25]. Therefore, rare disease health policies should establish a customized support system for each life cycle stage by stratifying the target population of patients with rare diseases according to the distinct disease characteristics of different demographic groups.

In conclusion, this study is significant in that it empirically identified the patterns of change in rare disease statistics over the past 5 years and the latest occurrence status for 2023. The Annual Report can serve not only as evidence-based data on the occurrence status of rare diseases in the ROK but also as a robust evidence base for proactively forecasting healthcare resource needs associated with the expansion of the rare disease list and for monitoring policies aimed at reducing community health disparities. However, future improvements to the statistical system should extend beyond compiling the number of incident cases to include incidence rates, survival rates, and the overall prevalence of rare diseases, thereby enabling more precise tracking and assessment of demographic and life cycle vulnerabilities.

Acknowledgments

None.

Declarations

Ethics Statement: Not applicable.

Funding Source: This study was supported by the Korea Disease Control and Prevention Agency (no. 2025-11-014).

Conflict of Interest: The authors have no conflicts of interest to declare.

Author Contributions: Conceptualization: ISP, KAL. Data curation: ISP, KAL, JWL, KHC. Formal analysis: ISP, KAL, JWL. Funding acquisition: ISP. Investigation: ISP, KAL, KHC. Methodology: ISP, KAL, JWL, JHJ. Project administration: EJC. Resources: JYK, DHP, KHC. Supervision: JYK, DHP. Visualization: KAL. Writing – original draft: KAL, ISP, DHP, KHC. Writing – review & editing: ISP, KAL, JWL, JHJ, EJC, JYK, DHP, KHC.

References

  • 1.Nguengang Wakap S, Lambert DM, Olry A, et al. Estimating cumulative point prevalence of rare diseases: analysis of the Orphanet database. Eur J Hum Genet. 2020;28:165–73. doi: 10.1038/s41431-019-0508-0. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 2.Haendel M, Vasilevsky N, Unni D, et al. How many rare diseases are there? Nat Rev Drug Discov. 2020;19:77–8. doi: 10.1038/d41573-019-00180-y. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 3.Vásquez P, Hall L, Merlo G. Societal preferences in health technology assessments for rare diseases and orphan drugs: a systematic literature review of new analytic approaches. Value Health Reg Issues. 2024;44:101026. doi: 10.1016/j.vhri.2024.101026. [DOI] [PubMed] [Google Scholar]
  • 4.Faye F, Crocione C, Anido de Peña R, et al. Time to diagnosis and determinants of diagnostic delays of people living with a rare disease: results of a Rare Barometer retrospective patient survey. Eur J Hum Genet. 2024;32:1116–26. doi: 10.1038/s41431-024-01604-z. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 5.The Lancet Global Health, author. The landscape for rare diseases in 2024. Lancet Glob Health. 2024;12:e341. doi: 10.1016/S2214-109X(24)00056-1. [DOI] [PubMed] [Google Scholar]
  • 6.Claessens Z, Vanneste A, Van Isterdael C, Verbeke C, Wens I, Huys I. Criteria to evaluate unmet health-related needs of persons living with rare diseases and their caregivers: rapid literature review and stakeholder consultations. Orphanet J Rare Dis. 2025;20:321. doi: 10.1186/s13023-025-03838-6.5863f6984e774761a9362e539774c479 [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 7.Çakmak Barsbay M, Aydamak MY. Policy evaluation frameworks for rare diseases: a scoping review. BMC Health Serv Res. 2025;26:140. doi: 10.1186/s12913-025-13878-0.52eb3a2521a746ecaa9cd4c3633c25fc [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 8.Ludwig M, Alibone M, Norris R, et al. Epidemiology and economic burden of selected rare genetic diseases in Germany - a claims database study. Orphanet J Rare Dis. 2025;20:617. doi: 10.1186/s13023-025-04147-8.8a582c8c798c4a308b793cfd5f2c765f [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 9.Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA), author 2019 Annual report on the rare disease patients in Korea. KDCA; 2020. [Google Scholar]
  • 10.Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA), author 2021 Annual report on the rare disease patients in Korea. KDCA; 2022. [Google Scholar]
  • 11.Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA), author 2022 Annual report on the rare disease patients in Korea. KDCA; 2023. [Google Scholar]
  • 12.Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA), author 2023 Annual report on the rare disease patients in Korea. KDCA; 2024. [Google Scholar]
  • 13.Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA), author 2024 Annual report on the rare disease patients in Korea. KDCA; 2025. [Google Scholar]
  • 14.Burris S, Hitchcock L, Ibrahim J, Penn M, Ramanathan T. Policy surveillance: a vital public health practice comes of age. J Health Polit Policy Law. 2016;41:1151–73. doi: 10.1215/03616878-3665931. [DOI] [PubMed] [Google Scholar]
  • 15.Junaid M, Downs J, Groza T, et al. The United Nations convention on rare diseases-a framework for research prioritization. Front Public Health. 2025;13:1706653. doi: 10.3389/fpubh.2025.1706653.06f1236db48f4f09bd1423afa4310788 [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 16.United Nations General Assembly, author. Addressing the challenges of persons living with a rare disease and their families: resolution /adopted by the General Assembly [Internet] United Nations; 2023. [cited 2026 May 25]. Available from: https://digitallibrary.un.org/record/4032274?v=pdf . [Google Scholar]
  • 17.Choi KH, Cho WM, M J. Key findings from 2020 annual report on rare disease (2) patients in Korea: incidence, mortality and medical service utilization. Public Health Wkly Rep. 2024;17:199–217. doi: 10.56786/PHWR.2024.17.6.1. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 18.Lee K, Lee TH, Park IS, Kim JY, Sung JH, Choi KH. Current status of statistics and future improvement plans on rare diseases in Korea- focusing on 2021 annual report on the rare disease patients in Korea. Public Health Wkly Rep. 2024;17:1635–53. doi: 10.56786/PHWR.2024.17.39.1. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 19.Park IS, Lee K, Lee TH, Kim JY, Sung JH, Choi KH. Analysis of the incidence and trends of rare diseases in the Republic of Korea in 2022. Public Health Wkly Rep. 2025;18:1320–40. doi: 10.56786/PHWR.2025.18.35.2. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 20.Zhao H, Du C, Yang G, Wang Y. Diagnosis, treatment, and research status of rare diseases related to birth defects. Intractable Rare Dis Res. 2023;12:148–60. doi: 10.5582/irdr.2023.01052. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 21.Méndez-Vidal C, Bravo-Gil N, Pérez-Florido J, et al. A genomic strategy for precision medicine in rare diseases: integrating customized algorithms into clinical practice. J Transl Med. 2025;23:86. doi: 10.1186/s12967-025-06069-2.1fc059a5457b4ce1b024f0d76c9adc7c [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 22.Basu A, Thomas SK, Chapman RH, Spangler J. HTA evidence in rare diseases: just rare or also special? Pharmacoeconomics. 2025;43:1271–9. doi: 10.1007/s40273-025-01538-4. [DOI] [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
  • 23.Somanadhan S, McAneney H, Awan A, et al. Assessing the supportive care needs of parents of children with rare diseases in Ireland. J Pediatr Nurs. 2025;81:31–42. doi: 10.1016/j.pedn.2025.01.003. [DOI] [PubMed] [Google Scholar]
  • 24.Chen JS, Roberts CL, Simpson JM, March LM. Pregnancy outcomes in women with rare autoimmune diseases. Arthritis Rheumatol. 2015;67:3314–23. doi: 10.1002/art.39311. [DOI] [PubMed] [Google Scholar]
  • 25.Sabbà C, Lenato GM, Custodero C, Suppressa P. Rare diseases in the elderly: a new perspective for the specialist in geriatrics. Geriatr Care. 2019;5 doi: 10.4081/gc.2019.8769.c0341f5196ab4b61bb4f58d59331b40c [DOI] [Google Scholar]
Public Health Wkly Rep. 2026 Jul 6;19(31):1301–1323. [Article in Korean]

2019–2023년 희귀질환자 발생 양상과 2023년 주요 희귀질환 현황

박 일수 1, 이 경아 2,*, 이 정욱 3, 지 재훈 4, 최 은지 5, 김 지영 6, 박 도현 6, 최 경화 6

Abstract

목적

본 연구는 최근 5개년간 공표된 「희귀질환자 통계 연보」를 활용하여 국내 희귀질환의 발생‧사망‧진료이용 추이와 2023년도 연령별‧지역별 발생 현황 및 상위 다빈도 발생 질환을 분석하기 위해 수행되었다.

방법

2019년부터 2023년까지의 「희귀질환자 통계 연보」를 활용한 기술통계 기반의 후향적 분석연구이다. 연도별 발생 추세를 비교하고 2023년도 발생 현황을 세부적으로 분석하였다.

결과

희귀질환 신규 발생자 수는 매년 5만 명 선을 유지하다가 2023년에는 62,420명으로 분석되었으며, 당해 연도 사망자 수와 진료비 역시 증가하는 추세를 보였다. 2023년 연령군별 발생자 수는 60대에서 가장 많았으며, 지역별로는 경기도에서 가장 많았다. 다빈도 질환 분석 결과 남성은 특발성 폐섬유증, 여성은 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스가 1위로 분석되었다. 연령별로는 10–20대에서는 소장 및 대장 모두의 크론병, 30–50대에서는 다낭성 신장, 보통염색체우성, 60대 이상에서는 특발성 폐섬유증이 가장 많이 발생하였다. 연간 총 진료비는 특발성 폐섬유증에서 가장 많았다.

결론

「희귀질환자 통계 연보」는 2021년 통계 연보부터 자료 추적 기간을 2년으로 확장하여, 신규 발생자의 발생‧사망 현황 및 12개월간의 진료이용 현황을 단일 연도 연보 내에 통합 구축하였으며, 세분화 및 확대를 통해 분석의 정확성과 포괄성을 확보하는 방향으로 고도화되었다. 앞으로는 인구학적 생애주기별 취약성 포착을 위해 발생자 위주의 통계에서 나아가 발생률 및 생존율, 희귀질환 유병자 현황까지 제시할 필요가 있다.

Keywords: 희귀질환, 국가승인통계, 희귀질환자 통계 연보, 신규 발생자


핵심요약

① 이전에 알려진 내용은?

현재까지 5개 연도의 「희귀질환자 통계 연보」가 공표되었다. 희귀질환 신규 발생자 수는 2022년까지 매년 약 5만 명대였다.

② 새로이 알게 된 내용은?

2023년 신규 발생자 수는 62,420명으로 분석되었다. 2023년 다빈도 질환 분석 결과, 특발성 폐섬유증이 발생자 수와 연간 총진료비에서 가장 큰 규모를 차지하였으며, 신규 지정된 다낭성 신장, 보통염색체우성이 그 뒤를 이었다.

③ 시사점은?

국가 희귀질환 지정 목록 확대와 통계 체계 고도화는 잠재적 환자군을 제도권 내로 유입시키는 효과를 거두었다. 향후에는 신규 발생자 수 산출을 넘어, 인구학적‧생애주기별 취약성을 정밀하게 포착할 수 있는 발생률 및 생존율과 전체 희귀질환 유병자 중심의 유병률까지 파악할 수 있는 통계 체계로의 개편이 요구된다.

서 론

전 세계적으로 약 3–4억 명의 인구가 희귀질환의 영향을 받고 있으며, 새로운 희귀질환이 지속적으로 확인됨에 따라 그 규모는 증가하고 있다[1]. 그러나 희귀질환은 개별 질환별로는 유병자 수가 적어 질병의 병태생리가 명확히 밝혀지지 않고, 질병 발현 양상이 다양하여 예측 불가능성이 높은 경우가 많다[2,3]. 희귀질환은 최종 확진을 받기까지 평균 5년 이상이 걸린다고 보고되고 있으며, 진단을 받는다고 하더라도 질환의 95%는 승인된 치료법이 없어 어려움을 겪는다[4,5]. 의료 기술의 발달로 진단율이 점차 향상되고 있으나, 높은 치료비용에 따른 의료비 부담과 돌봄비용의 누적으로 인해 환자는 경제적 어려움과 다차원적 미충족 요구에도 직면해 있다[6]. 이러한 이유로 희귀질환은 국가적 차원의 체계적인 관리가 필요한 공중보건학적 분야임에도 불구하고, 대부분의 희귀질환 연구는 주로 특정 질환 중심의 소규모 대상군을 기반으로 하고 있어, 국가 전체 희귀질환의 종단적 변화와 보건의료 이용 형태의 추이를 파악하는 데는 한계가 있다[7,8]

한국 정부는 이러한 한계를 극복하고 근거 기반의 정책 수립 기반을 마련하고자 여러 행정‧공공기관에 분산된 데이터를 유기적으로 결합한 「희귀질환자 통계 연보」를 2020년부터 발간해 왔다[9-13]. 본 통계는 매년 희귀질환의 성별‧지역별‧연령별 발생자 수를 산출하고, 당해 연도 발생자 중 당해 연도의 사망자 수와 희귀질환 산정특례 등록 후 1년간의 진료이용 현황까지 제시한다는 점에서 정책적‧학술적 가치를 지닌다. 희귀질환은 낮은 유병률과 임상적 다양성으로 인해 환자의 실제 의료‧복지 수요와 지원 정책 간의 격차를 해소하기 어렵다는 한계가 있다[14-16]. 소수의 환자 규모는 정책 수립에 필요한 정량적 근거를 충분히 제시하기 어려우며, 질환별로 다른 임상적 특성은 일반화된 지원 체계 내에서는 제약이 발생할 수 있기 때문이다. 따라서 환자의 다차원적 요구를 정책 내로 포용하기 위해서는 국가 단위의 통계 체계를 정교화하여 실증적 데이터를 제시해야 한다.

「희귀질환자 통계 연보」는 데이터의 정밀성과 포용성을 제고하기 위해 지난 5개년 동안 산출 방법을 지속적으로 보완하는 과정을 거쳐왔다. 2019년 통계 연보는 당해 연도 신규 발생자 수만 제한적으로 제시하였고, 2019년 발생자의 사망 현황 및 등록 이후 3개월간의 진료이용 내역은 데이터 추적 기간으로 인해 이듬해인 「2020 희귀질환자 통계 연보」에 연계 수록하였다. 이러한 과도기적 조치로 인해 한 권의 연보 내에 서로 다른 연도의 통계(2020년 발생통계와 2019년 사망‧진료이용통계)가 혼재되어 데이터의 시의성과 정보 활용도를 저해하고 해석에 혼선을 초래할 우려가 제기되었다. 이러한 구조적 한계를 보완하고자 2021년 신규 발생 통계 생성을 일시 유예하고, 2020년 발생자 수를 재산출하여 이들의 사망 및 3개월 진료이용을 분석하여 2022년에 「2020 희귀질환자 통계 연보(2)」를 공표하였다. 이후 2023년 발간된 「2021 희귀질환자 통계 연보」부터는 행정자료의 수집 및 추적 기간을 기존 1년에서 2년으로 확대 정착시켰다. 이를 통해 해당 연도 신규 발생 현황과 사망 및 진료이용 통계를 단일 연보 내에 통합 수록하는 안정적인 체계를 확립하였다. 자료 추적 기간이 2년으로 연장됨에 따라 ‘등록 후 3개월’ 진료이용 현황을 ‘등록 후 12개월’의 진료이용 통계로 확대하여 질병부담 측정의 정확성을 높였다. 아울러 지리적 분석 단위를 기존의 7개 광역 권역 중심에서 17개 시‧도 행정구역별로 세분화하였다. 2024년 발간된 「2022 희귀질환자 통계 연보」에서는 통계의 정교성을 강화하였다. 사망자 분석의 다각화를 위해 질병별 성별 사망자 수 항목을 신설하였으며, 기존에 상이하게 운영되던 사망자 연령군과 발생자 연령군을 10세 단위로 통일하여 결과표 간 연계성을 확보하였다. 또한, 의료보장 형태별(건강보험 또는 의료급여) 급여 및 본인부담금 현황을 신규 항목으로 도입하여 취약계층의 의료이용을 파악할 수 있는 기반을 마련하였다. 2025년 발간된 「2023 희귀질환자 통계 연보」에서는 데이터의 포괄성을 확대하였다. 기존에는 신규 발생자 수가 200명을 초과하는 질환에서만 연령별‧지역별 현황을 공개했으나, 이를 모든 희귀질환으로 확대 적용하였다. 다만, 개인식별위험을 최소화하기 위해 3명 이하인 경우 세부 항목이 드러나지 않도록 제한적으로 공개함으로써 국가 보건의료 데이터의 개방성과 정보 보안성의 균형을 도출하였다.

이처럼 지난 5개년간 축적된 희귀질환자 통계 연보의 동태적 변화와 데이터를 종단적으로 고찰하는 것은 단순한 통계적 수치 확인을 넘어, 국가 희귀질환 보건의료 데이터 체계의 발전 과정을 추적하고 희귀질환 발생 추세를 진단하는 핵심적인 기초 자료가 된다. 앞선 선행연구도 「희귀질환자 통계 연보」 산출 방법 및 해당 연도 신규 발생자의 인구통계학적 분포와 진료비 규모를 제시하는 성과를 거두었다[17-19]. 그러나 희귀질환 목록이 매년 지속적으로 확대되고 있으며 이에 따라 신규 환자의 유입, 다빈도 질환의 양상, 진료비 역시 매년 새롭게 변화하고 있다. 따라서 보건의료 정책의 시의성을 확보하고 희귀질환 관리의 방향성을 정립하기 위해 가장 최근 공표된 통계 결과를 분석하여 공유하는 것이 필요하다. 이에 본 연구는 2019–2023년 「희귀질환자 통계 연보」를 활용하여 국가 희귀질환 발생 양상을 종단적으로 분석하는 한편, 2023년도의 희귀질환 발생 현황 특성을 세부적으로 분석하고자 한다.

방 법

1. 연구설계

본 연구는 국내 희귀질환 발생‧사망‧진료이용 현황과 특성을 규명하기 위해 최근 5개년간 공표된 「희귀질환자 통계 연보」의 데이터를 활용하여 수행된 기술통계 기반의 후향적 분석연구이다.

2. 「희귀질환자 통계 연보」 대상 및 자료수집 방법

1) 연구 대상의 정의 및 기준

「희귀질환자 통계 연보」의 대상이 되는 국내 희귀질환 신규 발생자는 질병관리청에서 공고한 국가관리대상 희귀질환에 해당되는 질환으로 희귀질환 본인일부부담금 산정특례 대상으로 최초 등록된 자이다. 이 중 당해 연도 신규 등록자는 행정적 등록 지연 가능성을 고려하여 해당 연도 다음 해의 12월 31일까지 최종 수집된 산정특례 데이터 중 ‘산정특례 적용 시작일’이 해당 연도 1월 1일부터 동년 12월 31일 사이에 존재하는 자로 제한하여 확정한다.

2) 자료수집 방법

「희귀질환자 통계 연보」는 5개의 유관기관(국민건강보험공단, 한국사회보장정보원, 건강보험심사평가원, 행정안전부, 국가데이터처)으로부터 개별적으로 자료를 수집하고, 수집된 자료는 자료의 특성에 따라 정제, 변환 등의 과정을 거쳐 사용된다. 국민건강보험공단과 한국사회보장정보원으로부터는 희귀질환 본인일부부담금 산정특례 대상자 정보를 수집하며, 건강보험심사평가원으로부터는 신규 발생자의 산정특례 적용 시작일로부터 12개월간의 진료이용 정보, 국가데이터처로부터는 신규 발생자의 당해 연도 사망 정보, 행정안전부로부터는 신규 발생자의 대상자의 주소 및 거주상태 정보를 수집한다.

3) 「희귀질환자 통계 연보」 분석 방법

국민건강보험공단 및 한국사회보장정보원으로부터 수집된 희귀질환 본인일부부담금 산정특례 대상자 정보의 원자료는 환자의 인적 정보 수정, 질환 변경, 자격 변동 등에 따른 갱신 이력이 로그 데이터 형태로 누적 기록되어 있어, 동일 대상자에 대해 복수의 중복 사례가 포함되어 있다. 이에 연결요소 네트워크 분석을 실시하여 서로 다른 시점에 입력된 동일인의 자격 정보를 식별 변수를 통해 유기적으로 연결할 수 있는 경우 단일한 개체로 인식함으로써 중복 대상자를 식별하였다. 최종 분석 데이터셋 구축 단계에서는 대상자별로 정렬된 복수의 로그 기록 중 논리적 오류가 없는 최종 시점의 데이터값만을 선택하여 대상자별 단일 값을 확정하였다. 이 중 이전 연도 산정특례 등록이력이 존재하지 않는 대상자만을 필터링하여, 최종적인 희귀질환 신규 발생자로 확정하였다. 최종 선정된 신규 발생자의 산정특례자료에 입력된 질병정보(질병분류코드, 질병분류코드 일련번호)는 매년 공고된 산정특례 희귀질환 목록에 맞추어 질병코드와 한글 및 영문 질환명으로 변경하였다. 또한 최종 선정된 신규 발생자에 대해 희귀질환 산정특례 등록 후 12개월간의 진료이용 자료(건강보험심사평가원), 당해 연도 사망 자료(국가데이터처), 주소 자료(행정안전부)를 연계하여 「희귀질환자 통계 연보」의 결과표를 산출하였다.

3. 자료분석 방법

본 연구에서는 국내 희귀질환 발생 양상과 2023년 세부 발생 현황을 규명하기 위해 다음과 같은 분석 과정을 수행하였다. 첫째, 2019년부터 2023년까지의 질병관리청 공고 국가관리대상 희귀질환 수, 신규 발생자 수, 당해 연도 사망자 수의 연도별 현황을 비교 분석하였다. 이때 신규 발생 현황은 성별(남, 여) 및 질환군별(희귀질환, 극희귀질환, 기타염색체이상질환)로 세분화하여 분석하였으며, 사망 현황은 질환군별로 분석하였다. 산정특례 등록 이후 12개월 간의 진료비 양상을 확인하기 위해서는 해당 통계가 연속적으로 제시되기 시작한 2021년부터 2023년까지 3개년간의 진료이용 현황을 분석하였다. 둘째, 「2023 희귀질환자 통계 연보」를 활용하여 2023년 기준 연령별‧지역별 희귀질환 발생 현황과 다빈도 발생 희귀질환 현황을 다각도로 고찰하였다. 연령별 발생 현황은 10세 단위로, 지역별 발생현황은 17개 시도를 기준으로 제시하였으며, 다빈도 희귀질환은 인구학적 특성에 따른 발생 분포를 파악하기 위해 성별 및 연령군을 기준으로 상위 1–5위 다빈도 질환을 도출하였다. 재정적 질병부담을 분석하고자 연간 총진료비 및 1인당 평균 진료비 기준 상위 5개 질환을 파악하였다.

결 과

1. 희귀질환 발생‧사망‧진료이용 현황의 연도별 양상

2019년부터 2023년까지 5개년간의 데이터를 분석한 결과(표 1), 고시된 희귀질환 목록은 2019년 926개에서 2023년 1,165개로 확대되었다. 이에 맞추어 실제로 국내에서 환자가 발생하여 등록된 발생 희귀질환 수 역시 2019년 636개에서 2023년 784개로 증가하는 양상을 보였다. 신규 발생자 수의 경우, 2019년(55,549명) 이후 2022년(54,952명)까지 매년 약 5만 명대 중반 수준을 유지해 왔으나, 2023년에는 62,420명으로 분석되었다. 성별 발생 추이를 살펴보면 2019년, 2020년, 2022년에는 여성 발생자가 많았고, 2021년과 2023년에는 남성 발생자가 많았으나 전반적인 성별 발생 정도는 남녀 간의 뚜렷한 격차 없이 유사한 수준을 유지하는 것으로 나타났다.

표 1. 희귀질환 발생‧사망 현황의 연도별 추이.

구분 2019년 2020년 2021년 2022년 2023년
희귀질환 목록(개) 926 1,014 1,086 1,123 1,165
발생 희귀질환(개) 636 694 753 770 784
신규 발생자(명) 전체 55,549 52,310 55,874 54,952 62,420
성별 남 26,171 25,353 27,976 27,357 31,614
여 29,378 26,957 27,898 27,595 30,806
질환군 희귀질환 54,728 50,455 53,967 52,790 59,797
극희귀질환 775 1,767 1,820 2,074 2,510
기타염색체이상질환 46 88 87 88 113
사망자 수(명) 전체 1,596 1,662 1,845 1,902 2,093
질환군 희귀질환 1,595 1,643 1,826 1,871 2,044
극희귀질환 1 18 19 31 49
기타염색체이상질환 0 1 0 0 0
진료이용a) 연간 실인원 수(명) - - 49,772 52,818 60,050
총진료비(억원) - - 3,072 3,374 3,915
1인당 평균(만원) 총진료비 - - 617 639 652
급여비 - - 553 572 584
본인부담금 - - 64 66 68

-=not available. a)등록 후 12개월간의 진료이용내역은 2021년 통계 연보부터 제시되어 있음.

질환군별 발생 분포에서는 희귀질환이 매년 전체 발생의 95% 이상으로 많은 비중을 차지하였다. 극희귀질환과 기타염색체이상질환은 지난 5개년간 크게 증가하였다. 극희귀질환 신규 발생자는 2019년 775명에서 2023년 2,510명으로 3.2배 이상 증가하였으며, 기타염색체이상질환 신규 발생자 역시 2019년 46명에서 2023년 113명으로 약 2.5배 증가하였다.

한편, 당해 연도 신규 발생자 중 당해 연도 사망자 수 역시 증가하는 양상을 보였다. 2019년 1,596명이었던 사망자 수는 매년 증가하여 2023년에는 2,093명으로 집계되었다. 질환군별 사망자 분포에서는 대부분의 사망자가 희귀질환군에 집중되어 있으며, 극희귀질환군의 사망자 수는 2019년 1명에서 2023년 49명으로 증가하였다.

희귀질환 산정특례 등록 후 12개월간 연간 진료 실인원 수는 2021년 49,772명, 2022년 52,818명에서 2023년 60,050명으로 증가하였다. 희귀질환자의 연간 총진료비는 2021년 3,072억 원, 2022년 3,374억 원, 2023년 3,915억 원으로 증가하였고, 환자 1인당 평균 총진료비는 2021년 617만 원에서 2022년 639만 원으로 증가하였고, 2023년에는 652만 원으로 분석되었다.

2. 2023년 기준 연령별‧지역별 희귀질환 발생 현황

2023년 기준 연령군별 발생 분포를 살펴보면 60–69세 연령군이 12,078명(19.3%)으로 가장 높은 비중을 차지하였으며, 50–59세 연령군이 10,123명(16.2%), 70–79세 연령군이 8,509명(13.6%) 순으로 나타났다(그림 1). 지역별 발생자 수는 경기도가 16,631명(26.6%)으로 가장 많았고, 서울특별시가 12,375명(19.8%)으로 그 뒤를 이었다(그림 2).

그림 1. 2023년 연령군별 희귀질환 발생자 수.

그림 1

그림 2. 2023년 지역별 희귀질환 발생자 수.

그림 2

a)주민등록주소지가 확인되지 않았거나 산정특례등록 신청서에 기재된 주소가 불명확한 경우.

3. 2023년 기준 상위 1–5위 희귀질환 발생 현황

2023년 발생자 수 및 진료비 기준 상위 1–5위 희귀질환 현황은 표 2와 같다. 2023년 신규 발생자 수가 가장 많은 희귀질환은 특발성 폐섬유증(5,543명)이었으며, 다낭성 신장, 보통염색체우성(4,830명), 비가역적 확장성 심근병증(3,367명) 순으로 나타났다. 남성은 특발성 폐섬유증(4,308명)이 1위를 기록하였고, 다낭성 신장, 보통염색체우성(2,562명), 비가역적 확장성 심근병증(2,266명) 순이었다. 반면 여성은 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(2,346명)가 가장 많았으며, 다낭성 신장, 보통염색체우성(2,268명), 건조증후군(쉐그렌, 2,093명) 순으로 집계되어 성별에 따른 상위 질환 분포의 차이를 보였다.

표 2. 2023년 상위 1–5위 희귀질환 발생 현황.

구분 1순위 2순위 3순위 4순위 5순위
전체(명) 특발성 폐섬유증(5,543) 다낭성 신장, 보통염색체우성(4,830) 비가역적 확장성 심근병증(3,367) 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(2,718) 모야모야병(2,372)
성별(명) 남 특발성 폐섬유증(4,308) 다낭성 신장, 보통염색체우성(2,562) 비가역적 확장성 심근병증(2,266) 소장 및 대장 모두의 크론병(1,686) 비폐색성 비대성 심근병증(831)
여 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(2,346) 다낭성 신장, 보통염색체우성(2,268) 건조증후군(쉐그렌) (2,093) 모야모야병(1,559) 특발성 폐섬유증(1,235)
연령별(명) <1세 팔로네징후(96) 대동맥의 축착(75) 상세불명의 이분척추(69) 두개골유합(62) 웨스트증후군(60)
1–9 세 신경섬유종증(비악성) 1형, 2형(106) 모야모야병(84) 연소성 류마티스관절염(74) 상세불명의 뇌전증지속상태(73) 소이증(小耳症) (70)
10–19세 소장 및 대장 모두의 크론병(656) 발작수면 및 허탈발작(269) 연소성 류마티스관절염(223) 소장의 크론병(176) 대장의 크론병(143)
20–29세 소장 및 대장 모두의 크론병(739) 발작수면 및 허탈발작(475) 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(404) 소장의 크론병(295) 대장의 크론병(219)
30–39세 다낭성 신장, 보통염색체우성(605) 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(479) 소장 및 대장 모두의 크론병(376) 모야모야병(344) 원추각막(283)
40–49세 다낭성 신장, 보통염색체우성(1,273) 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(595) 모야모야병(499) 비가역적 확장성 심근병증(449) 건조증후군(쉐그렌) (405)
50–59세 다낭성 신장, 보통염색체우성(1,376) 비가역적 확장성 심근병증(639) 건조증후군(쉐그렌) (615) 모야모야병(577) 기관 또는 계통 침범을 동반한 전신홍반루푸스(481)
60–69세 특발성 폐섬유증(1,499) 다낭성 신장, 보통염색체우성(921) 비가역적 확장성 심근병증(807) 건조증후군(쉐그렌) (630) 모야모야병(432)
70–79세 특발성 폐섬유증(2,251) 비가역적 확장성 심근병증(673) 류마티스성 다발근통(319) 다낭성 신장, 보통염색체우성(309) 비폐색성 비대성 심근병증(275)
≥80세 특발성 폐섬유증(1,464) 비가역적 확장성 심근병증(455) 수포성 유사천포창(437) 상세불명의 뇌전증지속상태(310) 류마티스성 다발근통(158)
연간 진료비(천원) 총진료비 특발성 폐섬유증(40,453,095) 상세불명의 뇌전증지속상태(36,732,908) 다낭성 신장, 보통염색체우성(26,302,326) 길랭-바레증후군(23,575,310) 모야모야병(19,704,339)
1인당 평균 고쉐병(318,423) 모르키오(-유사)(고전적) 증후군(245,701) II형 점액다당류증(213,268) 폼페병(166,219) 헐러-샤이에증후군(162,846)

연령별 분석 결과 1세 미만에서는 팔로네징후, 1–9세에서는 신경섬유종증(비악성) 1형, 2형, 10대와 20대에서는 소장 및 대장 모두의 크론병, 30–50대에서는 다낭성 신장, 보통염색체우성, 60대 이상에서는 특발성 폐섬유증이 가장 많이 발생하였다.

연간 총진료비가 가장 높게 발생한 질환은 특발성 폐섬유증으로 총 404.5억 원으로 분석되었으며, 상세불명의 뇌전증지속상태(367.3억 원), 다낭성 신장, 보통염색체우성(263.0억 원) 순이었다. 환자 1인당 평균 진료비는 고쉐병이 1인당 평균 3억 1,842만 원으로 가장 높았고, 모르키오(-유사)(고전적) 증후군(2억 4,570만 원), II형 점액다당류증(2억 1,327만 원) 순으로 분석되었다.

결 론

본 연구는 2019–2023년까지의 「희귀질환자 통계 연보」를 종단적으로 고찰하고, 최신 공표된 2023년도 신규 희귀질환 발생자의 특성을 분석함으로써 국내 희귀질환 발생 현황의 실증적 근거를 제시하고자 수행되었다. 지난 5개년간의 「희귀질환자 통계 연보」 산출 체계 변화는 국내 희귀질환 통계 연보가 보건 정책과 임상 현장에 기여하는 기반 데이터로 성숙했음을 보여준다. 특히 초기 동일 연보 내 서로 다른 연도의 통계가 혼재되던 구조적 문제를 데이터 수집 기간 확대로 해결하고, 발생‧사망‧진료이용을 단일 연보로 통합하여 데이터의 시의성과 정밀성을 제고하였다. 또한 진료이용 추적 기간을 12개월로 연장함으로써 환자의 연간 의료비 부담을 실증적으로 파악할 수 있는 기반을 마련하였다. 지리적 분석 단위를 17개 시‧도로 세분화하고 의료보장 형태별 급여 현황을 신규 도입한 것은 거주지 및 소득 계층별 격차를 모니터링 하여 공중보건의 형평성을 제고하는 전환점이 되었다[6]. 200명 이하 발생 질환까지 연령별, 지역별 발생 현황을 공개한 조치 역시 국가 차원에서 성별, 연령, 소득, 인종 등으로 세분화된 데이터를 수집 및 배포하여 국제적 협력을 구축하도록 한 유엔 총회 결의안 및 글로벌 연구 거버넌스 기틀과도 부합한다[15,16]. 이 과정에서 개인정보 보호 및 식별 방지를 위해 세부 항목별로 발생자 수가 3명 초과인 경우만 공개하도록 하여 정보의 유용성과 보안성의 균형을 도모하였다.

연도별 희귀질환 발생자 수를 보면, 희귀질환 목록과 신규 환자가 발생한 질환의 수, 신규 발생자 수가 지속적으로 증가하는 양상을 보였다. 이는 희귀질환 지정 범위가 점차 넓어지고, 진단기술의 발달과 질환 인식의 향상으로 인해 더 많은 질환에서 신규 진단이 이루어지고 있음을 시사한다[1,20,21]. 특히 2023년 신규 발생자 수는 62,420명으로 연보 발간 이래 최초로 6만 명을 초과하였다. 이는 2023년에 신규로 지정‧고시된 희귀질환의 영향이 작용한 것으로 확인되었다. 2022년 대비 2023년 희귀질환 목록에 새롭게 추가된 질환은 총 42개(희귀질환 1개, 극희귀질환 20개, 기타염색체이상질환 21개)였으며, 제외된 질환은 없었다. 이 신규 지정 질환군에서만 총 5,250명의 신규 질환자가 발생하였는데, 특히 신규 지정된 ‘다낭성 신장, 보통염색체우성’의 발생자가 4,830명으로 집계되어 발생자 증가의 주원인으로 분석되었다[13]. 그러나 신규 지정된 희귀질환은 이전 발병자까지 지정 연도에 일괄 등록되므로 지정 당해연도의 신규질환에 대해서는 발생 규모 해석상 주의가 필요하다. 또한 지난 5년간 신규 발생자 수를 살펴보면, 극희귀질환은 약 3.2배 증가하였으며, 기타염색체이상질환은 약 2.5배 증가하였다. 소수 질환군의 발생자 증가는 국가관리대상 희귀질환 지정을 점진적으로 확대함으로써 그간 보건의료 사각지대에 놓여있던 잠재적 환자군을 제도권 내로 포용해 온 정책적 성과가 반영된 결과로 해석할 수 있다[16]. 그러나 발생자 증가와 더불어 극희귀질환 사망자 수의 증가는 확진에 이르는 기간의 장기화와 표준 치료법 부재라는 소수 질환군 고유의 임상적 취약성이 여전히 존재함을 시사한다[2,3,22]. 다만, 당해 연도 사망자 수는 해당 희귀질환으로 인한 직접적 사인과 기타 질환 및 외인으로 인한 사망을 명확히 구분할 수 없다는 해석상의 한계를 지닌다.

진료이용 측면에서는 총진료비 역시 상승하고 있음을 알 수 있다. 특히 특발성 폐섬유증, 상세불명의 뇌전증지속상태 등 진료비 상위 5개 질환이 전체 희귀질환 총진료비의 35.9%를 점유하고 있는 것으로 나타났다. 이는 향후 희귀질환 지원 정책이 포용성 확대와 더불어 재정적 비중이 높은 상위 질환군에 대한 효율적인 재정 관리 및 모니터링 방안도 필요함을 시사한다. 한편, 환자 1인당 연간 평균 총 진료비가 높은 상위 5개 질환은 고쉐병, 모르키오(-유사)(고전적) 증후군 등으로 분석되어 총진료비가 높은 질환과는 차이가 있다. 따라서 환자 수는 적으나 인당 의료비 부담이 큰 희귀질환자까지 사각지대 없이 포괄하는 다각적인 보장성 강화 체계가 요구된다. 다만, 1인당 평균 총진료비가 높은 질환의 경우, 연간 신규 발생자 수가 극히 적어 해당 개별 데이터가 극단값으로 작용했을 가능성을 배재할 수 없으므로 장기적인 추적 분석을 통해 임상적‧정책적으로 유의미한 평균 진료비를 도출할 수 있도록 해야 한다. 또한 국가 지정 희귀질환 확대에 따른 영향을 고려하여 신규 및 기존 지정 질환을 분리하고 세부 질환별 사망 및 진료비를 시계열적으로 분석하여 질환 확대에 따른 누적 효과와 실제 의료 이용의 변화를 규명할 수 있도록 해야 한다.

마지막으로 연령별‧지역별 희귀질환 발생 현황과 다빈도 질환 분석 결과, 희귀질환은 성별 및 지역별, 연령별로 차이를 보였다. 이는 희귀질환이 단순히 하나의 질환군으로 묶일 수 없는 다층적‧이질적 집단임을 보여주며, 환자가 당면하는 임상적 문제와 사회경제적 요구가 인구학적 특성에 따라 다양할 수 있음을 시사한다[6]. 기존 문헌에 따르면 영유아 및 청소년기의 질환은 평생에 걸친 치료와 가족 전체의 돌봄 부담이 중심 문제가 되며, 가임기 여성 환자는 질환으로 인한 임신‧출산의 어려움을 겪는 반면, 노년기 희귀질환자는 희귀질환의 병태생리와 신체적 기능 저하가 결합하면서 독립적인 일상생활이 힘들어지며 복합적 어려움을 겪을 수 있다[23-25]. 따라서 희귀질환 보건 정책은 인구학적 집단이 가진 고유한 질병 특성을 고려하여 희귀질환 대상군을 세분화하여 생애주기별 맞춤형 지원 체계가 구축되어야 한다.

결론적으로 본 연구는 희귀질환 통계의 5개년 변화 양상과 최신 2023년 발생 현황을 실증적으로 규명해 냈다는 점에서 의의가 있다. 「희귀질환자 통계 연보」는 국내 희귀질환 발생 현황뿐만 아니라 희귀질환 목록 확대에 따른 선제적 의료 자원 예측은 물론, 지역사회 보건의료 불평등을 해소하기 위한 정책 모니터링의 강력한 근거 기반 데이터로 활용될 수 있을 것이다. 다만, 향후에는 신규 발생자 수 집계를 넘어 인구학적‧생애주기별 취약성을 정밀하게 포착할 수 있도록 발생률 및 생존율과 전체 희귀질환 유병자 중심의 현황까지 추적‧파악할 수 있는 통계 체계로의 개편이 요구된다.


Articles from Public Health Weekly Report are provided here courtesy of Korea Disease Control and Prevention Agency

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