Table 1.

A summary of the four sequence changes (SC) detected in different surface fish and cavefish populations

	SC1	SC2	SC3	SC4
SF Texas	C– – ––––––––CACACACACACACACACA - A - G	–	G–AAGCCCCCTTCCCCCCCTCCCCCCCC–TGCCT–C–T	ATAAAAA
SF Mexico	CCACACACACACACACACACACACACACA–A–G	+	G–AAGCCCCCCTT–––––––CCCCCCCC–TGCCTTC–T	A– – – – A
CF Pachón	C– – ––––––––CACACACACACA– – –––––A–G	+	G–AAGCCCCCCTCCCTCC––CCCCCCCC–TGCCT–C–T	A– – – – A
CF Molino	C– – ––––––––CACACACACACA– – –––––A–G	+	GGAAGCCCC–––CCCTCC––CCCCCCCCCTTGCTT––T	A– – – – A
CF Jineo	CCA– ––––––– CACACACACACACACACA - A - G	+	G–AAGCCCCCCTCCC–CC––CCCCCCT––TGC–TT––T	A– – – – A
CF Chica	ND	+	GGAAGCCCCCCT–––T–C––CCCCCCCC–TGCCTTCCT	A– – – – A
CF Los Sabinos	C– – –––––––– CACACACACACACACACA - A - G	+	GGAAGCCCCCCT–––TC–––CCCCCCCC–TGCCTTC–T	A– – – – A
CF Tinaja	C– – ––––––––– –CACACACACACACACACAAG	+	ND	A– – – – A

Dashes (-) indicate gaps. ND is not determined. For SC2 “+” is present and “–” is absent.