Table 3.
Host origin/capsular type | No. of strains | tbpA (%) | hgbA (%) | hgbB (%) | pfhA (%) | ptfA (%) | nanB (%) | nanH (%) | toxA (%) |
| |||||||||
Buffalo | 23 | 69.6 | 82.6 | 65.2 | 95.7 | 95.7 | 100 | 78.3 | 4.3 |
Cap type A | 5 | 80.0 | 80.0 | 80.0 | 100 | 100 | 100 | 60.0 | 20.0 |
Cap type B | 17 | 64.7 | 82.3 | 58.8 | 94.1 | 94.1 | 100 | 82.3 | 0.0 |
Cap type D | 1 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Cattle | 18 | 100 | 94.4 | 66.7 | 94.4 | 94.4 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type A | 5 | 100 | 100 | 100 | 100 | 80.0 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type B | 11 | 100 | 90.9 | 45.4 | 90.9 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 2 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
| |||||||||
Large ruminants (cattle + buffalo) | 41 | 82.9 | 87.8 | 65.9 | 95.1 | 95.1 | 100 | 87.8 | 2.4 |
Cap type A | 10 | 90.0 | 90.0 | 90.0 | 100 | 90.0 | 100 | 80.0 | 10.0 |
Cap type B | 28 | 78.5 | 85.7 | 53.5 | 92.8 | 96.4 | 100 | 89.2 | 0.0 |
Cap type D | 1 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type F | 2 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
| |||||||||
Chicken | 18 | 77.8 | 83.3 | 83.3 | 100 | 100 | 100 | 61.1 | 0.0 |
Cap type A | 13 | 69.2 | 84.6 | 76.9 | 100 | 100 | 100 | 53.8 | 0.0 |
Cap type B | 5 | 100 | 80.0 | 100 | 100 | 100 | 100 | 80.0 | 0.0 |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Duck | 8 | 87.5 | 87.8 | 100 | 100 | 100 | 100 | 50.0 | 37.5 |
Cap type A | 7 | 85.7 | 85.7 | 100 | 100 | 100 | 100 | 42.8 | 28.5 |
Cap type B | 1 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Emu | 4 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type A | 4 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type B | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Avian (chicken + duck + emu) | 30 | 83.3 | 86.7 | 90.0 | 100 | 100 | 100 | 63.3 | 10.0 |
Cap type A | 24 | 79.1 | 87.5 | 87.5 | 100 | 100 | 100 | 58.3 | 8.3 |
Cap type B | 6 | 100 | 83.3 | 100 | 100 | 100 | 100 | 83.3 | 16.6 |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Rabbit | 3 | 100 | 100 | 33.3 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type A | 1 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type B | 2 | 100 | 100 | 0.0 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |
Cap type D | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Pig | 34 | 79.4 | 73.5 | 67.6 | 85.3 | 100 | 88.2 | 67.6 | 44.1 |
Cap type A | 18 | 72.2 | 72.2 | 61.1 | 94.4 | 100 | 88.8 | 83.3 | 44.2 |
Cap type B | 9 | 100 | 88.8 | 66.6 | 100 | 100 | 100 | 88.8 | 11.1 |
Cap type D | 7 | 71.4 | 57.1 | 85.7 | 42.8 | 100 | 71.4 | 0.0 | 57.1 |
Cap type F | 0 | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. |
| |||||||||
Total (all isolates) | 108 | 82.4 | 83.3 | 72.2 | 93.5 | 98.1 | 96.3 | 75.0 | 17.6 |
Cap type A | 53 | 79.2 | 83.0 | 79.2 | 98.0 | 98.0 | 96.2 | 71.7 | 24.5 |
Cap type B | 45 | 86.7 | 86.7 | 60.0 | 95.6 | 97.8 | 100 | 88.9 | 4.4 |
Cap type D | 8 | 75.0 | 62.5 | 87.5 | 50.0 | 100 | 75.0 | 12.5 | 50.0 |
Cap type F | 2 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 0.0 |