Skip to main content
. 2017 Jun 28;8(34):56021–56029. doi: 10.18632/oncotarget.18715

Table 3. Basic information of candidate SNPs in this study.

SNP Chr Gene allel MAF(case) MAF(control) HWE OR 95%CI P
rs3783550 2q13 IL1A T/G 0.38 0.33 0.399 1.28 1.04 1.58 0.018*
rs3783546 2q13 IL1A C/G 0.38 0.33 0.459 1.30 1.05 1.60 0.014*
rs2856838 2q13 IL1A A/G 0.27 0.25 0.320 1.12 0.89 1.40 0.338
rs1609682 2q13 IL1A T/G 0.38 0.33 0.398 1.29 1.05 1.59 0.016*
rs3783521 2q13 IL1A G/A 0.38 0.33 0.399 1.29 1.05 1.59 0.015*
rs2853550 2q13 IL1B A/G 0.11 0.09 0.067 1.29 0.92 1.79 0.137
rs1143643 2q13 IL1B C/T 0.48 0.47 0.191 1.01 0.83 1.23 0.926
rs3136558 2q13 IL1B G/A 0.41 0.37 0.617 1.21 0.99 1.48 0.066
rs1143630 2q13 IL1B T/G 0.18 0.16 1.000 1.16 0.89 1.51 0.262
rs1143627 2q13 IL1B G/A 0.49 0.48 0.160 1.05 0.86 1.28 0.618
rs16944 2q13 IL1B A/G 0.49 0.48 0.162 1.06 0.87 1.29 0.556
rs1143623 2q13 IL1B G/C 0.41 0.40 0.286 1.04 0.85 1.28 0.675
rs17042888 2q13 IL1RN A/G 0.27 0.26 0.470 1.05 0.84 1.31 0.697
rs928940 2q13 IL1RN T/G 0.41 0.39 0.000 1.07 0.87 1.31 0.510
rs3181052 2q13 IL1RN G/A 0.43 0.41 0.248 1.09 0.89 1.34 0.384
rs452204 2q13 IL1RN G/A 0.36 0.35 1.000 1.06 0.86 1.30 0.594

*p value ≤ 0.05 indicates statistical significance; A/B stands for minor/major alleles on the control sample frequencies. HWE: Hardy–Weinberg equilibrium; MAF: minor allele frequency; OR: odds ratio; SNP: single-nucleotide polymorphisms.