Table II.

Hydrogen Bonding (Å) in the Sugar Binding Sites for Complexes of Griffithsin With Different Carbohydrates

Donor			Acceptor			Distance (Å)
Complex with mannose
MAN	1	O4	ASP A	112	OD2	2.55
MAN	1	O6	ASP A	112	OD1	2.79
MAN	1	O6	TYR A	110	O	3.12
TYR A	110	N	MAN	1	O6	2.79
ASP A	109	N	MAN	1	O5	2.99
ASP A	109	N	MAN	1	O6	2.99
GLY A	108	N	MAN	1	O6	3.19
GLY B	12	N	MAN	1	O3	2.84
MAN	2	O4	ASP A	30	OD2	2.46
MAN	2	O6	ASP A	30	OD1	2.70
TYR A	28	N	MAN	2	O6	2.80
SER A	27	OG	MAN	2	O5	3.70
SER A	27	N	MAN	2	O5	2.94
GLY A	44	N	MAN	2	O3	2.85
MAN	3	O4	ASP A	70	OD2	2.58
MAN	3	O6	ASP A	70	OD1	2.63
TYR A	68	N	MAN	3	O6	2.87
ASP A	67	N	MAN	3	O5	2.89
GLY A	66	N	MAN	3	O6	3.06
GLY A	90	N	MAN	3	O3	2.90
GLY A	12	N	MAN	4	O3	2.87
MAN	4	O4	ASP B	112	OD2	2.53
MAN	4	O6	ASP B	112	OD1	2.73
MAN	4	O6	TYR B	110	O	3.11
TYR B	110	N	MAN	4	O6	2.76
ASP B	109	N	MAN	4	O5	3.02
ASP B	109	N	MAN	4	O6	2.98
GLY B	108	N	MAN	4	O6	3.16
GLY B	44	N	MAN	5	O3	2.95
MAN	5	O4	ASP B	30	OD2	2.46
MAN	5	O6	ASP B	30	OD1	2.61
TYR B	28	N	MAN	5	O6	2.83
SER B	27	N	MAN	5	O5	2.94
GLY B	90	N	MAN	6	O3	2.81
MAN	6	O4	ASP B	70	OD2	2.59
MAN	6	O6	ASP B	70	OD1	2.69
MAN	6	O6	TYR B	68	O	3.16
TYR B	68	N	MAN	6	O6	2.93
ASP B	67	N	MAN	6	O5	3.02
Complex with 1→6α‐mannobiose
GLY B	12	N	MAN	12	O3	2.64
MAN	12	O4	ASP A	112	OD2	2.87
MAN	12	O6	ASP A	112	OD1	2.81
MAN	12	O6	TYR A	110	O	3.21
TYR A	110	N	MAN	12	O6	2.98
ASP A	109	N	MAN	12	O5	3.16
ASP A	109	N	MAN	12	O6	3.08
GLY A	108	N	MAN	12	O6	3.12
GLY A	44	N	MAN	22	O3	2.86
MAN	22	O4	ASP A	30	OD2	2.63
MAN	22	O6	ASP A	30	OD1	2.74
MAN	22	O6	TYR A	28	O	2.96
TYR A	28	N	MAN	22	O6	3.00
SER A	27	N	MAN	22	O5	2.86
GLY A	90	N	MAN	32	O3	2.82
MAN	32	O4	ASP A	70	OD2	2.63
MAN	32	O6	ASP A	70	OD1	2.78
MAN	32	O6	TYR A	68	O	2.99
TYR A	68	N	MAN	32	O6	2.65
ASP A	67	N	MAN	32	O5	2.71
ASP A	67	N	MAN	32	O6	2.90
GLY A	66	N	MAN	32	O6	3.05
GLY B	90	N	MAN	42	O3	3.01
MAN	42	O4	ASP B	70	OD2	2.60
MAN	42	O6	ASP B	70	OD1	2.61
TYR B	68	N	MAN	42	O6	2.98
ASP B	67	N	MAN	42	O5	2.89
GLY B	66	N	MAN	42	O6	3.12
GLY B	44	N	MAN	52	O3	3.10
MAN	52	O4	ASP B	30	OD2	2.70
MAN	52	O6	ASP B	30	OD1	2.71
MAN	52	O6	TYR B	28	O	3.05
TYR B	28	N	MAN	52	O6	2.92
SER B	27	N	MAN	52	O5	2.81
SER B	27	N	MAN	52	O6	2.94
GLY B	26	N	MAN	52	O6	3.10
MAN	62	O4	ASP B	112	OD2	2.68
MAN	62	O6	ASP B	112	OD1	2.87
MAN	62	O6	TYR B	110	O	3.08
TYR B	110	N	MAN	62	O6	2.75
ASP B	109	N	MAN	62	O5	2.86
GLY B	108	N	MAN	62	O6	3.32
GLY A	12	N	MAN	62	O3	3.03
Second sugar unit
MAN	31	O4	ASP A	67	OD2	2.99
TYR B	28	OH	MAN	41	O2	2.97
SER B	27	OG	MAN	51	O4	3.31
Complex with maltose
GLC	12	O4	ASP A	112	OD2	2.67
GLC	12	O6	ASP A	112	OD1	2.68
GLC	12	O6	TYR A	110	O	3.09
GLY B	12	N	GLC	12	O3	2.81
TYR A	110	N	GLC	12	O6	2.97
ASP A	109	N	GLC	12	O5	3.10
GLY A	108	N	GLC	12	O6	3.29
GLC	22	O4	ASP A	30	OD2	2.58
GLC	22	O6	ASP A	30	OD1	2.81
GLC	22	O6	TYR A	28	O	3.19
TYR A	28	N	GLC	22	O6	2.92
SER A	27	N	GLC	22	O5	2.95
SER A	27	N	GLC	22	O6	3.03
GLY A	26	N	GLC	22	O6	3.14
GLY A	44	N	GLC	22	O3	2.95
GLY A	90	N	GLC	32	O3	2.95
GLC	32	O4	ASP A	70	OD2	2.60
GLC	32	O6	ASP A	70	OD1	2.63
GLC	32	O6	TYR A	68	O	3.19
TYR A	68	N	GLC	32	O6	2.95
ASP A	67	N	GLC	32	O5	2.97
GLY A	66	N	GLC	32	O6	3.16
GLC	42	O4	ASP B	112	OD2	2.68
GLC	42	O6	ASP B	112	OD1	2.77
TYR B	110	N	GLC	42	O6	2.88
ASP B	109	N	GLC	42	O5	3.04
ASP B	109	N	GLC	42	O6	3.07
GLY A	12	N	GLC	42	O3	2.95
GLY B	44	N	GLC	52	O3	2.83
GLC	52	O4	ASP B	30	OD2	2.58
GLC	52	O6	ASP B	30	OD1	2.64
GLC	52	O6	TYR B	28	O	3.17
TYR B	28	N	GLC	52	O6	2.97
SER B	27	N	GLC	52	O5	2.98
GLY B	90	N	GLC	62	O3	3.03
GLC	62	O4	ASP B	70	OD2	2.58
GLC	62	O6	ASP B	70	OD1	2.68
GLC	62	O6	TYR B	68	O	3.12
TYR B	68	N	GLC	62	O6	2.89
ASP B	67	N	GLC	62	O5	3.05
ASP B	67	N	GLC	62	O6	3.04
GLY B	66	N	GLC	62	O6	3.08
Second sugar unit
SER A	27	OG	GLC	221	O6	3.21
GLC	31	O6	TYR A	28	OH	3.05
GLC	31	O3	ASP A	67	OD2	3.04
TYR B	28	OH	GLC	61	O6	2.97
GLC–GLC interactions
GLC	21	O3	GLC	22	O2	2.94
GLC	62	O2	GLC	61	O4	2.75
GLC	52	O2	GLC	51	O4	2.80
GLC	51	O3	GLC	52	O2	3.28
GLC	42	O2	GLC	41	O4	2.67
GLC	41	O3	GLC	42	O2	3.29
GLC	32	O2	GLC	31	O4	2.78
GLC	221	O3	GLC	22	O2	2.98
GLC	22	O2	GLC	21	O4	2.77
GLC	11	O3	GLC	12	O2	3.04
GLC	22	O2	GLC	221	O4	2.77