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. 2019 Jul 25;21(7):670–675. [Article in Chinese] doi: 10.7499/j.issn.1008-8830.2019.07.010

13例早发型腓骨肌萎缩症的基因分型研究

A genotyping study of 13 cases of early-onset Charcot-Marie-Tooth disease

徐 佳露 1, 章 毅 1, 赵 聪颖 1, 江 佩芳 1, 袁 哲锋 1, 余 永林 1, 夏 哲智 1, 高 峰 1,*
PMCID: PMC7389102  PMID: 31315766

Abstract

目的

探讨早发型腓骨肌萎缩症(CMT)的临床特征及遗传变异分析。

方法

以临床诊断为早发型CMT的患儿为研究对象,收集相关临床资料,进行肌电图及CMT相关基因检测并分析。

结果

早发型CMT病例共13例,男9例(69%),女4例(31%),平均就诊年龄4.0±2.1岁,其中12例(92%)患儿起病年龄 < 2岁。9例(69%)诊断为CMT1型(其中Dejerine-Sottas综合征6人),1例(8%)为中间型,3例(23%)为CMT2型。13例患儿的基因检测结果显示6例(46%)患儿存在外周髓鞘蛋白22(PMP22)基因重复突变、3例(23%)髓鞘蛋白零(MPZ)基因插入突变及点突变、3例(23%)线粒体融合蛋白2(MFN2)基因点突变、1例(8%)人轻肽神经丝蛋白(NEFL)基因点突变,其中11例(85%)为已知致病突变,2例(15%)为新变异。MPZ基因新变异c.394C > G(p.P132A)评级为"可能致病的"及MFN2基因新变异c.326A > G(p.K109R)评级为"致病的"。

结论

早发型CMT以PMP22基因重复突变及MPZ基因突变为主,临床分型以CMT1型为主,其中Dejerine-Sottas综合征占有相当比例。

Keywords: 腓骨肌萎缩症, 外周髓鞘蛋白22基因, 髓鞘蛋白零基因, 线粒体融合蛋白2基因, 人轻肽神经丝蛋白基因, 高通量测序, 儿童


腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease, CMT),又称遗传性运动感觉神经病(hereditary motor and sensory neuropathy, HMSN),是一组具有高度临床和遗传异质性的周围神经单基因遗传病,发病率约为1/2 500[1]。CMT的遗传模式有常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传及X-连锁遗传。目前发现80余个基因的1 000余个突变均可导致CMT的发生[2-3],其中外周髓鞘蛋白22(peripheral myelin protein 22, PMP22)、间隙连接蛋白β1(gap junction protein beta 1, GJB1)、髓鞘蛋白零(myelin protein zero, MPZ)、线粒体融合蛋白2(mitofusin 2, MFN2)四个基因的突变占总突变的近95%[4]。随着多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)及二代基因测序技术,如基因panel、全外显子组测序技术等的发展及应用,对于CMT的认识不再局限于传统的临床分型。如何确定突变基因,特别是新变异的致病性,确定基因分型,成为了当今分子诊断的难点所在。而美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)于2015年重新修订的序列变异解读标准和指南[5],基于人群数据、计算数据、功能数据、共分离数据等,对基因的变异进行分级,为解读工作提供了指向。本文通过对13例早发型CMT患儿的临床特征、家族史及基因检测结果进行分析,最终确定患儿的基因分型。

1. 资料与方法

1.1. 研究对象

以2014年4月至2018年3月在浙江大学医学院附属儿童医院临床诊断为早发型CMT的13例患儿为研究对象,其中男9例(69%),女4例(31%),其中12例(92%)患儿起病年龄 < 2岁,平均就诊年龄4.0±2.1岁。

对于早发型CMT采用诊断标准[6-7]:(1)发病年龄 < 10岁;(2)慢性起病,缓慢进展的肢体远端尤其是双下肢远端的肌无力和肌萎缩,典型者成鹤腿畸形;(3)肌电图显示周围神经性受损;(4)神经活检证实周围神经损害;(5)家族史阳性;(6)弓形足或脊柱侧凸;(7)排除以下疾病:慢性炎性脱髓鞘性多发性神经根神经病、糖尿病性周围神经病、酒精中毒性周围神经病、周围神经淀粉样变性、进行性脊髓性肌萎缩症、脊髓亚急性联合变性等。

患儿须具备上述第(1)、(2)、(3)、(7)四条及第(4)、(5)、(6)中任何一条。若家族中已有确诊者,再具备第(1)、(2)条即可诊断。

1.2. CMT临床分型

基于神经电生理和病理特点,CMT的临床分型可初步分为(1)脱髓鞘型(CMT1型):正中神经运动传导速度(motor nerve conduction velocity, MNCV) < 38 m/s,神经活检示显著的节段性脱髓鞘,施万细胞增生,呈“洋葱头”样改变;其中正中神经MNCV < 12 m/s者亦称Dejerine-Sottas综合征(Dejerine-Sottas syndrome, DSS);(2)轴索型(CMT2型):正中神经MNCV > 38 m/s,神经活检示慢性轴索变性和再生,有髓纤维减少,神经再生簇形成;(3)中间型:正中神经MNCV介于25~45 m/s,神经病理兼具脱髓鞘和轴索变性特点。

1.3. 资料采集

收集患儿相关临床资料:性别、就诊年龄、起病年龄、起病症状、家族史及神经系统体征。

1.4. 周围神经病相关基因高通量测序

抽取患儿外周静脉血3 mL,放置EDTA抗凝管中,送至北京金准基因科技有限责任公司,采用周围神经病相关106个基因panel检测。发现基因点突变时,根据选取位点的位置用Primer 5设计、合成引物,进行PCR扩增,对高通量测序结果中的变异位点进行Sanger测序验证;发现基因重复突变时,对捕获区域进行覆盖度计算及均一化处理,检测出可能发生拷贝数变异的区域,经MLPA检测基因(主要针对PMP22基因),确认重复范围;对亲属进行Sanger测序突变位点验证,根据家系共分离结果进一步判断其致病性。

应用人类基因突变数据库(HGMD, http://www.hgmd.cf.ac.uk)确认已报道的致病基因位点。对于新变异位点,应用ESP数据库(http://evs.gs.washington.edu/EVS)、千人数据库(http://browser.1000genomes.org)、ExAC数据库(http://exac.broadinstitute.org)进行正常对照人群变异比对,应用ACMG指南标准对新变异进行评级。

2. 结果

2.1. 临床表现

5例(38%)患儿存在运动发育落后,独走年龄 > 18月,伴行走不稳、平衡能力差、易摔倒、步态异常。13例(100%)患儿均存在远端肢体无力,4例(31%)伴远端肢体萎缩,6例(46%)伴上肢受累,1例(8%)伴脊柱侧凸。见表 1

1.

13例早发型CMT患儿基本信息及临床表现

病例 性别 就诊年龄(岁) 起病年龄(岁) 起病症状 临床表现
足畸形 远端肢体无力 远端肢体萎缩 上肢受累 感觉症状 脊柱侧凸
注:+示阳性症状;-示阴性症状。
1 2.3 < 2 20月独走,下肢无力 鹤腿 + - - 未评 -
2 3.3 < 2 24月独走,下肢无力 弓形足 + + + 未评 +
3 1.8 < 2 16月独走,步态异常 弓形足 + - - 未评 -
4 6 < 2 15月独走,步态异常,走路易摔跤 弓形足、鹤腿 + + + + -
5 5.4 < 2 13月独走,走路易摔跤 弓形足、鹤腿 + - - - -
6 4 < 2 20月独走,步态异常,走路易摔跤 弓形足 + - + 未评 -
7 5 < 2 12月独走,步态异常 马蹄内翻足 + + - + -
8 9 8 13月独走,8岁出现下肢无力,步态异常 弓形足、鹤腿 + + - + -
9 4.7 < 2 15月独走,下肢无力 弓形足、鹤腿 + - + 未评 -
10 1.3 < 2 16月尚不能独走 鹤腿 + - + 未评 -
11 3.2 < 2 18月独走,步态异常 鹤腿 + - - 未评 -
12 2.5 < 2 20月独走,上楼梯步态异常 鹤腿 + - + 未评 -
13 4.2 < 2 12月独走,15月出现步态异常,走路易摔跤 弓形足 + - - 未评 -

2.2. 肌电图结果

肌电图显示正中神经MNCV < 25 m/s者9人,介于25~45 m/s者1人,> 45 m/s者3人,可分为CMT1型9人(69%),中间型1人(8%),CMT2型3人(23%)。9例CMT1型患儿中,有6例正中神经MNCV < 12 m/s,即DSS;有5例(病例1、2、4、8、13)正中神经复合肌肉动作电位(compound muscle action potential, cMAP)均降低,提示合并轴索损害;且正中神经感觉神经传导速度(sensory nerve conduction velocity, SNCV)及感觉神经动作电位(sensory nerve action potential, SNAP)均未能引出。见表 2

2.

13例早发型CMT患儿的肌电图结果

病例 正中神经 临床分型
MNCV (m/s) cMAP (mV) SNCV (m/s) SNAP (μV)
注:[NP]未引出。
1 4.9 0.68 NP NP CMT1/DSS
2 8.8 0.38 NP NP CMT1/DSS
3 9.4 1.5 NP NP CMT1/DSS
4 9.2 0.2 NP NP CMT1/DSS
5 51.3 2.9 51.3 9.0 CMT2
6 25.5 2.6 30.1 1.63 中间型CMT
7 51.4 3.6 41.1 4.5 CMT2
8 23.3 1.3 NP NP CMT1
9 11.4 3.0 NP NP CMT1/DSS
10 6.1 2.8 NP NP CMT1/DSS
11 52.3 6.1 NP NP CMT2
12 18.6 3.0 NP NP CMT1
13 15.3 1.05 NP NP CMT1

2.3. 基因诊断

13例患儿的基因检测结果显示11例(85%)为已知致病突变,2例(15%)为新变异,其中5例(38%)存在家族史。突变基因包含PMP22重复突变(6例,46%)、MPZ基因插入突变及点突变(3例,23%)、MFN2基因点突变(3例,23%)及人轻肽神经丝蛋白(NEFL)基因点突变(1例,8%)。2例新变异分别为MPZ基因c.394C > G(p.P132A)及MFN2基因c.326A > G(p.K109R)。见表 3

3.

13例早发型CMT患儿突变基因、核苷酸及氨基酸改变信息

病例 临床分型 突变基因 核苷酸改变 氨基酸改变 父母有无变异 是否为新变异
1 CMT1/DSS MPZ c.394C > G p.P132A
2 CMT1/DSS MPZ c.90C > G p.I30M
3 CMT1/DSS PMP22 PMP22基因整体重复 -
4 CMT1/DSS PMP22 PMP22基因整体重复 -
5 CMT2 MFN2 c.326A > G p.K109R
6 中间型CMT NEFL c.293A > G p.N98S
7 CMT2 MFN2 c.280C > T p.R94W
8 CMT1 PMP22 PMP22基因整体重复 -
9 CMT1/DSS PMP22 PMP22基因整体重复 -
10 CMT1/DSS MPZ c.293C > T p.R98C
11 CMT2 MFN2 c.1090C > T p.R264W
12 CMT1 PMP22 PMP22基因整体重复 -
13 CMT1 PMP22 PMP22基因整体重复 -

2.4. 新变异分析

病例1携带MPZ基因c.394C > G(p.P132A)杂合变异,病例5携带MFN2基因c.326A > G(p.K109R)杂合变异。Sanger测序验证两位患儿的父母均未携带相应变异,该患儿为新发(de novo)变异。两个基因变异位点在哺乳动物中高度保守。见图 1~2

1.

病例1家系图、Sanger测序图及保守序列分析

图A示病例1家系图,■为先证者,○为健康女性,□为健康男性;图B示MPZ蛋白第132号氨基酸位点在哺乳动物中高度保守;图C示患儿存在MPZ基因c.394C > G(p.P132A)杂合突变,父母在该位点均未携带突变(箭头所示)。

1

2.

病例5家系图、Sanger测序图及保守序列分析

图A示病例5家系图,■为先证者,○为健康女性,□为健康男性;图B示MFN2蛋白第109号氨基酸位点在哺乳动物中高度保守;图C示患儿存在MFN2基因c.326A > G(p.K109R)杂合突变,父母在该位点均未携带突变(箭头所示)。

2

应用ACMG序列变异解读标准对2个新变异进行评级。MPZ基因c.394C > G(p.P132A)杂合变异,为新发变异,无家族史,符合PS2;该变异为ESP数据库、千人数据库、ExAC数据库正常对照人群中未发现的变异,符合PM2;SIFT、PolyPhen-2、PROVEAN软件的生物信息数据分析预测提示“有害的”,MutationAssessor预测提示“致病性中等”;因此该变异被判定为“可能致病的”。MFN2基因c.326A > G(p.K109R)杂合变异,也为新发变异,无家族史,符合PS2;MFN2蛋白第107~111号氨基酸为核苷酸结合域,影响GTP的结合[8-9],符合PS3;该变异为ESP数据库、千人数据库、ExAC数据库正常对照人群中未发现的变异,符合PM2;经SIFT、PolyPhen-2、PROVEAN、MutationAssessor软件的生物信息数据分析预测,均提示为“有害的”,符合PP3;因此该突变被判定为“致病的”。见表 4

4.

新变异的ACMG致病性分级

病例 突变基因 SIFT PolyPhen-2 PROVEAN Mutation-Assessor ACMG致病性分级 致病性判定
中等 支持证据
注:-示无支持证据。
1 MPZ 0.01 0.93 -6.97 2.37 PS2 PM2 - 可能致病的
5 MFN2 0 1.00 -2.66 4.07 PS2, PS3 PM2 PP3 致病的

3. 讨论

CMT是一组具有高度临床和遗传异质性的周围神经系统遗传病,诊断需结合临床分型及基因分型。二代测序技术的发展正改变着CMT基因诊断的方式。包含所有已知CMT相关基因的基因panel检测是如今最经济、最高效、最直接的基因检测方式,这能让临床医生在第一时间对所有CMT基因的突变情况有一个整体的了解。它能很好的体现基因型-表型的对应关系,为临床的治疗、随访提供可靠保障。但新变异的临床意义解读是临床工作的一个难点所在。2015年,ACMG提出了适用于所有孟德尔基因变异,包括单基因、多基因包、外显子组和基因组测序发现的遗传变异的解读标准与指南[5]

本研究共确诊13例早发型CMT患儿,6例(46%)PMP22基因重复突变,3例(23%)MPZ基因点突变,3例(23%)MFN2基因点突变及1例(8%)NEFL基因点突变,这与之前Cornett等[10]报道的CMT患儿前三位的突变基因一致。而对于占总体CMT人群突变第二位的GJB1基因,却并非CMT患儿的主要突变基因。这是由于在脱髓鞘型中,PMP22基因重复突变、MPZ、NEFL基因突变的患者多表现为早发型;而在轴索型中,几乎所有的MFN2基因突变的患者表现为早发型,而GJB1基因突变患者无论表现为脱髓鞘型或轴索型,起病年龄均相对较晚[11]

本研究中6例患儿起病年龄早,且正中神经MNCV < 12 m/s,符合DSS的诊断标准。突变基因包括3例MPZ基因突变和3例PMP22基因重复突变,与之前文献报道的DSS多数为MPZ及PMP22(包括整体重复及点突变)相一致[12]。近年来,DSS更被看做是一个临床综合征,尽管DSS患儿起病年龄早,且MNCV显著降低,提示着严重的脱髓鞘或者无髓鞘形成,但Gabreëls-Festen等[12]对25例DSS患者进行随访发现,仍有1/3的患者在平均年龄39.9岁时尚可独立行走1 km以上。DSS的出现并非预示着成人期的严重残疾及轮椅依赖的可能。

近年来,多项研究均提示MNCV虽能作为临床分型的主要指标,但却与疾病的进展不相平行。而cMAP尽管与起病年龄不相关,却关乎病程长短及疾病的严重程度,特别是在PMP22基因重复突变及MPZ基因突变的患者中,cMAP与远端肌力密切相关[13-14]。文中CMT1型患儿中有5人cMAP低于同龄儿,表明该型患儿除脱髓鞘病变外尚还存在轴索病变,且也预示着患儿相对预后不良。

综上,本研究依据患儿的临床表现、神经肌肉电生理特征、遗传模式、二代测序结果,结合临床分型及基因分型,采用ACMG标准对新变异致病性进行分析,共确诊早发型CMT 13例,为临床CMT的诊断确定基础。

Biography

徐佳露, 女, 博士, 主治医师

Funding Statement

国家青年科学基金(81501084)

References

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